国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

外擾作用下細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)魯棒性實(shí)驗(yàn)研究

2011-09-02 07:47楊國平包家立朱朝陽浙江中醫(yī)藥大學(xué)信息技術(shù)學(xué)院杭州30053
關(guān)鍵詞:魯棒性穩(wěn)態(tài)擾動

楊國平 應(yīng) 磊 包家立* 朱朝陽(浙江中醫(yī)藥大學(xué) 信息技術(shù)學(xué)院,杭州 30053)

2(浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)部 浙江省生物電磁學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,杭州 310058)

引言

內(nèi)穩(wěn)態(tài)是生理學(xué)的一個(gè)重要理論,1932年美國生理學(xué)家坎農(nóng)(W.B.Cannon)在出版的《人體的智慧》一書中明確提出了內(nèi)穩(wěn)態(tài)(homeostasis)概念,被認(rèn)為是20世紀(jì)生理學(xué)最重要的理論之一。內(nèi)穩(wěn)態(tài)理論描述了生物體維持內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定的自我調(diào)節(jié)過程,揭示了生物體對環(huán)境變化的一種耐受限度,但沒有在數(shù)量上對耐受性加以闡述。內(nèi)穩(wěn)態(tài)的產(chǎn)生機(jī)制是負(fù)反饋,控制論創(chuàng)始人、美國數(shù)學(xué)家維納和生理學(xué)家羅森布呂特認(rèn)為,負(fù)反饋是保持穩(wěn)態(tài)的基本條件,穩(wěn)態(tài)是動態(tài)平衡的結(jié)果[1]。

魯棒性原是統(tǒng)計(jì)學(xué)中的一個(gè)專門術(shù)語,20世紀(jì)70年代初開始在控制理論領(lǐng)域研究,用以表征控制系統(tǒng)對系統(tǒng)特性或參數(shù)攝動的不敏感性。生物體作為一種由多組分、多層次、多尺度組成的高度復(fù)雜的控制系統(tǒng),具有控制系統(tǒng)的一般共性,其中內(nèi)穩(wěn)態(tài)就是控制理論所闡述的穩(wěn)定性,但生理學(xué)中的內(nèi)穩(wěn)態(tài)分析還缺乏控制理論的方法??刂评碚摫砻?,魯棒性是一切類型控制系統(tǒng)所必須考慮的一個(gè)基本問題。生物體遭受著外界環(huán)境變化而導(dǎo)致特性改變,因此魯棒性同樣也是生物系統(tǒng)分析中必須考慮的。

1997年,Barkai和Leibler首次報(bào)導(dǎo)了細(xì)菌趨化的生物魯棒性,說明細(xì)菌可以適應(yīng)化學(xué)誘導(dǎo)劑在一個(gè)較寬濃度范圍內(nèi)的變化,并且總是根據(jù)化學(xué)誘導(dǎo)劑濃度的變化來調(diào)節(jié)自身行為,認(rèn)為魯棒性是生物體的基本特性[2-3]。之后,關(guān)于生物魯棒性的研究逐漸增多,總結(jié)起來有幾個(gè)方向:一是以生物網(wǎng)絡(luò)為基礎(chǔ)的魯棒性研究,如生化網(wǎng)絡(luò)[4]、基因網(wǎng)絡(luò)[5]、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)[6]、p53網(wǎng)絡(luò)[7]等;二是以控制理論為基礎(chǔ)的方法學(xué)研究,如定量模型[8]、反饋控制[9-10]、非線性分岔[8,11-13]、魯棒區(qū)域[6,14-16]等;三是以生物物種為基礎(chǔ)的生物個(gè)案研究,如細(xì)菌[2-3,9]、p53基因[7]、盤基網(wǎng)柄菌[4]、體節(jié)極性基因[17]、血壓調(diào)節(jié)系統(tǒng)[18]等。Laub和Loomis提出的趨化盤基網(wǎng)柄菌細(xì)胞cAMP振蕩網(wǎng)絡(luò)模型,是目前方法學(xué)研究中用得較多的一種生物魯棒模型[4,8,13-17]。生物魯棒性對醫(yī)療技術(shù)的發(fā)展具有潛在的應(yīng)用價(jià)值,為腫瘤治療[19]和糖尿病治療[20]等提供了新思路。

穩(wěn)定是生物維生的基礎(chǔ),本研究以內(nèi)皮細(xì)胞為對象,用H2O2作為外源擾動劑,研究在外擾作用下細(xì)胞內(nèi)鈣穩(wěn)態(tài)魯棒性實(shí)驗(yàn)的技術(shù)路徑,為其他擾動劑(如電磁場)擾動生物系統(tǒng)穩(wěn)態(tài)的實(shí)驗(yàn)研究奠定基礎(chǔ)。研究表明,運(yùn)用控制理論分析生物系統(tǒng)的魯棒性是一種可行的方法。

1 原理

1.1 生物系統(tǒng)的數(shù)學(xué)描述

設(shè)生物系統(tǒng)是一個(gè)開放系統(tǒng),系統(tǒng)邊界將系統(tǒng)與環(huán)境分割開來,并且系統(tǒng)與環(huán)境通過系統(tǒng)邊界有物質(zhì)、能量、信息的交換,如圖1所示。生物系統(tǒng)運(yùn)行的狀況稱為狀態(tài),系統(tǒng)的行為通過狀態(tài)的獲取、保持和改變來體現(xiàn)。研究生物系統(tǒng)就是要研究系統(tǒng)所處的狀態(tài)、狀態(tài)可能的變化、不同狀態(tài)之間的轉(zhuǎn)移等,而生物系統(tǒng)狀態(tài)可以用一組狀態(tài)變量來表示,如生理或生化指標(biāo)。在一個(gè)穩(wěn)定的生物系統(tǒng)中,系統(tǒng)與環(huán)境之間的物質(zhì)、能量、信息交換保持著動態(tài)平衡,其生理行為是內(nèi)穩(wěn)態(tài)。當(dāng)外界擾動劑(簡稱擾動劑)改變了環(huán)境,生物系統(tǒng)與環(huán)境之間的物質(zhì)、能量、信息交換就發(fā)生變化,生物系統(tǒng)原有的內(nèi)穩(wěn)態(tài)可能被打破,也就是說生物系統(tǒng)狀態(tài)可能發(fā)生轉(zhuǎn)移。生物系統(tǒng)狀態(tài)是否轉(zhuǎn)移取決于擾動劑的強(qiáng)度,以及生物系統(tǒng)本身對擾動劑的耐受性,這種耐受性就是一種生物的魯棒性。當(dāng)擾動劑強(qiáng)度較大時(shí),如果生物系統(tǒng)的狀態(tài)不轉(zhuǎn)移,表明系統(tǒng)仍保持穩(wěn)定,可以判定該系統(tǒng)有較大的魯棒性。

圖1 生物系統(tǒng)與環(huán)境交互作用模型Fig.1 Model of interaction between biological system and environment

根據(jù)上述原理,設(shè)內(nèi)皮細(xì)胞內(nèi)鈣濃度[Ca2+]i為狀態(tài)x,雙氧水濃度[H2O2]為擾動劑量u。內(nèi)皮細(xì)胞所處的內(nèi)鈣狀態(tài)x及其可能的變化可以用動態(tài)非線性微分方程表示,有

式中,f(x,u,t)是x、u和時(shí)間t的非線性函數(shù)。

當(dāng)擾動劑不作用于細(xì)胞系統(tǒng)(u=0)時(shí),式(1)演變?yōu)闃?biāo)稱系統(tǒng),有

實(shí)際上,生物系統(tǒng)是一個(gè)時(shí)變系統(tǒng),系統(tǒng)狀態(tài)x、狀態(tài)變化率以及擾動劑u均隨時(shí)間t變化,式(1)和式(2)中的變量x和u均是t的函數(shù)。

1.2 Lyapunov穩(wěn)定性理論[21]

基于內(nèi)穩(wěn)態(tài)是生物系統(tǒng)與環(huán)境之間物質(zhì)、能量、信息交換動態(tài)平衡的結(jié)果,可以認(rèn)為生物系統(tǒng)是一種動力學(xué)系統(tǒng),具有動力學(xué)系統(tǒng)的一般特性。Lyapunov穩(wěn)定性理論是描述動力學(xué)系統(tǒng)穩(wěn)定性的理論,可以用來分析細(xì)胞內(nèi)鈣的穩(wěn)定性。設(shè)x=φ(t)是式(1)的解,定義在時(shí)間域(t0,∞)內(nèi),解初態(tài)為φ(t0);帶擾初態(tài)為x0=x(t0),對應(yīng)的軌線為x(t,t0,x0)。如果對于足夠小的ε>0,總有δ>0,使得只要

1)如果有

則稱解φ(t)是Lyapunov穩(wěn)定的,否則,稱φ(t)是Lyapunov不穩(wěn)定的。

2)如果t→∞,有

則稱解φ(t)是Lyapunov漸近穩(wěn)定的。

Lyapunov穩(wěn)定的物理意義:φ(t)是從解初態(tài)φ(t0)出發(fā)的式(1)解,x(t)是從帶擾初態(tài)x0=x(t0)(擾動的結(jié)果)出發(fā)的解。式(3)表示這兩種初態(tài)偏離小于δ,式(4)表示兩個(gè)解在全過程中每一時(shí)刻t的偏差都小于任意指定的小數(shù)ε。Lyapunov穩(wěn)定意味著只要擾動(初態(tài)偏離)足夠小,系統(tǒng)在時(shí)間域上的行為偏離也會足夠小。初值小的擾動只能引起軌線的小偏離,這樣系統(tǒng)就有能力保存自己并發(fā)揮功能。式(5)表示帶擾初態(tài)x0引起的軌線偏離隨時(shí)間延伸而趨于0,這種穩(wěn)定要求偏差最終完全消除,回到原定態(tài)。

1.3 魯棒性理論[22-23]

考慮式(1)的非線性系統(tǒng),擾動劑u的施加是依賴于系統(tǒng)狀態(tài)x(t),有

式中,θ[x(t)]稱為標(biāo)稱控制量。

事實(shí)上,擾動劑u包括加性擾動Φ和增益擾動Ψ(Φ和Ψ隨機(jī)),即

為了方便,統(tǒng)一記為

這樣,式(1)的系統(tǒng)在受到擾動劑作用后為

根據(jù)文獻(xiàn)[22],設(shè)式(1)系統(tǒng)在穩(wěn)態(tài)點(diǎn)的Lyapunov函數(shù)為V(x),則該系統(tǒng)必然存在一個(gè)擾動量集合,即

D={u:V(fs(x,t))-V(x)<0;?x≠0∈Rn,fs(x,t)}

2 實(shí)驗(yàn)方法

2.1 內(nèi)皮細(xì)胞傳代培養(yǎng)

細(xì)胞為永生化的人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞株(浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院病理與病理生理學(xué)系饋贈)。

2.1.1 復(fù)蘇

從-80℃冰箱中取出凍存的內(nèi)皮細(xì)胞,迅速置于37℃水浴鍋并不斷攪動。使凍存管中的凍存物在1min之內(nèi)融化。打開凍存管,將細(xì)胞懸液吸到離心管中。900r/min離心5min,棄去上清液。沉淀加適當(dāng)培養(yǎng)基胎牛血清(杭州四季青生物工程材料有限公司)后將細(xì)胞轉(zhuǎn)移至培養(yǎng)瓶中,37℃培養(yǎng)。

2.1.2 培養(yǎng)

待復(fù)蘇后的內(nèi)皮細(xì)胞在培養(yǎng)瓶是長成致密單層后,吸除瓶內(nèi)的舊培養(yǎng)液。取1mL含EDTA的0.25%胰酶(吉諾生物醫(yī)藥技術(shù)有限公司)溶液潤洗培養(yǎng)瓶,然后加入3mL胰酶溶液消化。當(dāng)在顯微鏡下觀察到細(xì)胞質(zhì)回縮、細(xì)胞間隙增大時(shí),加入含10%胎牛血清的RPMI.1640培養(yǎng)液(吉諾生物醫(yī)藥技術(shù)有限公司)和胰酶。用吸管輕輕反復(fù)吹打瓶壁細(xì)胞,使之從瓶壁脫離形成細(xì)胞懸液。900r/min離心細(xì)胞懸液,5min后棄去上清液。加入含10%胎牛血清的RPMI1640培養(yǎng)液,用吸管將沉淀重新制成細(xì)胞懸液。計(jì)數(shù)板計(jì)數(shù)后,把細(xì)胞懸液分成等份分裝入數(shù)個(gè)培養(yǎng)瓶中,或以1×105cells/皿的密度接種于35mm培養(yǎng)皿中(細(xì)胞復(fù)蘇第3代之后用于實(shí)驗(yàn)),接種24h后用于實(shí)驗(yàn)。

2.1.3 凍存

用含EDTA的0.25%胰酶溶液消化內(nèi)皮細(xì)胞,將細(xì)胞懸液收集至離心管中。900r/min離心5min,棄上清液。沉淀加入凍存保護(hù)液(含20%胎牛血清的RPMI.1640培養(yǎng)液+二甲基亞砜DMSO(美國Sigma公司),計(jì)數(shù),調(diào)整至5×106cells/mL左右。將懸液分至凍存管中,每管1mL。將凍存管口封嚴(yán),貼上標(biāo)簽,寫明細(xì)胞種類,凍存日期,放入-80℃冰箱中凍存。

2.2 細(xì)胞內(nèi)鈣測定

基礎(chǔ)細(xì)胞外液配制:NaCl(140mmol/L),MgCl2(1mmol/L),CaCl2(1.8mmol/L),HEPES(10mmol/L),葡萄糖(10mmol/L)。實(shí)驗(yàn)細(xì)胞外液為:在基礎(chǔ)細(xì)胞外液中,加1、10、30、50和100μmol/L五種不同劑量的H2O2作為擾動劑。

培養(yǎng)的內(nèi)皮細(xì)胞用基礎(chǔ)細(xì)胞外液漂洗2~3次,洗掉細(xì)胞表面的殘?jiān)棵蠹?xì)胞加入1mL熒光負(fù)載液(5μmol/LFluo-3/Am(美國Invitrogen公司)),37℃負(fù)載30min,再次用基礎(chǔ)細(xì)胞外液洗滌2~3次,充分洗掉沒有進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)的熒光探針,加入1mL基礎(chǔ)細(xì)胞外液,上機(jī)待測。

將負(fù)載好的細(xì)胞放在激光共聚焦顯微鏡(德國Leica)載物臺上,掃描條件為:激發(fā)波長488nm,物鏡20X,掃描速度為快速掃描,掃描密度512×512,掃描模式為時(shí)間序列掃描,掃描間隔時(shí)間Ts=3.6s。這樣,可以獲得細(xì)胞內(nèi)鈣變化的時(shí)序圖,細(xì)胞內(nèi)鈣濃度用熒光強(qiáng)度Fluo-3表示。

2.3 實(shí)驗(yàn)方法

取6皿細(xì)胞分別用于全局對照皿,1、10、30、50、100μmol/L劑量H2O2擾動實(shí)驗(yàn)。每個(gè)實(shí)驗(yàn)在加入擾動劑前,先記錄10min胞內(nèi)鈣熒光用于自身對照。然后,移開顯微鏡頭,加入擾動劑,再記錄50min胞內(nèi)鈣熒光。全局對照,連續(xù)記錄60min。

2.4 細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)圖繪制

根據(jù)文中1.3魯棒性理論,建立細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)圖作為魯棒性分析的基礎(chǔ)。將所獲得的細(xì)胞內(nèi)鈣時(shí)序圖分自身對照期(時(shí)長t=10min)、擾動期(t≤20s)和擾動響應(yīng)期(時(shí)長t=50min)3個(gè)時(shí)段。在采樣時(shí)刻t=0,Ts,2Ts,…,NTs(或采樣點(diǎn)0,1,2,…,N),獲得所對應(yīng)的細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)數(shù)據(jù)x(0),x(Ts),x(2Ts),…,x(NTs),組成細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)向量數(shù)據(jù)集為

式中,x(0),x(1),…,x(m)(mTs=10min)為自身對照期數(shù)據(jù)集;x(n),x(n+1),…,x(N)(NTsnTs=50min)為擾動響應(yīng)期數(shù)據(jù)集。x(m+1),…,x(n-1)為擾動期,即移開顯微鏡頭加入擾動劑所需的時(shí)間,其數(shù)據(jù)不參與分析。

這樣,細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)變化率數(shù)據(jù)集為

根據(jù)式(11)和式(12)的數(shù)據(jù)集,以細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)x為橫坐標(biāo)、細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)變化率為縱坐標(biāo),繪制-x的細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)圖。這樣,式(1)或式(2)系統(tǒng)是一種以x和為變量的二維系統(tǒng)。

2.5 標(biāo)稱系統(tǒng)穩(wěn)態(tài)點(diǎn)和穩(wěn)定域的實(shí)驗(yàn)確定

根據(jù)式(2),標(biāo)稱系統(tǒng)是指加擾動劑前的細(xì)胞系統(tǒng)。研究細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)的前提是:細(xì)胞在遭受外源因素?cái)_動前,標(biāo)稱系統(tǒng)是穩(wěn)定的。用以下方法,對標(biāo)稱系統(tǒng)的穩(wěn)定性作定量判斷。

在自身對照期,取細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)x在所遍歷時(shí)間(0,mTs)內(nèi)的均值xe和方差σ2分別為

式中,xe為穩(wěn)態(tài)點(diǎn),表征標(biāo)稱系統(tǒng)在遍歷時(shí)間(0,mTs)內(nèi)細(xì)胞內(nèi)鈣所處的穩(wěn)態(tài)。

由于式(2)標(biāo)稱系統(tǒng)是二維系統(tǒng),根據(jù)Lyapunov穩(wěn)定性和魯棒性理論,其穩(wěn)定點(diǎn)是一種封閉軌道線形成的中心點(diǎn)。該中心點(diǎn)是一個(gè)以(xe,0)為中心,以

為半徑的圓域A,K為置信系數(shù),且Lyapunov穩(wěn)定。因此,該圓域A即為穩(wěn)定域。

2.6 擾動作用下細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)轉(zhuǎn)移的實(shí)驗(yàn)判斷

在擾動響應(yīng)期(nTs,NTs),細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)x是關(guān)于以帶擾初態(tài)x0=x(t0)=xe為起點(diǎn),在遍歷時(shí)間(nTs,NTs)內(nèi)對應(yīng)的軌線x(t,t0,xe)。該軌線的每一個(gè)采樣點(diǎn)(x(i),(i))(i=n,n+1,…,N)距離標(biāo)稱系統(tǒng)穩(wěn)定點(diǎn)中心(xe,0)的距離為

如果r’<r,可以判斷細(xì)胞在遭受擾動劑作用后,內(nèi)鈣狀態(tài)仍保持在穩(wěn)定域A內(nèi),是Lyapunov穩(wěn)定的。否則,可以判斷細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)發(fā)生轉(zhuǎn)移。

2.7 擾動劑穩(wěn)定魯棒域的實(shí)驗(yàn)確定

對6皿細(xì)胞分別編號1~6號,其中1號為全局對照,2~6號分別為1、10、30、50、100μmol/L劑量H2O2擾動。每皿分別選擇8個(gè)細(xì)胞做記錄,每個(gè)細(xì)胞通過自身對照期確定了穩(wěn)態(tài)點(diǎn)(xe,0)和穩(wěn)定域A。擾動響應(yīng)期內(nèi)每一個(gè)細(xì)胞的內(nèi)鈣狀態(tài)x均為以帶擾初態(tài)x(t0)=xe為起點(diǎn)的一條軌線x(t,t0,xe)。每種劑量的擾動均對應(yīng)8條這種軌線,判斷每條軌線是否處于Lyapunov漸進(jìn)穩(wěn)定。

若軌線x(t,t0,xe)處于Lyapunov穩(wěn)定,表明該擾動劑劑量對該細(xì)胞作用在穩(wěn)定魯棒域D內(nèi),否則,不在D內(nèi)。若軌線x(t,t0,xe)處于Lyapunov漸進(jìn)穩(wěn)定,表明該劑量的擾動劑對該細(xì)胞作用在穩(wěn)定魯棒域D邊界。這樣,以進(jìn)入Lyapunov漸進(jìn)穩(wěn)定所對應(yīng)的擾動劑劑量確定為穩(wěn)定魯棒域D。

3 結(jié)果與討論

3.1 鈣熒光負(fù)載

內(nèi)皮細(xì)胞經(jīng)熒光探針Fluo-3/AM負(fù)載30min后,進(jìn)行鈣熒光強(qiáng)度測定??梢姛晒庳?fù)載的背景值低,熒光在細(xì)胞中負(fù)載均勻,胞體清晰可見。同一皿中的細(xì)胞初始熒光強(qiáng)度并不一致,表明對不同細(xì)胞初始胞內(nèi)濃度[Ca2+]i是不相等的。

3.2 標(biāo)稱系統(tǒng)的內(nèi)穩(wěn)態(tài)與穩(wěn)定域

按式(13)~式(16)獲得6皿48個(gè)細(xì)胞在遭受擾動劑作用前,細(xì)胞內(nèi)鈣的穩(wěn)態(tài)點(diǎn)xe和穩(wěn)定域r如表1所示。這48個(gè)細(xì)胞自然生長條件相同(即來源于同一種源,在同一環(huán)境中培養(yǎng)),然而,細(xì)胞內(nèi)鈣的穩(wěn)態(tài)點(diǎn)卻從0.709到8.189不等,相差1個(gè)數(shù)量級,表明不同細(xì)胞即使在同一條件下生長,其內(nèi)鈣狀態(tài)有較大的差別,表現(xiàn)出強(qiáng)烈的個(gè)體差異。另一方面,穩(wěn)定域半徑從0.654到2.650不等分布,相差3倍,表明這48個(gè)細(xì)胞的穩(wěn)定性較好,可以排除后續(xù)擾動實(shí)驗(yàn)中細(xì)胞不穩(wěn)定對結(jié)果的影響。

根據(jù)控制理論,穩(wěn)定域半徑r是一種歐幾里得范數(shù)(2-范數(shù)),具有齊次性。因此,我們根據(jù)本例實(shí)際設(shè)置式(16)中置信系數(shù)K=2。

3.3 擾動作用下細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)轉(zhuǎn)移

圖2是6個(gè)細(xì)胞皿中其中一個(gè)細(xì)胞內(nèi)鈣的全景時(shí)序圖和相應(yīng)的狀態(tài)圖,一張完整的全景時(shí)序圖有自身對照期(0~mTs)、擾動期((m+1)Ts~(n-1)Ts)和擾動響應(yīng)期(nTs~NTs)3個(gè)時(shí)期。從時(shí)序圖中可見:當(dāng)按2.3實(shí)驗(yàn)方法移開鏡頭加擾動劑期間,細(xì)胞熒光為0,對應(yīng)的狀態(tài)圖回到了原點(diǎn)。

表1 內(nèi)皮細(xì)胞內(nèi)鈣穩(wěn)態(tài)與魯棒性Tab.1 Inner calcium homeostasis and robustness domain of H2O2on endothelial cells

用式(17)可以判斷2~6號細(xì)胞皿中共40個(gè)細(xì)胞內(nèi)鈣穩(wěn)定狀態(tài)如表1所示。結(jié)果表明:1μmol/L擾動劑擾動內(nèi)皮細(xì)胞,在8個(gè)細(xì)胞中,4個(gè)細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)穩(wěn)定,4個(gè)漸近穩(wěn)定,表明1μmol/L擾動劑不足以引起細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)的變化。10μmol/L擾動劑擾動,8個(gè)細(xì)胞中,有3個(gè)細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)穩(wěn)定,2個(gè)漸近穩(wěn)定,3個(gè)不穩(wěn)定,表明10μmol/L已經(jīng)可以擾動使一些細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)不穩(wěn)定。30μmol/L擾動劑擾動,8個(gè)細(xì)胞中,只有1個(gè)細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)穩(wěn)定,1個(gè)漸近穩(wěn)定,6個(gè)不穩(wěn)定,表明30μmol/L已經(jīng)使多數(shù)細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)不穩(wěn)定。50和100μmol/L擾動,全部細(xì)胞狀態(tài)均不穩(wěn)定,表明這兩個(gè)劑量的擾動劑已經(jīng)足以使細(xì)胞內(nèi)鈣狀態(tài)轉(zhuǎn)移。

表1結(jié)果顯示,細(xì)胞內(nèi)鈣初態(tài)x0=xe較小或較大的細(xì)胞受擾動后內(nèi)鈣狀態(tài)有的穩(wěn)定或漸進(jìn)穩(wěn)定,有的不穩(wěn)定。表明初態(tài)x0=xe對細(xì)胞受擾后狀態(tài)穩(wěn)定性影響不大。

3.4 擾動劑的穩(wěn)定魯棒域

圖2 細(xì)胞內(nèi)鈣的全景時(shí)序圖(左)及其狀態(tài)圖(右):(a)對照;(b)1μmol/L;(c)10μmol/L;(d)30μmol/L;(e)50μmol/L;(f)100μmol/L。Fig.2 Whole time sequence(left)and state-chart(right)of inner calcium on the endothelial cells,(a)control;(b)1μmol/L;(c)10μmol/L;(d)30μmol/L;(e)50μmol/L;(f)100μmol/L。

從表1可見,1μmol/L的擾動劑可以使4個(gè)細(xì)胞發(fā)生漸進(jìn)穩(wěn)定,表明1μmol/L擾動劑是這4個(gè)細(xì)胞可能的魯棒域。10μmol/L擾動劑可以使2個(gè)細(xì)胞漸近穩(wěn)定,表明10μmol/L擾動劑是這2個(gè)細(xì)胞可能的魯棒域。30μmol/L擾動劑可以使1個(gè)細(xì)胞漸近穩(wěn)定,表明30μmol/L擾動劑是這個(gè)細(xì)胞可能的魯棒域。從而可得,穩(wěn)定魯棒域D與細(xì)胞個(gè)體有關(guān),并且不同細(xì)胞個(gè)體所對應(yīng)的D差別較大,進(jìn)一步表明個(gè)體差異對穩(wěn)定魯棒域D的影響。

另一方面,對內(nèi)皮細(xì)胞群體來說,超過50μmol/L的擾動劑均不能使細(xì)胞狀態(tài)回到標(biāo)稱系統(tǒng)的穩(wěn)定點(diǎn),這表明內(nèi)皮細(xì)胞種族的內(nèi)鈣穩(wěn)態(tài)魯棒域D至少在50μmol/L以內(nèi)。因此,實(shí)驗(yàn)表明內(nèi)皮細(xì)胞種族的穩(wěn)態(tài)魯棒域D至少在50μmol/L以內(nèi),但個(gè)體的穩(wěn)態(tài)魯棒域D需因個(gè)體而定。

4 結(jié)論

通過以用H2O2擾動內(nèi)皮細(xì)胞內(nèi)鈣穩(wěn)態(tài)為例,證明利用控制理論的結(jié)論設(shè)計(jì)生物魯棒性實(shí)驗(yàn),以及用Lyapunov穩(wěn)定性理論和魯棒性理論實(shí)現(xiàn)細(xì)胞內(nèi)鈣穩(wěn)態(tài)定量化分析是一種有效的方法。

[1]維納,著.控制論(關(guān)于在動物和機(jī)器中控制和通信的科學(xué))[M].北京:北京大學(xué)出版社,2007:13-30,83-96.

[2]Barkai N,Leibler S.Robustness in simple biochemical networks[J].Nature,1997,387:913-917.

[3]Alon U,Surette MG,Barkai N,et al.Robustness in bacterial chemotaxis[J].Nature,1999,397:168-171.

[4]Laub MT,Loomis WF,A molecular network that produces spontaneous oscillations in excitable cells of dictyostelium[J].Mol.Biol.Cell,1998,9:3521-3532.

[5]Von Dassow G,Meir E,Munro EM,et al.The segment polarity network is a robust developmental module[J].Nature,2000,406:188-192.

[6]Meir E,vonDassow G,Munro EM,et al.Robustness,flexibility,and the role of lateral inhibition in the neurogenic network[J].Curr Biol,2002,12:778-786.

[7]Dartnella L,Simeonidisb E,Hubankc M,et al.Robustness of the p53 network and biological hackers[J].FEBS,2005,579:3037-3042.

[8]Ma L,Iglesias PA.Quantifying robustness of biochemical network models[J].BMC Bioinformatics,2002,3:38.

[9]Yi TM,Huang Y,Simon MI,et al.Robust perfect adaptation in bacterial chemotaxis through integral feedback control[J].PNAS,2000,97(9):4649-4653.

[10]Freeman M.Feedback control of intercellular signalling in development[J].Nature,2000,408:313-9.

[11]Radde N.The impact of time delays on the robustness of biological oscillators and the effect of bifurcations on the inverse problem[J],EURASIP J Bioin for Sys Biol,2009,2009:1-14.

[12]Borisuk MT,Tyson JJ,Bifurcation analysis of a model of mitotic control in frog eggs[J].J Theor Biol,1998,195:69-85.

[13]Apri M,Molenaar J,Gee M,et al.Efficient estimation of the robustness region of biological models with oscillatory behavior[J].PLoS ONE,2010,5(4):e9865.

[14]Kim J,Bates DG,Postlethwaite I,et al.Robustness analysis of biochemical network models[J].IEE Proc Syst Biol,2006,153(3):96-104.

[15]Kitano H,Cancer as a robust system:implications for anticancer therapy[J].Nature Reviews,2004,4:227-235.

[16]朱炳,包家立,應(yīng)磊.生物魯棒性的研究進(jìn)展[J].生物物理學(xué)報(bào),2007,23(5):357-362.

[17]Chen BS,Wang YC,Wu WS,et al.A new measure of the robustness of biochemical networks[J],Bioinformatics,2005,21(11):2698-2705.

[18]毛連根,朱朝陽,包家立,等.一種血壓反饋控制系統(tǒng)的狀態(tài)分析方法[J].中國生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)報(bào),2010,29(2):259-264.

[19]Kitano H,Cancer as a robust system:implications for anticancer therapy[J].Nature Reviews,2004,4:227-235.

[20]Kitano H,Oda K,Kimura T,et al.Metabolic syndrome and robustness tradeoffs[J].Diabetes,2004,53(Suppl 3):S6-S15.

[21]苗東升,著.系統(tǒng)科學(xué)精要[M].北京:中國人民大學(xué)出版社,1998:62-68.

[22]De Nicolao G,Magni L,Scattolini R,On the Robustness of receding-horizon control with terminal cnonstraints[J].IEEE Trans Automatic Control,1996,41(3):451-453.

[23]李陽春,許曉鳴,楊煜普.一類非線性預(yù)測控制系統(tǒng)的魯棒穩(wěn)定性[J].自動化學(xué)報(bào),1999,25(6):852-855.

猜你喜歡
魯棒性穩(wěn)態(tài)擾動
Bernoulli泛函上典則酉對合的擾動
可變速抽水蓄能機(jī)組穩(wěn)態(tài)運(yùn)行特性研究
碳化硅復(fù)合包殼穩(wěn)態(tài)應(yīng)力與失效概率分析
一類四次擾動Liénard系統(tǒng)的極限環(huán)分支
帶擾動塊的細(xì)長旋成體背部繞流數(shù)值模擬
電廠熱力系統(tǒng)穩(wěn)態(tài)仿真軟件開發(fā)
武漢軌道交通重點(diǎn)車站識別及網(wǎng)絡(luò)魯棒性研究
荒漠綠洲區(qū)潛在生態(tài)網(wǎng)絡(luò)增邊優(yōu)化魯棒性分析
元中期歷史劇對社會穩(wěn)態(tài)的皈依與維護(hù)
(h)性質(zhì)及其擾動