劉 濤 ,李建瑞 ,嚴(yán)江偉 ,李玲香 ,王利偉 ,
1.北京市垂楊柳醫(yī)院耳鼻咽喉科,北京 100022;2.中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所,北京 100029;3.內(nèi)蒙古醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院耳鼻喉科,內(nèi)蒙古呼和浩特 010059
耳聾是最常見的殘疾之一,其發(fā)病率高、病因復(fù)雜、治療困難,給個(gè)人、家庭及社會(huì)帶來(lái)巨大的壓力和沉重的負(fù)擔(dān)。據(jù)各國(guó)統(tǒng)計(jì),每1000名新生兒中,有1~3例聽力障礙兒童,其中至少一半與遺傳因素有關(guān)。研究表明,線粒體(mtDNA)12SrRNA基因A1555G點(diǎn)突變能引起氨基糖苷類藥物敏感性耳聾(aminoglycoside antibiotics induced deafness,AAID)[1],占遺傳性聾1%~2%[2]。目前國(guó)內(nèi)用于檢測(cè)線粒體 12S rRNA基因第1555位A>G均質(zhì)性突變的方法為:PCR擴(kuò)增線粒體DNA片段,限制性內(nèi)切酶分析(RFLP)和 DNA序列分析[3]。本文采用常規(guī)流行病學(xué)的研究方法結(jié)合分子生物學(xué)的手段,于2006年7月~2010年10月對(duì)內(nèi)蒙古鄂爾多斯市特殊教育學(xué)校102名非綜合征型感音神經(jīng)性耳聾患者的mtDNA A1555G點(diǎn)突變進(jìn)行檢測(cè),以了解耳聾和該突變的關(guān)系。
選擇內(nèi)蒙古鄂爾多斯市特殊教育學(xué)校學(xué)生102例。這些學(xué)生從內(nèi)蒙古鄂爾多斯市下屬的各個(gè)旗、縣招生。其中,男56例,女46例;年齡6~23歲,平均15.65歲;蒙古族10例,漢族92例。
1.2.1 病史資料采集 首先,通過(guò)學(xué)校給家長(zhǎng)或監(jiān)護(hù)人發(fā)放知情同意書;然后由學(xué)生和家長(zhǎng)共同填寫調(diào)查問卷。問卷包括患者的一般情況,如姓名、性別、出生年月;特別要關(guān)注患者的耳聾病史、家族中是否有同樣的耳聾患者、是否用過(guò)耳毒性藥物、耳聾是否與外傷有關(guān)、是否患過(guò)腮腺炎等可以引起耳聾的傳染病疾病史。對(duì)患者的耳鼻喉科進(jìn)行正規(guī)的??茩z查和聽力學(xué)評(píng)估。對(duì)所有患者行純音測(cè)聽和聲導(dǎo)抗檢查。在學(xué)校對(duì)所有患者抽取外周靜脈血3 ml,低溫冷凍保存。在實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行全基因組DNA的提取,然后進(jìn)行A1555G點(diǎn)突變的篩查。
1.2.2 基因組DNA的制備 用DNA提取試劑盒(QIA amp DNA Blood Mini Kit 250)提取耳聾患者的全基因組DNA,取適量用紫外分光光度計(jì)進(jìn)行純度檢測(cè),將提取的DNA置于-80℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3 引物設(shè)計(jì)與合成 用Primer 3 input數(shù)據(jù)庫(kù)設(shè)計(jì)引物,引物由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。正向引物序列:5'-CCGCCATCTTCAGCAAACCCTG-3';反向引物序列:5'-TAGTAAGGTGGAGTGGGTTTGG-3'。
1.2.4 PCR擴(kuò)增 PCR反應(yīng)體系包括1×PCR緩沖液、1.5 mmol/L MgCl2、0.2 mmol/L dNTPs、0.2 mol/L 正反向引物、40 ng 基因組DNA、1U TaqDNA聚合酶(PCR反應(yīng)試劑均為北京Fermentas公司產(chǎn)品),去離子滅菌水補(bǔ)足至20 μl。PCR反應(yīng)在 DNA熱循環(huán)儀(BIO RAD PTC-200,美國(guó)BIO RAD公司)上進(jìn)行。反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性 3 min,95℃變性 30 s,62℃退火 30 s,72℃延伸 30 s,經(jīng) 30個(gè)循環(huán),最后 72℃延伸 10 min。4℃保存。PCR產(chǎn)物 4 μl與1 μl溴酚藍(lán)混合,1.5%瓊脂糖凝膠電泳(120 V,40 min),DL2000 DNA Ladder(北京天根公司)標(biāo)記,化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)下進(jìn)行PCR產(chǎn)物鑒定。
1.2.5 限制性內(nèi)切酶分析 酶切總體系30 μl,針對(duì)mtDNA 12SrRNA的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證后取10 μl,加入Alw26I(酶切位點(diǎn):5'-GAGAC)限制性內(nèi)切酶(北京 Fermentas公司)1 μl,Buffer Tango 緩沖液 2 μl,去離子滅菌水補(bǔ)足至30 μl。酶切條件:37℃水浴箱中溫育消化過(guò)夜,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證,酶切切開者為150 bp和295 bp兩個(gè)條帶,為突變陰性;如只見445 bp的一個(gè)條帶,說(shuō)明存在mtDNA A1555G突變;均設(shè)陽(yáng)性和陰性對(duì)照。不能切開的或是酶切顯示不清的送測(cè)序驗(yàn)證。
1.2.6 DNA序列測(cè)定 擴(kuò)增出的PCR產(chǎn)物經(jīng)QIAGEN PCR純化試劑盒純化,純化產(chǎn)物經(jīng)電泳證實(shí)后,再做Cycle Sequencing反應(yīng)。用擴(kuò)增模扳的引物行測(cè)序反應(yīng),然后在3100毛細(xì)管測(cè)序儀上該片段進(jìn)行DNA序列測(cè)定。取DNA庫(kù)內(nèi)正常人混合基因組DNA做正、反向測(cè)序,作為單鏈DNA測(cè)序的陽(yáng)性對(duì)照。 反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性 2 min,95℃變性 10 s,50℃退火5 s,60℃延伸4 min,循環(huán)25次。反應(yīng)產(chǎn)物用Gentri-Sep Spin columns除去過(guò)量的dye terminators保證反應(yīng)產(chǎn)物適合在3100毛細(xì)管測(cè)序儀內(nèi)進(jìn)行。測(cè)序結(jié)果經(jīng)過(guò)3100測(cè)序分析系統(tǒng)軟件進(jìn)行分析。
聾啞學(xué)校的102例非綜合征型耳聾患者中,三代人中可發(fā)現(xiàn)2例耳聾患者的有11例,1例是父母近親結(jié)婚,其余均為散發(fā)性耳聾。
極重度聾占大多數(shù),共89例,其次是重度聾,共10例,中度聾和中重度聾3例。聲導(dǎo)抗測(cè)試:鼓室壓圖:大多數(shù)為A型鼓室曲線共58例;其次是As型鼓室曲線共30例;B型鼓室曲線共13例;Ad型鼓室曲線僅有1例。鐙骨肌反射:57例雙耳都沒有引出鐙骨肌反射,31例可引出鐙骨肌反射者,但反應(yīng)閾較高,另外14例聽力較好耳可引出鐙骨肌反射。1.5歲以下發(fā)現(xiàn)耳聾82例,1.5~5.0歲發(fā)現(xiàn)耳聾20例。
用氨基糖苷類抗生素后發(fā)現(xiàn)耳聾54例。其中以使用慶大霉素最多見為33例,其次是鏈霉素共13例??敲顾嘏c上述二種藥物聯(lián)合使用2例。三種藥物兩兩聯(lián)合使用5例,三種聯(lián)合使用1例。因感冒發(fā)熱使用48例,其他病因使用6例。
本實(shí)驗(yàn)擴(kuò)增的片段是從線粒體基因核苷酸1261到1705,PCR產(chǎn)物共有445 bp。含有GAGAC核苷酸序列的DNA片段可被限制性內(nèi)切酶Alw26I識(shí)別。如果發(fā)生突變,這個(gè)識(shí)別位點(diǎn)消失,PCR產(chǎn)物不被酶切,經(jīng)該酶孵育過(guò)的電泳檢測(cè)仍為445 bp一條帶;如果未發(fā)生突變,擴(kuò)增產(chǎn)物被酶切后就被分為295 bp和150 bp兩個(gè)片段。7例患者的PCR產(chǎn)物經(jīng)Alw26I酶切后無(wú)識(shí)別位點(diǎn)的丟失,電泳檢測(cè)為一條445 bp的帶,陽(yáng)性率是6.9%(7/102),有氨基糖苷類用藥史54例,該點(diǎn)突變的發(fā)生率為13.0%(7/54)。部分病例酶切結(jié)果見圖1。
圖1 部分病例酶切結(jié)果
7例存在線粒體基因A1555G位點(diǎn)突變,與酶切結(jié)果相吻合。見圖2。
人類線粒體是一個(gè)雙鏈閉環(huán)分子,由16569 bp的核苷酸序列組成。與其他細(xì)胞器諸如溶酶體和過(guò)氧化物酶等特化膜結(jié)構(gòu)相比,線粒體具有自己的遺傳物質(zhì),因而是一種半自主復(fù)制體。這是指mtDNA能夠獨(dú)立地復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯[4-5]。當(dāng)mtDNA出現(xiàn)突變時(shí),核苷酸序列和空間結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,導(dǎo)致mtDNA亞單位rRNA的結(jié)構(gòu)與細(xì)菌蛋白核糖體的結(jié)構(gòu)極為相似,改變了結(jié)構(gòu)的rRNA與氨基糖苷類抗生素有極高的親和力。而野生型rRNA卻不能與氨基糖苷結(jié)合[6]。這是氨基糖苷類抗生素致聾的的機(jī)制之一。
在臨床工作中,有的患者由于患有結(jié)核病等原因,使用氨基糖苷類抗生素可達(dá)3個(gè)月之久,卻沒有發(fā)生聽力下降;有些患者僅用了少量的氨基糖苷類抗生素,結(jié)果發(fā)生了極為嚴(yán)重的聽力下降而導(dǎo)致聾啞癥??梢妭€(gè)體對(duì)氨基糖苷類抗生素的敏感性有巨大的差異性,這是由基因決定的。本研究資料也說(shuō)明,該地區(qū)有明顯的抗生素濫用傾向,只要有發(fā)熱就使用氨基糖苷類抗生素。因此,停止濫用抗生素對(duì)降低耳聾的發(fā)生也是非常有效的方法之一。由于本研究有7例患者存在mtDNA A1555G點(diǎn)突變,全部有氨基糖苷類抗生素用藥史,說(shuō)明mtDNA A1555G點(diǎn)突變是他們患病的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。但是,另外的47例卻沒有檢測(cè)到該位點(diǎn)的的突變,不能排除mtDNA其他位點(diǎn)的突變;如線粒體A7445G點(diǎn)突變,C1494T等的點(diǎn)突變[2-7]。也不能排除核基因的調(diào)控和環(huán)境因素的影響。賈婧杰等[8]對(duì)山東省濱州市特教學(xué)校74例耳聾學(xué)生進(jìn)行了12S rRNA基因A1555G點(diǎn)突變的檢測(cè),5例為陽(yáng)性,陽(yáng)性率為6.76%(5/74)與本文結(jié)果一致。該群體線粒體A1555G位點(diǎn)的突變率高于以往的報(bào)道,攜帶有該突變的個(gè)體對(duì)氨基糖苷類抗生素有高度易感性,因此該基因突變是感音神經(jīng)性耳聾的原因之一。鮑曉林等[9]對(duì)西北地區(qū)245例患者行A1555G點(diǎn)突變檢測(cè),86例有氨基糖苷類藥物應(yīng)用史,檢測(cè)到21例線粒體DNA 12SrRNA A1555G同質(zhì)型突變,突變檢出率為24.4%(21/86);在東北地區(qū)188例患者中,66例有氨基糖苷類藥物應(yīng)用史,檢測(cè)到2例同質(zhì)型突變,1例異質(zhì)性突變,突變檢出率為4.5%(3/66)。兩地區(qū)比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,西北地區(qū)線粒體DNA 12SrRNA A1555G突變檢出率顯著高于東北地區(qū)。
由于本次研究只針對(duì)內(nèi)蒙古鄂爾多斯聾啞學(xué)校學(xué)生進(jìn)行檢測(cè),這些學(xué)生大多為重度-極重度非綜合征型耳聾患者,而本文只檢測(cè)了mtDNA A1555G突變,還應(yīng)有該基因其他位點(diǎn)的突變。所以內(nèi)蒙古鄂爾多斯地區(qū)的線粒體基因突變的頻率應(yīng)該高于單個(gè)點(diǎn)突變6.9%的比率。這一地區(qū)mtDNA高突變率的遺傳學(xué)因素,氨基糖苷類藥物的高使用率是這一地區(qū)高聾啞癥發(fā)生率的原因。因此,氨基糖苷類抗生素的使用應(yīng)該非常慎重,對(duì)非用不可的患者要仔細(xì)詢問其耳聾家族史,進(jìn)行mtDNA A1555G點(diǎn)突變的檢測(cè),對(duì)該位點(diǎn)陰性的個(gè)體先行常見其他位點(diǎn)的檢測(cè),必要時(shí)行全部基因組mtDNA的檢測(cè)。如果有mtDNA的點(diǎn)突變則避免使用氨基糖苷類抗生素,防止人為因素造成的聽力損害。這對(duì)防聾將產(chǎn)生重大而深遠(yuǎn)的意義。
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