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多環(huán)芳烴氣相色譜保留指數(shù)與結(jié)構(gòu)參數(shù)的定量關(guān)系

2011-06-04 05:56戴益民黃可龍李潯曹忠曾巨瀾
關(guān)鍵詞:鄰接矩陣分子結(jié)構(gòu)芳烴

戴益民 ,黃可龍,李潯 ,曹忠 ,曾巨瀾

(1. 中南大學(xué) 化學(xué)化工學(xué)院,湖南 長沙,410083;

2. 長沙理工大學(xué) 電力與交通材料保護(hù)湖南省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,湖南 長沙,410004;3. 長沙理工大學(xué) 化學(xué)與生物工程學(xué)院,湖南 長沙,410004)

煤、石油以及有機(jī)質(zhì)不完全燃燒產(chǎn)生大量的多環(huán)芳烴化合物,由于它們大多在環(huán)境中的化學(xué)穩(wěn)定性高,水溶性低且長期殘留,因而具有潛在的致癌、致畸和致突變作用,對環(huán)境的危害極大。如何在多環(huán)芳烴異構(gòu)體尚難以獲得標(biāo)識化合物且缺乏其普遍的色譜數(shù)據(jù)的情況下簡捷而又快速地對其生物毒性和環(huán)境行為進(jìn)行預(yù)測,篩選出具有潛在危害的化學(xué)品成為重要的研究課題[1-2]。氣相色譜保留指數(shù)是進(jìn)行色譜定性分析的基礎(chǔ),當(dāng)固定相一定時,化合物在色譜柱上的保留行為與分子結(jié)構(gòu)及其化學(xué)和電性特征密切相關(guān);因此,根據(jù)分子結(jié)構(gòu)特征建立定量結(jié)構(gòu)-色譜保留關(guān)系(QSRR)對預(yù)測化合物的保留指數(shù)、選擇色譜分離條件以及探索色譜保留機(jī)制是非常有效的途徑。隨著QSRR 技術(shù)日益被重視,已有很多研究利用拓?fù)?、電性和幾何特征等對化合物分子進(jìn)行結(jié)構(gòu)描述,并建立分子結(jié)構(gòu)-色譜保留之間的定量相關(guān)模型來預(yù)測化合物的色譜保留指數(shù)[3-8],但QSRR主要集中用于烷烴、烯烴、醇和胺類化合物的研究,而用于多環(huán)芳烴化合物的研究較少[9-10]。鑒于此,本文作者選擇 100個多環(huán)芳烴化合物為研究對象,在分子距離矩陣和鄰接矩陣的基礎(chǔ)上提取出表征多環(huán)芳烴分子支化度的描述子CN和表征多環(huán)芳烴分子結(jié)構(gòu)的描述子 CT,應(yīng)用線性回歸方法進(jìn)行建模。

1 原理與方法

化合物的氣相色譜保留指數(shù)是分子微觀結(jié)構(gòu)的宏觀反映。通常多環(huán)芳烴的色譜保留值隨其碳原子數(shù)和其相對分子質(zhì)量的增加而呈近似遞增規(guī)律,但取代多環(huán)芳烴的保留值,由于分子結(jié)構(gòu)特點(diǎn)及其內(nèi)部相互作用的影響,使其隨碳原子數(shù)和相對分子質(zhì)量增加明顯表現(xiàn)出線性偏離;因此,探討能夠準(zhǔn)確描述多環(huán)芳烴分子結(jié)構(gòu)的參數(shù)是進(jìn)行其定量結(jié)構(gòu)色譜保留關(guān)系研究的關(guān)鍵。目前,常用的參數(shù)有幾何參數(shù)、電子參數(shù)和拓?fù)鋮?shù),而通過圖論方法得到表征化合物結(jié)構(gòu)的分子描述符,是定量表征化合物的重要手段。對于任一n個頂點(diǎn)的分子圖可以構(gòu)造1個n×n的距離矩陣和鄰接矩陣。距離矩陣中元素dij等于圖中連接頂點(diǎn)i和j的最小邊數(shù),當(dāng)i和j間不連通時,dij取無窮大。鄰接矩陣中任何邊 r和邊 s鄰接,則在矩陣的(r,s)和(s,r)位置記為1,其他位置記為0。對于任一分子圖,其距離矩陣D和鄰接矩陣A分別表示為:

通常分子拓?fù)渲笖?shù)的計算可通過對描述分子圖的鄰接矩陣和距離矩陣的處理來實(shí)現(xiàn)。距離矩陣主要反映分子結(jié)構(gòu)大小及其支化度信息,而鄰接矩陣反映分子的連接方式。為充分考慮分子中頂點(diǎn)原子的性質(zhì)和成鍵情況及分子中原子與原子的連接關(guān)系,在距離矩陣D和鄰接矩陣A的基礎(chǔ)上作如下處理得到矩陣C:

利用MATLAB程序求出矩陣C的所有特征值λi,為此提出2個新的分子結(jié)構(gòu)描述子CN和CT:

其中:描述子CN由矩陣C的特征值加和的平方根所構(gòu)成,表征由多環(huán)芳烴的距離矩陣和鄰接矩陣相乘得到的對稱矩陣向量范數(shù)[11]。另外,根據(jù)平面直角坐標(biāo)系中2點(diǎn)之間距離公式可知:描述子 CN等于多環(huán)芳烴分子中各頂點(diǎn)到分子中心的距離,能有效反映分子支化度及各頂點(diǎn)之間相互作用的程度。CT由矩陣C的特征值的和所構(gòu)成,表征分子結(jié)構(gòu)的大小。當(dāng)界面分子處于不對稱力場時,分子主體間相互作用與分子界面上相互作用力的差異導(dǎo)致分子結(jié)構(gòu)發(fā)生變化。與六元環(huán)相比,由于五元環(huán)中缺失的頂點(diǎn)與相鄰兩頂點(diǎn)之間不存在相互作用,扭轉(zhuǎn)角發(fā)生改變導(dǎo)致分子構(gòu)型發(fā)生變化,相應(yīng)分子體積和表面積減少。

2 結(jié)果與討論

2.1 數(shù)據(jù)來源

本文研究的100個多環(huán)芳烴化合物的氣相色譜保留指數(shù)見文獻(xiàn)[12]。表 1所示為所有化合物的名稱及相應(yīng)的實(shí)驗(yàn)氣相色譜保留值。

2.2 模型與檢驗(yàn)

根據(jù)式(1)和(2),在計算機(jī)上采用MATLAB軟件編程求出分子結(jié)構(gòu)描述子 CN和CT,見表 1。利用線性回歸法將100個多環(huán)芳烴的氣相色譜保留指數(shù)與其結(jié)構(gòu)參數(shù)CN和CT建立相應(yīng)的兩描述子回歸模型,并采用留一法對該模型進(jìn)行交互校驗(yàn)檢測,所得結(jié)果

如下:

表1 部分多環(huán)芳烴的分子結(jié)構(gòu)描述子CN和CT以及氣相色譜保留指數(shù)的實(shí)驗(yàn)值和計算值Table 1 Molecular structural descriptors CN and CT of part PAHs and experimental/calculated gas chromatography retention index data

其中:IR的表達(dá)式中,括號內(nèi)前面數(shù)字為回歸系數(shù)期望值,后面數(shù)字為標(biāo)準(zhǔn)偏差;n為樣本數(shù);m為變量數(shù);R為復(fù)相關(guān)系數(shù);RCV為交互檢驗(yàn)的復(fù)相關(guān)系數(shù);SRM為均方根誤差;F為Fisher檢驗(yàn)值。由以上結(jié)果可知:其削減誤差為 99.4%,表明采用描述子 CN和CT來描述多環(huán)芳烴氣相色譜保留指數(shù)的變化規(guī)律僅0.6%的隨機(jī)因素未被揭示。按式(3)得出的部分計算值見表 1,其平均相對誤差為 1.37%,最大相對誤差僅為 4.76%,預(yù)測值與實(shí)驗(yàn)值較吻合,且其復(fù)相關(guān)系數(shù)R和RCV非常接近,說明描述子CN和CT包含了影響多環(huán)芳烴氣相色譜保留指數(shù)的主要結(jié)構(gòu)因素;同時,模型有很強(qiáng)自身擬合能力以及對外部樣本的預(yù)測能力。

建立 QSRR 模型的目的是預(yù)測未知化合物的色譜保留行為,因此,模型不僅要求相關(guān)性能好,建模誤差小,同時還要求預(yù)測能力強(qiáng),即對不包含在訓(xùn)練集內(nèi)的樣本即外部測試集里的樣本具有較強(qiáng)的預(yù)測能力。為此,將100個多環(huán)芳烴隨機(jī)抽出近2/3樣本作為訓(xùn)練集,剩余的化合物(表1中帶“*”號)作為測試集用來檢驗(yàn)?zāi)P偷念A(yù)測能力。同樣采用線性回歸法對訓(xùn)練集進(jìn)行回歸分析:

結(jié)果表明:由訓(xùn)練集所建立的模型擬合質(zhì)量和預(yù)測能力與全部數(shù)據(jù)的模型結(jié)果非常接近,說明模型具有很好的穩(wěn)健性。用基于訓(xùn)練集數(shù)據(jù)所建立的 QSRR模型來預(yù)測測試集中的多環(huán)芳烴氣相色譜保留指數(shù),預(yù)測結(jié)果如圖1所示,所有樣本都均勻分布于過原點(diǎn)45°直線周圍,沒有特別明顯的異常點(diǎn)。

為了更加直觀地觀測誤差的分布情況,由訓(xùn)練集與測試集的模型估計誤差分布圖(圖2,化合物序號見表1)可知:絕大多數(shù)樣本的誤差分布在±2倍均方根誤差以內(nèi),僅幾個為明顯離群值。另外,將100個樣本的Cook距離值與中心化杠桿值作圖也得到同樣的結(jié)論,僅36和72號等幾個樣本稍顯異常。

2.3 模型比較

為進(jìn)一步評價本文所選擇的參數(shù)對多環(huán)芳烴氣相色譜保留指數(shù)進(jìn)行預(yù)測的有效性,在相同樣本數(shù)的情況下,Kang等[9]根據(jù)分子極化效應(yīng)理論,采用碳鏈的準(zhǔn)長度與準(zhǔn)共軛體系表面積作為描述符進(jìn)行多元線性回歸(MLR)分析;周麗平等[10]從分子圖論拓?fù)鋵W(xué)角度出發(fā),提出用六元素組成的分子距邊矢量表達(dá)多環(huán)芳烴化學(xué)結(jié)構(gòu),對其氣相色譜保留值進(jìn)行定量相關(guān)性研究,相關(guān)結(jié)果如表2所示。從表2可知:本文所用方法僅根據(jù)分子的距離矩陣和鄰接矩陣提取2個分子結(jié)構(gòu)描述符得到模型統(tǒng)計結(jié)果均優(yōu)于文獻(xiàn)[9-10]中的結(jié)果,而且該方法具有參數(shù)計算簡單、無需查找任何數(shù)據(jù)的優(yōu)點(diǎn)。

圖2 100個多環(huán)芳烴保留指數(shù)計算結(jié)果偏差Fig.2 Deviations of retention index for 100 PAHs

2.4 模型的物理意義

當(dāng)色譜分離條件一定時,被測組分的氣相色譜保留指數(shù)主要與分子本身結(jié)構(gòu)及其化學(xué)和電性特征密切相關(guān)。本文定義的 CN表征由多環(huán)芳烴的距離矩陣和鄰接矩陣相乘得到的對稱矩陣向量范數(shù),反映分子支化度的情況,結(jié)果表明:隨著支化度的加大,化合物在固定相上的色譜保留作用降低,這可能是同分異構(gòu)體的分子支化度加大后其分子形狀類似球體,與色譜柱固定相接觸面積變小,分子間色散力也隨之變小的緣故。而CT反映分子結(jié)構(gòu)大小,隨著碳鏈長度增加,分子體積增大,色散力也加大,因而,化合物在固定相上的保留作用增強(qiáng),相應(yīng)的多環(huán)芳烴氣相色譜保留指數(shù)值增大。應(yīng)當(dāng)指出的是:當(dāng)多環(huán)芳烴分子中含有五元環(huán)時,描述子CT須在正常求得結(jié)果的基礎(chǔ)上減去2才能得到良好的回歸結(jié)果。這可能是與六元環(huán)相比,五元環(huán)的扭轉(zhuǎn)角變化較大導(dǎo)致構(gòu)型發(fā)生變化[13],分子色散力與極化率變小,使分子與色譜柱固定相接觸面積變小的緣故。

表2 本文QSRR模型與文獻(xiàn)[9-10]中的回歸模型統(tǒng)計結(jié)果比較Table 2 Statistical results comparison of QSRR models for this paper and Refs. [9-10]

雖然所建模型都符合建模要求,但有必要討論分子結(jié)構(gòu)描述子各自對整個模型所做的貢獻(xiàn),進(jìn)而探討具有不同物理意義的參數(shù)對多環(huán)芳烴氣相色譜保留指數(shù)的影響。為此,采用相對貢獻(xiàn)(Ψr)和百分?jǐn)?shù)貢獻(xiàn)(Ψf)[14]來定量描述參數(shù)對模型的貢獻(xiàn)。其中,Ψr和 Ψf分別定義為:

式中:ai和分別為模型中第i個描述子前的系數(shù)及該參數(shù)的平均值;R2為模型的判定系數(shù)。通過分析,CN的相對貢獻(xiàn)和百分?jǐn)?shù)貢獻(xiàn)分別為-8.007和2.03%;CT的相對貢獻(xiàn)和百分?jǐn)?shù)貢獻(xiàn)分別為 384.741和97.37%,可知CN和CT對所構(gòu)建的QSRR模型貢獻(xiàn)不同,增加分子體積、減小分子支化度有利于多環(huán)芳烴氣相色譜保留指數(shù)的增加。CT的貢獻(xiàn)更大,說明分子結(jié)構(gòu)大小是決定多環(huán)芳烴氣相色譜保留指數(shù)變化規(guī)律的主要因素,而支化度則起補(bǔ)充作用。

3 結(jié)論

(1) 用描述子 CN和 CT對多環(huán)芳烴的氣相色譜保留指數(shù)進(jìn)行模擬,模型對內(nèi)部樣本具有較強(qiáng)的估計能力,同時,對外部樣本具有較強(qiáng)的預(yù)測能力。

(2) 描述參數(shù)計算簡單,僅根據(jù)分子的距離矩陣和鄰接矩陣就可以得到滿意的結(jié)果。所建模型不僅在一定程度上闡明了多環(huán)芳烴氣相色譜保留指數(shù)與其分子結(jié)構(gòu)信息之間的關(guān)系,同時也為研究多環(huán)芳烴化合物的色譜保留行為提供一種新的方法。

[1] Ferreira M M C. Polycyclic aromatic hydrocarbons: A QSPR study[J]. Chemosphere, 2001, 44(2):125-146.

[2] Santiuste J M, Harangi J, Takács J M. Mosaic increments for predicting the gas chromatographic retention data of the chlorobenzenes[J]. Journal of Chromatography A, 2003,1002(1/2): 155-168.

[3] Liu F P, Liang Y Z, Cao C Z, et al. QSPR study of GC retention indices for saturated esters on seven stationary phases based on novel topological indices[J]. Talanta, 2007, 72(4): 1307-1315.

[4] Farkas O, Zenkevich I G, Stout F, et al. Prediction of retention indices for identification of fatty acid methyl esters[J]. Journal of Chromatography A, 2008, 1198/1199: 188-195.

[5] Chen H F. Quantitative predictions of gas chromatography retention indexes with support vector machines, radial basis neural networks and multiple linear regression[J]. Analytica Chimica Acta, 2008, 609(1): 24-36.

[6] 王宇, 劉樹深, 趙勁松, 等. 電拓?fù)錉顟B(tài)預(yù)測有機(jī)磷酸酯類化合物的氣相色譜保留指數(shù)[J].化學(xué)學(xué)報, 2006, 64(10):1043-1050.WANG Yu, LIU Shu-shen, ZHAO Jing-song, et al. Prediction of gas chromatographic retention indices of organophosphates by electrotopological state index[J]. Acta Chimica Sinica, 2006,64(10): 1043-1050.

[7] 劉鳳萍, 梁逸曾, 曹晨忠. 拓?fù)?量子指數(shù)醛酮?dú)庀嗌V保留指數(shù)及沸點(diǎn)的定量構(gòu)效關(guān)系[J]. 分析化學(xué), 2007, 35(2):227-232.LIU Feng-ping, LIANG Yi-zeng, CAO Chen-zhong.Quantitative structure property relationship study of gas chromatographic retention indices and boiling points for oxo-compounds using topological-quantum descriptors[J].Chinese Journal of Analytical Chemistry, 2007, 35(2): 227-232.

[8] LI Xiao-ru, LAN Zheng-gang, LIANG Yi-zeng. Analysis of volatile chemical components of Radix Paeoniae Rubra by gas chromatography-mass spectrometry and chemometric resolution[J]. Journal of Central South University of Technology,2007, 14(1): 57-61.

[9] Kang J J, Cao C Z, Li Z L. Quantitative structure–retention relationship studies for predicting the gas chromatography retention indices of polycyclic aromatic hydrocarbons quasi-length of carbon chain and pseudo-conjugated system surface[J]. Journal of Chromatography A, 1998, 799: 361-367.

[10] 周麗平, 夏之寧, 李伯玉, 等. 多環(huán)芳烴分子結(jié)構(gòu)的距邊矢量表征及其氣相色譜保留指數(shù)預(yù)測[J]. 色譜, 2001, 19(1): 25-31.ZHOU Li-ping, XIA Zhi-ning, LI Bo-yu, et al. Estimation of gas chromatographic retention index for polycyclic aromatic hydrocarbons using VMDE[J]. Chinese Journal of Chromatography.2001, 19(1): 25-31.

[11] 李志斌. 線性代數(shù)[M]. 北京: 機(jī)械工業(yè)出版社, 2006: 97-98.LI Zhi-bin. Linear algebra[M]. Beijing: China Machine Press,2006: 97-98.

[12] Lee M L, Novotny M V, Bartle K D. Analytical chemistry of polycyclic aromatic compounds[M]. New York: AcVmdemic Press, 1981: 1-5

[13] 邢其毅, 裴偉偉, 徐瑞秋, 等. 基礎(chǔ)有機(jī)化學(xué)[M]. 3版. 北京:高等教育出版社, 2005: 88.XING Qi-yi, PEI Wei-wei, XU Rui-qiu, et al. Fundamentals of organic chemistry[M]. 3rd ed. Beijing: Higher Education Press,2005: 88.

[14] Needham D E, Wei I C, Seybold P G. Molecular mounting of the physical properties of the alcanes[J]. Journal of American Chemical Society, 1988, 110: 4186-4194.

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