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變形鏈球菌LuxS蛋白與LuxS/AI-2群體感應(yīng)系統(tǒng)的研究進(jìn)展

2011-02-09 04:53儲(chǔ)冰峰
關(guān)鍵詞:生物膜鏈球菌半胱氨酸

夏 麗 儲(chǔ)冰峰

變形鏈球菌是口腔致齲的主要細(xì)菌之一。變形鏈球菌能夠選擇性地在牙齒表面黏附,形成細(xì)菌生物膜,促進(jìn)菌斑形成,通過(guò)攝入蔗糖、葡萄糖和果糖等進(jìn)行糖酵解,產(chǎn)生能量同時(shí)生成大量乳酸,使牙齒硬組織脫鈣致齲。LuxS蛋白酶在1999年被Winzer等人[1]證實(shí)存在,但早在上世紀(jì)60年代該蛋白酶就作為S-核苷高半胱氨酸(S-ribosylhom ocysteine,SRH)的裂解酶被報(bào)道[2],是細(xì)菌轉(zhuǎn)甲基作用和蛋氨酸循環(huán)合成途徑之一的關(guān)鍵酶。近年來(lái),有大量的研究報(bào)道了,LuxS作為自體誘導(dǎo)信號(hào)分子-2(autoinducer-2,AI-2)生物合成中不可或缺的酶。

口腔環(huán)境中存在大量細(xì)菌,細(xì)菌能夠適應(yīng)環(huán)境的變化是通過(guò)識(shí)別細(xì)胞外的信號(hào),調(diào)控自身基因表達(dá)來(lái)實(shí)現(xiàn)的。這種胞外信號(hào)由細(xì)菌產(chǎn)生后,可以調(diào)控同種細(xì)菌數(shù)量,也可以被異種細(xì)菌識(shí)別,作為異種細(xì)菌間的交流信號(hào),調(diào)節(jié)不同種屬細(xì)菌的生物行為,這一現(xiàn)象被稱為群體感應(yīng)[3](quorum sensing,QS)。已在多種革蘭氏陰性和陽(yáng)性菌中證實(shí)并且在大量研究中發(fā)現(xiàn)AI-2可以介導(dǎo)不同種屬間的細(xì)菌交流。在各種不同細(xì)菌中,LuxS的同系物參與AI-2的生物合成。AI-2介導(dǎo)的群體感應(yīng)機(jī)制可以調(diào)節(jié)基因表達(dá),包括生物膜形成、毒力因子、生物熒光、抗生素耐藥性、形成孢子和形成感受態(tài)等。干擾這一系統(tǒng)會(huì)改變細(xì)菌的致病性,由于LuxS/AI-2在不同的細(xì)菌中調(diào)節(jié)這些行為,也使其成為藥物抑制劑靶點(diǎn)。本文對(duì)變形鏈球菌中LuxS蛋白基因、結(jié)構(gòu)、作用機(jī)制和功能,尤其是LuxS/AI-2群體感應(yīng)的相關(guān)內(nèi)容作一綜述。

1.LuxS蛋白的基因特點(diǎn)

變形鏈球菌的LuxS是含160個(gè)氨基酸的金屬蛋白酶,LuxS在細(xì)菌中有近50%的保守序列[4][5][6]。Wen等[7]通過(guò)對(duì)變形鏈球菌UA159全基因組的研究,發(fā)現(xiàn)與哈維氏弧菌同源的luxS基因。該基因位于染色體的nt443111到442632,由480個(gè)堿基對(duì)組成的開(kāi)放閱讀框編碼。Merritt等[8]通過(guò)對(duì)變形鏈球菌基因進(jìn)行BLAST研究,發(fā)現(xiàn)LuxS蛋白基因編碼的氨基酸序列在革蘭氏陽(yáng)性菌有高度同源性,與化膿鏈球菌、肺炎鏈球菌、乳酸球菌、產(chǎn)氣莢膜桿菌的LuxS蛋白分別有84%、83%、64%、45%的一致性和92%、91%、79%、64%的相似性;在革蘭氏陰性菌也有顯著的同源性,與哈維氏弧菌、腦膜炎奈瑟氏菌、大腸桿菌、流感嗜血桿菌的LuxS蛋白分別有38%、36%、37%、37%的一致性和57%、58%、59%、58%的相似性。說(shuō)明LuxS蛋白的保守性較好,可能與其發(fā)揮重要的生理功能有關(guān)。

2.LuxS蛋白的結(jié)構(gòu)

LuxS蛋白有HXXEH(His-Xaa-Xaa-Glu-His)保守序列,這種序列通常在含有Zn2+的蛋白中測(cè)得。LuxS的晶體結(jié)構(gòu)既有游離的基團(tuán),又存在S-核苷高半胱氨酸(S-ribosylhomocysteine,SRH)或高半胱氨酸,溶解度高[9]。LuxS存在同型二聚體,每個(gè)亞基的殘基在二聚體表面有相同的活化位點(diǎn),每個(gè)活化位點(diǎn)存在一個(gè)二價(jià)的金屬離子,以前被認(rèn)為是Zn2+,近年來(lái)Pei等[10]認(rèn)為是Fe2+。在枯草桿菌中金屬離子的4面分別與HXXEH保守序列的54位和58位組氨酸、126位半胱氨酸和水分子結(jié)合,這一結(jié)構(gòu)為酶的催化中心。Fe2+活化氧分子,半胱氨酸被氧化為磺丙氨酸,蛋白結(jié)構(gòu)改變,LuxS酶失活。LuxS金屬蛋白酶的配基環(huán)境與多肽的去甲酰基酶相似,F(xiàn)e2+形式的LuxS在有氧的環(huán)境下會(huì)迅速失活,而由Zn2+或Co2+組成的LuxS蛋白形式卻非常穩(wěn)定,Co-LuxS的催化能力與Fe-LuxS相同,比Zn-LuxS強(qiáng)10倍。

3.LuxS的作用機(jī)制

LuxS催化非氧化還原反應(yīng)的硫醚鍵斷裂[11]。Pei等[10]認(rèn)為L(zhǎng)uxS催化的反應(yīng)是一種金屬催化羰鍵轉(zhuǎn)移的反應(yīng)。在水溶液中,SRH的核糖環(huán)水合后以醛的形式處于平衡狀態(tài),形成酶-底物復(fù)合體。SRH的C1羰鍵打開(kāi)與酶的金屬離子結(jié)合,取代酶中金屬離子結(jié)合的水分子或氧。隨著金屬離子的增多,SRH的C2堿基與酶的其他活化位點(diǎn)結(jié)合,形成五碳烯二醇化物,溶液中質(zhì)子增加,與酶結(jié)合的C1羰鍵的氧再結(jié)合質(zhì)子,形成含酮鍵的互變異構(gòu)體中間產(chǎn)物,C2形成羰基,與酶的金屬離子結(jié)合,C1羰鍵與酶斷開(kāi)。如此循環(huán),最后進(jìn)行β-消除,產(chǎn)生4,5-二羥基-2,3-戊二酮(4,5-dihydroxy-2,3-pentanedione, DPD),DPD再自發(fā)轉(zhuǎn)化成酮式。

3.1 參與活化甲基代謝 LuxS在細(xì)胞甲基代謝中有重要作用,為細(xì)胞的RNA、DNA、特殊的代謝和蛋白提供甲基,是中間產(chǎn)物S-腺苷高半胱氨酸(S adenosylhomocysteine,SAH)循環(huán)的關(guān)鍵酶之一。LuxS活化甲基代謝的反應(yīng),有與催化形成AI-2相同的途徑,從S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosylmethionine,SAM)生成高半胱氨酸;也可由另一條途徑,經(jīng)SAH水解酶,直接將SAH催化生成高半胱氨酸,這一途徑不產(chǎn)生AI-2。高半胱氨酸在鈷胺素依賴的甲硫氨酸合成酶作用下生成甲硫氨酸,甲硫氨酸經(jīng)SAM合成酶催化形成SAM,完成轉(zhuǎn)甲基作用和蛋氨酸循環(huán)。

3.2 催化形成AI-2 AI-2由SAM經(jīng)過(guò)至少3步酶促反應(yīng)生成,SAM在甲基轉(zhuǎn)運(yùn)酶催化下與甲基供體反應(yīng),生成毒性中間產(chǎn)物SAH,SAH與SAM結(jié)構(gòu)相似,是一個(gè)潛在的SAM依賴的甲基轉(zhuǎn)移酶的反饋抑制劑,SAH很快被S-腺苷高半胱氨酸核苷酶(S-adenosylhomocysteine nucleosidase,Pfs)分解,生成腺嘌呤和 SRH,SRH由LuxS催化部分核糖基斷裂,形成烯醇形式的DPD和高半胱氨酸[12],DPD自動(dòng)重排形成AI-2。研究[13]證實(shí)通過(guò)等位基因替換技術(shù)構(gòu)建的變形鏈球菌luxS缺陷株不能產(chǎn)生活性AI-2。

4.變形鏈球菌的LuxS和LuxS/AI-2群體感應(yīng)系統(tǒng)的作用

由于LuxS蛋白在細(xì)菌甲基代謝和AI-2合成中發(fā)揮重要作用,Merritt等[8]利用AI-2特異性報(bào)告菌株V.harveyi BB170證實(shí),變形鏈球菌可產(chǎn)生功能性的AI-2,且在對(duì)數(shù)生長(zhǎng)的中晚期達(dá)到最高值。已有研究證實(shí)LuxS與變形鏈球菌的生物膜形成、糖代謝、產(chǎn)酸耐酸、變鏈素等毒力因子密切相關(guān)。

luxS缺失突變的變形鏈球菌菌株的生物膜形成能力與培養(yǎng)條件相關(guān)。Wen等[7]建立luxS變異的變形鏈球菌UA159,在96孔板上培養(yǎng),對(duì)生物膜形成沒(méi)有影響。Merritt等[8]則觀察到luxS缺陷株形成的生物膜結(jié)構(gòu)改變,表面粗糙,更易凝結(jié)成塊,對(duì)清潔劑和抗生素耐藥性增強(qiáng)。生物膜形成的變化與培養(yǎng)細(xì)菌的環(huán)境有關(guān)。在蔗糖介質(zhì)中變化明顯,luxS變異菌株生物膜松散呈巢穴狀,而野生株光滑平展。Yoshida等[14]建立luxS變異的變形鏈球菌GS-5,在0.5%蔗糖溶液中,變異株與野生株相比,生物膜明顯變稀薄,電子顯微鏡掃描顯示細(xì)菌凝聚團(tuán)塊變大。結(jié)果發(fā)現(xiàn)AI-2調(diào)節(jié)了葡萄糖轉(zhuǎn)移酶基因,進(jìn)而調(diào)控蔗糖依賴的生物膜形成。也有學(xué)者[15]用含蔗糖和葡萄糖的培養(yǎng)基培養(yǎng)luxS缺失的變形鏈球菌UA159,觀察到在含蔗糖的培養(yǎng)基中l(wèi)uxS缺失菌株生物膜形成能力明顯減弱,證實(shí)LuxS/AI-2主要對(duì)蔗糖依賴的生物膜形成起調(diào)控作用。

LuxS和LuxS/AI-2群體感應(yīng)系統(tǒng)也參與了變形鏈球菌糖代謝、產(chǎn)酸耐酸及一些應(yīng)激反應(yīng)的基因調(diào)控。Yoshida等[14]建立luxS變異的變形鏈球菌,在0.5%蔗糖溶液中,變異株在對(duì)數(shù)生長(zhǎng)中期,葡聚糖轉(zhuǎn)移酶的gtfB和gtfC基因表達(dá)上調(diào),而gtfD基因略下調(diào)。Wen等[16]通過(guò)luxS缺陷株發(fā)現(xiàn)關(guān)鍵的毒力因子果聚糖酶下調(diào)了50%以上,菌株對(duì)酸更加敏感,但仍有一定的耐受性。Northern雜交顯示與DNA損傷修復(fù)相關(guān)的RecA,SmnA(AP核酸內(nèi)切酶),和Nth(核酸內(nèi)切酶)都下調(diào),尤其在對(duì)數(shù)生長(zhǎng)的早期,其他下調(diào)的基因還包括編碼膜相關(guān)蛋白的基因,如ffh(一個(gè)信號(hào)識(shí)別分子的亞單位)和brpA(生物膜調(diào)節(jié)蛋白A),但對(duì)過(guò)氧化氫的耐受力增強(qiáng)。luxS基因缺失后,影響糖代謝和細(xì)胞膜結(jié)構(gòu)的相關(guān)基因,luxS可能對(duì)細(xì)菌在酸性環(huán)境等一些應(yīng)激環(huán)境下的耐受性有一定調(diào)節(jié)作用。

變鏈素是變形鏈球菌合成分泌的抗菌性多肽,在牙菌斑菌落中抑制其他細(xì)菌使變形鏈球菌生存,根據(jù)其產(chǎn)生菌株的不同分為變鏈素Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ。在細(xì)菌密度高時(shí),變鏈素Ⅰ的表達(dá)水平升高。研究表明[17][18],luxS基因缺失導(dǎo)致變鏈素Ⅰ特異性結(jié)構(gòu)調(diào)節(jié)子mutA和轉(zhuǎn)錄激活子mutR轉(zhuǎn)錄水平降低。此外,變形鏈球菌luxS突變株中irvA(變鏈素I抑制子)的轉(zhuǎn)錄水平顯著提高,同時(shí)缺失luxS和irvA基因,變鏈素合成水平恢復(fù)。說(shuō)明當(dāng)LuxS蛋白功能正常時(shí)irvA轉(zhuǎn)錄受到抑制,當(dāng)luxS基因缺失時(shí)irvA基因表達(dá)量大幅提高。高水平的irvA抑制mutA和mutR轉(zhuǎn)錄,進(jìn)一步導(dǎo)致變鏈素I合成水平降低。正常情況下,隨著細(xì)菌密度增加,變形鏈球菌分泌的AI-2達(dá)到一定濃度時(shí),irvA的轉(zhuǎn)錄受到抑制,變鏈素I表達(dá)升高;當(dāng)luxS缺失時(shí),irvA的表達(dá)增加,mutA和mutR轉(zhuǎn)錄受到抑制,變鏈素I表達(dá)降低。但luxS、irvA、mutR、mutA和變鏈素I具體的相互作用機(jī)制還有待進(jìn)一步研究。

LuxS和LuxS/AI-2系統(tǒng)在變形鏈球菌的生理活動(dòng)中發(fā)揮了重要作用,但究竟是LuxS蛋白在細(xì)菌轉(zhuǎn)甲基和蛋氨酸循環(huán)中所起的作用,還是LuxS/AI-2群體感應(yīng)機(jī)制引起的變化,還有待進(jìn)一步驗(yàn)證。Hasona等[19]用基因芯片分析LuxS蛋白表達(dá)下降的變形鏈球菌,發(fā)現(xiàn)包括分子伴侶、蛋白酶、細(xì)胞被膜合成酶、DNA修復(fù)和復(fù)制酶的81個(gè)蛋白基因表達(dá)上調(diào),而與細(xì)胞感受態(tài)相關(guān)的基因、核糖體蛋白、與氨基酸和蛋白的生物合成酶有關(guān)的35個(gè)基因表達(dá)下調(diào)。Sztajer等[20]將LuxS的代謝功能與AI-2信號(hào)分子的功能分離研究,培養(yǎng)luxS缺失的變形鏈球菌UA159,并加入化學(xué)合成的DPD,發(fā)現(xiàn)585個(gè)基因表達(dá)受影響(占基因組的30%),這種變化不能由信號(hào)分子AI-2恢復(fù),因此不是受群體感應(yīng)的影響,而是由于LuxS酶不能在甲基轉(zhuǎn)運(yùn)代謝的過(guò)程中發(fā)揮作用所致。細(xì)菌中幾乎所有功能酶都受到影響,包括與生物膜形成、桿菌素合成、感受態(tài)和耐酸性相關(guān)的酶。同時(shí),有59個(gè)基因在添加AI-2后轉(zhuǎn)錄改變,這些基因與蛋白合成、細(xì)胞張力、分裂有關(guān)。其中有3個(gè)與已知的AI-2轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白無(wú)關(guān)的膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白表達(dá)增加。因此luxS缺失會(huì)直接導(dǎo)致細(xì)菌的基因和表型變化,LuxS蛋白對(duì)細(xì)菌的基因表達(dá)和細(xì)菌多種蛋白的功能有直接調(diào)節(jié)作用。而LuxS催化形成AI-2信號(hào)分子,通過(guò)LuxS/AI-2群體感應(yīng)系統(tǒng)調(diào)節(jié)細(xì)菌生物膜中細(xì)菌的生物學(xué)行為,也能夠有效地促使細(xì)菌檢測(cè)種群的密度變化,并通過(guò)改變細(xì)菌的狀態(tài)來(lái)調(diào)整群體細(xì)菌的種類(lèi)和密度。

5.問(wèn)題與展望

變形鏈球菌LuxS蛋白調(diào)控變形鏈球菌基因表達(dá),并催化形成AI-2信號(hào)分子,是群體感應(yīng)效應(yīng)中的關(guān)鍵蛋白。LuxS/AI-2信號(hào)系統(tǒng)在調(diào)控細(xì)菌生物膜形成、糖代謝、耐酸性、耐藥性等方面有重要作用。近年來(lái)防齲研究主要集中于以PAc,GTFs和GBPs為疫苗靶點(diǎn)的抗齲疫苗研究[21],盡管目前對(duì)LuxS蛋白具體的調(diào)控機(jī)制和LuxS/AI-2信號(hào)系統(tǒng)的傳導(dǎo)途徑還不明確,但不管是針對(duì)LuxS蛋白還是LuxS/AI-2信號(hào)系統(tǒng)的研究,都可以使我們進(jìn)一步認(rèn)識(shí)口腔細(xì)菌生存的生理機(jī)制,并且成為口腔致齲菌藥物治療的新靶點(diǎn)、新途徑。

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