王曉歐,王錦院,舒曠怡,游暢,胡榕,王錦樂,林素珍,李姍姍,江明華
溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院育英兒童醫(yī)院 臨床檢驗中心,浙江 溫州 325027
纖維蛋白原(fibrinogen, Fg)在止血中起核心作用,它是血小板聚集的支持物,纖維蛋白轉(zhuǎn)化的底物,纖維蛋白溶解和傷口愈合的支架[1]。遺傳性異常纖維蛋白原血癥(congenital dysfibrinogenemia, CD)是編碼Fg的基因(FGA、FGB和FGG)缺陷引起的一種臨床上可表現(xiàn)為自發(fā)性出血或血栓形成的罕見遺傳性血液病[2-3],部分患者有肺動脈高壓等癥狀。有研究[3]顯示,CD患者中42%的人有出血現(xiàn)象,在外傷或合并其他相關(guān)凝血系統(tǒng)異常的患者中,出血情況尤為嚴(yán)重。因大多數(shù)無癥狀的CD患者被漏診或未被報道,該病在人群中發(fā)病率尚無具體統(tǒng)計資料[4]。大約一半的CD病例中,偶然發(fā)現(xiàn)是最常見的診斷方式[5-7]。筆者對1個CD家系進行了臨床特征和遺傳學(xué)分析,現(xiàn)報告如下。
1.1 對象 先證者,男,20歲,因“機器碾壓傷致右手2-4掌骨多發(fā)粉碎性開放性骨折伴活動受限3 h”入院進行手術(shù)治療,術(shù)前凝血檢查發(fā)現(xiàn)凝血酶時間(thrombin time, TT)(22.0 s)延長,F(xiàn)g(0.91 g/L)活性下降?;颊呒韧鶡o自發(fā)出血史或血栓傾向史,無肝腎病史及臨床藥物過敏史。家系調(diào)查發(fā)現(xiàn)先證者母親月經(jīng)量多、時間長,輕傷后出血難止,其父親和弟弟表現(xiàn)無殊,父母非近親結(jié)婚,系譜圖見圖1。本研究通過溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院倫理委員會審批(批準(zhǔn)號LW2018-11),所有家系成員均簽署知情同意書。
圖1 CD家系圖
1.2 方法
1.2.1 常規(guī)出凝血指標(biāo)和生化功能檢測:用枸櫞酸鈉抗凝管采集先證者及家系成員外周血各2.7 mL,供凝血指標(biāo)及基因檢測用;生化促凝管采集各2 mL,用于血清肝功能及腎功能檢測。法國Stago STA-R全自動血凝儀檢測Fg活性(Clauss法)、TT、部分活化凝血活酶時間(activated partial thromboplastin time, APTT)、血漿凝血酶原時間(prothrombin time, PT)、纖維蛋白(原)降解產(chǎn)物[fibrin(ogen) degradation products, FDPs]、D二聚體(D-dimer, D-D),采用配套試劑盒進行檢測;德國Siemens ADVIA2400型生化分析儀檢測Fg抗原(試劑盒購自上海太陽生物技術(shù)有限公司)和肝、腎功能。
1.2.2 Fg基因檢測:用基因組DNA提取試劑盒(購自美國Axygen公司)對4個家系成員外周血進行基因組DNA的提?。灰镉缮虾Iど锕こ逃邢薰緟⒄瘴墨I[8]進行設(shè)計合成,涵蓋Fg 3個編碼基因(FGA、FGB、FGG)所有外顯子及側(cè)翼序列,引物序列見表1。用DNA擴增試劑盒(購自大連寶生物工程有限公司)將待檢標(biāo)本在ECT-811 PCR擴增儀(購自廣州合眾生物科技股份有限公司)進行擴增。PCR產(chǎn)物送杭州擎科生物技術(shù)有限公司進行純化、測序,將測序結(jié)果通過Mutation Surveyor軟件與參考序列進行比對,發(fā)現(xiàn)基因變異位點后再次進行正、反向測序確認(rèn)并家系驗證。
表1 FGA、FGB和FGG三個基因的引物序列
1.2.3 生物信息學(xué)軟件分析:用PolyPhen-2、Mutation Taster和PROVEAN 3個變異位點有害性預(yù)測軟件評估變異位點對Fg功能的影響程度,當(dāng)3種軟件均預(yù)測同一遺傳變異對Fg的功能影響較大時,認(rèn)定該遺傳變異具有高危害性。用PyMol軟件建模分析變異前后Fg的分子三維結(jié)構(gòu),推測此變異對Fg功能的影響;用同源性分析軟件Clustal X對Fg γ鏈氨基酸序列進行保守性比對;用I-Mutant Suite軟件分析單點變異對Fg穩(wěn)定性的影響。
1.2.4 血栓彈力圖評估Fg功能:按照血栓彈力圖凝血分析儀(美國血液技術(shù)公司, Hemostasis Analyzer TEG 5000)標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程,模擬人體內(nèi)凝血過程,檢測家系成員相關(guān)參數(shù),監(jiān)測凝血和纖維蛋白溶解整個過程中血凝塊的動態(tài)變化,反映全血的凝血和纖溶能力,其中凝塊形成時間(K)和凝固角(Angle)主要反映Fg的功能和水平,綜合凝血指數(shù)(CI)反映機體處于低凝或高凝狀態(tài)。
2.1 臨床表型檢測 在先證者Fg:C 顯著降低(0.91 g/L)而Fg:Ag正常(3.20 g/L),F(xiàn)g:C/Fg:Ag<0.7,TT(22.0 s)延長且不能被硫酸魚精蛋白校正;PT、APTT、FDPs、D-D均在正常范圍內(nèi),肝腎功能無異常,排除了抗凝系統(tǒng)和繼發(fā)因素的影響。其母、弟弟與先證者檢測結(jié)果相似,其父各項指標(biāo)均未見異常,見表2。
表2 家系各成員表型檢測結(jié)果
2.2 Fg基因變異分析結(jié)果 先證者編碼Fg γ鏈的FGG基因第9外顯子c.1133G>A雜合變異,導(dǎo)致γ鏈p.Gly378Asp,見圖2A;其母和弟弟攜帶相同變異,父親則為野生型,見圖2B,通過ExAC、千人基因組、gnomAD數(shù)據(jù)庫檢索,未發(fā)現(xiàn)正常人群攜帶該變異,排除此變異為多態(tài)性的可能。
圖2 FGG 基因第9號外顯子部分測序圖
2.3 生信軟件預(yù)測結(jié)果 3款預(yù)測軟件均提示FGGc.1133G>A可能為有害致病的變異,PolyPhen-2評分結(jié)果為1.0分(可能有害的);Mutation Taster預(yù)測結(jié)果提示c.1133G>A變異致病,不僅使氨基酸序列發(fā)生變化,還有可能改變剪切位點;PROVEAN預(yù)測結(jié)果為-11.03分(有害的)。
2.4 變異蛋白模型分析FGG基因c.1133G>A變異,導(dǎo)致p.Gly378Asp,用PyMol軟件建模分析發(fā)現(xiàn),Gly378位于γ鏈D結(jié)構(gòu)域,Gly378的主鏈與Ser404形成一個氫鍵;當(dāng)Gly378變異為Asp378,側(cè)鏈變長,且與Ser404的側(cè)鏈增加了一個氫鍵,同時與Thr379增加了兩個氫鍵,見圖3。
圖3 p.γ Gly378Asp變異模型圖
2.5 同源比對保守性分析 用Clustal X軟件對Fg γ鏈氨基酸序列進行同源保守性比對發(fā)現(xiàn),γ鏈第378位氨基酸在不同物種間(人、小鼠、牛、蛙和七鰓鰻)為高度保守性序列,均為甘氨酸,見圖4。
圖4 Fg γ鏈同源序列比對
2.6 變異蛋白質(zhì)穩(wěn)定性預(yù)測 用I-Mutant Suite軟件分析單點變異對蛋白質(zhì)穩(wěn)定性的影響,其DDG值為-0.99 kcal/mol,提示蛋白質(zhì)穩(wěn)定性下降(DDG值>0.5:增加蛋白質(zhì)穩(wěn)定性;DDG值<-0.5:降低蛋白質(zhì)穩(wěn)定性;-0.5≤DDG值≤0.5:中性),見圖5A,其提供的PhD-SNP預(yù)測結(jié)果為致病性變異,見圖5B。
圖5 p.Gly378Asp穩(wěn)定性預(yù)測圖
2.7 血栓彈力圖功能試驗結(jié)果 先證者、其母親和弟弟K值均延長,Angle值變小,提示三位c.1133G>A變異攜帶者Fg功能降低;先證者與其母親CI值變小,提示血液可能處于低凝狀態(tài),先證者弟弟CI值接近正常水平,提示無凝血功能障礙表現(xiàn);先證者父親K值、Angle值和CI值均在正常范圍內(nèi)。見表3。
表3 家系各成員血栓彈力圖檢測結(jié)果
Fg是人體內(nèi)含量最高的凝血因子,每個Fg分子由一個中央E區(qū)和兩個外圍D區(qū)組成,D區(qū)由Bβ鏈和γ鏈的羧基端構(gòu)成[9]。γ鏈的D區(qū)羧基端有多個功能位點:如D-D的結(jié)合位點、形成E-D連接的“a”聚合位點和血小板結(jié)合位點等[10],所以當(dāng)該羧基端的氨基酸發(fā)生改變時,可能影響到這些功能位點而導(dǎo)致Fg功能異常。
本文報道的1例CD家系先證者行右手骨折復(fù)位內(nèi)固定、皮瓣轉(zhuǎn)移修復(fù)術(shù),術(shù)中無大出血,術(shù)后傷口愈合不良;先證者母親月經(jīng)量多、時間長,輕傷后出血難止;先證者弟弟無明顯癥狀,三者的臨床表現(xiàn)具異質(zhì)性,但都符合CD的臨床表現(xiàn),與文獻[3-4]報道一致。實驗室檢查中,先證者及其母親、弟弟的Fg:C明顯降低而Fg:Ag正常,F(xiàn)g:C/Fg:Ag<0.7,TT延長且硫酸魚精蛋白無法將其糾正,符合CD的實驗室診斷標(biāo)準(zhǔn)。
基因分析證實先證者及其母親、弟弟均攜帶FGG基因c.1133G>A變異,先證者的變異遺傳自其母親,父親為野生型。本例突變p.Gly378Asp,由原來等電點為5.97 的中性氨基酸(Gly)變成了等電點為2.77酸性氨基酸(Asp),所帶電荷及疏水性的改變使這個位點所處的高度保守的D區(qū)羧基端結(jié)構(gòu)域發(fā)生變化。為了進一步研究p.Gly378Asp對Fg蛋白結(jié)構(gòu)的影響,本研究進行了蛋白模型分析,發(fā)現(xiàn)Gly378位于Fg γ鏈D結(jié)構(gòu)域,D結(jié)構(gòu)域含多個功能位點,其中γ400-411附近的氨基酸殘基是血小板膜糖蛋白IIb/IIIa的作用位點,當(dāng)Gly378變異為Asp378,導(dǎo)致側(cè)鏈變長,且與Ser404、Thr379增加了三個氫鍵,改變了空間作用力,影響了血小板膜糖蛋白IIb/IIIa與Fg的結(jié)合,阻礙了血小板的聚集,使凝塊形成變慢。本研究還應(yīng)用I-Mutant Suite軟件分析p.Gly378Asp變異對蛋白質(zhì)穩(wěn)定性的改變,其DDG值為-0.99 kcal/mol,再次證實蛋白質(zhì)穩(wěn)定性存在下降。
血栓彈力圖的三個參數(shù)K值、Angle值和CI值可以作為CD診斷的參考指標(biāo),K值和Angle值具有較高的特異性和敏感性,可以評估CD患者的整體止凝血狀態(tài),甚至預(yù)測出血或血栓形成的風(fēng)險。本研究利用血栓彈力圖試驗發(fā)現(xiàn),先證者及其母親、弟弟的血凝塊聚合的速率減低,提示三位家系成員Fg功能低下,先證者及其母親CI值降低,提示兩者處于低凝狀態(tài),可能有出血風(fēng)險,需長期監(jiān)測,避免出血風(fēng)險;先證者弟弟CI值接近正常水平,提示無凝血功能障礙表現(xiàn),這與其弟弟無癥狀的臨床表型一致。通過血栓彈力圖試驗,驗證了c.1133G>A導(dǎo)致Fg多功能位點的D結(jié)構(gòu)域改變而使其功能下降的分子發(fā)病機制。
根據(jù)美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)與基因組學(xué)學(xué)會(The American College of Medical Genetics and Genomics, ACMG)制定的臨床變異解讀標(biāo)準(zhǔn)和指南,對FGG基因c.1133G>A變異的致病性進行分析,檢索千人基因組、gnomAD、ExAC數(shù)據(jù)庫未見正常人攜帶該變異(PM2);變異在家系中共分離(PP1);經(jīng)HGMD專業(yè)版數(shù)據(jù)庫查詢,F(xiàn)GG基因c.1133G>A變異(p.Gly378Asp)未見報道,γ鏈的Gly378在不同物種間同源序列比對具有高度的保守性(PP2),見圖4;3個生信軟件預(yù)測c.1133G>A變異均為有害的(PP3);先證者及家系成員的表型符合CD臨床表型(PP4)。支持證據(jù)組合為:PM2+PP1+PP2+PP3+PP4,根據(jù)ACMG指南,判定c.1133G>A(p.Gly378Asp)變異為可能致病性變異。
此外,在先證者及其父親和弟弟FGB基因第8號外顯子存在c.1433G>A(p.Arg478Lys)雜合改變,BβArg478Lys是一個常見的多態(tài)性,位于Bβ分子的C-端,在分子水平上具有顯著的表型效應(yīng)。研究表明,它與冠狀動脈疾病的嚴(yán)重程度有關(guān),也與腦卒中的發(fā)育狀況有關(guān),攜帶這個多態(tài)性位點將可能增加血栓風(fēng)險事件。
國外一項研究[11]表明,在CD診斷后平均隨訪8.8年中,CD患者有大出血(包括產(chǎn)后出血)的高風(fēng)險,還有血栓事件的高風(fēng)險。與血栓相關(guān)的Fg變異的患者尤其危險,在這種患者中,應(yīng)考慮長期抗凝[12]。在某些特定的臨床環(huán)境下,抗纖溶藥物也是CD治療的一部分[12]。
本研究報道了一例FGG基因新變異(c.1133G>A)致CD家系,拓寬了FGG基因突變譜;同時還發(fā)現(xiàn)該家系中3位成員存在BβArg478Lys多態(tài)性改變,故應(yīng)長期觀察先證者及其家系成員在不同狀態(tài)下Fg功能的動態(tài)變化,有助于指導(dǎo)CD患者的治療,也有助于為進一步闡明基因型和臨床表現(xiàn)的關(guān)系提供依據(jù)。