2023年11月,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物病原生物功能基因組研究創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在《Trends in Plant Science》上發(fā)表了題為“Plant-virus arms race beyond RNA interference”的綜述。該論文介紹了該研究團(tuán)隊(duì)及國際同行在植物與病毒之間通過RNA介導(dǎo)的多層次博弈,并提出RNA識別機(jī)制是植物抵抗RNA病毒侵染的重要防線的科學(xué)新觀點(diǎn)。作者呼吁科研人員關(guān)注RNA層面對病毒侵染的調(diào)控作用,為探索更為有效的植物病毒防治方法提供新的科學(xué)依據(jù)。
RNA干擾(RNAi)是植物抵抗病毒侵染的最主要的防御手段。通過RNAi,植物可以識別并降解病毒RNA,從而抑制病毒侵染;同時,病毒通過編碼RNA沉默抑制子(VSRs)來對抗寄主植物的RNAi防御防御手段。近年來,研究人員發(fā)現(xiàn),在植物中除了RNAi以外,RNA降解(RNA decay),RNA質(zhì)量控制(RQC)以及RNA N-6甲基化修飾(m6A)等機(jī)制也參與了植物抵抗病毒的防御過程。
RQC是真核生物中保守的RNA檢測機(jī)制,在RNA翻譯過程中識別異常RNA產(chǎn)生的特殊狀態(tài),進(jìn)而啟動RNA decay機(jī)制降解異常RNA。病毒編碼RNA往往產(chǎn)生區(qū)別于寄主RNA的特殊結(jié)構(gòu)和編碼特征,在核糖體翻譯過程中能夠被RQC機(jī)制識別。m6A是真核生物中最常見和廣泛研究的RNA化學(xué)修飾,可以通過作用于病毒RNA以影響病毒侵染。研究人員發(fā)現(xiàn),m6A修飾的病毒RNA可以被特定的無義介導(dǎo)的RNA降解因子(NMD)識別并激活RNA decay途徑降解,從而抑制病毒侵染;然而,病毒編碼的VSRs不僅可以干擾RNAi的功能,還可以干擾RNA降解功能。此外,病毒RNA上的特殊莖環(huán)結(jié)構(gòu)在逃避RQC識別機(jī)制中也發(fā)揮重要作用。該論文為解析植物與病毒在RNA層面的相互作用提出了新的研究方向,對這些機(jī)制的深入解析將有助于揭示植物抵御病毒侵染的整體機(jī)制,并為開發(fā)新的抗病毒策略提供理論基礎(chǔ)。