高 叢,繆錦來,鄭 洲,金 青
(1.青島科技大學(xué)化工學(xué)院,山東 青島 266042;2.國家海洋局第一海洋研究所,山東 青島 266061)
纖維素酶廣泛存在于自然界的生物體中,是一種能夠?qū)⒗w維素降解為葡萄糖的多組分酶系,通常將其分為內(nèi)切葡聚糖酶、外切葡聚糖酶及β-葡萄糖苷酶,可廣泛用于中藥成分提取、食品、紡織、飼料、釀酒、石油勘探等諸多領(lǐng)域,尤其在生物能源工業(yè)中具有重要地位。利用纖維素酶將廢棄纖維類物質(zhì)糖化,用于制備生物乙醇,緩解能源緊張,是解決未來資源問題的一條重要途徑。
目前,人們對常溫和高溫纖維素酶的研究較多,關(guān)于低溫纖維素酶的研究相對較少。低溫酶既可以實現(xiàn)在低溫條件下進行高效酶解反應(yīng),同時也可以通過較低溫度的熱處理使酶失活,從而節(jié)約能量,降低生產(chǎn)成本。因此,對低溫纖維素酶產(chǎn)生菌的篩選及酶學(xué)性質(zhì)研究已成為熱點。
我國關(guān)于南極低溫纖維素酶的研究才剛剛開始。在南極地區(qū),科研人員已在冰雪、土壤及巖石樣品中發(fā)現(xiàn)了數(shù)量眾多的微生物,并證明微生物在南極自然環(huán)境下可以產(chǎn)生大量活性物質(zhì)(如低溫酶、抗生素、多糖及脂類等),為研究低溫纖維素酶提供了豐富資源。
作者在此從82株南極細菌中篩選出1株高產(chǎn)低溫纖維素酶菌株NJ64,通過16S rDNA序列進行鑒定,并對其產(chǎn)酶條件及酶學(xué)性質(zhì)進行初步研究,以期為南極低溫纖維素酶的開發(fā)利用奠定基礎(chǔ)。
南極嗜冷細菌分離于2001年10月~2002年3月在中國第十八次南極科學(xué)考察時采集的南極海水水樣和海冰樣品。
發(fā)酵培養(yǎng)基為2216E液體培養(yǎng)基,配方為:蛋白胨5 g、酵母粉1 g;用過濾陳海水定容至1000 mL,pH值7.0~7.5,121 ℃下濕熱滅菌20 min。
篩選培養(yǎng)基為添加1%羧甲基纖維素鈉的2216E培養(yǎng)基。
采用剛果紅染色法[1]在篩選培養(yǎng)基上對82株南極細菌進行初步篩選。
將菌株于10 ℃搖床培養(yǎng)96 h后,取發(fā)酵液在7000 r·min-1的條件下離心15 min,取上清液,過濾,得粗酶液。
以羧甲基纖維素鈉為底物,采用DNS法測定纖維素酶活性[2]。在520 nm下用分光光度計測定吸收值。以每分鐘每毫升纖維素酶粗酶液水解羧甲基纖維素鈉產(chǎn)生1 μg還原糖所需要的酶量定義為1個酶活單位(U)。
DNA模板的制備[3]:將50 μL菌體培養(yǎng)液加入到100 μL預(yù)冷的蒸餾水中,在冰上放置1 h以上或者3次凍融循環(huán)(-10 ℃/60 ℃)。
采用細菌16S rDNA的通用引物8-27F(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)和1492R(5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′) 進行PCR擴增[4]。PCR反應(yīng)條件為:95 ℃,1 min;55 ℃,1 min;72 ℃,1.5 min;循環(huán)30次,72 ℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)純化后由華大基因上海鼎安生物科技有限公司進行測序。將所測定的細菌的16S rDNA序列同GenBank數(shù)據(jù)庫進行相似性比較分析,選取與實驗菌株親緣關(guān)系較近的細菌用BioEdit軟件的多序列比對排列(Clustalw multiple alignment)進行序列比對,系統(tǒng)發(fā)育分析采用Mega3.1軟件的鄰接法(Neighbor-joining method)進行。
分別研究培養(yǎng)時間、初始pH值和培養(yǎng)溫度對NJ64產(chǎn)酶的影響。將菌株NJ64接種于發(fā)酵培養(yǎng)基中,10 ℃搖床培養(yǎng)120 h,每24 h取發(fā)酵液制備粗酶液測定纖維素酶活性;將菌株NJ64分別接種于初始pH值為5.5、6.5、7.5、8.5、9.5及10.5的發(fā)酵培養(yǎng)基中,10 ℃搖床培養(yǎng)96 h,測定發(fā)酵液中纖維素酶活性;將菌株NJ64接種于發(fā)酵培養(yǎng)基中,分別于5 ℃、10 ℃、15 ℃及20 ℃搖床培養(yǎng)96 h,測定發(fā)酵液中纖維素酶活性。
取10 ℃搖床培養(yǎng)96 h的發(fā)酵液,離心后得到粗酶液,分別在0 ℃、10 ℃、20 ℃、30 ℃、40 ℃、50 ℃及60 ℃的條件下進行酶促反應(yīng),40 min后用DNS法測酶活,確定酶促反應(yīng)最適溫度;將粗酶液分別在pH值為6.0、7.0、8.0、9.0、10.0及11.0的條件下進行酶促反應(yīng),40 min后用DNS法測酶活,確定酶促反應(yīng)最適pH值。
采用剛果紅法從82株南極嗜冷細菌中初篩到7株產(chǎn)纖維素酶的細菌。在平板培養(yǎng)基上進行剛果紅染色并脫色后,菌落周圍出現(xiàn)明顯透明圈。將此7株菌進行復(fù)篩,用DNS法測定發(fā)酵液的酶活性,比較7株菌產(chǎn)酶活性高低,最終確定菌株NJ64為產(chǎn)酶量最高的細菌。
將南極嗜冷菌NJ64的16S rDNA的PCR克隆子進行測序,獲得長度為1390 bp的16S rDNA序列,將此16S rDNA序列提交GenBank數(shù)據(jù)庫,獲得的序列注冊號為:HQ453988。將此序列與GenBank數(shù)據(jù)庫進行比較。結(jié)果表明,與菌株NJ64同源性較高的菌株均為假交替單胞菌屬(Pseudoalteromonassp.),其同源性均大于98.5%。16S rDNA序列同源性小于98%,可以認為屬于不同的種;同源性小于93%~95%,可以認為屬于不同的屬[5,6]。因此,通過16S rDNA序列的比較分析,判斷菌株NJ64應(yīng)屬于假交替單胞菌屬。用BioEdit軟件進行序列比對,采用Mega3.1軟件的鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果見圖1。
圖1 NJ64系統(tǒng)發(fā)育樹
由圖1可知,系統(tǒng)發(fā)育分析與16S rDNA的序列同源性比較結(jié)果相一致。菌株NJ64屬于交替單胞菌目(Alteromonadales),交替單胞菌科(Alteromonadaceae),假交替單胞菌屬(Pseudoalteromonassp.)。
2.3.1 培養(yǎng)時間對NJ64產(chǎn)酶的影響(圖2)
圖2 培養(yǎng)時間對NJ64產(chǎn)酶的影響
由圖2可知,隨著培養(yǎng)時間的延長,纖維素酶活性迅速上升,在72 h時達到最大值,而后酶活性逐漸下降。因此,確定NJ64產(chǎn)酶的最適培養(yǎng)時間為72 h。
2.3.2 初始pH值對NJ64產(chǎn)酶的影響(圖3)
圖3 初始pH值對NJ64產(chǎn)酶的影響
由圖3可知,pH值為7.5時,纖維素酶的活性最高。因此,確定NJ64產(chǎn)酶的最適初始pH值為7.5。
2.3.3 培養(yǎng)溫度對NJ64產(chǎn)酶的影響(圖4)
圖4 培養(yǎng)溫度對NJ64產(chǎn)酶的影響
由圖4可知,培養(yǎng)溫度為5~20 ℃時,纖維素酶活性變化不大;10~15 ℃范圍內(nèi)的酶活性相對較高。因此,確定NJ64產(chǎn)酶的最適培養(yǎng)溫度為10 ℃。
2.4.1 酶促反應(yīng)最適溫度
反應(yīng)溫度對纖維素酶活性的影響如圖5所示。
圖5 反應(yīng)溫度對纖維素酶活性的影響
由圖5可知,反應(yīng)溫度為10~40 ℃時,纖維素酶具有較高的活性,且酶活性隨反應(yīng)溫度的升高變化較為平緩,均保持在較理想水平;反應(yīng)溫度高于40 ℃后,纖維素酶活性急劇下降。因此,可以確定該纖維素酶的最適反應(yīng)溫度為40 ℃,屬于低溫酶[7]。
2.4.2 酶促反應(yīng)最適pH值
反應(yīng)pH值對纖維素酶活性的影響如圖6所示。
圖6 反應(yīng)pH值對纖維素酶活性的影響
由圖6可知,pH值為6.0~9.0時,隨pH值的增大,纖維素酶活性逐漸升高;pH值大于9.0后,酶活性急劇下降。因此,可以確定該纖維素酶的最適反應(yīng)pH值為9.0左右。
從82株南極嗜冷菌中篩選分離出1株高產(chǎn)低溫纖維素酶的南極細菌NJ64,經(jīng)16S rDNA鑒定屬于假交替單胞菌屬(Pseudoalteromonassp.);其在初始pH值7.5、10 ℃的環(huán)境中發(fā)酵培養(yǎng)72 h時產(chǎn)酶量最高;所產(chǎn)纖維素酶的最適酶促反應(yīng)pH值為9.0左右、最適反應(yīng)溫度為40 ℃,為典型的低溫纖維素酶。
目前在利用纖維素酶對廢棄纖維素物質(zhì)進行糖化時,常用的纖維素酶最適酶促反應(yīng)溫度(50 ℃左右)高于酵母的發(fā)酵溫度(37~40 ℃)[8],而本實驗篩選得到的低溫纖維素酶的酶促反應(yīng)溫度與酵母的發(fā)酵控制溫度范圍較為一致,可以將纖維素糖化與發(fā)酵同步進行生產(chǎn)乙醇,具有較好的應(yīng)用前景。
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