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豬細(xì)小病毒HNLY201301株遺傳特性及其對小鼠的致病性研究

2022-08-04 03:05:08徐伊璇彭文婧曹三杰顏其貴黃小波文翼平杜森焱
關(guān)鍵詞:核苷酸毒株基因組

鄭 藝,徐伊璇,彭文婧,曹三杰,顏其貴,黃小波,文翼平,趙 勤,杜森焱,伍 銳

(四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院豬病研究中心,成都 611130)

豬細(xì)小病毒(porcine parvovirus,PPV)自1966年首次報道以來,一直是導(dǎo)致豬繁殖障礙的常見病毒之一[1],嚴(yán)重威脅著養(yǎng)豬業(yè)的發(fā)展。PPV引發(fā)的繁殖障礙性疾病的特點是流產(chǎn)、木乃伊胎、死胎和后續(xù)不孕。除此以外,PPV感染也可引起全白細(xì)胞減少、肝炎、腸炎、紅細(xì)胞再生障礙、免疫復(fù)合物介導(dǎo)的血管炎和小腦共濟(jì)失調(diào)等癥狀[2]。與其他病毒相比,PPV對環(huán)境具有較強(qiáng)的抵抗力,一般來說,一旦豬場感染PPV,其根除將非常困難。根據(jù)遺傳差異,PPV被分為7種基因型,除經(jīng)典細(xì)小病毒1型(PPV1)外,2001年至今全球陸續(xù)分離鑒定成功PPV2~7[1,3-4]。近年來,PPV1感染日趨嚴(yán)重,我國已分離出大量毒株。通過將這些分離到的毒株與20世紀(jì)分離到的毒株進(jìn)行比較,證實了現(xiàn)代毒株與以前毒株有愈發(fā)相似的趨勢[5-6]。為了解河南洛陽地區(qū)分離到的PPV毒株的基因型和致病性,本研究擬對HNLY201301株進(jìn)行遺傳信息分析以及生物學(xué)特性研究。

1 材料和方法

1.1 病毒與細(xì)胞

2013年5月,在河南省洛陽市郊區(qū)某養(yǎng)豬場的100頭初產(chǎn)母豬(未接種過PPV疫苗)發(fā)生了流產(chǎn)和死胎,共計20頭。將死胎組織病料處理后接種PK-15細(xì)胞,成功分離出一株豬細(xì)小病毒,并命名為HNLY201301;PK-15細(xì)胞由四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院豬病研究中心(以下稱本中心)保存。

1.2 菌株與實驗動物

感受態(tài)細(xì)胞DH5α由本中心制作并保存;SPF級BalB/c小鼠,購自成都達(dá)碩生物科技有限公司。

1.3 主要試劑與試劑盒

1%動物紅細(xì)胞、4%多聚甲醛固定液,購自成都百思博生物技術(shù)有限公司;pMD19-T載體購自美國Promega公司;T4連接酶、Taq DNA聚合酶,購自寶生物工程(大連)有限公司;DMEM培養(yǎng)基、青鏈霉素溶液,購自美國Gibco公司;胎牛血清購自美國Hyclone公司;基因組DNA提取試劑盒、DNA純化試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒,均購自天根生化科技(北京)有限公司。

1.4 引物設(shè)計與病毒DNA提取

根據(jù)Genbank上發(fā)表的PPV的基因序列(登錄號:DKX242359),利用Primer Premier 5.0軟件分段設(shè)計了5對引物(表1),用于擴(kuò)增HNLY201301株的全基因組序列。將病毒接種于50%融合度的PK-15細(xì)胞,待出現(xiàn)明顯細(xì)胞病變效應(yīng)(CPE)后收集病毒液,按照說明書步驟提取病毒DNA,保存于-20℃。

表1 引物信息Table 1 Primer sequence

1.5 基因克隆與基因組測序

以提取到的病毒DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,在1%瓊脂糖凝膠上通過凝膠電泳分離PCR產(chǎn)物,試劑盒純化目的條帶。將純化后的片段連接到pMD19-T載體上,然后轉(zhuǎn)化進(jìn)大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,37℃平板培養(yǎng)過夜。挑選陽性白色菌落擴(kuò)大培養(yǎng)后提取重組質(zhì)粒,提取的重組質(zhì)粒送往生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行測序。使用DNAMAN軟件對得到的DNA序列進(jìn)行比對拼接,獲得完整的基因組序列。最后將得到的核苷酸序列利用Bankit序列提交工具提交給GenBank[7]。

1.6 系統(tǒng)發(fā)育分析

使用Lasergene 4.0軟件對HNLY201301株的NS1和VP1基因進(jìn)行核苷酸同源性分析和氨基酸同源性分析。利用Mega 5.0軟件,對NS1和VP1核苷酸序列進(jìn)行分子演化遺傳分析,采用鄰接法(neighbor-joining method),基于1 000個重復(fù),構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹[2],以確定HNLY201301株與其他豬細(xì)小病毒之間的進(jìn)化關(guān)系[8]。

1.7 生長曲線測定

按感染復(fù)數(shù)(MOI)1將病毒接種于PK-15細(xì)胞,分別在感染后不同時間點收集病毒液。PK-15細(xì)胞正常傳代消化后接種于96孔板,于37℃、5% CO2環(huán)境中培養(yǎng)過夜。將待測病毒液10倍梯度稀釋后接種于96孔板,每個稀釋度分別接種8孔,同時設(shè)置健康細(xì)胞孔作為對照,于37℃、5% CO2環(huán)境中繼續(xù)培養(yǎng),5~7 d內(nèi)觀察并記錄細(xì)胞病變情況,按Reed-Muench法計算TCID50[9],繪制生長曲線。

1.8 血凝試驗

在V底96孔板中各加入25μL磷酸鹽緩沖鹽溶液(PBS),再在第一孔中加入25μL病毒液,從左往右依次倍比稀釋病毒液,然后在每孔中加入1%動物的紅細(xì)胞,震蕩混勻,37℃孵育45 min后判定結(jié)果,以完全凝集的最高稀釋孔為該病毒的凝集價。

1.9 小鼠體內(nèi)感染試驗

1.9.1 靜脈注射感染試驗

對COPD患者而言,肺康復(fù)訓(xùn)練是一項長期的醫(yī)療過程,因此需患者具有較強(qiáng)的耐力和毅力。在肺康復(fù)訓(xùn)練中需對患者實施有效的健康宣教,這有利于后期訓(xùn)練,提高患者對疾病的認(rèn)知度,促進(jìn)患者養(yǎng)成良好的生活飲食習(xí)慣,提高其治療依從性,也一定程度增強(qiáng)患者對治療疾病的信心,使患者掌握正確肺康復(fù)方法并持之以恒,能避免疾病加重[9]。

為評估HNLY201301株的組織嗜性,36只BalB/c小鼠公母各半,統(tǒng)一靜脈注射0.2 mL病毒液(病毒滴度為10-6.71TCID50/mL),對照組注射等量PBS,3 d內(nèi)觀察病變。每6 h隨機(jī)選擇3只小鼠進(jìn)行人道安樂死[10],收集血液、心臟、肝臟、脾臟、肺臟、睪丸、儲精囊、子宮和卵巢等多器官組織樣本。

1.9.2 陰道灌注感染試驗

為評估HNLY201301株的生殖道途徑感染情況,12只雌性BalB/c小鼠,統(tǒng)一陰道灌注40μL病毒液(病毒滴度為10-6.71TCID50/mL),對照小鼠灌注等量PBS。在接種后不同時間點,每組3只小鼠被人道安樂死,并收集其子宮、心臟、肝臟和脾臟。

1.10 組織病理診斷

將新鮮組織用固定液浸泡固定24 h以上,用手術(shù)刀將目的部位組織修平整,依次進(jìn)行脫水、包埋、切片、脫蠟至水處理,然后使用蘇木素和伊紅進(jìn)行染色,脫水后用中性樹膠封片,最后在光學(xué)顯微鏡下觀察并采集圖像。

1.11 熒光定量PCR(qPCR)

基于HNLY201301株VP2基因設(shè)計用于qPCR法檢測病毒載量的引物(表1),收集的血液及組織用于提取病毒DNA作為檢測模板。qPCR擴(kuò)增程序為:95 ℃ 30 s;95 ℃ 5 s,68 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s(39個循環(huán));繪制熔解曲線。

2 結(jié)果與分析

2.1 病毒基因序列分析

測序結(jié)果顯示,HNLY201301株的基因組全長為4 723 bp,有兩個主要ORF,其中ORF1編碼437個氨基酸的NS1,116個氨基酸的NS2和77個氨基酸的NS3,ORF2編碼480個氨基酸的VP1和375個氨基酸的VP2。我們已將本研究獲得的HNLY201301株核苷酸序列提交給了GenBank,獲得登錄號MF447833。使用DNAMAN軟件對DNA序列進(jìn)行比對(表2)后發(fā)現(xiàn),HNLY201301株與其他PPV1株之間的核苷酸序列同源性為92.3%~99.7%,與GD2013株的基因組序列同源性最高。除GD2013株以外,相較于其他參考毒株,HNLY201301株序列的121至159位存在39個堿基的缺失。使用Lasergene 4.0軟件對NS1、VP1和VP2進(jìn)行核苷酸及氨基酸同源性分析(表2)發(fā)現(xiàn),與參考毒株相比,HNLY201301株NS1的核苷酸和氨基酸序列同源性分別為99.4%~99.9%和99.2%~99.7%,VP1的核苷酸和氨基酸序列同源性分別為98.7%~100.0%和98.5%~99.7%,VP2的核苷酸和氨基酸序列同源性分別為98.4%~99.9%和98.2%~99.8%。HNLY201301株與從中國河南省分離的HN-2011株和J-PPV株具有較高的核苷酸同源性和氨基酸同源性。對HNLY201301株和參考毒株VP2編碼區(qū)關(guān)鍵氨基酸位點進(jìn)行分析(表3),結(jié)果表明,HNLY201301株和高致病性Kresse株第378、383氨基酸突變位點以及和HN-2011株在第45、144、320、436個氨基酸突變位點上具有高度相似性。

表2 HNLY201301株與其他PPV1株的序列比對Table 2 Sequence information for HNLY201301 strain and other reference PPV1 strain

表3 HNLY201301株與其他PP1株VP2蛋白關(guān)鍵位點氨基酸比較Table 3 Amino acid difference in VP2 between HNLY201301 strain and other reference PPV1 strain

2.2 病毒系統(tǒng)發(fā)育樹分析

基于NS1基因的系統(tǒng)發(fā)育樹分析(圖1)表明,HNLY201301株與J-PPV株、Kresse株以及NADL-2株親緣關(guān)系最近,基于VP1基因的系統(tǒng)發(fā)育樹分析(圖2)表明,HNLY201301株與HN-2011株的親緣關(guān)系最近。總體而言,HNLY201301株與PPV1株的關(guān)系最為密切且其他PPV1株形成了與其他細(xì)小病毒不同的系統(tǒng)發(fā)育分支。

圖1 基于NS1基因的系統(tǒng)發(fā)育樹分析Figure 1 Phylogenetic tree analysis based on NS1 gene

圖2 基于VP1基因的系統(tǒng)發(fā)育樹分析Figure 2 Phylogenetic tree analysis based on VP1 gene

2.3 病毒的細(xì)胞病變效應(yīng)及生長曲線測定

圖3 HNLY201301株在PK-15細(xì)胞上引起的CPE(200×)Figure 3 CPE induced by HNLY201301 strain on PK-15 cells

圖4 HNLY201301株在PK-15細(xì)胞上的生長曲線Figure 4 Growth curve of HNLY201301 strain on PK-15 cells

2.4 病毒血凝性分析

血凝試驗結(jié)果顯示,HNLY201301株可以凝集小鼠、大鼠、豚鼠、兔、雞、鴨和豬的紅細(xì)胞。其中豬的紅細(xì)胞的凝集價最高,為1∶1 024,其次為兔和小鼠的紅細(xì)胞的凝集價,均為1∶512,其余動物紅細(xì)胞的凝集價為1∶256。表明HNLY201301株血凝譜廣,凝集價高。

2.5 靜脈注射導(dǎo)致的小鼠感染分析

靜脈注射HNLY201301株,在3 d的觀察期內(nèi),未觀察到明顯臨床癥狀,所有小鼠均存活。取小鼠血液及部分組織器官,提取病毒DNA后qPCR法檢測病毒拷貝數(shù)。結(jié)果(表4)表明,36 h內(nèi)能在小鼠血液中檢出PPV,不同性別之間差異不顯著。對于多種組織器官中病毒的檢測,主要在雌鼠子宮檢出了PPV,睪丸和脾臟僅一例陽性無代表性,其余部位如心、脾、肺、卵巢和儲精囊檢測結(jié)果均為陰性。病理切片結(jié)果(圖5)顯示,小鼠的子宮有明顯的病理變化,主要病變?yōu)樽訉m固有層毛細(xì)管擴(kuò)張充血,子宮腺增生(綠色箭頭指示),中性粒細(xì)胞及淋巴細(xì)胞浸潤全層,組織疏松腫脹,炎癥明顯(紅色箭頭指示)?;谠囼灲Y(jié)果以及PPV的生殖道感染特點,我們選擇陰道灌注的方式對雌鼠的感染情況進(jìn)行進(jìn)一步了解。

表4 靜脈注射感染小鼠組織中的病毒載量Table 4 Tissue distribution of PPV DNA load in mice infected by intravenous injection

圖5 靜脈注射PPV后小鼠子宮病理切片(200×)Figure 5 Pathological sections of mouse uterus after intravenous injection of PPV

2.6 陰道灌注導(dǎo)致的小鼠感染分析

通過陰道灌注HNLY201301株,在15 d的觀察期內(nèi),檢查發(fā)現(xiàn)小鼠的陰唇腫脹,所有小鼠均存活。qPCR結(jié)果(表5)表明,感染3 d后,小鼠的子宮和肝臟檢測結(jié)果呈陽性。感染7 d后,在子宮和肝臟中未檢測到病毒。在子宮、心臟、肝臟和脾臟的病理切片中,同樣只有子宮可以觀察到不同程度的病變(圖6)。比較典型的病變是子宮內(nèi)膜上皮出現(xiàn)絨毛狀增生以及子宮內(nèi)膜上皮壞死(綠色箭頭指示),中性粒細(xì)胞浸潤,炎癥明顯(紅色箭頭指示)。

圖6 陰道灌注PPV后小鼠子宮病理切片F(xiàn)igure 6 Pathological sections of mouse uterus after vaginal perfusion of PPV

表5 陰道灌注感染小鼠組織中的病毒載量Table 5 Tissue distribution of PPV DNA load in mice infected by intravenous injection

3 討論

HNLY201301株的基因組大小為4 723 bp,有兩個主要ORF,以及5′-UTR和3′-UTR,符合PPV基因組的典型結(jié)構(gòu)[11]。盡管HNLY201301株核苷酸序列的第121至159位存在39個堿基的缺失,但無法確定這些缺失對HNLY201301株的生物學(xué)功能是否有影響,需要進(jìn)一步的研究來確定其生物學(xué)特性和遺傳進(jìn)化特征,同時也需要更廣泛的流行病學(xué)調(diào)查來確定PPV1在中國豬群中的分布和傳播。

HNLY201301株是2013年5月在河南洛陽某小型養(yǎng)殖戶中發(fā)現(xiàn),與從同省份2011年分離的HN-2011株和2013年分離的J-PPV株具有較高的核苷酸同源性和氨基酸同源性,并且同屬于PPV1,推測PPV1已在河南的養(yǎng)殖場中流行,并且在當(dāng)?shù)刎i群中保持較低的進(jìn)化率。查詢PPV的流行病學(xué)調(diào)查研究得知,以河南駐馬店為例,2014年上半年P(guān)PV的平均陽性率為25.0%[12],國內(nèi)其他地區(qū)PPV的平均陽性率在16.7%~41.1%之間(包括湖北、四川及貴州部分地區(qū))[13],因此PPV在我國仍需得到重視,必須加強(qiáng)防控以減少損失。

國內(nèi)目前主要依靠疫苗免疫以及提高飼養(yǎng)管理水平來防控PPV感染,盡管亞單位疫苗、重組活載體疫苗以及核酸疫苗的研究陸續(xù)取得了一定突破,但目前最常用的疫苗主要為滅活疫苗(所用毒株包括CP-99株、S-1株、BJ-2株、WH-1株、NJ株、CG-05株、YBF01株以及L株)[14],而弱毒疫苗(所用毒株包括NADL-2弱毒株、HT株、HT-SK-C株以及N株)由于存在毒力反強(qiáng)的可能,同時不易保存和運輸,再加上無法區(qū)分疫苗接種動物及野毒感染動物可能對免疫程序造成影響,這些原因都使弱毒疫苗的運用受到一定限制[15-17]。Kresse株為經(jīng)典PPV強(qiáng)毒株,NADL-2株為經(jīng)典PPV弱毒株,通過比對多株P(guān)PV VP2蛋白的氨基酸序列分析后發(fā)現(xiàn),45S、215I、378G、383Q及436P位點在決定毒株的組織嗜性和致病性強(qiáng)弱上起重要作用,通常表現(xiàn)為強(qiáng)毒株[18-19],HNLY201301株符合PPV強(qiáng)毒株的特征。本試驗中,HNLY201301株的滴度可達(dá)10-8.45TCID50/mL,對比弱毒N株的10-4.39TCID50/mL[20]以及重組病毒rPRV-VP2株的10-4.75TCID50/mL[21],HNLY201301株在豬腎細(xì)胞系中較高的滴度表明,其作為疫苗候選株具有優(yōu)良的潛力。

目前,PPV對小鼠的致病性研究尚未見報道。我們的試驗發(fā)現(xiàn)HNLY201301株感染不會造成小鼠死亡,但能夠感染小鼠子宮細(xì)胞并造成病理損傷。病毒的感染通常需要病毒與易感細(xì)胞上的受體結(jié)合,從而達(dá)到入侵的目的,由此我們推測,小鼠的生殖細(xì)胞上可能存在能與PPV進(jìn)行結(jié)合的受體。

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