王喜英 趙輝 盧志宏 譚智勇 宋希娟
摘要:汞(Hg)是一種廣泛存在于土壤環(huán)境中的全球污染物之一,土壤微生物對(duì)汞脅迫的敏感性強(qiáng)于動(dòng)植物,可從微生物角度為蔬菜土壤汞污染生態(tài)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估提供科學(xué)依據(jù)。采用盆栽試驗(yàn),應(yīng)用熒光定量PCR和高通量測(cè)序(Illumina HiSeq)技術(shù),分析對(duì)照(CK)、低濃度汞(T1)、中濃度汞(T2)和高濃度汞(T3)脅迫處理下蔬菜土壤hgcA基因數(shù)量、細(xì)菌數(shù)量、真菌數(shù)量和群落結(jié)構(gòu)變化特征。結(jié)果表明,T1處理增加細(xì)菌和hgcA基因數(shù)量,分別比CK、T2和T3提高了37.48%和 12.01%、57.31%和 19.37%、88.85%和14.82%。汞脅迫降低了真菌數(shù)量,其中T2處理降低最顯著。T3處理降低了土壤細(xì)菌群落α多樣性指數(shù)(豐富度和多樣性),T1處理降低了土壤真菌群落α多樣性指數(shù)(豐富度和多樣性)。土壤細(xì)菌門水平上,共獲得18個(gè)類群,其中放線菌門、變形菌門和綠彎菌門為優(yōu)勢(shì)類群,且在不同處理間差異極顯著。T2和T3處理分別顯著增加了變形菌門和放線菌門相對(duì)豐度。綠彎菌門相對(duì)豐度均表現(xiàn)隨汞濃度增加逐漸遞減的趨勢(shì)。土壤真菌門水平上,共獲得9個(gè)類群,其中子囊菌門、被孢菌門和擔(dān)子菌門為優(yōu)勢(shì)類群,其相對(duì)豐度共占真菌群落的94.64%。隨著汞濃度增加,子囊菌門相對(duì)豐度遞增,被孢菌門相對(duì)豐度遞減。擔(dān)子菌門在 T1 處理中最高(5.40%)。土壤pH值、銨態(tài)氮含量、硝態(tài)氮含量和全汞含量與土壤細(xì)菌數(shù)量、細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)有顯著關(guān)系。綜上,汞脅迫對(duì)蔬菜土壤hgcA基因、細(xì)菌和真菌數(shù)量有顯著影響,高汞脅迫造成了土壤細(xì)菌多樣性減少,細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)和組成發(fā)生變化,而細(xì)菌群落對(duì)汞脅迫的敏感性強(qiáng)于真菌。
關(guān)鍵詞:汞;蔬菜土壤;hgcA基因;細(xì)菌;真菌;高通量測(cè)序
中圖分類號(hào):S182文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A
文章編號(hào):1002-1302(2023)14-0229-11
汞是一種危險(xiǎn)和持久性的環(huán)境污染物,可在大氣中轉(zhuǎn)化和長距離運(yùn)輸,最終在食物鏈中積累,危害人類身體健康。在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中,施用的化肥、石灰、污泥、肥料、除草劑和殺菌劑等,已經(jīng)成為土壤汞的重要來源之一[1]。汞在土壤中的毒性高度依賴于其化學(xué)種類,甲基汞化合物被認(rèn)為是毒性最大的物種[2]。土壤汞的甲基化主要通過環(huán)境中微生物轉(zhuǎn)化而成,hgcA作為汞甲基化生物標(biāo)志物,常用來評(píng)估土壤中潛在汞甲基化微生物[3]。土壤微生物可以快速響應(yīng)土壤環(huán)境脅迫變化,對(duì)土壤污染程度具有重要的指示作用[4-5]。研究表明,微生物對(duì)重金屬脅迫比植物更敏感[4]。關(guān)于汞對(duì)土壤微生物影響的研究很少,且更多集中在細(xì)菌群落[6-9]。在重金屬污染物脅迫下,微生物數(shù)量減少甚至死亡,或變成抗性優(yōu)勢(shì)群[10]。在重金屬污染土壤中,強(qiáng)耐受性微生物相對(duì)豐度增加,敏感微生物逐漸減少,土壤生態(tài)系統(tǒng)逐漸退化,并出現(xiàn)新物種[11]。Harris-Hellal等研究表明,在低汞濃度(0.1 mg/kg)條件下,土壤微生物群落變化不明顯,在高汞濃度(20 mg/kg)下土壤微生物群落功能多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)發(fā)生變化[12]。Xie等研究發(fā)現(xiàn),隨著汞濃度的增加,土壤中革蘭氏陽性菌與革蘭氏陰性菌比例逐漸增加[13]。Frossard等通過研究不同汞濃度(0.32、3.2、32 μg/g)對(duì)森林土壤細(xì)菌和真菌群落的影響,發(fā)現(xiàn)最高汞濃度造成微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性變化[14]。Wang等研究表明,在高濃度汞處理下,隨培養(yǎng)時(shí)間增加,微生物群落豐富度逐漸下降,而低濃度汞和中低濃度汞對(duì)土壤微生物群落均勻性影響不大[11]。Liu等評(píng)估汞污染對(duì)水稻土壤細(xì)菌多樣性的影響,發(fā)現(xiàn)在中等汞濃度下細(xì)菌多樣性最高,表明中等干擾下生物多樣性達(dá)到峰值[15]。Rajapaksha等研究認(rèn)為真菌通常比細(xì)菌對(duì)重金屬更耐受[16]。然而,關(guān)于汞對(duì)土壤真菌數(shù)量和群落結(jié)構(gòu)的影響及其驅(qū)動(dòng)因素,尚缺乏深入的研究。
蔬菜已經(jīng)成為人們飲食必不可少的食物之一。汞成為菜地污染最嚴(yán)重的重金屬之一[17]。白菜在我國種植面積廣泛,對(duì)金屬富集作用強(qiáng)于其他非葉蔬菜,對(duì)生態(tài)系統(tǒng)和人類構(gòu)成了更大威脅[18]。目前,汞對(duì)土壤細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)的影響更多集中在水稻和森林等植物[15,19],同時(shí),關(guān)于hgcA基因豐度的研究更多的是在厭氧環(huán)境[20-22],但在蔬菜土壤等非厭氧環(huán)境中研究較少。因此,本研究采用盆栽試驗(yàn),應(yīng)用熒光定量PCR和Miseq高通量測(cè)序,研究汞脅迫下蔬菜(白菜)土壤hgcA基因數(shù)量、細(xì)菌和真菌數(shù)量、群落組成及其環(huán)境驅(qū)動(dòng)因素,揭示土壤微生物對(duì)汞脅迫的響應(yīng)機(jī)制,從微生物角度為蔬菜汞脅迫的生態(tài)評(píng)估及生物預(yù)警提供科學(xué)依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 供試土壤
土壤樣品采集于貴州省銅仁市碧江區(qū)(109°13′12″E,27°47′30″N)典型菜地黃壤土。從表層0~20 cm收集新鮮土壤去除植物殘?bào)w礫石等,風(fēng)干后過2 mm篩用作盆栽試驗(yàn)。土壤基本理化性質(zhì):pH值為6.56,有機(jī)碳含量為17.05 g/kg,全氮含量為1.63 g/kg,速效鉀含量為46.59 mg/kg,速效磷含量為16.92 mg/kg和全汞含量為0.331 mg/kg。
1.2 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
以HgCl2為汞源,設(shè)置4個(gè)汞濃度組(0、1、10、50 mg/kg),分別代表對(duì)照(CK)、低汞(T1)、中汞(T3)和高汞(T3)濃度污染土壤。每個(gè)處理重復(fù)3次,共計(jì)12個(gè)處理,將土壤樣品混合均勻后,裝入高21 cm、上口直徑21 cm 塑料盆中,盆栽用土 5 kg。為保持添加的汞趨于均勻穩(wěn)定且被土壤充分吸附,土壤老化時(shí)間為90 d,同時(shí)保持土壤含水量在60%。老化結(jié)束后,栽種試驗(yàn)于2021年4月在銅仁學(xué)院溫棚進(jìn)行,供試小白菜品種購自天津市宏豐蔬菜研究有限公司。每盆栽種10粒,白菜出苗后,每盆留苗4株。白菜生長期間管理水平一致,為避免水中汞進(jìn)入,均采用蒸餾水澆灌,同時(shí)保持土壤田間持水量為60%。在白菜生長60 d時(shí),進(jìn)行植株和土壤樣品采集。白菜測(cè)量鮮質(zhì)量、株高和根長等指標(biāo)(表1)。土樣采集后,去除植物根系并過2 mm篩后,分為2份,1份用于土壤銨態(tài)氮和硝態(tài)氮含量測(cè)定,其余風(fēng)干土壤用于全汞含量和理化指標(biāo)分析;1份-20? ℃冰箱保存用于土壤微生物分析。
1.3 測(cè)定項(xiàng)目及方法
1.3.1 土壤全汞含量和理化指標(biāo)測(cè)定
土壤全汞(THg)含量采用王水水浴消化,原子熒光光度計(jì)測(cè)定[23]。參照鮑士旦的《土壤農(nóng)化分析》對(duì)土壤理化指標(biāo)進(jìn)行測(cè)定[24]:采用電位法測(cè)定pH值;采用重鉻酸鉀氧化法測(cè)定有機(jī)碳(SOC)含量;采用凱氏定氮法測(cè)定全氮(TN)含量;采用靛酚藍(lán)比色法測(cè)定銨態(tài)氮(NH+4-N)含量;采用酚二磺酸比色法測(cè)定硝態(tài)氮(NO-3-N)含量;采用碳酸氫鈉浸提-鉬銻抗比色法測(cè)定速效磷(AP)含量;采用乙酸銨提取-火焰光度法測(cè)定速效鉀(AK)含量。
1.3.2 土壤DNA提取
采用DNA提取試劑盒(Omega,GA,USA),按照試劑盒步驟進(jìn)行提取。用核酸定量儀(NanoDrop ND-2000)對(duì)DNA濃度和純度進(jìn)行檢測(cè)。
1.3.3 土壤細(xì)菌、真菌、hgcA基因熒光定量PCR
利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)技術(shù)對(duì)細(xì)菌(16S rRNA)、真菌(ITS)、hgcA基因豐度進(jìn)行分析,細(xì)菌16S rRNA基因的 V3-V4區(qū)擴(kuò)增引物為338F(5′-ACTCCTACGGGAGGCAGCAC-3′)與519R(5′-GGACTACNNGGGTATCTAAT-3′)[19]。真菌ITS擴(kuò)增引物為ITS1F(5′-CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA-3′)和ITS2R(5′-GCTGCGTTCTTCATCGATGC-3′)[25];hgcAF(5′-GCCAACTACAAGMTGASCTWC-3′)與hgcAR(5′-CCSGCNGCRCACCAGACRTT-3′)[26]。每個(gè)PCR擴(kuò)增樣品重復(fù)3次,通過Minipre Kit獲得樣品質(zhì)粒,根據(jù)樣品質(zhì)粒的標(biāo)準(zhǔn)曲線,分別計(jì)算基因拷貝數(shù)。
1.3.4 高通量測(cè)序
采用2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物。利用Illumina MiSeq平臺(tái)對(duì)細(xì)菌16S rRNA、真菌ITS進(jìn)行測(cè)序(上海派森諾生物科技有限公司)。對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量控制后,在97%相似度水平下進(jìn)行OTU劃分和歸并。應(yīng)用RDP-classifier分別在16S rRNA和真菌ITS數(shù)據(jù)庫中對(duì)97%相似水平的OTU代表序列進(jìn)行分類注釋。使用Mothur軟件分別對(duì)細(xì)菌和真菌群落的α多樣性指數(shù)進(jìn)行分析。
1.4 數(shù)據(jù)分析
采用SPSS 21.0統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)土壤全汞含量和理化性質(zhì)、hgcA基因數(shù)量、細(xì)菌和真菌數(shù)量、群落α多樣性指數(shù)、群落組成相對(duì)豐度進(jìn)行方差分析和顯著性檢驗(yàn)(P<0.05);使用SPSS 21.0和R軟件進(jìn)行相關(guān)性分析。使用R軟件進(jìn)行土壤細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)聚類分析、主坐標(biāo)分析和冗余分析。
2 結(jié)果與分析
2.1 土壤全汞含量和理化性質(zhì)
隨汞濃度增加,土壤全氮和銨態(tài)氮含量總體呈現(xiàn)遞增趨勢(shì),其中CK處理的全氮含量分別與T1、T2和T3差異顯著;CK處理的銨態(tài)氮含量分別與T2和T3差異顯著。汞濃度增加,導(dǎo)致土壤pH值趨于中性且T3處理顯著高于其他處理。土壤有機(jī)碳含量在T1和T2處理均小于CK,但T3處理顯著增加。硝態(tài)氮含量隨汞濃度增加呈遞減趨勢(shì),且CK分別與T2和T3之間差異顯著。土壤速效磷、速效鉀含量和C/N 比均是CK處理最高。土壤全汞含量大小順序?yàn)門3>T2>T1>CK,且T2和T3分別與T1和CK之間差異顯著(表2)。
2.2 土壤細(xì)菌、真菌和hgcA基因豐度
由圖1可知,細(xì)菌16S rRNA基因豐度在不同處理中差異顯著。不同汞濃度下細(xì)菌16S rRNA基因拷貝數(shù)為1.35×109~2.54×109/g干土,且相互之間差異顯著。T1處理顯著增加了細(xì)菌數(shù)量,比CK提高了37.48%。T2和T3處理顯著低于CK,分別比CK降低了12.61%和19.79%。真菌ITS基因拷貝數(shù)為0.83×108~1.99×108/g干土。汞添加降低了真菌數(shù)量,CK處理中真菌ITS基因拷貝數(shù)高于其他處理,與T1處理差異不顯著,分別是T2和T3處理的2.39倍和1.48倍。各處理土壤中均檢測(cè)出hgcA基因,范圍為6.9×105~8.24×105/g干土。hgcA基因拷貝數(shù)隨汞濃度增加而有所不同,在T1處理最高,與CK差異不顯著,與T2和T3差異顯著。
為明確汞污染下蔬菜土壤細(xì)菌16S rRNA、真菌ITS和hgcA基因拷貝數(shù)差異的影響因素,分別與土壤理化性質(zhì)進(jìn)行相關(guān)性分析(圖2)。細(xì)菌16S rRNA基因拷貝數(shù)分別與土壤pH值、銨態(tài)氮含量呈極顯著負(fù)相關(guān)關(guān)系;與有機(jī)碳、速效磷和總汞含量呈顯著負(fù)相關(guān)關(guān)系;與硝態(tài)氮含量呈極顯著正相關(guān)關(guān)系。真菌ITS基因拷貝數(shù)與全氮含量呈顯著負(fù)相關(guān)關(guān)系;與碳氮比呈顯著正相關(guān)。hgcA基因拷貝數(shù)與土壤pH值呈顯著負(fù)相關(guān)關(guān)系。
2.3 土壤細(xì)菌和真菌測(cè)序結(jié)果及其α多樣性指數(shù)
由表3可知,土壤細(xì)菌和真菌覆蓋度均在0.98以上,測(cè)序結(jié)果可以真實(shí)反映各處理土壤微生物群落特征。土壤細(xì)菌和真菌中CK、T1、T2和T3獲得質(zhì)控后序列數(shù)分別為88 856(116 967)、83 655(110 772)、84 090(112 434)和88 335(113 698)。土壤細(xì)菌OTUs隨汞濃度增加逐漸減少。CK處理土壤細(xì)菌和真菌OTUs均最多,分別為3 781、622個(gè);土壤細(xì)菌CK處理與T3之間差異顯著;土壤真菌CK處理分別與T1、T2和T3之間差異顯著。說明汞濃度增加改變了蔬菜土壤細(xì)菌和真菌OTUs水平上的物種組成,且土壤真菌變化更加明顯。
土壤細(xì)菌α多樣性指數(shù)均大于真菌。隨汞濃度增加,土壤細(xì)菌Chao1指數(shù)和ACE指數(shù)均表現(xiàn)出先增加后降低趨勢(shì),表明低汞濃度有利于土壤細(xì)菌群落豐富度增加。 T3處理Chao1指數(shù)和ACE指數(shù)均顯著低于其他處理,說明土壤細(xì)菌豐富度受到高濃度汞污染的影響嚴(yán)重。Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)變化趨勢(shì)相同,隨汞濃度增加逐漸降低;其中,CK、T1和T2處理之間變化不明顯,T3處理顯著低于其他處理。土壤真菌α多樣性指數(shù)均是T2處理最高,其中Chao1指數(shù)、ACE指數(shù)和Shannon指數(shù)是T1處理最小,且T2與CK和T3之間差異不明顯,T2與T1差異顯著。Simpson指數(shù)隨汞濃度增加表現(xiàn)先增加后降低趨勢(shì),且T2與CK差異顯著。可知,低汞脅迫對(duì)土壤細(xì)菌群落的多樣性和豐富度有促進(jìn)作用,對(duì)土壤真菌群落的多樣性和豐富度有抑制作用。
相關(guān)性分析結(jié)果(圖2)表明,土壤細(xì)菌Chao1指數(shù)、ACE指數(shù)、Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)分別與土壤pH值、銨態(tài)氮和總汞含量呈極顯著負(fù)相關(guān)關(guān)系,與硝態(tài)氮含量呈極顯著正相關(guān)關(guān)系,與速效鉀含量呈顯著正相關(guān)關(guān)系。Chao1指數(shù)和ACE指數(shù)與有機(jī)碳含量呈顯著負(fù)相關(guān)關(guān)系。Chao1指數(shù)與速效磷含量呈顯著負(fù)相關(guān)關(guān)系。Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)分別與有機(jī)碳含量呈極顯著負(fù)相關(guān)關(guān)系。土壤真菌Chao1指數(shù)與速效磷含量呈顯著正相關(guān)關(guān)系。Simpson指數(shù)與碳氮比呈顯著負(fù)相關(guān)關(guān)系。
2.4 土壤細(xì)菌和真菌群落組成
通過對(duì)汞脅迫下蔬菜土壤樣品OTUs進(jìn)行歸類,土壤細(xì)菌得到18個(gè)門、50個(gè)綱、114個(gè)目、172個(gè)科和262個(gè)屬。土壤真菌得到9個(gè)門、20個(gè)綱、47個(gè)目、91個(gè)科和139個(gè)屬。在細(xì)菌門水平上,將平均相對(duì)豐度<1%類群歸類為其他,得到6個(gè)類群(圖3-a),分別為放線菌門(Actinobacteria)、變形菌門(Proteobacteria)、綠彎菌門(Chloroflexi)、酸桿菌門(Acidobacteria)、芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)和厚壁菌門(Firmicutes),其中放線菌門、變形菌門、綠彎菌門、酸桿菌門和芽單胞菌門在不同處理之間有極顯著差異(P<0.01)。放線菌門(59.56%~68.99%)、變形菌門(16.67%~19.43%)和綠彎菌門(3.95%~7.22%)為優(yōu)勢(shì)菌門,占細(xì)菌總類群相對(duì)豐度的84.96%~89.62%。放線菌門相對(duì)豐度在T3處理中最高,分別是CK、T1和T2的1.13倍、1.16倍和1.15倍。變形菌門相對(duì)豐度隨汞濃度增加表現(xiàn)先增加后減少,在T2處理最高(19.43%),T3處理最低(16.67%)。綠彎菌門和酸桿菌門相對(duì)豐度均表現(xiàn)出隨汞濃度增加逐漸遞減,在T3處理最低(3.95%和3.01%),分別比CK降低了45.21%和50.2%。芽單胞菌門在T1處理最高(4.43%),T3處理最低(2.92%)。厚壁菌門相對(duì)豐度在不同處理中差異不顯著,CK最低(1.91%),T2處理最高(2.51%)。在屬水平上,得到相對(duì)豐度在1%以上的10個(gè)類群(圖3-c),分別為鏈絲菌屬(Streptomyces)、小單孢菌屬(Micromonospora)、類諾卡氏菌屬(Nocardioides)、Subgroup_6、芽單胞菌屬(Gemmatimonas)、67-14、KD4-96、Gaiella、濱田氏菌屬(Hamadaea)和Marmoricola。其中,鏈絲菌屬、小單孢菌屬和類諾卡氏菌屬為優(yōu)勢(shì)菌屬,相對(duì)豐度分別為2.42%~27.42%、5.72%~8.17%和4%~6.6%。隨汞濃度增加,鏈絲菌屬相對(duì)豐度顯著增加,T1、T2和T3分別是CK的1.31倍、3.85倍和11.44倍。小單孢菌屬相對(duì)豐度在T3處理顯著高于其他處理,比CK增加了20.86%。汞添加降低了類諾卡氏菌屬相對(duì)豐度,其中T3處理降低幅度最大,且與其他處理之間差異極顯著。
在門水平上,真菌群落相對(duì)豐度達(dá)到1%以上的類群有3個(gè),分別為子囊菌門(Ascomycota,平均相對(duì)豐度80.94%)、被孢菌門(Mortierellomycota,平均相對(duì)豐度10.33%)和擔(dān)子菌門(Basidiomycota,平均相對(duì)豐度3.37%)(圖3-b)。隨汞濃度增加,子囊菌門相對(duì)豐度遞增,被孢菌門相對(duì)豐度遞減。子囊菌門和被孢菌門在不同汞濃度處理中差異極顯著,子囊菌門相對(duì)豐度在T3處理最高(91.92%),分別比CK、T1和T2增加了28.7%、17.22%和12.09%。被孢菌門相對(duì)豐度在T1、T2和T3處理中,分別比CK減少了30.37%、42.04%和98.51%。擔(dān)子菌門相對(duì)豐度隨汞濃度增加表現(xiàn)為先增加后減少趨勢(shì),大小順序?yàn)門1>CK>T2>T3。屬水平上,相對(duì)豐度大于1%的類群為鐮刀菌屬(Fusarium)、被孢霉屬(Mortierella)、扁孔腔菌屬(Lophiostoma)、螺旋聚孢霉屬(Clonostachys)、小不整球殼屬(Plectosphaerella)和圓孢霉屬(Staphylotrichum),且不同處理間差異顯著(圖3-d)。其中,鐮刀菌屬和被孢霉屬為優(yōu)勢(shì)類群,相對(duì)豐度分別為12.78%~33.26%和0.27%~18.94%。鐮刀菌屬相對(duì)豐度隨汞濃度增加顯著遞增,T1、T2和T3分別比CK增加了30.75%、46.32%和162.25%。被孢霉屬相對(duì)豐度在汞添加處理中均小于CK(18.94%),T3處理最低(0.27%)。汞添加顯著增加了扁孔腔菌屬和螺旋聚孢霉屬相對(duì)豐度,其中扁孔腔菌屬相對(duì)豐度在T2處理最高(6.33%),螺旋聚孢霉屬在T3處理最高(7.31%)。汞添加降低了小不整球殼屬和圓孢霉屬相對(duì)豐度,汞濃度越高抑制作用越強(qiáng)。
2.5 土壤細(xì)菌和真菌群落的層次聚類和PCoA分析
汞脅迫下土壤細(xì)菌和真菌的層次聚類樹如圖4所示。不同處理土壤細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)差異明顯。土壤細(xì)菌和真菌除T1外,其他處理3個(gè)重復(fù)聚類在一起。其中,CK和T1處理之間距離較近。T3與CK和T1處理之間距離較遠(yuǎn)。PCoA分析進(jìn)一步證實(shí)了汞脅迫處理土壤細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)差異明顯。PCoA1和PCoA2對(duì)細(xì)菌和真菌群落分別解釋了總變異的43.5%(24.8%)和14.3%(23.5%)(圖5)。CK、T1和T2距離較近,說明土壤細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)相似度較高。T3和其他處理在不同象限內(nèi),T3與CK、T1和T2相距較遠(yuǎn),說明高濃度汞脅迫對(duì)土壤細(xì)菌和真菌群落影響最大。
2.6 土壤細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)與環(huán)境因子的關(guān)系
本研究在土壤細(xì)菌和真菌屬水平上與土壤理化性質(zhì)進(jìn)行了冗余分析(圖6)。RDA1和RDA2分別解釋了土壤細(xì)菌群落變異的93.52%和3.09%,前兩軸解釋了總變異的96.61%。RDA1和RDA2分別解釋了土壤真菌群落變異的82.13%和7.55%,前兩軸解釋了總變異的89.68%。由表4可知,土壤pH值、銨態(tài)氮含量、硝態(tài)氮含量和全汞含量對(duì)細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)有極顯著影響,有機(jī)碳含量對(duì)細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)有顯著影響,全氮含量對(duì)真菌群落結(jié)構(gòu)有極顯著影響, 速效鉀含量對(duì)真菌群落結(jié)構(gòu)有顯著影響。
3 討論與結(jié)論
3.1 汞脅迫對(duì)蔬菜土壤細(xì)菌、真菌和hgcA基因豐度的影響
重金屬污染由于降解性低,給土壤帶來了嚴(yán)重的環(huán)境惡化問題,通過功能干擾、蛋白質(zhì)變性或細(xì)胞膜破壞影響微生物生長和代謝,抑制微生物活性,導(dǎo)致土壤微生物總量下降[8]。
本研究土壤細(xì)菌數(shù)量(CK除外)隨汞濃度增加表現(xiàn)遞減趨勢(shì),與Zheng等研究結(jié)果[19]一致。T1處理土壤細(xì)菌數(shù)量顯著高于其他處理,可能由于低濃度汞處理蔬菜土壤pH值較低,降低了汞的生物利用度和甲基化,對(duì)土壤鉀和磷的釋放有促進(jìn)作用,有利于植物生長[27-28]。植物長勢(shì)好,根系分泌物多,可以促進(jìn)細(xì)菌數(shù)量增加[29]。Frossard等研究也認(rèn)為,小于3.2 mg/kg的汞濃度對(duì)土壤細(xì)菌數(shù)量沒有顯著抑制作用[14]。本研究T1處理的汞濃度較低,對(duì)植物生長和土壤細(xì)菌還未起到抑制作用,說明該汞濃度未超過閾值。相關(guān)性分析表明,土壤細(xì)菌數(shù)量與總汞含量呈負(fù)相關(guān),Hg污染抑制微生物生長,與Liu等研究結(jié)果[30]一致。然而,Liu等研究認(rèn)為,長期來看,水稻土壤細(xì)菌數(shù)量與總汞含量沒有顯著相關(guān)性[15],這可能與本研究開展的是短期汞脅迫試驗(yàn)有關(guān)。本研究中,隨汞濃度增加土壤真菌數(shù)量下降,這與許多重金污染下所得結(jié)果[14,31]一致。汞污染下細(xì)菌數(shù)量遠(yuǎn)高于真菌,有可能細(xì)菌與真菌競爭營養(yǎng),從而對(duì)真菌群落產(chǎn)生更大生存壓力[31]。T3處理真菌數(shù)量高于T2,說明真菌對(duì)高濃度汞污染具有更大抵抗力。Zheng等研究也認(rèn)為,許多真菌可以忍受高濃度汞污染,通過排出有機(jī)酸與土壤中金屬形成復(fù)合物,從而降低重金屬毒性[19]。
本研究hgcA基因基因拷貝數(shù)為 6.9×105~8.24×105/g干土,遠(yuǎn)低于周心勸等關(guān)于水稻田的研究結(jié)果[20],可能與hgcA基因主要是在厭氧條件下形成有關(guān)??偣颗chgcA豐度沒有顯著相關(guān),與Liu等研究結(jié)果[32]一致,但與Vishnivetskaya等研究結(jié)果[33]不一致,這可能與取樣環(huán)境、植物類型和土壤類型等因素有關(guān)。T1處理hgcA基因數(shù)量高于其他處理,可能與土壤pH值有關(guān),由于pH值直接影響汞在土壤中的溶解度。Liu等研究認(rèn)為,在堿性環(huán)境中可能不適合含汞甲基化hgcA基因的微生物存活,當(dāng)土壤處于酸性條件下時(shí),汞的甲基化程度增強(qiáng),導(dǎo)致汞的生物利用度增加,然而,當(dāng)pH值過低時(shí),大量腐殖酸會(huì)影響汞的生物利用度或甲基供體轉(zhuǎn)移,降低汞的甲基化[3]。
3.2 汞脅迫對(duì)蔬菜土壤細(xì)菌和真菌多樣性的影響
微生物多樣性是評(píng)估土壤生態(tài)系統(tǒng)功能的重要指標(biāo)[27]。本研究土壤細(xì)菌α多樣性指數(shù)(CK除外)均隨汞含量增加而減少,與Vishnivetskaya等研究結(jié)果[33]一致。Crognale等研究認(rèn)為,短期重金屬污染對(duì)土壤微生物數(shù)量、豐富度和多樣性產(chǎn)生負(fù)面影響[34]。土壤細(xì)菌Chao1指數(shù)和ACE指數(shù)在低汞濃度中最高,然后隨汞濃度增加逐漸下降,表明土壤微生物群落豐富度逐漸下降,豐富度受到高汞濃度影響嚴(yán)重。這種趨勢(shì)很可能是由于低濃度汞的存在刺激抗金屬物種生長,汞濃度增加導(dǎo)致許多敏感物種死亡,最終導(dǎo)致微生物遺傳多樣性下降[35]。土壤細(xì)菌Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)在對(duì)照、低汞濃度和中汞濃度下變化不顯著,但高汞濃度下明顯改變了Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù),與Liu等研究結(jié)果[15]相似。這種原因可能是隨汞濃度增加,不能適應(yīng)高汞濃度的微生物數(shù)量逐漸減少甚至死亡。
Rieder等研究表明,真菌比細(xì)菌對(duì)長期重金屬污染更有抵抗力,真菌對(duì)汞的反應(yīng)不如細(xì)菌強(qiáng)烈[36]。本研究中,隨汞濃度增加,真菌Chao1指數(shù)、ACE指數(shù)、Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)表現(xiàn)先增后減少趨勢(shì),與Frossard等研究結(jié)果[37]一致。該結(jié)果也支持了中度干擾假說,表明中等汞濃度可提高真菌多樣性[38]。前人研究認(rèn)為,汞污染通過影響土壤理化性質(zhì)間接影響真菌多樣性,土壤理化性質(zhì)是土壤微生物多樣性的重要驅(qū)動(dòng)因素,汞在調(diào)節(jié)土壤真菌豐度和多樣性方面具有重要性[39]。Durand等研究表明,在受汞污染脅迫的礦區(qū),土壤真菌多樣性與汞濃度呈負(fù)相關(guān)關(guān)系[40]。然而,本研究中沒有發(fā)現(xiàn)汞對(duì)真菌多樣性有顯著影響,與Frossard等研究結(jié)果[37]一致。目前,關(guān)于這一現(xiàn)象的原因尚未明確,可能是由于土壤真菌群落對(duì)汞的預(yù)適應(yīng)性,真菌耐汞類群的改變或者低汞生物利用導(dǎo)致缺乏汞毒性[41]。
3.3 汞脅迫對(duì)蔬菜土壤細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)的影響
Wang等研究認(rèn)為,重金屬汞進(jìn)入土壤將對(duì)土壤微生物群落結(jié)構(gòu)和功能產(chǎn)生嚴(yán)重影響[11]。本研究結(jié)果也表明,汞導(dǎo)致土壤細(xì)菌和真菌群落組成發(fā)生變化,存在劑量相關(guān)效應(yīng),這與之前研究結(jié)果[19,42]一致。土壤細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,可能因重金屬汞添加引起土壤金屬敏感生物數(shù)量減少,耐抗微生物數(shù)量增加,導(dǎo)致微生物群落組成發(fā)生變化[43]。
本研究中,細(xì)菌群落中放線菌門、變形菌門和綠彎菌門為優(yōu)勢(shì)菌門,與前人研究結(jié)果[19,44]一致。放線菌門在動(dòng)植物殘?bào)w分解過程中起著重要作用,有利于土壤氮轉(zhuǎn)化,可產(chǎn)生抗生素減少病原微生物侵害[45]。放線菌門相對(duì)豐度在高汞濃度下顯著增加,說明放線菌門對(duì)汞污染具有耐受性。相關(guān)研究已經(jīng)證明放線菌門對(duì)重金屬污染具有耐受性[46],可能與阻力機(jī)制及沉淀-溶解平衡有關(guān),限制了土壤游離金屬離子的動(dòng)態(tài)變化[47]。Barkay等研究認(rèn)為,放線菌門對(duì)汞具有耐受性,主要與其含有耐汞基因(merA)有關(guān)[48]。變形菌門具有固氮、代謝和利用光合作用存儲(chǔ)能量的作用[49]。本研究中,變形菌門相對(duì)豐度在中等汞濃度最高,高汞濃度最低,可能與中度干擾或應(yīng)激假說有關(guān)[15]。由此可知,變形菌門對(duì)汞具有一定耐受性,當(dāng)汞濃度超過一定閾值,將導(dǎo)致其數(shù)量減少或者死亡。變形菌門的耐受能力可能有3個(gè)方面原因,一是汞可以被吸附在微生物活細(xì)胞或死細(xì)胞中,從而降低有效汞對(duì)其影響[43];二是變形菌門含有merA基因,merA編碼汞還原酶,可將汞離子還原為元素汞[50];三是通過外排系統(tǒng)擠出重金屬離子、通過含硫醇分子進(jìn)行分離以及還原為具有降低毒性的氧化狀態(tài)[51]。綠彎菌門含有綠色色素,具有降解纖維素作用,與地上生物量呈顯著正相關(guān)關(guān)系[52]。本研究綠彎菌門相對(duì)豐度隨汞濃度增加顯著降低,一方面可能由于地上蔬菜生物量總體隨汞濃度增加逐漸減少,土壤中纖維素減少,不利于綠彎菌門生長。另一方面,綠彎菌門中沒有脂質(zhì)外膜和專門的分泌系統(tǒng),對(duì)汞較敏感,其生長易受汞抑制[53]。
op de Beeck等研究表明,重金屬污染對(duì)土壤真菌群落結(jié)構(gòu)變化具有重要影響[54]。本研究子囊菌門、被孢菌門和擔(dān)子菌門為優(yōu)勢(shì)類群,與Zhang等研究結(jié)果[55]相似。子囊菌門被認(rèn)為是降解木質(zhì)纖維素的重要真菌,廣泛存在于農(nóng)田土壤。子囊菌門相對(duì)豐富隨汞脅迫加劇呈增加趨勢(shì),說明對(duì)高濃度汞污染具有更大耐受性,可能由于子囊菌為腐生菌,能降解土壤有機(jī)質(zhì)[56],在高汞濃度脅迫下土壤有機(jī)碳最多,從而有利于子囊菌門相對(duì)豐度增加。目前,關(guān)于子囊菌門對(duì)重金屬污染的應(yīng)激反應(yīng)機(jī)制研究較少。隨汞濃度增加,被孢菌門和擔(dān)子菌門相對(duì)豐度總體表現(xiàn)遞減趨勢(shì)。擔(dān)子菌門能適應(yīng)較低養(yǎng)分環(huán)境,具有降解纖維素和木質(zhì)素的能力[57]。汞濃度增加,土壤全氮和銨態(tài)氮等養(yǎng)分增加,蔬菜生物量減少,蔬菜殘?bào)w及木質(zhì)素較少,不利于擔(dān)子菌門生長。在重金屬脅迫下,擔(dān)子菌群酶活性受到抑制[58],也導(dǎo)致?lián)泳T相對(duì)豐度減少。
本研究通過RDA分析探討了土壤細(xì)菌和真菌群落與土壤理化性質(zhì)之間的相關(guān)性,揭示了微生物群落受特定土壤理化性質(zhì)的影響。土壤細(xì)菌和真菌群落與土壤pH值、銨態(tài)氮、硝態(tài)氮和總汞含量有顯著相關(guān)性。許多研究也表明,土壤pH值和重金屬含量對(duì)微生物群落結(jié)構(gòu)有顯著影響[31,59]。土壤pH值通過影響金屬離子溶解度和流動(dòng)性在土壤重金屬的積累中起著重要作用,決定土壤養(yǎng)分的生物有效性,同時(shí)H+與溶解金屬之間的配體競爭,導(dǎo)致重金屬遷移率和生物利用度增加[45]。Wen等研究表明,模擬酸雨可增加土壤溶液中重金屬可溶性含量,增加重金屬的環(huán)境風(fēng)險(xiǎn)[60]。一些敏感和耐受性菌群豐度隨土壤pH值增加而變化,土壤pH值通過影響重金屬形態(tài)和可用性,從而導(dǎo)致生態(tài)毒性的變化[61]。
低汞濃度處理提高了土壤細(xì)菌和hgcA基因數(shù)量。高汞濃度脅迫顯著降低了土壤細(xì)菌群落α多樣性指數(shù)。汞濃度越高,對(duì)微生物群落結(jié)構(gòu)影響越大,真菌對(duì)汞的敏感性弱于細(xì)菌。放線菌門和子囊菌門對(duì)汞污染具有耐受性,綠彎菌門和被孢菌門對(duì)汞污染敏感。低汞濃度對(duì)擔(dān)子菌門有促進(jìn)作用,中等汞濃度對(duì)變形菌門有促進(jìn)作用。土壤pH值、銨態(tài)氮、硝態(tài)氮和汞含量是影響土壤細(xì)菌和真菌群落變化的主要因素。然而,關(guān)于汞對(duì)蔬菜土壤細(xì)菌和真菌群落的影響機(jī)制需開展長期的定點(diǎn)和多蔬菜種類研究。
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收稿日期:2022-07-20
基金項(xiàng)目:貴州省教育廳自然科學(xué)項(xiàng)目(編號(hào):黔教合KY字[2020]163);銅仁學(xué)院博士科研啟動(dòng)基金(編號(hào):tyxyDH2002、tyxyDH1603);綠色農(nóng)藥與農(nóng)業(yè)生物工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放基金(編號(hào):黔教合KY字[2019]036);銅仁學(xué)院碩士點(diǎn)及學(xué)科建設(shè)研究子項(xiàng)目(編號(hào):trxyxwdxm-027);貴州省科技項(xiàng)目(編號(hào):黔科合SY字[2014]3035)。
作者簡介:王喜英(1981—),女,河南汝南人,碩士,講師,主要從事生物化學(xué)及生物信息學(xué)分析。E-mail:810315971@qq.com。
通信作者:趙 輝,博士,教授,主要從事土壤微生態(tài)及作物栽培研究。E-mail:yancao504@163.com。