邢林林 郭茂祖 王娟
摘要: 進(jìn)化樹(shù)是推演生命歷史的一個(gè)重要工具。在構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)的所有算法中,基于進(jìn)化距離的算法是其中研究的重點(diǎn)。但是,這一方法較為嚴(yán)重地依賴著距離矩陣的質(zhì)量。人們開(kāi)發(fā)了多種基于生物事實(shí)的進(jìn)化模型來(lái)改進(jìn)距離矩陣的構(gòu)建過(guò)程,很大程度上提高了進(jìn)化距離的準(zhǔn)確性。同時(shí),也提出了許多方法來(lái)檢測(cè)距離矩陣的質(zhì)量。文中提出了基于模型的距離以及p距離,采用一種組合的新距離的方式來(lái)構(gòu)建距離矩陣。同時(shí)采用直接檢測(cè)距離矩陣的統(tǒng)計(jì)學(xué)計(jì)分方法以及構(gòu)建進(jìn)化樹(shù),對(duì)比實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明文中的方法實(shí)用且有效。
關(guān)鍵詞:
中圖分類號(hào):TP391文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào):2095-2163(2012)04-0035-06