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葡萄糖徹底氧化生成多少ATP問題的探索

2022-08-02 09:17:44曾德二鄭彥坤魏和平
產(chǎn)業(yè)與科技論壇 2022年14期
關(guān)鍵詞:糖酵解驅(qū)動力羧酸

□曾德二 鄭彥坤 魏和平 龔 莉

一、問題的提出

葡萄糖代謝是生物化學(xué)教學(xué)的重點,其中一個最基本的問題是如何計算一分子葡萄糖在細胞中徹底氧化還原最后生成多少ATP?已有多篇文獻參與討論這類問題[1,2,5]。這些文獻多以分析葡萄糖代謝的化學(xué)反應(yīng)過程來處理生成ATP數(shù),但過于繁瑣,對于非葡萄糖物質(zhì)生成ATP的問題沒有有效的啟發(fā)和引申。筆者在生物化學(xué)和細胞生物學(xué)的教學(xué)中,經(jīng)常被學(xué)生問到碳水化合物生成ATP的問題。比如一分子草酰乙酸徹底氧化生成多少ATP?一分子甘油徹底氧化生成多少ATP?解決這類問題可以參照文獻中處理葡萄糖的方法,把所有的化學(xué)反應(yīng)式都列出來,然后“求和”。這是切實可行的方法,但需要對各種碳水化合物在體內(nèi)的各種化學(xué)反應(yīng)過程非常熟悉,過多的化學(xué)反應(yīng)式和各種系數(shù)的配平會讓最終的“求和”變得困難。要解決此類問題的疑問,需要尋找具有普適意義的方法?;谶@種初衷,結(jié)合教學(xué)實踐,找到了一種碳氧化數(shù)“算法”來處理此類問題。之所以稱為“算法”是因為它能夠體現(xiàn)問題的本質(zhì),并具有更簡單有效的計算規(guī)則,也具有理論性、可操作性、可推廣性。

二、“算法”的基本原理

為了更好的闡述該計算方法,我們先來考察葡萄糖徹底氧化的兩個重要步驟中的能量轉(zhuǎn)化問題。葡萄糖在細胞徹底氧化的第一個步驟是糖酵解過程和三羧酸循環(huán)[3,4]。蘊含在葡萄糖分子中的不活潑的化學(xué)能轉(zhuǎn)化成活潑的自由電子的能量,電子的載體是NADH。因此第一個步驟其實解決的是到底有多少自由電子轉(zhuǎn)移出來生成NADH的問題。根據(jù)國際化學(xué)學(xué)會的規(guī)定,中性化合物分子所有元素氧化數(shù)代數(shù)和為0,而第一個步驟中的所有化學(xué)反應(yīng)只有中性水分子的加入,因此不改變反應(yīng)前后元素氧化數(shù)代數(shù)和為0的原則。由于沒有氧分子的參與,氧元素的氧化數(shù)在反應(yīng)前后沒有任何變化,始終是-2。碳的氧化數(shù)從0變化到二氧化碳的+4,葡萄糖分子碳的氧化數(shù)總共改變了+24,要維持氧化數(shù)反應(yīng)前后代數(shù)和為0的原則,氫的氧化數(shù)必須對等的改變了-24,即有24個氧化數(shù)+1氫變?yōu)檠趸瘮?shù)為0的氫。基于這種推理,總共有24個氧化數(shù)+1的氫接受了24個自由電子發(fā)生了這種改變??紤]到細胞中的電子轉(zhuǎn)移載體是NAD+,因此每轉(zhuǎn)移2個自由電子,會有一個NADH生成,總共有12個NADH的生成(實際上是10個NADH和2個FADH2)。通過以上討論,我們不需要認真地對每一個化學(xué)反應(yīng)進行求和,就可以直接定量葡萄糖在第一個步驟中的能量轉(zhuǎn)化。即1分子葡萄糖可以轉(zhuǎn)化成12分子的NADH儲存起來。在不知道葡萄糖在糖酵解途徑和三羧酸循環(huán)反應(yīng)的這是葡萄糖分解代謝第一個步驟的真正本質(zhì),把不活潑的化學(xué)能高效地轉(zhuǎn)化成活潑的自由電子的能量。

三、應(yīng)用實例

根據(jù)上面的規(guī)則,將七種典型的碳水化合物初始狀態(tài)碳的氧化數(shù)、終末狀態(tài)碳的氧化數(shù)、氧化數(shù)改變、NADH數(shù)目等在表1中列出。1分子NADH包含2個自由電子,通過在線粒體內(nèi)膜電子傳遞鏈復(fù)合物上進行跨膜傳遞,將大約10個質(zhì)子泵到線粒體內(nèi)膜間隙形成質(zhì)子驅(qū)動力。最后平均4個質(zhì)子可以通過ATP合酶生成一個ATP分子,即一分子的NADH可以生成2.5個ATP。在不考慮這幾種碳水化合物徹底氧化所經(jīng)歷的復(fù)雜的化學(xué)反應(yīng)過程,我們能夠快速求出這七種碳水化合物在細胞內(nèi)生成ATP的數(shù)目。需要說明的問題是,葡萄糖在糖酵解途徑和三羧酸循環(huán)反應(yīng)中,有底物活化消耗ATP和底物水平磷酸化生成ATP的過程。自由電子跨膜傳遞形成的質(zhì)子驅(qū)動力通過ATP合酶生成ATP的過程,只能是大約每4個質(zhì)子可以生成一分子的ATP,從這個角度來說,碳水化合物徹底氧化生成ATP的數(shù)目不可能真正的“精確”定量??紤]到底物活化和底物水平磷酸化加起來對ATP的貢獻非常小,可以忽略這種因素對結(jié)果的影響。

表1 碳水化合物徹底氧化前后氧化數(shù)變化及ATP初步估算

四、葡萄糖能量轉(zhuǎn)化的討論

從氧化數(shù)改變的角度處理葡萄糖或者其他碳水化合物徹底氧化生成多少ATP問題確實起到了一些好的效果,在教學(xué)實踐中也確實有助于幫助學(xué)生對碳水化合物能量轉(zhuǎn)化問題的理解。從葡萄糖徹底氧化生成二氧化碳和水的過程來看,總共有三次能量轉(zhuǎn)化過程。從能量轉(zhuǎn)化的圓餅圖可以直觀的看出,葡萄糖經(jīng)過糖酵解和三羧酸循環(huán)的第一個步驟,將大約90.4%的自由能轉(zhuǎn)化成自由電子載體NADH的能量;NADH在線粒體電子傳遞鏈上進行電子跨膜傳遞,將電勢能轉(zhuǎn)化成質(zhì)子驅(qū)動力的能量,這個過程具有極高的能量轉(zhuǎn)化效率,只損失大約3.4%的能量;最后質(zhì)子驅(qū)動力驅(qū)動ATP合酶生成ATP,這個過程中將有60%質(zhì)子驅(qū)動力的能量轉(zhuǎn)化生成ATP,即分子馬達的效率達到了60%。計算葡萄糖徹底有氧氧化生成ATP的能量轉(zhuǎn)化效率,達到了52.3%,效率可觀。

圖1 葡萄糖不同途徑的能量轉(zhuǎn)化效率

五、結(jié)語

本文從碳的氧化數(shù)改變的角度,分析出葡萄糖及其他碳水化合物徹底氧化生成NADH的數(shù)目。通過計算NADH的自由能,質(zhì)子驅(qū)動力儲存的自由能以及生成ATP的自由能,也得出了葡萄糖糖酵解途徑和三羧酸循環(huán)的能量轉(zhuǎn)化效率;以及隨后質(zhì)子驅(qū)動力形成和ATP合成的能量轉(zhuǎn)化效率,能夠幫助學(xué)生深入理解葡萄糖在細胞內(nèi)能量利用過程。

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