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小葉苦丁枝條提取物的植物乳桿菌發(fā)酵代謝組分析

2023-08-22 08:05:12吳雨烔周禮紅方月月解文利
關(guān)鍵詞:小葉代謝物枝條

吳雨烔, 周禮紅*, 方月月, 解文利, 白 雪

(1. 貴州大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,貴州 貴陽(yáng) 550025;2. 貴州大學(xué) 農(nóng)業(yè)生物工程研究院,貴州 貴陽(yáng) 550025;3. 貴州大學(xué) 山地植物資源保護(hù)與保護(hù)種質(zhì)創(chuàng)新教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 貴州 貴陽(yáng) 550025;4. 貴州泰和現(xiàn)代生態(tài)農(nóng)業(yè)科技有限公司,貴州 遵義 564400)

我國(guó)擁有悠久的別樣茶飲用歷史,其中小葉苦丁最早載于《貴州民間方藥集》[1],由于其含咖啡因較少,口感層次豐富,飲后不影響睡眠,能清熱解毒,在夏季頗受人們喜愛(ài)。 小葉苦丁為木樨科植物,包括粗壯女貞、麗葉女貞、日本毛女貞等屬,本研究中貴州小葉苦丁屬粗壯女貞,在中國(guó)、孟加拉國(guó)、柬埔寨、越南均有分布。 其在我國(guó)分布頗廣,主要生長(zhǎng)在海拔400~2 000 m,分布地區(qū)主要有貴州、云南、四川、安徽南部等[2],其中貴州余慶縣及四川筠連縣產(chǎn)業(yè)規(guī)模較大。

小葉苦丁茶中黃酮、多酚、苯乙醇苷類等生物活性成分在各項(xiàng)研究中表現(xiàn)出優(yōu)異的藥理作用。 氧化應(yīng)激是衰老和許多疾病的誘因,會(huì)給細(xì)胞造成難以修復(fù)的損傷,而小葉苦丁茶在體外抗氧化模型和動(dòng)物模型中效果顯著[3]。 在Caco-2 細(xì)胞腸道模型中能有效保護(hù)細(xì)胞免受H2O2誘導(dǎo)的氧化應(yīng)激損傷[4],調(diào)節(jié)腸道微生態(tài),增強(qiáng)腸道屏障抵御能力,減輕腸道炎癥[5-6],而腸道微生態(tài)又通過(guò)腦腸軸與肥胖癥、糖尿病、心血管疾病等代謝失調(diào)類疾病相關(guān)聯(lián)。 研究還發(fā)現(xiàn),小葉苦丁茶能降低血糖濃度和預(yù)防高血壓[7]、降低血脂[8]和改善肥胖人群心血管疾病的相關(guān)指標(biāo)[9]、抑菌抗炎和抗腫瘤活性[10],可作為功能性食品開(kāi)發(fā)的原料、天然的食品添加劑和藥用成分的提取原料。

貴州省余慶縣小葉苦丁茶量大質(zhì)優(yōu),深受市場(chǎng)青睞,遠(yuǎn)銷日、法、東南亞,被稱為“中國(guó)小葉苦丁之鄉(xiāng)”。 2020 年,貴州省余慶縣小葉苦丁茶銷售產(chǎn)值超過(guò)5 億元,市場(chǎng)需求量超過(guò)6 500 t,在全國(guó)37個(gè)中大城市開(kāi)設(shè)了300 余個(gè)銷售網(wǎng)點(diǎn)[11]。 采茶后剩余的大量枝條一般作為廢料焚燒,環(huán)境不友好的同時(shí)還忽略了其可能存在的食用或者藥用價(jià)值。

作者前期研究發(fā)現(xiàn),小葉苦丁枝條在體外抗氧化模型中表現(xiàn)優(yōu)異,而抗氧化性與多種生理活性相關(guān)聯(lián), 表明小葉苦丁枝條中存在多種生理活性成分, 且小葉苦丁枝條活性成分水提率較為理想,同時(shí)提取后殘?jiān)捎糜谟袡C(jī)肥生產(chǎn)。 乳酸發(fā)酵可以提高基質(zhì)的生理活性和功能特性,作者所在實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)建立了植物乳桿菌發(fā)酵提取物的工藝,故采用植物乳桿菌對(duì)小葉苦丁枝條提取物進(jìn)行發(fā)酵, 通過(guò)LC-MS、NRM 非靶向代謝組研究其發(fā)酵前后物質(zhì)構(gòu)成和分布。

1 材料與方法

1.1 材料與儀器

1.1.1 材料與試劑 菌種:Lactobacillus plantarum LP-15,專利號(hào)ZL 2016 1 027815.9;小葉苦丁Ligustrum robustum(Rxob.) Blume 枝條:取自貴州省遵義市余慶縣,北緯27°16′29″,東經(jīng)107°48′19″;甲醇、乙腈:純度≥99.9%,Thermo 公司;2-氯苯丙氨酸: 純度98.5%,Aladdin 公司;甲酸:LC-MS 級(jí),TCI 公司;甲酸銨:純度≥99.9%,Sigma 公司;H2O:Milli-Q 公司。

1.1.2 儀器與設(shè)備 離心機(jī)H1850-R:湖南湘儀實(shí)驗(yàn)室儀器開(kāi)發(fā)有限公司;混勻儀QL-866:上海巴玖實(shí)業(yè)有限公司;真空濃縮儀5305:艾本德股份有限公司;濾膜0.22 μm PTFE:天津市津騰實(shí)驗(yàn)設(shè)備有限公司;液相色譜儀UltiMate 3000、質(zhì)譜儀Q Exactive Focus:賽默飛世爾科技公司。

1.2 方法

1.2.1 發(fā)酵樣品制備 枝條前處理:余慶縣的小葉苦丁枝條洗凈, 切成約2 cm 長(zhǎng)小段后烘干至恒質(zhì)量待用。

枝條水提物制備: 稱取200 g 枝條置于1 000 mL 蒸餾水中煮沸20 min,過(guò)濾,補(bǔ)齊蒸發(fā)水分至1 000 mL, 即得小葉苦丁枝條提取物。 提取物用100 mL 錐形瓶分裝,裝樣量為70 mL,在110 ℃下滅菌10 min, 取發(fā)酵前樣品, 編號(hào)LS1、LS2、LS3、LS4、LS5、LS6,記為GPLS1 組。

枝條水提物發(fā)酵方法:取作者所在實(shí)驗(yàn)室保藏菌種植物乳桿菌LP-15, 在斜面上活化2 次后用無(wú)菌水沖洗, 調(diào)整菌懸液OD600值為0.700±0.002,以10%的接種體積分?jǐn)?shù)接種于MRS 液體培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)24 h。 該種子液以5%的接種體積分?jǐn)?shù)接入上述滅菌提取液中,37 ℃下培養(yǎng)24 h, 取發(fā)酵后樣品,編號(hào)FLS1、FLS2、FLS3、FLS4、FLS5、FLS6,記為GPLS2 組。

1.2.2 代謝組檢測(cè)樣本制備 上述樣品分別取100 μL 加入400 μL 甲醇中, 振蕩混勻60 s,4 ℃下于12 000 r/min 離心10 min,取上清液進(jìn)行真空濃縮。所得樣品加入4 μg/g 的2-氯苯氨酸和體積分?jǐn)?shù)80%甲醇溶液120 μL 復(fù)溶, 經(jīng)0.22 μm 膜過(guò)濾后進(jìn)行代謝組檢測(cè)。

每個(gè)待測(cè)樣本各取20 μL 混合成質(zhì)量控制(quality control,QC)樣本,用于跟蹤校正信號(hào)漂移的情況,分別在數(shù)據(jù)采集過(guò)程中的開(kāi)始、過(guò)程中和結(jié)束時(shí)插入QC 樣本。

色譜條件: 采用ACQUITY HUPLC?HSS T3 1.8 μm(2.1 mm×150 mm)色譜柱,自動(dòng)進(jìn)樣溫度為8℃,流量0.25 mL/min,柱溫40 ℃,進(jìn)樣量2 μL,流動(dòng)相正離子為0.1 g/dL 甲酸水和0.1 g/dL 甲酸乙腈,負(fù)離子為5 mmol/L 甲酸銨水和乙腈,見(jiàn)表1。

表1 洗脫程序Table 1 Elution procedure

質(zhì)譜條件:電噴霧離子源電壓分別為正離子噴霧電壓3.5 kV,負(fù)離子噴霧電壓2.5 kV,鞘氣5.25 MPa,輔助氣1.75 MPa。 毛細(xì)管溫度325 ℃,以分辨率70 000 進(jìn)行全掃描,掃描范圍81~1 000,并采用HCD 進(jìn)行二級(jí)裂解,碰撞電壓為30 eV,同時(shí)采用動(dòng)態(tài)排除去除無(wú)必要的MS/MS 信息。

1.2.3 數(shù)據(jù)處理 使用Proteowizard 軟件將檢測(cè)到的原始數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成mzXML 格式后, 通過(guò)R 語(yǔ)言的XCMS 程序包進(jìn)行峰識(shí)別、峰過(guò)濾、峰對(duì)齊,得到包括質(zhì)核比和保留時(shí)間及峰面積等信息的數(shù)據(jù)矩陣;進(jìn)而得到正負(fù)離子模式下的前體分子,導(dǎo)出數(shù)據(jù)至excel, 使用R 語(yǔ)言MetaboanalystR 程序包3.0 版進(jìn)行主成分分析、偏最小二乘法判別分析等多元統(tǒng)計(jì)分析。

2 結(jié)果與分析

2.1 質(zhì)量控制

QC 樣本用于跟蹤和校正數(shù)據(jù)采集過(guò)程中產(chǎn)生的信號(hào)漂移,如圖1~2 所示,在正負(fù)離子模式下QC樣本均包含于95%置信區(qū)間內(nèi),聚集良好,說(shuō)明檢測(cè)方法穩(wěn)定,數(shù)據(jù)可靠。

圖1 正離子模式QC 樣本PCA 得分Fig. 1 PCA score of QC sample in positive ion mode

圖2 負(fù)離子模式QC 樣本PCA 得分Fig. 2 PCA score of QC sample in negative ion mode

2.2 主成分分析

通過(guò)主成分分析(principal component analysis,PCA),樣本自然聚集成明顯分離的2 組,即發(fā)酵前樣本組與發(fā)酵后樣本組, 與研究者的人為分組吻合。 樣本均被包含在95%的置信區(qū)間內(nèi),不存在離群值, 在66.7%的概率上解釋了小葉苦丁枝條提取物在植物乳桿菌發(fā)酵前后物質(zhì)變化上存在的差異。

2.3 偏最小二乘法判別分析

PCA 適用于組間差異大的情況,當(dāng)組間差異較小時(shí), 用偏最小二乘法判別分析 (Partial Least Squares Discriminant Analysis,PLS-DA)補(bǔ)充分析,可以更好地確定樣本關(guān)系。GPLS1 和GPLS2 樣品均包含于95%置信區(qū)間內(nèi),無(wú)離群值,兩組點(diǎn)云明顯分離,說(shuō)明發(fā)酵前后代謝物有顯著差異,Compnent1 能在54.7%的概率上解釋GPLS1 和GPLS2 的組間差異,Compnent1 和Compnent2 累計(jì)貢獻(xiàn)率為61.3%,見(jiàn)圖3。 用置換檢驗(yàn)n=100 來(lái)判斷PLS-DA 模型的區(qū)分效果,結(jié)果見(jiàn)圖4。觀測(cè)檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量在隨機(jī)分布右側(cè), 說(shuō)明對(duì)GPLS1 和GPLS2 的判別結(jié)果并不完全由隨機(jī)導(dǎo)致。 P>0.05,說(shuō)明模型判別效果不顯著,有必要進(jìn)行正交偏最小二乘法判別分析減少噪音干擾,見(jiàn)圖5。

圖3 PCA 得分圖Fig. 3 Score plot of PCA

圖4 PLS-DA 得分圖Fig. 4 Score plot of PLS-DA

圖5 PLS-DA 置換檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量分布及P 值Fig. 5 PLS-DA permutation test statistics distribution and P value

2.4 正交偏最小二乘法判別分析

與PLS-DA 結(jié)果一致,GPLS1 和GPLS2 所有樣本點(diǎn)均被包含于95%的置信區(qū)間內(nèi),無(wú)離群點(diǎn),2 組點(diǎn)云明顯分離, 在61.3%的概率上可以解釋2 組代謝物變化上的差異。交叉檢驗(yàn)R2Y=0.995,Q2=0.983,均接近于1,說(shuō)明模型穩(wěn)定可靠。對(duì)正交偏最小二乘判 別 分 析 (orthogonal partial least squares discrimination analysis,OPLS-DA) 模型 進(jìn) 行頻 次100 次的置換檢驗(yàn),結(jié)果見(jiàn)圖6~7。 觀測(cè)檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量位于隨機(jī)分布右尾后,且P<0.05,說(shuō)明OPLS-DA 模型能夠有效判別不同分組,小葉苦丁枝條發(fā)酵前后存在差異顯著的代謝物。

圖6 OPLS-DA 得分圖Fig. 6 Score plot of OPLS-DA

圖7 OPLS-DA 置換檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量分布及P 值Fig. 7 OPLS-DA permutation test statistics distribution and P value

2.5 單變量分析

多元分析結(jié)果顯示,GPLS1 和GPLS2 間存在顯著差異,單變量分析通過(guò)代謝物變化倍數(shù)來(lái)衡量差異的大小。 如圖8 所示, 粉色點(diǎn)代表了變化倍數(shù)(fold change,FC)絕對(duì)值大于2 且P<0.05 的代謝物,這些代謝物在發(fā)酵前后變化較大,發(fā)酵后顯著上調(diào)的代謝物106 種,顯著下調(diào)的代謝物92 種。 為了篩選出重要代謝物并直觀顯示其發(fā)酵前后的變化,以FC≥2 或FC≤0.5 且P<0.05 為標(biāo)準(zhǔn),篩選出單維統(tǒng)計(jì)排名前25 的代謝物作箱式圖,見(jiàn)圖9。 發(fā)酵后相對(duì)含量大幅度上調(diào)的16 種,下調(diào)的9 種,這些代謝物在GPLS1 組和GPLS2 組的組間差異極顯著。

圖8 變化倍數(shù)火山圖Fig. 8 A volcano map of multiple variations

圖9 TOP 25 代謝物差異箱式圖Fig. 9 Box plot of top 25 differential metabolites

2.6 差異代謝物篩選

根據(jù)OPLS-DA 的分析結(jié)果,變量重要性(value importance in projection)VIP>1 且P<0.05 的代謝物共286 種, 這286 種代謝物對(duì)OPLS-DA 判別結(jié)果有重要作用。 為了進(jìn)一步篩選差異顯著的代謝物,結(jié)合OPLS-DA 和單變量分析結(jié)果, 以FC≥2 或FC≤0.5 且P<0.05、VIP>1 為指標(biāo),共篩選出175 種代謝物, 其中顯著上調(diào)的100 種, 顯著下調(diào)的75種, 篩選出單維統(tǒng)計(jì)排名前25 的代謝物作為差異較大的代謝物,見(jiàn)表1。 其中肽類3 種,碳水化合物1 種,核酸類4 種,脂類1 種,有機(jī)酸1 種,黃酮類1種,其他14 種。慶大霉素C1a、川皮苷、鵝肌肽、莽草酸分別上調(diào)22 672 倍、915 倍、11 倍、20 倍;普魯卡因、尿嘧啶、奧西那林分別下調(diào)33 倍、16 倍、15 倍。

表1 TOP 25 代謝物Table 1 Top 25 metabolites

2.7 代謝通路分析

上述篩選出的差異代謝物作為關(guān)鍵代謝物通過(guò)富集分析和拓?fù)浞治龅玫?1 條差異顯著的代謝通路,其中氨基酸代謝通路6 條,說(shuō)明發(fā)酵過(guò)程中氨基酸代謝相關(guān)物質(zhì)前后變化較為豐富。 如圖10藍(lán)色區(qū)域所示,在顯著富集的前11 條通路中:丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代謝的氣泡最大,通路中關(guān)鍵代謝物包括L-谷氨酰胺,琥珀酸半醛等;其次是β-丙氨酸代謝通路,關(guān)鍵代謝物包括差異代謝物鵝肌肽、尿嘧啶等。 苯丙氨酸代謝包括苯乙醇、富馬酸等;絡(luò)氨酸代謝包括富馬酸、4-羥基苯乙醇、琥珀酸鹽等; 泛酸鹽和輔酶A 的生物合成包括尿嘧啶、L-纈氨酸、維生素B5等。苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成包括莽草酸、L-苯丙氨酸、L-色氨酸等。TCA 循環(huán)是好氧生物體內(nèi)各大代謝的重要樞紐部分,包括差異代謝物富馬酸、順烏頭酸等;氮素代謝的關(guān)鍵代謝物包括L-谷氨酰胺、 一磷酸腺苷等;精氨酸和脯氨酸代謝通路中包括了顯著差異的代謝物L(fēng)-谷氨酰胺、2-琥珀酰-L-谷氨酸-5-半醛、胍丁胺等; 亞油酸代謝包括γ-亞麻酸、12,13-DHOME等;丁酸鹽代謝途徑包括關(guān)鍵代謝物富馬酸、琥珀酸等。

圖10 代謝通路富集分析和拓?fù)浞治鯢ig. 10 Enrichment analysis and topology analysis of metabolic pathway

3 討 論

通過(guò)LC-MS 非靶向代謝組檢測(cè)手段, 共檢測(cè)出代謝物543 種,其中多肽類相對(duì)含量在發(fā)酵后由32.5%增加至70.8%; 碳水化合物由39.2%減少至7.8%;有機(jī)酸發(fā)酵前為9.4%,發(fā)酵后為9.1%;核酸由7.9%下調(diào)至1.9%; 維生素和輔酶類發(fā)酵前為5.6%,發(fā)酵后為3.6%;脂類在發(fā)酵前為4.2%,發(fā)酵后為2.6%; 類固醇發(fā)酵前為0.63%, 發(fā)酵后升高到4.3%;激素由0.046%降至0.023%。

發(fā)酵后小肽相對(duì)含量大幅增加,通過(guò)微生物發(fā)酵產(chǎn)生的小肽可能表現(xiàn)出一系列親代蛋白質(zhì)不具有或效果一般的生理活性:如抗氧化活性、降低血液膽固醇、血管緊張素Ⅰ抑制活性[12]、α-葡萄糖苷酶和α-淀粉酶抑制作用[13],有在體內(nèi)拮抗炎癥、多種心腦血管疾病、糖尿病的潛能。 肽類中鵝肌肽、L-亮氨酸、L-谷氨酰胺被鑒定為差異代謝物。 鵝肌肽是一種組氨酸二肽,能有效降低高尿酸血癥小鼠的尿酸水平[14],具有抗氧化活性,人體補(bǔ)充鵝肌肽對(duì)促進(jìn)健康有著積極作用[15]。L-亮氨酸是人體必需的21 種氨基酸之一,參與調(diào)節(jié)氨基酸和蛋白質(zhì)代謝、改善糖代謝和脂代謝紊亂[16-17]。 L-谷氨酰胺雖然是非必需氨基酸,但其參與蛋白質(zhì)代謝,能夠有效減輕腸道炎癥和氧化應(yīng)激[18]。 植物乳桿菌的生理代謝活動(dòng)消耗碳源,碳水化合物的相對(duì)含量大幅下降,產(chǎn)生有機(jī)酸。 有機(jī)酸是發(fā)酵后枝條酸味的來(lái)源,代謝物中檢測(cè)到L-蘋(píng)果酸、富馬酸、順烏頭酸、沒(méi)食子酸、奎尼酸等,研究表明有機(jī)酸具有多種生物活性[19]。鑒定到的有機(jī)酸中,順烏頭酸為三羧酸循環(huán)的中間產(chǎn)物, 莽草酸是芳香族類物質(zhì)生物合成途徑的中間體,連接糖代謝和多酚代謝[20],具有抗炎、鎮(zhèn)痛、抗血栓作用[21]。核酸相對(duì)含量明顯下調(diào),差異代謝物中幾種核酸類物質(zhì)降低倍數(shù)超過(guò)2 倍,核苷酸參與體內(nèi)許多代謝,嘌呤最終代謝物尿酸升高是疾病的生化基礎(chǔ)。 25 種差異代謝物中,川皮苷變化倍數(shù)為915倍,川皮苷是一種黃酮類脂分子,苦味化合物,具有抗氧化、抗炎、抗癌[22]及神經(jīng)保護(hù)作用[23]。 γ-亞麻酸變化倍數(shù)為9 倍,同樣具有抗炎、抗氧化、降低血糖[24-25]等一系列生理活性。 2-苯乙醇是一種芳香化合物,有苦味、花卉味、蜂蜜味,與糖結(jié)合形成苯乙醇苷類,苯乙醇苷類具有很強(qiáng)的生物活性如抗氧化性[26]。

4 結(jié) 語(yǔ)

通過(guò)對(duì)植物桿乳桿菌發(fā)酵小葉苦丁枝條前后的代謝物進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)發(fā)酵前后代謝物差異顯著,說(shuō)明發(fā)酵改變了小葉苦丁枝條提取物的物質(zhì)構(gòu)成, 提高了某些生理活性代謝物的相對(duì)含量。而抗生素慶大霉素C1a 與林可霉素及其他藥用成分的大幅增加,也為植物乳桿菌發(fā)酵小葉苦丁枝條提取物的安全問(wèn)題帶來(lái)了不確定性。 作者初步分析了小葉苦丁枝條提取物發(fā)酵前后的差異組成,證明了乳酸菌發(fā)酵對(duì)小葉苦丁枝條的資源化利用是可行的,而慶大霉素C1a 等成分帶來(lái)的安全風(fēng)險(xiǎn)和川皮苷等幾種生物活性成分精確定量還需要進(jìn)一步的評(píng)估和研究。

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