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ATP1B3 在神經(jīng)膠質(zhì)瘤中表達(dá)及其對(duì)細(xì)胞增殖和遷移的影響

2024-04-10 00:16:58嚴(yán)其康扈清云王彩霞朱金玲
關(guān)鍵詞:膠質(zhì)瘤基因蛋白

嚴(yán)其康,扈清云,孫 權(quán),王彩霞,朱金玲

(1.佳木斯大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,黑龍江 佳木斯 154007;2.佳木斯大學(xué)第一附屬醫(yī)院, 黑龍江 佳木斯 154007)

神經(jīng)膠質(zhì)瘤是起源于神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞的中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤,是顱內(nèi)腫瘤中最常見(jiàn)和最致命的類(lèi)型,生長(zhǎng)迅速,具有極強(qiáng)的侵襲性,病人預(yù)后差。神經(jīng)膠質(zhì)瘤的基礎(chǔ)研究和對(duì)其治療手段的探索一直是國(guó)內(nèi)外學(xué)者研究的熱點(diǎn)和難點(diǎn)問(wèn)題。Na/K-ATP酶 由 催 化 亞 基α(100~112 kDa),調(diào) 節(jié)β(45~55 kDa)亞基和γ(FXYD2)(6.5~10 kDa)亞基組成[1]。已經(jīng)鑒定出β 亞基的3 種不同的同種型:β1(ATP1B1基因),β2(ATP1B2基因)和β3(ATP1B3基因)[2]。3 種β 亞基在細(xì)胞中的分布具有組織特異性。已有文獻(xiàn)說(shuō)明,Na/K-ATP 酶β 亞基參與調(diào)節(jié)細(xì)胞粘附功能,特別是在癌癥進(jìn)展期間[3-6]。實(shí)驗(yàn)室前期發(fā)現(xiàn)CASPR1-ATP1B3 蛋白相互作用影響腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞Na/K-ATP 酶的質(zhì)膜定位,但在膠質(zhì)瘤細(xì)胞中研究極少[7]。 并且有研究表明,ATP1B3基因在胃癌、肝癌中存在高表達(dá),影響其發(fā)生發(fā)展,而在膠質(zhì)瘤中未見(jiàn)研究,因此本研究選Na/K-ATP 酶的核心蛋白ATP1B3 作為靶分子研究其在不同組織級(jí)別的膠質(zhì)瘤細(xì)胞中的表達(dá)水平,探討ATP1B3基因表達(dá)對(duì)膠質(zhì)瘤患者總體生存率的影響及對(duì)膠質(zhì)瘤細(xì)胞的增殖、遷移的影響。為尋找神經(jīng)腫瘤細(xì)胞標(biāo)志物和治療的分子靶點(diǎn)提供試驗(yàn)和理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 試劑及材料來(lái)源

人膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(U87MG)及MEM 培養(yǎng)基購(gòu)自上海酶研生物科技有限公司,胎牛血清購(gòu)自美國(guó)Gibco 公司,胰蛋白酶、青-鏈霉素溶液、辣根過(guò)氧化物酶標(biāo)記山羊抗小鼠IgG(H+L)、逆轉(zhuǎn)錄試劑盒、DAB 顯色液均購(gòu)自上海碧云天生物技術(shù)有限公司,熒光定量PCR 試劑盒購(gòu)自中國(guó)Takara 公司,單克隆ATP1B3 抗體(67554-1-lg)及GAPDH 抗體(60004-1-lg)購(gòu)自中國(guó)proteintech 公司,干擾RNA 購(gòu)自中國(guó)吉瑪基因公司。2 級(jí)、3 級(jí)、4 級(jí)膠質(zhì)瘤組織切片來(lái)自于佳木斯大學(xué)第一附屬醫(yī)院。1 級(jí)通常為低級(jí)-例如毛細(xì)胞星形細(xì)胞瘤;2 級(jí)為低度惡性腫瘤,如星形膠質(zhì)瘤或少突膠質(zhì)細(xì)胞瘤浸潤(rùn);3 級(jí)包括間變性星形細(xì)胞瘤,間變性室管膜瘤,間變性少突膠質(zhì)細(xì)胞瘤和間變性少星形膠質(zhì)瘤;4 級(jí)通常為膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(Glioblastoma multiforme,GBM) 具有內(nèi)皮細(xì)胞增殖或腫瘤壞死。

1.2 方法

1.2.1 在線數(shù)據(jù)庫(kù)分析ATP1B3在膠質(zhì)瘤中的表達(dá),及其與患者生存預(yù)后的關(guān)系 下載TCGA(https://portal.gdc.cancer.gov)數(shù)據(jù)庫(kù)中膠質(zhì)瘤患者的轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)數(shù)據(jù)集、臨床數(shù)據(jù)集并進(jìn)行整理。然后使用CGGA(http://www.cgga.org.cn/)數(shù)據(jù)庫(kù)在線分析ATP1B3在不同級(jí)別膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá),進(jìn)入官網(wǎng),首頁(yè)選擇“Analyze”;點(diǎn)擊mRNA data;在 Distribution 處“gene”框 輸 入“ATP1B3”;點(diǎn)擊submit。對(duì)TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)下載的數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,通過(guò)ATP1B3表達(dá)水平中位值將膠質(zhì)瘤患者分為兩組,分別為高表達(dá)ATP1B3組和低表達(dá)ATP1B3組。采用R 包"survival" "survminer"分析ATP1B3基因表達(dá)水平與膠質(zhì)瘤患者生存率的關(guān)系,包括患者總生存期(overall Survival, OS),無(wú)進(jìn)展生存期(progression-free survival, PFS), ROC(receiver operating characteristic curve, ROC)生存分析。比較分析ATP1B3表達(dá)水平與癌癥患者臨床特征的相關(guān)性,包括分級(jí)、年齡和性別等。

1.2.2 免疫組化染色驗(yàn)證ATP1B3在膠質(zhì)瘤組織切片中的表達(dá) 對(duì)2 級(jí)、3 級(jí)、4 級(jí)膠質(zhì)瘤組織進(jìn)行IHC 染色。常規(guī)石蠟切片后60 ℃烤片15 min,進(jìn)行二甲苯脫蠟與梯度酒精脫水,PBS 緩沖液沖洗,pH值8.0~8.5 的EDTA 抗原修復(fù)液100 ℃抗原修復(fù),PBS 緩沖液沖洗,37 ℃過(guò)氧化氫甲醇消化內(nèi)源性過(guò)氧化物酶10 min,PBS 緩沖液沖洗,加入5%BSA 封閉液封閉。滴加ATP1B3 抗體(1∶300)4 ℃冰箱內(nèi)孵育過(guò)夜,PBS 緩沖液沖洗,羊抗鼠IgG 聚合物滴定及DAB 顯色,蘇木素染液襯染,梯度酒精脫水、二甲苯透明、中性樹(shù)膠封片后在顯微鏡下觀察。

1.2.3 體外細(xì)胞培養(yǎng) 將在MEM 完全培養(yǎng)基(10%胎牛血清和1%雙抗)中的U87MG 細(xì)胞,放入6 孔板中培養(yǎng),6 孔板置于5%CO2的恒溫37 ℃的培養(yǎng)箱中培養(yǎng)細(xì)胞。

1.2.4 細(xì)胞轉(zhuǎn)染 干擾RNA 序列由吉瑪基因公司設(shè)計(jì),ATP1B3-Homo-336 序列為,S: CAUUCACGAUGUGGGUUAUTT AS: AUAACCCACAUCGUGAAUGTT;ATP1B3-Homo-530 序列為S:GAAGAACAGAAGAACCUCATT AS:UGAGGUUCUUCUGUUCUUCTT ;ATP1B3- Homo -976 序 列 為 S:GGGACGAGUUAUGUUCAAA TT AS:UUUGAACAUAACUCGUCCCTT;陰性對(duì) 照siRNA 序 列 為S:UUCUCCGAACGUGUCACGUTT AS:ACGUGACACGUUCGGAGAATT;將培養(yǎng)細(xì)胞分為5 組,即空白對(duì)照組、陰性對(duì)照組(SI-NC)、si-ATP1B3-336 組、si-ATP1B3-530組、si-ATP1B3-976 組,當(dāng)6 孔板中細(xì)胞密度達(dá)到30%~50%時(shí),配制轉(zhuǎn)染體系,加入125 μL OPTIMEM、100pmol si-RNA(陰性對(duì)照組加入陰性對(duì)照siRNA、si-ATP1B3-336 組 加 入ATP1B3-Homo-336、si-ATP1B3-530 組加入ATP1B3-Homo-530、si-ATP1B3-976 組加入ATP1B3-Homo-976)、4 μL Lipo-8000,混勻,室溫下靜置20 min?;旌虾蟮捏w系以點(diǎn)滴的方式將轉(zhuǎn)染復(fù)合物加入含有U87MG 細(xì)胞的6 孔板中,輕輕搖勻后放入細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h后以備用于RT-PCR 檢測(cè),轉(zhuǎn)染細(xì)胞培養(yǎng)48 h 后以備Western blot 檢測(cè)。篩選敲減效率高的siRNA 以被后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

1.2.5 熒光定量PCR 檢測(cè)轉(zhuǎn)染后細(xì)胞ATP1B3基因的mRNA 表達(dá)水平 用RNA 抽提試劑盒提取轉(zhuǎn)染后U87MG細(xì)胞中總mRNA,分光光度計(jì)測(cè)定RNA的濃度和純度,反轉(zhuǎn)錄為cDNA,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR 試 劑 盒 進(jìn) 行RT-PCR 擴(kuò) 增,ATP1B3-S:ACGATGTGGGTTATGCTTCAGACTC;ATP1B3-AS:CCTGCATACGAAGTTGGATCAGACC;內(nèi)參GAPDH 序列為S:UGACCUCAACUACAUGGUUTT;AS:AACCAUGUAGUUGAGGUCATT。7300 檢測(cè)結(jié)果,采用2-ΔΔCt法計(jì)算各組細(xì)胞ATP1B3基因mRNA 的相對(duì)表達(dá)量(內(nèi)參為GAPDH)。

1.2.6 Western blotting 檢測(cè)轉(zhuǎn)染后ATP1B3 蛋白及相關(guān)通路蛋白MTOR、P-MTOR 表達(dá)量 收集轉(zhuǎn)染后U87MG 細(xì)胞,蛋白裂解液提取總蛋白,通過(guò)BCA 法測(cè)定提取蛋白質(zhì)的濃度。取50 μg 蛋白進(jìn)行SDS-PAGE(12%)電泳分離,濕轉(zhuǎn)法將蛋白轉(zhuǎn)移到PVDF 膜上,5%脫脂牛奶37 ℃封閉1 h,將膜置于相應(yīng)的ATP1B3鼠單克隆抗體(1∶1 500)、GAPDH 鼠 單 克 隆 抗 體(1∶10 000)中4 ℃過(guò) 夜,MTOR、P-MTOR(1∶1 500),TBS-T 洗去未結(jié)合的一抗,洗滌3 次,每次10 min。再用辣根過(guò)氧化物酶標(biāo)記的山羊抗小鼠IgG 37 ℃孵育1 h。TBS-T洗去未結(jié)合的二抗,洗滌3 次,每次10 min。利用全自動(dòng)化學(xué)發(fā)光/熒光圖像分析系統(tǒng)觀察結(jié)果,ImageJ 進(jìn)行分析。

1.2.7 CCK-8 法檢測(cè)細(xì)胞增殖 收集對(duì)照組及si-ATP1B3-336 組細(xì)胞接種于96 孔板(3×103個(gè)/孔),每組5 個(gè)復(fù)孔,每孔加入10 μL CCK-8 溶液(按試劑說(shuō)明書(shū)操作),于培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)1 h,使用酶標(biāo)儀檢測(cè)450 nm 波長(zhǎng)處的光密度值(OD 值)。在0、24、48 和72 h 連續(xù)記錄各個(gè)孔的數(shù)值。細(xì)胞增殖越多越快,則顏色越深,OD 值越大。

1.2.8 Transwell 檢測(cè)細(xì)胞遷移能力 收集對(duì)照組、si-ATP1B3-336 組細(xì)胞加入0.25%胰蛋白酶消化,加入不含血清的MEM 培養(yǎng)液制備單細(xì)胞懸液(5×104個(gè)/mL),取200 μL 細(xì)胞懸液接種于transwell 上室,下室加入600 μL 含有10%胎牛血清的培養(yǎng)液,將小室放入培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)24 h 后,4%多聚甲醛固定20 min,0.1%結(jié)晶紫染液染色10 min,倒置顯微鏡下觀察記錄細(xì)胞遷移結(jié)果。

1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)下載的數(shù)據(jù)檢驗(yàn)結(jié)果均通過(guò)R4.2.2 程序計(jì)算所得,CGGA 數(shù)據(jù)庫(kù)在線分析結(jié)果有網(wǎng)站內(nèi)部程序自動(dòng)生成。實(shí)驗(yàn)檢測(cè)結(jié)果采用GraphPad Prism9 軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,組間比較采用單因素方差分析,P<0.05 為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 在線數(shù)據(jù)獲取和分析結(jié)果

從TCGA 數(shù)據(jù)中獲得神經(jīng)膠質(zhì)瘤樣本共704個(gè),并對(duì)ATP1B3高、低表達(dá)兩組進(jìn)行獨(dú)立性檢驗(yàn)。CGGA 數(shù)據(jù)庫(kù)分析膠質(zhì)瘤患者癌組織中ATP1B3mRNA 的表達(dá)水平,隨著膠質(zhì)瘤級(jí)別(2,3,4 級(jí))的升高,ATP1B3的表達(dá)水平顯著升高,(P<0.001)(圖1A)。通過(guò)R 軟件進(jìn)行分層分析,結(jié)果顯示:ATP1B3在膠質(zhì)瘤患者中的表達(dá)水平與年齡和病理分級(jí)有關(guān),差異有顯著性(P<0.001)(圖2A、C),ATP1B3表達(dá)水平與性別無(wú)關(guān)(P>0.05)(圖2B)。使用R 語(yǔ)言包計(jì)算ATP1B3表達(dá)水平對(duì)膠質(zhì)瘤患者總體生存率的影響,繪制生存曲線圖,ATP1B3低表達(dá)組生存率明顯高于ATP1B3高表達(dá)組(P<0.001)(圖3)。

圖1 ATP1B3 在不同級(jí)別膠質(zhì)瘤中的表達(dá)Fig 1 ATP1B3 expression in different grades of gliomas

圖2 ATP1B3 表達(dá)水平與臨床特征相關(guān)分析Fig 2 Correlation analysis between ATP1B3 expression level and clinical characteristics

圖3 ATP1B3 表達(dá)水平與患者生存率Fig 3 ATP1B3 expression level and patient survival rate

2.2 免疫組化檢測(cè)ATP1B3 在膠質(zhì)瘤組織切片中的表達(dá)結(jié)果

免疫組化結(jié)果顯示,2、3、4 級(jí)別膠質(zhì)瘤組織切片分別呈現(xiàn)淡黃色、黃褐色、棕色,印證了數(shù)據(jù)庫(kù)分析結(jié)果(圖1B)。染色強(qiáng)度評(píng)分具體為-(無(wú)染色),+(弱染色為淡黃色),++(中等染色為黃褐色),+++(強(qiáng)染色為棕色)。

2.3 SI-ATP1B3-336 干擾效果明顯

敲減ATP1B3基因表達(dá),RT-qPCR 檢測(cè)結(jié)果顯示,相較于對(duì)照組,SI-ATP1B3-336 組mRNA 水平顯著降低(F=17.45,P<0.01)(圖4A),western blot實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)一步證明si-ATP1B3-336 組中ATP1B3的敲減效果(F=30.84,P<0.000 1)(圖4B),因此將該干擾序列用于后續(xù)研究。

圖4 干擾RNA( si-RNA)篩選Fig 4 Interfering RNA (Si-RNA) screening

2.4 敲減ATP1B3 對(duì)膠質(zhì)瘤細(xì)胞增殖、遷移的影響

Transwell 遷移實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,si-ATP1B3-336組遷移細(xì)胞數(shù)明顯減少(t=6.254,P<0.01)細(xì)胞遷移能力減弱(圖5A)。CCK8 實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,si-ATP1B3-336 組細(xì)胞的增殖能力顯著低于對(duì)照組(t=9.812,P<0.001)(圖5B)。

圖5 敲減ATP1B3 后 U87MG 細(xì)胞增殖、遷移能力Fig 5 Proliferation and migration ability of U87MG cells after knockdown of ATP1B3

2.5 敲減ATP1B3 對(duì)MTOR 信號(hào)通路蛋白的影響

與對(duì)照組相比敲減ATP1B3后,P-MTOR 蛋白表達(dá)量顯著下降(t=3.909,P<0.05),P-MTOR/MTOR 比值顯著降低(t=3.132,P<0.05)(圖6),表明ATP1B3可能通過(guò)影響細(xì)胞生長(zhǎng)信號(hào)通路從而影響膠質(zhì)瘤細(xì)胞的增殖和遷移。

圖6 MTOR、P-MTOR 蛋白表達(dá)水平Fig 6 MTOR,P-MTOR protein expression levels

3 討 論

2021 年出版了第五版中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分類(lèi)(WHO-CNS5)。WHO-CNS5 將基因、分子及信號(hào)通路改變等特征納入分類(lèi)系統(tǒng),并結(jié)合病理組織學(xué)特征、免疫組化等方法進(jìn)行整合和分層診斷[8,9]。根據(jù)腦膠質(zhì)細(xì)胞瘤的組織結(jié)構(gòu)和細(xì)胞特征,在顯微鏡下觀察術(shù)中或術(shù)后膠質(zhì)瘤的病理分級(jí)。不同級(jí)別的膠質(zhì)瘤治療方式有所不同,預(yù)后和生存情況也大不同。對(duì)于低級(jí)別膠質(zhì)瘤采用的是手術(shù)為主的治療。對(duì)于高級(jí)別膠質(zhì)瘤,無(wú)論術(shù)后是否達(dá)到了全切都必須進(jìn)行放療、化療等后續(xù)的輔助治療。多形性惡性膠質(zhì)瘤惡性程度高,GBM 最明顯的特征之一就是細(xì)胞增殖失控[10],研究發(fā)現(xiàn)GBM 呈現(xiàn)表觀遺傳學(xué)和遺傳不同亞群的多態(tài)性特點(diǎn),會(huì)導(dǎo)致其發(fā)生和發(fā)展具有不同的機(jī)制,并導(dǎo)致治療的失?。?1]。目前越來(lái)越多的證據(jù)表明,在不同或同一細(xì)胞類(lèi)型中,相同的配體可能有不同的受體,進(jìn)而誘導(dǎo)不同的反應(yīng)[12]。動(dòng)物細(xì)胞中質(zhì)膜的嵌入蛋白,又稱(chēng)Na-K泵,通過(guò)水解ATP 轉(zhuǎn)運(yùn)細(xì)胞內(nèi)外的鈉鉀離子,維持細(xì)胞的電化學(xué)梯度[13],并維持離子濃度的平衡。研究表明Na/K-ATP 酶是一種信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄激活因子[14-17],影響細(xì)胞增殖[18],參與細(xì)胞運(yùn)動(dòng)[19]和細(xì)胞凋亡[20]。最近的綜述描述了Na/K-ATP 酶參與細(xì)胞增殖和肥大,細(xì)胞凋亡,細(xì)胞粘附,細(xì)胞遷移,信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路和鈉泵結(jié)合藥物的相關(guān)分子基礎(chǔ)[21]。

最近有研究指出膠質(zhì)瘤在侵入腦實(shí)質(zhì)時(shí),利用離子通道和轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白體維持它們的單一生長(zhǎng)和侵襲[22,23],其中包括Na/K-ATP 酶,但其具體機(jī)制不詳。Li 等[24]研究表明,ATP1B3在胃癌細(xì)胞系中的mRNA 和蛋白質(zhì)水平均升高,并通過(guò)PI3K/AKT 信號(hào)通路調(diào)節(jié)胃癌細(xì)胞的進(jìn)展,敲減ATP1B3顯著抑制了人胃癌細(xì)胞的細(xì)胞增殖、集落形成能力、遷移和侵襲能力以及增加細(xì)胞凋亡。Lu 等[25]研究發(fā)現(xiàn),ATP1B3在肝癌組織中高表達(dá),敲減ATP1B3抑制肝癌細(xì)胞增殖和遷移,促進(jìn)肝癌細(xì)胞凋亡和上皮向間充質(zhì)轉(zhuǎn)化。

本研究結(jié)果顯示敲減U87MG 細(xì)胞中的ATP1B3后,膠質(zhì)瘤細(xì)胞的增殖、遷移能力顯著下降。ATP1B3表達(dá)水平隨著膠質(zhì)瘤惡性程度的升高而升高,ATP1B3高表達(dá)不利于患者的生存、預(yù)后,下調(diào)ATP1B3減少了P-MTOR 的表達(dá),推測(cè)其可能是通過(guò)影響MTOR 信號(hào)通路從而影響U87MG 細(xì)胞增殖、遷移。綜上所述,ATP1B3可能作為神經(jīng)膠質(zhì)瘤治療的潛在靶點(diǎn),但關(guān)于其具體作用機(jī)制仍需進(jìn)一步探究。

作者貢獻(xiàn)度說(shuō)明:

嚴(yán)其康:課題的構(gòu)思與實(shí)驗(yàn),撰寫(xiě)文章;扈清云、孫權(quán)、王彩霞: 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)整理,分析;朱金玲:論文指導(dǎo)與修改,經(jīng)費(fèi)支持。

所有作者聲明不存在利益沖突關(guān)系。

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