蘇柏茵,楊翠鳳,陸燕雯,冼思蔓,梁 忠,藍(lán) 丹
(百色學(xué)院農(nóng)業(yè)與食品工程學(xué)院,廣西百色 533000)
藥用植物是一類(lèi)具有入藥用途的植物,在根系存在著植物和微生物之間的相互作用,它們的相互作用可改善土壤環(huán)境,從而成為有利于植物生長(zhǎng)的資源。植物與這些微生物關(guān)系密切,在長(zhǎng)時(shí)間的自然演變中雙方形成了互惠共生體系[1]。大量研究表明,根際微生物無(wú)論在種類(lèi)還是數(shù)量上都具有多樣性的特征,且遠(yuǎn)多于根際外土壤的微生物[2]。另外,一些研究表明,藥用植物的根際中微生物較多,尤其是活性放線菌[3],綜合藥用植物的功效,其根際被推測(cè)可能擁有更多的生防菌株[4]。
放線菌(Actinomycetes)是原核微生物,革蘭氏染色呈陽(yáng)性,在培養(yǎng)基上菌落呈放射狀,故得名放線菌,以孢子繁殖,其菌絲呈分支狀,分類(lèi)有氣生菌絲和基內(nèi)菌絲,在土壤中廣泛分布,主要分類(lèi)有鏈霉菌屬、小單孢菌屬、小雙孢菌屬、馬杜拉菌屬等,土壤中90%以上屬于鏈霉菌屬。放線菌是具有潛力的微生物資源,其價(jià)值主要來(lái)自其次級(jí)代謝產(chǎn)物,可應(yīng)用于抗生素、維生素、酶制劑等,應(yīng)用的抗生素大約70%由放線菌產(chǎn)生,如鏈霉素、卡那霉素、慶大霉素等,與人類(lèi)日常的生活與生產(chǎn)關(guān)系密切[5]。在一些極端環(huán)境下,如干旱、潮濕、鹽堿地、重金屬污染、輻射污染區(qū)、地?zé)岬貐^(qū)等,發(fā)現(xiàn)新型放線菌已成為研究的一大熱點(diǎn)[6]。
土壤中含有大量放線菌,是放線菌的主要來(lái)源。以分離技術(shù)來(lái)說(shuō),人們分離出的放線菌僅占自然界放線菌總量的10%~20%。因此,土壤放線菌資源的新菌種分離也是重要的研究方向。本試驗(yàn)采用金銀花(Lonicera japonicaThunb.)根際土壤作為試驗(yàn)材料,對(duì)其中的放線菌資源進(jìn)行分離,并對(duì)分離出的放線菌進(jìn)行抗菌活性篩選。
土壤樣品采自金銀花根際土壤,金銀花高35~40 cm,整株植株健康,無(wú)明顯病害,樣品取自金銀花根部5~15 cm 耕作層土壤,樣品裝于一次性無(wú)菌袋中,帶回實(shí)驗(yàn)室放于置物架上風(fēng)干。
高氏一號(hào)培養(yǎng)基:磷酸氫二鉀0.5 g,七水硫酸鐵0.01 g,硝酸鉀1 g,七水硫酸鎂0.5 g,氯化鈉5 g,瓊脂20 g,可溶淀粉20 g,無(wú)菌水1 000 mL,pH 調(diào)至7.2~7.4。LB 培養(yǎng)基:LB 肉湯25 g、無(wú)菌水1 000 mL、瓊脂15~20 g。培養(yǎng)基配制好后立即高溫高壓滅菌(121 ℃,20 min),放置備用。
抑菌活性測(cè)試菌株:金黃色葡萄球菌、大腸桿菌和枯草芽孢桿菌。
1.2.1 金銀花根際土壤樣品預(yù)處理 采集的土壤在室溫下風(fēng)干6 d,然后取出5 g土壤樣品放入盛有45 mL無(wú)菌水的三角瓶?jī)?nèi),置入搖床(設(shè)定180 r/min,30 min)混勻,使土壤充分懸浮[7]。用移液槍取1 mL上清液,加入9 mL 無(wú)菌水中,依次按10-1、10-2、10-3、10-4、10-5倍梯度稀釋。本次試驗(yàn)取10-3、10-4、10-5的樣品溶液涂布于高氏一號(hào)培養(yǎng)基。
1.2.2 菌株分離與純化 將涂布土壤稀釋液的平板置于28 ℃恒溫箱,培養(yǎng)5~7 d 后觀察菌落生長(zhǎng)情況和菌落特征,挑選肉眼可辨別的放線菌接種于高氏一號(hào)培養(yǎng)基純化培養(yǎng)。
1.2.3 抑菌活性研究 放線菌發(fā)酵液制備:從培養(yǎng)好的已純化放線菌培養(yǎng)基中挑取菌絲,置于高氏一號(hào)液體培養(yǎng)基中進(jìn)行搖床培養(yǎng),搖床設(shè)定28 ℃,180 r/min 轉(zhuǎn)速,培養(yǎng)5 d。
細(xì)菌種子液制備:采用平板劃線法,在LB 培養(yǎng)基上37 ℃培養(yǎng)24 h,之后用接種環(huán)將細(xì)菌接種于LB液體培養(yǎng)基的試管,搖床培養(yǎng)2 h,設(shè)定溫度37 ℃,180 r/min 轉(zhuǎn)速。
待測(cè)細(xì)菌平板處理:分別從上述制備的種子液中吸取100 μL 金黃色葡萄球菌、大腸桿菌和枯草芽孢桿菌置于平板上,均勻涂布至微干。
放線菌抑菌特性研究采用濾紙片法[8]:用無(wú)菌鑷子將濾紙片(直徑6 mm,厚度0.7 mm)浸入放線菌發(fā)酵液中,取出并在瓶?jī)?nèi)壁除去多余的液體,將紙片放到接好靶標(biāo)菌的平板上,每個(gè)處理3 次重復(fù),以無(wú)菌水代替發(fā)酵液浸泡濾紙片作為對(duì)照,28 ℃培養(yǎng)48~72 h。
1.2.4 拮抗菌16S rDNA 的鑒定 鑒定使用Biospin細(xì)菌基因組DNA 提取試劑盒提取篩選出的拮抗菌DNA,以 通 用 引 物27F(5′-AGAGTTTGATCCTGG CTCA-3′)和1492R(5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′)擴(kuò)增拮抗菌株16S rDNA 序列。
PCR 反 應(yīng) 體 系 為40 μL,包 括2×Phanta Max Master Mix 20 μL,10 μmol/L上游引物1 μL,10 μmol/L下 游 引 物1 μL,DNA 模 板1 μL,ddH2O 補(bǔ) 足 至40 μL。PCR 擴(kuò)增在Biometra Easy Cycler Gradient 中進(jìn)行,程序?yàn)?5 ℃預(yù)變性3 min;95 ℃完成變性15 s,56 ℃復(fù)性15 s,72 ℃延伸30 s,共35 個(gè)循環(huán);最后72 ℃延伸5 min。PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物委托擎科生物科技有限公司進(jìn)行測(cè)序,最后將測(cè)序結(jié)果在NCBI 網(wǎng)站進(jìn)行BLAST-N 比對(duì),然后利用MEGA5.05 軟件構(gòu)建NJ系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。
從金銀花根際土壤分離獲得的7 株放線菌菌落多為白色(1 株為粉色,1 株為灰色),圓形,表面干燥,不光滑,呈干粉樣,凸起或扁平,部分有可溶性色素產(chǎn)出,如圖1 所示。
圖2 為濾紙片法篩選抑菌活性菌株的結(jié)果。經(jīng)篩選,4 號(hào)和7 號(hào)放線菌對(duì)金黃色葡萄球菌、枯草芽孢桿菌具有拮抗作用,2 株放線菌對(duì)金黃色葡萄球菌的抑菌作用效果相當(dāng),抑菌圈直徑均為4.5 mm(表1);2 株放線菌對(duì)枯草芽孢桿菌均具有抑菌作用,其中4 號(hào)放線菌對(duì)枯草芽孢桿菌產(chǎn)生的拮抗效果較好,抑菌圈直徑達(dá)6.5 mm。
表1 產(chǎn)生拮抗作用的放線菌的抑菌圈直徑 (單位:mm)
圖2 濾紙片法篩選抑菌活性菌株
對(duì)拮抗菌株進(jìn)行16S rDNA 分子鑒定,結(jié)果見(jiàn)圖3。結(jié)果表明,4 號(hào)放線菌與黃三素鏈霉菌(Streptomyces flavotricini)菌株的親緣關(guān)系最近,聚為一個(gè)分支,一致性為100%;7 號(hào)放線菌與加納鏈霉菌(Streptomyces gardneri)菌株的親緣關(guān)系最近,聚為一個(gè)類(lèi)群,經(jīng)鑒定,黃三素鏈霉菌和加納鏈霉菌均屬于鏈霉菌屬,一致性為100%。
圖3 基于16S rDNA 構(gòu)建NJ 系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
自植物根際土壤中分離的具有拮抗作用的放線菌大多為鏈霉菌屬,其次為小單孢菌屬、小雙孢菌屬等其他屬[9-11]。研究人員從艾草[12]、枸骨[13]、木豆[14]等中草藥的根際土壤中能夠分離獲得具有抑菌活性的放線菌菌株,甚至是廣譜性抑菌的活性菌株,因此,從藥用植物根際土壤分離篩選有益菌株是發(fā)掘具有抑菌作用的活性菌株的有效途徑。與內(nèi)生菌不同的是,根際的分泌物使得附近的土壤微生物富集,分布在根際的放線菌的豐富度依賴于土壤所處環(huán)境的理化性質(zhì)。研究發(fā)現(xiàn),最利于這些菌株生長(zhǎng)的成分往往來(lái)自鄰近植物根際的土壤浸液。此外,土壤中的有機(jī)質(zhì)會(huì)影響放線菌的富集度,有機(jī)質(zhì)越多,其他細(xì)菌便會(huì)和放線菌形成競(jìng)爭(zhēng)性關(guān)系導(dǎo)致該區(qū)域的放線菌的富集度下降,因此在一些極端土壤環(huán)境下更有可能發(fā)現(xiàn)新型放線菌[15]。本試驗(yàn)共分離出7 株放線菌,經(jīng)初篩與復(fù)篩,4 號(hào)和7 號(hào)這2 株放線菌對(duì)金黃色葡萄球菌、枯草芽孢桿菌2 種病原細(xì)菌產(chǎn)生了抑菌圈,即具有拮抗作用。經(jīng)分子鑒定,結(jié)果表明4 號(hào)為黃三素鏈霉菌,7 號(hào)為加納鏈霉菌。