王大林,劉永剛,李昌武,謝式云,廖 柱
(1.羅牛山股份有限公司,海南 ???570125;2.云南農(nóng)業(yè)大學(xué),云南 昆明 650000;3.海南羅牛山畜牧有限公司,海南 ???570100)
在我國畜牧生產(chǎn)中,豬的養(yǎng)殖生產(chǎn)占有重要地位,豬產(chǎn)仔數(shù)對商品豬生產(chǎn)的意義不言而喻。因此,發(fā)掘及篩選長大二元母豬高產(chǎn)仔數(shù)相關(guān)的基因及分子標(biāo)記,并積極用這些基因或分子標(biāo)記,以促進(jìn)養(yǎng)豬生產(chǎn),提升經(jīng)濟(jì)效益具有重要的意義。DIS3L2(DIS3 Like 3'-5' Exoribonuclease 2,DIS3 3'-5'外切核糖核酸酶2),是一種高度保守的3'-5'外切核糖核酸酶[1],DIS3L2在RNA代謝中起到關(guān)鍵作用,并參與多種生物學(xué)和生理過程,如細(xì)胞分裂、增殖、分化和凋亡[2-3]。Ching-Jung等[4]的研究表明,DIS3L2的損失完全阻斷了雄性果蠅的精子發(fā)生,導(dǎo)致雄性不育,同時揭示了異常的基因表達(dá)程序,并表明非編碼RNA可能優(yōu)先受到DIS3L2的影響。但截至目前,大多關(guān)于DIS3L2的研究是關(guān)于人類Perlman(帕爾曼)綜合征,其主要表征為胎兒羊水過多、巨大兒、獨(dú)特面部外觀等[5],造成該疾病具有此臨床特征的主要原因是由RNA代謝紊亂引起的,雖然DIS3L2的確切靶標(biāo)尚未被表征,但在細(xì)胞模型中已經(jīng)確認(rèn)DIS3L2低表達(dá)與細(xì)胞生長和分裂過程中出現(xiàn)異常有關(guān)[6-8]。目前還未見關(guān)于利用豬DIS3L2基因作為長大的二元母豬產(chǎn)仔數(shù)的遺傳標(biāo)記來進(jìn)行長大二元母豬產(chǎn)仔數(shù)標(biāo)記輔助選育的報道。本文為確定DIS3L2基因PCR-TaqI-RFLP多態(tài)性位點(diǎn)與長大的二元母豬產(chǎn)仔數(shù)差異是否相關(guān),建立的PCR-TaqI-RFLP方法進(jìn)行多態(tài)性檢測,以分析豬不同基因型與總胎次活產(chǎn)仔數(shù)的相關(guān)關(guān)系。
探明DIS3L2基因與長大母豬的總胎次產(chǎn)仔數(shù)是否存在關(guān)聯(lián),探明DIS3L2基因與長大母豬的總胎次活仔數(shù)是否存在關(guān)聯(lián)。試驗(yàn)于2021年在海南海口進(jìn)行。
隨機(jī)選擇200頭7胎齡的長大二元母豬為試驗(yàn)材料,采用PCR-TaqI-RFLP方法進(jìn)行多態(tài)性檢測,并分析豬不同基因型與產(chǎn)活仔數(shù)的相關(guān)關(guān)系。采用Statistical Analysis System (SAS)統(tǒng)計軟件GLM程序進(jìn)行單標(biāo)記方差分析并進(jìn)行顯著性檢驗(yàn),所采用模型為:Yijk=μ+Gi+Yi+Pk+eijk,Yijk為性狀表型值,μ為平均值,Gi為基因型效應(yīng)(包括基因加性效應(yīng)和顯性效應(yīng);加性效應(yīng)用1、0和-1分別代表AA、AC和CC基因型,顯性效應(yīng)用1、-1和1分別代表AA、AC和CC基因型);Yi、Pk為固定效應(yīng),分別為年度和胎次效應(yīng);eijk為殘差效應(yīng)。
(1)從豬耳組織中提取基因組DNA,根據(jù)豬DIS3L2基因序列和所述的兩條遺傳標(biāo)記特異引物(表1),用該兩條引物在豬基因組DNA中進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR程序?yàn)椋?4 ℃ 4 min,35個循環(huán)94 ℃ 50 s,57 ℃ 45 s,72 ℃ 50 s,然后72 ℃10 min,最后4 ℃終止反應(yīng),PCR反應(yīng)體系:2.0 μL DNA(100 ng),2.5 μL 2 mmol/L mixed dNTPs,2.5 μL 10×Taq DNA polymerase buffer,2.5 μL 25 mmol/L MgCl2,1 μL 20 μmol/L引物1,1 μL 20 μmol/L第2引物,2 unit of Taq DNA polymerase(1 U/μL),11.5 μL無菌水,最后得到PCR產(chǎn)物。
表1 DIS3L2基因作為長大母豬總胎次產(chǎn)仔數(shù)和總胎次活仔數(shù)遺傳標(biāo)記的兩條特異引物
(2)將步驟(1)中得到的PCR產(chǎn)物用限制性內(nèi)切酶TaqI酶切,TaqI酶切反應(yīng)體系為:10 μL PCR產(chǎn)物,7 μL無菌水,1 μL Taq I(10 U),2 μL 10×buffer。PCR產(chǎn)物TaqI酶切反應(yīng)條件為:混合物在水浴鍋65 ℃恒溫加熱4 h。在2%的含有EB(溴化乙錠)的瓊脂糖凝膠電泳檢測酶切結(jié)果,凝膠成像系統(tǒng)觀察并記錄基因型。
根據(jù)條帶差異,可分為3種基因型,具有228 bp、176 bp 2條帶的是AA型,只有404 bp 1條帶的是CC型,同時具有404 bp、228 bp、176 bp 3條帶的是AC型(圖1)。
圖1 長大母豬DIS3L2基因分型檢測結(jié)果
在200頭長大二元母豬群中進(jìn)行了不同基因型與產(chǎn)仔數(shù)間關(guān)聯(lián)分析,統(tǒng)計分析結(jié)果總結(jié)見表2。
表2 DIS3L2基因型與長大二元母豬產(chǎn)仔數(shù)的關(guān)聯(lián)分析
由結(jié)果可以看出,在長大二元母豬中,基因型AA及AC個體的總胎次產(chǎn)仔數(shù)和總胎次活仔數(shù)極顯著高于CC基因型個體(P<0.01)。通過選留DIS3L2基因位點(diǎn)含有A等位基因的長大二元母豬個體作為種畜,可以提高其總胎次產(chǎn)仔數(shù)和總胎次活仔數(shù)。