国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

羅曼粉蛋雞感染E亞型禽白血病病毒的分子生物學(xué)檢測(cè)分析

2022-10-30 12:15:52何建宇羅東還張小波吳詩(shī)卉龍小川王廷龍溫貴蘭
貴州畜牧獸醫(yī) 2022年5期
關(guān)鍵詞:登錄號(hào)外源性內(nèi)源性

何建宇, 孫 蕓,2, 徐 飛,2, 羅東還,2, 張小波,2, 吳詩(shī)卉, 冉 鳳, 龍小川, 王廷龍, 李 濤, 溫貴蘭,2*

(1. 貴州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院,貴州貴陽(yáng)550025; 2. 貴州省動(dòng)物生物制品工程技術(shù)研究中心,貴州貴陽(yáng)550016; 3. 貴州省動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心,貴州貴陽(yáng)550008)

禽白血病是由反轉(zhuǎn)錄病毒科、α反轉(zhuǎn)錄病毒屬的禽白血病病毒(Avian leukosis virus,ALV)引起的禽類腫瘤疾病[1]。根據(jù)血清中和試驗(yàn)、宿主范圍、囊膜糖蛋白特性等,ALV可分為A~K 11個(gè)亞群[2,3]。根據(jù)自然傳播方式與病毒復(fù)制的生物學(xué)特性,ALV又可劃分為外源性病毒和內(nèi)源性病毒,其中A、B、C、D、J、K為外源性病毒,E、F、G、H、I為內(nèi)源性病毒。通常情況下,E亞群ALV無致病性或致病性較弱[4],但會(huì)影響外源性ALV的檢測(cè),造成結(jié)果誤差[5]。由于外源性ALV與內(nèi)源性ALV同時(shí)存在的情況時(shí)有發(fā)生,也極易造成不同亞群之間的基因重組[6]。2021年11月1日,貴州省惠水縣某養(yǎng)殖場(chǎng)的羅曼粉蛋雞出現(xiàn)死亡現(xiàn)象,3天內(nèi)共死亡89只,產(chǎn)蛋率下降7%?,F(xiàn)將養(yǎng)殖場(chǎng)送檢的10只病死雞進(jìn)行禽白血病病毒排查檢測(cè)情況報(bào)道如下,供參考。

1 材料與方法

1.1 檢測(cè)病料采集10只送檢病死雞的肝臟、脾臟(分別編號(hào)1~10)作為檢測(cè)病料。

1.2 主要試劑2×EsTaqDNA聚合酶(購(gòu)自康為世紀(jì)有限公司)、RNA提取試劑盒(購(gòu)自世紀(jì)元亨公司),反轉(zhuǎn)錄試劑盒、DL 2 000 DNA Marker[均購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司]。

1.3 主要儀器高速冷凍離心機(jī)(型號(hào):TGL-18M,上海盧湘儀離心機(jī)儀器有限公司)、基因擴(kuò)增儀(型號(hào):T20,杭州朗基科學(xué)儀器有限公司)、電泳儀(型號(hào):DYY-8C,北京市六一儀器廠)。

1.4 引物設(shè)計(jì)ALVp27基因是ALV各亞群的高度保守基因,內(nèi)源性和外源性病毒中均存在。P27蛋白是ALV群特異性抗原,是ALV核心衣殼蛋白的主要成分,含量高,占病毒總蛋白的30%以上,是制備檢測(cè)抗體的首選抗原[7]。因此本試驗(yàn)參考徐麗等[8]的方法,利用Primer Premier 7.0軟件設(shè)計(jì)ALVp27基因的通用擴(kuò)增引物。按照張喜懿等[9]的方法,參照GenBank中ALV-A(登錄號(hào):MF926337)、ALV-B(登錄號(hào):M14902)、ALV-K(登錄號(hào):KP686142)的p27基因序列,以及ALV-J(登錄號(hào):Z46390)的gp85基因序列,分別設(shè)計(jì)A、B、J、K亞型ALV核酸檢測(cè)擴(kuò)增引物。按照黃新[10]的方法,參照ALV-E(登錄號(hào):KF746200)的p27基因序列設(shè)計(jì)E亞型ALV核酸檢測(cè)擴(kuò)增引物。各引物信息見表1。

表1 引物信息

1.5 ALV核酸檢測(cè)液氮條件下研磨肝臟、脾臟,按照RNA提取試劑盒說明書方法提取總RNA,按反轉(zhuǎn)錄試劑盒明書方法合成各病毒cDNA。反轉(zhuǎn)錄體系:dNTP Mix 4 μL、Primer Mix 2 μL、RNA Template 4 μL、5×RT Buffer 4 μL、DTT 2 μL、HifiScript 1 μL、加入RNase-Free Water補(bǔ)足至20 μL。反轉(zhuǎn)錄程序:42 ℃ 45 min,85 ℃ 5 min。反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物-20 ℃保存?zhèn)溆谩R愿鱟DNA為模板進(jìn)行PCR檢測(cè)。PCR反應(yīng)體系25 μL:2×TaqMaster Mix 12.5 μL,上、下游引物各1 μL,cDNA 2 μL,ddH2O 8.5 μL。PCR反應(yīng)條件見表2。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。

表2 PCR反應(yīng)條件

1.6 ALV-E的遺傳進(jìn)化分析將擴(kuò)增產(chǎn)物送至上海生工生物有限公司測(cè)序。測(cè)序結(jié)果上傳至 NCBI(美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心)、BLAST(生物大分子序列比對(duì)搜索工具)進(jìn)行比對(duì),以GenBank中11株ALV各亞型毒株為參考株,利用生物信息分析軟件MegAlign 7.1進(jìn)行同源性分析,并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。參考毒株信息見表3。

表3 參考毒株信息

2 結(jié)果與分析

2.1 ALV核酸檢測(cè)結(jié)果PCR產(chǎn)物經(jīng)1.2%瓊脂糖凝膠電泳分離后,1、2、3、5、6、9號(hào)病料在744 bp處出現(xiàn)特異性條帶,說明10只病死雞中有6只存在ALV感染(見圖3)。6份陽(yáng)性樣品經(jīng)ALV-E亞型檢測(cè)同樣在1 074 bp處出現(xiàn)特異條帶(見圖4)。

2.2 遺傳進(jìn)化分析將雞場(chǎng)分離的病毒株(命名為:HS202101S株)與11株ALV參考株進(jìn)行同源性分析,結(jié)果HS202101S毒株與ALV-E亞型的E-ros001、E-B9、E-TYR毒株同源性最高,均為99.1%;與ALV-J亞型的GZN16毒株同源性最低,為37.1%;與其他亞型毒株同源性均相對(duì)較低,為37.3%~41.2%。 構(gòu)建HS202101S毒株與11株ALV參考毒株的系統(tǒng)進(jìn)化樹,由圖5可見:HS202101S毒株與E-ros001、E-B9、E-TYR屬于1個(gè)小分支,進(jìn)化關(guān)系最近。

M:DL 2 000 DNA Marker; -:陰性對(duì)照; +:陽(yáng)性對(duì)照; 1~10:檢測(cè)樣品圖3 ALV核酸PCR檢測(cè)

M:DL 2 000 DNA Marker; 1~6:檢測(cè)樣品; +:陽(yáng)性對(duì)照; -:陰性對(duì)照?qǐng)D4 ALV-E核酸PCR檢測(cè)

圖5 ALV系統(tǒng)進(jìn)化樹分析

3 結(jié)論

經(jīng)實(shí)驗(yàn)室分子生物學(xué)檢測(cè)分析,貴州省惠水縣某養(yǎng)雞場(chǎng)存在ALV-E感染。

4 討論

4.1本次檢測(cè)旨在排查惠水縣某養(yǎng)雞場(chǎng)的羅曼粉蛋雞是否存在ALV感染,結(jié)果表明在沒有特征癥狀情況下,6只雞存在ALV-E內(nèi)源性感染。內(nèi)源性ALV是存在于雞染色體基因組上的 ALV前病毒基因組或片段,可隨染色體的復(fù)制而垂直傳播,致瘤性很低。外源性 ALV 通常不通過宿主細(xì)胞染色體傳遞給下一代[11],可誘發(fā)腫瘤,可垂直和水平傳播。

4.220世紀(jì)90年代,我國(guó)首次分離到外源性ALV-J,主要是從國(guó)外引進(jìn)白羽雞所致,隨后國(guó)內(nèi)養(yǎng)殖的黃羽雞、蛋雞及地方品種雞陸續(xù)被各型ALV感染,并造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失,其中引起雞發(fā)病死亡的主要是外源性ALV。大部分雞的染色體基因組中存在ALV的前病毒DNA,宿主體內(nèi)的ALV-E在一定條件下可產(chǎn)生完整的病毒粒子或表達(dá)某些特征蛋白質(zhì)。攜帶完整ALV-E病毒粒子的雞往往對(duì)其他外源性ALV 的抵抗力較差,更容易發(fā)生外源性 ALV 誘發(fā)的禽白血病腫瘤[11]。ALV-E 基因座遵循孟德爾遺傳方式,很多ALV-E原病毒是不完整或轉(zhuǎn)錄沉默的,但仍然有一些完整的、能夠活躍轉(zhuǎn)錄并產(chǎn)生感染性病毒的元件存在,這些具有轉(zhuǎn)錄活性元件的ALV-E會(huì)影響雞的產(chǎn)蛋量和蛋重等重要的經(jīng)濟(jì)特征;此外,攜帶ALV-E21毒株的低羽鳥類與正常羽鳥類相比,產(chǎn)量較低,死亡率較高[12]。綜上所述,對(duì)于E亞型禽白血病病毒的研究也應(yīng)當(dāng)引起重視。

猜你喜歡
登錄號(hào)外源性內(nèi)源性
內(nèi)源性NO介導(dǎo)的Stargazin亞硝基化修飾在腦缺血再灌注后突觸可塑性中的作用及機(jī)制
基于DNA條形碼進(jìn)行金花茶組種間鑒別
種子(2021年2期)2021-03-31 09:23:32
病毒如何與人類共進(jìn)化——內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒的秘密
科學(xué)(2020年3期)2020-11-26 08:18:34
含氟新農(nóng)藥的研究進(jìn)展
浙江化工(2019年5期)2019-06-04 08:33:34
外源性防御肽(佰潤(rùn))對(duì)胸腔鏡術(shù)后氣道黏膜修復(fù)的影響
小反芻獸疫病毒F基因的序列分析
麥冬中外源性有害物質(zhì)的分析
中成藥(2017年9期)2017-12-19 13:34:56
電子版館藏?cái)?shù)據(jù)回溯中的交叉、重疊、阻滯問題處理
外源性表達(dá)VEGF165b對(duì)人膀胱癌T24細(xì)胞侵襲力的影響
內(nèi)源性12—HETE參與缺氧對(duì)Kv通道抑制作用機(jī)制的研究
雅江县| 洪江市| 视频| 密云县| 怀柔区| 都匀市| 宁国市| 昌吉市| 黔江区| 伊宁市| 青浦区| 会东县| 高淳县| 遂溪县| 双柏县| 治多县| 弥勒县| 和田市| 阿拉尔市| 青龙| 江达县| 信阳市| 阜宁县| 河西区| 靖西县| 白城市| 澄城县| 廉江市| 伊金霍洛旗| 通榆县| 六盘水市| 新安县| 闻喜县| 大姚县| 崇文区| 上杭县| 三亚市| 南充市| 稻城县| 孝昌县| 恩施市|