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腦膜炎敗血伊麗莎白菌耐藥性的研究進(jìn)展

2022-08-30 07:18:18巫祺樂方子璇袁舒穎陳妍雯陳力孫桂芹
微生物與感染 2022年1期
關(guān)鍵詞:內(nèi)酰胺酶喹諾酮類藥物

巫祺樂,方子璇,袁舒穎,陳妍雯,陳力,孫桂芹

1. 浙江中醫(yī)藥大學(xué)醫(yī)學(xué)技術(shù)與信息工程學(xué)院,浙江 杭州 310053; 2. 復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院教育部、衛(wèi)健委、醫(yī)科院醫(yī)學(xué)分子病毒學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,上海 200032

腦膜炎敗血伊麗莎白菌(Elizabethkingiameningosepticum,EM),又稱腦膜炎膿毒性黃桿菌(Chryseobacteriummeningosepticum,CM或Flavobacteriummeningosepticum,F(xiàn)M),2005年Kim等[1]將EM從黃桿菌屬重新劃分至伊麗莎白菌屬,并將其正式更名為EM。該菌是非發(fā)酵革蘭陰性桿菌,無鞭毛、莢膜,其生化特征主要表現(xiàn)為過氧化氫酶、氧化酶和吲哚陽(yáng)性[2]。EM廣泛存在于自然界中,多見于土壤、水源以及醫(yī)院環(huán)境[3],是引起院內(nèi)侵入性感染的重要病原體[4]。近年來,EM院內(nèi)感染呈上升趨勢(shì)[5],在全球范圍散發(fā)[6-8]。有研究表明,EM呈多重耐藥,且不同地區(qū)分離得到的EM耐藥性存在差異[9-11]。因此,加強(qiáng)EM耐藥性的檢測(cè)并分析其耐藥機(jī)制,對(duì)選擇臨床用藥和預(yù)防耐藥菌株出現(xiàn)具有重要意義。本研究收集整理國(guó)內(nèi)外關(guān)于EM耐藥性的報(bào)道,就其耐藥現(xiàn)狀和耐藥機(jī)制作綜述。

1 EM的耐藥現(xiàn)狀

EM對(duì)大多數(shù)抗菌藥物具有天然抵抗力,給臨床治療帶來極大困難。該菌對(duì)用于治療革蘭陰性菌感染的抗菌藥物,如β-內(nèi)酰胺類、氨基糖苷類、四環(huán)素類等具有較高耐藥率,且不同地區(qū)分離得到的EM存在耐藥性差異(見表1)。

本研究收集中國(guó)北京、上海、浙江以及美國(guó)、法國(guó)、印度等地區(qū)關(guān)于EM耐藥性的報(bào)道,根據(jù)抗菌藥物分類,對(duì)其耐藥性數(shù)據(jù)進(jìn)行整理,結(jié)果詳見表1。大部分地區(qū)分離的EM對(duì)β-內(nèi)酰胺類、氨基糖苷類抗菌藥物的耐藥率達(dá)到或接近100%;對(duì)β-內(nèi)酰胺酶抑制劑復(fù)合物哌拉西林/他唑巴坦敏感率為70%左右,但少數(shù)地區(qū)如中國(guó)臺(tái)州[20-22]、美國(guó)[30]分離的EM對(duì)β-內(nèi)酰胺酶抑制劑復(fù)合物哌拉西林/他唑巴坦耐藥。大部分地區(qū)分離的EM對(duì)氟喹諾酮類藥物較為敏感,耐藥率在20%左右,而中國(guó)的北京[9]、寧波[17]、臺(tái)州[20-22]、湖南[26]以及韓國(guó)等地區(qū)[11]的耐藥率則超過50%。

替加環(huán)素是一種新型的四環(huán)素類抗菌藥物,可與細(xì)菌核糖體30S亞單位結(jié)合,阻止肽鏈延長(zhǎng)[28]。根據(jù)表1的統(tǒng)計(jì)結(jié)果,EM的臨床分離株對(duì)替加環(huán)素有較好的敏感性,敏感率約為60%,但中國(guó)湖南[26]、沙特阿拉伯[29]等地區(qū)已出現(xiàn)對(duì)替加環(huán)素耐藥的EM菌株,耐藥率在70%以上。另外,多黏菌素被認(rèn)為是革蘭陰性菌治療的最后一道防線,主要作用于細(xì)菌細(xì)胞膜,使胞內(nèi)重要物質(zhì)外漏,從而起到抗菌作用[30],然而各個(gè)地區(qū)EM對(duì)多黏菌素的耐藥率為100%(見表1)。

2 EM耐藥機(jī)制

不同地區(qū)分離的EM具有不同的耐藥性,存在多種耐藥機(jī)制,如藥物滅活酶的產(chǎn)生、藥物作用靶位基因的改變、生物膜的形成、外排系統(tǒng)過表達(dá)等。本研究收集了已報(bào)道的EM耐藥基因情況,并進(jìn)行分析,結(jié)果如表2所示。

2.1 產(chǎn)生藥物滅活酶

2.1.1 產(chǎn)生藥物水解酶β-內(nèi)酰胺類藥物是臨床常用的抗生素,根據(jù)氨基酸序列,可將β-內(nèi)酰胺酶分為A、B、C和D 4類[54]。目前研究表明,EM可以產(chǎn)超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(extended-spectrum β-lactamases,ESBLs),為A類β-內(nèi)酰胺酶,主要介導(dǎo)EM對(duì)頭孢菌素、青霉素類藥物的抗性[35, 39]。另外,EM還能產(chǎn)B類β-內(nèi)酰胺酶,又稱金屬β-內(nèi)酰胺酶(metallo-β-lactamase,MBL),主要介導(dǎo)EM對(duì)碳青霉烯類藥物耐藥[39]。

EM產(chǎn)生的ESBLs主要有CME(Chryseo~bacteriummeningosepticumESBLs)和TLA-1。有報(bào)道發(fā)現(xiàn),EM產(chǎn)生的CME(CME-1、CME-2)可以介導(dǎo)耐藥[34-35]。另外,Chen等[31]通過全基因組測(cè)序檢測(cè)到EM中含有編碼A類β-內(nèi)酰胺酶的tla-1。有研究表明,TLA-1的水解能力與CME-1相當(dāng),對(duì)頭孢他啶、頭孢噻肟有良好的水解活性[36]。

EM產(chǎn)MBL有BlaB和GOB兩種型別。blaB和blaGOB耐藥基因位于染色體上,無法跨物種傳播,且前者活性高于后者[39],二者可在EM中同時(shí)存在。如上海的部分EM菌株不僅同時(shí)含有blaB和blaGOB,還含有cme[13],而安徽部分EM只含blaB[25],杭州部分EM只含blaGOB[37](見表2)。另有研究表明,EM產(chǎn)生的BlaB還能夠水解β-內(nèi)酰胺酶抑制劑,包括他唑巴坦等[31, 55]。

表2 不同國(guó)家/地區(qū)已報(bào)道的EM耐藥相關(guān)基因統(tǒng)計(jì)Tab.2 Statistics of resistance-related genes of Elizabeth meningitidis reported in different countries/regions

2.1.2 產(chǎn)生藥物修飾酶產(chǎn)生藥物修飾酶是EM對(duì)氨基糖苷類藥物耐藥的重要原因,這些修飾酶可以使氨基糖苷類藥物的一些結(jié)構(gòu)被修飾、滅活,或者抑制與其他類藥物的協(xié)同作用[56]。Chen等[31]報(bào)道,EM含編碼乙?;D(zhuǎn)移酶(aminoglycoside acetyltransferases,AACs)的相關(guān)基因aac(6′)-Iaj,可以編碼乙酰基轉(zhuǎn)移酶,乙?;龖c大霉素以外的氨基糖苷類藥物[42],從而降低藥物的活性。EM中還檢測(cè)到了編碼核苷酸轉(zhuǎn)移酶(aminoglycoside nucleotidyltranferases,ANTs)的ant(6)基因,介導(dǎo)EM對(duì)鏈霉素耐藥[43]。

2.1.3 產(chǎn)生其他酶類產(chǎn)生二氫葉酸合成酶(Sul)和二氫葉酸還原酶(Dfr)可能導(dǎo)致EM對(duì)磺胺類藥物如復(fù)方新諾明的耐藥[44-45]。有研究報(bào)道,對(duì)復(fù)方新諾明耐藥的EM中,可以檢測(cè)到合成上述2種酶的基因sul1、sul2,且在sul2陽(yáng)性的菌株中,檢測(cè)到一株含有編碼二氫葉酸還原酶基因(dfrA12)的EM[44],而其余對(duì)復(fù)方新諾明敏感的分離株中未檢測(cè)到上述基因。

2.2 藥物作用靶位的改變

氟喹諾酮類藥物是治療EM感染的候選藥物[10, 31],然而北京[9]、臺(tái)州[20-22]、湖南[26]等地已出現(xiàn)耐藥菌株(見表1)。Jian等[46]研究報(bào)道,EM中DNA促旋酶的GyrA亞基末端,常發(fā)生Ser83Ile取代,從而介導(dǎo)其對(duì)氟喹諾酮類藥物耐藥。除發(fā)生Ser83Ile突變外,發(fā)生Ser83Arg突變也會(huì)提高EM對(duì)氟喹諾酮類抗生素的耐藥率[13]。除此之外,Jian等[46]認(rèn)為,gyrB、parC、parE保守區(qū)域的突變也可能引起EM對(duì)氟喹諾酮類藥物耐藥。

2.3 主動(dòng)外排機(jī)制

細(xì)菌對(duì)抗菌藥物的外排機(jī)制是造成耐藥的重要原因之一[57]。研究報(bào)道,EM的外排泵主要包括RND家族(resistance nodulation division family)、MFS家族(major facilitator super family)、MATE家族(multidrug and toxic compound extrusion)和ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(ATP-binding cassette)[58-60]。

Kukutla等[58]通過比較伊麗莎白菌屬基因組序列,發(fā)現(xiàn)伊麗莎白按蚊中37個(gè)編碼RND轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的基因與EM有83.5%的同一性,以及44個(gè)編碼MFS超家族的基因與EM有73.7%的同一性,可以非特異性排出β-內(nèi)酰胺類和氟喹諾酮類藥物。Chen等[31]在2015年—2016年美國(guó)密歇根州暴發(fā)EM感染的病人身上分離得到3株菌株,并從中檢測(cè)出18個(gè)編碼耐多藥外排泵的基因,包括ceoB,msrB,adeG等。

Agrawal等[49]、Liang等[59]在EM中檢測(cè)出耐多藥外排泵相關(guān)蛋白。Liang等[59]在標(biāo)準(zhǔn)菌株(ATCC 13253)中同時(shí)檢測(cè)到MATE家族蛋白、ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(CmeB蛋白)以及RND家族蛋白(AcrB蛋白)。Agrawal等[49]通過蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)研究發(fā)現(xiàn),EM中含有ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白以及TetR/AcrR家族(TetR/AcrR family),賦予EM對(duì)四環(huán)素和其他有毒化合物的抗性(見表2)。

2.4 外膜蛋白的改變

外膜蛋白(outer memberain protein,OMP)是革蘭陰性細(xì)菌運(yùn)輸抗生素的重要通道[61]。Agrawal等[49]在EM中檢出OmpA和OmpW。OmpA是細(xì)菌中高度保守的一種β桶型孔蛋白,有報(bào)道稱該蛋白在鮑曼不動(dòng)桿菌中可以與內(nèi)膜外排泵系統(tǒng)耦合(如MFS超家族、RND家族),將抗生素從質(zhì)膜排出[50]。OmpW也是一種β桶型孔蛋白,在阪崎腸桿菌中,OmpW的表達(dá)可導(dǎo)致硫酸新霉素、氨芐西林耐藥[51]。

3 討論與展望

自20世紀(jì)50年代腦膜炎敗血伊麗莎白菌引發(fā)腦膜炎被首次報(bào)道以來[1],中國(guó)、美國(guó)、英國(guó)、法國(guó)、印度等國(guó)家都有由該菌引起的新生兒腦膜炎、菌血癥、肺炎、心內(nèi)膜炎等疾病的報(bào)道,EM已成為醫(yī)院感染的重要病原菌之一[4]。因EM呈多重耐藥,給臨床治療特別是藥物選擇帶來一定困難,故受到醫(yī)務(wù)人員的重視。

EM對(duì)臨床常用于治療革蘭陰性菌的抗菌藥物天然耐藥,如碳青霉烯類、氨基糖苷類、β-內(nèi)酰胺類,耐藥率幾乎達(dá)100%;多黏菌素作為治療革蘭陰性菌的最后一道防線[30],EM對(duì)其耐藥率也達(dá)100%(見表1)。因此,臨床用藥時(shí)應(yīng)盡量避免使用上述藥物。而大部分地區(qū)EM對(duì)氟喹諾酮類、β-內(nèi)酰胺酶抑制劑復(fù)合物、替加環(huán)素等藥物有較好的敏感性,可將其作為臨床治療EM感染的候選藥物。目前已有研究報(bào)道,使用氟喹諾酮類藥物可提高感染EM患者的生存率[62];且通過替加環(huán)素與左氧氟沙星聯(lián)合用藥,能夠成功治療EM引起的敗血癥[63]。但值得注意的是,目前EM被檢出含耐氟喹諾酮類、β-內(nèi)酰胺酶抑制劑復(fù)合物、替加環(huán)素等藥物的基因。因此,在臨床治療用藥時(shí),應(yīng)根據(jù)實(shí)驗(yàn)室藥敏結(jié)果,選擇適當(dāng)?shù)目股?,同時(shí)可考慮聯(lián)合用藥。

EM的多重耐藥,與其具有多種耐藥基因相關(guān),從而具有多種耐藥機(jī)制。目前,國(guó)內(nèi)外對(duì)EM耐藥機(jī)制的研究主要集中于EM能產(chǎn)生MBL和ESBLs(主要為CME型),且不同地區(qū)分離的EM所含有的基因型不同[13, 25, 37],而關(guān)于EM其他耐藥機(jī)制的研究尚待進(jìn)一步深入。有學(xué)者發(fā)現(xiàn),EM能同時(shí)含有編碼MBL和ESBLs的基因[13],也能僅含blaB或blaGOB中的一種[25, 37]。Chang等[41]提出,EM應(yīng)同時(shí)具有blaB和blaGOB,若將僅含其中一種基因的菌種也鑒定為EM,則可能會(huì)將黃桿菌屬的細(xì)菌誤判為EM,這也表明EM的快速鑒定有待改進(jìn)。

EM的快速準(zhǔn)確鑒定和菌株溯源對(duì)其預(yù)防和控制具有重要意義。但由于數(shù)據(jù)庫(kù)尚未建立,伊麗莎白菌屬中其他菌種容易被誤認(rèn)為EM[64],因此須推動(dòng)高通量測(cè)序、質(zhì)譜技術(shù)在臨床感染性疾病中的應(yīng)用,從而加強(qiáng)EM與其他伊麗莎白菌屬的精準(zhǔn)鑒別,以提高EM的臨床檢出率。

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