楊金波,李培東,劉春國(guó),范春艷
( 1.河北工程大學(xué)生命科學(xué)與食品工程學(xué)院,河北 邯鄲 056038 ; 2.青島信得藥業(yè)有限公司,山東 青島 266100 )
禽流感是由A型流感病毒(avian influenza virus,AIV)引起的一種禽類疾病,嚴(yán)重危害畜禽業(yè)發(fā)展和人類健康。其中H9N2亞型禽流感屬于低致病性禽流感,可在動(dòng)物體內(nèi)長(zhǎng)期存在,也引起其他病原體的繼發(fā)感染。近年來(lái)已有人感染H9N2的相關(guān)報(bào)道[1]。因此,加強(qiáng)對(duì)H9N2亞型AIV的監(jiān)測(cè)并分析其遺傳變異特點(diǎn)及跨種傳播機(jī)制十分重要。
A型流感病毒基因組有8個(gè)基因節(jié)段,其中第7個(gè)基因節(jié)段M能夠編碼翻譯多種蛋白,包括M1基質(zhì)蛋白、M2離子通道蛋白以及M42等。M1是維持病毒形態(tài)的基質(zhì)蛋白[2],也是調(diào)節(jié)病毒形態(tài)表型的決定性遺傳因素[3-4],可以與HA和NA相互作用,在病毒粒子出芽過(guò)程中起到關(guān)鍵作用,影響其形成和釋放[5-6]。同時(shí),M1蛋白具有型特異性,可結(jié)合內(nèi)部病毒蛋白NP,二者的抗原性不同是流感病毒分型(A~D)的依據(jù)[5,7]。研究表明,基于M1蛋白的核酸疫苗對(duì)同源或異源AIV感染均可起到保護(hù)作用[8]。此外,深入研究M1有助于為開(kāi)發(fā)流感病毒新治療靶點(diǎn)提供參考[9]。M2蛋白是一種典型的Ⅲ型囊膜蛋白,是AIV表面除HA、NA外的另一種抗原[10]。有研究指出,M2蛋白可以與M1蛋白N端的1~160個(gè)氨基酸相互作用,從而達(dá)到協(xié)助M1蛋白順利出芽的目的[11-12]。M2含量雖少但具有較高的同源性,是研制流感通用疫苗的主要候選免疫原之一[13-14]。M42蛋白從結(jié)構(gòu)與功能上均類似M2蛋白,但僅在一些流感病毒株中表達(dá),并非流感病毒復(fù)制所必需[15]。本研究對(duì)2019—2022年分離的幾株不同來(lái)源的H9N2亞型AIV進(jìn)行M基因的遺傳演化分析,以期為AIV的M蛋白相關(guān)生物學(xué)機(jī)制的研究提供參考。
試驗(yàn)所用病料采集自部分養(yǎng)殖場(chǎng)病死雞的氣管及泄殖腔分泌物。SPF雞胚購(gòu)自北京勃林格殷格翰維通生物技術(shù)有限公司。
主要試劑:AxyPrep體液病毒DNA/RNA小量提取試劑盒(康寧生命科學(xué)(吳江)有限公司)、一步法RT-PCR試劑盒(康為世紀(jì)生物科技股份有限公司)、2×Taq預(yù)混液(北京康潤(rùn)誠(chéng)業(yè)生物科技有限公司)、反轉(zhuǎn)錄酶及相關(guān)試劑等(寶生物工程(大連)有限公司),瓊脂糖、電泳緩沖液等(北京索萊寶科技有限公司)。
主要儀器:TP350型PCR儀(TaKaRa公司)、DYY-6C型瓊脂糖凝膠電泳儀(北京市六一儀器廠)。
引 物HA(Bm-HA-1:TATTCGTCTCAGGGAGCAAAAGCAGGGG,Bm-NS-890R:ATATCGTCTCGTATTAGTAGAAACAAGGGTGTTTT)、NA(Bm-NA-1:TATTGGTCTCAGGGAGCAAAAGCAGGAGT,Bm-NA-1413R:ATATGGTCTCGTATTAGTAGAAACAAGGAGT TTTTT)、M(Bm-M-1:TATTCGTCTCAGGGAGCAAAAGCAGGTAG,Bm-M-1027R:ATATCGTCTCGTATTAGTAGAAACAAGGTAGTTTTT)參照自Hoffmann等[16]設(shè)計(jì)的通用引物,Uni-12(AGCAAAAGCAGG)反轉(zhuǎn)錄引物均交由北京擎科生物科技有限公司合成。
1.4.1 樣品采集與病毒分離培養(yǎng)
無(wú)菌條件下取有呼吸道癥狀、產(chǎn)蛋率下降的病死雞氣管、泄殖腔中的分泌物。RT-PCR擴(kuò)增病毒HA和NA基因參照SuperRT One Step RT-PCR Kit進(jìn)行。
反 應(yīng)體 系(50 μL):SuperRT OneStep EnzymeMix 2 μL、2×SuperRT OneStepBuffer 25 μL、上下游引物各2 μL、模板8 μL、RNase-Free Water 19 μL。反應(yīng)程序:50 ℃ 30 min;94 ℃ 3 min;94 ℃ 30 s,53 ℃ 30 s,72 ℃1 min 30 s,30個(gè)循環(huán);72 ℃ 5 min;4 ℃終止反應(yīng)。
測(cè)序比對(duì)后確定為H9N2亞型AIV后,將陽(yáng)性病料接種于SPF雞胚尿囊腔,棄去24 h內(nèi)死亡的雞胚,72 h后收獲尿囊液。收集具有HA效價(jià)的尿囊液,分裝-80 ℃凍存。
1.4.2 M基因的RT-PCR擴(kuò)增
使用AxyPrep體液病毒DNA/RNA小量試劑盒提取尿囊液中病毒RNA,逆轉(zhuǎn)錄成cDNA用于PCR擴(kuò)增,使用2×Taq預(yù)混液擴(kuò)增病毒M基因。
新的時(shí)代呼喚新的教育觀和人才觀。正如加德納所說(shuō):“時(shí)代已經(jīng)不同,我們對(duì)才華的定義應(yīng)該擴(kuò)大。教育對(duì)孩子最大的幫助是引導(dǎo)他們走入適應(yīng)的領(lǐng)域,使其因潛能得以發(fā)揮而獲得最大的成就感?!币粋€(gè)好的英語(yǔ)教學(xué)評(píng)價(jià)體系,應(yīng)該是多元的、綜合的、開(kāi)放的。作為一線的英語(yǔ)教師,我堅(jiān)信每個(gè)孩子身上都有獨(dú)特的閃光點(diǎn),每個(gè)孩子都能在我們積極構(gòu)建的多元評(píng)價(jià)體系中發(fā)揮潛能,學(xué)有所成。
反應(yīng)體系(50 μL):2×Taq PCR StarMix with Loading Dye 25 μL、上下游引物各2 μL、模板2 μL、Sterile ddH2O 19 μL。反應(yīng)程序:50 ℃ 30 min;94 ℃ 3 min;94 ℃ 30 s,53 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min 30 s,30個(gè)循環(huán);72 ℃ 5 min,4 ℃終止反應(yīng)。
1.4.3 序列測(cè)定及分析
PCR產(chǎn)物于1%瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳鑒定,送至北京擎科生物科技有限公司利用測(cè)序引物進(jìn)行病毒的基因序列測(cè)定。基因測(cè)序結(jié)果使用DNAStar 7.1軟件包進(jìn)行序列拼接(Seqman軟件)、翻譯(Editseq軟件)、比對(duì)以及關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn)變異分析(MegAlign軟件)。
通過(guò)NCBI Blastn搜索和下載各病毒基因的最相似序列以及國(guó)內(nèi)H9N2亞型AIV各進(jìn)化分支的經(jīng)典參考序列,使用MEGA 7軟件以Neighbor-joining(NJ)法繪制遺傳進(jìn)化樹(shù)。8株H9N2亞型AIV以及其他相關(guān)毒株信息及縮寫見(jiàn)表1。
表1 8株H9N2亞型AIV以及其他相關(guān)毒株信息及縮寫Tab.1 Eight strains of H9N2 subtype AIV and information and abbreviations of other related strains
由圖1可知,8株分離株的PCR擴(kuò)增結(jié)果經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳后,出現(xiàn)M特異性目的條帶,片段大小約為1 027 bp,與預(yù)期結(jié)果相符。
圖1 8株H9N2亞型M基因PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果Fig.1 Electrophoresis results of eight strains of H9N2 subtype M gene PCR products
由表2可知,分離株與經(jīng)典株、疫苗株在M基因中核苷酸一致性主要在98%以上,為98.88%~99.90%,其中XD1與XD6、XD4與XD7對(duì)應(yīng)的序列相同,但一致性仍存在差異。分析結(jié)果顯示,與各分離株核苷酸一致性最高的參考序列最早來(lái)自2012年,其他毒株主要為2017年以來(lái)的病毒。
表2 與分離株的核苷酸一致性最高的參考毒株信息Tab.2 Reference viruses with highest genetic identities to H9N2 viruses 單位:%
由表3可知,一致性比較結(jié)果顯示,8個(gè)分離株M之間的核苷酸一致性為88.0%~99.7%,氨基酸一致性為89.7%~99.7%;XD1和XD6的核苷酸與氨基酸一致性均為最高達(dá)到99.7%;XD2和XD8的核苷酸一致性最低為88.0%,氨基酸一致性為90.0%;XD5和XD8的氨基酸一致性則最低為89.7%。8株分離株與2株經(jīng)典株進(jìn)行M基因序列比對(duì)分析核苷酸一致性表明,XD1~XD7與G1株的一致性最高為92.7%~94.2%,XD8與BJ94株的一致性最高為93.0%;與目前市場(chǎng)上的疫苗株(F98株、SD696株、WJ57株)進(jìn)行序列對(duì)比分析核苷酸一致性表明,XD1~XD7與WJ57株的一致性最高為96.7%~98.5%,XD8與SD696株的一致性最高為92.0%。
表3 分離株與經(jīng)典株、疫苗株的M基因之間的核苷酸及其推導(dǎo)氨基酸序列的一致性比較Tab.3 Comparison of nucleotide and deduced amino acid sequences of M gene among isolates, classical strains and vaccine strains
圖2 H9N2亞型AIV M基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)Fig.2 Phylogenetic tree of M genes of H9N2 avian influenza viruse
流感病毒的M基因包含1 027個(gè)核苷酸,其中M1蛋白由252個(gè)氨基酸編碼組成,M2蛋白由97個(gè)氨基酸殘基組成[13]。
由表4可知,在M1與M2蛋白中,8株分離株的10個(gè)關(guān)鍵位點(diǎn)中有4個(gè)位點(diǎn)相對(duì)保守;其余6個(gè)位點(diǎn)中,XD1~XD7均與經(jīng)典株不同,但與近年新出的疫苗株WJ57相同,XD8所有位點(diǎn)都與經(jīng)典株相同。
表4 分離株M基因關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn)分析Tab.4 Analysis of key amino acid loci in M gene of isolates
本研究對(duì)2019—2022年中國(guó)不同省份已接種過(guò)疫苗的養(yǎng)殖場(chǎng)分離到的8株H9N2亞型AIV進(jìn)行了M序列測(cè)定、進(jìn)化分析與重要位點(diǎn)分析。通過(guò)對(duì)8株分離株的M基因進(jìn)行分析得出,從分離時(shí)間來(lái)看,一致性最高毒株最早來(lái)自2012年;從核苷酸一致性來(lái)看,8株分離株與NCBI網(wǎng)站上序列的一致性均在98%以上,其中與XD8的核苷酸一致性最高的毒株序列來(lái)自H5N8亞型,表明其可能是一株重組病毒。與市面上的疫苗株一致性相比,XD1~XD7與WJ57株M基因的一致性最高,XD8與SD696株的一致性最高;8個(gè)分離株M之間的核苷酸與氨基酸一致性分別為88.0%~99.7%、89.7%~99.7%。由進(jìn)化樹(shù)分析可知,XD1~XD7屬于G1-like分支,XD8屬于BJ94-like分支。
Zhang等[17]對(duì)M蛋白關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn)進(jìn)行分析,結(jié)果表明,M1蛋白中的95K、224N和242N殘基和M2蛋白中的21G均有可能增加AIV的感染性。而本試驗(yàn)分離株與經(jīng)典株相比,XD1~XD7的M1蛋白發(fā)生T37A、R95K、S224N和K242N突變,M2蛋白發(fā)生D21G突變,與上述研究結(jié)論相符。研究顯示,當(dāng)M1蛋白的N30D和T215A發(fā)生突變時(shí),不同病毒在小鼠體內(nèi)表現(xiàn)高低不同的致病性[18]。本研究中,所有分離株的M1蛋白30位均為D,215位均為A,所以8株分離株在哺乳動(dòng)物體內(nèi)的致病性也應(yīng)存在差異,具體差異情況還需要進(jìn)一步研究。
金剛烷類藥物可以靶向于M2蛋白,進(jìn)而起到抗流感作用[10],S31N則是最常見(jiàn)的金剛烷抗性標(biāo)記[19]。XD1~XD7的M2蛋白第31位氨基酸存在S轉(zhuǎn)變?yōu)镹的變異,表明均具有金剛烷胺類藥物的抗性[19];而XD8在31位氨基酸為S,顯示對(duì)金剛烷胺類藥物敏感。
綜上所述,本研究分離出8株禽源的H9N2亞型AIV,并對(duì)病毒的M基因進(jìn)行全長(zhǎng)擴(kuò)增及基因序列分析。結(jié)果顯示,XD1~XD7分離株M基因?qū)儆贕1-like分支,XD8分離株M基因?qū)儆贐J94-like分支。XD1~XD7分離株顯示金剛烷胺類藥物抗性,并發(fā)生增加病毒感染性的突變,而XD8則顯示對(duì)金剛烷胺類藥物敏感。