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馬鈴薯塊莖鉀含量近紅外模型的建立

2011-04-16 06:32劉翠翠高紅秀
中國(guó)馬鈴薯 2011年2期
關(guān)鍵詞:定標(biāo)塊莖光譜

劉翠翠,高紅秀,李 贊,金 萍,石 瑛

(東北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,黑龍江 哈爾濱 150030)

鉀是植物生長(zhǎng)中不可缺少的營(yíng)養(yǎng)元素,鉀素營(yíng)養(yǎng)和氮素、磷素營(yíng)養(yǎng)一樣,對(duì)植物的品質(zhì)起著重要作用,被稱為品質(zhì)元素[1]。鉀素不但會(huì)對(duì)作物的產(chǎn)量、品質(zhì)產(chǎn)生重要的影響,而且以各種方式直接或間接地影響植物的抗病性[2-5]。馬鈴薯屬喜鉀作物,鉀素能提高馬鈴薯的光合效率,還可影響光合產(chǎn)物的合成和運(yùn)輸,影響馬鈴薯的品質(zhì)以及產(chǎn)量的高低[6]。由此可見,鉀素對(duì)于馬鈴薯的生長(zhǎng)至關(guān)重要。過去人們對(duì)馬鈴薯含鉀量的研究較少,而現(xiàn)在研究人員逐漸認(rèn)識(shí)到,塊莖中鉀的含量如同還原糖含量、淀粉含量一樣也是馬鈴薯重要的品質(zhì)指標(biāo)之一。但是,對(duì)于育種過程中大量材料的篩選工作,既耗時(shí)又費(fèi)力。隨之出現(xiàn)并逐漸完善的近紅外光譜分析技術(shù)卻有效地解決了這個(gè)難題。

近紅外光譜(NIRS)分析技術(shù)是20世紀(jì)80年代后期迅速發(fā)展起來的一項(xiàng)測(cè)試技術(shù),在歐美等國(guó),NIRS已成為谷物品質(zhì)分析的重要手段[7]。我國(guó)在水稻、烤煙等作物品質(zhì)分析中已有應(yīng)用NIRS的報(bào)道,陸艷婷等[8]建立了秈稻的幾種品質(zhì)性狀的近紅外光譜模型,所建模型具有一定的實(shí)用價(jià)值。劉岱松等[9]建立了烤煙煙葉鉀含量的近紅外光譜模型,結(jié)果表明,近紅外法測(cè)定結(jié)果與常規(guī)化學(xué)分析方法的結(jié)果相關(guān)性較好,能夠應(yīng)用于烤煙鉀含量的快速診斷。由于近紅外光譜分析技術(shù)具有分析速度快、非破壞性測(cè)定、多組分同時(shí)測(cè)定、樣品不需預(yù)處理、低分析成本和操作簡(jiǎn)單等諸多優(yōu)點(diǎn),使得該項(xiàng)技術(shù)在作物品質(zhì)分析以及育種上的應(yīng)用越來越廣泛。

近紅外光譜分析技術(shù)已經(jīng)應(yīng)用于許多作物的諸多領(lǐng)域,但國(guó)內(nèi)尚未有在馬鈴薯上應(yīng)用的報(bào)道。本研究以1562份馬鈴薯品種、資源及雜種后代的塊莖為材料,建立馬鈴薯塊莖鉀含量的近紅外光譜分析模型,以期為馬鈴薯塊莖鉀含量的測(cè)定探索一種簡(jiǎn)便、快速、高效的分析方法,為建立馬鈴薯品質(zhì)性狀評(píng)價(jià)的新體系提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù),進(jìn)而對(duì)馬鈴薯品質(zhì)育種材料的篩選提供有效的、可用的新方法。

1 材料與方法

1.1 試驗(yàn)材料

供試材料為2007~2010年東北農(nóng)業(yè)大學(xué)馬鈴薯選種圃中入選的無性系材料,參加2007~2008年國(guó)家馬鈴薯區(qū)域試驗(yàn)、生產(chǎn)試驗(yàn)的品種(系),部分來自于訥河、克山和加格達(dá)奇等地的馬鈴薯品種(系),樣品數(shù)目為1562份。將新鮮馬鈴薯樣品切碎,105℃殺青30 min,70.5℃烘干約14 h至恒重后,磨成粉末。

1.2 試驗(yàn)方法

1.2.1 近紅外光譜的測(cè)定

試驗(yàn)儀器是FOSS公司生產(chǎn)的InfraXact Lab型近紅外光譜分析儀,將預(yù)處理過的樣品放到近紅外光譜分析儀的樣品杯中,以蓋過掃描感應(yīng)區(qū)域?yàn)闃?biāo)準(zhǔn),由裝于電腦上的操作軟件ISIscan來控制,光譜結(jié)果自動(dòng)存儲(chǔ)在本機(jī)配置的計(jì)算機(jī)中。

1.2.2 常規(guī)化學(xué)分析方法

馬鈴薯塊莖全鉀含量的測(cè)定采用火焰光度計(jì)法[10]。

1.2.3 剔除超常樣品和過剩樣品

試驗(yàn)所用軟件是FOSS公司的WINISI定標(biāo)軟件,將上述馬鈴薯塊莖鉀含量的化學(xué)分析值及其近紅外光譜值導(dǎo)入該軟件,運(yùn)用軟件的聚類分析功能,剔除馬氏距離(GlobalH或簡(jiǎn)稱GH,含義為得分的三維圖中,每個(gè)樣品距離中心樣品點(diǎn)的距離)大于3.0的樣品,即超常樣品,然后利用得分文件,選擇NH(NeighborH)>0.8(以某一樣品為中心,半徑0.8以內(nèi)的樣品將被認(rèn)為和此樣品為相似樣品,其光譜性質(zhì)不能增加定標(biāo)集樣品的變異范圍,即為過剩樣品)的樣品構(gòu)成定標(biāo)群體。

1.2.4 光譜預(yù)處理

本試驗(yàn)根據(jù)模型特點(diǎn)和測(cè)量要求選擇的回歸分析方法是MPLS(改進(jìn)最小二乘法回歸技術(shù)),對(duì)光譜的散射預(yù)處理方式采用了None(對(duì)光譜不進(jìn)行散射校正)和SNV+Detrend(標(biāo)準(zhǔn)正?;幚?去偏異技術(shù)),數(shù)學(xué)處理技術(shù)的參數(shù)分別為(Derivative導(dǎo)數(shù)處理=0,Gap做導(dǎo)數(shù)處理計(jì)算所采用的光譜點(diǎn)間隔=0,Smooth平滑處理間隔=1,Smooth2二次平滑處理間隔點(diǎn)=1)和(Derivative導(dǎo)數(shù)處理=1,Gap做導(dǎo)數(shù)處理計(jì)算所采用的光譜點(diǎn)間隔=4,Smooth平滑處理間隔=4,Smooth2二次平滑處理間隔點(diǎn)=1)。

1.2.5 定標(biāo)與驗(yàn)證

樣品的掃描數(shù)據(jù)和化學(xué)數(shù)據(jù)經(jīng)過處理后就可以建立定標(biāo)方程,上述兩種光譜預(yù)處理方式建立了兩個(gè)定標(biāo)方程,我們挑選交互驗(yàn)證標(biāo)準(zhǔn)偏差SECV偏小,交互驗(yàn)證相關(guān)系數(shù)1-VR偏大的一組為最終定標(biāo)結(jié)果。在建立定標(biāo)方程后,需對(duì)該方程的預(yù)測(cè)性能進(jìn)行驗(yàn)證。采用一組沒有參與定標(biāo)的獨(dú)立樣品組(即驗(yàn)證樣品集)驗(yàn)證該方程的預(yù)測(cè)性能。驗(yàn)證樣品集的成分應(yīng)覆蓋一定的范圍,以便得出合理的驗(yàn)證結(jié)果。驗(yàn)證結(jié)果的好壞主要取決于SEP(C)值和RSQ值,其中SEP(C)值越小越好,RSQ值越接近1越好。

2 結(jié)果與分析

2.1 剔除超常樣品和過剩樣品后的結(jié)果分析

由于原始樣品集的過剩樣品數(shù)量較大,所以剔除超常樣品和過剩樣品后,僅剩余369份樣品用于模型構(gòu)建。與未去除過剩樣品前相比,去除過剩樣品后,樣品分布較平均,有效改善了樣品過于集中的情況,此樣品集較有代表性。

樣品經(jīng)過處理后剩余369份材料,全部掃描光譜如圖1,剔除283位置處的81037和309位置處的20892,與其它掃描光譜相比,這兩處光譜有較大波動(dòng),不參與定標(biāo)。

2.2 鉀含量定標(biāo)集和驗(yàn)證集的分選

從最終用于馬鈴薯鉀含量的近紅外模型建立的樣品集367份中,隨機(jī)選取90份樣品組成驗(yàn)證集,剩余的277份樣品自動(dòng)生成定標(biāo)集。從表1可以看出,定標(biāo)集的變化范圍是0.825%~2.250%,驗(yàn)證集的變化范圍是0.850%~1.975%,驗(yàn)證集全部包含在定標(biāo)集內(nèi),符合定標(biāo)要求。但是,供試材料的鉀含量過于集中,變化幅度太小,這將對(duì)定標(biāo)結(jié)果產(chǎn)生一定的影響。

圖1 剔除過剩樣品后的光譜圖Figure 1 Spectra after removing excess samples

2.3 定標(biāo)模型的建立

通過軟件推薦的散射處理技術(shù)SNV+Detrend和None,建立了兩個(gè)馬鈴薯鉀含量的定標(biāo)方程,表2即為兩種不同光譜處理技術(shù)下的鉀含量定標(biāo)參數(shù),從表2中可以看出,兩種光譜處理技術(shù)在定標(biāo)的過程中,都自動(dòng)剔除了少量超常樣品,SNV+Detrend散射處理技術(shù)建立的定標(biāo)方程中的SEC值和SECV值都低于無散射處理技術(shù)建立的定標(biāo)方程,RSQ值和1-VR值都高于無散射處理技術(shù)建立的定標(biāo)方程,按照軟件推薦的選擇方式,選出一個(gè)SECV值低而1-VR值較高的一組作為定標(biāo)方程,即選擇SNV+ Detrend處理技術(shù)下的定標(biāo)方程,該方程中SECV值為0.072,而1-VR值為0.881,接近于0.900這一數(shù)學(xué)上常用的可接受標(biāo)準(zhǔn),定標(biāo)結(jié)果較好。

2.4 模型的驗(yàn)證

對(duì)于所建模型的優(yōu)劣,除了取決于定標(biāo)參數(shù)外,還要對(duì)該模型進(jìn)行驗(yàn)證,觀察其驗(yàn)證參數(shù)的好壞,全面評(píng)價(jià)定標(biāo)結(jié)果。用未參與定標(biāo)的90份驗(yàn)證集樣品檢驗(yàn)該模型的預(yù)測(cè)能力,結(jié)果顯示,有8份樣品出現(xiàn)了報(bào)警(報(bào)警閥值由軟件定義),剔除這8份報(bào)警樣品,用剩余的82份樣品對(duì)該模型進(jìn)行重新驗(yàn)證,結(jié)果見表3,SEP(C)值為0.080,RSQ值為0.866,而鉀含量近紅外模型預(yù)測(cè)值與實(shí)測(cè)值的交叉驗(yàn)證結(jié)果見圖2,由圖2可知,驗(yàn)證集樣品較均勻的分布在回歸線兩側(cè),并且全部分布在兩條報(bào)警線范圍內(nèi),以上結(jié)果說明該模型預(yù)測(cè)效果較好,可以用其進(jìn)行馬鈴薯育種材料塊莖鉀含量的粗略測(cè)定,但是定標(biāo)結(jié)果并沒有達(dá)到預(yù)期效果,還有待于進(jìn)一步提高。

表1 鉀含量定標(biāo)和驗(yàn)證集的化學(xué)分析數(shù)據(jù)Table 1 Chemical analysis of potassium content calibration and validation sets

表2 兩種不同散射處理技術(shù)下的鉀含量定標(biāo)參數(shù)Table 2 Calibration parameters of potassium content under two different scattering process technologies

表3 修正后鉀含量驗(yàn)證參數(shù)Table 3 Validation parameters of potassium content after revising

圖2 修正后的鉀含量近紅外模型預(yù)測(cè)值與實(shí)測(cè)值的交叉驗(yàn)證結(jié)果Figure 2 Results of cross-validation between potassium content NIR predicted and measured after revising

3 討論

實(shí)踐證明,應(yīng)用所建模型能夠快速、高效的測(cè)定馬鈴薯塊莖的鉀含量,從而縮短育種年限,縮小育種規(guī)模,大大提高了育種的效率。由此可見,近紅外光譜技術(shù)是現(xiàn)代育種過程中非常重要的育種手段。但是,本試驗(yàn)中所建模型并不十分理想,究其原因,可能受以下幾方面因素的影響:

樣品的均一性與否對(duì)模型的精確度有著重要的影響,馬鈴薯塊莖不是均質(zhì)的材料,各部位含鉀量并不相同,掃描光譜樣品與化學(xué)分析樣品的取樣差異會(huì)影響光譜與化學(xué)分析值間的關(guān)聯(lián)程度。另外,常規(guī)化學(xué)分析的準(zhǔn)確性也直接影響著建模的準(zhǔn)確性,本試驗(yàn)的常規(guī)分析采用火焰光度計(jì)法,由于分析方法的局限性使得操作過程中可能出現(xiàn)一定的隨機(jī)誤差,導(dǎo)致化學(xué)分析值的結(jié)果存在著誤差,一定程度上影響了模型的精確度。

近紅外光譜信息量大、信號(hào)微弱、譜區(qū)重疊嚴(yán)重,尤其是在測(cè)量低濃度的樣品時(shí),需要提高儀器的信噪比來抵消這一方面的影響,進(jìn)而提高分析結(jié)果的可靠性,所以在進(jìn)行分析之前一般要對(duì)光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理。

受收集材料的影響,本試驗(yàn)所用材料數(shù)量充足,但是鉀的含量(干基)大多分布在1%~2%之間,范圍較狹窄,樣品代表性有所局限,對(duì)于建模有一定的影響,今后應(yīng)陸續(xù)補(bǔ)充材料,增加樣品的代表性,擴(kuò)大供試樣品鉀含量的范圍,從而完善該模型。

本試驗(yàn)建立了馬鈴薯塊莖鉀含量的近紅外模型,并對(duì)該模型的準(zhǔn)確性進(jìn)行了檢驗(yàn)。結(jié)果表明:鉀含量定標(biāo)方程的SECV值為0.072,而1-VR值為0.881,較接近1,鉀含量的驗(yàn)證參數(shù)SEP(C)值為0.080,RSQ值為0.866,說明所建模型較好,具有一定的實(shí)用價(jià)值,可以將其用于馬鈴薯育種過程中大量材料的篩選工作,加速馬鈴薯育種進(jìn)程。但所建模型還有很大完善的空間,今后需逐步對(duì)該模型進(jìn)行優(yōu)化,進(jìn)一步提高它的預(yù)測(cè)能力。

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