2022年2月，北京市農(nóng)林科學(xué)院植物保護(hù)研究所食用菌研究室在《Journal of Fungi》發(fā)表題為“Haplotype-Resolved Genome Analyses Reveal Genetically Distinct Nuclei within a Commercial Cultivar of”的研究論文。該研究基于HiFi測(cè)序和Hi-C輔助組裝，構(gòu)建了迄今最完整的香菇單倍型基因組。其中，SP3組裝的基因組大小為50.83 Mb，并將99.63%的序列錨定到10條染色體上；SP30組裝的基因組大小為49.80 Mb，并將98.91%的序列錨定到10條染色體上，BUSCO評(píng)估基因組完整性分別為96.4%和96.2%。在此基礎(chǔ)上，比較了2株香菇單倍型基因組與其他已公布的4株香菇株系基因組的共線(xiàn)性，鑒定到了不同香菇株系間的共有和特有基因。此外，利用共線(xiàn)性分析揭示了SP3和SP30基因組間的染色體重排以及重排基因的功能差異，發(fā)現(xiàn)2個(gè)核基因組序列差異大于30%，添補(bǔ)了對(duì)香菇不同交配型基因組差異的認(rèn)知。最后，對(duì)SP3和SP30基因組中的2個(gè)非連鎖交配型位點(diǎn)A（matA）和B（matB）進(jìn)行了定位研究，發(fā)現(xiàn)SP3和SP30中matA的距離和基因結(jié)構(gòu)方面存在差異，而兩者間的matB在數(shù)量和位置上存在差異，為香菇定向雜交育種提供研究基礎(chǔ)。該研究為進(jìn)一步研究香菇栽培品種間、栽培品種與野生品種間的關(guān)系以及2個(gè)細(xì)胞核對(duì)香菇子實(shí)體形成的協(xié)同調(diào)控作用奠定了基礎(chǔ)。