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兩起獸醫(yī)PCR實(shí)驗(yàn)室核酸污染原因排除及消毒成效的調(diào)查及建議

2022-12-11 17:47孫劍峰王占利康文彪豆玲趙雯高軍軍
中獸醫(yī)學(xué)雜志 2022年3期
關(guān)鍵詞:試劑核酸陰性

孫劍峰,王占利,康文彪,豆玲,趙雯,高軍軍

(甘肅省動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心,甘肅蘭州 730046)

甘肅省大多數(shù)基層獸醫(yī)實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)具備分子生物學(xué)檢測能力,實(shí)驗(yàn)隊(duì)伍人員配置齊全、素質(zhì)高,實(shí)驗(yàn)室建設(shè)合理,市縣級獸醫(yī)實(shí)驗(yàn)室每年省級比對結(jié)果正確符合率超過90%?,F(xiàn)階段PCR試驗(yàn)已經(jīng)是病原學(xué)檢測的成熟手段,分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室主要開展實(shí)時(shí)熒光PCR試驗(yàn),普通PCR試驗(yàn)由于要進(jìn)行電泳等步驟已經(jīng)很少用。近幾年獸醫(yī)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室很容易發(fā)生核酸污染[1],尤其在春秋兩季集中監(jiān)測樣品任務(wù)量特別大的情況下,加上試驗(yàn)人員水平層次不平,有的分子學(xué)實(shí)驗(yàn)室構(gòu)造不合理,試驗(yàn)結(jié)束后消毒和廢棄物處理程序不規(guī)范,極易造成污染。實(shí)驗(yàn)室一旦污染及污染后消毒處理不當(dāng)會(huì)導(dǎo)致近段時(shí)間無法進(jìn)行試驗(yàn),尋找污染步驟及祛除污染需要花費(fèi)大量人力和試劑[2],因此預(yù)防核酸污染才是關(guān)鍵?,F(xiàn)結(jié)合兩起獸醫(yī)PCR實(shí)驗(yàn)室污染原因查找過程及祛除核酸污染過程,總結(jié)出相應(yīng)污染原因及控制和清除核酸污染的措施。

1 調(diào)查對象及尋找污染原因的方法

調(diào)查對象是一個(gè)獸醫(yī)PCR實(shí)驗(yàn)室。尋找污染原因的方法是通過查看每次做的試驗(yàn)結(jié)果,對發(fā)現(xiàn)有多份陽性的試驗(yàn)用增設(shè)空白對照驗(yàn)證是否污染,如果確實(shí)污染就要采集可能污染地方樣品,通過比對試驗(yàn)查找污染原因,比對試驗(yàn)主要是不同部位樣品比對、試劑比對、人員比對、實(shí)驗(yàn)室比對、儀器比對等,通過相應(yīng)消毒措施后再用試驗(yàn)驗(yàn)證核酸污染是否祛除。

2 實(shí)驗(yàn)室構(gòu)造、主要使用儀器和試劑情況

2.1 實(shí)驗(yàn)室構(gòu)造

該獸醫(yī)PCR實(shí)驗(yàn)室有4個(gè)單獨(dú)分區(qū),依次是試劑準(zhǔn)備間、樣品處理及提取間、核酸擴(kuò)增間、電泳間,壓力分別從正壓到負(fù)壓,每個(gè)區(qū)之間有傳遞窗,沒有單獨(dú)的緩沖間,排風(fēng)系統(tǒng)是中央空調(diào)系統(tǒng),每間有2個(gè)排風(fēng)口,樣品提取間有2個(gè)生物安全柜,1個(gè)臭氧消毒機(jī)。

2.2 主要使用儀器

全自動(dòng)核酸提取儀(西安天隆,型號:NP968),3臺熒光PCR儀(ABI 7500,ABI Q5,Agilent),4臺高速離心機(jī)。

2.3 主要使用試劑

天隆核酸提取試劑盒(批號:E0119090321),哈爾濱元亨生物藥業(yè)有限公司的ASFV熒光PCR檢測試劑盒(批號:ASFV2021004),F(xiàn)MDV通用型實(shí)時(shí)熒光RTPCR檢測試劑盒(批號:FMDV20200601P),青島立見的ASFV熒光PCR檢測試劑盒(批號:40222104),蘭獸研FMDV熒光定量RT-PCR檢測試劑盒(批號:20210909431),青島立見核酸祛除劑(批號:140321906),納克生物科技有限公司PCR核酸質(zhì)粒氣溶膠污染清除劑(批號:2021060500),84消毒液,70%酒精,30%過氧化氫,自配含氯消毒劑。

3 調(diào)查結(jié)果

2021年6月份,該獸醫(yī)PCR實(shí)驗(yàn)室在春季定點(diǎn)檢測試驗(yàn)中發(fā)現(xiàn)非洲豬瘟病毒核酸污染,試驗(yàn)結(jié)果分析過程中發(fā)現(xiàn)ASF陰性對照和部分樣品核酸陽性,經(jīng)過幾次重復(fù)試驗(yàn)陰性對照為陽性,懷疑實(shí)驗(yàn)室被ASF核酸污染,通過反復(fù)試驗(yàn)驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)是提取區(qū)移液器和一個(gè)生物安全柜臺面被污染。

2021年11月份,該獸醫(yī)PCR實(shí)驗(yàn)室在秋季集中監(jiān)測試驗(yàn)中發(fā)生口蹄疫病毒核酸染,96孔反應(yīng)板中陰性對照和空白對照都是FMDV核酸檢測陽性,檢測樣品零散陽性和多份可疑,重復(fù)試驗(yàn)結(jié)果都有弱陽性出現(xiàn),且結(jié)果對不上,做了人員比對和試劑比對,結(jié)果還是一樣,懷疑實(shí)驗(yàn)室被FMDV核酸污染,通過實(shí)驗(yàn)室比對、試劑比對、儀器比對等發(fā)現(xiàn)提取間環(huán)境被FMDV氣溶膠污染。

4 核酸污染原因排除、祛除核酸污染過程分析及消毒成效驗(yàn)證

4.1 ASFV核酸污染原因排除、污染祛除與消毒驗(yàn)證過程

4.1.1 ASFV核酸污染原因排除

在當(dāng)天非洲豬瘟病原學(xué)試驗(yàn)中,試驗(yàn)陰性對照有1份陽性和1份可疑,換了試劑進(jìn)行重復(fù)試驗(yàn)結(jié)果一致,實(shí)驗(yàn)室可能污染了。換了間PCR實(shí)驗(yàn)室和用兩種試劑同時(shí)開展試驗(yàn),開始設(shè)立4份空白對照和20份環(huán)境樣品(盛有3 ml PBS的5 ml離心管中開蓋靜置12 h在提取間和擴(kuò)增間),再進(jìn)行ASFV熒光PCR試驗(yàn),24份樣品全為陰性(試驗(yàn)成立),說明實(shí)驗(yàn)室環(huán)境和試劑沒有污染。接著通過反復(fù)擦拭采集移液槍頭部及內(nèi)部、離心機(jī)孔里、96孔離心板孔里、生物安全柜臺面、地面等18份樣品,用2種試劑繼續(xù)在新PCR實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行ASFV熒光PCR試驗(yàn),結(jié)果顯示1份移液器樣品和2份生物安全柜臺面樣品ASFV核酸檢測陽性,其余樣品均為陰性;換了提取間另一個(gè)生物安全柜(有自己獨(dú)立的移液器),重新用全自動(dòng)核酸提取儀和手動(dòng)柱式濾膜提取這18份樣品,同時(shí)設(shè)立空白對照,18份樣品檢測結(jié)果全為陰性且試驗(yàn)成立,說明之前HFsafe 1200的生物安全柜臺面及里面的移液器被污染了。

4.1.2 ASFV核酸污染祛除過程

將污染的生物安全柜臺面放置在地上,先用酒精擦拭臺面內(nèi)外,用除銹劑對安全柜生銹地方進(jìn)行擦拭(生銹地方容易吸附核酸),用核酸消除劑對臺面和安全柜各個(gè)部位進(jìn)行噴霧消毒[2],安裝好臺面,配好3%過氧化氫放置在臺面進(jìn)行熏蒸消毒6h(安全柜密封狀態(tài)),用酒精、核酸消除劑該安全柜移液器進(jìn)行拆卸擦洗、噴霧及安裝后高壓滅菌。

4.1.3 消毒驗(yàn)證過程

用之前非洲豬瘟已知盲樣6份和重新擦拭采集該生物安全柜臺面和所有移液器樣品及提取間環(huán)境樣品共20份,在污染的實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行ASFV熒光PCR試驗(yàn),已知盲樣結(jié)果完全正確,19份樣品陰性,1份安全柜臺面樣品可疑,重復(fù)消毒,1周之后重新采樣進(jìn)行重復(fù)試驗(yàn)結(jié)果全陰性,ASFV核酸污染消除,實(shí)驗(yàn)室恢復(fù)正常工作。

4.2 FMDV核酸污染原因排除、污染祛除與消毒驗(yàn)證過程

4.2.1 FMDV核酸污染原因排除

在2021年秋季集中監(jiān)測中開展FMDV實(shí)時(shí)熒光RT-PCR試驗(yàn)時(shí),擴(kuò)增后96孔反應(yīng)板中陰性對照和空白對照都是FMDV核酸檢測可疑或陽性,檢測樣品零散陽性和多份可疑,重復(fù)試驗(yàn)結(jié)果都有弱陽性及可疑出現(xiàn),且結(jié)果對不上,換了人員和試劑進(jìn)行重復(fù)試驗(yàn)結(jié)果一致,實(shí)驗(yàn)室可能污染了,馬上停止試驗(yàn)查找污染原因。首先換了間新的PCR實(shí)驗(yàn)室,用之前的試劑和樣品開展試驗(yàn),并設(shè)立2份空白對照,結(jié)果原先樣品全為FMDV核酸陰性且試驗(yàn)成立;配制PBS后高壓30 min,分裝2ml在離心管(規(guī)格5 ml)中,用無菌棉簽蘸取滅菌蒸餾水在可能污染地方(移液槍尖里外兩面、離心機(jī)孔里、96孔離心板孔里、安全柜臺面、地面)涂抹采樣18份和環(huán)境采樣10份(裝有PBS的離心管靜置12h),在新的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行FMDV實(shí)時(shí)熒光RT-PCR試驗(yàn)(全自動(dòng)核酸提取儀提取和用兩種擴(kuò)增體系),試驗(yàn)成立(陰陽性對照及空白對照滿足說明書要求),兩種試劑結(jié)果一致(試劑沒有污染),離心機(jī)孔里、安全柜臺面、地面出現(xiàn)4份陽性和1份可疑樣品,環(huán)境樣品出現(xiàn)1份陽性和2份可疑樣品,證明實(shí)驗(yàn)室被口蹄疫病毒氣溶膠污染。這次污染比6月份那次嚴(yán)重多了,查找可能污染步驟,懷疑是陽性對照擴(kuò)增產(chǎn)物沒有處置得當(dāng),因?yàn)樵搶?shí)驗(yàn)室的擴(kuò)增產(chǎn)物在體表噴灑84消毒液后放入提取間生物安全垃圾桶中,八連管管蓋如果沒有完全密封,擴(kuò)增產(chǎn)物就會(huì)污染實(shí)驗(yàn)室。

4.2.2 FMDV核酸污染祛除過程

整個(gè)PCR實(shí)驗(yàn)室都要徹底清掃消毒,將污染的生物安全柜臺面及角落、離心機(jī)各個(gè)孔里、實(shí)驗(yàn)室臺面先用酒精擦拭2遍,再用核酸消除劑噴霧消毒2遍,地面用5%的含氯消毒劑擦拭消毒[3],提取間生物安全柜用配好3%過氧化氫放置在臺面進(jìn)行熏蒸消毒不少于6 h,并對槍尖盒、槍架、96孔離心管架用5%的含氯消毒劑浸泡消毒,消毒處理提取間所有敞開或用過的耗材,擴(kuò)增產(chǎn)物用10%的含氯消毒劑浸泡12 h并轉(zhuǎn)移到廢棄物臨時(shí)貯存室 ;打開整個(gè)PCR實(shí)驗(yàn)室的紫外燈及移動(dòng)紫外燈照射消毒6 h,紫外消毒結(jié)束后打開臭氧機(jī)8 h(保持閉光狀態(tài)即關(guān)燈拉窗簾,等臭氧消毒結(jié)束后2d每天打開空調(diào)系統(tǒng)12 h),1周后重復(fù)上次的消毒。

4.2.3 消毒驗(yàn)證過程

消毒半個(gè)月后重新采樣驗(yàn)證消毒效果,用口蹄疫已知盲樣5份和重新采集原先CT值比較小的部位樣品及提取間環(huán)境樣品共17份,在消毒過的實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行FMDV實(shí)時(shí)熒光RT-PCR試驗(yàn),實(shí)驗(yàn)結(jié)果(陰性對照翹尾),11份樣品陰性,2份離心機(jī)和1份地面樣品陽性,3份環(huán)境樣品可疑;每半個(gè)月重復(fù)之前步驟一次,1個(gè)月后重新采樣15份,用5份盲樣和2份無RNA酶水驗(yàn)證試驗(yàn),15份樣品和2份無RNA酶水全陰性,盲樣和陰陽性對照都正確,PCR實(shí)驗(yàn)室不消毒空置半個(gè)月后重新采樣15份進(jìn)行FMDV實(shí)時(shí)熒光RT-PCR試驗(yàn),結(jié)果全為陰性,實(shí)驗(yàn)室核酸污染消除,該實(shí)驗(yàn)室恢復(fù)正常檢測工作。

5 預(yù)防、清除獸醫(yī)PCR實(shí)驗(yàn)室核酸污染的建議

5.1 獸醫(yī)PCR實(shí)驗(yàn)室核酸污染預(yù)防措施的建議

(1)制定科學(xué)嚴(yán)禁的PCR實(shí)驗(yàn)室管理制度。分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室負(fù)責(zé)人加強(qiáng)操作人員監(jiān)督,劃分職責(zé),責(zé)任到人,落實(shí)制定制度[3]。

(2)改造不合理的PCR實(shí)驗(yàn)室布局。最少3個(gè)區(qū),一般4個(gè)區(qū),依次為配液間、樣品處理及提取間、核酸擴(kuò)增間、電泳分析間[4],4個(gè)分區(qū)必須相互獨(dú)立(包括儀器設(shè)備、抹布、拖把等),如提取間移液器不能從擴(kuò)增間直接到配夜間,配液間(屬于潔凈區(qū))要有單獨(dú)的衣服和消毒設(shè)施,堅(jiān)決不能讓陽性樣品進(jìn)入配液區(qū)。

(3)定期開展試驗(yàn)人員培訓(xùn)。進(jìn)行崗前培訓(xùn),開展加強(qiáng)PCR試驗(yàn)人員生物安全意識和試驗(yàn)規(guī)范操作的培訓(xùn),嚴(yán)格落實(shí)廢棄物處理制度。

(4)PCR試驗(yàn)規(guī)范操作。一旦污染需要很長時(shí)間清除,只有規(guī)范操作,才能更好防止PCR實(shí)驗(yàn)室污染。開展PCR試驗(yàn)前,先做好試驗(yàn)準(zhǔn)備,打開通風(fēng)設(shè)備和空調(diào)系統(tǒng),穿干凈消過毒的試驗(yàn)服和鞋,戴好一次性口罩、手套、帽子,將試劑盒放置室溫半小時(shí)后進(jìn)行試驗(yàn)。進(jìn)行PCR試驗(yàn)時(shí),先分體系放置到配夜間-20℃冰箱中,然后進(jìn)行樣品提取擴(kuò)增,盡可能使用可高壓處理的移液器和一次性帶濾芯的無RNA酶槍尖;組織和全血樣品處理最好在安全柜臺面鋪設(shè)一次性防水臺布,每次離心管開蓋前要離心防止蓋上殘留液體濺出,如果濺在手套和安全柜臺面后立即更換手套和消毒臺面(先用酒精擦拭再用5%含氯消毒劑噴灑消毒);每次試驗(yàn)須設(shè)立2份陰性對照,移液器嚴(yán)格按照操作規(guī)程進(jìn)行,每年對移液器進(jìn)行校準(zhǔn)維修保養(yǎng)和定期更換生物安全柜的過濾網(wǎng)及空調(diào)過濾器,加模板時(shí)最后加陽性對照(先離心再小心開蓋,模板加完后八聯(lián)管蓋一定要蓋緊)。每次試驗(yàn)結(jié)束后,形成消毒程序,先將生物安全廢液缸里面廢棄試劑耗材倒入生物安全垃圾袋里及時(shí)進(jìn)行高壓滅菌處理再轉(zhuǎn)移至臨時(shí)貯存室,PCR產(chǎn)物用10%含氯消毒劑浸泡消毒(不高壓處理),將剩余的試劑耗材密封保存,酒精擦拭安全柜臺面后噴核酸消除劑進(jìn)行消毒,擦拭消毒移液器后并定期進(jìn)行高壓滅菌,消毒臺面和試驗(yàn)地面用5%的含氯消毒劑擦拭兩遍,各個(gè)房間的抹布、拖把不能混用,清掃消毒完后打開安全柜和各區(qū)紫外燈照射1 h。

5.2 清除獸醫(yī)PCR實(shí)驗(yàn)室核酸污染的建議

(1)實(shí)驗(yàn)室一旦發(fā)現(xiàn)污染,立即停止試驗(yàn),用實(shí)驗(yàn)室比對、試劑比對、樣品比對查找污染原因,找到可能污染重點(diǎn)部位,進(jìn)行重點(diǎn)消毒,如果是核酸氣溶膠污染要關(guān)閉整個(gè)實(shí)驗(yàn)室,并進(jìn)行徹底清掃消毒。

(2)嚴(yán)格按消毒程序進(jìn)行操作。整個(gè)PCR實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行徹底清掃消毒(消毒液現(xiàn)配現(xiàn)用,消毒液嚴(yán)格按比例進(jìn)行配制),將污染部位先用酒精擦拭2遍,再用核酸消除劑噴霧消毒2遍,試驗(yàn)地面及死角用5%的含氯消毒劑擦拭兩遍[5],生物安全柜用配好3%過氧化氫熏蒸消毒不少于6h,打開整個(gè)PCR實(shí)驗(yàn)室的紫外燈及移動(dòng)紫外燈照射消毒不少于6h,紫外消毒結(jié)束后打開臭氧機(jī)8h,臭氧消毒結(jié)束后每天打開通風(fēng)系統(tǒng)12h,如此反復(fù)消毒直至核酸污染祛除。

(3)初次消毒驗(yàn)證污染祛除后,實(shí)驗(yàn)室打開通風(fēng)系統(tǒng)(每天6h)空置半個(gè)月后,重新用試驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證合格后再恢復(fù)實(shí)驗(yàn)室正常工作。

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