陳彥如,張 嵐,王光麗
(江南大學(xué) 化學(xué)與材料工程學(xué)院,江蘇 無錫 214122)
NF-κB p50是一種關(guān)鍵的多效轉(zhuǎn)錄因子,在基因表達(dá)中起著重要作用。NF-κB p50的研究對(duì)白血病、乳腺癌、肺癌等相關(guān)癌癥具有重要意義[1]。近年來,針對(duì)NF-κB p50的檢測(cè)方法主要包括電化學(xué)法[2]、熒光法[3]和比色法[4]。其中,比色法操作簡(jiǎn)便,易于可視化檢測(cè)、成本較低且無需昂貴復(fù)雜的儀器。因此,開發(fā)靈敏度較高、選擇性好的比色分析方法具有重要意義。
納米酶作為當(dāng)前研究的熱點(diǎn),具有合成簡(jiǎn)便、穩(wěn)定性高、成本低和催化活性可調(diào)等優(yōu)點(diǎn)[5-6]。目前,比色分析中采用的納米酶不容易直接與生物反應(yīng)結(jié)合構(gòu)建巧妙的生物傳感平臺(tái)。雖然原位形成的納米酶為構(gòu)建生物傳感器提供了新視角,但其形成仍受限于堿性磷酸酶介導(dǎo)的酶促反應(yīng)并局限于免疫分析或酶分析[7]。因此,探索新型原位形成的納米酶與其他多樣化的生物反應(yīng)相結(jié)合以構(gòu)建新型生物傳感體系具有重要意義。
本文構(gòu)建了一種將K4Fe(CN)6配位到PbTiO3表面獲得原位納米酶的新策略,且PbTiO3表面原位形成的納米酶活性可通過脫氧核糖核苷5′-單磷酸(dNMP)進(jìn)行調(diào)節(jié)?;谶@一發(fā)現(xiàn),以NF-κB p50為目標(biāo)物,開發(fā)了一種無標(biāo)記、無固定且高靈敏的生物傳感平臺(tái)。當(dāng)NF-κB p50不存在時(shí),在核酸外切酶Exo III的作用下,dNMP不斷產(chǎn)生并結(jié)合在PbTiO3表面,阻礙了K4Fe(CN)6在PbTiO3表面原位形成納米酶。NF-κB p50存在時(shí),dNMP難以產(chǎn)生,使得K4Fe(CN)6順利結(jié)合到PbTiO3表面,催化底物TMB氧化,以此實(shí)現(xiàn)NF-κB p50的定量檢測(cè)。本研究開發(fā)的一種原位形成納米酶新方法具有靈敏度高、選擇性好和操作簡(jiǎn)便等優(yōu)點(diǎn)。
JEM-2100plus型透射電子顯微鏡(日本日立株式會(huì)社);D8型X射線衍射儀(德國布魯克AXS有限公司);Nicolet FT-IR 6700型紅外光譜儀(美國賽默飛公司);UV-3600型紫外可見近紅外分光光度計(jì)(日本島津公司);InVia型共焦拉曼光譜儀(英國雷尼紹貿(mào)易有限公司);FS5型熒光分光光度計(jì)(英國愛丁堡儀器公司);SpectraMax M5型酶標(biāo)儀(美國分子儀器公司);DYY-8C型凝膠電泳儀(北京六一生物科技有限公司)。
Pb(NO3)2、鈦酸四正丁酯、Tween 20、K4Fe(CN)6、叔丁醇、3,3′,5,5′-四甲基聯(lián)苯胺、KI、NaHCO3、對(duì)苯二甲酸、過硫酸銨和30%H2O2(分析純,國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司);辣根過氧化物酶(HRP,≥250 U/mg)、超氧化物歧化酶(SOD,≥2 500 U/mg)購自Sigma-Aldrich公司;30%丙烯酰胺/雙丙烯酰胺(29∶1)溶液、4S Gel Red、N,N,N′,N′-四甲基乙二胺、牛血清白蛋白(BSA)、甲胎蛋白(AFP)、癌胚抗原(CEA)、前列腺特異性抗原(PSA)、人血清白蛋白(HSA)購自上海生工生物工程股份有限公司;NF-κB p50、NF-κB p65購自南京百斯凱科技有限公司。
實(shí)驗(yàn)所用HPLC純化的DNA購于上海生工生物工程有限公司,所用序列如下:
單鏈DNA 1(P1):5′-TCA GGA AAG TCC C-3′;
單鏈DNA 2(P2):5′-GGG ACT TTC CTG AGA CTT AGC-3′(加粗序列表示NF-κB p50蛋白的識(shí)別序列);
發(fā)夾DNA探針:5′-GCT AAG TCT CAG GAA AG T CCC GAC TTA GCA TCG-3′。
PbTiO3的合成根據(jù)文獻(xiàn)稍作修改[8]:0.331 2 g Pb(NO3)2溶解于50 mL去離子水中,向該溶液中加入1.82 mL Tween 20,并在室溫下不斷攪拌。將0.35 mL Ti(C4H9O)4加至上述溶液,所得混合液在60℃劇烈攪拌30 min,收集的沉淀物在600℃下煅燒120 min。
將2.0 μmol/L單 鏈DNA(P1和P2)在10 mmol/L pH 7.5的Tris-HCl緩沖 液(含10 mmol/L MgCl2,100 mmol/L NaCl)中混合并于95℃下加熱5 min,冷卻至室溫。將20 μL P1/P2與10 μL不同濃度的NF-κB p50蛋白在30 μL蛋白結(jié)合緩沖液(10 mmol/L Tris-HCl,包含100 mmol/L KCl、2 mmol/L MgCl2、0.25 mmol/L DTT,pH 7.5)中混合,室溫下孵育30 min,使NF-κB p50蛋白與其識(shí)別雙鏈DNA序列結(jié)合。隨后,向上述混合液中加入20 μL 1.0 U/μL ExoⅢ和20 μL 1 μmol/L發(fā)夾DNA探針,37℃下孵育1 h。
隨后,向上述混合液中加入20 μL 1.0 mg/mL PbTiO3懸浮液,反應(yīng)2 min后,依次加入20 μL 0.05 mmol/L K4Fe(CN)6、20 μL 5.0 mmol/L TMB、20 μL 5.0 mmol/L H2O2和NaAc-HAc緩 沖 液(0.2 mol/L,pH 4.5),使反應(yīng)混合物的最終體積為200 μL。充分混合后,35℃反應(yīng)20 min,測(cè)定oxTMB在652 nm處的吸光度。
采用非變性聚丙烯酰胺(15%)凝膠電泳研究不同情況下的體系產(chǎn)物。將7.5 μL反應(yīng)產(chǎn)物和2.5 μL 6×樣品緩沖液混合后加入聚丙烯酰胺凝膠泳道中,在1×TBE緩沖液(89 mmol/L的Tris-硼酸,pH 8.0)中進(jìn)行凝膠電泳。先在80 V下電泳1 h,然后在110 V下繼續(xù)電泳1 h。最后,采用3×4S GelRed核酸染料在黑暗中染色30 min,Gel Doc XR+成像系統(tǒng)拍照。
為評(píng)估所提出的比色分析的實(shí)用性,收集HeLa細(xì)胞提取物作為真實(shí)樣品。HeLa細(xì)胞按照文獻(xiàn)進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng)[9],使用細(xì)胞核提取試劑盒(Active Motif,Carlsbad,CA)提取細(xì)胞溶液產(chǎn)物用于測(cè)定。向細(xì)胞核提取液中加入不同濃度的標(biāo)準(zhǔn)NF-κB p50溶液進(jìn)行實(shí)驗(yàn),操作步驟同“1.3”。
采用透射電子顯微鏡(TEM)對(duì)合成的PbTiO3進(jìn)行表征,可觀察到PbTiO3為約30~45 nm的納米片(圖1A)。PbTiO3的X射線衍射圖(XRD)顯示PbTiO3的衍射峰歸屬于四方相的PbTiO3(JCPDS No.06-0452)(圖1B),表明已成功合成PbTiO3納米材料。
圖1 PbTiO3的TEM圖(A)及XRD圖(B)Fig.1 TEM image(A)and XRD pattern(B)of PbTiO3
分別考察不同物質(zhì)氧化TMB后的吸收光譜(見圖2)。結(jié)果顯示,只有當(dāng)PbTiO3、K4Fe(CN)6和H2O2同時(shí)存在時(shí),TMB才能被催化為藍(lán)色的oxTMB,此時(shí)的吸收光譜最強(qiáng),推測(cè)PbTiO3與K4Fe(CN)6反應(yīng)形成的PbTiO3/K4Fe(CN)6復(fù)合物具有類過氧化物酶活性,能在H2O2存在下催化氧化TMB。根據(jù)報(bào)道可知[10],K4Fe(CN)6中C≡≡N基團(tuán)可與TiO2納米顆粒表面暴露的Ti(IV)結(jié)合。考察了PbTiO3、K4Fe(CN)6以及K4Fe(CN)6/PbTiO3的吸收光譜圖。如圖3A所示,乳白色PbTiO3懸浮液在加入無色K4Fe(CN)6溶液后呈黃色,絡(luò)合后的吸收波長(zhǎng)明顯紅移,證明PbTiO3與K4Fe(CN)6成功結(jié)合。從FT-IR光譜(圖3B)可以看出,經(jīng)過K4Fe(CN)6處理的PbTiO3樣品中出現(xiàn)一個(gè)屬于—C≡≡N的伸縮振動(dòng)吸收峰(2 023 cm-1)[11],該峰與純K4Fe(CN)6中的—C≡≡N位置接近,表明K4Fe(CN)6成功絡(luò)合在PbTiO3表面。如圖3C所示,配位后PbTiO3樣品的拉曼光譜也觀察到屬于—C≡≡N的特征峰(2 063、2 095 cm-1)[11],同樣表明PbTiO3與K4Fe(CN)6已成功結(jié)合。
圖2 不同反應(yīng)體系的吸收光譜Fig.2 Absorption spectra of different reaction systems
圖3 不同樣品的吸收光譜(A)、FT-IR光譜(B)及拉曼光譜(C)Fig.3 Absorption spectra(A),F(xiàn)T-IR spectra(B)and Raman spectra(C)for different samples
與天然酶和其他過氧化物納米酶相似,PbTiO3/K4Fe(CN)6的催化活性與反應(yīng)溶液pH值、反應(yīng)溫度及反應(yīng)時(shí)間等參數(shù)密切相關(guān)。如圖4A所示,納米酶在pH 4.5時(shí)顯示活性最佳,與HRP(pH 5.5時(shí)活性最佳)相比,納米酶能在更酸性的條件下保持相對(duì)較高的催化活性。從圖4B可以觀察到,納米酶和HRP分別在35℃和40℃時(shí)表現(xiàn)出最佳催化活性,且納米酶在較高的溫度下仍能保持較好的活性。反應(yīng)20 min左右,納米酶顯示出最佳催化活性(圖4C)。在上述最優(yōu)反應(yīng)條件下,探究了納米酶的穩(wěn)態(tài)動(dòng)力學(xué)參數(shù),并通過公式V=Vmax·[S]/(Km+[S])進(jìn)行計(jì)算(V為初始速度,Vmax為最大反應(yīng)速度,[S]為底物濃度,Km為Michaelis-Menten常數(shù))[12]。圖5A、B分別為不同濃度TMB、H2O2為底物時(shí)催化體系的吸光度隨反應(yīng)時(shí)間的變化。通過A、B圖,得到反應(yīng)速率與底物TMB或H2O2濃度的關(guān)系圖(圖5C、D),其插圖為反應(yīng)速率的倒數(shù)與底物濃度的倒數(shù)的關(guān)系圖。以TMB和H2O2為底物時(shí),計(jì)算所得的Km分別為0.199 mmol/L和0.131 mmol/L。與HRP相 比,PbTiO3/K4Fe(CN)6的Km明 顯 小 于HRP(TMB:0.434 mmol/L,H2O2:3.7 mmol/L[13]),說明PbTiO3/K4Fe(CN)6納米酶對(duì)TMB具有更高的親和力,并且在催化反應(yīng)達(dá)到最佳活性時(shí)所需要的H2O2濃度更少。
圖4 PbTiO3/K4Fe(CN)6和HRP在不同pH反應(yīng)溶液(A)和不同反應(yīng)溫度下的相對(duì)催化活性(B),以及PbTiO3/K4Fe(CN)6在不同反應(yīng)時(shí)間下的相對(duì)催化活性(C)Fig.4 Relative catalytic activities of PbTiO3/K4Fe(CN)6 and HRP in reaction solution with different pH values(A)and reaction temperatures(B),relative catalytic activities of PbTiO3/K4Fe(CN)6 at different reaction times(C)
圖5 PbTiO3/K4Fe(CN)6在500 μmol/L H2O2和不同濃度TMB(A)、500 μmol/L TMB和不同濃度H2O(2B)存在下的吸光度;以TMB(C)、H2O(2D)為底物時(shí)PbTiO3/K4Fe(CN)6的穩(wěn)態(tài)動(dòng)力學(xué)分析Fig.5 Absorbance of PbTiO3/K4Fe(CN)6 in the presence of 500 μmol/L H2O2 and different concentrations of TMB(A),500 μmol/L TMB and different concentrations of H2O(2B).Steady-state kinetic assay of the PbTiO3/K4Fe(CN)6 for the catalytic reaction with TMB(C),H2O(2D)as substrate inset:the Lineweaver-Burk plots of the double reciprocal of the Michaelis-Menten equation
為了探究催化反應(yīng)過程中的活性中間體,進(jìn)一步向催化體系中加入叔丁醇和NaHCO3(?OH的清除劑[14])。結(jié)果顯示,催化體系的活性無明顯變化(圖6A),說明?OH不是催化反應(yīng)的主要活性物質(zhì)。進(jìn)一步采用對(duì)苯二甲酸(TA)作為熒光探針[15]檢測(cè)?OH的產(chǎn)生(圖6B),結(jié)果顯示,TA本身或其與其它物質(zhì)的混合物并無熒光產(chǎn)生(曲線a、b),TA與H2O2反應(yīng)會(huì)在425 nm處產(chǎn)生微弱的熒光(曲線c),而TA在催化體系中的熒光(曲線d)比曲線c的熒光強(qiáng)度低,表明催化體系中未產(chǎn)生?OH。當(dāng)存在O·-2的清除劑超氧化物歧化酶(SOD)[16]時(shí),納米酶的催化活性明顯受到SOD的影響,表明在催化氧化TMB過程中,O·-2作為活性中間體催化氧化TMB。
圖6 不同清除劑對(duì)PbTiO3/K4Fe(CN)6相對(duì)活性的影響(A),以及不同反應(yīng)體系的熒光光譜(B)Fig.6 Effects of different scavengers on the relative activity of PbTiO3/K4Fe(CN)6(A),fluorescence spectra of different reaction systems(B)
據(jù)報(bào)道,dNMP中的磷酸根可與PbTiO3表面的Ti緊密結(jié)合[17]?;谶@一反應(yīng),設(shè)計(jì)了NF-κB P50蛋白的檢測(cè)體系,檢測(cè)原理如圖7所示:兩個(gè)反向互補(bǔ)的單鏈DNA(命名為P1和P2),雜交后得到具有NFκB p50特異性識(shí)別序列的雙鏈DNA(命名為P1/P2)。當(dāng)NF-κB P50不存在時(shí),P1/P2中的P1被ExoⅢ水解并產(chǎn)生dNMP,釋放的P2與隨后加入的發(fā)夾DNA繼續(xù)雜交并不斷被ExoⅢ水解,同時(shí)被釋放的發(fā)夾DNA不斷與剩余的P2雜交以啟動(dòng)下一輪的水解,釋放的大量dNMP吸附在PbTiO3表面并阻止納米酶的形成。當(dāng)存在NF-κB P50時(shí),P1/P2在結(jié)合NF-κB P50后無法被ExoⅢ水解[18],反應(yīng)體系中無法產(chǎn)生dNMP,使得K4Fe(CN)6順利與PbTiO3結(jié)合,催化TMB由無色變?yōu)樗{(lán)色,基于此可實(shí)現(xiàn)對(duì)NF-κB P50的檢測(cè)。
圖7 ExoⅢ輔助的信號(hào)放大反應(yīng)比色檢測(cè)NF-κB p50的示意圖Fig.7 Schematic illustration of colorimetric determination of NF-κB p50 by ExoⅢassisted signal amplification
如圖8A和B所示,當(dāng)不存在NF-κB p50時(shí),P1/P2不影響整個(gè)體系的模擬酶活性(曲線a,b),添加ExoⅢ后,P1/P2被水解,產(chǎn)生的dNMP抑制納米酶的形成,導(dǎo)致吸光度顯著降低(曲線d)。引入發(fā)夾DNA(Hairpin)后,產(chǎn)生更多dNMP,導(dǎo)致吸光度進(jìn)一步降低(曲線e)。而存在NF-κB p50時(shí),無法通過ExoⅢ水解產(chǎn)生dNMP,使K4Fe(CN)6能順利結(jié)合到PbTiO3表面形成納米酶,導(dǎo)致吸光度恢復(fù)(曲線c)。采用凝膠電泳進(jìn)一步驗(yàn)證該策略的可行性(圖8C)。相對(duì)于泳道1~3中單獨(dú)的P1、P2或P1/P2,泳道4中的條帶歸因于DNA雙鏈P1/P2被ExoⅢ水解后的產(chǎn)物P2。將P1/P2、ExoⅢ和發(fā)夾DNA混合后(泳道6),由釋放的P2與發(fā)夾DNA形成的雙鏈DNA不斷被ExoⅢ水解,同時(shí)釋放出發(fā)夾DNA用于下一輪水解反應(yīng),其位置與泳道5中單獨(dú)的發(fā)夾DNA的條帶相近。而NF-κB p50的加入阻止了ExoⅢ的水解,因此在泳道7中產(chǎn)生一條遷移緩慢的條帶,上述結(jié)果證明該策略是可行的。
圖8 紫外-可見吸收光譜(A)和oxTMB在不同溶液中的相應(yīng)直方圖(B),不同條件下的凝膠電泳圖(C)Fig.8 UV-Vis absorption spectrum(A)and the corresponding histograms(B)of the oxTMB in different solutions(C)Polyacrylamide gel electrophoresis image under different conditions
考察了加入不同濃度(0、0.003、0.05、0.1、0.3、0.5、1、5、10 nmol/L)的NF-κB p50對(duì)體系在最大吸收峰(652 nm)處吸光度的影響。結(jié)果顯示,隨NF-κB p50濃度的增加,氧化TMB在652 nm處的吸收強(qiáng)度逐漸增加(見圖9A)。這是由于越來越多的NF-κB p50蛋白嵌入P1/P2,阻止了ExoⅢ對(duì)P1/P2的水解,使得反應(yīng)體系中dNMP的產(chǎn)生較少,隨后K4Fe(CN)6順利與PbTiO3結(jié)合,形成的過氧化物模擬酶催化TMB由無色變?yōu)樗{(lán)色。根據(jù)圖9B、C,NF-κB p50蛋白的線性范圍為3.0 pmol/L~10 nmol/L,檢出限(LOD,S/N=3)為1.2 pmol/L。與其他已報(bào)道的檢測(cè)方法相比(表1),該方法由于設(shè)計(jì)了信號(hào)循環(huán)放大策略,使得檢測(cè)靈敏度提高,具有較寬的檢測(cè)范圍和較低的檢出限。此外,與其他不同NF-κB p50的檢測(cè)方法相比,這種基于納米酶的比色生物傳感平臺(tái)操作更簡(jiǎn)便且無需DNA修飾/固定等復(fù)雜步驟。
表1 不同NF-κB p50蛋白檢測(cè)方法的比較Table 1 Comparison of different methods for the detection of NF-κB p50
為了驗(yàn)證該方法的選擇性,選取一些可能存在的干擾物,如5.0 nmol/L的牛血清白蛋白(BSA)、甲胎蛋白(AFP)、癌胚抗原(CEA)、前列腺特異性抗原(PSA)、人血清白蛋白(HSA)和NF-κB p65,并對(duì)比其與0.5 nmol/L NF-κB p50的信號(hào)響應(yīng)情況。結(jié)果如圖9D所示,只有NF-κB p50能引起oxTMB在652 nm處的吸光度增強(qiáng),說明該方法對(duì)NF-κB p50檢測(cè)具有較好的選擇性。
圖9 不同濃度NF-κB p50的吸收光譜(A),NF-κB p50蛋白檢測(cè)的線性關(guān)系圖(B、C),及檢測(cè)方法的選擇性(D)Fig.9 The absorption spectra of NF-κB p50 at different concentrations of NF-κB p50,the linear calibration plots for NF-κB p50 detection(B,C),and the selectivity of the method(D)
采用標(biāo)準(zhǔn)加入法,將HeLa細(xì)胞提取液稀釋10倍進(jìn)行回收率考察(見表2)。結(jié)果顯示,NF-κB p50的回收率為99.1%~102%,相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差(RSD)不大于5.3%,表明該方法對(duì)HeLa細(xì)胞提取液樣品中NF-κB p50的檢測(cè)可行。
表2 HeLa細(xì)胞提取液中NF-κB p50的測(cè)定(n=3)Table 2 Determination of NF-κB p50 in HeLa cell extracts(n=3)
本文通過將K4Fe(CN)6結(jié)合到PbTiO3表面原位形成納米酶。以NF-κB p50為目標(biāo)物,通過引入發(fā)夾DNA并借助ExoⅢ輔助的水解過程控制dNMP產(chǎn)生,進(jìn)而調(diào)控PbTiO3表面原位形成的納米酶活性,開發(fā)了一種基于納米酶的無標(biāo)記、無固定和信號(hào)放大的生物傳感器,用于靈敏檢測(cè)NF-κB p50。本方法不僅提供了一種原位形成納米酶的新策略,還易與能產(chǎn)生dNMP的生物反應(yīng)相結(jié)合,具有靈敏度高、選擇性好、操作簡(jiǎn)便的優(yōu)點(diǎn)。