摘要:本研究對遮陰處理和自然光照下睡蓮‘甘娜’葉片進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,以揭示遮陰對其葉片發(fā)育的影響機(jī)制。結(jié)果表明,遮陰處理下共篩選得到I 303個差異表達(dá)基因,其中558個基因上調(diào),745個基因下調(diào);GO功能注釋分析發(fā)現(xiàn),遮陰處理會在細(xì)胞發(fā)育和次生代謝等方面造成影響;KEGG通路注釋與富集分析結(jié)果表明,遮陰處理會影響次生代謝、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞壁生物合成以及光合作用等信號通路的表達(dá)。差異表達(dá)基因篩選結(jié)果顯示,遮陰條件下睡蓮葉片生長素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中的AUXI/IAX、SAUR、IAA基因,光合作用途徑中的psbR、LHCB4、LHCB1基因,代謝途徑中的CHS、4CL等基因,細(xì)胞壁發(fā)育中的CFPT、TUBA、CESA等基因以及光受體的基因如HY5、RFWD2、COP1等都存在顯著差異表達(dá)。這表明遮陰處理下,睡蓮葉片通過限制細(xì)胞壁生長,影響光吸收能力,調(diào)節(jié)初生以及次生代謝途徑,調(diào)控對生長素的響應(yīng)和光信號傳導(dǎo),以及調(diào)節(jié)相關(guān)基因的表達(dá)來適應(yīng)環(huán)境變化,維持正常生長和生理功能。
關(guān)鍵詞:遮陰;睡蓮‘甘娜’;轉(zhuǎn)錄組;代謝途徑
中圖分類號:S682.32:Q781 文獻(xiàn)標(biāo)識號:A 文章編號:1001-4942(2025)01-0012-10
睡蓮屬于睡蓮科(Nymphaeaceae)睡蓮屬(Nymphaea)多年生水生草本浮葉植物。睡蓮以其花色繁多、姿態(tài)優(yōu)雅、花期長、易栽培、適應(yīng)性強(qiáng)等特點(diǎn)在園林設(shè)計(jì)中備受喜愛,適用于公園及家庭水面裝飾。同時小微型品種也適合家庭盆栽。在家庭種植環(huán)境中,睡蓮的生長常受限于光照不足或光照強(qiáng)度較弱而顯著影響其生長狀況和開花數(shù)量。深入探索睡蓮在弱光環(huán)境下的耐陰性及其生理響應(yīng)機(jī)制,對于推動微小型睡蓮的培育技術(shù)及其在園林水景中的廣泛應(yīng)用,具有重要實(shí)踐意義。
遮陰可以改變植物的生長環(huán)境,影響植物的光合作用、養(yǎng)分的吸收和再分配等多種生理過程,以及葉片中光合產(chǎn)物的積累。植物光合作用對光強(qiáng)很敏感,光強(qiáng)過低時植物凈光合速率下降、碳水化合物合成減少,碳平衡遭到破壞。孫智超等研究表明,在弱光環(huán)境下,葉片的捕光效能顯著降低,進(jìn)一步導(dǎo)致基質(zhì)和基粒類囊體結(jié)構(gòu)的解體,相關(guān)酶活性受到抑制,光系統(tǒng)受到損傷,從而降低了植物的碳同化能力。
植物在進(jìn)化過程中,為了適應(yīng)不同光照條件,逐漸在體內(nèi)發(fā)展并完善了光受體系統(tǒng)。次生代謝產(chǎn)物是植物長期為了適應(yīng)環(huán)境而生成的,次生代謝受光受體信號調(diào)控。苯丙素是植物常見的一類次生代謝產(chǎn)物,苯丙素類經(jīng)環(huán)化、氧化、還原等反應(yīng)可生成香豆素類等物質(zhì),然后通過聚合可生成木質(zhì)素和木脂素類物質(zhì)。而在黃酮類合成途徑中,苯丙氨酸經(jīng)過一系列酶的作用先生成桂皮酸,再生成香豆酸然后經(jīng)過查爾酮合成酶(CHS)催化生成查爾酮。而查爾酮可轉(zhuǎn)化為其他類黃酮類,包括花青素等。任夢露研究表明,不同種類的光質(zhì)、變化的光照強(qiáng)度以及光周期的信號可以通過誘導(dǎo)或限制與類黃酮合成緊密相關(guān)的基因表達(dá),實(shí)現(xiàn)對花青素苷合成與積累的精細(xì)調(diào)控。這種調(diào)控機(jī)制在植物的光合作用及其代謝過程中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。木質(zhì)素是細(xì)胞壁的重要組成成分之一,而當(dāng)植物處于遮陰條件下時會導(dǎo)致木質(zhì)素合成相關(guān)酶活性下降。
此外,周琳等研究表明,激素作為在植物體內(nèi)的核心信號分子,具有觸發(fā)并調(diào)節(jié)多種基因轉(zhuǎn)錄路徑的功能。在光信號改變的情況下,植物內(nèi)源激素的含量也會發(fā)生不同的變化,對植物的生長發(fā)育起重要的調(diào)控作用。韓霜等研究表明,在面臨遮陰脅迫時,植物體會通過增加生長素的含量來觸發(fā)庇陰反應(yīng),以適應(yīng)環(huán)境壓力。然而,當(dāng)遮陰程度過度時,植物體內(nèi)的生長素水平會受到抑制,可能對植物生長和發(fā)育產(chǎn)生不利影響。
本試驗(yàn)旨在通過對睡蓮‘甘娜’實(shí)施遮陰處理,對比遮陰處理與自然光照條件下其葉片形態(tài)與功能方面的差異,并借助轉(zhuǎn)錄組分析手段,深入闡釋遮陰對睡蓮的影響及其內(nèi)在機(jī)制,為睡蓮的庭院栽培提供理論依據(jù)。
1材料與方法
1.1試驗(yàn)設(shè)計(jì)
試驗(yàn)于2023年6月20日-9月1日在信陽農(nóng)林學(xué)院園藝學(xué)院的實(shí)習(xí)基地馨園內(nèi)進(jìn)行。睡蓮品種為‘甘娜’。以盆栽方式將睡蓮置于大缸中,缸的規(guī)格為50 cmX 50 cm,確保為睡蓮提供適宜的生長環(huán)境和穩(wěn)定的生長空間。試驗(yàn)分兩組,對照組采取自然光照,試驗(yàn)組對睡蓮進(jìn)行遮陰處理,遮光度設(shè)置為60%。試驗(yàn)期間定期觀察遮陰處理下睡蓮葉片的變化,當(dāng)與對照組出現(xiàn)顯著差異時采集兩組中同一時期的成熟葉片,每組3個重復(fù),對照組樣本標(biāo)記為X-1、X-2和X-3,遮陰組樣本標(biāo)記為Y-1、Y-2和Y-3。
1.2轉(zhuǎn)錄組測序
將處理好的樣品進(jìn)行干冰保存,送至上海元莘生物醫(yī)藥科技有限公司進(jìn)行睡蓮RNA的提取和轉(zhuǎn)錄組測序分析。使用標(biāo)準(zhǔn)的提取程序提取RNA,對樣品進(jìn)行嚴(yán)格的質(zhì)量控制,檢測其完整性、濃度和純度,以保證文庫質(zhì)量,確定測序的結(jié)果無誤。
1.3數(shù)據(jù)處理與分析
通過GO、COG、KEGG等數(shù)據(jù)庫對測序數(shù)據(jù)進(jìn)行差異顯著性分析及功能富集分析,利用TBtool軟件繪制基因表達(dá)熱圖。
2結(jié)果與分析
2.1轉(zhuǎn)錄組測序分析
如表1所示,經(jīng)過嚴(yán)格的RNA質(zhì)量評估,原始序列Q30堿基百分比在93%以上,GC含量在47%以上,所有樣本的總RNA質(zhì)量均符合后續(xù)建庫與分析的標(biāo)準(zhǔn)(表1)。