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羊布氏桿菌病快速檢測技術(shù)應(yīng)用比較

2022-11-28 14:53
畜禽業(yè) 2022年1期
關(guān)鍵詞:濁度氏桿菌引物

(江蘇省常熟市梅李動物防疫站,江蘇 常熟 215511)

0 引言

羊布氏桿菌屬于一種慢性傳染病,對生殖系統(tǒng)的危害性較高,以公羊產(chǎn)生睪丸炎與母羊出現(xiàn)流產(chǎn)等現(xiàn)象為主要特征。該病的臨床表現(xiàn)相對隱蔽,傳染性較高,檢測難度較大。傳統(tǒng)的診斷方法耗時較長、操作繁瑣,需要借助多種精密儀器才能得出判定結(jié)果,難以有效在基層中推廣。為了解決此類問題,本文將對幾種快速檢測技術(shù)的實驗過程進行深入討論,從而找出最適合在基層應(yīng)用的檢測方法。

1 實驗過程

1.1 材料準備

所需準備的實驗材料主要包括:被檢試樣,以江蘇省常熟市某地區(qū)隨機收集的160份綿羊血液作為分析對象;菌株與DNA,從畜牧公司采購M5株、從檢驗檢疫局獲得大腸桿菌與沙門氏菌的DNA;引物,布氏桿菌與PCR的引物均需根據(jù)國標T1088的相關(guān)規(guī)定完成,本文所采用的引物是由某科技公司合成而得;主要試劑,緩沖液、聚合酶、氯化鎂、脫氧核糖核苷三磷酸、分子標記、核酸燃料、熒光目視檢測試劑盒與血液基因提取試劑盒;主要儀器,電泳儀、冰箱、離心機、濁度儀、PCR儀、微量振蕩器與移液器;羊血液基因組,需要根據(jù)提取試劑盒的操作規(guī)范來完成提取操作;M5株與DNA的提取,需要依照國標T2714所規(guī)定的方法完成。

1.2 檢測方法

1.2.1 金屬浴LAMP擴增

該方法使用的材料劑量為:反應(yīng)緩沖液12.5 μL、引物30 μL、聚合酶1.0 μL、去離子水6.0 μL、模板1.5 μL。而反應(yīng)條件為:金屬干浴鍋63℃ 50 min,90℃ 10 min。實驗流程為:在反應(yīng)管內(nèi)的混合物調(diào)試均勻后放置在金屬浴鍋中完成LAMP的擴增,待反應(yīng)結(jié)束后觀測管內(nèi)是否存有白色混濁物,之后將離心機設(shè)定為6 000 rpm 5 min,觀察是否存在白色沉淀。同時實驗過程所采用的模板應(yīng)為M5株DNA、雙蒸水,二者分別對應(yīng)陽性對照與陰性對照,此外還要提前準備好待測樣品DNA。

1.2.2 濁度儀LAMP擴增

該方法所使用的材料劑量為:反應(yīng)緩沖液12.0 μL、引物2.5 μL、聚合酶1.0 μL、去離子水6.0 μL、模板1.5 μL。反應(yīng)條件為:濁度儀的設(shè)置應(yīng)為80℃ 10 min、63℃ 40 min。實驗流程為:反應(yīng)管內(nèi)的混合物在調(diào)試均勻后放置在濁度儀中完成LAMP的擴增。待反應(yīng)結(jié)束后,可觀測柱狀下層的顏色呈現(xiàn)狀況,其中紅色代表陽性,綠色則表示為陰性。而實驗過程中采用的模板則分別為:大腸桿菌DNA、綠膿桿菌DNA、沙門氏菌DNA,三者作為陰性對照。M5株DNA則作為陽性對照。此外還要準備雙蒸水以及待測樣品DNA。

1.2.3 熒光目視檢測試劑盒法

該方法所使用的材料劑量分別為:反應(yīng)緩沖液12.0 μL、引物3.5 μL、聚合酶1.0 μL、去離子水5.0 μL、模板1.5 μL、黃綠素染料1.0 μL。反應(yīng)條件為:金屬干浴鍋需設(shè)定為63℃ 50 min、90℃ 10 min。實驗流程為:反應(yīng)管內(nèi)的混合物在調(diào)試均勻后放置在金屬干浴鍋中完成LAMP擴增,待反應(yīng)結(jié)束后,可觀察反應(yīng)管呈現(xiàn)的具體顏色,并通過紫外線照射來判斷是否有熒光產(chǎn)生。在實驗過程中所使用的模板為M5株DNA與雙蒸水,二者分別作為陽性對照與陰性對照,同時還要準備好待測樣品DNA。

1.2.4 PCR擴增

該方法所使用的材料劑量分別為:反應(yīng)緩沖液13.0 μL、引物1.0 μL、聚合酶0.5 μL、脫氧核糖核苷三磷酸2.0 μL、氯化鎂3.0 μL、去離子水13.0 μL、模板1.5 μL、黃綠素燃料1.0 μL。反應(yīng)條件為:95℃ 15 s、95℃ 5 min、52℃ 30 s、70℃ 90 s,72℃ 5 min,完成40個循環(huán)。實驗流程為:反應(yīng)管內(nèi)的混合物在調(diào)試均勻后放置在PCR儀上,待反應(yīng)結(jié)束后,提取5 μL的產(chǎn)物,進行2.0%的瓊脂糖電泳后,放置在凝膠成像儀中完成觀察記錄。在實驗過程中所使用的模板為M5株DNA與雙蒸水,二者分別作為陽性對照與陰性對照,同時還要準備好待測樣品DNA。

2 實驗結(jié)果

2.1 金屬浴LAMP擴增結(jié)果

經(jīng)過63℃ 50 min、90℃ 10 min的LAMP擴增后,在陽性對照管以及待測試樣管中可發(fā)現(xiàn)白色混濁物,在完成6 000 rpm 5 min的離心處理后會出現(xiàn)沉淀現(xiàn)象,此類現(xiàn)象說明布氏桿菌在擴增時會伴有大量的硫酸鎂生產(chǎn),并在離心后沉淀效果愈發(fā)明顯。而陰性對照管則未發(fā)現(xiàn)明顯變化,證明布氏桿菌未出現(xiàn)擴增。使用該檢測方法測試的160份羊血液中,共有12份檢測出布氏桿菌[1]。

2.2 濁度儀LAMP擴增結(jié)果

在經(jīng)過63℃ 40 min、80℃ 10 min的濁度儀擴增后,可在2號檢測通道觀察到藍色柱狀圖,并且底部呈現(xiàn)紅色,證明該通道為陽性反應(yīng),有布氏桿菌擴增生成。而其余的通道未產(chǎn)生藍色柱狀圖并且底部多為綠色,證明陰性對照管沒有完成布氏桿菌的擴增。待測試樣管所對應(yīng)的3號通道有明顯的藍色柱狀圖產(chǎn)生,并且底部同樣呈現(xiàn)為紅色,證明該試管發(fā)生了布氏桿菌的擴增。使用該檢測方法測試的160份羊血液中,共有12份檢測出布氏桿菌。

2.3 熒光目視檢測試劑盒法擴增結(jié)果

在金屬干浴鍋經(jīng)過90℃ 10 min、63℃ 50 min的擴增后,可在陽性反應(yīng)管中看到紅色轉(zhuǎn)換為綠色的顏色變化,證明該試管中出現(xiàn)布氏桿菌陽性擴增,而陰性反應(yīng)管的顏色未出現(xiàn)明顯改變,始終為橙紅色,證明未出現(xiàn)布氏桿菌的擴增。而待測樣品反應(yīng)管與陽性反應(yīng)管的顏色變化趨勢一致,都是由紅色轉(zhuǎn)變?yōu)榫G色,證明出現(xiàn)了布氏桿菌的擴增。之后利用紫外線照射進行實際結(jié)果的觀測,可發(fā)現(xiàn)擴增出的布氏桿菌反應(yīng)管在照射下產(chǎn)生熒光,而沒有擴增出布氏桿菌的反應(yīng)管則沒有熒光產(chǎn)出。使用該檢測方法測試的160份羊血液中,共有12份檢測出布氏桿菌[2]。

2.4 PCR擴增結(jié)果

根據(jù)電泳結(jié)果可知,M5株陽性DNA以及待測試樣在800 bp與180 bp存在條帶,證明有布氏桿菌擴增而出,而陰性試樣與5號泳道的待測試樣只在800 bp存在條帶,證明未出現(xiàn)布氏桿菌擴增狀況。該檢測結(jié)果與T1011的判定方法相符。該檢測方法同樣以160份羊血液作為實驗對象,發(fā)現(xiàn)的布氏桿菌共計10份。

3 實驗分析

布氏桿菌對各國畜牧業(yè)都產(chǎn)生了惡劣的影響,不僅使羊群的生殖器官、內(nèi)臟受到破壞,還造成了大量經(jīng)濟損失,同時也對畜牧人員的生命安全產(chǎn)生威脅。隨著分子生物學的進一步成熟與發(fā)展,PCR、LAMP等基因檢測方法的應(yīng)用越來越受到人們重視,新的基因檢測方法也在不斷開發(fā)、研究當中。

以往的檢測流程過于繁瑣與復雜,并且對實驗儀器的要求相對嚴格,這就導致傳統(tǒng)的檢測方法已無法滿足基層測試的相關(guān)需要。但LAMP技術(shù)卻能有效解決此類問題,由于其使用的引物是對DNA鏈上的區(qū)段進行針對性設(shè)計的,相較于傳統(tǒng)的PCR探針只能對2個區(qū)段設(shè)計引物,更好地實現(xiàn)了特異性的優(yōu)化,在進行反應(yīng)時所采用的置換型合成酶也能夠在60℃~65℃的環(huán)境下完成DNA擴增,使檢測的時間被大幅縮短。同時LAMP技術(shù)對實驗儀器的要求較低,具有良好的適用性與經(jīng)濟性,以上優(yōu)點足以證明LAMP反應(yīng)更適合用在基層檢測中。此外,在DNA合成過程中,需要從DNTPS中提取焦磷酸離子以及鎂離子,確保二者在反應(yīng)溶液中充分反應(yīng),并生成白色沉淀焦磷酸鎂。本次實驗即是采用此反應(yīng)原理使LAMP方法能夠在金屬浴中被良好應(yīng)用,根據(jù)實驗結(jié)果顯示陽性反應(yīng)管內(nèi)會產(chǎn)生白色渾濁,并且反應(yīng)現(xiàn)象十分明顯,達到肉眼可見的級別。這足以證明LAMP方法可以實現(xiàn)布氏桿菌的擴增,實驗原理與實際結(jié)果保持一致。同時該方法的操作流程簡易,對設(shè)備的要求較低,對人員的技術(shù)要求偏低。而且LAMP反應(yīng)從始至終都無需完成反應(yīng)管的開啟,這不僅可以防止氣溶膠的形成,避免DNA污染導致假陽性的產(chǎn)生,還完全符合基層的快速檢測條件[3]。

為了保證實驗結(jié)果具有較高的可信度與可靠性,本次實驗也采用了LAMP濁度儀進行布氏桿菌的檢測,該方法可以對生成的焦磷酸鎂沉淀的渾濁度進行檢測,之后以數(shù)據(jù)圖的形式呈現(xiàn)基因是否產(chǎn)生擴增現(xiàn)象。在反應(yīng)完成后,便可直接觀察通道的改變狀況,如果有藍色柱狀產(chǎn)生并且底部出現(xiàn)紅色則證明目的基因被有效擴增出,代表陽性,反之則代表陰性。根據(jù)實驗結(jié)果顯示,LAMP濁度儀的觀測效果良好,可以直接反映基因的具體擴增量以及變化情況,但由于設(shè)備本身的造價較為高昂,因此在基層應(yīng)用中難以得到有效推廣。

LAMP反應(yīng)過程中出現(xiàn)的擴增物在與黃綠素染料充分結(jié)合的情況下,能夠產(chǎn)生相應(yīng)的顏色變化,依照此原理,實驗中可通過熒光目視檢測試劑盒進行布氏桿菌的檢測。實驗結(jié)果顯示,在加入檢測試劑后,反應(yīng)溶液會變?yōu)榫G色代表陽性,若反應(yīng)溶液無顏色變化則為陰性,而在紫外光照射下出現(xiàn)熒光為陽性,未產(chǎn)生熒光則為陰性。這種可視度較高的變化能夠使判定結(jié)果更加準確、清晰,但有數(shù)據(jù)顯示該反應(yīng)的時間較長,通常要高于1 h,容易產(chǎn)生假陽性,并且試劑盒的成本較高,還需應(yīng)用紫外照射設(shè)備,因此同樣不適用于基層檢測。

綜上所述,本次實驗所采取的3種LAMP快速檢測方法的檢出效果均好于以往的PCR檢測方法,而且3種方法的陽性檢出率一致,重復率相同。這其中金屬浴LAMP的應(yīng)用效果佳,并且該方法無論是在試劑方面還是在實驗設(shè)備方面都不需要投入過高的成本費用,同時也能保證極高的檢出率和良好的檢測效果,因此相比較于其他兩種LAMP快速檢測法更適合在基層中進行應(yīng)用,能夠切實滿足相關(guān)使用條件,值得推廣。

4 結(jié)語

通過對羊布氏桿菌病快速檢測技術(shù)的材料準備、實驗流程、實驗結(jié)果進行分析討論可知,金屬浴LAMP方法無需昂貴的設(shè)備與試劑,具有檢測準確度高,經(jīng)濟性好的優(yōu)勢。金屬浴LAMP檢測方法可以作為基層推廣的主要檢測方法。

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