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桑天牛纖維素酶編碼基因的克隆及分泌表達(dá)

2022-08-26 09:02潘宇杰梁笑玲張楚玥陳少珍林曉玲李虹儀
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2022年16期
關(guān)鍵詞:葡聚糖纖維素克隆

張 茂, 潘宇杰, 梁笑玲, 張楚玥, 陳少珍, 林曉玲, 李虹儀

(韶關(guān)學(xué)院英東生物與農(nóng)業(yè)學(xué)院,廣東韶關(guān) 512005)

飼料原料的短缺問題一直影響著畜牧業(yè)的發(fā)展,成為我國畜牧業(yè)面臨的一大挑戰(zhàn),因此需要不斷開發(fā)飼料資源。纖維素是自然界年產(chǎn)量巨大的可再生資源,然而這些寶貴的纖維素資源并沒有被有效地利用。此外,豬和家禽日糧中也存在大量纖維素因含有非淀粉多糖(non starch polysaccharides,NSP)等抗?fàn)I養(yǎng)因子而降低了其他營養(yǎng)物質(zhì)的吸收利用率而不能被畜禽利用。飼用酶制劑被認(rèn)為是目前能有效解決養(yǎng)殖領(lǐng)域中飼料安全、飼料原料缺乏的新型飼料添加劑。為了促進(jìn)不同類型飼糧纖維的合理開發(fā)和利用,可通過添加纖維素酶來提高動(dòng)物機(jī)體對(duì)飼糧纖維的消化利用率,改善動(dòng)物腸道健康,提高動(dòng)物生產(chǎn)性能,以緩解飼料資源危機(jī)。纖維素酶來源有細(xì)菌、真菌、昆蟲等,同時(shí)也有大量不同來源的基因被克隆,如芽孢桿菌、木霉、青霉、牛瘤胃微生物、天牛、白蟻、白蟻體內(nèi)細(xì)菌、福壽螺等。動(dòng)物源(如天牛、白蟻、福壽螺等)消化道分泌的纖維素酶對(duì)纖維素展現(xiàn)出較好的水解能力,其應(yīng)用亦受到廣泛關(guān)注。桑天牛消化道內(nèi)源表達(dá)的纖維素酶在分解木質(zhì)纖維素方面具有較高的活性,可進(jìn)一步將其研究應(yīng)用于飼料資源的開發(fā)。本試驗(yàn)以桑天牛為來源,克隆桑天牛腸道纖維素酶基因,構(gòu)建體外表達(dá)載體并在PK15細(xì)胞中進(jìn)行表達(dá),以期得到高活性的纖維素酶基因用于酶制劑生產(chǎn)或轉(zhuǎn)基因研究,拓寬畜牧業(yè)的飼料來源。

1 材料與方法

1.1 主要試劑

TRIzol試劑、反轉(zhuǎn)錄試劑盒PrimeScriptRT reagent Kit with gDNA Eraser、LA酶、pMD18-T載體、連接試劑盒DNA Ligation Kit Ver.2.1、限制性內(nèi)切酶(Ⅰ、Ⅰ)、DL 2000 DNA Marker、PCR檢測試劑Ex,均購自TaKaRa公司;膠回收Gel Extraction Kit D2500、質(zhì)粒提取Plasmid Mini Kit Ⅰ,均購自O(shè)mega公司;轉(zhuǎn)染試劑Lipofctamine、細(xì)胞培養(yǎng)試劑胎牛血清(FBS)、達(dá)爾伯克(氏)改良伊格爾(氏)(DMEM)培養(yǎng)基、磷酸鹽緩沖液(PBS),均購自Life公司;羧甲基纖維素鈉(CMC-Na)、-葡聚糖,均購自Sigma公司。PK15細(xì)胞、表達(dá)載體pCMS-EGFP于筆者所在實(shí)驗(yàn)室保存。試驗(yàn)于2017年5月至2020年12月在華南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院及韶關(guān)學(xué)院英東生物與農(nóng)業(yè)學(xué)院進(jìn)行。

1.2 引物設(shè)計(jì)

參考GenBank發(fā)布的桑天牛纖維素酶編碼基因(AY741064)、(AY451326)的序列,用DNAstar軟件進(jìn)行引物設(shè)計(jì),擴(kuò)增其cDNA序列(長度分別為711、720 bp),分別加入酶切位點(diǎn)Ⅰ、Ⅰ和Kozak序列,引物由深圳華大基因科技有限公司合成,引物序列見表1。

表1 纖維素酶基因擴(kuò)增引物序列信息

1.3 RT-PCR擴(kuò)增

將采集的桑天牛在超凈工作臺(tái)中的冰上分離出腸道組織,用TRIzol法提取腸道組織的總RNA,用PrimeScriptRT reagent Kit with gDNA Eraser進(jìn)行cDNA的合成,反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)條件:37 ℃ 15 min,85 ℃ 5 s,4 ℃保存。以cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,反應(yīng)體系:0.5 μL LA(5 U/μL),5 μL 10×LABuffer Ⅱ,8 μL dNTP Mixture,各1 μL上、下游引物,4 μL模板,加ddHO至50 μL。反應(yīng)條件:95 ℃ 3 min;95 ℃ 30 s,56 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,35個(gè)循環(huán);72 ℃ 10 min。反應(yīng)結(jié)束后用瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測。將PCR產(chǎn)物分別與 pMD18-T 進(jìn)行連接,然后進(jìn)行轉(zhuǎn)化,再將單克隆菌液送至測序公司測序,將測序結(jié)果與參考序列進(jìn)行比對(duì)分析,選擇無移碼、缺失、終止突變的克隆進(jìn)行后續(xù)試驗(yàn)。

1.4 酶切

分別以含有、基因的載體為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,然后用限制性內(nèi)切酶Ⅰ、Ⅰ分別對(duì)表達(dá)載體pCMS-EGFP及PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行酶切,酶切體系:5 μL 10×QuickCut Green Buffer,各2.5 μL QuickCutⅠ、Ⅰ,30 μL DNA,加ddHO至50 μL。37 ℃保溫1 h,酶切結(jié)束后用Gel Extraction Kit進(jìn)行目的片段的回收。

1.5 表達(dá)載體的構(gòu)建

將回收的載體片段pCMS-EGFP與插入基因DNA片段按照連接試劑盒(DNA Ligation Kit Ver.2.1)說明書比例混合制備成體積為10 μL 的DNA 溶液,加入等體積的10 μL Solution Ⅰ,充分混勻后于 16 ℃ 連接反應(yīng)30 min,反應(yīng)結(jié)束后將連接液進(jìn)行轉(zhuǎn)化、涂板,挑單克隆菌落進(jìn)行培養(yǎng),用通用引物T3、T7進(jìn)行菌液PCR,將PCR檢測陽性的菌液送往深圳華大基因科技有限公司測序,對(duì)測序結(jié)果進(jìn)行比對(duì),分析構(gòu)建質(zhì)粒的準(zhǔn)確性。

1.6 轉(zhuǎn)染PK15細(xì)胞

將PK15細(xì)胞在含有5% FBS、1%雙抗的DMEM中于37 ℃、5%CO培養(yǎng)箱中培養(yǎng),用Plasmid Mini Kit Ⅰ試劑盒抽提表達(dá)質(zhì)粒DNA,用Lipofectamine 3000 進(jìn)行轉(zhuǎn)染。將PK15細(xì)胞傳代于6孔板中,當(dāng)細(xì)胞匯合度約為60%時(shí)進(jìn)行轉(zhuǎn)染,分別用125 μL Opti-MEM將質(zhì)粒DNA(2.5 μg)和P3000Reagent(5 μL)進(jìn)行稀釋,然后將稀釋的DNA加入到稀釋的轉(zhuǎn)染試劑中輕輕混勻,在室溫下孵育15 min,將孵育好的混合物加入培養(yǎng)細(xì)胞中混勻。將構(gòu)建的表達(dá)載體及空載體分別轉(zhuǎn)染3次,轉(zhuǎn)染后48 h在熒光顯微鏡下觀察增強(qiáng)綠色熒光蛋白(EGFP)的表達(dá)情況。

1.7 纖維素酶活性的測定

培養(yǎng)72 h后收集細(xì)胞培養(yǎng)液作為粗酶液,采用二硝基水楊酸法(DNS法)在溫度為40 ℃、pH值為4.5和5.5的條件下測定其水解活性。以1% CMC-Na 溶液作為底物,并參考NY/T 912—2004《飼料添加劑 纖維素酶活力的測定 分光光度法》測定纖維素酶活性;以0.8%-葡聚糖溶液作為底物,并參考NY/T 911—2004《飼料添加劑-葡聚糖酶活性的測定 分光光度法》測定-葡聚糖酶活性,計(jì)算出不同纖維素酶基因表達(dá)的粗酶液的纖維素酶活性、-葡聚糖酶活性。

1.8 纖維素酶基因的RT-PCR檢測

用細(xì)胞刮片將PK15細(xì)胞刮下,用TRIzol法提取培養(yǎng)細(xì)胞總RNA并反轉(zhuǎn)錄成cDNA,用纖維素酶基因、擴(kuò)增引物分別進(jìn)行PCR擴(kuò)增,檢測纖維素酶基因在PK15細(xì)胞中的表達(dá)情況。

1.9 統(tǒng)計(jì)分析

酶活性以“平均值±標(biāo)準(zhǔn)差”表示,對(duì)不同纖維素酶基因(、)表達(dá)的酶活性進(jìn)行獨(dú)立樣本檢驗(yàn),用SPSS 19.0進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,<0.05表示差異顯著。

2 結(jié)果與分析

2.1 Agc Ⅰ、Agc Ⅱ基因的擴(kuò)增

以桑天牛腸道組織總RNA反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA為模板,經(jīng)PCR擴(kuò)增后進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測,結(jié)果獲得大小約為730、740 bp的預(yù)期條帶(圖1)。測序結(jié)果與目的序列進(jìn)行比對(duì)發(fā)現(xiàn),克隆的基因(711 bp)有4個(gè)堿基發(fā)生突變,基因(720 bp)發(fā)生了8個(gè)堿基突變,相似度分別為99.4%(基因)和98.3%(基因);基因編碼236個(gè)氨基酸,基因編碼239個(gè)氨基酸,氨基酸比對(duì)分析結(jié)果顯示,與目的基因氨基酸序列的相似度為100.0%,基因與目的基因氨基酸序列的相似度為99.6%,在第56位氨基酸位置上發(fā)生了S→N的突變,表明克隆的、基因沒有發(fā)生移碼、缺失、終止突變,可用于后續(xù)基因的表達(dá)試驗(yàn)。

2.2 表達(dá)載體的構(gòu)建

通過酶切、連接、轉(zhuǎn)化、菌液PCR檢測,構(gòu)建出包含纖維素酶基因的表達(dá)載體pCMS-、pCMS-(圖2),測序結(jié)果正確,表明表達(dá)載體構(gòu)建成功。

2.3 轉(zhuǎn)染后EGFP的表達(dá)

利用脂質(zhì)體將表達(dá)載體pCMS-EGFP、pCMS-和pCMS-分別轉(zhuǎn)染PK15細(xì)胞,48 h后于熒光顯微鏡下檢測轉(zhuǎn)染效果。結(jié)果(圖3)顯示,轉(zhuǎn)染的PK15細(xì)胞中均觀察到EGFP的表達(dá),視野中綠色熒光細(xì)胞數(shù)量較多,表明轉(zhuǎn)染效果良好。

2.4 纖維素酶活性的測定

利用DNS法在40 ℃測定纖維素酶基因表達(dá)粗酶液的活性。結(jié)果(圖4)顯示,以CMC-Na為底物,在pH值為5.5的環(huán)境下,、基因表達(dá)的纖維素酶活性分別為(0.09±0.01)、(0.24±0.02) U/mL;在pH值為4.5的環(huán)境下,纖維素酶活性分別為(0.07±0.00)、(0.20±0.01) U/mL。以-葡聚糖為底物時(shí),在pH值為5.5的環(huán)境下,、基因表達(dá)的-葡聚糖酶活性分別為(0.27±0.02)、(0.43±0.05) U/mL;在pH值為4.5的環(huán)境下,-葡聚糖酶活性分別為(0.05±0.00)、(0.16±0.01) U/mL??蛰d體轉(zhuǎn)染的PK15細(xì)胞培養(yǎng)液中未檢測到纖維素酶、-葡聚糖酶。此外, 在以-葡聚糖、CMC-Na為底物及不同pH值條件下,基因表達(dá)的纖維素酶、-葡聚糖酶的活性都顯著高于基因(<0.05)。

2.5 纖維素酶基因的表達(dá)

通過提取轉(zhuǎn)染后PK15細(xì)胞總RNA進(jìn)行RT-PCR檢測纖維素酶基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá),結(jié)果(圖5)顯示,在pCMS-、pCMS-轉(zhuǎn)染PK15細(xì)胞cDNA中擴(kuò)增出、基因目的條帶,而在轉(zhuǎn)染空載體pCMS-EGFP的陰性對(duì)照PK15細(xì)胞中未檢測到有纖維素酶基因表達(dá),表明纖維素酶基因在PK15細(xì)胞中表達(dá)成功。

3 討論

木質(zhì)纖維素是植物細(xì)胞壁的主要組成成分,是地球上最豐富的可再生生物質(zhì),占據(jù)了地球90%以上光合作用產(chǎn)生的生物質(zhì)資源,同時(shí)也是一種飼料資源。在單胃動(dòng)物日糧中添加纖維素酶可以有效消除飼料中纖維素的抗?fàn)I養(yǎng)作用、提高飼料營養(yǎng)物質(zhì)的消化利用率,同時(shí)還能開發(fā)飼料資源。為了緩解畜牧業(yè)飼料資源短缺的局面,近幾年來,大量木本飼料如桑葉、辣木、構(gòu)樹等被開發(fā)用于豬和家禽飼料中,這些飼料中纖維素含量過高不易消化,更需要添加高活力的纖維素酶來降解含量較高的木質(zhì)纖維素,以更好地將這些非常規(guī)飼料用于畜禽養(yǎng)殖中。桑天牛主要以樹木纖維素為食源,它主要依靠腸道和唾液中的各種纖維素酶、半纖維素酶的協(xié)同作用分解食物中的纖維素、半纖維素,桑天牛自身能夠分泌纖維素酶并能有效分解木質(zhì)纖維素,因此本研究選擇從桑天牛腸道組織中克隆纖維素酶基因。本試驗(yàn)成功從桑天牛腸道組織中克隆到了纖維素酶編碼基因、的cDNA序列,長度分別為711、720 bp,與目的基因序列相比,沒有發(fā)生移碼、缺失、終止突變,2個(gè)基因翻譯的氨基酸序列與目的基因序列相比相似度都在99%以上。此外,本研究克隆的纖維素酶基因的cDNA序列與基因的相似度為76%,同屬于GHF45家族,再次證明桑天牛自身消化道能夠分泌纖維素酶體系。

通過構(gòu)建表達(dá)載體分別轉(zhuǎn)染PK15細(xì)胞進(jìn)行表達(dá),在細(xì)胞培養(yǎng)液中檢測到了纖維素酶活力和-葡聚糖酶活性,表明克隆的纖維素酶基因兼具-葡聚糖酶活性。酶活性測定結(jié)果顯示,在40 ℃、pH值為4.5及pH值為5.5的條件下,纖維素酶基因表達(dá)的酶活性都優(yōu)于基因表達(dá)的酶活性,在pH值為5.5的條件下的酶活性優(yōu)于pH值為4.5的酶活性,所以基因可作為候選基因進(jìn)行下一步研究。此外,對(duì)PK15細(xì)胞進(jìn)行的RT-PCR檢測結(jié)果發(fā)現(xiàn)了纖維素酶基因、的表達(dá),表明纖維素酶基因在PK15細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)了分泌表達(dá)。

本研究克隆了桑天牛纖維素酶基因并構(gòu)建出真核表達(dá)載體,將其轉(zhuǎn)染PK15細(xì)胞進(jìn)行了分泌表達(dá),在基因表達(dá)的粗酶液中測定到了較高的纖維素酶及-葡聚糖酶活性,可以為桑天牛纖維素酶基因在轉(zhuǎn)基因及酶制劑制的生產(chǎn)方面提供參考。

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