胡新元,譚雪蓮,孫小花,謝奎忠,柳永強(qiáng)
(1.甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院,甘肅省馬鈴薯種質(zhì)資源創(chuàng)新工程實(shí)驗(yàn)室,甘肅 蘭州 730070; 2.甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院旱地農(nóng)業(yè)研究所,甘肅省水資源高效利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,甘肅 蘭州 730070; 3.甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院馬鈴薯研究所,甘肅 蘭州 730070)
馬鈴薯(SolanumtuberosumL.)是世界第四大糧食作物,我國是馬鈴薯種植面積最大的國家,約占世界種植面積的22%[1-2]。由于人口不斷增長(zhǎng),預(yù)計(jì)到2050年全球糧食需求將翻一番[3-4]。中國作為世界第二大經(jīng)濟(jì)體,一直在采取措施提高糧食產(chǎn)量,2015年中國農(nóng)業(yè)部啟動(dòng)馬鈴薯主糧化戰(zhàn)略,到2020年,馬鈴薯面積由5.3×106hm2增加到1.0×107hm2以上[5]。近年來,馬鈴薯連年種植現(xiàn)象非常普遍,連作會(huì)造成環(huán)境因子的過度消耗,使土壤微生態(tài)環(huán)境惡化,植物病原體富集,最終導(dǎo)致作物生長(zhǎng)障礙[6]。連作導(dǎo)致馬鈴薯土傳病害逐年加劇,嚴(yán)重影響了馬鈴薯產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展。據(jù)報(bào)道,馬鈴薯連作2 a,產(chǎn)量沒有顯著變化,但連作第3年,產(chǎn)量下降17.07%以上[7-8]。有研究表明,微生態(tài)系統(tǒng)的失衡是造成連作障礙發(fā)生的主要原因之一,土壤微生物類群的變化又會(huì)影響土壤微生態(tài)功能[6]。馬鈴薯連作導(dǎo)致的土壤微生物群落結(jié)構(gòu)演替一直以來備受關(guān)注。因此,研究不同連作年限下土壤微生物多樣性的變化,對(duì)于促進(jìn)馬鈴薯種植業(yè)的可持續(xù)發(fā)展具有重要意義。
土壤真菌與土傳病害的發(fā)生密切相關(guān)[9]。孟品品等[10]采用PCR-DGGE分子指紋圖譜技術(shù)研究了馬鈴薯連作對(duì)根際土壤真菌種群結(jié)構(gòu)的影響,研究表明連作使根際土壤中病原真菌成為優(yōu)勢(shì)種群,根際微生態(tài)環(huán)境惡化。李繼平等[11]采用稀釋平板法和殘?jiān)蛛x法研究了馬鈴薯連作對(duì)土壤病原真菌種群動(dòng)態(tài)變化的影響,發(fā)現(xiàn)0~10 cm土層中土傳病原真菌菌落數(shù)隨連作年限的增加而增加。龔靜等[12]研究表明,馬鈴薯連作1季和3季土壤真菌結(jié)構(gòu)相似。研究發(fā)現(xiàn),大豆長(zhǎng)期連作,真菌群落結(jié)構(gòu)和功能組成向利于植物健康方向發(fā)展[13]。大豆長(zhǎng)期連作(6~38 a),土壤中抑制大豆胞囊線蟲的假單胞菌屬(Psudomonas)、紫霉屬(Purpureocillium)和pochonia豐度逐年增加[14]。與連作3 a相比,大豆連作20 a根際土壤中根腐病病原菌鐮孢菌(Fusariumoxysporum)種群密度顯著降低[15]。長(zhǎng)期種植馬鈴薯是否有利于抑病土的產(chǎn)生,從而抑制病原菌的生長(zhǎng),改善土壤環(huán)境和植株生長(zhǎng),馬鈴薯是否可以進(jìn)行適度連作,目前仍罕見報(bào)道。因此,本研究采用高通量測(cè)序技術(shù),通過研究馬鈴薯土壤真菌多樣性和群落結(jié)構(gòu)在連作條件下的演變規(guī)律,以期為解決馬鈴薯適度連作和土壤微生態(tài)修復(fù)問題提供理論依據(jù)。
試驗(yàn)布設(shè)在甘肅省定西市安定區(qū)寧遠(yuǎn)鎮(zhèn)紅土村中川社(35°26.714′N, 104°50.886′E),海拔1 991 m,試驗(yàn)地為平坦川地,屬中溫帶偏旱區(qū),日照時(shí)數(shù)2 476.6 h,年均氣溫6.4℃,≥10℃積溫2 239.1℃,無霜期140 d。多年平均降水量390.9 mm,年蒸發(fā)量1 531 mm,干燥度2.53,為典型的黃土高原半干旱雨養(yǎng)農(nóng)業(yè)區(qū),土壤為典型的黃綿土。
2010年3月開始進(jìn)行定位試驗(yàn),供試品種為:春小麥(定西35號(hào))、豌豆(隴豌1號(hào))、馬鈴薯(隴薯10號(hào))。試驗(yàn)采用隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì),設(shè)6個(gè)處理。(1)輪作(R):馬鈴薯/小麥/豌豆序列輪作,2019年種植馬鈴薯;(2)馬鈴薯連作1 a(C1):2018—2019 年連續(xù)2 a種植馬鈴薯;(3)馬鈴薯連作3 a(C3):2016—2019 年連續(xù)4 a種植馬鈴薯;(4)馬鈴薯連作5 a(C5):2014—2019 年連續(xù)6 a種植馬鈴薯;(5)馬鈴薯連作7 a(C7):2012—2019年連續(xù)8 a種植馬鈴薯;(6)馬鈴薯連作9 a(C9):2010—2019年連續(xù)10 a種植馬鈴薯。C5~C9處理的前茬作物均為春小麥。每個(gè)處理3次重復(fù),共18個(gè)小區(qū),每個(gè)小區(qū)面積為23.8 m2(5.67 m×4.2 m)。
小麥播種量為187.5 kg·hm-2, 3月下旬播種,7月下旬收獲。豌豆播種量為180 kg·hm-2,4月初播種,7月中旬收獲。馬鈴薯種植密度為67 500株·hm-2,4月下旬種植,9月下旬收獲。小麥?zhǔn)┓柿繛榧僋和P2O5各105 kg·hm-2,豌豆施肥量為純N 135.0 kg·hm-2、P2O5108.0 kg·hm-2,馬鈴薯施肥量為純N135 kg·hm-2、P2O5108 kg·hm-2。在作物生長(zhǎng)季節(jié),雜草采用人工除草,此外無其他田間管理措施。
馬鈴薯塊莖膨大期采用 “S”形方法取樣,從0~20 cm土層采集距離馬鈴薯根部周圍0~2 cm土樣,樣品混勻后過2 mm篩,裝入無菌塑料離心管中,放入液氮中帶回實(shí)驗(yàn)室,并儲(chǔ)存于-80℃冰箱用于微生物分析。
使用MN NucleoSpin soil Kit (Machery-nagel, Dueren, Germany)從0.75 g土壤中提取總DNA。根據(jù)真菌ITS1保守區(qū)使用引物ITS1F (5′-CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA-3′)和ITS2 (5′ -GCTGCGTTCTTCATCGATGC-3′)。每10 μl PCR混合物中含有5 μl KOD FX Neo Buffer、0.3 μl 10 μM引物、2 μl dNTP(每個(gè)2 mmol·L-1)、0.2 μl KOD FX Neo、50 ng DNA,并加入蒸餾水定容至10 μl。每個(gè)樣品進(jìn)行重復(fù)擴(kuò)增、合并,然后使用Cycle Pure Kit (Omega, Norcross, GA, USA)進(jìn)行純化,形成測(cè)序文庫,使用Illumina HiSeq 2500技術(shù)進(jìn)行測(cè)序分析。
每個(gè)種植方式對(duì)應(yīng)選取3個(gè)獨(dú)立土壤樣品進(jìn)行ITS測(cè)序,鑒定樣品中的真菌;測(cè)序序列的Q3控制90%以上;從樣本中隨機(jī)抽取一定數(shù)量的序列,統(tǒng)計(jì)這些序列所代表的物種數(shù)目,并以序列數(shù)與物種數(shù)來構(gòu)建曲線,控制序列數(shù)取值在曲線平緩段,保證測(cè)序數(shù)據(jù)量飽和,足以反映樣品中的物種多樣性。
用QIIME軟件挑選出屬分類學(xué)水平上豐度最高的OTU序列作為代表序列,進(jìn)行多重序列比對(duì)并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,然后通過Python語言工具繪制圖形。通過Beta多樣性分析來比較不同樣品在物種多樣性方面(群落組成及結(jié)構(gòu))存在的差異大小,根據(jù)距離矩陣獲得相應(yīng)距離下的樣品層次聚類樹,并進(jìn)行非度量多維標(biāo)定(Non-metric multi-dimensional scaling, NMDS)分析。
采用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)馬鈴薯土壤真菌群落的α-多樣性指數(shù)進(jìn)行了分析。馬鈴薯連作年限對(duì)土壤真菌群落豐富度有顯著影響,相似性水平為97%(圖1)。隨著馬鈴薯連作年限的增加,土壤真菌菌群豐度和Chao1顯著增加。連作7 a和9 a的馬鈴薯土壤真菌菌群豐度最高,馬鈴薯/春小麥/碗豆輪作的馬鈴薯土壤真菌菌群豐度最低。C7與C9間無顯著差異,而C7、C9與R、C1 C3間差異顯著。表明連作年限的增加使土壤真菌群落的豐富度和多樣性提高。
注:不同字母表示處理間差異顯著(P<0.05)。Note:Different letters indicate significant differences among different treatments (P<0.05).圖1 馬鈴薯連作年限對(duì)土壤真菌群落Chao1和菌群豐度的影響Fig.1 Effect of potato continuous cropping years on Chao1 and community richness of soil fungal communities
對(duì)馬鈴薯土壤真菌群落的分布進(jìn)行了分析(圖2),置換檢驗(yàn)(Permutation test)表明,種植年限對(duì)馬鈴薯土壤真菌群落的分布有顯著影響(R2=0.56,P<0.001)。從圖2可以看出,C7和C9處理比較接近,說明這兩個(gè)處理的真菌群落相似度較高,他們和R處理的距離較遠(yuǎn),C1、C3和C5處理位于R處理和C7、C9處理之間,證明C7和C9處理與R處理的真菌群落相似度低,真菌群落差異顯著。
注:NMDS是基于真菌群落組成的布雷-柯蒂斯距離。誤差條表示標(biāo)準(zhǔn)誤差。Note:NMDS are based on Bray-Curtis distances according to fungal community composition. Error bars indicate standard errors.圖2 不同馬鈴薯連作年限下土壤真菌群落的非度量多維尺度(NMDS)圖Fig.2 NMDS plot showing the shift of fungal communities in relation to potato continuous cropping years
對(duì)檢測(cè)到的>90%的真菌群落在綱水平的分類進(jìn)行分析(圖3,見189頁),可以看出,試驗(yàn)供試樣本主要富集的13個(gè)真菌綱:錘舌菌綱(Leotiomycetes)、傘菌綱(Agaricomycetes)、壺菌綱(Chytridiomycetes)、座囊菌綱(Dothideomycetes)、子囊菌綱(Ascomycota_unidentified)、糞殼菌綱(Sordariomycetes)、銀耳綱(Tremellomycetes)、盤菌綱(Pezizomycetes)、散囊菌綱(Eurotiomycetes)、酵母綱(Saccharomycete)、Fungi_unidentified、Archaeorhizomycetes、傘型束梗孢菌綱(Agaricostilbomycetes)。土壤真菌群落的相似度總體分為兩類,C7和C9處理為一組,其他處理分為一組。R、C1、C3、C5間差異較小,長(zhǎng)期連作C7和C9間差異較小,而R、C1、C3、C5與C7、C9間差異較大,說明連作7 a后馬鈴薯田土壤真菌群落結(jié)構(gòu)發(fā)生較大改變。再細(xì)分,R處理和C1、C3、C5處理分開,可以分為3組,這和圖2的真菌群落相似度分類相似,說明馬鈴薯輪作和連作也會(huì)引起土壤微生物群落一定的變化。
注:*表示處理間差異顯著(P<0.05),下同。Note: * shows significant differences among treatments (P<0.05),the same below.圖3 連作年限對(duì)馬鈴薯田土壤綱水平真菌群落影響的熱圖Fig.3 Heat map shows the effects of continuous cropping years on potato soil fungal community at class level
在不同種植年限的馬鈴薯農(nóng)田土壤中,共檢測(cè)到273個(gè)真菌屬,其中平均相對(duì)豐度>0.15%的真菌屬有44個(gè),對(duì)檢測(cè)到的豐度排名前44的真菌屬進(jìn)行差異分析,其中,13個(gè)真菌屬在不同處理的馬鈴薯農(nóng)田土壤中差異顯著(圖4),分別為:鐮刀菌屬(Fusarium)、Nectriaceae、靈芝屬(Ganoderma)、Metarhizium、Lecanicillium、木生紅曲霉屬(Xylogone)、叢赤殼屬(Nectria)、Ascomycota_unidentified、曲霉屬(Aspergillus)、青霉屬(Penicillum)、頭梗霉(Cephaliophora)、隱球菌屬(Cryptococcus)、剛毛四枝孢菌屬(Tetracladium)。青霉菌在連作5、7 a和9 a的土壤中數(shù)量顯著高于輪作。潛在的有害病菌為鐮刀菌屬(Fusarium)、Nectriaceae、靈芝屬(Ganoderma)、綠僵菌屬(Metarhizium)、Lecanicillium、木生紅曲霉屬(Xylogone)、叢赤殼屬(Nectria),其中,鐮刀菌屬是引起馬鈴薯枯萎病的土傳病原真菌。鐮刀菌屬種類很多,本研究土壤中主要是尖孢鐮刀菌(F.oxysporum),而綠僵菌屬在馬鈴薯連作土壤中屬于拮抗菌,沒有致病性。
注:+表示該真菌屬為潛在的有害病菌。Note:+ indicates that the fungus is a potentially harmful pathogen.圖4 連作年限對(duì)馬鈴薯田土壤屬水平真菌群落影響的熱圖Fig.4 Heat map shows the effects of continuous cropping years on potato soil fungal community at genus level
土壤潛在有害病原真菌屬水平豐度聚類分析顯示(圖5),不同連作年限潛在病原菌群落可以分為兩組,C5、C7、C9處理為一組,R、C1、C3為一組,同一組內(nèi)真菌群落組成類型相似。結(jié)果表明馬鈴薯連作5、7 a和9 a群落組成在屬水平上相似性較高,而馬鈴薯輪作、連作1 a、連作3 a群落組成在屬水平上相似性較高。由此可見,當(dāng)馬鈴薯連作5 a以后,土壤潛在病原真菌種群豐度開始發(fā)生較大變化。病原菌鐮刀菌屬(Fusaruim)在C5中相對(duì)豐度達(dá)最高,顯著高于R、C1、C3以及C7、C9。拮抗菌綠僵菌屬(Metarhizium)在C5、C7、C9中相對(duì)豐度顯著高于R、C1、C3。
連作障礙的產(chǎn)生與土壤微生物的多樣性密不可分,土壤真菌多樣性和數(shù)量與土壤健康狀況呈負(fù)相關(guān)[16],長(zhǎng)期連作使作物土壤微環(huán)境發(fā)生改變,土壤真菌多樣性和豐富度有所提高,破壞了原有土壤微生物群落的結(jié)構(gòu),影響作物的健康生長(zhǎng)[17-18]。目前不同作物不同連作年限的研究結(jié)果不盡相同。趙存鵬等[6]研究得出,輪作后棉花根際土壤中真菌Chao1、ACE和Shannon指數(shù)顯著高于連作棉田。張子龍等[19]研究表明,小麥/三七輪作土壤真菌群落多樣性和豐富度顯著高于三七連作。劉珊廷等[20]研究表明木薯輪作根際土壤中Shannon指數(shù)和Chao1指數(shù)均高于連作。而本研究發(fā)現(xiàn),隨著連作年限的增加,真菌多樣性指數(shù)呈上升趨勢(shì)。馬鈴薯連作5 a Richness顯著高于小麥/馬鈴薯輪作,馬鈴薯連作7 a和9 a菌群豐度顯著高于連作1、3 a以及小麥/馬鈴薯輪作,馬鈴薯連作3 a的Chao1顯著高于小麥/馬鈴薯輪作,馬鈴薯連作5、7 a和9 a與連作3 a和輪作處理間差異顯著。說明隨著馬鈴薯種植年限的延長(zhǎng),馬鈴薯田真菌多樣性呈上升趨勢(shì)。這與大豆連作20 a的根際土壤真菌種群的多樣性顯著高于3 a短期連作的研究結(jié)論一致[15]。
連作通常會(huì)使得土壤中真菌致病菌數(shù)量增加,植株根系釋放的分泌物也會(huì)促進(jìn)病原菌的繁殖和生長(zhǎng),同時(shí)抑制有益細(xì)菌的生長(zhǎng),使病原菌成為優(yōu)勢(shì)種群而引發(fā)土傳病害,使作物植株生長(zhǎng)發(fā)育不良而引起產(chǎn)量和品質(zhì)下降[21-22]。本研究中,從真菌屬分類水平進(jìn)行分析,馬鈴薯土壤中優(yōu)勢(shì)真菌屬包括鐮刀菌屬(Fusarium)、Nectriaceae、靈芝屬(Ganoderma)、綠僵菌屬(Metarhizium)、Lecanicillium、木生紅曲霉屬(Xylogone)、叢赤殼屬(Nectria)等致病病原菌;在我國,馬鈴薯土傳病害主要有枯萎病(Fusariumsp)、干腐病(Fusariumsp)、青枯病(Ralstoniasolanacearum)、黃萎病(Verticilliumdahliae)、黑痣病(Rhizoctoniasolani)、瘡痂病(Streptomycesscabies)、粉痂病(Spongosporasubterranean)等。已有研究顯示,鐮刀菌屬(Fusaruimspp.)是引起馬鈴薯枯萎病和干腐病的土傳病害致病菌[11]。本研究中,鐮刀菌屬在連作土壤中的豐度較高,尤其是連作第5年的土壤,這與劉星等[23]研究顯示,F(xiàn)usariumsp.、Fusariumsolani在馬鈴薯連作土壤中數(shù)量均增加的結(jié)論一致。
馬鈴薯枯萎病病原菌種類隨地域不同而有差異,其致病力也不一致。引起枯萎病的病原菌鐮刀菌(Fusariumspp.)主要有茄病鐮刀菌(F.solani)、尖孢鐮刀菌(F.oxysporum)、接骨木鐮刀菌(F.sambucinum)、雪腐鐮刀菌(F.nivale)、串珠鐮刀菌(F.moniliforme)、三線鐮刀菌,銳頂鐮刀菌(F.acuminatum)和燕麥鐮刀菌(F.avenaceum)等[24]。河北馬鈴薯枯萎病病原菌為茄病鐮刀菌、串珠鐮刀菌和尖孢鐮刀菌[25]。內(nèi)蒙古和甘肅馬鈴薯枯萎病病原菌有尖孢鐮刀菌、茄病鐮刀菌和三線鐮刀菌[25],甘肅馬鈴薯枯萎病病原菌還有燕麥鐮刀菌[26]。本研究中,馬鈴薯連作土壤中尖孢鐮刀菌(F.oxysporum)在連作5 a的土壤中大量富集,說明在甘肅定西馬鈴薯種植區(qū)內(nèi),尖孢鐮刀菌是導(dǎo)致馬鈴薯發(fā)病的主要致病菌。同時(shí),尖孢鐮刀菌也是河北、內(nèi)蒙、甘肅馬鈴薯枯萎病的主要致病菌。
然而,長(zhǎng)期連作的效果不一定是負(fù)面的,有研究發(fā)現(xiàn),作物連作可能引起拮抗菌逐年富集[27],某些有益菌數(shù)量也會(huì)增加[28],這些有益菌群通常產(chǎn)生一些激素類化合物,通過促進(jìn)作物養(yǎng)分吸收、抑制病原菌生長(zhǎng)等方式來促進(jìn)植物生長(zhǎng)。一些作物在一定連作年限后土壤逐步得到自我恢復(fù),并且連作障礙程度趨于減輕甚至消失[29]。本研究中,Ascomycota_unidentified、曲霉屬(Aspergillus)、青霉屬(Penicillum)、頭梗霉(Cephaliophora)、隱球菌屬(Cryptococcus)、剛毛四枝孢菌屬(Tetracladium)等有益菌真菌屬在不同處理的馬鈴薯根部土壤中差異顯著。其中,青霉菌在連作5、7 a和9 a的土壤中數(shù)量顯著高于輪作。青霉菌(Penicillium)參與有機(jī)物的分解,促進(jìn)土壤碳和氮的循環(huán),降解土壤中的有害物質(zhì)[30],其產(chǎn)生的代謝活性物質(zhì)對(duì)部分鐮刀菌屬(Fusarium)病原菌產(chǎn)生明顯抑制作用[31]。這有可能是鐮刀菌在連作5 a的土壤中數(shù)量達(dá)到最高,在連作7 a和9 a的土壤中數(shù)量又開始顯著降低的原因,與大豆連作20 a的土壤中,鐮孢菌數(shù)量顯著低于3 a連作的結(jié)論一致[15]。本研究中,綠僵菌屬(Metarhizium)在馬鈴薯連作5、7 a和9 a的土壤中相對(duì)豐度顯著增加。綠僵菌屬(Metarhizium)可以對(duì)植物病害產(chǎn)生拮抗作用[32],同時(shí)促進(jìn)植物對(duì)氮素營(yíng)養(yǎng)的吸收,增強(qiáng)植物抗病性[33],還可以分泌各種有機(jī)酸溶解土壤中固態(tài)磷,提高作物養(yǎng)分利用率[34]。
1)與馬鈴薯輪作農(nóng)田相比,馬鈴薯連作7 a和9 a的農(nóng)田土壤真菌菌群豐度和Chao1顯著提高,說明馬鈴薯連作7 a后,農(nóng)田土壤真菌群落的豐富度和多樣性增加。
2)對(duì)馬鈴薯土壤真菌群落的分布進(jìn)行分析,表明C7和C9真菌群落結(jié)構(gòu)相似度較高,C1、C3、C5真菌群落結(jié)構(gòu)相似度較高,C7和C9與R的真菌群落結(jié)構(gòu)差異較大,C1、C3、C5的真菌種群群落結(jié)構(gòu)介于C7、C9與R之間。說明馬鈴薯長(zhǎng)期連作會(huì)引起土壤微生物群落的變化,尤其是連作7 a真菌群落結(jié)構(gòu)發(fā)生較大改變。
3)引起馬鈴薯枯萎病的土傳致病菌鐮刀菌屬(Fusaruim)在C5中相對(duì)豐度達(dá)最高,顯著高于R、C1、C3以及C7、C9。有益菌青霉菌(Penicillum)在C5、C7和C9的土壤中數(shù)量顯著高于R。拮抗菌綠僵菌屬(Metarhizium)在C5、C7、C9中相對(duì)豐度顯著高于R、C1、C3。馬鈴薯連作5 a和7 a的農(nóng)田土壤中拮抗菌和有益菌大量富集,同時(shí),土傳病原菌在連作5 a土壤中也大量富集,但是在連作7 a和9 a土壤中數(shù)量逐漸下降。