吳祝華 宋 娟 朱樹林 趙 邢 楊學(xué)祥 任嘉紅 陳鳳毛
(1.南京林業(yè)大學(xué) 南京 210037;2.湖州師范學(xué)院 湖州 313000;3.江蘇省句容市磨盤山林場(chǎng) 句容 212445;4.江蘇省句容市句容林場(chǎng) 句容 212424;5.長(zhǎng)治學(xué)院生物科學(xué)與技術(shù)系 長(zhǎng)治 046011)
植物促生微生物 ( plant growth promoting microbes,PGPM)可通過(guò)直接或間接作用促進(jìn)植物生長(zhǎng)并維系植物健康(Msimbiraet al., 2020)。PGPM 直接促生作用是指通過(guò)固氮、解磷和鐵螯合等機(jī)制增強(qiáng)土壤中養(yǎng)分元素的有效性,或提高細(xì)胞分裂素、生長(zhǎng)素和乙烯等植物激素的含量;間接促生作用是指通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)機(jī)制減少或抑制病原物生長(zhǎng)改變土壤微生物群落,從而激活植物防御機(jī)制,提高植物抗逆性(Waniet al., 2019)。
叢枝菌根真菌(arbuscular mycorrhizal fungi,AMF)是一類重要的PGPM,在全球范圍內(nèi)均有分布(Williset al., 2013)。AMF-宿主植物-土壤之間通過(guò)AMF 的菌絲網(wǎng)進(jìn)行交流,不僅可以在宿主植物群體間,甚至可以在宿主植物和其他植物之間形成龐大的聯(lián)接網(wǎng)絡(luò),使得營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)和水分在植物群體間得到充分利用(Chenet al., 2018)。AMF 還可通過(guò)外部菌絲體釋放的分泌物與其他土壤微生物進(jìn)行互作,促進(jìn)植物對(duì)礦物質(zhì)元素(氮、磷、鉀等)的吸收;提高宿主植物對(duì)部分病原菌(鏈霉菌、黃單胞菌、白粉菌等)的防御;增強(qiáng)宿主植物對(duì)干旱、鹽和溫度等非生物脅迫的抗性(Chenet al., 2018)。前期研究表明摩西斗管囊霉(Funneliformis mosseae)能夠提高植物的耐脅迫性,增強(qiáng)植物幼苗中超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)活性,促進(jìn)幼苗生長(zhǎng)(Song,et al.,2010)
楓香(Liquidambar formosana)是我國(guó)重要的鄉(xiāng)土彩葉樹種,樹干通直,枝葉繁茂,秋季葉色絢麗;其木材質(zhì)地堅(jiān)硬,結(jié)構(gòu)均勻,且抗壓、耐腐蝕,是制造家具、農(nóng)具、樂器、膠合板和包裝材料等的理想用材(江聶等, 2008)。楓香樹冠高大,落葉量大,可增加土壤有機(jī)質(zhì)含量、優(yōu)化土壤結(jié)構(gòu)、改善林地生境,因此也具有重要的生態(tài)價(jià)值。加強(qiáng)對(duì)楓香的栽培管理,對(duì)發(fā)展闊葉樹人工造林、開發(fā)鄉(xiāng)土樹種具有重要意義。
有關(guān)楓香根際微生物,前人研究表明,天然林中楓香根際可形成叢枝菌根,根際土壤中的AMF 孢子多樣性豐富,球囊霉屬為優(yōu)勢(shì)菌群(宋娟等,2021);從楓香根際土壤中分離和鑒定了有效解磷菌黏質(zhì)沙雷氏菌 (Serratia marcescenssubsp.marcescens)與爭(zhēng)論產(chǎn)堿菌(Variovorax paradoxus),且均顯示出良好的溶磷特性(宋娟等,2020 ;Ting,et al., 2010)。關(guān)于楓香葉色變化的研究目前主要集中于楓香轉(zhuǎn)色期其葉色變化與環(huán)境之間的關(guān)系方面(王冬雪 等, 2019), 而接種PGPM 對(duì)楓香葉色呈現(xiàn)與根際微生物群落的影響研究,目前鮮見報(bào)道。
本研究利用在楓香根際接種PGPM 優(yōu)良菌株黏質(zhì)沙雷氏菌NJ2D 與摩西斗管囊霉BJ04,研究PGPM對(duì)土壤理化性質(zhì)和楓香葉色的影響;并利用高通量Illumina MiSeq 技術(shù),研究不同微生物菌株處理下楓香林土壤的微生物PGPM 群落組成結(jié)構(gòu)和多樣性特征,以了解施加外源PGPM 對(duì)宿主植物根際土壤中微生物群落聚集的影響,從而改善土壤質(zhì)量并促進(jìn)彩葉樹種葉色呈現(xiàn),為微生物菌肥的研制提供參考。
研究區(qū)位于江蘇省句容市句容林場(chǎng)(119°14'57.76"E, 32°5' 06.40"N),該地為典型的亞熱帶季風(fēng)氣候。年均氣溫15.1 ℃,平均相對(duì)濕度78%,年均降水量1 018.6 mm,年均日照時(shí)間2 116 h,土壤類型為酸性棕壤。
本研究所用解磷菌黏質(zhì)沙雷氏菌(菌株NJ2D)由筆者前期分離自南京中山陵天然楓香林根際土樣中,菌株保藏號(hào)為CCTCC M 2012261,保存于南京林業(yè)大學(xué)林草學(xué)院森林保護(hù)實(shí)驗(yàn)室。摩西斗管囊霉(菌株BJ04)由中國(guó)北京市農(nóng)林科學(xué)院植物營(yíng)養(yǎng)與資源研究所提供。楓香為句容林場(chǎng)長(zhǎng)勢(shì)一致、生長(zhǎng)健壯的7 年生楓香苗。使用前需將-20 ℃的甘油保存菌在牛肉膏蛋白胨(NA)固體培養(yǎng)基上活化培養(yǎng)3 次。
對(duì)楓香進(jìn)行單接菌(NJ2D、BJ04)與雙接菌(NJ2D+BJ04)處理。將NJ2D 菌株活化后接種到牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基,30 ℃,160 r·min-1振蕩培養(yǎng)24 h 制成發(fā)酵液。將發(fā)酵液離心5 min(4 ℃,6 000 r·min-1),用無(wú)菌生理鹽水潤(rùn)洗菌體2~3 次后,再用無(wú)菌生理鹽水調(diào)節(jié)菌懸液,制成菌劑菌體濃度約為7×10~8×108cfu·mL-1,備用。將準(zhǔn)備好的NJ2D、BJ04 菌劑分別采用灌根法和直接施加菌劑法施入,NJ2D 菌懸液與BJ04 菌劑分別按每株100 g 施用量施于楓香根部附近,然后覆土、澆水,統(tǒng)一管理。設(shè)4 個(gè)處理,分別為:?jiǎn)谓臃NNJ2D、單接種BJ04、雙接種NJ2D+BJ04(各施100g·株-1,共施200g·株-1)和空白對(duì)照(CK),每個(gè)處理20 個(gè)重復(fù)。處理2 個(gè)月后,每個(gè)處理設(shè)3 個(gè)重復(fù),采集楓香根際(地表下15~25 cm 深) 的土壤0.5 kg,采集樣品分別裝入自封袋并做好標(biāo)記,篩除植物殘枝、石頭等雜質(zhì)后,置于低溫保存箱送至實(shí)驗(yàn)室。其中一部分土樣保存在-80 ℃超低溫箱,用于微生物測(cè)序分析(保存時(shí)間不超過(guò)3 天),另一部分土樣風(fēng)干后保存在4 ℃冰箱,用于土壤理化性質(zhì)測(cè)定。
土樣風(fēng)干后過(guò)2 mm 孔徑的土壤篩,用于測(cè)定土壤理化性質(zhì)。使用pH 計(jì)(Mettler Toledo,美國(guó)) 測(cè)定土壤pH (Xionget al., 2015)。采用抗壞血酸—鉬藍(lán)法測(cè)定有效磷含量(Olsen, 1954)。土樣在550 ℃下燃燒后,對(duì)有機(jī)質(zhì)含量進(jìn)行測(cè)定(Rosellet al., 2001)。使用凱氏定氮法測(cè)定全氮含量(Pageet al., 1982)。通過(guò)將新鮮土樣在105 ℃下烘干,用質(zhì)量分析法測(cè)定土壤含水率(Denget al., 2016)。采用氫氧化鈉熔融—鉬銻比色法測(cè)定土壤全磷含量(Renet al., 2016)。使用酸溶解原子吸收法(原子吸收光譜儀,Thermo Fisher Scientific,美國(guó))測(cè)量土壤全鉀含量。
于2021 年11 月下旬楓香葉色充分顯色(樹葉葉色基本一致)之時(shí),選擇天氣晴朗之日進(jìn)行葉色參數(shù)測(cè)定。每處理隨機(jī)選擇3 單株,每株樹采摘充分顯色葉3 片。葉色參數(shù)采用全自動(dòng)測(cè)色儀CM-2300D (廣東柯尼卡美能達(dá)公司)測(cè)定,每處理測(cè)定9 枚葉片,在每片葉正面中脈兩側(cè)進(jìn)行測(cè)定,記錄表征葉片顏色的L*、a*、b* 值,其中,L* 表示光澤明亮度,L* 值越大,亮度越高;a* 值表示紅綠色差,a* 值越大,紅色越深,a* 值越小,綠色越深;b* 值表示黃藍(lán)色差,b* 值越大,黃色越深,b* 值越小,藍(lán)色越深。
楓香葉片葉綠素a、葉綠素b 和類胡蘿卜素含量的測(cè)定采用Porrade 等(1989)的方法,花青素含量測(cè)定采用Colanero 等(2018)的方法。
選用 MoBio PowerMax Soil DNA isolation kit(MoBio Laboratories,Inc.,美國(guó))試劑盒提取土壤微生物基因總DNA。將提取的總DNA 用于細(xì)菌和叢枝菌根真菌群落的分析。真菌18S 核糖體RNA 基因通過(guò)巢式PCR 反應(yīng)擴(kuò)增。第1 輪擴(kuò)增引物為:F, 5′-GC ATATCAATAAGCGGAGGA-3′; R, 5′_-GTCGTTTAA AGCCATTACGTC-3′。第2 輪PCR 擴(kuò)增引物引物為:F,5′_-TTGAAAGGGAAACGATTGAAGT-3′ ;R,5′-_TAC GTCAACATCCTTAACGAA-3′。 細(xì)菌 16S rRNA 基因擴(kuò)增引物為338 F(5′- ACTCCTACGGGAGGCAGC AG-3′)和 806 R(5′-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3′)(Caporasoet al., 2012)。這些引物均包含特有的一組8個(gè)核苷酸的條形碼序列。PCR 擴(kuò)增體系為:12.5 uL 2×TaqPlus Master Mix,3 uL BSA(2 ng·μL-1),1uL 上下游引物和30 ng DNA 模版。PCR 重復(fù)3 次,16S V3、V4和18S(ITS1、ITS2)的PCR 擴(kuò)增程序條件如下:94 ℃5 min,30 個(gè)循環(huán),94 ℃ 30 s,50 ℃ 30 s,和72 ℃ 60 s;72 ℃ 7 min 4 ℃保存。而AMF PCR 擴(kuò)增分為2 個(gè)步驟,第1 輪PCR 反應(yīng)程序?yàn)?4 ℃ 5 min;94 ℃ 5 s,58 ℃ 6 s,72 ℃ 10 s,30 個(gè)循環(huán);72 ℃ 7 min。第2 輪PCR 反應(yīng)程序?yàn)?4 ℃ 5 min;94 ℃ 5 s, 58 ℃ 6 s,72 ℃ 10 s,30 個(gè)循環(huán);72 ℃ 7 min。獲得的PCR 產(chǎn)物進(jìn)行1%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))瓊脂糖凝膠電泳后,使用AxyPrep DNA Gel Extraction Kit(Axygen Biosciences)凝膠回收試劑盒純化,切膠回收PCR 產(chǎn)物。將每個(gè)樣品等比例混合后,利用Illumina公司Miseq PE300 平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序(艾維可生物科技有限公司,中國(guó))。
使用QIIME( Version 1.8,http://qiime.org)(Caporasoet al., 2012)去除< 200 bp 片段和低質(zhì)量序列(average quality scores < 20 reads)獲得高質(zhì)量的細(xì)菌、真菌序列。使用UPARSE 根據(jù)97%的相似度對(duì)所有樣本進(jìn)行聚類(Edgar, 2013),并利用UCHIME 軟件鑒定并去除嵌合體序列。使用(Silva)數(shù)據(jù)庫(kù)(Release128 http://www.arb-silva.de)進(jìn)行細(xì)菌物種注釋(Quastet al., 2012)。另外,使用UNITE 數(shù)據(jù)庫(kù)(Release7.0 http://unite.ut.ee/index.php)對(duì)真菌進(jìn)行分類(K?ljalget al., 2013)。利用QIIME(V1.8, http://qiime.org/)計(jì)算出可用于分析物種復(fù)雜性的Alpha 多樣性指數(shù),包括Chao、Shannon 和observed species 指數(shù)。使用one-way ANOVA、Excel 2007 和SPSS 17.0 進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析以及真菌群落、細(xì)菌群落與土壤環(huán)境因子和葉色素含量間的Pearson 相關(guān)性分析。利用R 軟件(V 4.0.5)進(jìn)行韋恩圖和功能的熱圖作圖。利用linear discriminant analysis effect size(LefSe)分析方法設(shè)定顯著差異的線性判別式分析(line discriminant analysis, LDA)值為4.0,尋找不同處理間豐度差異顯著物種。其他基礎(chǔ)繪圖運(yùn)用Origin 2018 繪制。利用Canoco(Version 4.5)軟件對(duì)環(huán)境因子和微生物群落多樣性進(jìn)行主成分(PCA)分析。利用psych R 包對(duì)復(fù)雜微生物群落中的共生模式進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)分析,在Cytoscape 軟件(V 3.6.1)中進(jìn)行可視化操作。
處理組與對(duì)照楓香根際土樣全氮、全磷和全鉀含量見表1。與對(duì)照(CK)相比,NJ2D、BJ04 和NJ2D+BJ04 處理的楓香苗根際土壤全氮、全磷、有機(jī)質(zhì)、有效磷含量、含水率和pH 均顯著提高(P< 0.05)。與CK 和其他處理組相比,NJ2D+BJ04 處理?xiàng)飨愀H的土壤全氮、有機(jī)質(zhì)含量和土壤含水率均顯著提高 (P<0.05)。BJ04 處理的楓香根際土壤全鉀和有效磷含量均顯著高于其他各處理組(P< 0.05)。此外,NJ2D 處理的楓香苗根際土壤pH 顯著高于其他各處理(P<0.05)。以上結(jié)果說(shuō)明,接種菌劑 NJ2D、BJ04 可以有效提高土壤養(yǎng)分,以雙接種效果最好。
表1 促生微生物對(duì)楓香根際土壤理化性質(zhì)的影響(n=3)①Tab.1 Soil physicochemical properties in the rhizosphere of Liquidambar formosana grown in field soil as affected by the inoculated microorganism
不同接菌處理?xiàng)飨愕娜~色參數(shù)變化見圖1。不同處理之間,楓香葉片的光澤明亮度L* 值呈明顯變化( “+”表示偏明亮,“-”表示偏暗),單接種 NJ2D處理?xiàng)飨忝绲腖*逐漸提高,并達(dá)到最大值。相反,單接種 BJ04 處理?xiàng)飨忝绲腖*值較CK 則顯著降低(P<0.05)(圖1b)。與 CK 相比,楓香葉片的色相紅綠色差a*值(“+”表示偏紅,“-”表示偏綠)在接菌處理后呈現(xiàn)明顯下降趨勢(shì)(圖1c)。單接種 BJ04 和雙接種NJ2D+BJ04 處理?xiàng)飨忝绲腷* 值(“+”表示偏黃,“-”表示偏藍(lán)),與CK 相比呈現(xiàn)顯著下降的趨勢(shì),表明CK 組和單接種NJ2D 處理組的b*值較高,楓香葉色變黃的程度加深(圖1d)。以上結(jié)果表明,菌劑NJ2D、BJ04 對(duì)楓香葉色表型參數(shù)產(chǎn)生了顯著影響。
圖1 接種促生菌對(duì)楓香葉色變化與葉片色素含量的影響Fig.1 Leaf color and pigments of L.formosana affected by the inoculated microorganism
接種NJ2D、BJ04 還對(duì)楓香葉片葉綠素含量產(chǎn)生不同程度的影響(圖1e)。與CK 相比, NJ2D 和NJ2D+BJ04 處理?xiàng)飨愕娜~綠素a、葉綠素b、總?cè)~綠素值顯著降低(P< 0.05);單接種BJ04 則顯著提高了楓香葉片的葉綠素a、葉綠素b 和總?cè)~綠素含量(P< 0.05)(圖1e);此外,單接種BJ04 可顯著提高楓香葉片中的類胡蘿卜素含量(圖1f);單接種NJ2D 和接種NJ2D+BJ04 處理的類胡蘿卜素含量分別下降了20.15% 和14.67%(圖1f);雙接種NJ2D+BJ04 的楓香葉片中花青素含量較對(duì)照組顯著增加(P< 0.05),而單接種 NJ2D、BJ04 菌劑的楓香葉片中花青素含量較對(duì)照CK 顯著降低(P< 0.05)(圖1g)。
采用Illumina MiSeq 對(duì)CK 和處理組楓香根際土壤樣品測(cè)序共獲得2 界、36 門 、98 綱 、140 目 、296科、482 屬、1 380 種的土壤細(xì)菌,及1 綱、3 目、3 科、9 屬、68 種的土壤AMF。高通量測(cè)序結(jié)果(圖2a)顯示,NJ2D、BJ04、NJ2D+BJ04 和CK 之間共有OTUs 個(gè)數(shù)為2 731 個(gè);CK、NJ2D、BJ04 和NJ2D+BJ04 特有OTUs 分別有385、261、242 和151 個(gè)。此外,由圖2c可以看出,對(duì)照組和處理組共有OTUs 為204 個(gè);CK、BJ04、NJ2D、NJ2D+BJ04 各處理組特有OTUs 分別有8、6、1、6 個(gè)。處理后,特有OTUs 減少了,可能是接種微生物增進(jìn)了功能菌群,減少了無(wú)關(guān)菌種數(shù)群。
圖2 接種促生菌對(duì)楓香根際土壤細(xì)菌多樣性的影響Fig.2 The soil bacterial diversity in L.formosana rhizosphere affected by the inoculated microorganism
對(duì)照與處理組楓香根際微生物多樣性見表2。NJ2D、BJ04 和NJ2D+BJ04 處理?xiàng)飨愕腃hao1 多樣性指數(shù)值相似,而CK 組顯著低于處理組(P< 0.05)。此外,CK 組的Shannon 多樣性指數(shù)也最小。而對(duì)于AMF,根際Chao1 指數(shù)最高的是CK ,表明CK 組楓香根際的群落豐富度指數(shù)較處理組大。Shannon 指數(shù)最高的是BJ04 組,最低的是NJ2D 組,表明BJ04 組根際AMF 的群落多樣性最大,NJ2D 組際AMF 的群落多樣性最小。
表2 楓香根際土壤微生物多樣性指數(shù)Tab.2 Diversity index of the soil microbes in the rhizosphere under L.formosana relative to variety
楓香根際土壤細(xì)菌在門水平的豐度分析如圖2所示,相對(duì)豐度排在前5 位的是放線菌門(Actinobacteria,29.77%~35.72%)、變形菌門(Proteobacteria,24.74%~35.30%)、綠彎菌門(Chloroflexi,6.38%~15.68%)、酸桿菌門(Acidobacteria,6.49%~10.77%)和芽單胞菌門(Gemmatimonadetes,6.08%~9.45%)。其中,與CK 相比,NJ2D、BJ04 和NJ2D+BJ04 處理組中的變形菌門和放線菌門的相對(duì)豐度明顯升高。在NJ2D 處理組中芽單胞菌門和擬桿菌門(Bacteroidetes)的豐度相對(duì)較高(圖2b),而藍(lán)細(xì)菌門(Cyanobacteria)和厚壁菌門(Firmicutes)為BJ04 處理組中的主要門。此外,疣微菌門(Verrucomicrobia)和Saccharibacteria 菌門主要出現(xiàn)在NJ2D+BJ04 中。最后,與處理組相比,CK 組群落中的酸桿菌門、綠彎菌門和浮霉菌門(Planctomycetes)的相對(duì)豐度最高(圖2b)。
進(jìn)一步分析和比較屬水平上的細(xì)菌、AMF 的相對(duì)豐度值(圖2d、2e、3a、3b)。楓香根際細(xì)菌屬(圖2d)主要包括熱酸菌屬(Acidothermus,2.45%~4.97%)、芽單胞菌屬(Gemmatimonas,3.15%~3.79%)、鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas,2.72%~3.71%)、嗜熱光合細(xì)菌屬(Roseiflexus, 1.64%~2.57%)和慢生根瘤菌屬(Bradyrhizobium,1.24%~1.57%)。單接種NJ2D 處理組中,鏈霉菌屬(Streptomyces,3.70%)和慢生根瘤菌屬(1.57%)為優(yōu)勢(shì)屬(圖2e)。而單接種BJ04 處理組中嗜熱光合細(xì)菌屬(2.57%)和羅河桿菌屬(Rhodanobacter,2.12%)為優(yōu)勢(shì)屬。雙接種NJ2D+BJ04 處理組中,Jatrophihabitans(1.53%)為優(yōu)勢(shì)屬,而Haliangium屬(0.76%)的相對(duì)豐度值低于其他各處理組(圖2e)。從AMF 屬水平上看(圖3a),楓香根際AMF 的優(yōu)勢(shì)屬為球囊霉屬(Glomus,18.37%~43.25%)、根生囊霉屬(Rhizophagus,2.37%~11.37%)、多氏囊霉屬(Dominikia,1.52%~6.67%)、 卡氏囊霉屬(Kamienskia,4.57%~0.02%)、巨孢囊霉屬(Gigaspora,1.51%~0.02%)、硬囊霉屬(Sclerocystis,0.59%~0.01%)和近明球囊霉屬(Claroideoglomus,0.460%~0.001%)。其中,球囊霉屬(43.25%)和卡氏囊霉屬(2.14%)在CK 組中的相對(duì)豐度較高,而多氏囊霉屬在雙接種NJ2D+BJ04 處理組中的相對(duì)豐度(6.67%)較高(圖 3b)。綜上可以看出,不同處理?xiàng)l件下楓香根際土壤樣品中的細(xì)菌、AMF組成較為相似,但其相對(duì)豐度值之間存有較大差異。
圖3 接種促生菌對(duì)楓香根際土壤AMF 多樣性的影響Fig.3 The soil AMF diversity in the rhizosphere of L.formosana affected by the inoculated microorganism
為進(jìn)一步分析不同處理下細(xì)菌菌群的差異。通過(guò)LefSe 分析對(duì)細(xì)菌物種相對(duì)豐度進(jìn)行比較。根據(jù)線性判別式分析(line discriminant analysis, LDA)計(jì)算結(jié)果來(lái)判斷差異顯著性的高低,LDA 的值越高,差異顯著性越高,對(duì)LDA ≥ 3 的細(xì)菌進(jìn)行分析(圖4a),找出組間具有顯著差異的物種(Biomarker)。單接種NJ2D處理?xiàng)飨忝绺H共有11 個(gè)特征細(xì)菌,分別是紅螺菌科(Rhodospirillaceae)、假諾卡氏菌屬(Pseudonocardia)、g__Pseudolabrys、f_288_2、根瘤菌科(Rhizobiaceae)、溶桿菌屬(Lysobacter)、根瘤菌屬(Rhizobium)、莫拉菌科(Moraxellaceae)、橙色桿孢囊菌(Virgisporangium)、g_Pedomicorbium、百脈根根瘤菌(s_Rhizobium_etli)。單接種BJ04 的楓香苗根際特征細(xì)菌為f_Acidimicrobiaceae。雙接種NJ2D+BJ04 的楓香苗根際特征細(xì)菌為g_Caenimonas(圖4a)。
圖4 不同接菌處理下楓香根際細(xì)菌(a)和真菌(b)的差異性分析Fig.4 Difference in bacterial (a) and fungal (b) populations in the rhizosphere of L.formosana under different inoculation conditions
利用LefSe 對(duì)不同處理下真菌菌群的差異進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)6 個(gè)差異豐富的分類學(xué)分支(a= 0.01,LDA Score ≥ 3.0)(圖4b),可以找出組間具有顯著差異的物種(biomarker),以及顯著影響組間差異性的物種或群落。由圖4 中可知,單接種BJ04 楓香苗根際的差異物種主要為球囊霉屬種(s_Glomus_sp_rp65、s_Glomus_sp_rp10 與s_Glomus_ sp_DQF05),硬囊霉屬、彎絲硬囊霉屬(s_Sclerocystis_sinupsa)。而CK 組中只有1 個(gè)特征真菌為球囊霉屬的s_Glomus_sp_3_ZHNL_2013a。單接種NJ2D 和雙接種NJ2D+BJ04的楓香根際真菌群落組間無(wú)顯著差異物種(圖4b)。
人工接種微生物會(huì)影響微生物的組成和分布,通過(guò)主成分分析(principal component analysis,PCA)檢驗(yàn)土壤理化性質(zhì)、葉色素與細(xì)菌群落的相關(guān)性,結(jié)果(圖5a)中紅色射線表示土壤性質(zhì)和葉色素,箭頭的長(zhǎng)度代表的是其影響程度,射線間的夾角代表相關(guān)程度。圖中第1 坐標(biāo)軸解釋了細(xì)菌群落組成和土壤性質(zhì)、葉色素間總變異的37.45%,第2 坐標(biāo)軸解釋了細(xì)菌群落組成和土壤性質(zhì)、葉色素間總變異的48.96%。分別基于這2 種距離使用置換多元方差分析(PERMANOVA),進(jìn)行999 次置換后發(fā)現(xiàn),研究區(qū)樣品兩兩之間均有著顯著差異(P< 0.05)。圖中單接種BJ04 處理組與雙接種NJ2D+BJ04 處理組細(xì)菌群落組成相似度較高,而單接NJ2D 處理組與BJ04 處理組的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)相似(圖5a)。此外,CK 組與雙接種NJ2D+BJ04 處理組細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)在PCA 圖中的位置比較分散,距離較遠(yuǎn)。NJ2D、BJ04 的接種處理使得楓香根際的細(xì)菌群落組成發(fā)生了變化,說(shuō)明NJ2D、BJ04 會(huì)對(duì)楓香根際的細(xì)菌群落產(chǎn)生影響。另外,PCA 結(jié)果(圖5a)表明,土壤pH、TP 和AP 含量與單接種NJ2D 處理組的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)呈顯著正相關(guān)(P< 0.05),土壤TK 含量與葉綠素和類胡蘿卜素含量呈顯著正相關(guān)(P< 0.05),土壤TN與花青素含量呈顯著正相關(guān)(P< 0.05)。
圖5 接種促生菌對(duì)楓香根際土壤微生物群落組成與環(huán)境因子、葉色素間的PCA 分析Fig.5 PCA of soil microbial community composition, environmental factors and leaf pigments in rhizosphere of L.formosana by inoculating microorganism
對(duì)楓香根際AMF 群落而言,主成分分析表明,PCA1、PCA2 分別解釋了樣本間33.15%和48.97%的變異來(lái)源,第一、二兩軸的累積貢獻(xiàn)率達(dá)82.12%。CK 組、單接種黏質(zhì)沙雷氏菌NJ2D、摩西斗管囊霉BJ04 菌劑的處理組之間的點(diǎn)距離較近,說(shuō)明3 個(gè)樣地的AMF 群落構(gòu)成相似;而CK 組和單接種摩西斗管囊霉BJ04 處理組與雙接種NJ2D+BJ04 處理組之間距離較遠(yuǎn),說(shuō)明雙接種NJ2D+BJ04 處理組與CK 組和單接種摩西斗管囊霉BJ04 處理組之間的AMF 群落結(jié)構(gòu)差異較大(圖5b)。利用置換多元方差分析(PERMANOVA),發(fā)現(xiàn)研究區(qū)樣品兩兩之間均有著顯著性差異(P< 0.05),進(jìn)一步佐證了樣本組間群落結(jié)構(gòu)差異的顯著性。此外,本研究結(jié)果顯示,土壤TN、土壤水分含量、土壤有機(jī)質(zhì)以及楓香葉片中花青素的含量與雙接種NJ2D+BJ04 菌劑處理組的AMF 群落結(jié)構(gòu)呈顯著正相關(guān)(P< 0.05),土壤 TK、TP、AP、葉片中葉綠素和類胡蘿卜素值與單接種摩西斗管囊霉BJ04 處理組中的AMF 群落結(jié)構(gòu)呈顯著正相關(guān)(P< 0.05)(圖5b)。
為了進(jìn)一步明確不同接種處理土壤微生物群落與土壤理化性質(zhì)、葉色素間的的相關(guān)性,對(duì)土壤微生物群落與土壤理化因子和葉色素間進(jìn)行Pearson 相關(guān)分析,結(jié)果表明土壤pH 與類胡蘿卜素、葉綠素a、葉綠素b、總?cè)~綠素含量和chao1(AMF)呈顯著負(fù)相關(guān)(P< 0.05)(P< 0.01)(表3)。有效磷與類胡蘿卜素、葉綠素a、葉綠素b 和總?cè)~綠素呈顯著正相關(guān)(P<0.05)(P< 0.01);土壤有機(jī)質(zhì)與土壤全氮呈極顯著正相關(guān)(P< 0.01)(表3);而土壤含水率、土壤全鉀對(duì)楓香葉色素、微生物多樣性間無(wú)顯著性影響。說(shuō)明楓香葉色含量和微生物多樣性對(duì)土壤pH、土壤有機(jī)質(zhì)、土壤總鉀、土壤有效磷和土壤含水量有響應(yīng),其中楓香葉色和微生物多樣性受土壤pH 和土壤有效磷的影響最大(表3)。
表3 不同接種處理下土壤微生物群落與土壤理化性質(zhì)、葉色素間的Pearson 相關(guān)性分析①Tab.3 Correlation analysis of soil microbial community, soil chemical and physical properties, and leaf pigments, as determined by Pearson correlation analysis
氮和磷是最常見的限制植物生長(zhǎng)和生產(chǎn)的營(yíng)養(yǎng)元素(Güsewell, 2004)。鉀可以調(diào)節(jié)植物根系的吸水能力,是促進(jìn)植物生長(zhǎng)重要的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)之一(Wanget al., 2013),能夠有效提高植物對(duì)水分脅迫的耐受性。本研究中,單接種NJ2D、BJ04 和雙接種NJ2D+BJ04菌劑后的楓香根際土壤當(dāng)中的TN、TP、有機(jī)質(zhì)、AP、水分含量和pH 均有所增加。其中,單接種BJ04 后楓香根際土壤的TK 含量增加最多。NJ2D 經(jīng)鑒定為沙雷氏菌屬(Serratiasp)。前人研究表明黏質(zhì)沙雷氏菌是一種高效的磷酸鹽溶解菌(Misraet al., 2012),其促進(jìn)植物生長(zhǎng)的機(jī)制之一是增強(qiáng)其固氮、固磷的能力(Selvakumaret al., 2008 , Islamet al., 2010)。 此外,有研究認(rèn)為,AMF 通過(guò)其根外菌絲可以有效提高植物對(duì)水分和根際營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的吸收,從而幫助其生長(zhǎng)(Augéet al., 2014)。由于單接種NJ2D、BJ04 和雙接種NJ2D+BJ04 菌劑能夠顯著提高楓香苗根際土壤養(yǎng)分,可對(duì)楓香的生長(zhǎng)起到促生長(zhǎng)作用。此外,筆者通過(guò)微生物多樣性分析發(fā)現(xiàn), NJ2D、BJ04 和NJ2D+BJ04會(huì)影響到楓香根際的微生物群落結(jié)構(gòu),土壤微生物群落能夠驅(qū)動(dòng)土壤有機(jī)質(zhì)的分解和土壤養(yǎng)分循環(huán)(Xuet al., 2019)。NJ2D、BJ04 和雙接種NJ2D+BJ04 處理組的楓香根際土壤細(xì)菌群落多樣性的Chao1 指數(shù)較CK 組高。由此推斷NJ2D、BJ04 和雙接種NJ2D+BJ04 菌劑可在一定程度上提高土壤肥力。
與其他處理相比,單接BJ04 處理組中的葉綠素和類胡蘿卜素含量相對(duì)較高,表明接種BJ04 可影響植物的活力,提高植物的抗逆性。Stahl 等(2005)發(fā)現(xiàn)葉綠素是影響植物顏色的主要因素,這可能是因?yàn)楹}卜素容易被葉綠素掩蓋。因此,單接種BJ04 處理組葉片在深秋時(shí)候仍呈現(xiàn)深綠色,可能是因?yàn)閱谓臃NBJ04 處理組楓香葉片的葉綠素含量最高所致。植物葉片顏色的變化與其葉片花青素的含量密切相關(guān)(Liet al., 2018)。花青素是植物重要的次生代謝物,可賦予植物呈現(xiàn)橙色、紅色、品紅、紫色和藍(lán)色(Huet al.,2015)。在本研究中,雙接種NJ2D+BJ04 處理組的花青素含量高于其他各組,而該組的葉綠素含量較低,且雙接種NJ2D+BJ04 處理組的楓香葉子顏色要比其他各組更紅。上述研究可能在一定程度上解釋了楓香深秋葉色變化差異的原因,為通過(guò)接種微生物 來(lái)培育更豐富的觀賞植物葉片顏色 提供了理論依據(jù)。另外,由于花青素具有幫助植物抵抗生物和非生物脅迫:如高光強(qiáng)、熱環(huán)境條件、水分脅迫和營(yíng)養(yǎng)缺乏、草食動(dòng)物的攻擊和植物滲透平衡的調(diào)節(jié)的能力(Qiet al.,2011)。因此,筆者進(jìn)一步推測(cè)雙接種NJ2D+BJ04 具有減輕植物生物和非生物脅迫的潛力。
在根際微生物群落方面,PCA 分析表明,接種外源菌株NJ2D、BJ04 和NJ2D+BJ04 對(duì)楓香人工林區(qū)楓香根際微生物群落結(jié)構(gòu)產(chǎn)生影響,并且處理組的細(xì)菌α 多樣性顯著高于對(duì)照組(P< 0.05),接種后細(xì)菌群落快速發(fā)生了改變。有研究指出,土壤細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)對(duì)干擾的反應(yīng)比其他微生物更為靈敏(Denget al., 2016),并且干擾和擾動(dòng)可能會(huì)增加細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)之間的相似性(Petsch, 2016),因此,單接種NJ2D、BJ04 和雙接種NJ2D+BJ04 菌劑處理組中特有的OTU 較少。值得注意的是,黏質(zhì)沙雷氏菌NJ2D 處理組和CK 組的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)明顯不同,這可能是因?yàn)镹J2D 的加入使其在楓香根際形成了不受阻礙的競(jìng)爭(zhēng)類群,從而與CK 組之間形成了差異顯著的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)。單接種NJ2D、BJ04 和雙接種NJ2D+BJ04 菌劑明顯影響到楓香根際AMF 群落的Chao1 指數(shù)。與對(duì)照相比,各處理均未顯著增加楓香根際土壤中的AMF Chao1 指數(shù),這可能是因?yàn)榻臃N的外源菌株競(jìng)爭(zhēng)力不如土壤中原有的內(nèi)源AMF, NJ2D、BJ04 的接種處理僅僅可能只是調(diào)節(jié)植物選擇其特定AMF 的一個(gè)誘導(dǎo)劑,證明寄主植物在對(duì)其根際AMF 群落的選擇時(shí)起到了主導(dǎo)性作用(Guyonnetet al., 2017),AMF 菌株在侵染過(guò)程中具有專一性和共生特性(Bonfanteet al., 2010)。雙接種NJ2D+BJ04 菌劑的處理組與CK 組相比其引起楓香根際AMF 群落結(jié)構(gòu)的差異性更顯著,表明其對(duì)AMF 群落結(jié)構(gòu)的影響程度更大。這可能是因?yàn)殡p接種NJ2D+BJ04 菌劑對(duì)土壤中全氮、有機(jī)質(zhì)含量和土壤含水率的影響較大。
與對(duì)照組相比,單接種NJ2D、BJ04 和雙接種NJ2D+BJ04 菌劑處理組中的酸桿菌門、綠彎菌門和浮霉菌門的相對(duì)豐度值下降,而變形菌門和放線菌門的相對(duì)豐度值增加。有研究指出,變形菌門可以促進(jìn)植物生長(zhǎng)(Mendeset al., 2013),放線菌門常常出現(xiàn)在富營(yíng)養(yǎng)化土壤當(dāng)中(Yanget al., 2017),變形菌門和放線菌門具有一些共同的特征:包括分解有機(jī)物和對(duì)植物根際病原菌的抑制功能(Yanget al., 2017)。綠彎菌門常常在極端、壓力的生境條件下出現(xiàn),如干旱、貧瘠和高溫的土壤條件下(Yamadaet al., 2009)。在寡營(yíng)養(yǎng)的土壤條件下,酸桿菌門更容易富集(Leffet al., 2015)。此外,酸桿菌門與土壤pH 呈負(fù)相關(guān)(Cat?oet al., 2014)。經(jīng)單接種NJ2D、BJ04 和雙接種NJ2D+BJ04 菌劑處理后可有效增加楓香根際變形菌門和放線菌門的數(shù)量,表明菌劑NJ2D、BJ04 和NJ2D+BJ04 具有改善土壤營(yíng)養(yǎng)條件和抑制植物根際病原菌的潛力。擬桿菌門(Bacteroidetes)通常與土壤pH 呈正相關(guān)(Jeanbilleet al.,2016),且擬桿菌門更適宜在營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)豐富的生境條件生存。浮霉菌門在與植物競(jìng)爭(zhēng)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),特別是磷時(shí)候被認(rèn)為是生長(zhǎng)緩慢的細(xì)菌(Polletet al., 2014)。筆者發(fā)現(xiàn), NJ2D 處理組的pH 以及NJ2D 處理組中的擬桿菌門的豐度均高于CK 組。但是在土壤pH 值相對(duì)較低的CK 組中,其浮霉菌門的數(shù)量相對(duì)較高。上述現(xiàn)象表明,擬桿菌門豐度的增加極有可能與土壤pH 值的增加有關(guān)。此外, NJ2D 處理組中擬桿菌門豐度的增加也可能是其促進(jìn)楓香生長(zhǎng)的原因之一。另外,在本研究中發(fā)現(xiàn), NJ2D 處理組中的鏈霉菌屬的相對(duì)豐度較高。有研究發(fā)現(xiàn),鏈霉菌屬是一類有效的生物防治劑菌種資源(Shekharet al., 2006)。表明接種NJ2D處理的楓香幼苗對(duì)病原菌的抵抗能力在一定程度上得到提高。
球囊霉屬和根生囊霉屬是土壤當(dāng)中最為豐富的屬。CK 組中根生囊霉屬的相對(duì)豐度值高于其他各處理組。有研究發(fā)現(xiàn)根生囊霉屬通過(guò)與病原菌競(jìng)爭(zhēng)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)、空間以及通過(guò)提高植物對(duì)逆境環(huán)境(如重金屬污染和高鹽)的耐受性來(lái)促進(jìn)寄主植物的生長(zhǎng)(Siddiqui and Akhtar, 2008)。由此可見,單接種NJ2D、BJ04 或者雙接種NJ2D+BJ04 菌劑后均可在一定程度上提高土壤養(yǎng)分,促進(jìn)楓香生長(zhǎng)。此外,雙接種NJ2D+BJ04 菌劑處理組中的球囊霉屬相對(duì)豐度值與CK 組相似,且黏質(zhì)沙雷氏菌NJ2D 和摩西斗管囊霉BJ04 處理組中球囊霉屬的相對(duì)豐度值也與CK 組相似。球囊霉屬在所有樣本中均普遍存在,這與Biermann 和Linderman(Biermann and linderman, 1983)和 Daniell 等(Daniellet al., 2001)的研究結(jié)果一致,源于球囊霉屬具有很高的產(chǎn)孢率和快速定殖的能力。一些研究發(fā)現(xiàn),引入本地微生物可以避免土著菌株與引入的外來(lái)菌株之間的拮抗關(guān)系(Pellegrinoet al., 2011)。NJ2D 篩選自楓香根際土樣, BJ04 篩自桃樹根際中,單獨(dú)接種NJ2D、BJ04 均能夠降低楓香根際球囊霉屬的豐度值,而單接種NJ2D 引起的球囊霉屬相對(duì)豐度值變化比單接種BJ04 菌劑處理組的大,表明NJ2D 對(duì)楓香根際球囊霉屬豐度值及整個(gè)AMF 群落結(jié)構(gòu)具有較強(qiáng)的修飾能力。
在本研究中,筆者發(fā)現(xiàn)單接NJ2D、BJ04 和雙接種NJ2D+BJ04 均可以有效改善楓香根際土壤養(yǎng)分和葉色素含量。在楓香根際接種NJ2D、NJ2D+BJ04 可形成獨(dú)特的細(xì)菌、AMF 群落結(jié)構(gòu)。這說(shuō)明NJ2D 和NJ2D+BJ04 外源性菌劑的接種是影響楓香根際細(xì)菌、AMF 群落結(jié)構(gòu)的重要因素。另外,土壤TN、TK、有機(jī)質(zhì)、AP、水分和pH 對(duì)楓香根際細(xì)菌、AMF 群落結(jié)構(gòu)變化的會(huì)產(chǎn)生一定的影響。以上結(jié)果為開發(fā)適合楓香生長(zhǎng)的微生物菌肥提供了理論和實(shí)踐依據(jù)。