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深度學(xué)習(xí)技術(shù)結(jié)合MRI 在前列腺癌中的應(yīng)用

2023-08-16 12:38吳翰昌邊云邵成偉
關(guān)鍵詞:前列腺癌前列腺神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)

吳翰昌,邊云,邵成偉

前列腺癌是男性最常見(jiàn)的泌尿生殖系統(tǒng)腫瘤。有文獻(xiàn)[1]報(bào)道,2023 年全球前列腺癌的預(yù)期發(fā)病率將居第1 位,死亡率居第2 位。盡管亞洲的前列腺癌發(fā)病率顯著低于歐美國(guó)家,但發(fā)病趨勢(shì)正逐漸接近發(fā)達(dá)國(guó)家[2]。多參數(shù)MRI(multiparametric MRI,mpMRI)目前是前列腺癌診斷中應(yīng)用最廣泛的影像學(xué)方法,但其僅限于識(shí)別惡性程度較高的臨床顯著前列腺癌(clinically significant prostate cancer,csPCa),難以發(fā)現(xiàn)非臨床顯著前列腺癌(non-clinically significant prostate cancer,ncsPCa),而且在診斷csPCa時(shí)常常會(huì)忽視其子病灶[3],也難以對(duì)前列腺癌的惡性程度有效分級(jí)。傳統(tǒng)的影像分析方法在前列腺癌的精準(zhǔn)治療上遇到了瓶頸問(wèn)題,而近年來(lái)人工智能(artificial intelligence,AI)技術(shù)迅猛發(fā)展,有諸多研究對(duì)這些問(wèn)題進(jìn)行了探索[4-5]。

深度學(xué)習(xí)是AI 領(lǐng)域的一個(gè)重要分支,其最主要的研究方法是利用計(jì)算機(jī)模擬人腦數(shù)十億個(gè)神經(jīng)元,通過(guò)函數(shù)代替神經(jīng)元構(gòu)建人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),自動(dòng)對(duì)輸入數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,總結(jié)數(shù)據(jù)的高維特征和規(guī)律。在現(xiàn)實(shí)生活中,以神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)為代表的深度學(xué)習(xí)技術(shù),已經(jīng)廣泛應(yīng)用于人臉識(shí)別、自動(dòng)駕駛等領(lǐng)域。在訓(xùn)練一個(gè)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的過(guò)程中,需要將同一個(gè)訓(xùn)練集樣本的輸入、輸出模式反復(fù)作用于模型,神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)能夠按照一定的規(guī)則自動(dòng)調(diào)節(jié)神經(jīng)元之間的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)和連接強(qiáng)度,使最終輸出值滿(mǎn)足要求,隨后在進(jìn)一步的訓(xùn)練集中不斷迭代升級(jí),神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)最核心的特征就是“學(xué)習(xí)”,數(shù)據(jù)量越大,識(shí)別效果越好。在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域應(yīng)用的探索中,影像科的海量圖像數(shù)據(jù)正好契合了深度學(xué)習(xí)技術(shù)的使用場(chǎng)景。卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(convolutional neural network,CNN)是深度學(xué)習(xí)中最具代表性的一類(lèi)模型,先后誕生了AlexNet、GoogLeNet、ResNet、DeepLab 等諸多不同結(jié)構(gòu)的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),與此相似的還有以U-net 為代表的全卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),都在醫(yī)學(xué)影像的應(yīng)用中逐步迭代,逐步進(jìn)入臨床實(shí)踐。目前,深度學(xué)習(xí)技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用于臨床,在前列腺的研究中有較多的成果,但也存在諸多局限,本文就目前該技術(shù)在前列腺癌中的研究現(xiàn)狀予以綜述。

1 前列腺影像的自動(dòng)分割

由于前列腺的體積小,其病灶和分區(qū)關(guān)系密切,故準(zhǔn)確自動(dòng)器官分割對(duì)于臨床研究具有重要價(jià)值。臨床上經(jīng)常需要根據(jù)前列腺的體積、分區(qū)和病灶位置制定放療計(jì)劃,同時(shí)靶向活檢穿刺等也需要明確、清晰的前列腺病灶分割。單純手動(dòng)操作費(fèi)時(shí)、費(fèi)力且一致性較差[6-7],如果AI 技術(shù)能自動(dòng)化地幫助醫(yī)生處理圖像,將極大地減少臨床工作量。

Zhu 等[8]共納入163 例前列腺穿刺病人的T2WI及擴(kuò)散加權(quán)成像(DWI)影像數(shù)據(jù),建立了級(jí)聯(lián)Unet 模型,訓(xùn)練2 個(gè)模型分別識(shí)別前列腺全腺體和外周帶,再將兩者識(shí)別結(jié)果綜合分析獲得最終的外周帶分區(qū),對(duì)前列腺全腺體輪廓識(shí)別的Dice 相似系數(shù)(dice similarity coefficient, DSC)達(dá)到92.7%,外周帶DSC 為79.3%。Cuocolo 等[9]在U-net 的基礎(chǔ)上,還比較了高效神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(efficient neural network,ENet)以及高效殘差分解卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(efficient residual factorized ConvNet,ERFNet)這兩種語(yǔ)義分割網(wǎng)絡(luò)的性能,利用開(kāi)源數(shù)據(jù)集ProstateX[10]建立模型,輸入T2WI 識(shí)別前列腺全腺體和移行帶,并將兩者之差判定為外周帶,結(jié)果發(fā)現(xiàn)ENet 模型效果最好,實(shí)現(xiàn)分割整個(gè)前列腺腺體的DSC 為91%,移行帶為87%,外周帶為71%。Bardis 等[11]對(duì)242 例前列腺癌病人的數(shù)據(jù)進(jìn)行研究,建立3 個(gè)U-net 模型分別用于前列腺的初步定位,識(shí)別前列腺的全腺體、移行帶和外周帶,結(jié)果顯示識(shí)別全腺體DSC 為94%,移行帶91.4%,外周帶77.6%。

2 前列腺癌病灶的檢測(cè)

歐洲泌尿放射學(xué)會(huì)依據(jù)mpMRI 制定的結(jié)構(gòu)化前列腺影像報(bào)告和數(shù)據(jù)系統(tǒng)(prostate imaging reporting and data system version, PI-RADS) v2.1 版評(píng)分細(xì)則是目前公認(rèn)的評(píng)估csPCa 的最優(yōu)標(biāo)準(zhǔn)[12],其診斷敏感度、特異度可以達(dá)到87%、74%[13]。但診斷可靠性依賴(lài)腫瘤的大小和惡性程度,尤其是對(duì)于ncsPCa 診斷效能極其有限[14-15],因此前列腺穿刺活檢術(shù)仍然是診斷所必須的流程。但在諸多大樣本研究中,前列腺活檢的陽(yáng)性檢出率均不超過(guò)50%[16-17],有近50%的病人接受了不必要的有創(chuàng)檢查,因此臨床上急需一種無(wú)創(chuàng)的工具進(jìn)一步優(yōu)化診斷流程。如果深度學(xué)習(xí)技術(shù)結(jié)合MRI 能夠建立模型自動(dòng)檢測(cè)病灶,既可以避免不必要的有創(chuàng)操作,也可以為靶向穿刺提供依據(jù),提高陽(yáng)性率的同時(shí)大幅度減少有創(chuàng)操作帶來(lái)的術(shù)后并發(fā)癥。

Schelb 等[18]納 入312 例 病 人T2WI、DWI 訓(xùn) 練U-net 模型,能識(shí)別腫瘤并生成概率圖,在計(jì)算前列腺癌的概率≥0.33 時(shí),檢測(cè)全部病灶的敏感度、特異度分別為45%、79%,與PI-RADS≥4 分評(píng)估效能相仿(55%、80%)。Sanford 等[19]利用ResNet50 在687例病人中建立5 分制分類(lèi)器模型,輸入T2WI、DWI、表觀擴(kuò)散系數(shù)(ADC)、動(dòng)態(tài)增強(qiáng)(dynamic contrast enhanced,DCE)的數(shù)據(jù),該模型基于醫(yī)生標(biāo)注預(yù)測(cè)PI-RADS 評(píng)分,與PI-RADS 評(píng)分的一致性為58%;模型評(píng)價(jià)為5 分時(shí)與PI-RADS 評(píng)分的一致性為80%,但陽(yáng)性預(yù)測(cè)值(92%)高于PI-RADS 評(píng)分(89%)。然而,該模型依賴(lài)醫(yī)生的手動(dòng)勾畫(huà),缺乏自動(dòng)檢測(cè)病灶的能力。

在此基礎(chǔ)上,Mehralivand 等[20]創(chuàng)新性設(shè)計(jì)了一個(gè)3D U-net 和3D ResNet34 結(jié)合的級(jí)聯(lián)模型,納入1 390 例病人,能夠以T2WI、DWI 為輸入組,同時(shí)實(shí)現(xiàn)自動(dòng)檢測(cè)病灶并對(duì)病灶進(jìn)行分類(lèi)2 個(gè)步驟。模型評(píng)分與醫(yī)生的總體一致性為30.8%,在分類(lèi)為5 分時(shí)一致性能夠達(dá)到52.5%,模型與醫(yī)生一致評(píng)估病灶為陽(yáng)性時(shí),陽(yáng)性預(yù)測(cè)值可以達(dá)到82.3%。盡管缺少全部的病理驗(yàn)證,且模型評(píng)分與醫(yī)生評(píng)分之間的一致性較差,但該研究結(jié)合2 種神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)建立了連貫的病灶檢測(cè)并分類(lèi)的模型,更符合真實(shí)世界臨床應(yīng)用。而且三維神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)能從二維圖像中提取三維特征,更好地分析病變的整體空間結(jié)構(gòu)。Arif 等[21]在符合主動(dòng)監(jiān)測(cè)條件的292 例ncsPCa 病人中,建立3DCNN 模型,輸入T2WI、ADC、DWI 數(shù)據(jù)識(shí)別csPCa。該模型可以識(shí)別體積最小為0.03 cm3的病灶,并且在體積>0.5 cm3的病灶時(shí),其敏感度、特異度、受試者操作特征曲線下面積(AUC)分別為94%、74%、0.89。盡管該研究納入病人存在選擇偏倚,缺乏高級(jí)別前列腺癌數(shù)據(jù)支持,但仍表現(xiàn)出良好的檢測(cè)效能。

在利用深度學(xué)習(xí)方法結(jié)合mpMRI 建立前列腺癌病灶檢測(cè)模型的過(guò)程中,由于方法學(xué)、金標(biāo)準(zhǔn)和病人群體的差異,直接比較已發(fā)表的模型之間的效能是困難的;而開(kāi)源數(shù)據(jù)集ProstateX 包含了詳盡的病人基線信息及完備的病理資料,包括DCE 序列容積轉(zhuǎn)移常數(shù)(Ktrans),可以支持多種研究之間進(jìn)行比較。同樣是基于ProstateX,Aldoj 等[22]利用3D-CNN建模發(fā)現(xiàn)以ADC+DWI+Ktrans的組合可以達(dá)到最高診斷效能(AUC 值0.897);而Pellicer-Valero 等[23]建立的3D Retina U-Net 模型則顯示T2WI+ADC+DWI+Ktrans的輸入組合最佳,實(shí)現(xiàn)在測(cè)試集中識(shí)別全部病灶的敏感度、特異度、AUC 分別為94.1%、78.8%、0.898。這些研究也提示,深度學(xué)習(xí)構(gòu)建的模型可能超越傳統(tǒng)的診斷思維,能更加有效地結(jié)合不同序列中的信息做出綜合診斷,而具體哪些序列的數(shù)據(jù)和算法結(jié)合是最有效的,還需要更多的探索。深度學(xué)習(xí)技術(shù)不斷推出新的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),其部分模型對(duì)于病灶檢測(cè)的準(zhǔn)確度,尤其對(duì)csPCa 的評(píng)估,甚至能超過(guò)PI-RADS 的評(píng)估效能。目前對(duì)這些模型的穩(wěn)定性和普適性還缺乏驗(yàn)證,但前景值得期待。

3 前列腺癌Gleason 分級(jí)評(píng)估

Gleason 評(píng)分能直觀地評(píng)價(jià)前列腺癌的惡性程度,是評(píng)估病人預(yù)后和指導(dǎo)治療方案的決定性因素。2014 年國(guó)際泌尿病理協(xié)會(huì)結(jié)合病理和預(yù)后提出了新的Gleason 分級(jí)分組系統(tǒng)(Grade Groups,GG),用1—5 組定義前列腺癌的惡性程度。GG=1 組的病灶對(duì)應(yīng)ncsPCa;GG≥2 組的病灶則對(duì)應(yīng)csPCa。分組越高,惡性程度越高。目前前列腺穿刺活檢仍是GG 評(píng)估的唯一方式,但活檢為有創(chuàng)性且存在難以避免的選擇偏倚,與前列腺全切術(shù)后病理一致性也僅為54%[24]。而影像學(xué)可無(wú)創(chuàng)地對(duì)器官做出全面評(píng)估,并且一些研究也通過(guò)分析病理影像特征、前瞻性隊(duì)列研究等方法證明了mpMRI 與Gleason 評(píng)分的相關(guān)性[25-27],但還不能成為預(yù)測(cè)Gleason 評(píng)分的方法。深度學(xué)習(xí)技術(shù)能夠結(jié)合MRI 多個(gè)序列并挖掘影像的高維特征,在建立預(yù)測(cè)模型方面有明顯優(yōu)勢(shì),為預(yù)測(cè)基于mpMRI 的Gleason 評(píng)分提供了新思路。

Khosravi 等[28]開(kāi)發(fā)了基于GoogLeNet 的模型,研究顯示鑒別GG=1 組和GG≥2 組的病灶A(yù)UC 為0.78,區(qū)分GG≥4 組和GG=1 組病灶的AUC 為0.86。Aldoj 等[22]基于多通道3D CNN 進(jìn)行分析,利用開(kāi)源數(shù)據(jù)集ProstateX 建立前列腺癌的分類(lèi)器,研究顯示區(qū)分GG≥2 組和GG=1 組的病灶的敏感度、特異度、AUC 分別為81.9%、86.1%、0.897。

單獨(dú)的前列腺癌GG 分組在神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中是一個(gè)分類(lèi)任務(wù),但需要匹配檢測(cè)病灶的功能,才可以實(shí)現(xiàn)自動(dòng)評(píng)估。Duran 等[29]以U-net 為骨架提出了ProstAttention-Net,實(shí)現(xiàn)端到端的前列腺分割、病灶檢測(cè)及GG 分組評(píng)估,在公開(kāi)數(shù)據(jù)集ProstateX-2 實(shí)現(xiàn)對(duì)GG 分組的Kappa 一致性評(píng)分為0.418。Cao 等[30]提出一個(gè)以DeepLab-ResNeT101 為骨架的Focal-Net,依據(jù)417 例病人的前列腺切除術(shù)后病理及T2WI、DWI 數(shù)據(jù)建模,該模型同樣能夠?qū)崿F(xiàn)自動(dòng)檢測(cè)病灶并生成GG 分組1—5 組的概率圖,鑒別GG≥2 組和GG=1 組的病灶A(yù)UC 值為0.81,GG≤2組和GG≥3 組的AUC 值0.79,但對(duì)GG>3 組病灶的鑒別效能欠佳。另外,Pellicer-Valero 等[23]提出的3D Retina U-Net 模型,能夠?qū)崿F(xiàn)在病灶檢測(cè)的基礎(chǔ)上同時(shí)對(duì)病灶予以GG 分組,這將是未來(lái)研究的主要趨勢(shì)。然而,GG 分組在活檢取材和評(píng)估過(guò)程中具有隨機(jī)性和主觀性,而前列腺癌又有多灶性的特點(diǎn),對(duì)于如何獲得更準(zhǔn)確的病理結(jié)果并與影像相對(duì)應(yīng),值得進(jìn)一步研究。

4 前列腺癌預(yù)后預(yù)測(cè)及療效評(píng)估

深度學(xué)習(xí)技術(shù)在諸多腫瘤領(lǐng)域都已用于術(shù)后療效評(píng)估、預(yù)后預(yù)測(cè)、治療方案選擇等,在前列腺癌的治療中結(jié)合MRI 研究也是一個(gè)新的熱點(diǎn)。

根治性前列腺切除術(shù)(radical prostatectomy,RP)是局限性前列腺癌治療的標(biāo)準(zhǔn)方法,但手術(shù)后10 年內(nèi)約有27%的病人會(huì)發(fā)生生化復(fù)發(fā)(biochemical recurrence,BCR)[31]。BCR 預(yù)示著術(shù)前可能有潛在的轉(zhuǎn)移癌細(xì)胞未能發(fā)現(xiàn),對(duì)于這部分病人及早進(jìn)行干預(yù)對(duì)其總體生存期至關(guān)重要。Zhong 等[32]研究91 例RP 術(shù)后病人(29 例發(fā)生BCR),利用Inception-ResNet-v2 輸入T1WI、T2WI、DWI 序列的組合,提取了1 536 個(gè)影像組學(xué)特征和45 個(gè)組學(xué)標(biāo)簽,模型在測(cè)試集中預(yù)測(cè)BCR 發(fā)生的準(zhǔn)確度為50.0%,預(yù)測(cè)BCR 未發(fā)生的準(zhǔn)確度為86.1%,測(cè)試集的總體分類(lèi)準(zhǔn)確度為74.1%。Yan 等[33]納入485 例RP 術(shù)后的病人,基于T2WI 提取并最終選擇了155 個(gè)影像組學(xué)特征,用深度學(xué)習(xí)生存分析構(gòu)建預(yù)測(cè)BCR 的模型,可實(shí)現(xiàn)預(yù)測(cè)無(wú)BCR 生存期的一致性指數(shù)為0.802,在預(yù)測(cè)BCR 3 年、5 年發(fā)生率中,AUC 值分別為0.84、0.83。在與其他傳統(tǒng)預(yù)測(cè)方法的比較中,該模型可以顯著降低假陽(yáng)性率,使近1/3 的病人避免過(guò)度治療。

利用深度學(xué)習(xí)方法對(duì)腫瘤的治療反應(yīng)進(jìn)行建模預(yù)測(cè),常見(jiàn)于各種腫瘤的研究。內(nèi)分泌聯(lián)合根治性放療治療局限性前列腺癌的療效與RP 的結(jié)果相似[34]。也有一些研究者[35-36]基于機(jī)器學(xué)習(xí)方法對(duì)放療反應(yīng)進(jìn)行評(píng)估,但還未結(jié)合深度學(xué)習(xí)的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行研究。如果深度學(xué)習(xí)技術(shù)結(jié)合MRI 產(chǎn)生的智能影像能對(duì)前列腺癌的治療反應(yīng)做出評(píng)估以及預(yù)后預(yù)測(cè),對(duì)制定個(gè)性化治療方案意義重大。

5 小結(jié)與展望

mpMRI 診斷前列腺癌的優(yōu)勢(shì)明顯,PI-RADS 評(píng)分系統(tǒng)診斷效能穩(wěn)定,但在臨床應(yīng)用中仍存在一些局限,用傳統(tǒng)方法難以解決。深度學(xué)習(xí)技術(shù)在醫(yī)學(xué)影像領(lǐng)域應(yīng)用極其廣泛,神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在不斷迭代優(yōu)化中,基于各種神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)建立的模型也可以通過(guò)輸入數(shù)據(jù)不斷學(xué)習(xí),識(shí)別圖像的準(zhǔn)確率可以持續(xù)提升。目前,深度學(xué)習(xí)結(jié)合MRI 的研究已經(jīng)深入到前列腺癌診治中的各個(gè)步驟,尤其是不考慮條件、費(fèi)用的前提下,mpMRI 也是極佳的前列腺篩查工具[37]。如果AI 診斷技術(shù)逐步成熟,能夠在工作中輔助醫(yī)生批量處理圖像,在精確診斷的同時(shí)大幅度地減少醫(yī)生的工作量,將會(huì)大幅度優(yōu)化影像醫(yī)學(xué)的應(yīng)用。但目前的研究還存在諸多挑戰(zhàn),包括影像結(jié)果缺乏病理金標(biāo)準(zhǔn)的對(duì)照,如何在神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中處理多序列數(shù)據(jù)的問(wèn)題,多中心、多種掃描設(shè)備、掃描協(xié)議造成的數(shù)據(jù)多樣性等問(wèn)題,也導(dǎo)致多數(shù)研究的結(jié)果穩(wěn)定性、普適性欠佳。而且大部分基于深度學(xué)習(xí)建立的模型,需要醫(yī)生手動(dòng)勾畫(huà)興趣區(qū),這個(gè)過(guò)程耗時(shí)耗力,也限制其進(jìn)一步臨床應(yīng)用。在今后的研究中,隨著深度學(xué)習(xí)算法和MR 技術(shù)的進(jìn)步,可為前列腺癌的進(jìn)一步研究提供更多可能。

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