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醫(yī)學(xué)開放存取資源的分布與獲取途徑

2010-06-06 06:25:36
中西醫(yī)結(jié)合研究 2010年5期
關(guān)鍵詞:生物醫(yī)學(xué)全文論文

劉 暢

華中科技大學(xué)圖書館,武漢 430074

1 開放存取資源概述

開放存取(Open Access,簡稱OA),又被譯為公開獲取、公開訪問、開放使用等。根據(jù)目前國際上關(guān)于OA較權(quán)威的三大宣言《布達(dá)佩斯開放存取倡議》[1]、《巴斯達(dá)開放存取出版聲明》[2]以及《柏林宣言》[3]對于OA的定義,筆者認(rèn)為開放存取資源(Open Access Resource,簡稱OA資源)是作者或出版社在擁有版權(quán)和授權(quán)的情況下,將其發(fā)表或出版的科研成果通過OA形式在互聯(lián)網(wǎng)上進(jìn)行發(fā)布,并以O(shè)A形式提供給公眾的一種開放性學(xué)術(shù)資源。

作為一種在網(wǎng)絡(luò)環(huán)境中發(fā)展起來的新型學(xué)術(shù)交流機(jī)制和全新的學(xué)術(shù)信息出版模式,OA資源的宗旨在于打通學(xué)術(shù)交流空間以及使用權(quán)限上的障礙,利用網(wǎng)絡(luò)條件促進(jìn)學(xué)術(shù)資源的傳播和交流,實(shí)現(xiàn)科學(xué)成果的廣泛共享,提高科學(xué)研究的效率以及提升科學(xué)研究成果的公共利用率,受到了學(xué)術(shù)界、出版界和圖書情報(bào)界廣泛的認(rèn)同和支持。

隨著OA運(yùn)動(dòng)的不斷發(fā)展,近年來,OA資源迅速增長,數(shù)量可觀。當(dāng)前OA資源主要有OA期刊和OA倉儲(chǔ)兩種形式[4],根據(jù)已有研究成果顯示,著名期刊指南《烏利希國際期刊指南》所收錄的OA期刊中,生物學(xué)、醫(yī)學(xué)的數(shù)量最多[5]。在全球最大的開放存取倉儲(chǔ)目錄OpenDOAR統(tǒng)計(jì)的OA倉儲(chǔ)學(xué)科分布上,醫(yī)學(xué)倉儲(chǔ)數(shù)量位居第一,已達(dá)122個(gè)[6]。在質(zhì)量控制方面,大部分OA期刊要求提交的論文必須經(jīng)由同行評審或者有編輯進(jìn)行質(zhì)量控制,一些著名的OA出版社出版的OA期刊大多都被SCI索引,其影響因子還居于所屬學(xué)科前列[7]。因此,醫(yī)學(xué)類OA資源的數(shù)量多,質(zhì)量也相對有保障,筆者將常用的醫(yī)學(xué)OA資源的獲取歸納為OA資源出版機(jī)構(gòu)、學(xué)科庫以及OA期刊目錄三種途徑,供廣大醫(yī)學(xué)工作者參考。

2 OA資源出版機(jī)構(gòu)

OA運(yùn)動(dòng)的興起帶動(dòng)了一批OA資源出版機(jī)構(gòu)的發(fā)展,在醫(yī)學(xué)方面以 PLoS、BioMed Central和 High-Wire Press最有影響力。這些出版社出版的OA期刊不僅在學(xué)術(shù)質(zhì)量上有保證,也利于用戶收集利用。

2.1 PLoS

公共科學(xué)圖書館(Public Library of Science,簡稱PLoS)(網(wǎng)址:http://www.plos.org/)是一個(gè)由科學(xué)家和醫(yī)生組成的非營利機(jī)構(gòu),致力于把世界上科學(xué)和醫(yī)學(xué)的文獻(xiàn)作為免費(fèi)資源向公眾開放。

目前,已出版7種經(jīng)過同行評審的生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的 OA期刊,分別是:PLoS Biology、PLoS Medicine、PLoS Computational Biology、PLoS Genetics、PLoS Pathogens、PLoS ONE、PLoS Neglected Tropical Diseases,它們均被 SCI[8]和 MEDLINE[9]收錄。以上七種期刊可在PLoS網(wǎng)站上免費(fèi)獲取全文。

其中PLoS Biology、PLoS Medicine是PLoS第一檔次的期刊,實(shí)行非常嚴(yán)格的同行評審制度,退稿率達(dá)到90%以上。PLoS Biology更是被定位為生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的高端期刊,希望趕超Science、Nature和Cell三大傳統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域權(quán)威期刊,該刊自2003年出版以來影響因子一直居于生物學(xué)期刊榜首且遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于本學(xué)科其他期刊,五年平均影響因子達(dá)14.798[10]。PLoS Medicine也表現(xiàn)不俗,五年平均影響因子為14.023,在其所屬學(xué)科 MEDICINE、GENERAL&INTERNAL 2009年期刊影響因子排名中位居第六[11]。PLoS ONE定位為發(fā)表任何在方法學(xué)上合理的文章,采用“輕度”同行評審(light-peerviewed)的評審機(jī)制,投稿相對容易。

2.2 BioMed Central

生物醫(yī)學(xué)中心(BioMed Central)(網(wǎng)址:http://www.biomedcentral.com/)是一家提供經(jīng)過同行評審的生物學(xué)、醫(yī)學(xué)研究論文開放出版的獨(dú)立出版社。

BioMed Central對論文的質(zhì)量進(jìn)行嚴(yán)格控制,對所有提交的研究論文進(jìn)行嚴(yán)格的同行評議,并且要求評審人員在每篇論文后面署名,論文的初稿、評審人員的意見、修改稿等都發(fā)布在網(wǎng)站上。BioMed Central除了將其出版的所有論文全部及時(shí)存入PubMed Central學(xué)科庫和多個(gè)其他國際資源庫,如 Google、Google Scholar、OAIster、Scirus、Socdar和 Zetoc 中外,還允許作者立即將已發(fā)表文章的最終正式版存入任何適當(dāng)?shù)臄?shù)字資源庫,因此,用戶可以通過多種途徑獲取BioMed出版的OA期刊。此外,BioMed Central所有雜志的論文都采用Scopus和 Google Scholar進(jìn)行跟蹤,以便作者們查看自己的研究被引用的次數(shù)[12]。

截至2010年9月9日,BioMed提供了206種經(jīng)過同行評審的生物醫(yī)學(xué)研究方面的期刊[13],其中有99種期刊被SCI索引[14],這說明該出版社出版的期刊中已有48%的期刊被 ISI索引,BioMed Central已成為出版高質(zhì)量的OA期刊的重要力量。但與PLoS相比,BioMed Central發(fā)行的OA期刊數(shù)量多,但影響力略低。

2.3 HighWire Press

HighWire Press(網(wǎng)址:http://highwire.stanford.edu)是全球最大的提供免費(fèi)全文的學(xué)術(shù)文獻(xiàn)出版商之一,于1995年由美國斯坦福大學(xué)圖書館創(chuàng)立。最初僅出版著名的周刊“Journal of Biological Chemistry”,目前已收錄電子期刊1 236種,內(nèi)容覆蓋生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、物理學(xué)、社會(huì)科學(xué),其中以生物醫(yī)學(xué)方面的OA期刊論文居多。

HighWire Press的出版物中不乏一些影響力比較高的期刊,如 Journal of Biological Chemistry、Health Policy and Planning、Health Services Research and Policy、Journal of Infection Prevention、Journal of Public Health和Occupation and Environmental Medicine。在所收錄的期刊中,46種完全免費(fèi) ,如Journal of Clinical Investigation、CA:A Cancer Journal for Clinicians、Clinical Diabetes;282 種免費(fèi)提供部分過刊全文、即在期刊出版一定時(shí)間(6~18個(gè)月)后免費(fèi)開放,如 American Journal of Clinical Nutrition、American Journal ofPhysiology 和 Blood等[15]。目前共有1 987 039篇可免費(fèi)獲得的全文[16]。

HighWire Press界面友好,檢索功能豐富,可以通過瀏覽主題詞來檢索對應(yīng)的期刊,同時(shí)也提供了一些個(gè)性化推送服務(wù)和研究工具,如引文管理軟件、桌面關(guān)鍵詞、地圖等[17]。因此,筆者認(rèn)為該網(wǎng)站是生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域研究者較好的信息參考來源。

3 醫(yī)學(xué)學(xué)科庫

學(xué)科庫,也被稱為“學(xué)科知識(shí)庫”、“學(xué)科開放存取倉儲(chǔ)”或“學(xué)科倉儲(chǔ)”,在國外通常被稱為“disciplinary archives”、“subject(discipline)based repositories”、“subjectspecific repositories”、“discipline-oriented repositories”和“domain specific data archives”等。有學(xué)者認(rèn)為“學(xué)科庫”最能代表這個(gè)主題概念[18],筆者亦贊同這一觀點(diǎn)。

關(guān)于學(xué)科庫的準(zhǔn)確定義尚無明確標(biāo)準(zhǔn),筆者認(rèn)為,從學(xué)科庫建設(shè)角度來說,它是以學(xué)科為主線,對某個(gè)學(xué)科領(lǐng)域的各種類型的資源進(jìn)行捕獲、收集、整理、描述、組織、索引,實(shí)現(xiàn)這些對象的長期保存和廣泛傳播,以實(shí)現(xiàn)對這些對象資源的共享和利用為目的的知識(shí)庫。

用戶可訪問全球最大的開放存取倉儲(chǔ)目錄Open-DOAR(網(wǎng)址:http://www.opendoar.org/)通過學(xué)科瀏覽功能方便找到醫(yī)學(xué)倉儲(chǔ)庫。前文中已說明在目前的OA倉儲(chǔ)學(xué)科分布上,醫(yī)學(xué)倉儲(chǔ)數(shù)量最多,無法詳細(xì)列舉,在此僅介紹最著名的醫(yī)學(xué)學(xué)科庫公共醫(yī)學(xué)中心(PubMed Central,簡稱 PMC)。

PMC(網(wǎng) 址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/)創(chuàng)建于2000年2月,是一個(gè)數(shù)字化的全文數(shù)據(jù)庫,由美國國家醫(yī)學(xué)圖書館(National Library of Medicine,簡稱NLM)下的生物技術(shù)信息國家中心[美國國家生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information),簡稱 NCBI]開發(fā)、管理和維護(hù)。學(xué)科領(lǐng)域涉及生物醫(yī)學(xué)、行為科學(xué)和臨床研究等學(xué)科領(lǐng)域,提供完全免費(fèi)的全文服務(wù)。PMC目前已收錄1 062種期刊,另外,還提供 MEDLINE、PREMEDLINE的文摘信息。出版社自愿加入PMC,但加入的期刊必須滿足編輯出版標(biāo)準(zhǔn),PMC論文的版權(quán)屬于期刊或作者所有[19]。

在資源開放程度上,由于 PMC中的論文大多有版權(quán)限制,因此全文開放存取的時(shí)間有所差異,分為可立即獲取(Immediate)、1個(gè)月后(After 1 month)、3個(gè)月后(After 3 months)、4個(gè)月后(After 4 months)、5個(gè)月后 (After 5 months)、6個(gè)月后 (After 6 months)、12個(gè)月后(After 12 months)和 36個(gè)月后(After 36 months)開放存取幾種形式,但83.6%的全文都是可以立即獲取的。PMC的資源獲取僅僅在獲取時(shí)間這一個(gè)方面有所限制。

在資源質(zhì)量控制方面,PMC收錄的期刊論文均經(jīng)過同行評議,質(zhì)量非常高,它收錄的很多期刊都被SCI所收錄。2009年3月11日,美國總統(tǒng)奧巴馬簽署了《2009年綜合撥款法案》(The 2009 Consolidated Appropriations Act),其中包括使美國國家衛(wèi)生研究院(National Institutes of Health,NIH)的強(qiáng)制性實(shí)施的公共存取政策(Public Access Policy)永久生效[20]。該政策要求受NIH資助開展研究而產(chǎn)出的經(jīng)同行評審的最終版本論文全文在期刊發(fā)表后至多12個(gè)月內(nèi)均應(yīng)通過PMC提供免費(fèi)在線利用與檢索。這一法案為PMC的資源數(shù)量和質(zhì)量提供了政策上的根本保障。

PMC的成立和發(fā)展是一批有志于推動(dòng)學(xué)術(shù)論文自由出版的科學(xué)家共同努力的結(jié)果,成為目前生物醫(yī)學(xué)研究者一站式獲取資源的理想站點(diǎn)。

4 OA期刊目錄

除了專門的醫(yī)學(xué)OA資源出版機(jī)構(gòu)、醫(yī)學(xué)學(xué)科庫之外,綜合性的OA期刊目錄也是獲取醫(yī)學(xué)OA期刊的途徑之一。目前,不少機(jī)構(gòu)和研究人員對現(xiàn)有的OA期刊進(jìn)行了收集整理,并提供站點(diǎn)和強(qiáng)大的檢索功能,有的甚至提供了期刊內(nèi)論文級(jí)別的檢索功能。筆者將其中最有影響的站點(diǎn)整理如下(表中數(shù)據(jù)均于2010年9月9日更新)。見表1。

以下5個(gè)站點(diǎn)可以說是目前世界上收錄范圍最廣、影響力最大的OA期刊目錄網(wǎng)站,具有發(fā)展迅速、資源數(shù)量龐大的特點(diǎn),并都提供較為健全和方便的檢索和瀏覽功能以及實(shí)用而有特色的增值服務(wù),限于篇幅不再展開。

表1 國內(nèi)外著名的OA期刊目錄站點(diǎn)(依首字母字順排列)

除了以上這3種醫(yī)學(xué)OA資源直接的來源渠道之外,還可以通過一些專業(yè)OA資源的搜索引擎,如OAIster、ePrints-U K來查找OA資源,這些搜索引擎對遵守OAI-PMH協(xié)議的OA資源進(jìn)行搜索,其中也能找出有關(guān)OA期刊的信息,并提供全文檢索服務(wù)。

5 結(jié)語

總之,OA期刊對降低科學(xué)文化傳播的成本,促進(jìn)科學(xué)信息的廣泛傳播、加快學(xué)術(shù)信息的交流、保障科學(xué)信息的長期保存,達(dá)到文獻(xiàn)資源的免費(fèi)共享,具有深遠(yuǎn)的進(jìn)步意義。隨著資源共享理念得到越來越多的政府機(jī)構(gòu)、學(xué)術(shù)團(tuán)體以及出版商的認(rèn)同,OA資源在質(zhì)量和數(shù)量上都有質(zhì)的飛躍,希望廣大醫(yī)學(xué)工作者能關(guān)注、利用OA資源并最終成為OA運(yùn)動(dòng)的參與者。

[1] What does BOAI mean by“open access”?[EB/OL].[2010-09-06].http://www.earlham.edu/~peters/fos/boaifaq.htm#Opena ccess.

[2] Definition of Open Access Publication[EB/OL].[2010-09-06].http://www.earlham.edu/~peters/fos/bethesda.htm#definition.

[3] Berlin Declaration on Open Access to Knowledge in the Sciences and Humanities[EB/OL].[2010-09-06].http://oa.mpg.de/openaccess-berlin/berlindeclaration.html.

[4] 李武.開放存取出版的兩種主要實(shí)現(xiàn)途徑[J].大學(xué)圖書館學(xué)報(bào),2005,23(4):58-63.

[5] 陳傳夫,王云娣.開放存取期刊的分布及獲取策略研究[J].中國圖書館學(xué)報(bào),2007,(6):82-87.

[6] OPENDOAR.[EB/OL].[2010-09-06].http://www.opendoar.org/find.php?format=charts.

[7] 劉暢.開放存取期刊的影響力分析[J].圖書情報(bào)工作,2008,(12):9-12.

[8] Web of knowledge[EB/OL].[2010-09-06].http://isiknowledge.com/wos.

[9] MEDLINE.[EB/OL].[2010-09-06].http://apps.isiknowledge.com/MEDLINE_GeneralSearch.

[10] JCR.[EB/OL].[2010-09-06].http://admin-apps.isiknowledge.com/JCR/JCR?RQ=RECORD&rank=1&journal=PLOS+BIOL.

[11] JCR.[EB/OL].[2010-09-06].http://admin-apps.isiknowledge.com/JCR/JCR?RQ=RECORD&rank=6&journal=PLOS+MED.

[12] BioMed Central Journals[EB/OL].[2010-9-8].http://www.biomedcentral.com/info/LibrAri es/indexing.

[13] BioMed Central[EB/OL].[2010-9-8].http://www.biomedcentral.com.

[14] Journal Indexing[EB/OL].[2010-9-8].http://www.biomedcentral.com/info/libraries/indexing.

[15] 路懷明.國外開放獲取醫(yī)學(xué)期刊全文網(wǎng)站的開發(fā)利用[J].醫(yī)學(xué)信息,2009,(8):9-12.

[16] Journal Indexing[EB/OL].[2010-9-8].http://highwire.stanford.edu/lists/freeart.dtl.

[17] Journal Indexing[EB/OL].[2010-9-8].http://highwire.stanford.edu/tools.dtl.

[18] 黃如花,馮晴.論學(xué)科庫的建設(shè)[J].圖書館論壇,2007,(6):131-136.

[19] PubMed Central[EB/OL].[2010-9-2].http://www.pubmedcentral.nih.gov/about/intro.html.

[20] Peter Suber.Open Access news.[EB/OL].[2010-4-12].www.earlham.edu/~peters/fos/fosblog.Html.

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