陳蕾
(武漢市動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心,湖北 武漢 430014)
布魯氏菌屬的細(xì)菌為革蘭氏陰性兼性胞內(nèi)寄生菌,屬于α-變形桿菌綱下的根瘤菌目。布魯氏菌對(duì)淋巴系統(tǒng)和生殖系統(tǒng)具有很強(qiáng)的組織趨向性,其細(xì)胞內(nèi)存活方式限制機(jī)體對(duì)其先天性和適應(yīng)性免疫反應(yīng),也隔離了抗生素的作用。在發(fā)展中國家,由于根除布魯氏菌病是一項(xiàng)昂貴、耗時(shí)和勞動(dòng)密集型的項(xiàng)目,很難在資源有限的國家有效實(shí)施,因此布魯氏菌病仍然是一個(gè)嚴(yán)重的問題。
接種疫苗和布魯氏菌病的檢疫撲殺都可有效降低布魯氏菌病的流行,這2項(xiàng)活動(dòng)可同時(shí)進(jìn)行。澳大利亞和新西蘭成功控制布魯氏菌病的經(jīng)驗(yàn)也表明設(shè)計(jì)良好、覆蓋率高的疫苗接種方案結(jié)合檢疫撲殺方法可以實(shí)現(xiàn)布魯氏菌病的根除[1]。早期使用M5、H38等疫苗預(yù)防動(dòng)物布魯氏菌病,目前使用的動(dòng)物疫苗是S19、Rev.1、S2、RB51和SR82,現(xiàn)階段還沒有批準(zhǔn)用于人類布魯氏菌病的有效疫苗[2]。
上述疫苗均存在某些缺陷,如接種后產(chǎn)生的抗體會(huì)干擾鑒別診斷,免疫效果不穩(wěn)定,存在安全性方面的問題等。因此研制安全性高、免疫保護(hù)效果好、能夠與野毒感染相鑒別診斷的布魯氏菌疫苗有助于推進(jìn)布魯氏菌病的凈化工作。而詳細(xì)的文獻(xiàn)計(jì)量研究和綜述有助于對(duì)以往關(guān)于布魯氏菌疫苗的研究進(jìn)行梳理,從而發(fā)現(xiàn)現(xiàn)有研究的重點(diǎn)和不足,對(duì)未來布魯氏菌疫苗研究有一定指導(dǎo)意義。
CiteSpace是一款基于java的應(yīng)用程序,通過計(jì)量學(xué)、共現(xiàn)分析和聚類分析,對(duì)某一學(xué)科或知識(shí)領(lǐng)域某一時(shí)期的科學(xué)文獻(xiàn)熱點(diǎn)和研究前沿進(jìn)行分析和可視化,彌補(bǔ)了傳統(tǒng)文獻(xiàn)綜述的的不足,可直觀表現(xiàn)研究熱點(diǎn)。本研究擬通過CiteSpace分析布魯氏菌疫苗的熱點(diǎn)和研究前沿,為研制安全、免疫效果好、能與野毒感染相區(qū)別的布魯氏菌疫苗指明方向。
以Webof Science核心數(shù)據(jù)庫為文獻(xiàn)檢索數(shù)據(jù)庫,以布魯氏菌疫苗作為主要檢索詞,具體檢索策略如下。
主題= Brucella vaccine
語言=English
文獻(xiàn)類型=Article & Review
時(shí)間跨度=1985—2022
檢索時(shí)間為2022年4月16日。經(jīng)過數(shù)據(jù)清洗、去重與人工篩選,最后得到1 118篇外文文獻(xiàn),其中論文1 030篇,綜述88篇。所有文獻(xiàn)記錄以純文本格式輸出。
本文結(jié)合文獻(xiàn)計(jì)量運(yùn)用Cite Space對(duì)布魯氏菌疫苗文獻(xiàn)進(jìn)行深入分析。參照Chen[3]的研究,Cite Space可以對(duì)收集到的論文的主題結(jié)構(gòu)和研究熱點(diǎn)進(jìn)行分析和可視化。研究首先通過數(shù)量統(tǒng)計(jì)方式分別從年度發(fā)文量、發(fā)文期刊對(duì)文獻(xiàn)外部特征進(jìn)行分析。其次,采用共被引文獻(xiàn)和共被引術(shù)語分析方法,尋找關(guān)鍵參考文獻(xiàn),識(shí)別研究模式,發(fā)現(xiàn)布魯氏菌疫苗研究領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。
論文發(fā)表數(shù)量是衡量學(xué)科發(fā)展的主要指標(biāo)之一。本文根據(jù)檢索文獻(xiàn),繪制了布魯氏菌疫苗研究的年度論文發(fā)表數(shù)量,見圖1,并對(duì)每年論文發(fā)表數(shù)量進(jìn)行指數(shù)擬合,以直觀反應(yīng)布魯氏菌疫苗研究的整體趨勢(shì)。盡管1999年發(fā)表1篇關(guān)于布魯氏菌疫苗的論文,但其后4年內(nèi)布魯氏菌疫苗研究并未得到學(xué)者的關(guān)注。從2004年開始,布魯氏菌疫苗的研究才引起少量學(xué)者的興趣;至此以后,布魯氏菌疫苗文獻(xiàn)呈現(xiàn)增長趨勢(shì),2006年發(fā)文數(shù)量達(dá)到50篇,2020年發(fā)文數(shù)量達(dá)91篇,近幾年布魯氏菌疫苗研究論文均穩(wěn)定在85篇左右。通過擬合每年論文發(fā)表數(shù)量的指數(shù)函數(shù),擬合曲線R方為0.5,曲線擬合較好,說明布魯氏菌疫苗研究數(shù)量呈指數(shù)型增長,這也意味著布魯氏菌疫苗研究越來越受到青睞。
圖1 各年份論文發(fā)表數(shù)量
隨著各領(lǐng)域?qū)W者對(duì)布魯氏菌疫苗研究興趣的不斷增加,有關(guān)布魯氏菌疫苗研究的視角和應(yīng)用范圍呈現(xiàn)出多樣化的趨勢(shì)。通過分析布魯氏菌疫苗研究所涉及的期刊和高被引文獻(xiàn)的分布情況,可以從更廣泛范圍剖析該領(lǐng)域研究狀況。根據(jù)布拉德福定律,參考Tjosvold等提出的核心區(qū)計(jì)算方法,計(jì)算核心期刊,即r0=2ln(eE*Y)[4]。其中,r0為核心區(qū)數(shù)量,E為歐拉系數(shù),E=0.577 2,Y為最大發(fā)文量期刊的載文量。由此計(jì)算得到r0=2ln(1.7818*111)≈10.57,近似認(rèn)為排名前10位的期刊處于核心區(qū)域,發(fā)文量共計(jì)360篇,占發(fā)文總數(shù)32.20%。從影響因子來看,核心期刊的影響因子均較高,且不乏動(dòng)物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的權(quán)威期刊,見表1。
表1 核心期刊分析
通過分析布魯氏菌疫苗的文獻(xiàn)共被引圖譜與高頻被引論文,可以非常清晰的了解對(duì)領(lǐng)域闡述重要影響的學(xué)術(shù)論文與主要學(xué)者,從而深入剖析該領(lǐng)域的奠基性文獻(xiàn)與理論基礎(chǔ)。本文通過CiteSpace6.1軟件繪制文獻(xiàn)共被引圖譜,見圖2,統(tǒng)計(jì)被引頻次前五的文獻(xiàn),見表2。圖2中每個(gè)節(jié)點(diǎn)代表一篇文獻(xiàn),由文獻(xiàn)的第一作者(年份)進(jìn)行表示。節(jié)點(diǎn)大小代表共被引次數(shù),節(jié)點(diǎn)越大表示共被引次數(shù)越多。節(jié)點(diǎn)間聯(lián)系粗細(xì)表示共被引關(guān)系的強(qiáng)弱。表2中顯示了被引頻次最高的五篇文獻(xiàn)。Dorneles等[5]的文章被引頻次最高,共被引39次。論文主要闡明流產(chǎn)布魯氏菌疫苗在牛布魯氏菌病控制/根除計(jì)劃中發(fā)揮的關(guān)鍵作用,并對(duì)近年來用于布魯氏菌病防控的若干種疫苗以及新型流產(chǎn)布魯氏菌疫苗的研制現(xiàn)狀進(jìn)行了綜述,最后結(jié)論認(rèn)為通過建立數(shù)學(xué)模型或評(píng)估接種疫苗后的免疫反應(yīng)來定義與抗體保護(hù)相關(guān)的免疫標(biāo)記物,將對(duì)流產(chǎn)布魯氏菌候選疫苗的篩選非常有幫助。其次,Moriyón等[6]的文章被引38次,其主要對(duì)粗糙型動(dòng)物布魯氏菌病疫苗的結(jié)構(gòu)、遺傳基礎(chǔ)及現(xiàn)狀進(jìn)行了分析。引用排名第3的是deFigueiredo等[7]的文章,論文總結(jié)道目前還沒有針對(duì)人類布魯氏菌病安全、有效的疫苗或?qū)颊哂押玫闹委煼椒ǎ@種疾病也需要低成本的臨床鑒別診斷。然而,隨著人們對(duì)布魯氏菌病病理和分子發(fā)病機(jī)制認(rèn)識(shí)日益加深,識(shí)別和評(píng)估新的藥物治療靶點(diǎn)以及應(yīng)用反向疫苗學(xué)和其他基因組工具開發(fā)安全、有效的亞單位疫苗的機(jī)會(huì)將大大增加。引用排名第4位和第5位的是Avila-Calderón和Lalsiamthara等[8-9]的文章,分別被引用34和33次,這2篇論文主要對(duì)布魯氏菌的細(xì)菌學(xué)、發(fā)病機(jī)制、免疫學(xué)意義、候選疫苗、與布魯氏菌相關(guān)的模型及布魯氏菌疫苗研制方法進(jìn)行了綜述。
表2 高被引文獻(xiàn)分析
圖2 布魯氏菌疫苗文獻(xiàn)共被引圖譜
關(guān)鍵詞作為作者對(duì)論文的總體概括,可非常清楚的了解研究的主題領(lǐng)域。本文利用Cite Space 對(duì)文獻(xiàn)進(jìn)行關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析,共現(xiàn)次數(shù)最多的為infection 258次,其次為melitensis 208次、vaccine 205次、abortus 193次。這些高頻共現(xiàn)關(guān)鍵詞代表了研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)詞匯,也形成研究領(lǐng)域知識(shí)傳播的關(guān)鍵途徑。此外,還對(duì)關(guān)鍵詞共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行聚類分析,見圖3。關(guān)鍵詞分為9個(gè)聚類,其中聚類1和聚類2出現(xiàn)時(shí)間最晚,可認(rèn)為是現(xiàn)在學(xué)者關(guān)注的研究方向。
圖3 關(guān)鍵詞聚類分析時(shí)序圖
研究前沿是科學(xué)研究中最新、最有發(fā)展?jié)摿Φ难芯恐黝}或領(lǐng)域。與研究熱點(diǎn)不同,研究前沿通常表現(xiàn)為一組突現(xiàn)的動(dòng)態(tài)概念和潛在的研究問題,利用文獻(xiàn)突現(xiàn)分析能夠了解文獻(xiàn)的時(shí)間分布和動(dòng)態(tài)變化性的特點(diǎn),可以較好地反映知識(shí)域內(nèi)的研究前沿和發(fā)展趨勢(shì)。從圖4的文獻(xiàn)突現(xiàn)分析,布魯氏菌疫苗研究領(lǐng)域呈現(xiàn)出多元化特征,不同時(shí)期出現(xiàn)不同的突變文獻(xiàn)。強(qiáng)度最大的文獻(xiàn)是Moriyón[6]的文章,其值為18.54;最長突現(xiàn)時(shí)間為5年,可說明關(guān)于布魯氏菌疫苗研究一直在不斷更新與發(fā)展。最近5年突現(xiàn)的文獻(xiàn)為Franc和Lalsiamthara等的文章,F(xiàn)ranc提到要減少或根除布魯氏菌病,必須采取跨學(xué)科或“同一健康”的措施,加快對(duì)布魯氏菌疫苗和診斷試劑的研發(fā)和改良[10]。Lalsiamthara等提到較為理想的布魯氏菌疫苗要求能在宿主體內(nèi)引起強(qiáng)烈的細(xì)胞免疫反應(yīng),為機(jī)體提供更好的保護(hù)力[9]。能誘導(dǎo)分泌IL-12和INF-γ的靶向宿主免疫的疫苗應(yīng)該能提供較好保護(hù)力。上述文獻(xiàn)在布魯氏菌疫苗研究領(lǐng)域中比較活躍,有可能成為未來一段時(shí)間的研究前沿趨勢(shì)。
圖4 布魯氏菌疫苗領(lǐng)域的文獻(xiàn)突現(xiàn)分析
利用Cite Space軟件分別從年度發(fā)文量、發(fā)文期刊、文獻(xiàn)共被引文獻(xiàn)和關(guān)鍵詞聚類分析探索了布魯氏菌疫苗的研究方向。從核心期刊發(fā)文量上來看,關(guān)于布魯氏菌疫苗的研究在2004年后大體上呈現(xiàn)逐年增長的趨勢(shì),關(guān)于布魯氏菌疫苗的研究依舊有增無減,表明布魯氏菌病的控制仍然需要疫苗技術(shù)的支持。從發(fā)文期刊上來看,載文量排名前10的期刊中,與獸醫(yī)或動(dòng)物相關(guān)期刊占了將近一半,包括VETERINARY MICROBIOLOGY、VETERINARY IMMUNOLOGY AND IMMUNOPATHOLOGY、TROPICAL ANIMAL HEALTH AND PRODUCTION、VETERINARY RESEARCH,表明動(dòng)物布魯氏菌病的疫苗研究較受重視。文獻(xiàn)共被引與高被引分析顯示,引用頻次最高的5篇文章均為綜述類文章,高被引文章提到,經(jīng)典疫苗總是有其缺陷性,如影響血清學(xué)診斷、有返強(qiáng)風(fēng)險(xiǎn)、對(duì)治療布魯氏菌病的抗生素利福平耐藥等。目前正處于探索研發(fā)階段的疫苗有重組蛋白疫苗、載體疫苗、DNA疫苗、外膜囊泡疫苗等。關(guān)鍵詞聚類分析顯示布魯氏菌主要的危害性,導(dǎo)致流產(chǎn),影響繁殖能力,也彰顯了疫苗研究的意義。脂多糖是目前研究的熱點(diǎn)。從文獻(xiàn)突現(xiàn)分析可以發(fā)現(xiàn)布魯氏菌疫苗研究一直在不斷向前發(fā)展,還有許多問題需要學(xué)者繼續(xù)完善和努力。