李則明,黃國(guó)錦,王晴晴
1.武漢市第四醫(yī)院醫(yī)務(wù)處(武漢 430032)
2.桂林醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院呼吸疾病實(shí)驗(yàn)室(廣西桂林 541001)
3.武漢大學(xué)中南醫(yī)院綜合超聲醫(yī)學(xué)科(武漢 430071)
癌癥已成為當(dāng)今世界上死亡率最高的疾病之一[1],其是一類多基因調(diào)控失衡而引發(fā)的分子疾病。目前,癌癥治療方法除傳統(tǒng)的手術(shù)切除、化學(xué)藥物治療和放射治療外,還增加了靶向治療與免疫治療等方法,但總體上療效欠佳[2],因此探尋可用于泛癌治療的新型分子靶點(diǎn)逐漸成為當(dāng)今腫瘤學(xué)科研究的熱點(diǎn)方向。含有DEP結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì)1B(DEP domain-containing protein 1B,DEPDC1B)高表達(dá)于多種惡性腫瘤組織中,并影響了其發(fā)生發(fā)展,本文將以此為切入點(diǎn)對(duì)癌蛋白DEPDC1B的研究進(jìn)展作一綜述。
癌蛋白DEPDC1B是定位于人類5號(hào)染色體長(zhǎng)臂1區(qū)2帶1亞帶的基因DEPDC1B編碼的癌蛋白,它由529個(gè)氨基酸構(gòu)成,主要由2個(gè)結(jié)構(gòu)域組成,分別是DEP結(jié)構(gòu)域和Rho GAP結(jié)構(gòu)域(圖1)[3-4]。該蛋白主要定位于細(xì)胞質(zhì)中的高爾基體,同時(shí)也可在細(xì)胞質(zhì)其他位置、細(xì)胞核以及細(xì)胞膜中檢測(cè)到。
圖1 DEPDC1B結(jié)構(gòu)模式圖Figure 1.Structural pattern diagram of DEPDC1B
結(jié)構(gòu)域是蛋白質(zhì)行使功能最基本的單位,因此深入了解蛋白質(zhì)的所有結(jié)構(gòu)域是挖掘其功能的重中之重。本文結(jié)合文獻(xiàn)報(bào)道和美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Infrmation,NCBI)對(duì)DEPDC1B的結(jié)構(gòu)域功能進(jìn)行了詳細(xì)探究,發(fā)現(xiàn)它包含了以下2個(gè)結(jié)構(gòu)域。
DEP結(jié)構(gòu)域是由80~100個(gè)氨基酸組成的球狀模塊結(jié)構(gòu)域,含一個(gè)三螺旋束和一個(gè)在C端區(qū)域中由兩個(gè)長(zhǎng)β鏈及兩個(gè)短β鏈組成的β-發(fā)夾“臂”[5-6]。其是在果蠅的蓬亂蛋白、秀麗隱桿線蟲(chóng)的產(chǎn)卵缺陷蛋白10和哺乳動(dòng)物細(xì)胞的普列克底物蛋白3種蛋白質(zhì)中的序列分析鑒定出來(lái)的一種球狀模塊結(jié)構(gòu)域[5],因此命名取自該3個(gè)蛋白質(zhì)名稱的開(kāi)頭字母。DEP結(jié)構(gòu)域存在于50多種蛋白質(zhì)中,這些包含DEP結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì)功能不盡相同[5-6],主要參與了膜錨定、G蛋白偶聯(lián)受體介導(dǎo)的信號(hào)調(diào)控以及其他的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)[4,7-8],影響細(xì)胞增殖、侵襲、遷移和抑制凋亡等方面[9-12]。有研究表明,含有DEP結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì)可能參與了Rac介導(dǎo)的PI3K信號(hào)通路,也會(huì)影響mTOR的活性[13-14]。有研究認(rèn)為在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中,DVL蛋白中DEP結(jié)構(gòu)域是啟動(dòng)wnt/β-catenin通路的關(guān)鍵因素[15]。
Rho GAP結(jié)構(gòu)域于1989年首次被發(fā)現(xiàn),其是由大約170個(gè)氨基酸、7個(gè)α螺旋組成的保守蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域,它存在于包括DEPDC1B在內(nèi)的70多個(gè)蛋白質(zhì)中[6,16]。Rho GAP結(jié)構(gòu)域是Rho GTPase活性調(diào)控必不可少的元件,主要通過(guò)加速GTP酶活性令其失活,使Rho GTPase與GDP結(jié)合為無(wú)活性的形式存在于細(xì)胞質(zhì)中[16-17]。Rho家族蛋白(Rac,RhoA和CDC42)主要功能是通過(guò)調(diào)控肌動(dòng)蛋白-肌球蛋白的組裝,以影響細(xì)胞周期進(jìn)程、細(xì)胞黏附能力和細(xì)胞運(yùn)動(dòng)能力等[17-19]。而Rho家族蛋白的活性的平衡主要由Rho GEFs的正向調(diào)控和Rho GAPs的負(fù)向調(diào)控相協(xié)調(diào)[20]。Yang等的研究報(bào)道,含有一個(gè)Rho GAP結(jié)構(gòu)域的融合基因PPAPDC1A的表達(dá)可以增強(qiáng)彌漫性胃癌細(xì)胞的侵襲能力[21]。另外有研究表明,Rho GAP結(jié)構(gòu)域可與DEP等多種結(jié)構(gòu)域共同串聯(lián)于多種基因中,參與調(diào)節(jié)多種信號(hào)通路以影響多種生物活性,如胞吞作用、細(xì)胞分裂、細(xì)胞分化、遷移和神經(jīng)元形成等,也可參與疾病的發(fā)生,如癌癥等[16,22]。
DEP和Rho GAP結(jié)構(gòu)域均被證明是參與GTPase信號(hào)通路調(diào)控的關(guān)鍵因素,其中DEP結(jié)構(gòu)域也存在于Rho GEFs和GAPs中。Su等的研究結(jié)果提示,DEPDC1B中的DEP結(jié)構(gòu)域與Rac1存在相互作用,并不影響RhoA和CDC42的活性,揭示DEP結(jié)構(gòu)域?qū)TPase信號(hào)通路的調(diào)節(jié)主要是通過(guò)作為GEFs來(lái)發(fā)揮的[23]。而DEPDC1B中的Rho GAP結(jié)構(gòu)域缺乏激活GAP活性所必須的精氨酸,致使該結(jié)構(gòu)域不能發(fā)揮對(duì)Rho GTPase的失活作用[24]。因此,DEPDC1B對(duì)GTPase通路的調(diào)節(jié)主要表現(xiàn)為激活作用,從而調(diào)節(jié)細(xì)胞運(yùn)動(dòng)、生長(zhǎng)、分化、細(xì)胞骨架重組和細(xì)胞周期進(jìn)展等。值得關(guān)注的是,DC1B的DEP結(jié)構(gòu)域在對(duì)該蛋白行使生物功能的過(guò)程中,更是發(fā)揮著廣泛的作用,主要體現(xiàn)在介導(dǎo)膜定位、膜錨定和影響G蛋白偶聯(lián)受體介導(dǎo)的信號(hào)調(diào)控等方面[4,7-8]。如,DEP結(jié)構(gòu)域與細(xì)胞膜上FZ受體的C端尾部的第三個(gè)細(xì)胞內(nèi)環(huán)相互作用并結(jié)合,參與激活經(jīng)典的wnt信號(hào)通路;DEP結(jié)構(gòu)域也可與細(xì)胞膜上帶負(fù)電荷的磷脂相互作用,并在Nhe2維持的堿性pH條件下與FZ相互作用,從而激活非經(jīng)典的wnt信號(hào)通路;DEP結(jié)構(gòu)域也可介導(dǎo)蛋白質(zhì)與G蛋白偶聯(lián)受體結(jié)合,從而調(diào)控GPCR信號(hào)通路。可見(jiàn),DEPDC1B中的DEP結(jié)構(gòu)域發(fā)揮著調(diào)控細(xì)胞生物功能變化的重要作用。然而,關(guān)于DEPDC1B中是否還含有其他的結(jié)構(gòu)域,目前尚未見(jiàn)報(bào)道,故尚不明確DEPDC1B的功能是否受到了其他結(jié)構(gòu)域的調(diào)控。此外,DEPDC1B對(duì)癌細(xì)胞的具體作用機(jī)制尚未完全闡明,仍需更多的研究予以佐證。
DEPDC1B于2006年被首次發(fā)現(xiàn),Hrefna K.Johannsdottir等的研究在比較基因雜交分析時(shí)發(fā)現(xiàn)BRCA1突變攜帶者的乳腺癌中,BRCC3/DEPDC1B發(fā)生了純合子缺失[25]。最初的報(bào)道中,DEPDC1B均被稱為BRCC3,2008年以后的研究中稱DEPDC1B。癌蛋白DEPDC1B的功能于2007年被首次報(bào)道,Boudreau等的研究通過(guò)探究Raf對(duì)ERK磷酸化的調(diào)控機(jī)制,用Raf siRNA處理MDA-MB-231細(xì)胞,在基因轉(zhuǎn)錄組測(cè)序中發(fā)現(xiàn)了BRCC3,并且證明了BRCC3是Raf調(diào)控ERK磷酸化的中間效應(yīng)因子,初步提出BRCC3可促進(jìn)細(xì)胞存活和細(xì)胞增殖能力[26]。但是,DEPDC1B在乳腺癌中的表達(dá)情況、對(duì)腫瘤發(fā)生發(fā)展過(guò)程的影響以及作用機(jī)制仍有待進(jìn)一步的研究。此外,該研究團(tuán)隊(duì)予以人乳腺癌MDA-MB-435細(xì)胞周期同步化處理,檢測(cè)DEPDC1B的蛋白水平表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)DEPDC1B高表達(dá)于G2/M期,并在HEK-293T細(xì)胞中過(guò)表達(dá)DEPDC1B可減弱細(xì)胞周期特異性抗腫瘤藥物依托泊苷對(duì)細(xì)胞的殺傷作用[26]。另有文獻(xiàn)報(bào)道,在乳腺癌細(xì)胞MCF7中DEPDC1B于細(xì)胞周期G2期積累,并通過(guò)DEPDC1B/RhoA/PTPRF軸調(diào)控細(xì)胞有絲分裂動(dòng)力學(xué),促進(jìn)細(xì)胞從G2期進(jìn)入M期[27]。
近年來(lái),關(guān)于DEPDC1B在癌癥中的研究報(bào)道愈發(fā)增多,目前發(fā)現(xiàn)它在多達(dá)10余種類型的癌癥中均有致癌作用,對(duì)其中8種類型的癌癥患者有提示不良預(yù)后的作用(表1)。DEPDC1B的致癌作用主要表現(xiàn)在促進(jìn)細(xì)胞侵襲、遷移、增殖及抑制凋亡方面。Yang等的研究發(fā)現(xiàn)DEPDC1B在非小細(xì)胞肺癌患者的臨床組織樣本中高表達(dá),在細(xì)胞中過(guò)表達(dá)DEPDC1B后可通過(guò)激活wnt/β-catenin通路增強(qiáng)癌細(xì)胞的侵襲和遷移能力[28]。Bai等的研究通過(guò)對(duì)前列腺癌組織進(jìn)行微陣列及mRNA高通量測(cè)序分析,發(fā)現(xiàn)DEPDC1B高表達(dá)可提高患者臨床分期、促進(jìn)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移以及加速生化復(fù)發(fā)[29]。Zhang等的研究發(fā)現(xiàn)在胰腺癌細(xì)胞中過(guò)表達(dá)DEPDC1B后可通過(guò)DEPDC1B與Rac1相互作用而激活Rac1/PAK1-LIM1-cofilin1信號(hào)通路,引起細(xì)胞發(fā)生遷移和侵襲[30]。另有Liu等人探究到DEPDC1B在膀胱癌細(xì)胞中激活的另一條促進(jìn)細(xì)胞侵襲和遷移的通路,即Akt/GSK3β/Snail通路[31]。DEPDC1B的高表達(dá)還可促進(jìn)軟組織肉瘤[32]、膀胱癌[33]、肝癌[34-35]、脊索瘤[36]、膠母細(xì)胞瘤[37]和黑色素瘤[38]細(xì)胞發(fā)生侵襲和遷移。此外,DEPDC1B還可促腫瘤細(xì)胞增殖,如Su等的研究發(fā)現(xiàn),DEPDC1B高表達(dá)于口腔癌細(xì)胞,并通過(guò)激活Rac1而調(diào)控ERK發(fā)揮促細(xì)胞增殖的生物學(xué)功能[23]。DEPDC1B的促增殖作用也體現(xiàn)在黑色素瘤[39]、膀胱癌[33]、肝癌[35]和脊索瘤[36]這幾類惡性腫瘤中;DEPDC1B抑制腫瘤細(xì)胞凋亡作用則體現(xiàn)在膠母細(xì)胞瘤[37]、膀胱癌[33]和肝細(xì)胞癌[35]中。
表1 癌蛋白DEPDC1B與各類癌癥的相關(guān)性Table 1.Correlation between oncoprotein DEPDC1B and various cancers
綜上所述,DEPDC1B的結(jié)構(gòu)組成,均與DEP結(jié)構(gòu)域和Rho GAP結(jié)構(gòu)域相關(guān),且主要為DEP結(jié)構(gòu)域發(fā)揮作用。DEPDC1B高表達(dá)于多種癌癥中,并且多與患者臨床預(yù)后密切相關(guān)。深入了解其機(jī)制發(fā)現(xiàn),DEPDC1B主要與促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的侵襲和遷移密切相關(guān),并且該方向的作用機(jī)制研究較多;其次與促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的增殖和抗凋亡也存在一定的相關(guān)性,但機(jī)制挖掘尚待深入。
另一方面,既有研究發(fā)現(xiàn)DEPDC1B的表達(dá)可能會(huì)影響腫瘤患者的療效。Raf-1是影響腫瘤細(xì)胞對(duì)放療和化療藥物產(chǎn)生耐藥性的一個(gè)至關(guān)重要的基因[42-43],多項(xiàng)基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)報(bào)道,通過(guò)反義寡核苷酸、siRNA和小分子抑制劑等方法處理細(xì)胞,干擾Raf-1的表達(dá)后,腫瘤對(duì)放療和化療的效應(yīng)有了很大程度的提高,也有相關(guān)的臨床驗(yàn)證試驗(yàn)進(jìn)行了類似報(bào)道[43-45]。由此發(fā)現(xiàn),Raf-1的表達(dá)是影響腫瘤療效的一個(gè)決定性因素。DEPDC1B正是通過(guò)干擾乳腺癌細(xì)胞MDA-MB-231中Raf-1的表達(dá)后發(fā)現(xiàn)的新型基因,研究證明DEPDC1B的表達(dá)升高會(huì)使依托泊苷對(duì)HEK-293T細(xì)胞的誘導(dǎo)死亡效果明顯減弱[26]。由此推斷,DEPDC1B有可能會(huì)參與腫瘤細(xì)胞的化療藥物抵抗過(guò)程。Niu等對(duì)277個(gè)人類淋巴母細(xì)胞樣細(xì)胞系進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)研究,識(shí)別放療相關(guān)性生物標(biāo)志物,為了更準(zhǔn)確的預(yù)測(cè)輻射反應(yīng),最終篩選出包含DEPDC1B在內(nèi)的5個(gè)標(biāo)志物,它們可導(dǎo)致至少兩種細(xì)胞對(duì)放射治療反應(yīng)發(fā)生改變[46]。由此認(rèn)為DEPDC1B不僅有可能影響腫瘤細(xì)胞的化療效果,還會(huì)影響到放療療效。
靶向泛癌的藥物研發(fā)已經(jīng)成為近幾年癌癥領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。癌蛋白DEPDC1B在非小細(xì)胞肺癌、口腔癌和惡性黑色素瘤等多達(dá)10余種癌癥中均呈高表達(dá)狀態(tài),且DEPDC1B的高表達(dá)給非小細(xì)胞肺癌、前列腺癌和軟組織肉瘤等8種癌癥患者帶來(lái)不良預(yù)后。由此可見(jiàn),DEPDC1B與多種癌癥的發(fā)生發(fā)展均有一定的相關(guān)性,有可能是一個(gè)潛在的泛癌基因;同時(shí),DEPDC1B對(duì)腫瘤放療和化療反應(yīng)的影響,也增加了它作為一個(gè)新型的分子靶點(diǎn)、成為癌癥患者治療方向的可能性。
目前為止,癌蛋白DEPDC1B在腫瘤細(xì)胞中發(fā)揮的作用主要體現(xiàn)在提高細(xì)胞的侵襲、遷移和增殖能力,以及降低凋亡水平等,這些功能與其包含的DEP結(jié)構(gòu)域和Rho GAP結(jié)構(gòu)域密切相關(guān)。然而,尚未明確DEPDC1B是否還具備其他影響癌癥發(fā)生發(fā)展及預(yù)后的功能作用。因此,對(duì)癌蛋白DEPDC1B在癌癥中的作用及機(jī)制進(jìn)行更加深入的探索有重要的臨床意義。