古 力
英國(guó)人彼得·格雷的《愛爾蘭大饑荒》引用愛爾蘭的一句諺語說:“窮人的餐點(diǎn)——除了小土豆就是大土豆?!痹?9世紀(jì)40至50年代,嚴(yán)重依賴土豆為生的愛爾蘭人遭遇了一場(chǎng)土豆歉收的大饑荒,結(jié)果造成約110萬人死亡,幸存者中大量的人移民到美國(guó)和加拿大,這使得美國(guó)的人口成分發(fā)生了重要的改變,美國(guó)前總統(tǒng)肯尼迪和克林頓就是愛爾蘭移民的后裔。
尋找致病基因
愛爾蘭大饑荒的原因有很多。不過,研究人員一直在探討是什么樣的致病菌導(dǎo)致了當(dāng)時(shí)的土豆歉收。導(dǎo)致土豆大量死亡的元兇是一種病菌。研究人員一直在探索它的基因。這種探索有點(diǎn)像追蹤1914年至1918年導(dǎo)致4000萬至5000萬人死亡的西班牙大流感的病毒基因一樣。致使農(nóng)作物患病的病原菌如同致人患病的病菌一樣,都可以從基因上探索它們致病力的強(qiáng)與弱、傳播的途徑和危害性。盡管農(nóng)作物患病歉收導(dǎo)致人類的災(zāi)害是間接的,但有時(shí)候并不亞于直接致人以死亡的疾病,愛爾蘭的大饑荒就是如此。因此,這樣的研究在今天可以為防止這兩類大災(zāi)難提供有益的知識(shí)、經(jīng)驗(yàn)和教訓(xùn)。
愛爾蘭大饑荒中的土豆歉收過去一直認(rèn)為是農(nóng)作物的晚疫病菌(一種真菌)所引起。晚疫病菌是卵菌或水霉菌的一個(gè)成員,在遺傳上它與瘧原蟲有著更為親密的關(guān)系。
今天,研究人員終于發(fā)現(xiàn)這種晚疫病菌的遺傳秘碼,并將研究結(jié)果發(fā)表于英國(guó)的《自然》雜志上。晚疫病菌的基因組要比一般的真菌大很多,它的外部裝裹了額外的DNA,使得它能很快適應(yīng)環(huán)境,以進(jìn)攻宿主,如土豆,造成作物大量死亡。
進(jìn)行這項(xiàng)研究的美國(guó)麻省理工和哈佛聯(lián)合學(xué)院的查得·努斯鮑姆指出,晚疫病菌的基因組比它的一些同類細(xì)菌還要大得多,原因在于它擁有一些復(fù)制其自身的跳躍基因。
晚疫病菌的基因組約75%充滿了重復(fù)的DNA,這好像是一種快速的進(jìn)化。這種進(jìn)化使得病菌能迅速演化出可以進(jìn)攻植物宿主的基因。這也能解釋為何晚疫病菌能毀壞在遺傳上對(duì)晚疫病有抵抗力的土豆。多年來,晚疫病一直對(duì)作物造成嚴(yán)重的危害,即使在今天人們可以使用大量的殺蟲劑,但也只有少數(shù)殺蟲劑能對(duì)付它們。
晚疫病通過孢子傳播,對(duì)全球的糧食安全造成了極大威脅。在美國(guó),從邁阿密到俄亥俄州,晚疫病是目前家庭花園中土豆和西紅柿的主要?dú)⑹郑⑼{到這些地方的商業(yè)和農(nóng)場(chǎng)。這種病導(dǎo)致土豆綠葉上環(huán)形的綠霉或棕色斑點(diǎn),并且讓桿莖發(fā)黑,在幾天之內(nèi)就讓莊稼毀滅。
基因的比較
為了弄清晚疫病菌為何有如此大的殺傷力,研究人員破譯了它的基因組并與其兩種親屬——大豆疫霉病菌(P.sojae)和橡樹疫霉病菌(P.ramorun)的基因組進(jìn)行比較。大豆疫霉病菌主要是感染大豆,而橡樹疫霉病菌則會(huì)導(dǎo)致橡樹和其他樹突然死亡。
研究人員發(fā)現(xiàn)。晚疫病菌的基因組是它的兩個(gè)親屬的基因組的2.5到4倍大,而且有兩個(gè)顯著的區(qū)域成全了它的攻擊性。一個(gè)區(qū)域充滿了產(chǎn)生迅速變化的DNA拷貝,是一個(gè)富含重復(fù)基因的區(qū)域。這個(gè)基因密集區(qū)域也包含大量對(duì)感染植物起重要作用的基因,例如它們與損害作物的霉菌屬基因有共同點(diǎn)。而另一個(gè)區(qū)域則包含著數(shù)百萬年進(jìn)化以來所保留的基因。
由于晚疫病菌的基因變異非常迅速,它們能對(duì)作物產(chǎn)生更大的攻擊性,對(duì)作物的致病力也更強(qiáng)。變異基因當(dāng)中有一種關(guān)鍵基因稱為“效應(yīng)器”基因,它能瓦解和破壞作物的正常生理功能,因而能為自己的生存建立一個(gè)根據(jù)地。但是,晚疫病菌的這些基因也可能促發(fā)作物的免疫系統(tǒng)產(chǎn)生反應(yīng),從而把這些基因當(dāng)作晚疫病菌感染的最初目標(biāo)來防御。
正是由于作物的免疫系統(tǒng)的抵抗作用,使得晚疫病菌啟動(dòng)了基因的快速變化來反制作物的免疫系統(tǒng)。晚疫病菌的富含大量重復(fù)基因的區(qū)域就像一個(gè)孵化器,使得能對(duì)作物感染的病菌的關(guān)鍵基因快速地產(chǎn)生,又迅速地死亡。結(jié)果,這些致病的關(guān)鍵基因就既能隨時(shí)起作用,又隨時(shí)丟失,作物的免疫系統(tǒng)也就難以識(shí)別和打擊它們,因而難以抗御病菌的入侵。
對(duì)晚疫病菌基因的分析和對(duì)比也發(fā)現(xiàn),可以通過它們的“效應(yīng)器”基因來識(shí)別以前尚不知的其他致病“效應(yīng)器”基因,特別是可以識(shí)別兩組重要的致病基因,如RXLR基因和哥倫比亞根癌線蟲(CRN)基因。RXLR基因是鐮刀形瘧原蟲向人類紅細(xì)胞中轉(zhuǎn)移所需要的基因,而CRN基因也能導(dǎo)致土豆染病并歉收。這對(duì)今天防止土豆、西紅柿和橡樹等植物的病害也有重要意義。
晚疫病菌的基因分布反映了它的生存戰(zhàn)略,它能迅速產(chǎn)生成千上萬的攻擊性基因,這些基因又比其他寄宿于農(nóng)作物的病菌進(jìn)化得更快。因此,晚疫病菌有強(qiáng)大適應(yīng)性和突變能力。
早在2001年6月7日,美國(guó)北卡羅萊納大學(xué)的植物病理學(xué)家瓊·里泰諾在英國(guó)《自然》雜志上發(fā)表報(bào)告說,引起1845年到1850年間愛爾蘭土豆大饑荒的不是過去所認(rèn)為的來自墨西哥的US-1的菌株,而是另外一種菌株。里泰諾和同事們對(duì)英國(guó)保存的大饑荒土豆枯葉進(jìn)行研究,分析了上面遺留的晚疫病菌的DNA,證明這些DNA特征與US-1菌株并不相同。今天,研究人員終于初步弄清了晚疫病菌的基因組,這對(duì)于防治今天的土豆疫情也有重要的幫助作用。
但是,僅僅弄清土豆的致病原因還不夠,因?yàn)檫@不足以解釋當(dāng)時(shí)歐洲普遍出現(xiàn)土豆的晚疫病,但卻只在愛爾蘭產(chǎn)生大饑荒的現(xiàn)象。這就要從農(nóng)業(yè)指導(dǎo)思想和社會(huì)關(guān)系上找原因。其中一個(gè)重要原因就是,愛爾蘭人把雞蛋裝在了一個(gè)籃子里,或者說,他們只有一種食物可以依賴,這就是土豆。
晚疫病菌的強(qiáng)致病基因固然是土豆歉收的重要原因,但種植的單一和經(jīng)濟(jì)的貧困才是愛爾蘭大饑荒的更重要的原因。(文章代碼:2106)
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