王宇翔,吳夏泠,張文彬
(1北京分子科學(xué)國家研究中心,高分子化學(xué)與物理教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,軟物質(zhì)科學(xué)與工程中心,北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院,北京 100871;2集美大學(xué)海洋食品與生物工程學(xué)院,福建 廈門 361021)
自1920年Staudinger首次提出高分子的概念以來,高分子已成為材料領(lǐng)域不可或缺的組成部分,逐漸建立了高分子鏈?zhǔn)浇Y(jié)構(gòu)的認(rèn)知范式,并從中衍生出兩條截然不同的發(fā)展路徑(分別是以聚烯烴為范例的合成高分子工業(yè)和以核酸、蛋白質(zhì)為范例的分子生物學(xué)),對(duì)人類社會(huì)發(fā)展持續(xù)產(chǎn)生著重要、廣泛而深遠(yuǎn)的影響。高分子結(jié)構(gòu)的特殊性來自于其隨著分子量增大、分子結(jié)構(gòu)復(fù)雜化以及多重分子鏈間次級(jí)相互作用而產(chǎn)生的涌現(xiàn)性能,使其不僅可發(fā)生分子鏈纏結(jié),帶來黏度、彈性等宏觀性能的改變,還可通過改變序列成為信息的載體,并經(jīng)由折疊實(shí)現(xiàn)多種多樣的功能[1]。線性高分子的交聯(lián)進(jìn)一步形成網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),帶來更為豐富的材料性質(zhì),是包括塑料、橡膠、凝膠等多種高分子材料的實(shí)際存在形式。至今,人們已經(jīng)發(fā)展了多種策略,以精準(zhǔn)控制從分子參數(shù)(如長度、序列、立體化學(xué)、拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)等)到網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)(如互穿網(wǎng)絡(luò)、雙網(wǎng)絡(luò)、納米復(fù)合結(jié)構(gòu)等)的高分子多級(jí)結(jié)構(gòu),在相關(guān)材料研發(fā)上取得了長足的進(jìn)展,促進(jìn)了對(duì)結(jié)構(gòu)-性能關(guān)系的理解。
近年來,合成生物學(xué)的發(fā)展又為材料科學(xué)領(lǐng)域增添了新的活力。合成生物學(xué)旨在編輯活體生物以實(shí)現(xiàn)用戶功能導(dǎo)向的目標(biāo)。類似于計(jì)算機(jī)編程,合成生物學(xué)通過編輯DNA、蛋白質(zhì)來改變亞細(xì)胞層次甚至個(gè)體層次的生命活動(dòng)。2000年,第1個(gè)基因?qū)用娴那袚Q開關(guān)[2]和抑制器元件[3]設(shè)計(jì)成功,揭開了合成生物學(xué)的序幕。此后,研究者們陸續(xù)實(shí)現(xiàn)了對(duì)原核[4]和真核細(xì)胞[5]基因回路的編輯,并逐步走向整個(gè)基因組的設(shè)計(jì)和合成[6]。而類似CRISPR/Cas9等先進(jìn)的基因編輯技術(shù)則使得其應(yīng)用變得更加簡單和直接[7]。近年來,結(jié)合計(jì)算機(jī)輔助蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)的進(jìn)展,研究者們又進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)了從用戶需求出發(fā)的、基于蛋白質(zhì)的邏輯回路的從頭設(shè)計(jì)[8],堪稱合成生物學(xué)的又一個(gè)里程碑。這些工程化策略使得人們可以賦予細(xì)胞特定的材料屬性,發(fā)展相應(yīng)的生物活體功能材料。2014年,Lu團(tuán)隊(duì)[9]構(gòu)建了工程化細(xì)菌與菌毛蛋白CsgA納米纖維組裝體相融合的活體材料,可通過融合表達(dá),方便地調(diào)控活體材料的性能,并和非生物組分組裝,實(shí)現(xiàn)器件化。這打開了材料科學(xué)嶄新的一頁。相比于傳統(tǒng)材料,活體材料最大的優(yōu)勢(shì)在于其兼具生命的特征和材料的功能,不僅可自我生長、自我成形、具有生命體系的諸多復(fù)雜功能(如酶活性),還具有對(duì)環(huán)境響應(yīng)、自我修復(fù)、易與各種加工技術(shù)(3D打印、器件化)整合等優(yōu)勢(shì)。但是,目前多數(shù)活體材料工作都集中在展示其生命特征上,而殊少關(guān)注其材料屬性,尤其在力學(xué)性能方面遠(yuǎn)遜于傳統(tǒng)高分子材料。要在這方面取得突破就必須借鑒材料科學(xué)(尤其是高分子科學(xué))幾十年來的豐碩成果。
2021年6月8日,中國科學(xué)院深圳技術(shù)研究院的戴卓君研究員團(tuán)隊(duì)和杜克大學(xué)的游凌沖團(tuán)隊(duì)在《自然·通訊》上合作發(fā)表了以“Living fabrication of functional semi-interpenetrating polymeric materials”為題的研究。該研究以殼聚糖微凝膠為基質(zhì)材料,設(shè)計(jì)包裹含有工程化大腸桿菌的生物活體功能材料,可自發(fā)表達(dá)、原位形成具有錨定功能蛋白的半互穿網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)(圖1)。當(dāng)功能蛋白為β-內(nèi)酰胺酶(Bla)時(shí),該活體材料可保護(hù)小鼠在抗生素?cái)_動(dòng)下維持較為穩(wěn)定的腸道菌群組成,并有效減少給藥次數(shù)。
圖1 半互穿網(wǎng)絡(luò)活性材料的制備和應(yīng)用Fig.1 Preparation and application of semi-interpenetrating network living materials
在材料設(shè)計(jì)方面,該工作將高分子科學(xué)的半互穿網(wǎng)絡(luò)理念成功引入活體材料中,其第一網(wǎng)絡(luò)由三聚磷酸鈉和殼聚糖通過靜電作用交聯(lián)所得,而第二互穿組分則由工程化細(xì)菌產(chǎn)生和釋放的反應(yīng)性功能蛋白原位聚合而得。不同于傳統(tǒng)高分子材料的加工制備,該工作的難點(diǎn)在于如何原位實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)單體的可控釋放與有效聚合。研究者將具有密度誘導(dǎo)細(xì)菌自主裂解特點(diǎn)的ePop回路引入該體系,通過表達(dá)一種來源于噬菌體的、可阻礙其細(xì)胞壁合成的E蛋白毒素,使得當(dāng)細(xì)菌密度生長至一定水平時(shí),即自發(fā)裂解、釋放出蛋白質(zhì)單體。同時(shí),研究者選用可基因編碼的蛋白質(zhì)反應(yīng)對(duì)諜標(biāo)簽(SpyTag)和諜捕手(SpyCatcher)分別修飾蛋白質(zhì)單體,使其在釋放后局部濃度較高的情況下自發(fā)聚合,通過與第一組分的互穿,一方面實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)單體的固定化,一方面促進(jìn)了其力學(xué)性能的提升,抑制了微凝膠在細(xì)菌生長過程中的塌縮。值得注意的是,半互穿網(wǎng)絡(luò)的儲(chǔ)能模量能達(dá)到2 kPa,遠(yuǎn)高于非互穿凝膠網(wǎng)絡(luò)以及單純的諜網(wǎng)絡(luò)水凝膠[10]或殼聚糖微凝膠。
在材料功能方面,該工作將可降解β-內(nèi)酰胺類抗生素的Bla作為功能蛋白質(zhì)單體融入半互穿網(wǎng)絡(luò),以期保護(hù)腸道菌群組成免受抗生素?cái)_動(dòng)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,半互穿網(wǎng)絡(luò)的存在對(duì)于Bla的酶活具有非常重要的保護(hù)作用。得益于工程菌具有不斷產(chǎn)生Bla的功能以及互穿網(wǎng)絡(luò)對(duì)酶穩(wěn)定性的提升,在體外實(shí)驗(yàn)中,即使在抑制劑長時(shí)間作用下,其酶活性依然可在撤除抑制劑后快速恢復(fù);在體內(nèi)實(shí)驗(yàn)中,該活體材料被灌胃輸送至小鼠腸道內(nèi),在靜脈輸入抗生素后,該小鼠腸道的菌群總量和菌群結(jié)構(gòu)整體上展現(xiàn)出比對(duì)照組(無材料組、無互穿網(wǎng)絡(luò)組以及無細(xì)胞組)更加顯著的穩(wěn)定性,較好地解決了Bla易受到環(huán)境影響而失活的問題。
這一研究成果為生物活體功能材料的構(gòu)建提供了新的思路,提示活體材料的發(fā)展應(yīng)多多借鑒和應(yīng)用傳統(tǒng)的高分子材料工程策略。在該工作中,高分子互穿網(wǎng)絡(luò)通過機(jī)械互鎖限制了兩個(gè)組分的相對(duì)運(yùn)動(dòng)趨勢(shì),不僅使其兼具每個(gè)組分獨(dú)特的性能優(yōu)勢(shì),如環(huán)境響應(yīng)性與特定功能,更達(dá)到了提高材料力學(xué)性能、改善其耐受性的效果。事實(shí)上,高分子網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)調(diào)控還包括雙網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)、化學(xué)-物理交聯(lián)協(xié)同、滑環(huán)交聯(lián)點(diǎn)、納米復(fù)合結(jié)構(gòu)等諸多策略,均有其獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。例如,雙網(wǎng)絡(luò)水凝膠通過第一網(wǎng)絡(luò)的斷裂作為“犧牲鍵”耗散能量,而通過稀疏交聯(lián)的高分子量第二網(wǎng)絡(luò)維持其整體性,從而協(xié)調(diào)兩個(gè)組分,實(shí)現(xiàn)大幅增韌、有效提升力學(xué)性能[11]。類似地,化學(xué)-物理交聯(lián)協(xié)同的網(wǎng)絡(luò)中,動(dòng)態(tài)的物理交聯(lián)在外力下不斷斷開并重新形成,高效耗散能量,而化學(xué)交聯(lián)則維持了整體結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性[12]?;h(huán)交聯(lián)點(diǎn)則是獨(dú)特的可變交聯(lián)點(diǎn)結(jié)構(gòu),可以像滑輪一樣導(dǎo)致網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的重組,重新分散應(yīng)力,帶來增韌的效果[13]。引入納米材料作為多價(jià)交聯(lián)點(diǎn)則可以制備納米復(fù)合物,大幅提高材料的力學(xué)性能[14]。首先,靈活利用這些策略可有效改善活體材料的力學(xué)性能和耐用性。其次,雖然活體材料的一個(gè)亮點(diǎn)在于可自發(fā)成型,但如果它兼容目前已經(jīng)非常成熟的各種高分子加工方案,不失為更為便捷的應(yīng)用途徑。最后,生物體系所能夠應(yīng)用和提供的大分子構(gòu)建相對(duì)有限,為了拓展活體材料的功能多樣性,必須向傳統(tǒng)高分子化學(xué)學(xué)習(xí),引入并整合非天然的高分子組分。然而,在活體材料中應(yīng)用高分子的相關(guān)策略并非易事,需要使用合成生物學(xué)的語言和工具[15]。例如,要控制單體的釋放和聚合,在這里就不能簡單套用傳統(tǒng)的高分子聚合反應(yīng),而是要用到新的、可基因編碼的蛋白質(zhì)偶聯(lián)化學(xué)(如諜化學(xué));而要協(xié)調(diào)各個(gè)過程的時(shí)空次序,則不能簡單通過外部操作的時(shí)序性來實(shí)現(xiàn),更多應(yīng)該是通過程序化控制基因回路來實(shí)現(xiàn)。這樣的交叉融合不僅僅是理念上的,還需要研究工具、研究方法以及具體基元和分子模塊上的融會(huì)貫通(圖2)。
圖2 合成生物學(xué)與材料科學(xué)的交叉與融合Fig.2 Intersection and integration between materials science and synthetic biology
總之,合成生物學(xué)與材料科學(xué)尤其是高分子科學(xué)的交叉融合是大勢(shì)所趨。傳統(tǒng)高分子是以追求靜態(tài)結(jié)構(gòu)的極限性能為目標(biāo),生命體是以追求特定環(huán)境壓力下的最適生存為目標(biāo),而活體材料有望結(jié)合兩者的主要優(yōu)勢(shì),帶來材料科學(xué)的變革。雖然生命體總是將生存作為第一優(yōu)先權(quán),總是要在滿足這個(gè)要求的前提下來實(shí)現(xiàn)所有其他的功能屬性,平添了不少限制,但同時(shí)也帶來了包括自修復(fù)性、可再生性、超高活性、功能多樣性等諸多優(yōu)勢(shì)。生命體本身也在進(jìn)化過程中形成許多的活體功能材料。天然活體材料的成功啟示我們:材料科學(xué)的發(fā)展應(yīng)借鑒這些生命特征,不僅要注重單一的材料性質(zhì),還要追求多組分體系中復(fù)雜的相互作用網(wǎng)絡(luò)所帶來的涌現(xiàn)性質(zhì)。毫不夸張地說,生物活體功能材料既是材料在人類智慧出現(xiàn)之前的自然選擇,也是人造材料的理想未來。它既是起源,也是未來。為了更好地發(fā)展生物活體功能材料,我們認(rèn)為應(yīng)著重:①通過發(fā)展新穎的工具,融合合成生物學(xué)和高分子科學(xué)的理念和基元,廣開思路,拓展現(xiàn)有的研究范式與思維;②仔細(xì)甄別兩個(gè)體系的優(yōu)勢(shì)和劣勢(shì),設(shè)計(jì)可同時(shí)發(fā)揮兩者長處的體系,將惰性成分和活性成分融合成為一個(gè)密不可分的功能整體;③針對(duì)特定應(yīng)用場(chǎng)景,展示其“殺手锏”級(jí)應(yīng)用。其中,蛋白質(zhì)作為生命中心法則中功能的主要承載者,也是活體材料的重要主體。以蛋白質(zhì)為核心,結(jié)合蛋白質(zhì)工程,有望擺脫傳統(tǒng)天然蛋白質(zhì)作為材料的局限性,既可詮釋序列、結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系,又有望實(shí)現(xiàn)目的導(dǎo)向的可設(shè)計(jì)性,尋找到合適的切入點(diǎn),迅速取得突破。合成生物學(xué)與材料科學(xué)在現(xiàn)階段的諸多不同恰恰為兩者在未來的合作和融合提供了廣闊的發(fā)展空間。