您好.
我對(duì)貴刊已發(fā)表的論文《聚腺苷二磷酸核糖聚合酶-1抑制劑高通量篩選模型》一文的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)產(chǎn)生疑問(附件為其文章),其文章在Fig 3中顯示PARP-1的標(biāo)準(zhǔn)曲線,橫坐標(biāo)為PARP的濃度,縱坐標(biāo)為RFU,隨著PARP含量增加,NAD含量應(yīng)是降低,熒光值應(yīng)當(dāng)是降低,但是論文中RFU是上升,我對(duì)這篇文章的真實(shí)性產(chǎn)生疑問,請(qǐng)給予回復(fù)解釋此事,謝謝!
讀者
關(guān)于PARP-1抑制劑篩選模型的建立文章,我們查閱了當(dāng)時(shí)實(shí)驗(yàn)記錄(本實(shí)驗(yàn)主要完成于2005年1月~10月)
1)Fig 2中,我們只檢測了反應(yīng)體系中不同濃度的NAD+反應(yīng)后的熒光值,此時(shí)沒有加入PARP-1酶。結(jié)果表明,直到500 nM反應(yīng)仍具有良好的線性關(guān)系。
2)在Fig 3中,我們實(shí)驗(yàn)的目的是想通過這個(gè)實(shí)驗(yàn)確定反應(yīng)中所要需要的PARP-1酶的量。我們選用了不同濃度的PARP-1,同時(shí)我們也加入逐漸增加的NAD+的濃度(起到滴定作用:從500 nM,1000 nM,2500 nM,5000 nM,10 000 nM和20 000 nM),我們發(fā)現(xiàn)當(dāng)酶的濃度達(dá)到1 000 μg·L-1時(shí),即使增加酶的濃度和NAD+的濃度,熒光值也沒什么變化,可能是反應(yīng)中酶全部反應(yīng)后,剩余NAD+的濃度達(dá)到飽和所導(dǎo)致的。因此我們實(shí)驗(yàn)中選擇酶的量為大于1 000 μg·L-1。選用的NAD+的量為500 nM。我們認(rèn)為Fig 3中熒光值上升可能是由于逐漸加入NAD+含量增加的原因。
3)當(dāng)我們確定反應(yīng)的酶的量和NAD+的量后,就建立了篩選模型,空白對(duì)照組只含有NAD+,認(rèn)為是100%抑制,陽性對(duì)照孔只含有NAD+和Parp-1,認(rèn)為是0%抑制率。對(duì)于加了化合物的孔則通過計(jì)算得到相對(duì)的抑制率。
4)關(guān)于周老師對(duì)Fig 3的疑問,非常抱歉我們沒有在文章中寫明反應(yīng)條件,建立的該模型是在我們實(shí)驗(yàn)室初步建立完成的,也進(jìn)行了陽性藥篩選和穩(wěn)定性研究,但是由于我們寫作不嚴(yán)謹(jǐn),給您帶來困擾,很抱歉。
如果需要我進(jìn)一步提供資料,我會(huì)積極配合,謝謝。此致!
柳軍