胡曉倩,陳來同,趙 健
(北京大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,北京 100871)
SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳染色方法
胡曉倩,陳來同,趙 健
(北京大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,北京 100871)
目的 建立一種操作簡便、快速、靈敏度高、無毒的蛋白質(zhì)電泳染色方法。方法 利用考馬斯亮藍(lán)G-250(CBB G-250)在SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)后對(duì)蛋白質(zhì)條帶進(jìn)行染色,對(duì)不同染色條件進(jìn)行探討,并與考馬斯亮藍(lán)R-250(CBB R-250)染色法進(jìn)行比較。結(jié)果 CBB G-250染色法試劑無毒,背景淺,經(jīng)改良其靈敏度與CBB R-250染色法相當(dāng),達(dá)到0.1~0.5μg。結(jié)論 CBB G-250染色方法簡單經(jīng)濟(jì),靈敏度能夠滿足一般要求,適用于蛋白質(zhì)電泳結(jié)果的快速分析。
SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳;染色方法;考馬斯亮藍(lán)G-250;靈敏度
蛋白質(zhì)條帶染色是SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)中的重要步驟,染色方法有多種[1],考馬斯亮藍(lán)R-250(CBB R-250)(三苯基甲烷)染色法是生化實(shí)驗(yàn)室中蛋白質(zhì)電泳檢測和定量分析常用的方法??捡R斯亮藍(lán)G-250(CBB G-250)分子結(jié)構(gòu)略有不同,是一種甲基取代的三苯基甲烷,廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)溶液濃度測定[2],因其電泳染色靈敏度稍差,應(yīng)用較少。研究表明,酸性條件下CBB G-250分子的芳香環(huán)結(jié)構(gòu)通過疏水相互作用形成聚集體[3],在電泳染色中染料是以聚集體的形式與蛋白質(zhì)結(jié)合,高濃度的硫酸銨可以使染料分子的聚集體增加,提高染色靈敏度并降低背景[4-5],用中性鹽作為脫色液可以快速無毒地達(dá)到很好的效果[6]。本文以 Bradford CBB G-250的染色液[2]為基礎(chǔ),對(duì)SDS-PAGE凝膠的染色條件進(jìn)行探討和改良,力求建立一種更簡便快速、靈敏的蛋白質(zhì)條帶染色方法。
大腸桿菌DH5α菌株提取液來自本院分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室;blue plus protein marker(包含6種已知相對(duì)分子質(zhì)量(Mr)的標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì),Mr16 000~94 000),北京全式金生物技術(shù)有限公司;CBB G-250,Amresco公司;牛血清白蛋白(BSA)(進(jìn)口分裝),北京中北林格科技發(fā)展有限公司。
SE250小型垂直板電泳槽及電源,瑞典GE公司;HEλIOSα紫外-可見分光光度計(jì),英國UNICAM公司;凝膠成像儀,法國Vilber Lourmat公司;脫色搖床,美國Parmer公司。
2.1.1 CBB G-250 染色液 CBB G-250 100 mg,無水乙醇50 mL,85%磷酸100 mL,用去離子水稀釋至1 000 mL,濾紙過濾備用。
2.1.2 固定液 含50%甲醇或50%乙醇,10%乙酸,40%去離子水。
2.1.3 脫色液 7%乙酸溶液或0.25 mol/L氯化鉀溶液。
電泳方法參照《分子克隆實(shí)驗(yàn)指南》[7],采用5%濃縮膠,12%分離膠(凝膠厚度1 mm)進(jìn)行SDSPAGE電泳。電泳完畢取出凝膠,置于不同成份的固定液中固定0.5~1 h;然后將凝膠置于不同成份的染色液中,振蕩染色1~3 h或過夜;棄去染色液,將凝膠置于不同成份的脫色液中脫色;對(duì)凝膠進(jìn)行照相。
對(duì)CBB G-250染色液(含 15μg/mL BSA,2μg/mL SDS或含15μg/mL BSA和2μg/mL SDS)在320~800 nm波長范圍內(nèi)進(jìn)行掃描,觀察SDS對(duì)染料與蛋白質(zhì)結(jié)合的影響。
電泳過程按照常規(guī)操作,固定液中含50%甲醇或50%乙醇,其它成分相同,固定時(shí)間0.5或1 h做比較。染色結(jié)果顯示,固定步驟是必需的,含50%甲醇固定0.5 h即可進(jìn)行染色,但固定1 h染色效果更佳;含50%乙醇固定時(shí)間0.5 h染色效果稍差,固定1 h以上可達(dá)到同樣效果;固定過程中更換固定液可以加強(qiáng)固定效果(圖1)??梢娨掖纪耆梢蕴娲状甲鳛楣潭ㄒ旱挠行С煞?,降低固定液的毒性。
電泳和固定過程按照常規(guī)操作,用CBB G-250染色液染色1,2,3 h或過夜,結(jié)果表明染色1 h已能初步觀察結(jié)果,染色3 h蛋白質(zhì)條帶顏色已到達(dá)飽和,與染色過夜的結(jié)果相當(dāng)(圖2)。所以染色2 h能夠基本滿足要求,對(duì)于濃度較低的樣品可適當(dāng)延長染色時(shí)間。
對(duì)染色液中含85%磷酸分別為10%,15%,20%時(shí)進(jìn)行染色試驗(yàn),結(jié)果顯示當(dāng)染色液中含10%的85%磷酸時(shí)染色效果最好。反應(yīng)體系的酸度影響染料分子的質(zhì)子化程度,從掃描光譜看到吸收峰的高度和位置均發(fā)生變化[3]。當(dāng)染色液中含有10%的85%磷酸時(shí),染料分子的磺酸基仍然多處于解離狀態(tài),利于與蛋白質(zhì)中的堿性氨基酸殘基結(jié)合。當(dāng)染色液中含有15%以上的85%磷酸時(shí),染料分子的聚集程度增加使得部分染料分子沉淀出來,造成染色效果較差。
圖1 固定液的成份及固定時(shí)間對(duì)染色效果的影響Fig.1 The effect of fixative composition and fixed time on the staining
圖2 CBB G-250染色時(shí)間對(duì)染色效果的影響Fig.2 The effect of fixed time of CBB G-250 on the staining
用不同濃度的BSA溶液作為樣品進(jìn)行電泳,利用CBB R-250和CBB G-250兩種染色液分別染色,CBB R-250的染色靈敏度達(dá)到0.1μg,CBB G-250的染色靈敏度僅1μg。在CBB G-250染色液中加入10%硫酸銨,可使其染色靈敏度提高到0.1~0.5μg(圖3),基本能達(dá)到CBB R-250的染色水平。試驗(yàn)結(jié)果顯示高濃度的硫酸銨能促進(jìn)染料與蛋白質(zhì)的結(jié)合,在提高染色靈敏度的同時(shí)沒有加深背景。
CBB G-250染色后背景很淺,對(duì)于濃度高的樣品可以直接觀察到條帶,利用7%乙酸漂洗2h即可脫去背景的顏色。試用0.25 mol/L氯化鉀溶液進(jìn)行脫色比乙酸脫色效果更明顯,條帶更清晰,且無毒無味,利于環(huán)保。
圖3 硫酸銨對(duì)CBB G-250染色靈敏度的影響Fig.3 The effect of(NH4)2SO4 on the sensitivity of CBB G-250
對(duì)CBB G-250染色液及含有BSA和SDS的染色液在320~800 nm范圍內(nèi)進(jìn)行掃描,從掃描圖譜(圖4)觀察到,CBB G-250染色液在465和645 nm有吸收峰,當(dāng)染料與蛋白質(zhì)結(jié)合后,在595 nm處出現(xiàn)了一個(gè)峰與645 nm的峰疊加;當(dāng)染色液中含有SDS時(shí),染料分子及其與蛋白質(zhì)結(jié)合后的掃描曲線均發(fā)生了變化,第2個(gè)峰移到660 nm,且595 nm處的吸收變得不明顯。實(shí)驗(yàn)中也發(fā)現(xiàn)SDS的存在確實(shí)影響染色效果,其原因可能是由于SDS易于與蛋白質(zhì)結(jié)合,它的存在干擾染料與蛋白質(zhì)的結(jié)合,從而影響染色效果。實(shí)驗(yàn)表明在固定步驟中更換固定液能更好地除去SDS,染色效果更好。
本研究結(jié)果表明,通過采用 CBB G-250染色法,乙醇完全可以替代甲醇作為固定液的有效成分,這樣可以降低固定液的毒性,使操作更加安全;染色液中含10%的85%磷酸時(shí)染色效果最好,在染色液中加入10%硫酸銨,可使其染色靈敏度明顯提高,染色2 h能夠達(dá)到最佳效果,對(duì)于濃度較低的樣品可適當(dāng)延長染色時(shí)間;用0.25 mol/L氯化鉀溶液替代7%乙酸溶液漂洗脫色效果更明顯,條帶更清晰,且無毒無味,有利于環(huán)保;此外固定步驟很重要,更換固定液能更好地除去SDS,染色效果更好。雖然CBB G-250染色法靈敏度略遜于CBB R-250染色法,但是經(jīng)過實(shí)驗(yàn)的改良基本能達(dá)到CBB R-250的染色水平。本方法的優(yōu)點(diǎn)在于CBB G-250能快速結(jié)合蛋白質(zhì),染色時(shí)間短,而背景顏色很淺,易于脫色,對(duì)于蛋白質(zhì)含量較大的樣品染色1 h不經(jīng)脫色即可觀察結(jié)果,并且重復(fù)性好、穩(wěn)定性強(qiáng),所以CBB G-250染色法是一種經(jīng)濟(jì)快捷實(shí)用的方法,適用于蛋白質(zhì)電泳定量分析,值得推廣使用。
圖4 SDS對(duì)CBB G-250染色的影響Fig.4 The effect of SDSon CBB G-250 staining
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Investigation of protein staining protocols of SDS-polyacrylamide gel electrophoresis
HU Xiao-qian,CHEN Lai-tong,ZHAO Jian
(School of Life Sciences,Peking University,Beijing 100871,China)
Purpose To establish a simple,rapid,highly sensitive,non-toxic protein electrophoresis staining protocol.Methods By utilizing Coomassie Brilliant Blue G-250(CBB G-250)to stain the protein bands by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis(SDS-PAGE),the different dyeing conditions were explored and compared to the staining of Coomassie Brilliant Blue R-250(CBB R-250).Results CBB G-250 staining protocol presents non-toxic,light background and comparable sensitivity after optimization to CBB R-250 staining,which is reaching 0.1-0.5 μg.Conclusion CBB G-250 staining protocol is simple and economic.Its sensitivity could meet the general requirements,and is applicable to the rapid analysis of protein electrophoresis.
SDS-PAGE;staining method;Coomassie Brilliant Blue G-250;sensitivity
Q503
A
1005-1678(2011)02-0128-03
2010-01-26
胡曉倩,女,工程師,主要從事生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)和研究工作,Email:huxiaoqian@pku.edu.cn。