國 果,吳建偉,吳沁怡,付 萍,張 勇
幾丁質(zhì)是構(gòu)成大多數(shù)真菌細胞壁的主要成分,同時也廣泛存在于節(jié)肢動物外殼和軟體動物中。它不僅是昆蟲的重要結(jié)構(gòu)組織,也是昆蟲防止機械損傷和生物危害的屏障。幾丁質(zhì)酶(chitinase)是幾丁質(zhì)降解酶系重要成員,屬于糖苷水解酶18家族GH18,能夠?qū)锥≠|(zhì)聚合物分解成殼糖乙糖苷和乙酰葡糖胺糖苷兩個部分[1]。該酶廣泛存在于各種真菌、植物、昆蟲和魚類等生物中。催化水解昆蟲幾丁質(zhì)的酶主要是幾丁質(zhì)酶,通過阻斷幾丁質(zhì)酶,可以阻止昆蟲蛻皮和圍食膜再生,以達到殺滅昆蟲的目的[2-3]。因此,研究獲取昆蟲來源的幾丁質(zhì)酶可以作為生物殺蟲劑來控制昆蟲和真菌病害。目前已克隆得到黑腹果蠅(Drosophila melanogaster)、岡比亞按蚊 (Anopheles gambiae)、赤擬谷盜(Tribolium castaneum)、家蠶(Bombyx mori)、埃及伊蚊(Aedes aegypti)等二十幾種昆蟲的幾丁質(zhì)酶基因cDNA[4-6]。
家蠅(Musca domestica)是世界性分布的衛(wèi)生昆蟲,從幼蟲到成蟲均生活在骯臟的環(huán)境中,是許多病原體的攜帶者,約60多種引起人類和動物疾病的病原體與家蠅有關(guān),包括傷寒、霍亂、痢疾、肺結(jié)核及一些寄生蟲病等。目前對家蠅的研究主要是集中在抗菌肽方面[7],對其幾丁質(zhì)酶的研究尚未見報道。本研究克隆了家蠅幾丁質(zhì)酶基因,并建立了體外表達系統(tǒng),對其序列進行生物信息學的分析,為進一步研究家蠅幾丁質(zhì)酶的酶學特性和有效利用奠定一定的基礎(chǔ)。
1.1.1 文庫、菌種及質(zhì)粒 家蠅三齡幼蟲全長cDNA質(zhì)粒文庫的構(gòu)建和EST測序及UniGene分析由北京華大合作完成。原核表達質(zhì)粒pET 28a(+)和大腸桿菌BL21(DE3)由中山大學引進本實驗室保存。
1.1.2 主要試劑及工具酶 Ex Taq酶(含dNTP),EcolⅠ、HindⅢ、T4DNA連接酶,DNA 標準(DL15,000,DL2,000)均購自大連寶生物工程公司;異丙硫代β-D半乳糖苷(IPTG)購自美國Promega公司;DNA凝膠回收試劑盒、質(zhì)粒純化試劑盒購自廣州鉑爾生物。
1.1.3 引物合成和DNA測序 基因擴增引物合成和重組質(zhì)粒DNA測序由Invitrogen上海生物技術(shù)有限公司完成。
1.2.1 家蠅幾丁質(zhì)酶基因Ⅰ(MDCⅠ)的識別及序列測定 對測定得到的家蠅三齡幼蟲EST序列進行BLASTX分析,從中篩選獲得編碼家蠅幾丁質(zhì)酶基因的文庫質(zhì)粒(編號為005-C09),命名為MDCⅠ。
1.1.2 MDCⅠ 基因的生物信息學分析 利用瑞士生物信息學研究所的蛋白分析專家系統(tǒng)(Expert Protein Analysis System,ExPASy)提供的生物信息學工具,分析預測蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)、修飾位點、信號肽、跨膜區(qū)及二級結(jié)構(gòu)等。
1.2.3 MDCⅠ 基因的擴增 根據(jù)已獲得的MDCⅠ編碼序列,利用DNA Club和Primer5.0設(shè)計引物。上游引物:5′GCCGAATTCTTTCTAGTGGTATGGCAGCAG 3′帶EcoRⅠ酶切位點;下游引物:5′GCGAAGCTTTCTGTTGGAATGATCAGT GG 3′,帶HindⅢ酶切位點。
以家蠅三齡幼蟲cDNA文庫中MDCⅠ基因的質(zhì)粒為模板,94℃預變性5min后,熱循環(huán)參數(shù)為94℃1min,59℃1min,72℃1min,共35個循環(huán),最后72℃延伸10min。PCR產(chǎn)物1%瓊脂糖凝膠電泳回收。
1.2.4 重組原核表達質(zhì)粒(pET 28a(+)-MDCⅠ)的構(gòu)建及鑒定 將PCR產(chǎn)物和原核表達質(zhì)粒pET 28a(+)經(jīng)EcoRⅠ、HindⅢ 雙酶切后回收,連接并轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL 21/DE3感受態(tài)細胞,卡那霉素篩選陽性克隆,對陽性克隆提取質(zhì)粒進行PCR,雙酶切和測序鑒定。
1.2.5 MDCⅠ基因在大腸桿菌BL 21/DE3中的誘導表達 取50μL培養(yǎng)過夜的陽性克隆菌液,加入含有卡那霉素的5mL LB培養(yǎng)基中(菌液/培養(yǎng)基為1/100),37℃220r/min振搖至 OD600=0.4~0.6時,加入IPTG至終濃度1mmol/L,誘導表達5h。離心收集菌體,在沉淀中加入100μL 1×SDS-PAGE上樣緩沖液,煮沸5min,13000r/min離心1min取上清10μL進行SDS-PAGE電泳分析。
2.1 序列分析 MDCⅠ基因與果蠅的同源基因氨基酸序列的一致性可達60%~70%,ORF全長753bp,編碼251個氨基酸(圖1),預測分子量為28.63kDa,理論等電點(pI值)5.78。含有3個半胱氨酸,在溶液中性質(zhì)穩(wěn)定。
MotifScan(模序)分析顯示,該蛋白含有1個N-糖基化位點,3個N-肉豆蔻?;稽c,6個蛋白激酶C磷酸化位點及1個幾丁質(zhì)酶的活性位點;由Signal P 3.0預測N端含有23個氨基酸殘基的信號肽;PredictProtein分析蛋白的拓撲結(jié)構(gòu)和二級結(jié)構(gòu)顯示,MDCⅠ蛋白有一個跨膜區(qū)位于aa6-aa16,Sec預測α螺旋(H)、β折疊(E)和無規(guī)則卷曲(L)的比例是:29.54:17.79:52.67,以無規(guī)則卷曲為主。
BLAST對其保守結(jié)構(gòu)域分析顯示,MDCⅠ中含有幾丁質(zhì)酶的保守結(jié)構(gòu)域和活性位點,屬于糖苷水解酶18家族(圖2)。
圖1 家蠅幾丁質(zhì)酶基因Ⅰ開放閱讀框cDNA序列及對應(yīng)編碼的氨基酸序列Fig.1 Full-length cDNA sequence of MDCⅠand the amino acid sequence encoded by the ORF
2.2 MDCⅠ基因擴增及原核重組質(zhì)粒的鑒定MDCⅠ基因經(jīng)PCR擴增后,獲得了800bp左右的特異條帶(圖3泳道1)。將重組質(zhì)粒進行雙酶切鑒定,產(chǎn)物進行1%瓊脂糖凝膠電泳。電泳結(jié)果顯示(圖3泳道3):重組質(zhì)粒雙酶切后,在800bp左右有一清晰的條帶,與目的基因的大小基本相符,提示重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。將挑選的陽性克隆子送Invitrogen公司,進一步以pET 28a(+)的通用引物對重組質(zhì)粒測序,結(jié)果表明相應(yīng)的插入序列與目的基因cDNA序列一致,證明MDCⅠ基因原核表達重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。
2.3 目的基因表達產(chǎn)物的SDS-PAGE鑒定 取重組菌誘導前后的表達產(chǎn)物進行SDS-PAGE,結(jié)果發(fā)現(xiàn)誘導的重組菌約在32kDa左右出現(xiàn)表達條帶,與目的蛋白預測的分子量(28.63kDa)加上所帶His標簽分子量(約3kDa)基本相符,而未誘導菌無此條帶(圖4)。
圖2 GenBank中MDCⅠ功能域分析Fig.2 Functional domain analysis of MDCⅠin GenBank
圖3 重組質(zhì)粒的雙酶切鑒定圖Fig.3 Identification of pET 28a(+)-MDCⅠby PCR amplification and restriction enzymes digestionM:DNA Marker DL 2000;1:PCR product of MDCⅠamplified from cDNA library of Musca domestica;2:pET 28a(+)digested by restriction enzymes EcoRⅠand HindⅢ;3:pET 28a(+)-MDCⅠdigested by restriction enzymes EcoRⅠand HindⅢ
圖4 重組質(zhì)粒pET 28a(+)-MDCⅠ在大腸桿菌的表達產(chǎn)物SDS-PAGE電泳分析1:蛋白質(zhì)分子量標準;2、3:IPTG誘導的表達產(chǎn)物;4、5:未誘導的表達產(chǎn)物箭頭所指為目標蛋白Fig.4 SDS-PAGE analysis on prokaryotic expression product of pET 28a(+)-MDCⅠM,1:Protein marker;2,3:BL21cell containing IPTG induced pET 28a(+) -MDCⅠ;4,5:BL21 cell containing uninduced pET 28a(+)-MDCⅠ
一種昆蟲體內(nèi)幾丁質(zhì)酶基因有1個還是多個在很長時間內(nèi)存在爭議,隨著昆蟲基因組測序的完成,Zhu Q等2004年首次報道在果蠅中有多個幾丁質(zhì)酶基因[8]。我課題組在對家蠅EST序列分析的過程中,也發(fā)現(xiàn)了家蠅體內(nèi)至少存在兩個幾丁質(zhì)酶基因,本研究選取了其中一個基因進行序列分析及克隆表達(另一個基因另文報道),命名為 MDCⅠ。MDCⅠ基因序列包含完整的開放閱讀框,為全長cDNA序列。序列分析顯示,該酶具有典型的幾丁質(zhì)酶結(jié)構(gòu)特征,從N端到C端依次含有信號肽、幾丁質(zhì)酶活性中心,編碼的氨基酸序列與18家族昆蟲幾丁質(zhì)酶有較高的相似性。一般認為,昆蟲幾丁質(zhì)酶分子量在40~85kDa之間,比植物幾丁質(zhì)酶(25~40kDa)和細菌幾丁質(zhì)酶(20~60kDa)大[9],而我們得到的MDCⅠ預測的蛋白分子量為28kDa左右,表達出的蛋白經(jīng)SDS-PAGE電泳也證實了其分子量與預測的分子量基本相符,提示家蠅幾丁質(zhì)酶分子量較其他昆蟲的小。
本研究將家蠅幾丁質(zhì)酶基因片段克隆到原核表達載體pET 28a(+)中,構(gòu)建重組質(zhì)粒pET 28a(+)/MDCⅠ,所獲得的重組質(zhì)粒經(jīng)過酶切、PCR和測序鑒定,證實含有目的基因片段,且連接、構(gòu)建正確。重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化入大腸桿菌BL 21/DE3,IPTG誘導表達,電泳顯示重組蛋白條帶非常清晰,表明重組蛋白得到了高效表達,本實驗結(jié)果為進一步研究MDCⅠ的生物學活性及表達模式奠定了基礎(chǔ)。
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