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基于廣泛靶向代謝組的桃果實(shí)衰老軟化過程差異代謝物篩選與鑒定

2024-04-30 14:22郭紹雷許建蘭張斌斌張妤艷沈志軍馬瑞娟俞明亮
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2024年6期

郭紹雷 許建蘭 張斌斌 張妤艷 沈志軍 馬瑞娟 俞明亮

摘要:篩選與鑒定參與調(diào)控桃果實(shí)采后貯藏過程衰老軟化相關(guān)代謝物質(zhì),以深入了解桃果實(shí)采后衰老軟化相關(guān)生理生化機(jī)制。常溫貯藏條件下,萘乙酸處理可加速霞暉8號七成熟桃果實(shí)衰老軟化,采用超高液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù),檢測桃果實(shí)貯藏0、3、6 d代謝物質(zhì)的變化,選取差異倍數(shù)值(≥2或≤0.5),采用正交偏最小二乘判別分析模型所獲得的變量重要性投影值(≥1)的代謝物為差異代謝物。結(jié)果表明,在霞暉8號桃果實(shí)5組樣品中共檢測到816種代謝物,可被分為11類,其中檢測到酚酸類物質(zhì)160種,占比最高。通過比較在各分組中代謝物定量信息的差異倍數(shù)變化前10的代謝物,結(jié)合KEGG信號通路的差異代謝物聚類分析,篩選并鑒定到可能參與桃果實(shí)軟化的各種代謝物29種,其中脂質(zhì)與酚酸類物質(zhì)鑒定到最多,各有7種。

關(guān)鍵詞:桃果實(shí);衰老軟化;代謝組;差異代謝物

中圖分類號:S662.101? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

文章編號:1002-1302(2024)06-0198-08

收稿日期:2023-10-23

基金項目:現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(編號:CARS-30);江蘇省種業(yè)振興“揭榜掛帥”項目(編號:JBGS[2021]082)。

作者簡介:郭紹雷(1988—),男,山東郯城人,博士,助理研究員,主要從事桃種質(zhì)資源與新品種選育工作。E-mail:guoshaolei0305@126.com。

通信作者:俞明亮,博士,研究員,主要從事桃種質(zhì)資源與新品種選育工作。E-mail:mly@jaas.ac.cn。

桃[(Prunus persica L.) Batsch]原產(chǎn)于中國,在世界多地廣泛栽種,依據(jù)聯(lián)合國糧食及農(nóng)業(yè)組織統(tǒng)計(https://www.fao.org/faostat/zh/#data/QCL),2021年我國桃栽培面積和產(chǎn)量占全球比重超過50%,均位列世界第一。然而,桃是典型的呼吸躍變型水果。常溫下,成熟桃果實(shí)軟化迅速,不方便采運(yùn),貨架期較短,果實(shí)易損耗[1],造成重大經(jīng)濟(jì)損失,是制約我國桃產(chǎn)業(yè)進(jìn)一步發(fā)展的因素之一。桃果實(shí)衰老軟化相關(guān)機(jī)理的探究,將為桃果實(shí)采后保鮮技術(shù)的進(jìn)步及耐貯新品種的選育提供理論依據(jù)。

乙烯的生物合成和信號轉(zhuǎn)導(dǎo),以及下游的細(xì)胞壁降解,是存在于果實(shí)衰老軟化中的復(fù)雜生理生化過程[2-4]。研究表明,乙烯可通過調(diào)控木葡聚糖內(nèi)糖基轉(zhuǎn)移酶/水解酶、β-半乳糖苷酶、果膠甲酯酶以及多聚半乳糖醛酸酶等細(xì)胞壁降解相關(guān)酶活性,參與調(diào)控果實(shí)衰老軟化[5-7]。還有研究表明,包括MADS-box、NAC、ERF等在內(nèi)的轉(zhuǎn)錄因子,可通過調(diào)控乙烯生物合成或信號轉(zhuǎn)導(dǎo),影響果實(shí)衰老軟化進(jìn)程[8-9]。在桃果實(shí)中,多聚半乳糖醛酸酶是決定果實(shí)衰老軟化進(jìn)程的主要因素之一,通過外源乙烯處理桃果實(shí),使多個多聚半乳糖醛酸酶家族基因成員的表達(dá)量,伴隨果實(shí)衰老軟化而顯著升高[10]。乙烯響應(yīng)因子PpeERF2可與PpePG1啟動子結(jié)合,負(fù)調(diào)控PpePG1的表達(dá),進(jìn)而影響桃果實(shí)成熟軟化[11]。β-半乳糖苷酶與果實(shí)衰老軟化密切相關(guān)[12],桃β-半乳糖苷酶基因家族成員中PpBGAL2和PpBGAL16在不同肉質(zhì)桃常溫貯藏過程中差異表達(dá)[13],且PpBGAL16可能受乙烯誘導(dǎo)參與桃果實(shí)衰老軟化[14]。Gu等的研究表明,桃PpHB.G7轉(zhuǎn)錄因子可調(diào)控PpACS1和PpACO1編碼酶ACS與ACO活性,影響乙烯生物合成,對桃果實(shí)的成熟軟化起作用[15]。生長素與乙烯相互作用調(diào)控果實(shí)衰老軟化成為當(dāng)前研究的熱點(diǎn)。噴施萘乙酸(1-naphthaleneacetic acid,簡稱NAA)可使硬質(zhì)桃迅速變軟,并提高乙烯生物合成中ACS1、ACS7與ACO3等基因的轉(zhuǎn)錄水平,增加乙烯釋放量[16]。最近的研究表明,桃生長素響應(yīng)因子PpIAA1可調(diào)控PpACS1的表達(dá),影響乙烯釋放量,而乙烯響應(yīng)因子PpERF4還可通過與PpACO1和PpIAA1啟動子結(jié)合,影響乙烯合成[17]。桃生長素響應(yīng)因子PpARF6可結(jié)合PpACS1和PpACO1的啟動子,激活其轉(zhuǎn)錄,促進(jìn)乙烯的生物合成。蛋白水平上,PpARF6抑制PpEBF1/PpEBF2和PpEIL2/PpEIL3之間的相互作用,增強(qiáng)PpEIL2/PpEIL3蛋白穩(wěn)定性,對PpACS1和PpACO1的轉(zhuǎn)錄激活作用增強(qiáng),進(jìn)一步促進(jìn)乙烯合成[18]。桃果實(shí)衰老軟化機(jī)制受多種因子調(diào)控,是一個復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。目前,相關(guān)生理生化機(jī)制的研究大多集中在相關(guān)酶活的變化和關(guān)鍵基因調(diào)控研究。

廣泛靶向代謝組學(xué)通過建庫、檢測、分析等流程,完成對代謝物組分的鑒定和相對含量的分析,具有通量高、覆蓋廣、靈敏度與精度高的特點(diǎn)[19-20]。目前該技術(shù)已廣泛應(yīng)用于桃[21-22]、葡萄[23]、冬棗[24]、茶[25]等園藝作物上。桃果實(shí)常溫貯藏過程代謝組學(xué)的研究還鮮有報道,缺乏相關(guān)系統(tǒng)的研究,相關(guān)代謝機(jī)理仍需探究。本研究選取七成熟桃果實(shí)常溫貯藏6 d,通過NAA處理加快果實(shí)軟化,采用基于液質(zhì)聯(lián)用的廣泛靶向代謝組學(xué)技術(shù),鑒定和比較分析常溫貯藏過程中代謝物組分和相對含量,為桃果實(shí)采后保鮮技術(shù)的發(fā)展及耐貯藏新品種的選育提供理論依據(jù)。

1? 材料與方法

1.1? 試驗材料

本研究以桃品種霞暉8號果實(shí)為試驗材料,霞暉8號桃果實(shí)樣品取自江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院果樹研究所桃試驗園,常規(guī)栽培管理。試驗于2021年進(jìn)行,選取七成熟標(biāo)準(zhǔn)(果實(shí)完成膨大,底色未轉(zhuǎn)變)桃果實(shí)進(jìn)行采收,采收后立即運(yùn)回江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院實(shí)驗室進(jìn)行貯藏試驗。選取大小均一、無病蟲傷害的完好桃果實(shí)用于常溫貯藏試驗。根據(jù)Tatsuki等的方法[26],對桃果實(shí)進(jìn)行NAA噴施處理,NAA噴施濃度為1 mmol/L(含0.01% Tween 20),對照組噴施0.01% Tween 20水溶液,噴施頻次間隔1 d。常溫貯藏試驗,溫度設(shè)為(25±1) ℃,相對濕度為75%~85%,貯藏0、3、6 d各取樣1次,對照組(CK,0、3、6 d),NAA處理組(NT,0、3、6 d),5個桃果實(shí)為1次重復(fù),所有試驗進(jìn)行3次生物學(xué)重復(fù)。桃果實(shí)樣品先去皮,后切成大小均勻塊狀,經(jīng)液氮快速冷凍處理后,置于-80 ℃冰箱。

1.2? 硬度檢測

桃果實(shí)硬度檢測使用TA-XT Plus質(zhì)構(gòu)儀,使用直徑為8 mm的探頭在桃果實(shí)樣品腹縫線兩側(cè)中間部位進(jìn)行檢測,檢測深度是5 mm,速率是 1 mm/s。

1.3? 代謝物提取

桃果實(shí)樣品先通過凍干機(jī)真空冷凍干燥,后將桃果實(shí)樣品磨成粉末。稱量0.100 g桃果實(shí)粉末,置于1.2 mL含70%甲醇的提取液中進(jìn)行溶解。對提取液進(jìn)行渦旋處理6次,頻次按照每30 min渦旋 0.5 min 進(jìn)行。渦旋處理后的提取液放于4 ℃冰箱過夜。離心后,吸取上清液,吸取的上清液使用0.22 μm微孔膜過濾,用于檢測。

1.4? 色譜質(zhì)譜方法

使用超高效液相色譜和串聯(lián)質(zhì)譜(色譜儀,SHIMADZU Nexera X2;串聯(lián)質(zhì)譜,Applied Biosystems 4500 QTRAP)進(jìn)行數(shù)據(jù)采集。超高液相色譜使用的色譜柱為安捷倫SB-C18,色譜柱的參數(shù)(1.8 μm,2.1 mm,100 mm)。其他液相色譜采集條件:分為A和B兩相,使用超純水(加入0.1%的甲酸)作為A相,使用乙腈(加入0.1%的甲酸)作為B相。洗脫梯度設(shè)置:開始后,B相占比5%,然后設(shè)置B相于 9 min 內(nèi)占比勻速增至95%,保持1 min,設(shè)置B相11.10 min內(nèi)占比減少至5%,并維持至14 min。液相色譜采集條件中,進(jìn)樣量4 μL,流速保持在 0.35 mL/min,柱溫保持在40 ℃。主要的質(zhì)譜條件:使用AB4500 Q TRAP UPLC/MS/MS質(zhì)譜系統(tǒng),配置電噴霧離子源。設(shè)定電壓5 500 V(正離子模式)/-4 500 V(負(fù)離子模式),源溫度設(shè)定為 550 ℃,簾氣參數(shù)設(shè)定為0.172 4 MPa,碰撞誘導(dǎo)電離參數(shù)條件設(shè)定為高。

1.5? 代謝物定性定量分析

代謝物定性分析,以MWDB(Metware database)為數(shù)據(jù)庫,數(shù)據(jù)分析前需刪除包括含NH+4、Na+、K+,與其他碎片離子在內(nèi)的各種重復(fù)信號,以及產(chǎn)生的同位素信號。然后依據(jù)獲得的二級譜信息,完成物質(zhì)的定性解析。通過三重四級桿質(zhì)譜儀中的多反應(yīng)監(jiān)測模式,進(jìn)行代謝物定量:目標(biāo)物質(zhì)的前體離子(母離子)最初利用四級桿獲得篩查,后使其經(jīng)碰撞室誘導(dǎo)電離后形成碎片離子,然后,利用三重四級桿繼續(xù)篩查,獲取1個特征碎片離子。數(shù)據(jù)分析,首先獲取桃樣品檢測到的物質(zhì)質(zhì)譜峰,后對其峰面積進(jìn)行積分。針對試驗中不同桃果實(shí)樣品中的同一個代謝物的質(zhì)譜出峰,進(jìn)行積分校正[27]

1.6? 數(shù)據(jù)處理與分析

確定差異代謝物的標(biāo)準(zhǔn):代謝物的差異倍數(shù)值(Fold change,F(xiàn)C)≥2或≤0.5,采用正交偏最小二乘判別分析模型所獲得的變量重要性投影值(variable importance in projection,簡稱VIP)≥1[28]。使用KEGG數(shù)據(jù)庫注釋和顯示差異代謝物[29]

2? 結(jié)果與分析

2.1? 桃果實(shí)常溫貯藏過程中硬度變化

霞暉8號七成熟桃果實(shí)隨常溫貯藏過程延長,對照組與NAA處理組硬度均下降。NAA處理后使霞暉8號七成熟果實(shí)硬度迅速下降,下降速度快于對照組(圖1)。

2.2? 桃果實(shí)常溫貯藏過程中代謝物種類鑒定

將七成熟桃果實(shí)噴施NAA常溫貯藏0、3、6 d,對照分別命名CK 0 d、CK 3 d、CK 6 d,處理組命名為NT 3 d、NT 6 d。經(jīng)與數(shù)據(jù)庫比對分析發(fā)現(xiàn),在霞暉8號桃果實(shí)5組樣品中共檢測到816種代謝物,可被分為11類(表1)。其中檢測到酚酸類物質(zhì)160種,占比最高。脂質(zhì)、黃酮類、氨基酸及其衍生物、有機(jī)酸占比較高。

2.3? 桃果實(shí)常溫貯藏過程各分組相對含量變化趨勢

為研究桃果實(shí)差異代謝物不同分組中的相對含量變化趨勢,將分組比較中的差異代謝物的相對含量進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化,隨后進(jìn)行K均值聚類分析。如圖2所示,桃果實(shí)常溫貯藏過程中的代謝物相對含量變化趨勢共分為7組。第3組代謝物相對含量變化趨勢包含的差異代謝物有64種,該組中差異代謝物在對照組與處理組中均有上升趨勢,第5組中差異代謝物相對含量變化在對照組與處理組中均有下降趨勢,包含的差異代謝物有44種。各組所含代謝物數(shù)量有異同,其中第6組所含的差異代謝物也有64種,與第3組相同,第4組所含差異代謝物最少,只有8種。

2.4? 桃果實(shí)常溫貯藏過程中差異代謝物鑒定

比較在各分組中代謝物定量信息的差異倍數(shù)變化,鑒定對照組中的CK 0 d vs. CK 3 d、CK 3 d vs. CK 6 d,處理組中的CK 0 d vs. NT 3 d、NT 3 d vs. NT 6 d的差異代謝物,對上調(diào)前10位差異代謝物和下調(diào)前10位差異代謝物進(jìn)行分析。由圖3可見,在對照組2分組CK 0 d vs. CK 3 d與CK 3 d vs. CK 6 d上調(diào)前10位差異代謝物中共鑒定到19種代謝物,其中溶血磷脂酰膽堿18∶4在對照組2分組中均是上調(diào)前10位差異代謝物。對照組2分組中下調(diào)前10位差異代謝物中共鑒定到18種,其中松柏醇、1-甲基腺嘌呤在CK 0 d vs. CK 3 d與CK 3 d vs. CK 6 d 2分組中均是下調(diào)前10位差異

代謝物。處理組2分組中共鑒定到上調(diào)代謝物20種,2分組中上調(diào)前10位的差異代謝物均不相同。處理組2分組中下調(diào)前10位差異代謝物中共鑒定到18種,其中松柏醇、溶血磷脂酰膽堿16∶1(2n異構(gòu))在處理組CK 0 d vs. NT 3 d與NT 3 d vs. NT 6 d 中均是下調(diào)前10位的差異代謝物。

對照組2分組鑒定到的19種與處理組2分組鑒定到的20種上調(diào)前10位差異代謝物取交集,共鑒定到10種代謝物:香蘭素乙酸酯、溶血磷脂酰膽堿16∶2(2n異構(gòu))、溶血磷脂酰膽堿16∶2、溶血磷脂酰膽堿18∶4、水飛薊素、溶血磷脂酰膽堿19∶1、4-乙基苯甲醛、7-羥基-4-甲基-8-硝基香豆素、10-羥基癸酸、5-甲氧基水楊酸。對照組2分組(18種)與處理組2分組(18種)下調(diào)前10位差異代謝物取交集,共鑒定到7種代謝物:松柏醇、溶血磷脂酰膽堿16∶1(2n異構(gòu))、溶血磷脂酰膽堿 18∶1 (2n異構(gòu))、2-羥基肉桂酸、丁香酸、L-甲硫氨酸、1-甲基腺嘌呤。鑒定到的代謝物信息見表2。

2.5? KEGG信號通路的差異代謝物聚類熱圖分析

KEGG信號通路的差異代謝物聚類分析是根據(jù)差異代謝物的KEGG注釋信息,選擇至少含有5個差異代謝物的KEGG代謝通路,對所選的KEGG代謝通路中的差異代謝物的相對含量進(jìn)行聚類分析,挖掘重要代謝通路中的代謝物在不同分組中的特性。由KEGG信號通路的差異代謝物聚類分析(圖4),發(fā)現(xiàn)在對照組2分組CK 0 d vs. CK 3 d與CK 3 d vs. CK 6 d中共有上調(diào)代謝物7種,其中吲哚-3-乙酸同時在對照組2分組中上調(diào)。在對照組2分組中下調(diào)的代謝物共鑒定到9種,其中松柏醇在CK 0 d vs. CK 3 d與CK 3 d vs. CK 6 d中均為下調(diào)。在處理組2分組中CK 0 d vs. NT 3 d與NT 3 d vs. NT 6 d的KEGG信號通路的差異代謝物聚類分析中上調(diào)代謝物共鑒定到22種,其中迷迭香酸、腺苷在處理組2個分組中均有上調(diào)趨勢。處理組2分組中下調(diào)代謝物共鑒定到21種,其中松柏醇、2-羥基肉桂酸在處理組2分組CK 0 d vs. NT 3 d與NT 3 d vs. NT 6 d中均下調(diào)。

對照組2分組中的7種與處理組2分組中的22種有上調(diào)趨勢代謝物取交集,共鑒定到5種代謝物:脫落酸、對香豆醇、迷迭香酸、腺苷-5′-單磷酸、尿嘧啶核苷。對照組2分組(9種)與處理組2分組(21種)有下調(diào)趨勢代謝物取交集,共鑒定到8種代

謝物:腐胺、松柏醇、磷酸烯醇式丙酮酸、黃苷、2-羥基肉桂酸、阿魏酸、L-甲硫氨酸、2-(甲酰氨基)苯甲酸。在KEGG信號通路的差異代謝物聚類分析中篩選得到的代謝物信息見表2。

本研究通過代謝物定量信息的差異倍數(shù)變化和KEGG信號通路的差異代謝物聚類分析共鑒定到可能參與桃果實(shí)軟化的各種代謝物29種,其中脂質(zhì)類和酚酸類各有7種,核苷酸及其衍生物有5種,有機(jī)酸類3種,生物堿2種,黃酮、木脂素和香豆素、氨基酸及其衍生物各1種,其他類2種(表2)。

3? 討論與結(jié)論

桃是世界上栽培最為廣泛的落葉果樹之一,我國桃產(chǎn)業(yè)在世界占有重要地位,近年來在栽培面積和產(chǎn)量上一直占比超過全球50%。然而,桃作為典型的呼吸躍變型水果,成熟后極易軟化,貨架期較短,運(yùn)輸成本較高,損耗高[1],給種植者和銷售者帶來較大的經(jīng)濟(jì)損失。桃果實(shí)衰老軟化的調(diào)控仍是桃產(chǎn)業(yè)發(fā)展需要應(yīng)對的問題,與種植者、生產(chǎn)者營收與產(chǎn)業(yè)發(fā)展都息息相關(guān)。開展桃果實(shí)衰老軟化相關(guān)理論的研究能為降低桃果實(shí)采后損耗提供理論基礎(chǔ),對桃產(chǎn)業(yè)的持續(xù)健康發(fā)展有重要意義。

在所有的脂質(zhì)中,磷脂的種類豐富,也是構(gòu)成細(xì)胞膜最主要的脂類物質(zhì)。本研究7種脂質(zhì)相對含量的變化,可能與桃果實(shí)衰老軟化過程中細(xì)胞膜的分解有關(guān)。酚酸類物質(zhì)是主要的多酚類物質(zhì)之一。植物中的酚類物質(zhì)被認(rèn)為是重要的次生代謝物質(zhì)之一。研究發(fā)現(xiàn),酚類物質(zhì)在植物抗病蟲害、抗逆等多方面發(fā)揮作用[30],同時在果實(shí)中也具有重要的抗氧化能力[31-32]。本研究篩選鑒定的7種酚酸類代謝物種,迷迭香酸隨著桃果實(shí)貯藏軟化過程有上調(diào)趨勢,多數(shù)酚酸類物質(zhì)[松柏醇、2-羥基肉桂酸、丁香酸、阿魏酸、2-(甲酰氨基)苯甲酸]在桃果實(shí)貯藏軟化過程中有下調(diào)趨勢,對香豆醇則無明顯規(guī)律。朱辰暉等的研究表明,酚酸類物質(zhì)能激活桃果實(shí)中多種抗氧化酶,能增強(qiáng)桃果實(shí)的抗氧化能力;使用對羥基肉桂酸,桃果實(shí)多酚對DPPH·和羥自由基清除能力得到加強(qiáng),桃果實(shí)的成熟衰老得到延緩[33]。阿魏酸在柑橘抗氧化活性中被鑒定為主要作用物質(zhì)之一[34]。因而這些酚酸類物質(zhì)含量可能隨著桃果實(shí)衰老軟化進(jìn)程逐漸減少,抗氧化活性減弱。吲哚-3-乙酸是常見的生長素類物質(zhì),在植物體內(nèi)發(fā)揮著重要作用。Tatsuki等研究發(fā)現(xiàn),硬質(zhì)桃在成熟后幾乎不釋放乙烯,且吲哚-3-乙酸含量極低,而普通桃有大量乙烯釋放,吲哚-3-乙酸含量較高,表明乙烯的生物合成可能需要生長素介導(dǎo)[26]。硬質(zhì)桃中PpACS1的表達(dá)量和乙烯釋放量同時受NAA誘導(dǎo)增加,暗示吲哚-3-乙酸可介導(dǎo)乙烯合成[35]。腐胺是植物體內(nèi)多胺的主要種類之一。研究表明,外源多胺處理可下調(diào)桃果實(shí)乙烯合成相關(guān)基因表達(dá),上調(diào)多胺合成相關(guān)基因的表達(dá),促進(jìn)果實(shí)多胺合成并降低乙烯釋放量和呼吸速率,延緩桃果實(shí)成熟衰老[36]。張海燕等使用外源腐胺處理油桃,促使油桃超氧化物歧化酶、過氧化氫酶、過氧化物酶的活性提高,同時乙烯釋放量和呼吸釋放速率下降,果實(shí)硬度下降延緩[37]。說明生物堿類物質(zhì)吲哚-3-乙酸與腐胺在桃果實(shí)衰老軟化過程中起到重要調(diào)控作用。研究表明,桃果實(shí)成熟過程中,內(nèi)源脫落酸的積累構(gòu)成了果實(shí)成熟的啟動信號,而脫落酸高峰的出現(xiàn)啟動了果實(shí)的后熟衰老進(jìn)程[38],本研究中脫落酸的相對含量變化趨勢符合上述結(jié)果。有研究表明,在桃果實(shí)成熟軟化過程中脫落酸可能也受到乙烯的調(diào)控,如乙烯可通過PpERF3調(diào)節(jié)脫落酸生物合成基因PpNCED2/3的表達(dá)從而促進(jìn)其生物合成[39]。其他代謝物質(zhì)在桃果實(shí)衰老軟化進(jìn)程中如何發(fā)揮作用還需要更深入的研究。本研究使用廣泛靶向代謝組學(xué)方法分析鑒定了29種代謝物質(zhì),可能參與桃果實(shí)軟化的進(jìn)程,將為桃果實(shí)衰老軟化過程中的代謝物質(zhì)研究提供參考。

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