苗明珠 綜述 孫麗洲 審校
(南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院婦產(chǎn)科,江蘇 南京 210036)
非整倍體異常是人類最常見的一類染色體數(shù)目異常,其中最常見的為三體征,常見染色體三體綜合征的發(fā)病率為1∶400[1]。最常見的非整倍體異常發(fā)生在21、18、13號(hào)常染色體及X,Y性染色體。這些異常主要包括21-三體綜合征(唐氏綜合征)、18-三體綜合征(Edward綜合征)、13-三體綜合征(Patau綜合 征)、45XO(Turner 綜 合 征)、47XXY(Klinefelter綜合征),約占產(chǎn)前診斷中有臨床意義的染色體異常的80%[2,3]。因此,做好對(duì)胎兒非整倍體的檢測(cè)一直是產(chǎn)前診斷的重要部分。
傳統(tǒng)的產(chǎn)前診斷方法為細(xì)胞遺傳學(xué)核型分析,是診斷染色體異常的金標(biāo)準(zhǔn)。方法是對(duì)羊膜腔穿刺獲得的羊水細(xì)胞或絨毛抽吸獲得的絨毛細(xì)胞進(jìn)行培養(yǎng),對(duì)染色體有絲分裂期的核分裂相進(jìn)行分析。對(duì)所有的23對(duì)染色體都進(jìn)行檢查,可以檢出包括染色體數(shù)目異常和染色體重排等結(jié)構(gòu)異常在內(nèi)的多種染色體異常,例如平衡或不平衡的染色體易位和染色體倒位。盡管核型分析為最有效的產(chǎn)前診斷方法,但是該方法需要高質(zhì)量的專業(yè)人員且非常耗時(shí),其結(jié)果報(bào)道的時(shí)間大約為10~14天[4]。據(jù)報(bào)道,在英國每20個(gè)孕婦就有一個(gè)需要進(jìn)行產(chǎn)前診斷[5]。傳統(tǒng)的細(xì)胞遺傳學(xué)方法在產(chǎn)前診斷的發(fā)展中已受到限制,尋找快速、準(zhǔn)確的產(chǎn)前診斷方法已成為當(dāng)今產(chǎn)前診斷的研究熱點(diǎn)。對(duì)于我國這樣一個(gè)人口大國來講,尋求更快、更簡便的產(chǎn)前診斷方法更加重要及必需。目前我國進(jìn)行產(chǎn)前診斷的指征主要有:高齡孕婦(≥35歲)、血清學(xué)篩查高風(fēng)險(xiǎn)、超聲探測(cè)的胎兒異常及父母一方或雙方有染色體異常的家族史。近年來,隨著高齡產(chǎn)婦的增加,以及孕婦外周血清學(xué)篩查的開展和超聲技術(shù)的發(fā)展,需要進(jìn)行產(chǎn)前診斷的孕婦數(shù)量逐年增加[5],因此,很有必要建立快速、簡便的非整倍體診斷方法應(yīng)用于臨床。分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展為尋求新的產(chǎn)前診斷技術(shù)提供了基礎(chǔ)。一些分子診斷技術(shù)已用于產(chǎn)前診斷領(lǐng)域,可做到快速診斷,通常在24~48小時(shí)內(nèi)即可得到結(jié)果[1]。熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(quantitative fluorescent polymerase chain reaction,QF-PCR)就是一種迅速發(fā)展的可用于快速產(chǎn)前診斷的分子生物學(xué)方法。1992年,日本人 Higuchi發(fā)明了該技術(shù)[6]。QFPCR是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)積累實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,最后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法[6]。1993年Mansfield ES[7]首次報(bào)道了基于短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeat,STR)的 QF-PCR 產(chǎn)前診斷技術(shù),至今已經(jīng)歷了近20年的發(fā)展。本文著重對(duì)QF-PCR在產(chǎn)前診斷非整倍體中的應(yīng)用進(jìn)行探討。
自從1983年Mullis發(fā)明聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)以來,PCR技術(shù)作為一種重要的基因診斷方法,以其迅速、簡便、靈敏等優(yōu)點(diǎn)很快成為科研、臨床診斷的熱點(diǎn)技術(shù)。但是傳統(tǒng)PCR技術(shù)不能準(zhǔn)確定量。為克服上述不足,人們采取了許多方法,如雜交法、酶聯(lián)法及尿苷酶降解法等,但均不能得到滿意的結(jié)果。直到1992年,日本人Higuchi[6]發(fā)明實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),該問題才逐步得到改善。他在原有的普通PCR儀的基礎(chǔ)上,加以改進(jìn),添加一個(gè)激發(fā)和檢測(cè)裝置,并通過在PCR反應(yīng)液中添加染料溴化乙錠(EB)的方法,來實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR反應(yīng)的全過程。隨著新的熒光染料和熒光標(biāo)記探針的引入以及QF-PCR高靈敏度、高特異性和高精確性的特點(diǎn),目前該技術(shù)已被廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)科學(xué)研究、臨床診斷、疾病研究及藥物研發(fā)等領(lǐng)域。
QF-PCR技術(shù)首次用于非整倍體的產(chǎn)前診斷源于1993年,Mansfield[7]應(yīng)用基于STR的 QF-PCR技術(shù)診斷了21三體、18三體及X染色體數(shù)目異常。STR,是多型性的一種類型,指兩個(gè)或多個(gè)核苷酸重復(fù)排列,且不同的重復(fù)序列相鄰的形式,長度約2~10個(gè)堿基對(duì),常見于非編碼的內(nèi)含子中。由于重復(fù)單位及重復(fù)次數(shù)不同,使其在不同種族、不同人群之間的分布具有很大差異性,構(gòu)成了STR遺傳多態(tài)性。不同個(gè)體之間在一個(gè)同源STR位點(diǎn)的重復(fù)次數(shù)不同,由此可應(yīng)用基于STR的等位基因比判斷感興趣的染色體的拷貝數(shù)。Mansfield用于診斷的STR分別為21號(hào)染色體的D21S11,18號(hào)染色體的MBP的5’端的2個(gè)STR、X染色體的HPRT等。1994年,Pertl等應(yīng)用相同的STR——D21S11,對(duì)134例樣本進(jìn)行了診斷。除了2例無法判斷,其余正常樣本均顯示雙等位基因比接近1∶1,21三體樣本顯示為1∶1∶1的三等位基因比或2∶1的雙等位基因比[8]。當(dāng)一種染色體只應(yīng)用一個(gè)STR時(shí),如果兩條同源染色體的STR相同,即為純合,就無法判斷該染色體的拷貝數(shù)。為了克服上述問題,在接下來的一系列研究中一些學(xué)者逐漸對(duì)一種染色體應(yīng)用幾個(gè)STR,以提高雜合覆蓋率,進(jìn)而減少無法判斷的情況[9,10]。經(jīng)歷了近20年的發(fā)展,現(xiàn)在用于常見非整倍體診斷的STR,英國臨床細(xì)胞遺傳學(xué)協(xié)會(huì)(Association of Clinical Cytogenetics,ACC)已于2007年做了明確規(guī)定。
除了上述幾種非整倍體異常的診斷方法,1998年13三體綜合征也應(yīng)用QF-PCR的方法首次成功診斷[11]。于是,QF-PCR在非整倍體的產(chǎn)前診斷中主要應(yīng)用于21、18、13、X、Y幾種常見染色體異常的診斷。在QF-PCR首次報(bào)道用于非整倍體的產(chǎn)前診斷后,接下來的研究主要集中于其在幾種常見非整倍體異常產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用及單細(xì)胞方面[8,9,12],并未對(duì)該方法的靈敏度及特異性進(jìn)行系統(tǒng)的研究。直到2001年,一些大樣本的研究才開始對(duì)QF-PCR的靈敏度及特異性進(jìn)行考察[13,14]。一系列的研究證實(shí),QF-PCR對(duì)于非嵌合的非整倍體診斷的靈敏度和特異性均在90%以上[15-20]。在歐洲一些實(shí)驗(yàn)室,QF-PCR已取代其他非整倍體快速產(chǎn)前診斷(rapid aneuploidy detection,RAD)方法,作為核型分析的一種輔助手段用于非整倍體的快速產(chǎn)前診斷。
3.1.1 所需樣本量小、取樣孕周要求低 QF-PCR用于產(chǎn)前診斷所用的樣本可以是羊水、絨毛、胎兒血或胎兒組織,目前最常用的為羊水和絨毛。傳統(tǒng)的核型分析需要20mL的羊水,F(xiàn)ISH需要5~10ml的羊水。用于QF-PCR的DNA可以從很少量的羊水中提取,文獻(xiàn)中報(bào)道的用量為0.5~5ml[21-25],最多見的用量還是1~2ml[23]。其他樣本的用量為胎兒血5μL,1~2mm厚的胎兒組織層等[20]。用于PCR擴(kuò)增的DNA主要提取自細(xì)胞,因此不要求細(xì)胞必須是未受損的或是活細(xì)胞。這就使該方法對(duì)樣本的取樣孕周無特定要求,可早在12周,或晚期34周時(shí)進(jìn)行取樣,此時(shí)細(xì)胞活性對(duì)結(jié)果的可靠性沒有影響[13]。
3.1.2 快速 現(xiàn)在已認(rèn)識(shí)到孕婦在等待核型分析結(jié)果的這段長時(shí)間內(nèi),心理上處于一種焦慮狀態(tài)[5],對(duì)胎兒也會(huì)造成不良影響。因此減少等待時(shí)間、緩解焦慮也是RAD被應(yīng)用的一個(gè)主要原因。QFPCR在獲取樣本后24~48小時(shí)即可獲得診斷報(bào)告,可顯著減少孕婦的等待時(shí)間[18]。如果結(jié)果正常,可早期緩解孕婦及家庭的焦慮;如果結(jié)果不正常,可繼續(xù)等待核型分析的結(jié)果,也可即時(shí)采取終止妊娠等處理措施。
3.1.3 自動(dòng)化程度高 傳統(tǒng)的細(xì)胞遺傳學(xué)核型分析需要大量的人力,技術(shù)水平要求高,需要專業(yè)人員。一個(gè)有經(jīng)驗(yàn)的工作人員每年最多也只能完成250例核型分析[26]。而現(xiàn)在,在一個(gè)有DNA測(cè)序儀的實(shí)驗(yàn)室條件下,每次每臺(tái)儀器可完成90份樣本的檢測(cè)[13],甚至有的實(shí)驗(yàn)室每次可完成96例[27]。QF-PCR可實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化,一個(gè)工作人員可完成的檢測(cè)量明顯多于核型分析。因此,每天可進(jìn)行大量患者樣本的檢測(cè)。
3.1.4 可檢出母體細(xì)胞污染的樣本 母體細(xì)胞污染主要發(fā)生于侵入性產(chǎn)前診斷取樣過程中。肉眼可見的母血細(xì)胞污染的樣本,我們?cè)谔幚頃r(shí)不難發(fā)現(xiàn),但是對(duì)于一些肉眼無法辨別的污染樣本,在進(jìn)行核型分析或FISH檢測(cè)時(shí)則會(huì)遇到一定的問題。當(dāng)胎兒性別為男性時(shí),母體細(xì)胞污染容易檢出,但當(dāng)胎兒為女性時(shí),母體和胎兒混雜的細(xì)胞則無法分辨。在對(duì)母體細(xì)胞污染的樣本進(jìn)行QF-PCR檢測(cè)時(shí),會(huì)出現(xiàn)兩種基因型,此時(shí)可獲取母體樣本進(jìn)行擴(kuò)增,與用于產(chǎn)前診斷的樣本進(jìn)行仔細(xì)比較,可確定母體細(xì)胞的污染,但不能對(duì)欲進(jìn)行診斷的樣本做出染色體情況的診斷[22,28]。
3.1.5 成本-效益 與細(xì)胞遺傳學(xué)核型分析不同,QF-PCR不需要細(xì)胞培養(yǎng),也不需要FISH操作時(shí)復(fù)雜的處理程序及人力的消耗,因此其費(fèi)用相對(duì)較低[5,13,17,21,23,28]。對(duì)我國的國情來說,也是一種可行的方法。
3.2.1 只能用于常見染色體異常 QF-PCR現(xiàn)在所用的STRs主要是針對(duì)21、18、13、X、Y等常見染色體的標(biāo)記物,因此該方法目前只能用于這五類常見染色體數(shù)目異常的檢測(cè)[13]。對(duì)于其他目前仍沒有STRs標(biāo)記物的染色體,現(xiàn)在還無法檢測(cè)。
3.2.2 對(duì)嵌合體的檢出還不是很靈敏 QF-PCR已被證實(shí)為可靠的、有效的用于診斷主要的三體征的方法,對(duì)于非嵌合體樣本沒有假陽性和假陰性的結(jié)果[16]。Celia Donaghue等[29]通過實(shí)驗(yàn)評(píng)估了QF-PCR對(duì)嵌合體的檢出效力,并對(duì)檢出結(jié)果與核型分析結(jié)果的相關(guān)性進(jìn)行了分析,所得出的結(jié)論是當(dāng)異常細(xì)胞占整個(gè)樣本至少15%時(shí),QF-PCR可對(duì)其嵌合狀態(tài)做出診斷。也就是說,QF-PCR并不能對(duì)所有嵌合狀態(tài)做出診斷,只有異常細(xì)胞達(dá)到一定比例時(shí),才能做出診斷。
QF-PCR在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用,仍存在一定的爭議。盡管所有報(bào)道都認(rèn)為QF-PCR是一種經(jīng)濟(jì)且快速的診斷技術(shù),但對(duì)其準(zhǔn)確性卻持有不同的觀點(diǎn)。一些學(xué)者認(rèn)為,QF-PCR可作為傳統(tǒng)細(xì)胞遺傳學(xué)的一種輔助手段[9,13,30]。也有學(xué)者認(rèn)為,如果將來胎兒細(xì)胞能從母體外周血中分離得到,QF-PCR可作為產(chǎn)前診斷非整倍體的一種不錯(cuò)的選擇[10],因?yàn)镼F-PCR的應(yīng)用僅需很小的樣本量,有報(bào)道最少可用10個(gè)細(xì)胞[31]。而Mann等[32]卻持有不同的觀點(diǎn),他提倡個(gè)體化的產(chǎn)前診斷方案,即產(chǎn)前超聲異?;蚋改溉旧w異常者,建議核型分析;高齡孕婦或母體血清學(xué)篩查陽性者,可只進(jìn)行QF-PCR診斷。近幾年,Ogilvie和Leung[33,34]建議用QF-PCR取代傳統(tǒng)的細(xì)胞遺傳學(xué)核型分析,他們認(rèn)為該項(xiàng)技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)明顯大于缺點(diǎn)。
QF-PCR在非整倍體快速產(chǎn)前診斷中的研究主要在英國等一些歐 洲國家[20,25,35,36],也有一些在亞洲人群中的研究[22,24,37],而在美國的研究報(bào)道則很少[38]。英國從2007年開始已將QF-PCR作為非整倍體診斷的一種獨(dú)立方法,而不再作為核型分析的一種輔助手段。且英國ACC也于2007年底發(fā)布了QF-PCR用于非整體產(chǎn)前診斷的實(shí)踐指南,使其在此領(lǐng)域的應(yīng)用更加規(guī)范化。關(guān)于QF-PCR在國內(nèi)非整倍體產(chǎn)前診斷中應(yīng)用的報(bào)道不是很多[22,37]。由于大部分這方面的研究都以國外人群作為研究對(duì)象,且STR的遺傳多態(tài)性在不同人群與不同種族之間的分布具有很大差異性,所以直接將國外研究的STR應(yīng)用于國內(nèi)人群的靈敏度與特異性還有待考察。中國應(yīng)用QF-PCR于產(chǎn)前診斷領(lǐng)域,目前主要應(yīng)基于國內(nèi)人群的STR雜合率覆蓋的研究,以選取合適的STR標(biāo)記用于國內(nèi)人群的非整倍體診斷。
經(jīng)歷了近20年的發(fā)展,QF-PCR在英國已作為獨(dú)立檢測(cè)手段應(yīng)用于臨床。隨著此技術(shù)在非整倍體產(chǎn)前診斷中的逐漸應(yīng)用,相應(yīng)的商品化試劑盒也應(yīng)運(yùn)而生。目前用的最廣泛的試劑為ANEUFAST Multiplex QF-PCR Kit,與Chromoquant Version 2kit相比,該試劑盒的數(shù)據(jù)采集與結(jié)果分析都更加容易。
QF-PCR作為快速產(chǎn)前診斷的一種分子生物學(xué)方法,給現(xiàn)在的產(chǎn)前診斷帶來了巨大的發(fā)展前景。但其是否可以取代核型分析,作為一種最具成本-效益的單獨(dú)測(cè)試手段仍存在很大的爭議。在將來希望能將其與母血中游離胎兒核酸的非侵入性檢測(cè)手段結(jié)合起來,進(jìn)行胎兒染色體異常的診斷。相信隨著QF-PCR方法的不斷發(fā)展與成熟,QF-PCR將發(fā)揮越來越大的作用。
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