国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序在年齡相關(guān)性黃斑變性研究中的應(yīng)用

2023-01-05 11:55:53張福燕
國際眼科雜志 2022年6期
關(guān)鍵詞:單細(xì)胞脈絡(luò)膜補(bǔ)體

安 寧,張福燕,秦 波

0引言

細(xì)胞在多次分裂增殖期間發(fā)生分子生物學(xué)或基因的改變,產(chǎn)生細(xì)胞狀態(tài)或類型的多樣性,這種多樣性被稱為細(xì)胞異質(zhì)性,普遍存在于多細(xì)胞生物個體中。傳統(tǒng)的測序方法忽視細(xì)胞異質(zhì)性,只能反映細(xì)胞群體的平均差異,而單細(xì)胞技術(shù)可揭示細(xì)胞間異質(zhì)性,在更深層次上探究生命活動的本質(zhì)和規(guī)律。2013年單細(xì)胞測序技術(shù)被Science評為年度最值得關(guān)注的六大領(lǐng)域榜首,NatureMethods將該技術(shù)評為2013年度最重要的方法學(xué),2015年再度登上ScienceTranslationalMedicine封面,2018年單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序(single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)被Science評為年度突破技術(shù),2019/2020年單細(xì)胞多組學(xué)和單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組測序再次評為年度技術(shù),成為最值得期待的生物技術(shù)之一。scRNA-seq在單細(xì)胞水平對轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行擴(kuò)增與測序,直接比較來自不同生物條件的細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組信息,對細(xì)胞分群、發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞類型、識別疾病進(jìn)展中起重要作用的罕見細(xì)胞、理解細(xì)胞異質(zhì)性、生物多樣性等具有重要意義。目前scRNA-seq已被應(yīng)用于眼科領(lǐng)域,其在視網(wǎng)膜、脈絡(luò)膜生理學(xué)、視網(wǎng)膜疾病如年齡相關(guān)性黃斑變性(age-related macular degeneration,ARMD)中的研究日新月異,為探究ARMD病因,發(fā)展規(guī)律和靶向治療提供新的視角。

1 scRNA-seq技術(shù)簡介

scRNA-seq是在單細(xì)胞水平對轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測序的一項(xiàng)新技術(shù),其技術(shù)路線包括單細(xì)胞捕獲、mRNA反轉(zhuǎn)錄、cDNA擴(kuò)增、測序文庫構(gòu)建、高通量測序和數(shù)據(jù)分析[1]。目前提取單細(xì)胞的方法有:熒光激活細(xì)胞分選、激光捕獲顯微切割、手動細(xì)胞分選、微流體和微孔等[2]。一個單細(xì)胞中的總RNA量大約只有10pg,而其中的mRNA含量只有0.2pg,為獲得足夠的轉(zhuǎn)錄信息,需要進(jìn)行擴(kuò)增,目前常用的擴(kuò)增方法包括PCR擴(kuò)增法、IVT擴(kuò)增法、等溫擴(kuò)增法等,其中PCR擴(kuò)增法中的Smart-seq(switching mechanism at 5’ end of the RNA transcript)/Smart-seq2具有里程碑意義[3-4],其利用mRNA識別序列、MMLV逆轉(zhuǎn)錄酶等方法既能將mRNA高效擴(kuò)增到需要的數(shù)量級,又可盡量避免PCR偏差而得到均一覆蓋的文庫。IVT擴(kuò)增如CEL-seq(cell expression by linear amplifcation and sequencing)/CEL-seq2[5]采用線性擴(kuò)增的測序方法使擴(kuò)增錯誤率降低。利用Phi29聚合酶進(jìn)行擴(kuò)增的PMA法[6]屬于等溫擴(kuò)增法,但擴(kuò)增隨機(jī)性大,時常會導(dǎo)致整個基因組不同區(qū)域的擴(kuò)增倍數(shù)相差巨大。目前常用的單細(xì)胞測序平臺是基于微流控體系的10X Genomis公司的液滴法[7]及BD公司的微孔法[8],它們把單細(xì)胞提取、附加DNA標(biāo)簽、mRNA捕獲、mRNA反轉(zhuǎn)錄與擴(kuò)增、cDNA建庫和高通量測序后的數(shù)據(jù)分析整合在一起,大大提升了單細(xì)胞測序通量和成本,還能得到帶有獨(dú)特分子標(biāo)簽的單細(xì)胞基因序列信息。液滴法通過微流控技術(shù)將帶有barcode、UMI分子標(biāo)簽、引物及酶的凝膠微珠與單細(xì)胞混合形成顆粒,做出一個基于油包水乳濁液酶反應(yīng)原理的分子生物學(xué)分析系統(tǒng)。微孔法是將細(xì)胞懸液與標(biāo)記磁珠加入含有約200000個孔的蜂窩板,每個孔中容納一個細(xì)胞,不僅可一次性捕獲大量細(xì)胞,還能同時實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄組和蛋白組測序。獲得的海量數(shù)據(jù)需要進(jìn)一步處理分析,進(jìn)行數(shù)據(jù)質(zhì)控、基因組對比、數(shù)據(jù)歸一化(包括消除基因特異性偏差和調(diào)整細(xì)胞間計數(shù)分布差異等),然后使用細(xì)胞聚類分析、主成分分析和t-分布隨機(jī)鄰域嵌入算法等進(jìn)行線性與非線性降維,實(shí)現(xiàn)對高維數(shù)據(jù)的降維和可視化[9-10],最終獲得大量單細(xì)胞基因序列信息。

2 scRNA-seq在神經(jīng)視網(wǎng)膜研究中的應(yīng)用

2.1scRNA-seq在神經(jīng)視網(wǎng)膜細(xì)胞類型鑒定中的應(yīng)用scRNA-seq在眼科中的應(yīng)用主要集中在視網(wǎng)膜細(xì)胞亞型、相關(guān)基因表達(dá)和通路的研究上。視網(wǎng)膜是高度異質(zhì)性的組織,通過形態(tài)學(xué)、生理學(xué)和分子學(xué)標(biāo)準(zhǔn)將神經(jīng)視網(wǎng)膜分為神經(jīng)節(jié)細(xì)胞、雙極細(xì)胞、無長突細(xì)胞、水平細(xì)胞、光感受器細(xì)胞5種類型,scRNA-seq還可將其再細(xì)分為100多種細(xì)胞亞型[11]。例如,Rheaume等[12]確定了40個不同的鼠視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)細(xì)胞簇,并在每種細(xì)胞類型中鑒定了富集的基因,且在視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)細(xì)胞亞型中確定了區(qū)分左右眼的特異性標(biāo)記基因,Shekhar等[13]將鼠雙極細(xì)胞分為15個細(xì)胞簇,Macosko等[14]在小鼠視網(wǎng)膜中鑒定了21個不同的無長突細(xì)胞簇。細(xì)胞亞型的進(jìn)一步細(xì)化分類,能將細(xì)胞的基因表達(dá)特征與其功能和形態(tài)學(xué)特征聯(lián)系起來。

2.2scRNA-seq在黃斑中心凹與外周神經(jīng)視網(wǎng)膜差異基因分析中的應(yīng)用黃斑中心凹處的神經(jīng)元信息傳遞呈單線連接,故此區(qū)視覺非常敏銳,當(dāng)黃斑區(qū)病變時,視力明顯下降,為比較黃斑中心凹與外周神經(jīng)視網(wǎng)膜細(xì)胞的區(qū)別,有研究從死亡后6h內(nèi)處理的三組人類供體眼獲得中心凹和外周神經(jīng)視網(wǎng)膜樣本,得到8217個細(xì)胞,scRNA-seq發(fā)現(xiàn)外周神經(jīng)視網(wǎng)膜視錐細(xì)胞明顯少于中心凹,且中心凹視錐細(xì)胞富含PCP4、YBX1、PRDX1等,其分別在突觸可塑性蛋白形成、細(xì)胞增殖和應(yīng)激反應(yīng)中發(fā)揮作用[15-17]。此外,Banin等[18]報道了黃斑區(qū)20個高表達(dá)基因(如SLC17A6、SNCG、NEFL、NET1、STMN2、YWHAH、UCHL1、DPYSL2、APP、NDRG4、TUBA1B、MDH1、EEF2)和23個在視網(wǎng)膜周邊區(qū)域高表達(dá)的基因(如SAG、RCVRN、UNC119、GPX3、PDE6G、ROM1、ABCA4、DDC、PDE6B、GNB1、NRL)。中心凹Müller細(xì)胞也表現(xiàn)出不同于外周神經(jīng)視網(wǎng)膜的基因表達(dá)譜,中央凹Müller細(xì)胞富含F(xiàn)ABP5(參與神經(jīng)元分化和神經(jīng)元損傷的恢復(fù)[19])、HES5(與膠質(zhì)形成有關(guān)),外周Müller細(xì)胞富含轉(zhuǎn)鐵蛋白和金屬硫蛋白基因家族成員MT1G和MT3。且總體而言,Müller細(xì)胞的許多基因在不同的單細(xì)胞數(shù)據(jù)集上表現(xiàn)出一致的中心凹或外周神經(jīng)視網(wǎng)膜富集。這些研究提供了黃斑中心凹具有敏銳視覺的理論支持。

3 scRNA-seq在視網(wǎng)膜色素上皮層和脈絡(luò)膜研究中的應(yīng)用

3.1scRNA-seq在視網(wǎng)膜色素上皮層和脈絡(luò)膜生理學(xué)研究中的應(yīng)用視網(wǎng)膜色素上皮層(retinal pignebt epithelium,RPE)與脈絡(luò)膜聯(lián)系緊密,RPE-玻璃膜-脈絡(luò)膜毛細(xì)血管復(fù)合體對維持光感受器微環(huán)境有重要作用,RPE為感覺層視網(wǎng)膜的外層細(xì)胞提供營養(yǎng),吞噬和消化光感受器細(xì)胞外節(jié)膜盤維持新陳代謝。脈絡(luò)膜是一種多樣化的結(jié)締組織,包括施萬細(xì)胞、黑素細(xì)胞、成纖維細(xì)胞和幾類常駐白細(xì)胞,scRNA-seq鑒定了兩組在轉(zhuǎn)錄上不同的施萬細(xì)胞簇[20],它們均表達(dá)典型的施萬細(xì)胞標(biāo)志物PLP1,其中簇1高表達(dá)髓鞘蛋白(MPZ)和髓鞘堿性蛋白(MBP),簇2高表達(dá)非髓鞘施萬細(xì)胞基因SCN7A和NCAM1[21],有髓軸突的傳導(dǎo)速度更快,但缺少髓鞘的軸突是受損軸突的快速反應(yīng)者[22]。脈絡(luò)膜血管豐富,在解剖學(xué)上分為三層,深大口徑血管(Haller層),中等口徑血管(Sattler層),以及致密的淺表毛細(xì)血管網(wǎng),此血管系統(tǒng)向外層視網(wǎng)膜供應(yīng)約85%的血液。scRNA-seq檢測了上訴三層的特異表達(dá)基因,動脈表達(dá)SEMA3G、HEY1,靜脈表達(dá)DARC,脈絡(luò)膜毛細(xì)血管表達(dá)CA4、PLVAP[20]。ARMD的發(fā)病特征為光感受器細(xì)胞的進(jìn)行性損傷,因此,研究RPE-玻璃膜-脈絡(luò)膜毛細(xì)血管復(fù)合體生理學(xué)為進(jìn)一步理解ARMD發(fā)病機(jī)制有較大意義。

3.2scRNA-seq在黃斑區(qū)和外周視網(wǎng)膜色素上皮層或脈絡(luò)膜差異基因表達(dá)研究中的應(yīng)用ARMD的解剖學(xué)異常集中在黃斑區(qū)RPE和脈絡(luò)膜,而某些遺傳性視網(wǎng)膜疾病如視網(wǎng)膜色素變性病變位于外周視網(wǎng)膜,這種損傷模式被認(rèn)為是由于黃斑區(qū)和外周RPE或脈絡(luò)膜之間的分子差異導(dǎo)致,激發(fā)了學(xué)者對這兩個區(qū)域分子差異的研究。Mullins等[23]利用RNA測序和qPCR研究發(fā)現(xiàn)黃斑和外周RPE或脈絡(luò)膜之間存在差異表達(dá)的基因,例如,BEST1在外周RPE細(xì)胞中高表達(dá),ICAM1在黃斑區(qū)脈絡(luò)膜中高表達(dá),此結(jié)果在scRNA-seq中得到印證。以往的轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)比較黃斑區(qū)和外周RPE或脈絡(luò)膜基因后發(fā)現(xiàn)許多RPE特異性基因,如LRAT、RPE65,總體表現(xiàn)為在外周視網(wǎng)膜中的高度富集[24],然而scRNA-seq中,這些RPE特異性基因在黃斑和外周的表達(dá)量非常相似。這種差異歸因于黃斑區(qū)與外周脈絡(luò)膜細(xì)胞密度的不同,脈絡(luò)膜在黃斑以下最厚,徑向變薄[25],RPE特異性基因表達(dá)量被黃斑區(qū)中更多的脈絡(luò)膜細(xì)胞稀釋,使這類基因在外周視網(wǎng)膜表達(dá)顯得更高,scRNA-seq消除這一誤差,體現(xiàn)了其區(qū)別于傳統(tǒng)測序技術(shù)只反映細(xì)胞群平均差異的優(yōu)勢。scRNA-seq為深刻理解視網(wǎng)膜和脈絡(luò)膜生理學(xué)提供了巨大幫助,突出各種細(xì)胞類型之間的特征,提高對視網(wǎng)膜生理和疾病區(qū)域特異性的理解,為如何應(yīng)對視網(wǎng)膜損傷提供新的方向。

4 scRNA-seq在ARMD研究中的應(yīng)用

ARMD能導(dǎo)致患者中心視力的不可逆損傷,是嚴(yán)重的致盲性眼病,臨床上將其分為以視網(wǎng)膜玻璃膜疣為特征的干性ARMD和以新生血管生長為特征的濕性ARMD,其與炎癥反應(yīng)、免疫反應(yīng)、氧化應(yīng)激等的相關(guān)性成為近年的研究熱點(diǎn)。

4.1scRNA-seq在ARMD與炎癥反應(yīng)相關(guān)性研究中的應(yīng)用Newman等[26]從基因組水平發(fā)現(xiàn)ARMD與炎癥反應(yīng)的相關(guān)性,其與許多趨化因子的高表達(dá)有關(guān)。年齡是ARMD最重要的危險因素,Voigt等[20]通過scRNA-seq確定了嬰兒和成人脈絡(luò)膜內(nèi)皮細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的差異,嬰兒內(nèi)皮細(xì)胞富含的KLF2、NR4A1、NR2F2能下調(diào)炎性表面黏附分子的表達(dá),成人內(nèi)皮細(xì)胞則表現(xiàn)出更多促炎基因的表達(dá),包括黏附分子VCAM1、ICAM1、SELE、SELP以及趨化因子受體ACKR3等[27]。隨著年齡的增長,脈絡(luò)膜內(nèi)皮細(xì)胞炎癥介質(zhì)的產(chǎn)生有誘發(fā)ARMD的可能。

4.2scRNA-seq在ARMD與免疫系統(tǒng)相關(guān)性研究中的應(yīng)用Newman等[26]提出細(xì)胞介導(dǎo)的免疫反應(yīng)是ARMD的核心特征,推斷ARMD可能是一類具有共同免疫反應(yīng)過程的疾病。ARMD的蛋白質(zhì)組學(xué)研究表明,脈絡(luò)膜毛細(xì)血管內(nèi)皮細(xì)胞高度表達(dá)HLA-A抗原、CA4和PLVAP[28]等免疫因子。肥大細(xì)胞脫顆粒[29]和巨噬細(xì)胞向脈絡(luò)膜募集增加[30]與ARMD的發(fā)病有關(guān)。補(bǔ)體系統(tǒng)是一個復(fù)雜的固有免疫監(jiān)視系統(tǒng),補(bǔ)體基因的多態(tài)性與ARMD易感性密切相關(guān)[31],補(bǔ)體因子H(complement factor H,CFH)是補(bǔ)體替代途徑的負(fù)調(diào)節(jié)因子,CFH可增強(qiáng)RPE抗氧化應(yīng)激的能力,該基因的單核苷酸多態(tài)性能顯著增加ARMD的患病風(fēng)險[32]。多種補(bǔ)體基因如補(bǔ)體因子B(CFB)、補(bǔ)體因子I(CFI)、C3、C5等的單核苷酸多態(tài)性也發(fā)現(xiàn)與ARMD的發(fā)病存在顯著相關(guān)性[33]。scRNA-seq發(fā)現(xiàn)CFH主要在脈絡(luò)膜中表達(dá)[20],表達(dá)量為:脈絡(luò)膜內(nèi)皮細(xì)胞(動脈>毛細(xì)血管>靜脈)>脈絡(luò)膜基質(zhì)細(xì)胞(成纖維細(xì)胞和周細(xì)胞),且脈絡(luò)膜比視網(wǎng)膜表達(dá)更多的補(bǔ)體抑制劑及大量重要的補(bǔ)體調(diào)節(jié)因子CD46、CD55、CD59、CD93,提示ARMD的補(bǔ)體系統(tǒng)異常主要發(fā)生在脈絡(luò)膜[20]。補(bǔ)體旁路途徑的異常激活使膜攻擊復(fù)合物(membrane attack complex,MAC)在脈絡(luò)膜毛細(xì)血管上大量沉積[34],是導(dǎo)致脈絡(luò)膜毛細(xì)血管內(nèi)皮細(xì)胞死亡和功能障礙進(jìn)而誘發(fā)ARMD的重要原因[35]。Mullins等[36]發(fā)現(xiàn)老年人尤其是ARMD供體眼的MAC表達(dá)量高于青年供體眼,且青年供眼脈絡(luò)膜不受MAC的影響。RGCC基因?yàn)橹匾难a(bǔ)體應(yīng)答基因,MAC一旦被激活,RGCC就會增加炎癥基因的表達(dá)[37]并驅(qū)動血管功能障礙,scRNA-seq發(fā)現(xiàn)ARMD脈絡(luò)膜毛細(xì)血管中含有豐富的RGCC[20],認(rèn)為其可能作為ARMD治療的靶標(biāo)基因。細(xì)胞介導(dǎo)的免疫反應(yīng)、補(bǔ)體基因的異常表達(dá)、補(bǔ)體旁路的異常激活與ARMD的易感性密切相關(guān),scRNA-seq加強(qiáng)了對ARMD發(fā)病機(jī)制與免疫反應(yīng)相關(guān)性的深入理解,對靶向免疫治療ARMD有重要意義。

4.3scRNA-seq在ARMD與氧化應(yīng)激反應(yīng)相關(guān)性研究中的應(yīng)用氧化應(yīng)激是ARMD的發(fā)病機(jī)制之一,視網(wǎng)膜內(nèi)的鐵代謝失調(diào)被認(rèn)為是導(dǎo)致自由基產(chǎn)生進(jìn)而誘發(fā)氧化應(yīng)激的原因,轉(zhuǎn)鐵蛋白在ARMD患者中的表達(dá)增加[38],缺乏視網(wǎng)膜鐵結(jié)合蛋白的小鼠會出現(xiàn)RPE和脈絡(luò)膜損傷[39]。scRNA-seq發(fā)現(xiàn)[20]與外周視網(wǎng)膜相比,中心凹轉(zhuǎn)鐵蛋白表達(dá)量少,提示中心凹轉(zhuǎn)鐵蛋白的相對缺乏可能會增加該區(qū)域內(nèi)氧化損傷的易感性。人類和靈長類動物中心凹含有大量的葉黃素類胡蘿卜素,它能保護(hù)視網(wǎng)膜免受氧化損傷,scRNA-seq中[20],類胡蘿卜素裂解酶BCO2在外周視錐感光細(xì)胞中富集,而在中心凹較少[15],提示類胡蘿卜素在中心凹積累的機(jī)制。因此,使用抗氧化應(yīng)激類藥物可能對ARMD的治療有效。

4.4scRNA-seq在濕性ARMD基因表達(dá)研究中的應(yīng)用濕性ARMD又稱滲出性或新生血管性ARMD,較干性ARMD少見,但能迅速導(dǎo)致視力下降、視物變形或中心暗點(diǎn)?;趕cRNA-seq對濕性ARMD的研究中,脈絡(luò)膜毛細(xì)血管內(nèi)皮細(xì)胞富集基因Egr1[20]能在細(xì)胞應(yīng)激反應(yīng)中迅速激活,被視為內(nèi)皮細(xì)胞損傷反應(yīng)的關(guān)鍵介質(zhì),且能上調(diào)與血管功能有關(guān)基因如PDGF、FGF、TGFB、TNFA、ICAM1等的表達(dá)。ATF3基因在濕性ARMD供體的脈絡(luò)膜毛細(xì)血管中富集,并能被包括DNA損傷和氧化應(yīng)激的多種細(xì)胞應(yīng)激源激活。Menon等[40]從6個ARMD人類供體眼黃斑部和外周視網(wǎng)膜中獲得約23339個細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)TIMP3、VEGFA、COL4A3基因在ARMD患者的視網(wǎng)膜中高表達(dá),TIMP3和VEGFA被證實(shí)與新生血管有關(guān)[41]。Rohlenova等[42]誘導(dǎo)小鼠產(chǎn)生脈絡(luò)膜新生血管,進(jìn)行了一項(xiàng)針對小鼠脈絡(luò)膜新生血管內(nèi)皮細(xì)胞基因表達(dá)變化的scRNA-seq研究,發(fā)現(xiàn)這些內(nèi)皮細(xì)胞表現(xiàn)出與糖酵解、ATP合成和膜運(yùn)輸有關(guān)的幾個代謝基因的異常表達(dá),說明此狀態(tài)下的內(nèi)皮細(xì)胞代謝需求極高。來自這個小鼠脈絡(luò)膜新生血管細(xì)胞模型中的15個最豐富的基因,其中有11個在人類濕性ARMD供體中表現(xiàn)出一定程度的富集?;趕cRNA-seq發(fā)現(xiàn)與濕性ARMD相關(guān)基因的表達(dá),為臨床針對靶基因治療濕性ARMD提供理論依據(jù)。

5新興單細(xì)胞測序技術(shù)的不斷探索

雖然scRNA-seq已成為剖析細(xì)胞異質(zhì)性的重要工具,但細(xì)胞異質(zhì)性體現(xiàn)在基因組、表觀基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、空間,甚至?xí)r間等多個維度上,scRNA-seq僅局限于一維層面的測序是不完整的,因此,許多新興的單細(xì)胞測序技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生??臻g轉(zhuǎn)錄組學(xué)從一個完整的組織樣本中獲取全部的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),能夠定位和區(qū)分功能基因在特定組織區(qū)域內(nèi)的表達(dá)情況[43]。目前的scRNA-seq和空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)只提供了基因表達(dá)的靜態(tài)信息,這違背了RNA動力學(xué)和轉(zhuǎn)錄活動的隨機(jī)性,基于時間序列的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析可以揭示細(xì)胞生物信息的時間動態(tài)[44]。單細(xì)胞的異質(zhì)性本質(zhì)上是由基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、表觀基因組共同定義的,單細(xì)胞多組學(xué)能對同一細(xì)胞同時整合多種組學(xué)數(shù)據(jù),更完善了細(xì)胞的遺傳信息[45]。然而,這些技術(shù)在眼科領(lǐng)域中的應(yīng)用仍相對局限單薄,隨著研究者持續(xù)不斷的探索,相信單細(xì)胞測序技術(shù)多元化、多維化、多方面的研究在不久后將惠及眼科研究領(lǐng)域。

6總結(jié)與展望

scRNA-seq從單細(xì)胞水平分析細(xì)胞異質(zhì)性,是鑒別細(xì)胞與細(xì)胞間轉(zhuǎn)錄組差異的新興技術(shù)。本文總結(jié)了scRNA-seq在視網(wǎng)膜、脈絡(luò)膜發(fā)育及ARMD研究中的應(yīng)用,展示細(xì)胞發(fā)揮生理學(xué)作用與其所表達(dá)基因的相互關(guān)系,加深了對視網(wǎng)膜細(xì)胞生物學(xué)和疾病病理生理學(xué)的理解。scRNA-seq將轉(zhuǎn)錄信息與ARMD發(fā)病機(jī)制相結(jié)合,為深入理解ARMD發(fā)病機(jī)制及靶向診治方案提供了全新的思路。隨著scRNA-seq測序成本的不斷降低,學(xué)者實(shí)現(xiàn)更多方面的生物學(xué)和技術(shù)重復(fù),從而提高了不同生物學(xué)條件下檢測的多樣性和一致性,大量的研究將促進(jìn)新一代視網(wǎng)膜疾病診治的發(fā)展。但scRNA-seq局限于對細(xì)胞異質(zhì)性一維層面的理解仍存在較大缺陷,空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)、時間分辨測序、多組學(xué)以多維、豐富的研究賦予細(xì)胞異質(zhì)性更完整多態(tài)的理解,隨著眾多突破性技術(shù)的出現(xiàn),單細(xì)胞測序在眼科領(lǐng)域中的應(yīng)用將會朝著更多元化的方向發(fā)展。

猜你喜歡
單細(xì)胞脈絡(luò)膜補(bǔ)體
補(bǔ)體因子H與心血管疾病的研究進(jìn)展
抗dsDNA抗體、補(bǔ)體C3及其他實(shí)驗(yàn)室指標(biāo)對于診斷系統(tǒng)性紅斑狼瘡腎損傷的臨床意義
人工智能助力微生物單細(xì)胞鑒定
科學(xué)(2020年4期)2020-11-26 08:27:16
誤診為中心性漿液性脈絡(luò)膜視網(wǎng)膜病變的孤立性脈絡(luò)膜血管瘤1例
從瘀探討息肉樣脈絡(luò)膜血管病變中醫(yī)病因病機(jī)
OCT在健康人群脈絡(luò)膜厚度研究中的應(yīng)用及相關(guān)進(jìn)展
流感患兒血清免疫球蛋白及補(bǔ)體的檢測意義
102例慢性丙型肝炎患者血清免疫球蛋白和補(bǔ)體水平變化
聯(lián)合SNaPshot和單倍型分析技術(shù)建立G6PD缺乏癥單細(xì)胞基因診斷體系
單細(xì)胞測序技術(shù)研究進(jìn)展
扎鲁特旗| 永定县| 民县| 勐海县| 永仁县| 三明市| 东辽县| 玉田县| 东兴市| 商南县| 汾阳市| 富阳市| 江山市| 巩义市| 清远市| 盐亭县| 成都市| 凯里市| 庆城县| 重庆市| 合川市| 通城县| 商河县| 阜新市| 汉沽区| 琼海市| 大余县| 黔南| 武穴市| 碌曲县| 江永县| 平谷区| 上栗县| 项城市| 九龙县| 宽甸| 包头市| 九江市| 天台县| 满洲里市| 论坛|