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十字花科栽培作物根腫病抗性研究進(jìn)展

2022-10-27 12:19蘇賀楠楊雙娟魏小春趙艷艷王志勇尹喜恩張曉偉原玉香
中國瓜菜 2022年10期
關(guān)鍵詞:抗病侵染甘藍(lán)

蘇賀楠,楊雙娟,魏小春,趙艷艷,王志勇,尹喜恩,張曉偉,原玉香

(1.河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院園藝研究所 鄭州 450002; 2.鄢陵縣甘羅養(yǎng)生養(yǎng)老有限公司 河南 鄢陵 461200)

十字花科根腫病是由蕓薹根腫菌(Woron.)侵染引起的世界范圍內(nèi)普遍發(fā)生的一種重要土傳病害,在全世界多個國家均有分布。黃齊望等首次報道了十字花科作物根腫病在我國江西發(fā)生,近年來蔓延速度迅猛、發(fā)生程度加重、分布范圍極廣、經(jīng)濟(jì)損失嚴(yán)重。據(jù)統(tǒng)計,十字花科作物根腫病目前在我國20 多個?。ㄗ灾螀^(qū)、直轄市)均有不同程度地發(fā)生,尤其在西南部和中部發(fā)病地區(qū)危害最嚴(yán)重。該病專性寄生在十字花科作物的根部,包括白菜、菜心、油菜、甘藍(lán)、花椰菜、青花菜、芥藍(lán)、蘿卜、芥菜和蕪菁等栽培作物,通過侵染根毛導(dǎo)致根部薄壁細(xì)胞增生而形成腫瘤,對大面積十字花科栽培作物生產(chǎn)影響巨大,一旦發(fā)病,蔬菜作物產(chǎn)量急劇下降,經(jīng)濟(jì)效益嚴(yán)重下滑。

1 根腫病病害特點(diǎn)、癥狀及分類

1.1 根腫菌的生物學(xué)特征

根腫病病原菌為蕓薹根腫菌,同時具有真菌和原生動物特性,目前普遍認(rèn)為該菌屬于原生動物界、根腫菌門、根腫菌綱、根腫菌目、根腫菌屬。根腫菌在土壤中的主要存活狀態(tài)是形態(tài)和大小不一的休眠孢子。王靖等總結(jié)出油菜根腫菌休眠孢子直徑為1.7~4.3μm,白菜根腫菌休眠孢子直徑為2.2~4.2μm,結(jié)球甘藍(lán)根腫菌休眠孢子直徑為1.6~4.0μm,根腫菌休眠孢子呈近球形。

當(dāng)遇到適宜的環(huán)境條件時,土壤中的休眠孢子萌發(fā)釋放初級游動孢子,初級游動孢子形成變形體,靠近并接觸寄主根毛表皮,產(chǎn)生一種管狀結(jié)構(gòu)侵入細(xì)胞壁,完成根毛侵染階段,此階段的感病植株沒有明顯的表型病征。初級游動孢子在侵染的根毛內(nèi)形成原生質(zhì)團(tuán),原生質(zhì)團(tuán)經(jīng)過大量的核分裂后形成多個游動的孢子囊,已經(jīng)成熟的游動孢子囊會釋放出次級游動孢子,隨后2 個次級游動孢子融合形成雙核的次級游動孢子,融合后的次級游動孢子侵入植株根部皮層細(xì)胞,完成皮層侵染階段。皮層侵染階段會導(dǎo)致植物根部細(xì)胞異常增生,引發(fā)根部腫大甚至畸形,形成不同形狀的腫瘤。

1.2 根腫菌的發(fā)病癥狀

根腫菌專性寄生在十字花科作物根部,從寄主植株的幼苗期到成株期均可發(fā)病。在發(fā)病初期,受侵染的植株發(fā)病癥狀并不明顯,只在側(cè)根處出現(xiàn)一些小瘤子,腫根表面通常比較光滑,對植物的地上部分生長基本沒有影響。但是伴隨著根腫菌侵染時間的延長,植株主根也出現(xiàn)腫瘤,根部的腫瘤逐漸膨大,腫根表面變得粗糙且發(fā)生龜裂,使其他的雜菌容易入侵根部,造成植株吸收養(yǎng)分受阻,從而導(dǎo)致發(fā)病植株地上部長勢較弱、葉片逐漸萎蔫,且越到侵染后期發(fā)病越嚴(yán)重,最終引起整個植株枯萎死亡。

根腫菌侵染不同的十字花科栽培作物,根部腫瘤的存在部位、大小以及形狀也會產(chǎn)生差異(圖1)。當(dāng)根腫菌侵染的寄主是白菜、油菜、甘藍(lán)和芥菜類蔬菜作物時,主根的腫瘤體積大且數(shù)量少,而在側(cè)根的腫瘤體積小且數(shù)量多,根瘤的形態(tài)特征表現(xiàn)為球形、手指狀或者短棒狀;當(dāng)蘿卜、蕪菁等蔬菜作物受到根腫菌侵染時,主根一般無腫瘤或者腫瘤存在于主根的末端,根上有較大縊縮黑疤,須根上有較多的腫瘤,侵染后期根上黑疤凹陷形成大的黑洞,且中空腐爛。

圖1 大白菜、甘藍(lán)和蘿卜根腫病田間發(fā)病情況統(tǒng)計標(biāo)準(zhǔn)[12]

1.3 根腫病生理小種鑒定

Honig于1931 年首先提出根腫菌生理小種存在變異分化,隨著研究的深入,Ayers、Lamrnerink、Williams、Johnston、Toxopeus和Buczack等多位學(xué)者已經(jīng)建立了多種鑒定根腫菌小種分化的系統(tǒng),目前國內(nèi)外學(xué)者公認(rèn)的根腫菌生理小種的鑒別系統(tǒng)為Williams 建立的Williams 系統(tǒng)和Buczacki 等建立的European Clubroot Differential(ECD)系統(tǒng)。Williams 系統(tǒng)的鑒別寄主分別由2個蕪菁甘藍(lán)品種和2 個結(jié)球甘藍(lán)品種共4 個十字花科栽培作物品種組成,Williams 通過統(tǒng)計這4 個栽培作物品種對根腫菌不同的抗性反應(yīng),從而制定了Williams 系統(tǒng),該體系可以把從16 個不同的國家和地區(qū)收集而來的124 個菌株劃分為9 個不同的根腫菌生理小種。去除Williams 鑒別系統(tǒng)中1個蕪菁甘藍(lán)品種,增加12 個不同的十字花科鑒別寄主品種,利用這些鑒別寄主對不同生理小種的根腫病抗性來鑒定生理小種,命名為歐洲鑒別寄主體系的鑒別系統(tǒng)(ECD)。

根腫菌活體寄生的特殊性導(dǎo)致自然環(huán)境中并不存在單孢生理小種,侵染時都是以混合生理小種的狀態(tài)存在,因此通過鑒別系統(tǒng)鑒別出的小種僅為該菌株的優(yōu)勢生理小種。目前我國大部分地區(qū)的主要優(yōu)勢小種為4 號生理小種,還有一些其他生理小種也被相繼報道。原玉香等通過Williams 鑒別系統(tǒng)明確了河南省新野大白菜根腫菌是4 號生理小種,通過ECD 系統(tǒng)明確其生理小種為ECD16/15/31 和ECD21/31/31,說明經(jīng)Williams 鑒別系統(tǒng)鑒定的該地區(qū)4 號生理小種實(shí)際存在致病性差異;黃蓉等通過Williams 鑒別系統(tǒng)對江西省油菜根腫病發(fā)病區(qū)域進(jìn)行鑒定,發(fā)現(xiàn)致病菌為4 號和9 號生理小種;張晶等利用單孢分離技術(shù)和Williams生理小種鑒定方法對中國湖北利川、內(nèi)蒙古通遼、陜西太白、山東青島、北京、河南南陽、遼寧大連、遼寧沈陽以及云南昆明等9 個大白菜主產(chǎn)區(qū)的根腫菌進(jìn)行分離及鑒定,發(fā)現(xiàn)4 號生理小種為中國大白菜主產(chǎn)區(qū)的根腫菌優(yōu)勢小種,同時還包含除5 號以外的所有生理小種。

2 根腫病抗病基因與分子標(biāo)記的研究進(jìn)展

迄今,伴隨著科技的不斷發(fā)展,根腫病的相關(guān)研究已經(jīng)從遺傳學(xué)的理論水平發(fā)展到分子生物學(xué)水平,越來越多的十字花科栽培作物的抗根腫病基因被定位出來,通過雜交等常規(guī)育種途徑和克隆、轉(zhuǎn)基因等分子生物學(xué)手段導(dǎo)入感病的優(yōu)良品種中,加快了十字花科作物抗根腫病的育種步伐。因此,研究根腫病的抗病機(jī)制和抗病性的遺傳規(guī)律,不僅可以為十字花科栽培作物抗病育種提供相應(yīng)的理論依據(jù),另外,對于挖掘抗病基因、加快抗病育種的進(jìn)程以及改良育種技術(shù)都具有十分重要的意義。

2.1 白菜抗根腫病基因定位與克隆研究

大白菜(ssp.,AA=20)屬于蕓薹屬蕓薹種,是起源于我國的一種重要蔬菜。其根腫病抗性研究工作進(jìn)行較早,白菜中的根腫病抗性基因來源于不同亞種的歐洲飼用蕪菁(ssp.)。在1998 年,Matsumoto等利用RFLP 標(biāo)記HC352b 和HC181 將根腫病抗性基因定位于A03 連鎖群上,遺傳距離分別為3 cM 和12 cM。2003 年,Suwabe 等利用4號生理小種接種抗性來源于Siloga 蕪菁的抗病大白菜F分離群體,定位到了2 個與根腫病抗性相關(guān)的位點(diǎn),分別命名為(位于A08)和(位于A01),并篩選出2 個緊密連鎖的SSR 標(biāo)記BRMS-088 和BRMS-096。2004 年,Hirai 等利用Ano-01 生理小種對大白菜抗病分離群體接種,經(jīng)遺傳分析確定一個由1 對主效基因控制的新的抗根腫病基因(位于A03)。2006 年,Suwabe 等利用抗感根腫病大白菜材料G004 和A9709 構(gòu)建的F群體,繪制遺傳連鎖圖譜并進(jìn)行共線性分析,發(fā)現(xiàn)了位于A06 染色體上的。Piao 等對抗性來源于ECD01 蕪菁的大白菜分離群體接種4 號生理小種,發(fā)現(xiàn)具有抗性的位于A03 連鎖群,顯性SCAR 標(biāo)記TCR09 與基因緊密連鎖,遺傳距離為0.78 cM,2 個側(cè)翼標(biāo)記TCR01 和TCR09 與之間的遺傳距離為2.9 cM。Zhang 等認(rèn)為和是兩個緊密相連的抗性位點(diǎn)。Sakamoto等通過接種2 號生理小種和K04 菌株,定位了來源于Debra 蕪菁的抗病基因,分別命名為(位于A03)和( 位 于 A02)。 Laila 等利 用ddRAD-seq 技術(shù)鑒定到1 個新的抗性位點(diǎn)(位于A08),不同于以往報道的位于A08 染色體上的。Chen 等定位了來源于ECD04 蕪菁的抗根腫病基因.、.和.,這3 個位點(diǎn)分別抗2、10 和7 號生理小種。Kato 等對抗病性來源于Gelria 蕪菁的抗病大白菜材料進(jìn)行定位研究,定位到抗病基因CRb。Pang 等對大白菜抗感根腫病的F分離群體進(jìn)行定位研究,發(fā)現(xiàn)了位于A03 染色體60 kb 區(qū)域內(nèi)的,且在的上游區(qū)域。Chu 等通過構(gòu)建連鎖遺傳圖譜及轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序手段將()精細(xì)定位在A03 連鎖群上,兩側(cè)分子標(biāo)記MS7-9 和sN8591,遺傳距離分別為0.06 cM 和0.19 cM。Huang 等通過對大白菜抗感根腫病材料進(jìn)行RNA-seq 研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn)了位于A03 染色體近端區(qū)的。 Huang 等利 用Bulked Segregant RNA Sequencing(BSR-Seq)技 術(shù) 在A03 染 色 體23 339 019~23 465 030 bp 之間定位到1 個新的抗病基因,命名為。Chang 等對大白菜抗感根腫病池進(jìn)行BSR-Seq 和KASP 分析,結(jié)果定位到了1 個新的抗性基因,位于A08 染色體14.8~15.4 Mb 之間,命名為。Yu 等在大白菜根腫病抗性研究中定位了3 個抗性基因(位于A03)、(位于A02)和(位 于A08)。Karim 等利 用BSR-Seq 技術(shù)在大白菜A08 染色體上定位了2 個根腫病抗性位點(diǎn)和Rcr9。Choi 等對大白菜抗根腫病研究發(fā)現(xiàn)1 個位于和位點(diǎn)附近區(qū)域的抗病位點(diǎn)PbBrA08,通過標(biāo)記驗證、基因的結(jié)構(gòu)變異分析等手段確定了該位點(diǎn)是不同于上述抗病基因的新位點(diǎn)。Wei 等對大白菜抗根腫病研究發(fā)現(xiàn)1 個位于A03 染色體80 kb 區(qū)域內(nèi)的,通過RACE 克隆技術(shù)克隆出的全長序列,包含3 個外顯子和2 個內(nèi)含子,與已報道的(3 個外顯子和3 個內(nèi)含子)CDS 序列一致。

目前蕓薹屬A 基因組已定位的抗根腫病基因或位點(diǎn)有20 余個(表1),、、CRb和基因已經(jīng)被克隆,Hatakeyama 等通過構(gòu)建區(qū)間的高密度分子遺傳圖譜和BAC 文庫,以緊密連鎖的分子標(biāo)記為探針對BAC 文庫進(jìn)行篩選,隨后利用PCR 技術(shù)進(jìn)行cDNA 末端快速克隆,最后分別在抗病和感病材料中克隆出全長序列。Ueno 等利用擬南芥及大白菜參考基因組序列信息,通過cDNA 末端快速克隆技術(shù)最終克隆出,另外,利用基因的突變體及多個不同根腫病抗性的白菜材料分析了基因內(nèi)部可能與抗病相關(guān)的結(jié)構(gòu)域。Hatakeyama 等精細(xì)定位了位于A03 染色體140 kb 區(qū)域的,隨后利用新構(gòu)建的群體把區(qū)間縮小至64 kb,結(jié)合擬南芥同源序列及參考基因組信息,克隆出序列信息,與已報道的序列一致,最終確認(rèn)和是同一個基因。付鵬宇精細(xì)定位了位于染色體A03上60 kb 區(qū)域的,在抗根腫病和感病白菜材料中利用PCR 擴(kuò)增出序列全長,另外,把基因轉(zhuǎn)化到擬南芥中,對獲得的陽性植株進(jìn)行抗病性鑒定及根部組織細(xì)胞學(xué)形態(tài)觀察,最終結(jié)果驗證了抗4 號生理小種。伴隨著大白菜全基因組數(shù)據(jù)庫的公布,以及更多A 基因組亞種重測序以及從頭測序工作的進(jìn)行,抗病基因的定位與克隆工作將在白菜類蔬菜作物中加速開展起來,基因的功能研究工作也將得到進(jìn)一步的提升。

表1 白菜類抗根腫病基因位點(diǎn)及標(biāo)記信息

2.2 甘藍(lán)抗根腫病QTL定位研究

結(jié)球甘藍(lán)(L. var.,CC=18)簡稱甘藍(lán),近年來研究人員對甘藍(lán)品種進(jìn)行廣泛的根腫病抗病性鑒定,結(jié)果發(fā)現(xiàn)感病的甘藍(lán)品種占大部分,而根腫病抗性資源很少。由于接菌的生理小種及研究的抗源材料的不同,甘藍(lán)抗根腫病遺傳規(guī)律的研究結(jié)果也不同,目前大多數(shù)研究認(rèn)為甘藍(lán)中的根腫病抗性是由幾個主效位點(diǎn)和微效位點(diǎn)控制的數(shù)量性狀,司軍等認(rèn)為甘藍(lán)根腫病抗性受到3 對以上基因控制,為不完全隱性。

迄今,甘藍(lán)中關(guān)于抗根腫病位點(diǎn)精細(xì)定位的報道較少,目前也沒有克隆出抗病基因。Nagaoka等利用不同根腫病抗性的甘藍(lán)DH 系構(gòu)建分離群體進(jìn)行QTL 定位,結(jié)果定位到了5 個QTL 位點(diǎn),其中1 個主效QTL 位點(diǎn)的LOD 值為13.7,能夠解釋47%的表型變異。Lee 等利用Genotyping By Sequenceing(GBS)技術(shù),通過構(gòu)建F群體進(jìn)行甘藍(lán)抗根腫病QTL 定位,一共獲得了抗2 號生理小種的1 個主效QTL 位點(diǎn)CRQTL-YC 和抗9 號生理小種的 2 個 主 效 QTL 位 點(diǎn) CRQTL- GN_1 和CRQTL-GN_2,其中抗2 號生理小種的CRQTL-YC位點(diǎn)能夠解釋47.1%的表型變異。孫超等通過比較基因組學(xué)手段,在甘藍(lán)中同源克隆出白菜的和基因,鑒定出1 個可能與抗根腫病相關(guān)的位點(diǎn)。張小麗篩選出1 個抗根腫菌4 號生理小種的甘藍(lán)近緣野生種B2013,通過與感病品種雜交,后代抗病鑒定結(jié)果表明其抗病性狀是多基因控制的數(shù)量性狀,且存在顯性的主效基因,并通過QTL-seq將抗病QTL 定位在甘藍(lán)C09 染色體560 kb 區(qū)域。Peng 等利用SNP 基因芯片在甘藍(lán)中檢測到23 個與抗根腫病相關(guān)的QTL 位點(diǎn),可解釋6.1%~17.8%的表型變異。Dakouri 等通過BSR-seq 技術(shù)將甘藍(lán)抗根腫病3 號生理小種的主效基因定位到C07 染色體41~44 Mb 區(qū)間內(nèi),通過比較區(qū)間內(nèi)基因組的注釋結(jié)果,進(jìn)一步將TIR-NBS-LRR 類型基因和確定為候選基因。

2.3 甘藍(lán)型油菜根腫病抗性研究

甘藍(lán)型油菜(L.AACC=38)是通過白菜與甘藍(lán)種間雜交,隨后加倍形成的異源四倍體,種內(nèi)遺傳變異非常少,對根腫病抗性較差,整體上缺乏高抗或抗病品種。傳統(tǒng)遺傳學(xué)研究認(rèn)為,甘藍(lán)型油菜的根腫病抗性是由1~2 個獨(dú)立的顯性基因控制,這些顯性基因在大量抗性材料中都存在。Chiang 等對甘藍(lán)型油菜抗根腫病研究發(fā)現(xiàn),1 號和3 號生理小種的抗性均受單一顯性基因控制,而5 號生理小種的抗性是通過2 個隱性基因遺傳的。余青青等以人工合成甘藍(lán)型油菜為材料,對根腫病抗性進(jìn)行遺傳規(guī)律研究,發(fā)現(xiàn)該油菜的抗性受到一對顯性基因控制。Rahman 等發(fā)現(xiàn)甘藍(lán)型油菜抗根腫病基因受1~2 個顯性基因控制。Diederichsen 等利用ECD04 和DH 群體發(fā)現(xiàn)1 個控制甘藍(lán)型油菜根腫病抗性的主效基因和至少2 個隱性基因。Werner 等應(yīng)用7 種不同的根腫病生理小種,定位到位于8 條染色體上的19 個QTL,這些QTL 對于不同的根腫病菌生理小種具有特異性。目前研究人員已經(jīng)在甘藍(lán)型油菜上發(fā)現(xiàn)一些抗病基因或QTL 位點(diǎn),這些抗病位點(diǎn)大多與白菜和甘藍(lán)存在一定的同源關(guān)系,控制根腫病抗性的少數(shù)幾個起關(guān)鍵性作用的顯性基因很有可能來源于白菜的A 染色體組。

2.4 蘿卜根腫病抗性研究

與白菜、甘藍(lán)和甘藍(lán)型油菜相比,蘿卜(L. RR=18)的根腫病抗病性整體上更強(qiáng)。Diederichsen 等研究發(fā)現(xiàn)大部分蘿卜品種對根腫菌的抗性很有可能是由單個顯性位點(diǎn)控制的。Akaba 等以日本蘿卜為材料,接種根腫病2號生理小種,利用9 種類型的染色單體附加系進(jìn)行研究,結(jié)果表明,根腫病抗性基因存在于蘿卜的1條染色體上,不排除存在微效基因的影響。Kamei等用日本蘿卜和中國蘿卜雜交的95 個F群體進(jìn)行蘿卜根腫病抗病位點(diǎn)的QTL 分析,使用AFLP 和SSR 標(biāo)記構(gòu)建連鎖圖譜,結(jié)果表明該蘿卜的抗性由或與其緊密連鎖的基因控制,該基因與擬南芥第3 條染色體頂端區(qū)域的基因同源。Gan 等利用抗病蘿卜品種BJJ 和感病品種XNQ 雜交獲得的F群體,通過RAD-seq 技術(shù)定位到了分別位于8 號和9 號染色體上的5 個與根腫病抗病相關(guān)的QTL 位點(diǎn),分別命名為、、、和。

3 十字花科栽培作物抗根腫病機(jī)制研究進(jìn)展

3.1 抗病R基因在植物抗病中的作用

當(dāng)病原體入侵時,植物自身會產(chǎn)生有效的機(jī)制來識別和應(yīng)對,植物抵抗病原體的模式有2 種:由起初的病原體相關(guān)分子模式(PAMP)觸發(fā)的免疫(PAMP-triggered immunity,PTI)和隨后的效應(yīng)因子觸發(fā)的免疫(effector-triggered immunity,ETI)。植物抗病基因(disease resistance gene,)編碼的R蛋白可以識別相應(yīng)的PAMP 和效應(yīng)因子,基因通常含有核酸結(jié)合位點(diǎn)(nucleotide binding site,NBS)、亮氨酸重復(fù)(leucine rich repeat,LRR)結(jié)構(gòu),可以直接或間接地與病原菌的效應(yīng)因子結(jié)合,從而激發(fā)ETI 免疫反應(yīng),這些基因使植物能夠識別外源病原體從而激活誘導(dǎo)防御。

迄今,根據(jù)基因和蛋白的序列和結(jié)構(gòu)特點(diǎn)可將基因分為分為5 大類型:NBS-LRR(nucleotide binding site plus leucine richrepeat )、LRR-TM(leucine-rich repeat plus transmembrane receptor)、STK(serine-threonine kinase)、RLK(recepetor-Iike kinase)和SA-CC(signal anchorplus coiled-coil),其中NBS-LRR 類型基因在植物抗病基因中占據(jù)著重要的地位,根據(jù)N 端結(jié)構(gòu)特征,可以將其分為2 個亞家族(TIR-NBS-LRR 和non-TIR-NBS-LRR)。目前,已經(jīng)在白菜上克隆出來的4 個根腫病抗性基因、、和都具有核苷酸結(jié)合位點(diǎn)(nucleotide binding site,NBS)、亮 氨 酸 富 集(leucine-rich repeat,LRR)和TIR(drosophila toll or animal interleukin-1 receptors)結(jié)構(gòu)域。在白菜中基因是特異的、單一的、顯性的,而甘藍(lán)中存在的基因則具有更連續(xù)的抗性,包括主基因和次級基因的各種組合。

3.2 植物激素在根腫病反應(yīng)中的作用研究

植物激素在與病原菌互作過程中起著重要的作用,其中水楊酸(salicylic acid,SA)、茉莉酸(jasmonic acid,JA)和乙烯(ethylene,ET)是植物抵御外界脅迫信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中的重要調(diào)控因子,能幫助植物抵御病原菌的侵染;而生長素(indole-3-acetic acid,IAA)、細(xì)胞分裂素(cytokinin,CTK)和脫落酸(abscisic acid,ABA)等可能在某些病原菌侵染寄主時起到促進(jìn)作用。

在擬南芥中至少存在2 種應(yīng)答病原菌侵染的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑:一種是抵抗活體營養(yǎng)型病原菌侵染的水楊酸信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,另外一種是茉莉酸和乙烯依賴的途徑,主要是抵抗腐生型病原菌的侵染。水楊酸和茉莉酸/乙烯信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑在十字花科作物抵抗根腫菌侵染的過程中起著重要的作用,并且外源噴施SA 和JA 可以適當(dāng)減輕植株根腫病發(fā)病癥狀。Lovelock 等對花椰菜根腫病研究發(fā)現(xiàn),與對照相比,在受侵染的根部噴施SA 可以促進(jìn)一些病程相關(guān)基因-及-等上調(diào)表達(dá),減少植株根部腫瘤的形成,同時噴施SA 和JA 時,能顯著降低感病植株的發(fā)病癥狀。Ning 等在研究根腫病侵染結(jié)球甘藍(lán)的過程中發(fā)現(xiàn),在抗感材料都受到根腫菌侵染后,與SA 和JA 信號途徑相關(guān)的基因在抗病材料中上調(diào)表達(dá),而在感病寄主中下調(diào)表達(dá)。Galindo 等對不同根腫病抗性甘藍(lán)型油菜在根腫病侵染后的7、14、21 d 進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在抗病材料中與免疫功能相關(guān)的許多基因都與SA介導(dǎo)的反應(yīng)有關(guān)。Ji 等對根腫菌侵染后的大白菜進(jìn)行差異表達(dá)基因的研究發(fā)現(xiàn),在16 個候選基因中有2 個是與SA 信號通路相關(guān),同時還發(fā)現(xiàn)在SA處理后抗病寄主中SA 水平上升以及這2 個SA 信號通路相關(guān)的候選基因表達(dá)上調(diào),說明SA 信號路徑參與了白菜與根腫菌的互作過程。

多數(shù)研究認(rèn)為植物激素包括IAA 和CTK 促進(jìn)根腫病菌侵染寄主,在侵染過程中,IAA 和CTK 信號途徑均表現(xiàn)活躍,引起受侵染的植株根部IAA 和CTK 含量顯著上升,IAA 水平的上升可導(dǎo)致植株的細(xì)胞壁松弛、細(xì)胞伸長,最終可造成植株根部形成腫瘤。Xu 等對接種根腫菌后的甘藍(lán)型油菜研究發(fā)現(xiàn),接菌后3 d 和7 d 植株根部游離的IAA 水平提高,同時與IAA 合成相關(guān)的一些基因在根腫菌侵染早期被誘導(dǎo)表達(dá),另外,向接種后的植株噴施外源IAA 可顯著提高根毛的侵染率,而阻礙IAA傳導(dǎo)途徑可以有效減輕植株發(fā)病癥狀。

3.3 其他抗性機(jī)制在根腫病反應(yīng)中的研究

近年來,伴隨著一些高通量測序技術(shù)的發(fā)展與應(yīng)用,為研究十字花科作物根腫菌侵染過程中涉及防御反應(yīng)相關(guān)的代謝和信號網(wǎng)絡(luò)應(yīng)答機(jī)制提供了有效措施。譚翀通過對大白菜根部接種前后差異基因的表達(dá)分析發(fā)現(xiàn),根腫菌侵染后的根部與胼胝質(zhì)合成相關(guān)的基因均下調(diào)表達(dá),與胼胝質(zhì)降解相關(guān)的基因上調(diào)表達(dá),說明胼胝質(zhì)可能參與大白菜響應(yīng)根腫菌的侵染過程。最近,Chen 等對大白菜近等基因系進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,發(fā)現(xiàn)PAMPs、鈣離子泵入、激素信號、PR、轉(zhuǎn)錄因子及細(xì)胞壁重塑等相關(guān)基因在不同抗感材料之間呈現(xiàn)差異表達(dá),說明這些基因在根腫菌侵染初級階段的寄主-病原菌互作過程中起作用。Yuan 等對根腫菌侵染不同時期的大白菜進(jìn)行比較轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn)與防御酶、生長素、病程相關(guān)蛋白、抗病蛋白、細(xì)胞壁組織與生物合成、和轉(zhuǎn)錄因子相關(guān)的基因與根腫病抗性有關(guān)。Zhang 等對抗病甘藍(lán)野生種及感病青花菜進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測序,結(jié)果顯示,寄主對根腫菌的防御反應(yīng)在早期被誘導(dǎo)且相關(guān)途徑在侵染14 d 時受到抑制,與細(xì)胞壁成分、硫甙葡萄糖苷合成及植物信號轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)的基因均在侵染早期表達(dá),且大多數(shù)基因在抗病材料中上調(diào)表達(dá)。Verma 等利用miRNA 測序手段對甘藍(lán)型油菜根腫病的發(fā)生過程進(jìn)行了研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)miRNA 的靶基因主要涉及轉(zhuǎn)錄因子、激素相關(guān)基因及植物防御反應(yīng)相關(guān)基因等。

4 展 望

十字花科作物作為我國栽培總量最大的蔬菜和油料作物,高發(fā)的根腫病嚴(yán)重影響著產(chǎn)量。因此,選育抗病品種及探索抗病機(jī)制顯得尤為重要。中國現(xiàn)階段白菜類蔬菜、甘藍(lán)類蔬菜、甘藍(lán)型油菜、蘿卜育種中的基礎(chǔ)研究環(huán)節(jié)相對薄弱,除了在大白菜中根腫病抗性基因報道的較多,在甘藍(lán)和油菜中抗根腫病基因研究目前仍然還是處于QTL 初級定位階段,還未有明確的基因被報道,根腫病抗性的分子機(jī)制尚不完全清楚。隨著生物技術(shù)的發(fā)展,利用生物技術(shù)手段選育抗病品種及解析抗病機(jī)制已經(jīng)成為今后的研究趨勢,為在基因水平上認(rèn)識植物與根腫菌的互作機(jī)制創(chuàng)造了有利條件,目前已有很多研究人員通過組學(xué)等測序手段研究預(yù)測了根腫菌侵染后植物體內(nèi)基因或蛋白間可能的調(diào)控機(jī)制,但是關(guān)于這些機(jī)制研究的內(nèi)容還是處于初級階段,關(guān)于功能的研究較薄弱。因此,需進(jìn)一步加大對基礎(chǔ)研究的投入力度,建立更準(zhǔn)確的十字花科作物根腫病生理小種的鑒別體系,明確國內(nèi)病原生理小種的分布情況。同時結(jié)合高通量測序技術(shù)、數(shù)量性狀定位及生物信息學(xué)分析手段,加快對抗性基因的克隆及功能研究。

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