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miRNA 調控PRRSV 復制的研究進展

2022-08-15 00:42:44
湖北畜牧獸醫(yī) 2022年3期
關鍵詞:宿主基因組靶向

曹 輝

(沈陽工學院生命工程學院,沈陽 撫順 113122)

豬繁殖與呼吸綜合征(PRRS)又稱“藍耳病”,是一種危害大、難以控制的豬高度接觸傳染性疾病,主要是由豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)感染造成。主要臨床表現(xiàn)為母豬繁殖障礙(晚期流產(chǎn)、早產(chǎn)、死胎、弱胎、木乃伊胎)、仔豬呼吸障礙、非特異性淋巴單核性和間質性肺炎甚至死亡等[1-4]。由于PRRSV 的變異性很高,在疫苗和藥物的研究方面比較困難。

小RNA 又稱為microRNA(miRNA),是一類內(nèi)源性非編碼RNA 分子,長度約為22 個堿基,且保守性很高。它可以與靶mRNA 進行互補或者部分互補,使mRNA 降解或導致其翻譯受抑制,作為重要的轉錄后的調節(jié)因子用于調控基因的表達[5]。研究表明,miRNA 能影響病毒的復制,主要是miRNA 可靶向病毒基因組或調控宿主抗病毒反應。學者通過探索與PRRSV 相關的microRNA 來揭示其致病機制,以此來取得更新、更好治療PRRS 的策略[6-10]。對有關miRNA 調控PRRSV 作用的研究進行闡述,為PRRSV 的防控研究提供科學指導,對制定合理的免疫程序以及開發(fā)PRRSV 疫苗具有重要意義。

1 miRNA 的調控作用

研究表明,宿主細胞編碼的miRNA 在各種免疫細胞的產(chǎn)生、增殖、發(fā)育以及免疫應答過程中發(fā)揮著重要的調控作用。在T 細胞增殖過程中,miR-142-3p 可以與跨膜蛋白GARP(Glycoprotein A repetitions predominant)的3'端高度保守的miRNA 結合區(qū)域結合,通過調節(jié)GARP 的表達來控制CD4+T 細胞的增殖[11]。在B 細胞的發(fā)育和凋亡過程中,miR-34a 和miR-17-92 簇可以分別通過下調轉錄因子Foxp1 和促凋亡蛋白Bim,抑制B 祖細胞向前體B 細胞發(fā)育[12]。同時,宿主細胞編碼的miRNA 還能通過干擾病毒復制因子,調控病毒復制及染毒細胞凋亡來影響病毒增殖。如miR-340-5p 可以影響HBV 的復制[13],miR-325-3p 能 抑 制HBV 的 復 制[14],miR-211-5p 能夠促進HBV 的復制[15];miR-34a 能抑制AIV 病毒的復制[16],而miR-29c 在AIV 的誘導下能夠促進細胞凋亡過程[17]。gga-miR-445-5p、miR-375 能夠抑制NDV 的復制[18,19]。隨著miRNA 的病毒調控作用方面研究的深入,尤其是在豬病毒疾病的研究中,與PRRSV 相關的miRNA 也陸續(xù)被挖掘,PRRSV 作為單股正鏈RNA 病毒,其基因組含有較長的非編碼區(qū),可以為microRNAs 發(fā)揮作用提供眾多靶點。不同的miRNA 可以通過不同的機制來調節(jié)PRRSV 入侵宿主的生物學過程[20]。

2 miRNA 對PRRSV 復制的調節(jié)

2.1 miRNA-4262 對PRRSV 復制的調控

CD163 是PRRSV 入侵宿主細胞的關鍵受體。吳俊靜等[21]通過篩選和鑒定來獲得能夠調控CD163基因進行翻譯表達的miRNA,并以此為基礎找到能很好抑制PRRSV 復制的miRNA。在此基礎上,通過試驗進一步在細胞水平證實了miRNA-181c、miRNA-23b、miRNA-4262 能對PRRSV 的復制產(chǎn)生抑制效應,其中miRNA-4262 的抑制效果最好。研究還發(fā)現(xiàn),miRNA-4262 也可調控CD169基因。CD163和CD169這2 個基因可能同時受miRNA-4262 靶向調控,從而提高了抑制PRRSV 復制的能力。

2.2 mir-3215和mir-let-7g對PRRSV復制的調控

為探討mir-3215 和mir-let-7g 和PRRSV 的 關系,鐘瑤[22]成功篩選到mir-3215 和mir-let-7g 靶向基因組保守區(qū)域位,設計特異性引物,選取不同的時間點,用qPCR 的方法檢測經(jīng)PRRSV 刺激后的Marc-145細胞,觀察對miRNA表達的影響。結果表明,在感染早期,mir-3215 和mir-let-7g 表達受到抑制,但隨著時間延長,抑制情況減弱,36 h 左右mir-let-7g 先恢復到正常水平,而mir-3215 表達量要稍高一些,可能的原因是細胞內(nèi)mir-3215 表達代償性強。

2.3 let-7f-5p 對PRRSV 復制的調控

Reinhart 等[23]在秀麗隱桿線蟲里發(fā)現(xiàn)了let-7,它是一種能夠調節(jié)lin-41基因mRNA 表達的microRNA。此外,在果蠅和人類等有機體內(nèi)也證實存在let-7。研究表明,let-7 家族成員在對抗病原微生物的感染過程中起著重要作用。李娜[24]通過不同的引物設計、生物信息學軟件預測等方法,發(fā)現(xiàn)let-7f-5p 能夠和MYH9 3’UTR 的miRNA 特異性結合,發(fā)揮對MYH9 轉錄后的調控作用,let-7f-5p 在PAMs被PRRSV 感染后表達水平有所下降,但是它的靶基因MYH9的表達水平有上升的趨勢。此外,在PAMs中進行了let-7f-5p 模擬物的轉染試驗,將轉染終濃度設置為20、50、100 nmol/L,當轉染100 nmol/L let-7f-5p 模擬物時,將其與對照組相比發(fā)現(xiàn),細胞培養(yǎng)上清液中PRRSV 的病毒基因組拷貝數(shù)降低了83%,PRRSV ORF7 mRNA 降低了80%,抑制了MYH9 的表達,表明let-7f-5p 呈濃度梯度依賴性抑制PRRSV在PAMs中的復制。

2.4 miR-130b 對PRRSV 復制的調控

miR-130a、miR-130b、miR-301a、miR-301b 和miR-454 是miR-130 家族的5 個成員。李麗薇[25]在MARC-145 細胞上轉染miR-130 家族模擬體,結果顯示miR-130 可以抑制病毒復制。其中抑制作用最強的是miR-130b。以miR-130b 作為主要的研究對象,通過間接免疫熒光試驗驗證miR-130b 對PRRSV N 蛋白的影響,結果表明N 蛋白表達被miR-130b 所抑制。隨著miR-130b 轉染劑量的增加,其對PRRSV 抑制作用越明顯。

2.5 miR-10a-5p 對PRRSV 復制的調控

使用不同PRRSV 毒株感染宿主靶細胞PAMs,采用qRT-PCR 方法對PAM 中mir-10a-5p 水平進行定量檢測,驗證了宿主靶細胞PAMs 中miR-10a-5p表達上調可通過不同PRRSV 毒株感染來進行誘導;將前后轉染的miR-10a-5p mimics 用不同毒力的PRRSVs 進行感染,結果顯示這2 種情況下過表達miR-10a-5p 均可抑制不同毒力PRRSVs 的復制,且效果顯著;此外,還對特異性表達SRP14 的腺病載體進行了構建,研究SRP14 對PRRSV 復制的影響,結果表明,為控制對PRRSV 的復制以及SRP14 的翻譯,可以使miR-10a-5p 與相應的靶細胞結合,以此來識別SRP14,可有效抑制其表達,但會使PRRSV感染加速,導致SRP14 的表達能力降低,從而控制PRRSV 在PAMs的產(chǎn)生[26,27]。

2.6 miR-373和miR-24-3p對PRRSV復制的調控

miRNA 會對PRRSV 的復制起到促進作用。陳靜[28]運用過表達miR-373 的模擬物(miR-373 mimic)或抑制miR-373 表達的抑制劑(miR-373 inhibitor)轉 染MARC-145 細胞 來檢 測PRRSV 的增 殖情況,結果發(fā)現(xiàn)PRRSV 滴度可以通過miR-373 模擬物來提高,細胞內(nèi)外的PRRSV RNA 和N 蛋白的表達水平上調;相反,PRRSV 滴度可以通過miR-373 抑制劑來降低,細胞內(nèi)外PRRSV 的RNA 和N 蛋白的表達水平下調。這表明,PRRSV 在MARC-145 細胞和PAMs 中的復制可以通過miR-373 來促進。研究還發(fā)現(xiàn),用抑制Sp1 表達和過表達Sp1 的質粒先轉染MARC-145 細胞,再進行感染PRRSV,說明通過抑制Sp1 也能抑制PRRSV 的RNA 水平,降低PRRSV滴度和下調PRRSV N 蛋白的表達水平,而過表達Sp1 則起到相反的作用。這表明Sp1 可以促進PRRSV 復制。此外,用MARC-145 細胞共同轉染Sp1-Flag、miR-373 inhibitor 或形成各自對應的對照,轉染后通過檢測PRRSV 增殖情況,結果表明Sp1促進PRRSV 復制依賴于miR-373 的表達。

Xiao 等[29]研究PRRSV 感染仔豬肺組織的轉錄組變化時發(fā)現(xiàn),PRRSV 感染后血紅素加氧酶1 基因(heme oxygenase 1,HO-1)顯著下調表達,與體外研究結果一致[30]。王雪[31]通過生物信息學軟件預測并 驗 證 出miR-24-3p 是HO-1 的 靶miRNA,用PRRSV 感染MARC-145 細胞發(fā)現(xiàn),miR-24-3p 的表達量顯著升高;在MARC-145 細胞中過表達miR-24-3p 發(fā) 現(xiàn),HO-1 的表 達量 下 降而PRRSV 的 感染量上升,這說明HO-1 的表達受miR-24-3p 調控,且miR-24-3p 和HO-1 的關系呈負相關。

3 小結

在病毒與宿主的對抗中,細胞運用多重障礙以及自身的免疫防御來阻止病毒的入侵,但在長期進化過程中,病毒為了能順利進入細胞,完成復制增殖和傳播一系列過程[32-34],采取各種策略來建立有利于感染的環(huán)境。miRNA 既可以靶向作用病毒入侵的細胞關鍵因子[35,36],也可以直接作用于病毒基因組,其在病毒與宿主的互作中扮演著重要的角色[37,38]。隨著miRNA 研究的不斷深入,宿主miRNA 如何調控PRRSV 的復制也將更清晰,PRRSV 疫苗的成功開發(fā)也將指日可待。

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