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影像組學(xué)在肝細胞癌圖像分割、鑒別診斷和預(yù)后評估中的應(yīng)用進展

2023-11-15 07:28李寅喬張娟賈寧陽
山東醫(yī)藥 2023年28期
關(guān)鍵詞:組學(xué)肝細胞肝臟

李寅喬,張娟,賈寧陽

1 上海理工大學(xué)健康科學(xué)與工程學(xué)院,上海200093;2 海軍軍醫(yī)大學(xué)第三附屬醫(yī)院放射科

肝細胞癌(HCC)是原發(fā)性肝癌中發(fā)病率最高的惡性腫瘤,是全球癌癥相關(guān)死亡的第四大病因[1-2]。在過去的幾十年中,超聲波、電子計算機斷層掃描(CT)、磁共振成像(MRI)、正電子發(fā)射計算機型計算機斷層成像(PET)等醫(yī)學(xué)影像技術(shù)對肝細胞癌的早期篩查、診斷和治療反應(yīng)評估起到了重要的作用[3]。根據(jù)肝臟影像報告和數(shù)據(jù)系統(tǒng)(LI-RADS),典型的HCC的特征包括血供過多和獨特的洗脫方式,即在增強CT或MRI中“快進快出”的成像方式[4]。但LIRADS標(biāo)準(zhǔn)識別HCC的靈敏度僅為86%,特異性為85%。通過影像圖像得到的診斷和治療反應(yīng)結(jié)果受多種因素的影響,僅憑醫(yī)生視覺來精準(zhǔn)識別和分析肝臟醫(yī)學(xué)影像圖像中的信息并不太容易。人工智能可以自動識別復(fù)雜的圖像信息,并可以對圖像信息進行定量評估;可以幫助醫(yī)生更準(zhǔn)確地進行影像學(xué)診斷,大大減輕醫(yī)生的工作量。影像組學(xué)是醫(yī)學(xué)影像領(lǐng)域中常用的方法,包括傳統(tǒng)的機器學(xué)習(xí)算法和深度學(xué)習(xí)算法。影像組學(xué)通過計算機的算法可以對醫(yī)學(xué)圖像進一步深度挖掘。首先對影像檢查圖像進行分割,從勾畫的感興趣區(qū)域中提取高通量特征,將有意義的或與任務(wù)相關(guān)的特征通過計算機程序量化后再進一步分析和建立模型。這些特征可以更好地從多維度、深層次描述病灶的生物信息,如病灶大小、密度、形狀、紋理特征等[5]。傳統(tǒng)機器學(xué)習(xí)算法模型主要有支持向量機(SVM)、決策樹、隨機森林、貝葉斯算法、K-近鄰(K-NN)等,深度學(xué)習(xí)算法模型主要有神經(jīng)卷積網(wǎng)絡(luò)、殘差網(wǎng)絡(luò)、級聯(lián)網(wǎng)絡(luò)等?,F(xiàn)就影像組學(xué)在肝細胞癌圖像分割、鑒別診斷和預(yù)后方面的研究進展總結(jié)如下。

1 影像組學(xué)在肝細胞癌圖像分割中的應(yīng)用

分割任務(wù)是將感興趣區(qū)的器官或結(jié)構(gòu)在圖像中標(biāo)識出來。目前,雖然專家手動分割仍被認(rèn)為是判定器官或結(jié)構(gòu)有無異常的金標(biāo)準(zhǔn),但這一任務(wù)非常耗時,而且對閱片人員的專業(yè)水平和應(yīng)用軟件技能沒有統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn),從而導(dǎo)致判定的正確性存在局限。人工智能全自動分割則優(yōu)越性明顯,先進的計算機技術(shù)可以減少人為誤差,提高診斷效率和檢測方法的標(biāo)準(zhǔn)化水平。在最近的研究中,影像組學(xué)通過計算機算法對醫(yī)學(xué)圖像的處理更偏向于深度學(xué)習(xí),尤其是神經(jīng)卷積網(wǎng)絡(luò)在解決計算機視覺任務(wù)時優(yōu)于以前的傳統(tǒng)方法[6]。

1.1 影像組學(xué)與肝細胞癌CT圖像分割 目前,自動分割技術(shù)已廣泛應(yīng)用于肝細胞癌CT圖像。OUHMICH等[7]使用基于U-Net架構(gòu)的級聯(lián)神經(jīng)卷積網(wǎng)絡(luò)對健康和癌變的肝組織進行分割,以區(qū)分正常的肝實質(zhì)組織、活動性肝癌和壞死的腫瘤組織。內(nèi)部數(shù)據(jù)庫驗證顯示,同時處理所有任務(wù)多個級聯(lián)網(wǎng)絡(luò)比單個網(wǎng)絡(luò)具有更高的預(yù)測精度。通過CT門靜脈期圖像僅可以區(qū)分正常組織和腫瘤組織,多期圖像結(jié)合可以進一步區(qū)分活動性和壞死的腫瘤組織,多期圖像結(jié)合的級聯(lián)網(wǎng)絡(luò)分割肝實質(zhì)、壞死組織和腫瘤組織的Dice系數(shù)分別為90.5% 、75.8% 和59.6%。同時,WARDHAN等[8]利用神經(jīng)卷積網(wǎng)絡(luò),在偽三維模型內(nèi)進行評估,通過調(diào)整參數(shù)配置(如圖像疊層數(shù)、圖像對比度、網(wǎng)絡(luò)層數(shù))來提高神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在肝臟和腫瘤自動分割中的性能。

1.2 影像組學(xué)與肝細胞癌MRI圖像分割 目前,大多數(shù)肝臟自動分割集中在CT圖像。近年來,HANSCH等[9]提出采用3D U-Net架構(gòu)網(wǎng)絡(luò)在增強MRI圖像上進行自動分割訓(xùn)練,顯示對于病灶的檢出,動態(tài)增強MRI比動態(tài)增強CT具有更高的靈敏度。與2D架構(gòu)相比,3D架構(gòu)提高了分割性能,3D、2D平均Dice系數(shù)分別為70%、65%。此項研究表明,基于增強MRI深度學(xué)習(xí)模型正確檢測到的肝臟病變可以被自動分割,且準(zhǔn)確率較高。

2 影像組學(xué)在肝細胞癌鑒別診斷中的應(yīng)用

HCC的主要影像學(xué)表現(xiàn)為“快進快出”,即在增強CT或MRI掃描中動脈期明顯強化且靜脈期或者延遲期的密度或信號明顯下降。對于血供較多良性腫瘤的診斷還需進一步與惡性病變相鑒別,但最終還是以病理活檢診斷為金標(biāo)準(zhǔn)。病理活檢不但存在有創(chuàng)性的缺點,也易造成癌細胞擴散的危險,因此基于影像組學(xué)的計算機輔助診斷越來越受臨床醫(yī)生的關(guān)注。

2.1 影像組學(xué)基于超聲圖像的HCC鑒別診斷 超聲檢查是肝臟病變篩查的首選方法,檢測快速且價格相對便宜。BHARTI等[10]提出了一種基于CNN的集成學(xué)習(xí)模型,將一組精選的紋理特征(包括肝臟表面回聲紋理和高階特征灰度差異矩陣、灰度共生矩陣)作為輸入層,通過集成分類學(xué)習(xí)模型辨別四種類型的肝臟超聲圖像,即正常肝臟、慢性肝病、肝硬化和HCC。此集成分類學(xué)習(xí)模型是集合了K-NN 、SVM和隨機森林等機器學(xué)習(xí)模型,其診斷準(zhǔn)確率達到96.6%,優(yōu)于任意單一的分類模型。

2.2 影像組學(xué)基于CT圖像的HCC鑒別診斷 相比超聲檢查,CT檢查可進一步明確肝臟結(jié)節(jié)病變。YASAKA等[11]回顧性研究了肝臟腫塊CT平掃期、動脈期、延遲期共3個時期的圖像,基于神經(jīng)卷積網(wǎng)絡(luò)模型(由6個卷積層、3個最大池化層和3個完全連接的層組成)將肝臟腫塊分為5類。即A類:典型肝細胞癌;B類:典型肝細胞癌以外的惡性腫瘤;C類:不確定性腫塊;D類:血管瘤;E類:囊腫。使用55 536個圖像進行訓(xùn)練,區(qū)分類別A~B和C~E的受試者工作特征曲線下面積的中位數(shù)為0.92,對肝臟腫塊鑒別診斷的中位準(zhǔn)確率為84%,其準(zhǔn)確率優(yōu)于同期兩位放射醫(yī)師的診斷(72.2%和65.6%)。NAYAK等[12]設(shè)計了一個計算機輔助診斷系統(tǒng),基于肝臟三維半自動分割方法采用多時期CT圖像建立了SVM模型辨別診斷肝硬化和肝細胞癌,其準(zhǔn)確率分別為86%和81%。隨后,MOKRANE等[13]研究了一種深度學(xué)習(xí)模型,辨別肝結(jié)節(jié)是否為肝細胞癌以及對比增強對特征提取的影響。該研究回顧性分析了178例肝硬化和肝結(jié)節(jié)患者,經(jīng)病理活檢證實77%為肝細胞癌。在三期增強CT中每一期勾畫結(jié)節(jié)并提取了12組定量影像學(xué)特征,構(gòu)建了多種學(xué)習(xí)模型(SVM、K-NN、隨機森林),每個特征包括單期掃描的特征或雙期掃描之間圖像的變化,將肝結(jié)節(jié)分類為肝癌型或非肝癌型。最終模型的曲線下面積為0.66、敏感性為0.70、特異性為0.54,且特征提取不受對比度增強的影響。

2.3 影像組學(xué)基于MRI圖像的HCC鑒別診斷 與CT相比,MRI可以更全面評估肝臟病變并提高鑒別檢出率。HAMM等[14]將神經(jīng)卷積網(wǎng)絡(luò)與MRI圖像結(jié)合設(shè)計了由3個卷積層、2個最大池層和2個完全連接層組成的神經(jīng)卷積網(wǎng)絡(luò)模型辨別肝細胞癌病灶,并與2位經(jīng)過委員會認(rèn)證的放射科醫(yī)師辨別病灶的準(zhǔn)確性進行比較。結(jié)果顯示,模型的準(zhǔn)確率為92%、敏感性為92%、特異性為98%;2位放射科醫(yī)生辨別病灶的平均準(zhǔn)確率82.5%,敏感性為82.5%、特異性為96.5%?;谄綊?、增強的MRI圖像和臨床數(shù)據(jù)開發(fā)了一種神經(jīng)卷積網(wǎng)絡(luò),其分辨惡性腫瘤能力能夠達到與三位有經(jīng)驗的放射科醫(yī)師相當(dāng)?shù)乃?。與單獨的影像特征相比,臨床數(shù)據(jù)和危險因素的納入,大大提高了肝癌、轉(zhuǎn)移性腫瘤和其他原發(fā)性惡性腫瘤診斷及分類的總體準(zhǔn)確性。

3 影像組學(xué)在肝細胞癌預(yù)后評估中的應(yīng)用

手術(shù)切除、肝臟移植治療和射頻消融被認(rèn)為是治療早期肝癌的有效方法。手術(shù)切除是單發(fā)腫瘤患者保留肝功能的黃金標(biāo)準(zhǔn),肝臟移植是針對功能較差的早期肝癌患者的最佳選擇[15]。采用某種手段治療肝細胞癌前準(zhǔn)確預(yù)測患者臨床療效及其預(yù)后十分重要,這樣可以減少對患者的傷害、避免不必要的干預(yù),同時對選擇最佳治療方案和降低醫(yī)療費用也大有裨益。

3.1 影像組學(xué)對手術(shù)切除HCC患者的預(yù)后評估 在眾多治療方案中,手術(shù)切除術(shù)仍是HCC的首選治療方案。一項多中心研究基于CT圖像分析,建立影像組學(xué)模型來預(yù)測肝癌切除的術(shù)后復(fù)發(fā)率。從病灶及其周圍組織選擇和提取訓(xùn)練特征,設(shè)計了兩種基于機器學(xué)習(xí)算法的影像組學(xué)模型。第1種是術(shù)前模型,基于影像組學(xué)特征和手術(shù)前可用的參數(shù)(如血清AFP、白蛋白水平、膽紅素分級、肝硬化程度),第2種是術(shù)后模型,包括術(shù)前模型中的數(shù)據(jù)和病理結(jié)果(如合并衛(wèi)星結(jié)節(jié))。與其他非影像組學(xué)的腫瘤模型和當(dāng)前廣泛使用的分期系統(tǒng)相比,兩種模型均顯示出更高的預(yù)后預(yù)測性能。此外,這些模型還提供了3個不同復(fù)發(fā)風(fēng)險模式以及復(fù)發(fā)風(fēng)險因素,可能影響手術(shù)策略和藥物療法的使用。ZHANG等[16]基于術(shù)前增強MRI圖像,使用肝膽特異性對比劑建立MRI影像組學(xué)模型以預(yù)測手術(shù)切除HCC患者的總生存率。對腫瘤及其周圍組織和非腫瘤實質(zhì)進行定量分析,獲得了3個不同感興趣區(qū)域(腫瘤、病灶周圍和非腫瘤實質(zhì))的3個影像組學(xué)評分;將3個不同感興趣區(qū)域影像組學(xué)評分與臨床、影像學(xué)預(yù)測因子結(jié)合,其綜合評分C指數(shù)為0.84,為手術(shù)治療預(yù)后判定提供了性能最佳的最終模型。

3.2 影像組學(xué)對經(jīng)導(dǎo)管動脈栓塞化療術(shù)(TACE)治療HCC患者的預(yù)后評估 TACE為中期HCC不可切除腫瘤患者的治療方法之一,然而局部HCC對該治療方法的反應(yīng)是多變的,不必要的TACE程序可能導(dǎo)致不良反應(yīng)發(fā)生,因此預(yù)測TACE術(shù)后反應(yīng)對制定治療方案是非常有幫助的。PENG等[17]使用來自三個不同中心的總計789例患者的CT圖像訓(xùn)練殘差卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ResNet50)來預(yù)測TACE術(shù)后的反應(yīng)。該模型對于完全緩解、部分緩解、疾病穩(wěn)定和疾病進展預(yù)測的ROC曲線下面積分別為0.97、0.96、0.95和0.96,在驗證集中也表現(xiàn)出較高的性能。在另一項研究(TACE前腫瘤信號強度)中,基線MRI和臨床特征的組合用于訓(xùn)練兩個機器學(xué)習(xí)模型(邏輯回歸和隨機森林),以將患者分類為TACE應(yīng)答者或無應(yīng)答者,最佳總體準(zhǔn)確度為78%(靈敏度為62.5%,特異度為82.1%,陽性預(yù)測值為50%,陰性預(yù)測值為88.5%)。影像組學(xué)模型不僅可以預(yù)測治療后的反應(yīng),還可以預(yù)測治療后的生存期,幫助臨床醫(yī)生選擇最優(yōu)治療方案。PARK等[18]收集750例接受TACE治療的單個小HCC患者術(shù)前CT/MRI圖像,結(jié)合3個影像組學(xué)特征(腫瘤邊緣、腫瘤位置、增強模式)和2個臨床變量(年齡、血清白蛋白水平)建立預(yù)測模型,回顧性研究接受TACE治療的孤立小HCC患者的生存情況。結(jié)果顯示,該模型預(yù)測為低風(fēng)險、中風(fēng)險和高風(fēng)險組在驗證集中的中位總生存期分別為 137.5個月、76.1個月和 44.0個月,驗證集的總生存期、局部腫瘤無進展生存期和無進展生存期預(yù)測模型的時間依賴性ROC曲線顯示了可以接受的曲線下面積。

3.3 影像組學(xué)對射頻消融治療HCC患者的預(yù)后評估 射頻消融術(shù)是小肝癌(直徑<3 cm)常用的治療方法,是在超聲或CT等引導(dǎo)下,使高頻針刺入肝臟腫瘤,其具有創(chuàng)口小、并發(fā)癥少、操作簡單、費用低等優(yōu)勢。有學(xué)者回顧性研究了132例接受射頻消融的HCC患者,選取20個影像特征和4個臨床特征分別建立影像組學(xué)模型、臨床模型和聯(lián)合模型,基于增強MRI圖像建立影像組學(xué)模型預(yù)測HCC患者射頻消融術(shù)后的復(fù)發(fā)情況,結(jié)果顯示聯(lián)合模型效果最優(yōu)。通過提取治療前MRI圖像的紋理特征,從動脈期和平衡期提取107個一階特征和二階特征,可預(yù)測HCC患者對射頻消融治療的反應(yīng)。顯示依賴性不均一化和依賴方差辨別性能最高,且該研究有助于識別對射頻消融治療有完全緩解的HCC患者。

3.4 影像組學(xué)對放射治療HCC患者的預(yù)后評估 放射治療是利用同位素α、β、γ射線和各類X射線治療機或加速器產(chǎn)生的放射線治療腫瘤的一種方法。立體定向體外放射治療是一種新興的治療方式,對HCC具有良好的效果[19]。有學(xué)者回顧性收集137例非遠處轉(zhuǎn)移性巴塞羅那臨床肝癌C期患者,從治療前CT圖像選取7個重要影像組學(xué)特征構(gòu)建影像組學(xué)模型,建立了基于CT圖像的影像組學(xué)模型來預(yù)測接受立體定向體外放射治療的HCC患者總生存期。結(jié)果顯示臨床特征和影像組學(xué)特征相結(jié)合的聯(lián)合模型優(yōu)于任何一個單一模型,治療后6、12 和 18 個月的生存預(yù)測ROC曲線下面積分別為0.76、0.79、0.84。

3.5 影像組學(xué)對靶向和免疫治療HCC患者的預(yù)后評估 由于肝癌前期癥狀隱匿,大多數(shù)患者首次確診為晚期,易出現(xiàn)其他組織轉(zhuǎn)移現(xiàn)象,不能依靠肝臟移植、肝臟切除術(shù)、TACE術(shù)等治療方法,靶向治療和免疫治療已成為研究熱點。靶向治療時直接抑制腫瘤細胞的增值和新生血管的生長,其中索拉非尼、倫伐替尼、多納非尼已獲批應(yīng)用于臨床治療。除此之外,腫瘤的免疫逃逸也是HCC發(fā)生、發(fā)展的另一個重要因素。免疫治療則是激活免疫系統(tǒng),利用免疫檢查點抑制劑治療晚期HCC,如納武利尤單抗、卡瑞利珠單抗、帕博利珠單抗。LIAO等[20]基于增強CT圖像的影像組學(xué)模型預(yù)測磷脂酰肌醇3激酶信號通路的體細胞突變,此信號是調(diào)節(jié)HCC侵襲性的關(guān)鍵因素之一,且基因組改變與索拉非尼反應(yīng)相關(guān)。該研究納入132例HCC患者采用二代測序技術(shù)分析基因突變類型及信號通路的改變,還從瘤內(nèi)及瘤周提取影像組學(xué)特征進行分析。結(jié)果表明基于CT的影像組學(xué)模型可以描述HCC中磷脂酰肌醇3激酶信號通路的改變,并有助于確定是否應(yīng)用索拉非尼治療。除此之外,WANG等[21]應(yīng)用MRI圖像的T1WI、T2WI、DWI、動脈期、靜脈期、延遲期和肝膽期建立細胞角蛋白19表達的預(yù)測模型,分析227例HCC患者的術(shù)前多序列MRI圖像,從中提取647個影像組學(xué)特征,最終動脈期和肝膽期結(jié)合效果最佳,訓(xùn)練集和測試集的ROC曲線下面積分別為0.951和0.822,顯示影像組學(xué)模型對HCC腫瘤區(qū)域角蛋白19表達具有良好的預(yù)測能力。

近年來,人工智能和影像組學(xué)在肝細胞癌顯像中的應(yīng)用呈現(xiàn)指數(shù)增長,但在臨床應(yīng)用還有一些限制,例如圖像采集參數(shù)、分段方法、研究的可重復(fù)性和可比性均缺乏統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)。此外,這一領(lǐng)域的大多數(shù)研究都是回顧性設(shè)計,導(dǎo)致了患者群體中有潛在的選擇偏差。但是,人工智能尤其是深度學(xué)習(xí)在肝臟成像任務(wù)中還是極有前途的輔助手段,在最初的檢測和評估肝臟病變、臨床治療和預(yù)測肝臟治療反應(yīng)方面潛力巨大,人工智能輔助醫(yī)療服務(wù)將是未來醫(yī)療發(fā)展的大趨勢。

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