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患病青白藜可培養(yǎng)內(nèi)生菌的群落結(jié)構(gòu)及多樣性分析

2023-01-31 09:22喬佳慧子郝玉凡謝天艷
關(guān)鍵詞:莖稈芽孢菌落

呼 榮,喬佳慧子,郝玉凡,謝天艷,李 瑋,沈 碩

(青海大學(xué) 青海省農(nóng)林科學(xué)院/青藏高原生物技術(shù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,青海 西寧 810016)

【研究意義】藜麥(Chenopodium quinoaWilld)又稱南美藜、藜米等,1 年生草本植物,種植歷史長(zhǎng)達(dá)7 000 多年,被稱為“糧食之母”[1-3]。藜麥?zhǔn)且环N高蛋白、低熱量、活性物質(zhì)豐富的全營(yíng)養(yǎng)食物,具有提升人體新陳代謝、抑制癌細(xì)胞生長(zhǎng)等方面的功效[4-6]。自2008 年山西省規(guī)模化種植藜麥以來(lái),我國(guó)藜麥種植區(qū)出現(xiàn)各類病害,嚴(yán)重降低藜麥產(chǎn)量。據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道[7-9],引起我國(guó)藜麥真菌病害的病原菌眾多,由Peronospora variabilis引起的藜麥霜霉病導(dǎo)致山西靜樂(lè)縣藜麥種植區(qū)發(fā)病率達(dá)95%,減產(chǎn)約40%;由Cercosporacf.chenopodii引起的藜麥葉斑病導(dǎo)致藜麥減產(chǎn)約25%;莖點(diǎn)霉屬(Phomaspp.)真菌引起的黑稈病在藜麥植株抽穗后發(fā)病,導(dǎo)致植株枯死。因此,明確藜麥在種植區(qū)的病害種類,進(jìn)一步探索病害的發(fā)生發(fā)展規(guī)律,對(duì)有效控制藜麥病害、提高藜麥產(chǎn)量有重要的理論與實(shí)際意義?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】2017 年段慧[10]從藜麥病害部位分離獲得3 株鏈格孢屬(Alternariasp.)真菌,從藜麥種子分離獲得真菌和細(xì)菌共15 株,其中枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)對(duì)鏈格孢屬(Alternariasp.)真菌引起的藜麥葉斑病有防治效果。廖映凱[11]從健康藜麥葉片分離出細(xì)菌和真菌共3 株,其中1 株內(nèi)生細(xì)菌對(duì)造成藜麥葉斑病的病原菌成團(tuán)泛菌(Pantoea agglomerans)SCCDP-2 和SCCDP-4 有抑制效果。朱雪峰[12]在藜麥種子內(nèi)分離純化出61 株細(xì)菌和32 株真菌,其中7 株芽孢桿菌和1 株鏈格孢菌對(duì)藜麥菌核病具有生防潛力。何小慧[13]通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)評(píng)價(jià)了藜麥不同部位、不同時(shí)期內(nèi)生菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性。趙富清等[14]從青藜2 號(hào)中分離出內(nèi)生細(xì)菌34 株,其中3 株內(nèi)生細(xì)菌對(duì)鏈格孢屬(Alternariasp.)和刺盤(pán)孢屬(Colletotrichumsp.)2 種植物病原真菌有較強(qiáng)的拮抗作用。【本研究切入點(diǎn)】此前,有學(xué)者通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)揭示了連作藜麥土壤以及健康藜麥不同部位、不同時(shí)期內(nèi)生菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性[13,15],但尚未見(jiàn)患真菌病害的藜麥的不同部位細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性的相關(guān)報(bào)道。本研究以藜麥患病莖稈和葉片為材料,采用稀釋分離法分離純化細(xì)菌菌株、組織分離法分離純化真菌菌株,通過(guò)形態(tài)學(xué)觀察結(jié)合16S rRNA 和ITS基因測(cè)序,明確藜麥患病莖稈和葉片中細(xì)菌和真菌群落的種類歸屬,為后期藜麥病害的確定和防治研究提供依據(jù)?!緮M解決的關(guān)鍵問(wèn)題】本研究對(duì)藜麥不同病害組織的細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)、多樣性進(jìn)行分析,初步明確青海省內(nèi)引起藜麥病害的病原菌及拮抗菌,對(duì)藜麥病害的綜合防治至關(guān)重要。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 供試材料 2020年6月,在青海省農(nóng)林科學(xué)院試驗(yàn)地(36°43′N,101°45′E)采集青白藜莖稈和葉片病樣。

1.1.2 供試培養(yǎng)基(1)PDA 培養(yǎng)基:馬鈴薯200 g,葡萄糖20 g,瓊脂20 g,蒸餾水定容至1 L。(2)NA 培養(yǎng)基:牛肉膏3 g,蛋白胨10 g,NaCl 5 g,瓊脂20 g,蒸餾水定容至1 L,pH調(diào)至7.0~7.2。

1.2 試驗(yàn)方法

1.2.1 樣品處理 取采集的藜麥樣品,在超凈工作臺(tái)中用無(wú)菌水沖洗3次,無(wú)菌濾紙吸干水分,用體積分?jǐn)?shù)75%酒精浸泡35 s,無(wú)菌水沖洗3次,2% NaClO3溶液浸泡70 s,無(wú)菌水沖洗3次后晾干備用。

1.2.2 菌株的分離、純化和保存 采用常規(guī)組織分離法進(jìn)行真菌菌株的分離[16]。將莖稈切成1 cm 左右的小段,葉片切成1 cm×1 cm 的小塊,分別接種到PDA 固體培養(yǎng)基上,恒溫靜置培養(yǎng)2~5 d。待組織邊緣有菌絲出現(xiàn)后,接種針挑取菌絲至PDA 培養(yǎng)基,反復(fù)挑取邊緣菌絲培養(yǎng),直至獲得純化菌落,4 ℃冰箱保存。

采用稀釋分離法分離細(xì)菌菌株[17]。取莖稈和葉片組織各3 塊,置于滅菌研缽中,加入無(wú)菌水研磨成勻漿后梯度稀釋,分別取100 μL 菌懸液于NA 培養(yǎng)基上,均勻涂布,28 ℃靜置培養(yǎng)2~4 d。根據(jù)菌落形態(tài)、顏色等挑取單菌落進(jìn)行分離純化,4 ℃冰箱保存。

1.2.3 菌株的鑒定(1)形態(tài)學(xué)鑒定。將活化后的真菌菌株接種于PDA培養(yǎng)基上,觀察其生長(zhǎng)的菌落顏色、形狀和菌絲、孢子形態(tài),根據(jù)《真菌鑒定手冊(cè)》[18]對(duì)菌株進(jìn)行形態(tài)學(xué)鑒定。

將活化后的細(xì)菌菌株接種至NA 培養(yǎng)基上,觀察其菌落的顏色、形狀、濕潤(rùn)度和表面形態(tài)特征等,根據(jù)《常見(jiàn)細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》[19]和《伯杰細(xì)菌鑒定手冊(cè)》[20]對(duì)菌落進(jìn)行形態(tài)學(xué)鑒定。(2)分子生物學(xué)鑒定。真菌菌株用真菌基因組提取試劑盒提取DNA,以通用引物(表1)進(jìn)行rDNA ITS 序列的PCR 擴(kuò)增。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用10 g/L 瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè)后切膠回收,送至艾優(yōu)稷生物科技有限公司(西安)有限公司測(cè)序。將獲得的ITS 序列提交至GenBank 獲取登錄號(hào),GenBank BLAST 序列在NCBI(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),結(jié)果利用MAGE7.0軟件,采用Neighbor-Joining方法(Bootstrap值為1 000次),構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)[21]。

采用細(xì)菌16S rRNA 通用引物(表1)擴(kuò)增細(xì)菌的16S rRNA基因。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè)后切膠回收,送至艾優(yōu)稷生物科技有限公司(西安)有限公司測(cè)序。測(cè)序結(jié)果在EzBioCloud(https://www.ezbiocloud.net/)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),比對(duì)結(jié)果利用MAGE7.0 軟件,采用Neighbor-Joining 方法(Bootstrap 值為1 000 次),構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。

表1 引物序列信息Tab.1 Information of primer sequence

1.3 多樣性分析

以97%相似度進(jìn)行分類,建立操作分類單元(operational taxonomic unit,OTU),在屬和種水平上分析真菌和細(xì)菌的多樣性。Chao1指數(shù)評(píng)估菌群豐度,Chao1指數(shù)越大,OTU數(shù)目越多,說(shuō)明豐富度越高;選用Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)評(píng)估菌群多樣性,對(duì)群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行多樣性分析。

1.4 數(shù)據(jù)分析

利用Draw Venn Diagram 工具繪制Venn圖。利用Muthur軟件計(jì)算多樣性指數(shù)。利用Excel軟件進(jìn)行相關(guān)數(shù)據(jù)處理、圖形制作。

2 結(jié)果與分析

2.1 菌株的鑒定

2.1.1 真菌形態(tài)學(xué)鑒定 本試驗(yàn)共從藜麥病害組織中分離獲得44 株真菌,其中莖稈中共分離到14 株,葉片中分離30株。經(jīng)肉眼觀察菌落表面形態(tài),合并重復(fù)菌株后得到9個(gè)菌株,光學(xué)顯微鏡觀察9個(gè)菌株的形態(tài)特征(圖1)。初步判定分離的真菌屬于5 個(gè)屬:青霉屬Penicilliumsp.、鏈格孢屬Alternariasp.、新凸輪孢菌屬Neocamarosporiumsp.、毛殼屬Chaetomiumsp.和刺盤(pán)孢屬Colletotrichumsp.。

菌株20CLM F-4-2 和20DLM F-3-1-1 菌落邊緣整齊,為同心環(huán)形,中間部分呈現(xiàn)墨綠色,邊緣顏色為白色,產(chǎn)生很多粉狀物(圖1-A1,B1);菌株20ALM F-1-3-2-2、20ALM F-1-8 和20CLM F-1-3-2 菌落為同心環(huán)形,中間部位呈棕褐色,至邊緣部位顏色逐漸淡化為白色,菌落絮狀(圖1-C1,圖1-D1,圖1-E1);菌株20ALM F-2-1-1 菌落整體呈現(xiàn)白色,短絨狀(圖1-F1);菌株20DLM F-9-2-2 和20DLM F-9-6-2 菌落為圓形,整體為白色,有大量毛絨狀氣生菌絲,擴(kuò)展速度很快(圖1-G1,圖1-H1);菌株20DLM F-5-4菌落中央和邊緣呈現(xiàn)白色,中間部分為灰褐色(圖1-I1)。

圖1 真菌的形態(tài)特征與培養(yǎng)性狀Fig.1 Morphological and cultural characteristics of fungi

2.1.2 真菌分子生物學(xué)鑒定 選擇31 株具有代表性的真菌菌株進(jìn)行序列相似對(duì)比分析,使用Mega7.0軟件,根據(jù)Neighbor-Joining 方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。鑒定結(jié)果表明(圖2),31 株真菌菌株與其同屬內(nèi)近緣菌間的ITS 序列相似性位于98.59%~100.00%。結(jié)合形態(tài)特征和ITS 序列分析結(jié)果(表2),將菌株20CLM F-4-2 鑒定為P.polonicum,菌株20DLM F-3-1-1 為P.goetzii,菌株20ALM F-1-3-2-2 為A.alternata,菌株20ALM F-1-8 為A.tenuissima,菌株20CLM F-1-3-2 為A.brassicae,菌株20ALM F-2-1-1 為N.calvescens,菌株20DLM F-9-2-2 為C.elatum,菌株20DLM F-9-6-2 為C.globosum,菌株20DLM F-5-4為C.spinaciae。

圖2 基于ITS序列構(gòu)建的真菌菌株系統(tǒng)發(fā)育分析Fig.2 Phylogenetic analysis of fungal strains based on ITS sequences

表2 真菌菌株鑒定結(jié)果Tab.2 Identification results of fungal strains

2.1.3 細(xì)菌形態(tài)學(xué)鑒定 本試驗(yàn)共從藜麥病害組織中分離獲得212株細(xì)菌,其中莖稈中共分離到10株,葉片中分離到202 株。經(jīng)光學(xué)顯微鏡觀察單菌落形態(tài),結(jié)合觀察革蘭氏染色結(jié)果,合并重復(fù)菌株后得到13個(gè)菌株,菌株的形態(tài)見(jiàn)圖3。初步判定分離的細(xì)菌歸屬于沙雷氏屬Serratiasp.、芽孢桿菌屬Bacillussp.和Heyndrickxiasp.。

菌株20CLM B-8-2 菌落不規(guī)則形,乳白色不透明,潤(rùn)濕度高,中間部位有褶皺(圖3-A1);菌株20DLM B-2-2菌落為乳白色,邊緣褶皺(圖3-B1);菌株20CLM B-2-18菌落不規(guī)則形,乳白色,表面平整潤(rùn)濕(圖3-C1);菌株20CLM B-2-34 菌落為淡黃色不透明,邊緣波狀略有褶皺(圖3-D1);菌株20DLM B-5-13 菌落圓形,中心有凸起,潤(rùn)澤度較高,邊緣齊整(圖3-E1);菌株20DLM B-2-8 菌落潤(rùn)濕度較差,分泌透明物質(zhì),后期邊緣有絲狀物(圖3-F1);菌株20DLM B-10-5 菌落近圓形,略有突起,邊緣規(guī)整(圖3-G1);菌株20DLM B-4-4菌落不規(guī)則,潤(rùn)澤度較差,邊緣有毛狀物(圖3-H1);菌株20BLM B-1-14菌落為圓形,白色,邊緣平整光滑,中間凸起(圖3-I1);菌株20CLM B-5-7-1菌落松散,邊緣開(kāi)裂(圖3-J1);菌株20CLM B-3-3 菌落為圓形,淺黃色,表面有褶皺,潤(rùn)澤度較高(圖3-K1);菌株20DLM B-9-8 菌落近圓形不透明,表面干燥隆起,后期有黑色素產(chǎn)生(圖3-L1);菌株20DLM B-8-6菌落為近圓形,較濕潤(rùn),分泌透明物質(zhì)(圖3-M1)。菌株20CLM B-8-2為革蘭氏陰性菌,其他均為革蘭氏陽(yáng)性菌。

圖3 細(xì)菌形態(tài)學(xué)鑒定Fig.3 Bacterial morphological identification

2.1.4 細(xì)菌分子生物學(xué)鑒定 選擇測(cè)序得到的36 株具有代表性的細(xì)菌菌株進(jìn)行序列對(duì)比分析,使用Mega7.0 軟件,根據(jù)Neighbor-Joining 方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(圖4,圖5,圖6)。鑒定結(jié)果表明,36 株細(xì)菌菌株與其同屬內(nèi)近緣菌間的16S rRNA 序列相似性位于98.82%~100.00%。結(jié)合形態(tài)特征和16S rRNA 序列分析結(jié)果(表3),將菌株20CLM B-8-2 鑒定為S.liquefaciens,菌株20DLM B-2-2 為B.subtilis,菌株20CLM B-2-18為B.cabrialesii,菌株20CLM B-2-34為B.tequilensis,菌株20DLM B-5-13為B.altitudinis,菌 株20DLM B-2-8 為B.zhangzhouensis,菌株20DLM B-10-5 為B.halotolerans,菌株20DLM B-4-4 為B.paralicheniformis,菌株20BLM B-1-14 為B.velezensis,菌株20CLM B-5-7-1 為B.licheniformis,菌株20CLM B-3-3為B.pumilus,菌株20DLM B-9-8為B.atrophaeus,菌株20DLM B-8-6為H.oleronia。

圖4 基于16S rRNA基因序列構(gòu)建的菌株20CLM B-2-34、20BLM B-1-14、20CLM B-5-7-1和20CLM B-3-3系統(tǒng)發(fā)育分析Fig.4 Phylogenetic analysis of strains 20CLM B-2-34,20BLM B-1-14,20CLM B-5-7-1 and 20CLM B-3-3 constructed based on 16S rRNA gene sequences

圖5 基于16S rRNA基因序列構(gòu)建的20CLM B-8-2、20CLM B-2-18、20DLM B-2-8、20DLM B-10-5、20DLM B-4-4和20DLM B-8-6系統(tǒng)發(fā)育分析Fig.5 Phylogenetic analysis of 20CLM B-8-2,20CLM B-2-18,20DLM B-2-8,20DLM B-10-5,20DLM B-4-4 and 20DLM B-8-6 based on 16S rRNA gene sequences

圖6 基于16S rRNA基因序列構(gòu)建的20DLM B-2-2、20DLM B-5-13和20DLM B-9-8系統(tǒng)發(fā)育分析Fig.6 Phylogenetic analysis of 20DLM B-2-2,20DLM B-5-13 and 20DLM B-9-8 based on 16S rRNA gene sequences

表3 細(xì)菌菌株鑒定結(jié)果Tab.3 Identification results of bacterial strains

2.2 藜麥莖稈和葉片部位細(xì)菌和真菌OTU分析

由圖7 可見(jiàn),Venn 圖顯示了藜麥患病莖稈和葉片部位共有的及各自特有的OTU?;疾∏o稈部位特有的真菌OTU 為1,患病葉片部位特有的真菌OUT 為6,2 個(gè)部位共有真菌OTU 為9,重疊的OTU 為2,占比22.2%,表明患病葉片部位的真菌多樣性高于部位?;疾∏o稈部位無(wú)特有的細(xì)菌OTU,患病葉片部位特有的細(xì)菌OUT為9,2個(gè)部位共有細(xì)菌OTU為13,重疊的OTU為4,占比30.8%,表明患病葉片部位的細(xì)菌多樣性高于莖稈部位。綜合分析,患病葉片部位的微生物多樣性遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于莖稈。

圖7 藜麥莖稈和葉片部位真菌和細(xì)菌群落OTU韋恩圖Fig.7 OTU Venn diagram of fungal and bacterial communities in quinoa stem and leaf parts

2.3 藜麥莖稈和葉片部位細(xì)菌和真菌多樣性分析

患真菌病害的藜麥的不同部位細(xì)菌和真菌多樣性統(tǒng)計(jì)結(jié)果見(jiàn)表4。藜麥患病莖稈部位真菌群落劃分為1 個(gè)門(mén)、1 個(gè)綱、1 個(gè)目、1 個(gè)科、2 個(gè)屬,細(xì)菌群落為1 個(gè)門(mén)、1 個(gè)綱、1 個(gè)目、1 個(gè)科、1 個(gè)屬。藜麥患病葉片部位真菌群落為1 個(gè)門(mén)、3 個(gè)綱、4 個(gè)目、4 個(gè)科、4 個(gè)屬,細(xì)菌群落為2 個(gè)門(mén)、2 個(gè)綱、2 個(gè)目、2 個(gè)科、3 個(gè)屬。

表4 藜麥莖稈和葉片部位細(xì)菌和真菌群落各分類地位數(shù)量Tab.4 Number of taxonomic positions of bacterial and fungal communities in stems and leaves of quinoa

多樣性指數(shù)值計(jì)算結(jié)果見(jiàn)表5,Chao1指數(shù)表明患病葉片部位細(xì)菌豐富度幾乎為莖稈部位的5倍,真菌豐富度幾乎為莖稈部位的3 倍,說(shuō)明葉片中分離到的細(xì)菌和真菌豐富度遠(yuǎn)高于莖稈。Shannon 指數(shù)和Simpson指數(shù)都說(shuō)明患病葉片中分離到的真菌和細(xì)菌多樣性都略高于莖稈部位。

2.4 不同分類水平下真菌和細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)分析

2.4.1 屬分類水平 在屬的分類水平下,分析藜麥患病莖稈和葉片部位真菌及細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)(圖8)。結(jié)果表明,莖稈和葉片中分離到的主要優(yōu)勢(shì)真菌為鏈格孢屬Alternariasp.,占所有真菌總數(shù)的33.4%。莖稈中的優(yōu)勢(shì)真菌為鏈格孢屬Alternariasp.(71.4%),占其分離真菌總數(shù)量的比例明顯高于葉片(16.7%);葉片中的優(yōu)勢(shì)真菌為毛殼屬Chaetomiumsp.和青霉屬Penicilliumsp.,相對(duì)豐度分別為36.7%、33.3%。莖稈和葉片中主要優(yōu)勢(shì)細(xì)菌為芽孢桿菌屬Bacillussp.,占所有細(xì)菌總數(shù)的84.6%。莖稈中的細(xì)菌全部為芽孢桿菌屬Bacillussp.;葉片中包括芽孢桿菌屬Bacillussp.、沙雷氏屬Serratiasp.和Heyndrickxiasp.,芽孢桿菌屬的相對(duì)豐度為98.5%,其余屬的豐度占比為1.0%~0.5%。

2.4.2 種分類水平 從圖9 可以看出,在種的分類水平下,藜麥患病莖稈和葉片部位分離到的主要的優(yōu)勢(shì)真菌為A.alternata,占所有真菌總數(shù)的27.5%,其次為C.elatum(22.7%)和P.polonicum(20.4%)。藜麥莖稈部位包括3 個(gè)種的真菌:A.alternata、A.tenuissima和N.calvescens,莖稈中的優(yōu)勢(shì)種A.alternata(64.3%)占其分離真菌總數(shù)量的比例明顯高于葉片(10.0%);葉片中的優(yōu)勢(shì)種為C.elatum(33.3%)和P.polonicum(30.0%),其余各種如C.spinaciae、A.alternata、A.tenuissima、A.brassicae、P.goetzii、C.globosum所占比例差異不明顯。藜麥患病莖稈和葉片部位主要的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌種為B.velezensis和B.tequilensis,占所有細(xì)菌總數(shù)的36.8%和34.0%。莖稈中B.velezensis豐度比例為60.0%,其余各種豐度比例為10.0%~20.0%;葉片中的優(yōu)勢(shì)種為B.velezensis(35.6%)和B.tequilensis(35.1%),其余各種的豐度比例為0.5%~11.7%。

3 討論

藜麥作為一種新型高價(jià)值作物,被聯(lián)合國(guó)糧農(nóng)組織認(rèn)為是一種單體植物即可滿足人體基本營(yíng)養(yǎng)需求的食物[11]。本研究對(duì)藜麥患病莖稈、葉片部位細(xì)菌和真菌群落進(jìn)行多樣性分析。結(jié)果表明在分離得到的真菌中鏈格孢屬Alternariasp.是優(yōu)勢(shì)屬,豐度為33.4%。鏈格孢屬真菌作為重要的植物病原菌,引起的嚴(yán)重病害包括黑斑病、葉斑病等[10]。張斌等[22]研究發(fā)現(xiàn)由A.alternata和A.gaisen等多種鏈格孢菌引起的柑橘黑腐病和褐斑?。籝an等[23]在我國(guó)江蘇省的幾個(gè)山核桃品種發(fā)現(xiàn)由A.tenuissima引起葉黑斑??;Yosra 等[24]調(diào)查發(fā)現(xiàn)孜然鏈格孢A.burnsii引起突尼斯地區(qū)菜豆葉斑病,在病害易爆發(fā)時(shí)期,可造成極大損失;Hahn等[25]在巴西尖葉石杉上發(fā)現(xiàn)由A.arborescens引起的葉斑病。說(shuō)明引起藜麥病害的病原菌很有可能為鏈格孢屬Alternariasp.真菌。毛殼屬Chaetomiumsp.和青霉屬Penicilliumsp.是除鏈格孢屬外分離得到較多的真菌,豐度均為22.2%。在此前的研究中發(fā)現(xiàn),毛殼屬真菌可以用來(lái)防治棉花黃萎病[26],用于柑橘采后保鮮[27],也造成石榴葉斑病[28]等。青霉屬真菌可以抑制青枯菌活性[29],刺盤(pán)孢屬Colletotrichumsp.真菌可侵染線辣椒、箭筈豌豆等植物,造成產(chǎn)量下降[30-31]。

芽孢桿菌作為一類重要的生防菌資源,能夠有效預(yù)防植物病害。本研究對(duì)藜麥患病莖稈、葉片部位細(xì)菌群落進(jìn)行多樣性分析,結(jié)果表明分離得到的細(xì)菌優(yōu)勢(shì)屬為芽孢桿菌屬,豐度為84.6%,優(yōu)勢(shì)種為B.velezensis和B.tequilensis。據(jù)有關(guān)報(bào)道,藜麥種子內(nèi)生菌枯草芽孢桿菌、沙福芽孢桿菌可以防治藜麥葉斑病和藜麥菌核病[10,12],藜麥葉片內(nèi)生菌貝萊斯芽孢桿菌可以防治藜麥葉斑病[14],枯草芽孢桿菌可以防治棉花立枯病和黃萎病[32],特基拉芽孢桿菌可以防治稻瘟病等[33],貝萊斯芽孢桿菌可以防治桃樹(shù)根腐病、水稻紋枯病和花生白絹病等[34-36],萎縮芽孢桿菌可以抑制蘋(píng)果樹(shù)腐爛病菌菌絲生長(zhǎng)和孢子的萌發(fā)、防治櫻桃葉斑病[37-38]。

本研究對(duì)從藜麥患病莖稈和葉片部位獲得的細(xì)菌和真菌菌株進(jìn)行了形態(tài)學(xué)和分子學(xué)方面的初步探索,分析不同患病部位細(xì)菌和真菌組成及多樣性,初步探討了患病部位菌株組成差異,為后期研究提供了試驗(yàn)基礎(chǔ)及供試菌株,為之后研究菌株的次生物質(zhì)、誘導(dǎo)植物產(chǎn)生抗性等作用以及菌種資源開(kāi)發(fā)奠定了基礎(chǔ)。

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