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4種熒光原位雜交探針檢測隱匿易位急性早幼粒細(xì)胞白血病的比較

2023-02-01 03:24:08楊慧姜潤秋郭睿時(shí)雨喬純錢思軒李建勇仇海榮
關(guān)鍵詞:基因座易位探針

楊慧, 姜潤秋, 郭睿, 時(shí)雨, 喬純, 錢思軒, 李建勇, 仇海榮

(1. 南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院血液科,江蘇 南京 210029; 2. 南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院,江蘇 南京 210008)

急性早幼粒細(xì)胞白血病(acute promyelocytic leukemia,APL)以 t(15;17)(q24;q21)易位形成PML-RARα融合基因?yàn)樘卣鱗1],具有該融合基因的APL患者對全反式維甲酸及三氧化二砷均敏感,獨(dú)特的生物學(xué)和臨床特征使其成為急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)中一類高治愈性亞型。據(jù)報(bào)道,有98%的APL通過t(15;17)(q24;q21)平衡或插入易位形成PML-RARα融合基因,1%~2%的APL病例通過涉及RARα的其他融合表現(xiàn)為少見的APL亞型[2-3]。本研究報(bào)道3例臨床熒光原位雜交(fluorescence in situ hybridization,F(xiàn)ISH)檢測中容易漏診的一類少見隱匿插入易位APL病例,并對比4家不同公司基因探針對此型異常的檢測能力。

1 資料與方法

1.1 研究對象

選取3例經(jīng)細(xì)胞形態(tài)學(xué)、免疫學(xué)、細(xì)胞遺傳學(xué)、分子生物學(xué)綜合診斷為APL的罕見插入PML-RARα易位患者。本研究通過醫(yī)院倫理委員會審查,3例患者均已簽署知情同意書。

1.2 常規(guī)染色體核型分析

取骨髓液采用短期培養(yǎng)法制備染色體并采用R顯帶技術(shù)進(jìn)行核型分析。染色體異常按照《人類細(xì)胞遺傳學(xué)國際命名體制(ISCN2016)》的相關(guān)規(guī)定識別和描述。

1.3 FISH檢測PML-RARα融合基因

雙色雙融合PML-RARα探針分別購自美國Abbott公司、英國Cytocell公司、武漢康錄公司、廣州安必平公司。除安必平探針采用紅色標(biāo)記RARα基因,綠色標(biāo)記PML基因外,其余探針均為紅色標(biāo)記PML基因,綠色標(biāo)記RARα基因。Abbott探針跨越大小為515 kb的PML基因座和大小為700 kb的RARα基因座。在Cytocell探針中,PML基因座和RARα基因座大小分別為325 kb和331 kb。安必平探針跨越的基因座是最大的,其PML基因座大小為578 kb,RARα基因座大小為1 000 kb??典浱结樋缭酱笮?30 kb的PML基因座和大小為320 kb的RARα基因座。FISH檢測步驟根據(jù)制造商提供的方案進(jìn)行,至少計(jì)數(shù)300個(gè)間期細(xì)胞。正常細(xì)胞信號為兩紅兩綠(2R2G);出現(xiàn)黃色融合信號(F)表明發(fā)生易位,超過閾值(≥3%),則判定PML-RARα融合基因檢測陽性,典型信號模式為一紅一綠兩融合(1R1G2F)。

1.4 細(xì)胞形態(tài)學(xué)檢測

對骨髓涂片進(jìn)行瑞氏染色、過氧化物酶染色和高碘酸-希夫染色,并在顯微鏡下檢查細(xì)胞形態(tài)。對于過氧化物酶染色,陽性結(jié)果是細(xì)胞質(zhì)中出現(xiàn)棕色和黑色顆粒。對于高碘酸-希夫染色,細(xì)胞質(zhì)染成紅色表示陽性反應(yīng),陽性反應(yīng)物呈顆粒狀、塊狀或彌漫性。

1.5 RT-PCR檢測PML-RARα融合基因

從骨髓樣本中分離細(xì)胞并根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)方案提取總RNA。PML-RARα熒光定量PCR檢測采用基因擴(kuò)增儀StepOnePlusTMRT-PCR系統(tǒng)(美國ABI公司),反應(yīng)體系包括8 μL反應(yīng)液和12 μL RNA,反應(yīng)條件:42 ℃ 30 min,94 ℃ 5 min,95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min;共40個(gè)循環(huán)。擴(kuò)增曲線在40個(gè)循環(huán)前超過閾值被認(rèn)為PML-RARα融合基因?yàn)殛栃浴檫M(jìn)一步量化樣本并了解實(shí)驗(yàn)效率,使用1×103、1×104、1×105和1×106拷貝的ABL基因參考制作標(biāo)準(zhǔn)曲線。

1.6 免疫表型分析

通過流式細(xì)胞儀(美國貝克曼庫爾特公司)檢測新鮮的骨髓樣本,至少分析50 000個(gè)細(xì)胞。本研究所使用的抗體包括CD34、CD117、HLA-DR、CD13、CD33、CD11b、CD15、CD19、CD58、CD10、CD20、CD22、CD81、CD66c、CD38、CD64、CD14、CD56、CD11c、cMPO、cCD3、cCD79a、CD2、CD5、CD7、CD3、CD8、CD4、CD45。陰性對照采用相應(yīng)的同型對照抗體,陽性細(xì)胞群≥20%被定義為陽性。

2 結(jié)果

2.1 細(xì)胞形態(tài)學(xué)及免疫表型特征

3例APL患者白血病細(xì)胞形態(tài)學(xué)特征和免疫表型模式均較典型。經(jīng)瑞氏染色可見異常早幼粒細(xì)胞胞質(zhì)內(nèi)充滿大量的紫色顆粒,胞質(zhì)內(nèi)外部顏色不同,細(xì)胞核形狀不規(guī)則、扭曲或折疊。一些白血病細(xì)胞含有多個(gè)柴捆狀棒狀小體。異常早幼粒細(xì)胞的過氧化物酶染色為強(qiáng)陽性反應(yīng),而高碘酸-希夫染色顯示出弱陽性反應(yīng)。CD34、CD117、HLA-DR、CD13、CD33、CD11b、CD11c、CD15和CD38等免疫表型標(biāo)志物檢測發(fā)現(xiàn),3例病例均表現(xiàn)出典型的免疫表型,即患者不表達(dá)CD34、HLA-DR和CD11b,而表達(dá)CD13、CD33、CD117、CD38。

2.2 細(xì)胞及分子遺傳學(xué)結(jié)果

3例插入易位APL病例的常規(guī)染色體核型分析均表現(xiàn)為正常男性核型46,XY,而未能檢測到t(15;17)易位存在。FISH研究結(jié)果顯示,Abbott探針在此3例PML-RARα融合基因檢測均為陰性;Cytocell檢測到2例陽性,1例陰性;康錄和安必平探針3例均成功檢測到融合信號,詳見表1。所有FISH探針檢測到的融合信號均為微弱的融合信號,如圖1所示,箭頭所指分別為安必平及Cytocell探針?biāo)就换颊撸?7號RARα部分片段易位至15號PML處形成的弱融合信號。圖1中安必平PML-RARα探針顯示2R1G1F信號模式,箭頭所示的融合信號是17號染色體部分RARα片段(紅色)易位到15號染色體PML(綠色)處形成弱的PML-RARα融合信號;而Cytocell的PML-RARα探針顯示1R2G1F信號模式,箭頭所示融合信號由位于17號染色體的部分RARα片段(綠色)易位至位于15號染色體的PML(紅色)處形成弱的PML-RARα融合信號。而應(yīng)用RT-PCR方法在3例中均檢測到PML-RARα融合基因,如圖2所示,灰色箭頭指的是PML-RARα擴(kuò)增曲線。

表1 4種不同F(xiàn)ISH探針檢測插入性PML-RARα易位病例的比較

圖1 安必平及Cytocell探針檢測到弱PML-RARα融合(DAPI染色,×1 000)

圖2 健康人和3例APL患者PML-RARα融合基因的RT-PCR擴(kuò)增圖

3 討論

FISH技術(shù)對診斷經(jīng)典型t(15;17)易位形成的PML-RARα融合基因準(zhǔn)確性非常高,是臨床血液病診斷中的常用技術(shù)。然而,在檢測小片段隱匿PML-RARα易位時(shí),F(xiàn)ISH出現(xiàn)了少有的假陰性情況,F(xiàn)ISH陰性的罕見病例文獻(xiàn)也偶見報(bào)道,Kim等[4]總結(jié)1995至2010年共計(jì)13例個(gè)案報(bào)道,均為常規(guī)核型分析未見t(15;17),F(xiàn)ISH檢測PML-RARα陰性,而分子生物學(xué)方法如RT-PCR或RNA測序檢測到融合基因。由于PML-RARα融合基因的存在,此型患者對全反式維甲酸治療與經(jīng)典型t(15;17)患者具有相似的反應(yīng)和預(yù)后。表2為作者總結(jié)的1995至2021年文獻(xiàn)報(bào)道的20例此類少見病例[4-20],均為染色體及FISH檢測陰性APL病例,其中用于檢測的FISH探針除2例所用探針未知,2例來自O(shè)ncor以外,其余16例均為Abbott探針。

表2 分子遺傳陽性而細(xì)胞遺傳(FISH及核型)檢測陰性的20例病例

初診APL患者FISH檢測失敗,除了RT-PCR[21]或測序技術(shù)有更高的敏感性以外,PML/RARα探針本身的設(shè)計(jì)是否會影響到檢測敏感性,值得進(jìn)一步探討。國外報(bào)道一組少見插入易位病例[22]采用Abbott及Cytocell探針對比研究發(fā)現(xiàn),Abbott探針在一些隱匿性PML-RARα融合檢測中出現(xiàn)假陰性主要跟探針大小有關(guān),Abbott探針大小和其標(biāo)記覆蓋面積是Cytocell的2倍左右,這使得小片段插入部分與被插染色體信號強(qiáng)度差異較大,大片段信號遮蓋住小片段信號,以致融合信號不可見。表2中總結(jié)的20例少見病例,16例使用的是Abbott探針,這一方面與其在國際上廣泛使用有關(guān),另一方面與探針檢測的敏感性相關(guān)。從產(chǎn)生機(jī)制上來說,臨床少見的隱匿性PML-RARα融合,大多由插入易位引起,其中以ins(15;17)即17號小片段RARα成分插入至15號染色體PML處形成PML-RARα融合最為常見,而15號插入17號則相對少見[23-24],本研究中例3即為這種罕見型。

FISH檢測中,探針的大小、覆蓋范圍以及熒光強(qiáng)度對異常的檢出率均有影響。Abbott探針:PML探針覆蓋了該基因兩側(cè)180 kb和335 kb,包含了所有PML的斷裂點(diǎn)區(qū)域;RARα探針覆蓋了該基因700 kb范圍,包含了所有RARA的斷裂點(diǎn)區(qū)域。Cytocell探針:PML探針覆蓋了該基因兩側(cè)151 kb和174 kb;RARα探針覆蓋了該基因兩側(cè)167 kb和164 kb。本文中例1、例2為RARα小片段插入至PML處形成融合基因。Abbott的PML探針片段比較長,紅色熒光強(qiáng)度比較強(qiáng),小片段的RARα綠色熒光比較弱,插入后,綠色熒光被紅色熒光湮滅了,未能形成肉眼可見的黃色融合信號,故判為陰性結(jié)果。而Cytocell的PML探針片段比較小,紅色熒光強(qiáng)度比較弱,小片段的綠色RARα信號插入后,也能夠形成肉眼可見的黃色融合信號??典浱结樔L(PML330 kb,RARα320 kb)與Cytocell長度相仿,同理也能被識別。例3為PML小片段插入至RARα形成融合基因,Abbott探針判為陰性,其原因跟上述例1、例2分析的一致??典浱结槼晒z測到融合信號也是因?yàn)槠湓O(shè)計(jì)的RARα僅為320 kb,因而未將插入而來的小片段PML完全湮滅。與康錄探針大小類似的Cytocell探針結(jié)果卻判為陰性,這可能跟另一個(gè)因素有關(guān),即該探針設(shè)計(jì)的PML位點(diǎn)未能覆蓋例3中插入片段斷裂位點(diǎn),導(dǎo)致檢測結(jié)果出現(xiàn)假陰性。至于安必平探針,從大小上來說,PML基因座大小578 kb,RARα1 000 kb,其探針設(shè)計(jì)總體長度與Abbott探針相似,但與此相反,在3例APL中均成功檢測到融合信號。這可能與影響檢測的第3個(gè)因素即熒光強(qiáng)度有關(guān),雖然小片段插入信號被一定程度湮滅,但由于探針整體熒光強(qiáng)度偏強(qiáng),因此小片段插入信號仍然保留了下來從而能被觀測到。

對于檢測APL中少見的隱匿插入PML-RARα易位病例,國產(chǎn)安必平及康錄探針因熒光強(qiáng)度強(qiáng),檢測時(shí)表現(xiàn)出一定的優(yōu)勢。但由于信號細(xì)弱,無論采用何種探針,若不仔細(xì)觀察都可能出現(xiàn)漏診的情況。本研究旨在提高對FISH方法檢測此類少見異常的認(rèn)識,以利于及時(shí)發(fā)現(xiàn)這部分隱匿易位病例。同時(shí)應(yīng)該意識到敏感性高的探針其特異性會有一定程度的下降,希望臨床及實(shí)驗(yàn)室醫(yī)生認(rèn)識到診斷方法各有其局限性。由于方法學(xué)不同,RT-PCR及測序技術(shù)對此類插入易位檢測更為敏感。但各種檢測方法各有利弊,建議RT-PCR和FISH檢測綜合使用作為最實(shí)用、最敏感的診斷策略。

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