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水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)研究進(jìn)展

2023-12-25 03:11:11婁岱金趙國(guó)強(qiáng)
濕地科學(xué) 2023年5期
關(guān)鍵詞:物種水稻數(shù)據(jù)庫(kù)

婁岱金,蘇 玥,趙國(guó)強(qiáng),羅 濤

(江西科技師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,江西 南昌 330013)

水生植物是指能夠在水生環(huán)境中長(zhǎng)期或者周期性正常生長(zhǎng)的植物[1]。水生植物是風(fēng)景園林和歷史文化等建設(shè)中的重要組成部分,水生植物不僅具有很高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值,還在植物育種和植物進(jìn)化等方面具有重要的科研價(jià)值[2]。隨著各種生物技術(shù)的不斷發(fā)展,水生植物及其相關(guān)研究領(lǐng)域產(chǎn)出了海量的數(shù)據(jù)[3]。存儲(chǔ)和整理這些水生植物數(shù)據(jù)是水生植物研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)問(wèn)題。數(shù)據(jù)庫(kù)是水生植物研究領(lǐng)域快速發(fā)展的基礎(chǔ)[4],實(shí)現(xiàn)了水生植物數(shù)據(jù)的網(wǎng)絡(luò)共享和水生植物研究領(lǐng)域的跨學(xué)科交流[5]。

已有的水生植物數(shù)據(jù)庫(kù),例如,中國(guó)水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)、美國(guó)水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)和歐洲水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)等,為水生植物及其相關(guān)研究提供了重要的數(shù)據(jù)支持。這些水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)在植物分類、生物地理學(xué)、生態(tài)學(xué)和生理學(xué)等方面都有廣泛應(yīng)用[6]。在數(shù)據(jù)更新和維護(hù)的及時(shí)性和數(shù)據(jù)庫(kù)的穩(wěn)定性等方面,現(xiàn)有的水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)還存在著一些問(wèn)題。為了進(jìn)一步推動(dòng)水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)的發(fā)展,需要建立可持續(xù)發(fā)展的數(shù)據(jù)更新和維護(hù)機(jī)制,加強(qiáng)不同水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)之間的數(shù)據(jù)共享[7]。未來(lái),水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)應(yīng)該向數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化、數(shù)據(jù)共享和互操作性方面發(fā)展,這需要水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)的管理者和水生植物的研究者共同努力[8]。同時(shí),未來(lái)的水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)還需要不斷豐富數(shù)據(jù)內(nèi)容,提高數(shù)據(jù)庫(kù)本身的特色,開發(fā)出更加高效的數(shù)據(jù)分析和可視化工具,以更好地支持水生植物研究的發(fā)展。

本文首先介紹了國(guó)內(nèi)外的水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)以及包含水生植物數(shù)據(jù)的植物數(shù)據(jù)庫(kù);然后,以蓮(Nelumbo nucifera)和水稻(Oryza sativa)等為例,概述水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)在水生植物研究中的應(yīng)用;最后,總結(jié)了水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)展至今存在的問(wèn)題,提出對(duì)水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)未來(lái)發(fā)展的建議。

1 水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)概述

1.1 中國(guó)的水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)

國(guó)內(nèi)的水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)建設(shè)正在逐步發(fā)展,一些研究機(jī)構(gòu)和高校建立了水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)。

中國(guó)科學(xué)院植物研究所以中國(guó)水生植物志名錄的內(nèi)容為基礎(chǔ),建立了中國(guó)水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.plant.nsdc.cn/aquaticplants)。中國(guó)水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)記錄了中國(guó)的90科739種水生植物的信息,其內(nèi)容不僅包括水生植物的科、屬和物種名稱、生長(zhǎng)方式、分布地點(diǎn)和描述等信息,還提供了在全球范圍內(nèi)觀測(cè)和記錄的物種分布信息等,為中國(guó)水生植物研究者提供了基礎(chǔ)資料,是國(guó)內(nèi)比較知名的水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)。

中國(guó)濕地植物博物館建立的中國(guó)濕地植物數(shù)據(jù)庫(kù)(http://zgsdzw.com/),包括保護(hù)植物和入侵植物專題,對(duì)分布在中國(guó)濕地中的植物的種類、數(shù)量、等級(jí)和分布等進(jìn)行了歸納和統(tǒng)計(jì),并對(duì)其生態(tài)習(xí)性、保護(hù)現(xiàn)狀、入侵途徑、文化和應(yīng)用等進(jìn)行了描述。該數(shù)據(jù)庫(kù)為濕地中植物的愛好者以及相關(guān)領(lǐng)域的專業(yè)人士提供了濕地中植物的信息,以供交流和參考。

中國(guó)水生植物物種庫(kù)(http://www.nsii.org.cn/2017/minglu/shuisheng.html)是國(guó)家標(biāo)本資源共享平臺(tái)下的一個(gè)分支數(shù)據(jù)庫(kù),由國(guó)家科技基礎(chǔ)條件平臺(tái)資助,由中國(guó)科學(xué)院植物研究所整合生物多樣性大數(shù)據(jù)平臺(tái)而構(gòu)建。截至2020 年3 月31 日,該數(shù)據(jù)庫(kù)收錄了741 種水生植物,按科、屬進(jìn)行分類,包含了植物名錄、標(biāo)本記錄、照片、描述和補(bǔ)充數(shù)據(jù)的信息等,完善了中國(guó)水生植物物種多樣性的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

中國(guó)科學(xué)院武漢植物園建立了LOTUS-DB(http://lotus-db.wbgcas.cn)數(shù)據(jù)庫(kù),全面提供了蓮的注釋、基因功能和表達(dá)信息。這些信息將方便用戶有效地查詢和瀏覽蓮基因,下載有關(guān)基因組DNA、編碼序列(CDS)、轉(zhuǎn)錄本或肽序列、啟動(dòng)子和標(biāo)記的各種復(fù)雜數(shù)據(jù)信息。該數(shù)據(jù)庫(kù)促進(jìn)了蓮基因克隆、功能鑒定等多方面的研究,同時(shí)推動(dòng)了水生物種和植物進(jìn)化方面的研究[9]。

中國(guó)水稻研究所推出了名為“水稻世界基因組瀏覽器”的在線數(shù)據(jù)庫(kù)——國(guó)家水稻數(shù)據(jù)中心(http://www.ricedata.cn)。該數(shù)據(jù)庫(kù)將全球范圍內(nèi)的水稻基因組測(cè)序數(shù)據(jù)與豐富的水稻基因組注釋信息整合在一起[10],通過(guò)基因組瀏覽器的可視化展示,為廣大研究者提供了全方位的水稻基因組信息,為水稻分子生物學(xué)研究提供了有力的支持[11];促進(jìn)了水稻基因組和基因功能的研究,為水稻育種和農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的發(fā)展做出了重要貢獻(xiàn)。

以上數(shù)據(jù)庫(kù)的建設(shè)和發(fā)展,不僅提高了水生植物(蓮和水稻等)的研究水平和育種效率,也促進(jìn)了水生生物和植物進(jìn)化等領(lǐng)域的研究[12]。

1.2 國(guó)外的水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)

IWGS水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)(https://plants.iwgs.org)是由美國(guó)國(guó)際睡蓮和水園藝協(xié)會(huì)創(chuàng)建的,旨在分享與水生植物相關(guān)的信息、圖片和新聞等。目前,該數(shù)據(jù)庫(kù)已經(jīng)包含了3 000種水生植物的信息,為水生植物的育種專家、種植者和興趣愛好者提供了寶貴的數(shù)據(jù)。

新西蘭的淡水水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)(https://niwa.co.nz/freshwater/our-services/aquaticplants)作為新西蘭國(guó)家科學(xué)中心平臺(tái)下的子數(shù)據(jù)庫(kù),具有淡水植物信息資源調(diào)查、生物多樣性服務(wù)、生物安全服務(wù)和物種鑒定指南等功能,是一個(gè)具有研究?jī)r(jià)值和實(shí)用教育意義的數(shù)據(jù)庫(kù)門戶網(wǎng)站。

水族館植物數(shù)據(jù)庫(kù)(https://en.aqua-fish.net/plants/)是歐洲中部?jī)?nèi)陸國(guó)家的商用數(shù)據(jù)庫(kù)門戶網(wǎng)站。自2005 年以來(lái),記錄了37 科157 種熱帶淡水植物的相關(guān)信息。

德國(guó)的Flowgrow 水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.flowgrow.de/db/aquaticplants)是一個(gè)大型的水生植物群落集合在線數(shù)據(jù)庫(kù),由一群水族館愛好者共同建立和維護(hù),擁有非常全面的水生植物數(shù)據(jù)信息和水景新聞等,提供了大量有關(guān)水族館水生植物主題的信息,數(shù)據(jù)庫(kù)主要包含植物概述、物種鑒定、新型和特種水生植物等部分,為科研人員提技術(shù)支持和服務(wù)設(shè)計(jì)等幫助。

加拿大的淡水水族館植物數(shù)據(jù)庫(kù)(https://infolific.com/pets/freshwater-aquariums/plant-database/)由Infolific團(tuán)隊(duì)創(chuàng)立。2011年以來(lái),該數(shù)據(jù)庫(kù)收集了222種水族館淡水植物信息,為科研人員提供了基礎(chǔ)資料和為水族館文化愛好者提供了科普信息。

1.3 與水生植物相關(guān)的非水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)

在眾多的數(shù)據(jù)庫(kù)中,有一些非水生植物數(shù)據(jù)庫(kù),也可以用于水生植物研究。例如,由德國(guó)綜合生物多樣性研究中心研發(fā)的TRY 數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.try-db.org)是一個(gè)結(jié)合了原始數(shù)據(jù)源的植物生態(tài)類數(shù)據(jù)庫(kù)。自2007 年開始,該數(shù)據(jù)庫(kù)在全球范圍內(nèi)搜集植物功能性狀等各方面的數(shù)據(jù),建立了一個(gè)全球植物性狀網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù),至今已經(jīng)運(yùn)行15 a,并發(fā)展到第三代數(shù)據(jù)庫(kù)。截至2019年,TRY數(shù)據(jù)庫(kù)提供了11 850 781 個(gè)特征記錄、279 875 個(gè)植物類群信息和214篇出版物[13],形成了較為全面的植物性狀信息,成為供水生植物研究人員便捷使用的植物性狀數(shù)據(jù)公共存儲(chǔ)庫(kù),并計(jì)劃在未來(lái)開發(fā)成一個(gè)數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù),用于集成植物不同特征的數(shù)據(jù)[14]。

植物化學(xué)成分?jǐn)?shù)據(jù)庫(kù)(http://www.organchem.csdb.cn/scdb/main/plant_introduce.asp)由中國(guó)科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所建立。該數(shù)據(jù)庫(kù)收錄了十萬(wàn)種植物的化學(xué)成分信息,包括植物分類信息、植物圖片、分離的化學(xué)成分和相關(guān)研究文獻(xiàn)等。用戶可通過(guò)輸入水生植物物種名稱、科和屬描述信息、治療的疾病以及化合物等來(lái)檢索植物信息。

MAPS 數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.mapsdatabase.com)是一個(gè)比較獨(dú)特并將所有信息結(jié)合起來(lái)的植物化學(xué)物質(zhì)和結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù),由巴基斯坦費(fèi)薩拉巴德政府學(xué)院大學(xué)建立。該數(shù)據(jù)庫(kù)包含超過(guò)500 種藥用植物數(shù)據(jù),供研究人員查閱、檢索和下載,為水生植物化學(xué)研究帶來(lái)了很大的便利。

PlantGDB 數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.plantgdb.org/)是純植物組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù),由美國(guó)國(guó)家科學(xué)基金會(huì)創(chuàng)建。2004 年以來(lái),該數(shù)據(jù)庫(kù)已經(jīng)收集了超過(guò)100種植物的序列信息,并定期上傳其他大型平臺(tái)[例如,美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心建立的GenBank核苷酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank)等]的數(shù)據(jù),為水生植物的研究提供全新的和全面的植物序列信息[15]。

這些數(shù)據(jù)庫(kù)都可以用于水生植物研究,并且提供了關(guān)于植物的各種信息,包括生態(tài)學(xué)、化學(xué)成分和基因組學(xué)方面的數(shù)據(jù)。這些數(shù)據(jù)庫(kù)的出現(xiàn)和發(fā)展為水生植物研究提供了便利和支持。

2 水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)在相關(guān)研究領(lǐng)域中的應(yīng)用舉例

2.1 在蓮研究中的應(yīng)用

蓮是蓮科(Nelumbonaceae)、蓮屬(Nelumbo)的多年生草本水生植物。蓮是中國(guó)的重要水生經(jīng)濟(jì)作物[16],具有藥用、食用和觀賞等諸多價(jià)值。在植物分類和系統(tǒng)發(fā)育等方面,對(duì)蓮的研究具有代表意義。合理利用植物數(shù)據(jù)庫(kù),可以促進(jìn)蓮基因克隆、功能鑒定等多方面研究的發(fā)展,還能推動(dòng)水生植物物種進(jìn)化方面的研究[17]。真核生物染色體上的著絲粒由大量經(jīng)過(guò)快速進(jìn)化的DNA 重復(fù)序列組成,對(duì)蓮著絲粒的研究可以提供古老物種的進(jìn)化視角[18]。隨著蓮基因組計(jì)劃的啟動(dòng),對(duì)蓮著絲粒的系統(tǒng)研究將有助于研究蓮的物種基因遺傳學(xué)和分子學(xué)。利用LOTUS-DB數(shù)據(jù)庫(kù)的蓮基因組注釋數(shù)據(jù)庫(kù),對(duì)蓮著絲粒標(biāo)記蛋白NnCenH3(蓮花著絲粒特異性組蛋白H3 變體)進(jìn)行了表征;利用染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP)技術(shù),恢復(fù)了蓮的NnCenH3核小體相關(guān)序列,描述了古老物種蓮的特殊著絲粒輪廓[19],蓮著絲粒的性質(zhì)與其他開花植物有明顯差異,這為蓮著絲粒的進(jìn)化機(jī)制提供了重要線索,促進(jìn)了蓮基因克隆和功能鑒定等方面的研究,為蓮的遺傳育種提供了技術(shù)支撐。

2.2 在水稻研究中的應(yīng)用

中國(guó)是水稻種植大國(guó),水稻研究一直是中國(guó)水生植物研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)問(wèn)題。為了研究和整合水稻表型組學(xué)的相關(guān)知識(shí),建立了水稻表型組學(xué)的知識(shí)圖譜。利用國(guó)家水稻數(shù)據(jù)中心數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.ricedata.cn)提供的水稻表型組學(xué)的相關(guān)數(shù)據(jù)集,進(jìn)行了水稻表型組學(xué)實(shí)體研究[20]。

在水稻的雜交和選育等研究領(lǐng)域中,國(guó)家水稻數(shù)據(jù)中心數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.ricedata.cn)也得到了廣泛應(yīng)用。通過(guò)對(duì)國(guó)家水稻數(shù)據(jù)中心公布的48個(gè)宜香優(yōu)雜交水稻品種的米質(zhì)進(jìn)行分析,四川省宜賓市農(nóng)業(yè)科學(xué)院的有關(guān)科研人員發(fā)現(xiàn),該品種米質(zhì)除了受自身的遺傳因素影響外,環(huán)境條件對(duì)米質(zhì)也有很大影響,同一品種的米質(zhì)在不同省份有很大差異[21];他們還利用國(guó)家水稻數(shù)據(jù)中心提供的兩系不育系和兩系品種審定數(shù)據(jù)等信息,將四川省和湖南省兩個(gè)育種大省的兩系雜交稻審定情況進(jìn)行了對(duì)比,在育種方向上進(jìn)行了研究[22]。此外,還有多個(gè)研究機(jī)構(gòu)運(yùn)用國(guó)家水稻中心數(shù)據(jù)庫(kù)提供的數(shù)據(jù)信息來(lái)進(jìn)行蛋白質(zhì)和基因定位等方面的研究。國(guó)家水稻中心數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建,為中國(guó)水稻行業(yè)做出了巨大的貢獻(xiàn)。

2.3 在其他植物研究中的應(yīng)用

南荻(Miscanthus lutarioriparius)是禾本科(Poaceae)、芒屬(Miscanthus)的多年生草本植物,南荻是中國(guó)特有的濕生物種。利用數(shù)據(jù)庫(kù)和數(shù)據(jù)庫(kù)中的工具,對(duì)南荻的種質(zhì)資源遺傳多樣性進(jìn)行研究,有利于滿足其多樣性的育種要求[23]。通過(guò)查閱數(shù)據(jù)庫(kù)資料和實(shí)地考察,采用相關(guān)分析和通徑分析方法,對(duì)長(zhǎng)江中下游的高大型南荻的農(nóng)藝性狀和物候期進(jìn)行了鑒定與劃分;利用SLAF-seq簡(jiǎn)化基因組測(cè)序,再利用SSR 分子標(biāo)記技術(shù),依據(jù)GenBank 數(shù)據(jù)庫(kù)(www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank)已經(jīng)公布的核酸序列,檢測(cè)南荻種群中的等位變異和考察其種質(zhì)資源遺傳多樣性[24]。

木 賊 (Equisetum hyemale) 是 木 賊 科(Equisetaceae)、木賊屬(Equisetum)多年生常綠草本植物。木賊是一種重要的中藥材。為了能夠篩選出可以鑒定木賊屬的核心DNA 條形碼,首先,選用木賊屬的5 種物種共14 個(gè)樣品,從GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中下載了24條matK序列、13條psbA-trnH序列和84 條rbcL 序列,利用生物信息學(xué)軟件Muscle,進(jìn)行序列比對(duì);然后,利用PAUP 4.0軟件,計(jì)算遺傳距離;最后,采用聚類分析方法,利用MEGA 6.0軟件,系統(tǒng)分析數(shù)據(jù),結(jié)果顯示,在幾種組候選序列中,大亞基基因rbcL 在區(qū)分木賊屬的不同物種方面具有高效性和準(zhǔn)確性[25]。

3 水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)存在的問(wèn)題

3.1 數(shù)據(jù)庫(kù)更新不及時(shí)

與GenBank 和DDBJ 等大型數(shù)據(jù)庫(kù)相比,一些水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)的更新速度較慢[26]。例如,中國(guó)水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)是目前比較完整的收錄中國(guó)水生植物信息的數(shù)據(jù)庫(kù),雖然其有90 科739 種水生植物的基礎(chǔ)信息,但是在近幾年其數(shù)據(jù)的更新信息不多。中國(guó)水生植物物種庫(kù)的數(shù)據(jù)涉及741 種植物,截至2022年3月,新數(shù)據(jù)尚未上傳到網(wǎng)絡(luò)公共平臺(tái)上。一些大型的水生植物數(shù)據(jù)庫(kù),例如,Aquatic Plant Information Retrieval System (APIRS)和Aquatic Plant Database(APD)等,都存在數(shù)據(jù)更新不及時(shí)的現(xiàn)象。這種現(xiàn)象可能是因?yàn)榧夹g(shù)人員和研究人員側(cè)重的領(lǐng)域不同而形成的數(shù)據(jù)壁壘所致[27],導(dǎo)致獲取到的數(shù)據(jù)未能得到及時(shí)處理和上傳,從而影響數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)的更新速度。

3.2 數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)容缺乏特色

中國(guó)現(xiàn)有的水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)多數(shù)應(yīng)用于基礎(chǔ)研究。例如,中國(guó)水生植物物種庫(kù)提供植物用途、形態(tài)描述和瀕危物種保護(hù)情況等方面的信息;中國(guó)水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)也是如此,所提供的內(nèi)容是水生植物的屬和物種名稱、物種生長(zhǎng)方式、分布地點(diǎn)、物種描述等信息。而國(guó)外的水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)更偏向于商業(yè)用途,例如,新西蘭的淡水水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)旨在提供淡水植物的技術(shù)服務(wù)和解決方案;加拿大的淡水水族館植物數(shù)據(jù)庫(kù)為水生植物和水族館文化愛好者提供服務(wù)和科普信息。

縱觀全局,國(guó)內(nèi)外水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)在內(nèi)容上有一定的地域相似性,缺乏獨(dú)特的數(shù)據(jù)庫(kù)特色,所開發(fā)的數(shù)據(jù)庫(kù)只針對(duì)某一類研究或者服務(wù)[28]。

3.3 數(shù)據(jù)庫(kù)穩(wěn)定性差

在訪問(wèn)了前文中所提到的諸多數(shù)據(jù)庫(kù)后發(fā)現(xiàn),中國(guó)水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)和中國(guó)濕地植物數(shù)據(jù)庫(kù)存在無(wú)法正常訪問(wèn)的情況,同時(shí)還出現(xiàn)了數(shù)據(jù)庫(kù)頁(yè)面加載不流暢的問(wèn)題,無(wú)法正常訪問(wèn)LOTUS-DB數(shù)據(jù)庫(kù)中論文標(biāo)注的網(wǎng)址。一些國(guó)外的數(shù)據(jù)庫(kù)會(huì)因?yàn)榫W(wǎng)絡(luò)、域名和加載時(shí)間過(guò)長(zhǎng)等問(wèn)題無(wú)法進(jìn)行訪問(wèn)[29]。

4 討 論

在植物學(xué)、生態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)等不斷發(fā)展的基礎(chǔ)上,水生植物研究的內(nèi)容從簡(jiǎn)單的分類研究、屬性研究到生物化學(xué)研究等[30]。各種研究和實(shí)驗(yàn)積累了大量的水生植物數(shù)據(jù)信息。傳統(tǒng)的以書籍存儲(chǔ)數(shù)據(jù)的方式,在一定時(shí)間內(nèi)保證了數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)和數(shù)據(jù)的小范圍傳播,但是隨著各種先進(jìn)技術(shù)和專業(yè)設(shè)備的產(chǎn)生,水生植物數(shù)據(jù)呈爆發(fā)式海量增長(zhǎng),傳統(tǒng)的存儲(chǔ)方式已經(jīng)滿足不了水生植物研究的數(shù)據(jù)積累[31]。水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)的出現(xiàn)推進(jìn)了水生植物研究的發(fā)展,使得海量的水生植物數(shù)據(jù)被存儲(chǔ)和共享。

水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)展至今,國(guó)內(nèi)外都創(chuàng)建了很多水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)。例如,國(guó)外的Aquatic Plant Information Retrieval System (APIRS)、Aquatic Plant Database (APD)、European Native Aquatic Plant Database (ENAPD)、New Zealand Freshwater Plant Database等水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)和國(guó)內(nèi)的中國(guó)水生植物物種庫(kù)、中國(guó)水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)等。這些數(shù)據(jù)庫(kù)涵蓋了世界范圍內(nèi)水生植物的多樣性、分類、地理分布和生態(tài)特征等方面的信息,為研究人員提供了所需的數(shù)據(jù)資源[32-33]。相比之下,中國(guó)水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)的發(fā)展相對(duì)緩慢,尤其缺乏植物化學(xué)、遺傳學(xué)和生理生態(tài)學(xué)等方面的數(shù)據(jù)[34]。

5 展 望

建設(shè)和完善中國(guó)水生植物數(shù)據(jù)庫(kù)仍是一個(gè)有待解決的問(wèn)題。首先,需要建立完善的數(shù)據(jù)更新機(jī)制和人員管理制度,以確保及時(shí)更新數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù);其次,可以通過(guò)增加數(shù)據(jù)庫(kù)的特色內(nèi)容,例如,交互式地圖展示和生態(tài)系統(tǒng)模擬等,提高數(shù)據(jù)庫(kù)的應(yīng)用價(jià)值和增加用戶體驗(yàn)項(xiàng)目;最后,加強(qiáng)數(shù)據(jù)庫(kù)的系統(tǒng)維護(hù)和及時(shí)修復(fù),保障數(shù)據(jù)安全,確保數(shù)據(jù)庫(kù)的穩(wěn)定性和持續(xù)可用性。

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