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基于點(diǎn)突變庫(kù)研究絲切蛋白在煙曲霉抗逆性和致病力中的作用

2022-07-19 12:31:10房凌旭盧中一
關(guān)鍵詞:蠟螟丙氨酸抗逆性

房凌旭,盧中一

1. 深圳市前海蛇口自貿(mào)區(qū)醫(yī)院口腔科,廣東 深圳 518067;

2. 深圳大學(xué)高等研究院深圳市海洋微生物組工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東 深圳 518060

煙曲霉(Aspergillus fumigatus)是自然界中廣泛存在的曲霉屬真菌,其大量產(chǎn)生的分生孢子極易播散,可被人體吸入肺部,在一定條件下對(duì)免疫力低下人群產(chǎn)生致病性。煙曲霉可引起過(guò)敏性支氣管肺曲霉病、侵襲性曲霉病和慢性肺曲霉病等[1-3]。特別是煙曲霉具有較高的抗逆特性和致病力,一方面體現(xiàn)在其細(xì)胞壁的葡聚糖和幾丁質(zhì)等成分可增強(qiáng)其對(duì)宿主免疫系統(tǒng)的逃逸能力;另一方面體現(xiàn)在其具有較強(qiáng)的抗氧化能力,可抵抗巨噬細(xì)胞產(chǎn)生的活性氧簇等[4-5]。因此,研究煙曲霉抗逆性和致病力的關(guān)鍵蛋白及相關(guān)分子機(jī)制是治療煙曲霉感染的重要前提。目前,三唑類藥物是臨床上治療煙曲霉感染的一線藥物,但臨床和環(huán)境中唑類藥物及其衍生物的廣泛施用導(dǎo)致煙曲霉逐漸產(chǎn)生耐藥性問(wèn)題[6-7]。我國(guó)的一項(xiàng)研究顯示,從臨床樣品分離得到的159 株煙曲霉中,對(duì)伊曲康唑耐藥的煙曲霉陽(yáng)性率為4.4%[8];而SEWELL等[9]發(fā)現(xiàn),從英國(guó)南部收集到的178 份土壤樣品中檢測(cè)到的唑類耐藥煙曲霉陽(yáng)性率達(dá)6.7%。

絲切蛋白(Cofilin)是一種保守存在于真核生物中的肌動(dòng)蛋白結(jié)合蛋白,其通過(guò)切割肌動(dòng)蛋白絲(Factin)調(diào)節(jié)肌動(dòng)蛋白骨架重排?,F(xiàn)有研究表明,Cofilin是參與真菌抗逆機(jī)制和耐藥機(jī)制的關(guān)鍵蛋白,為具有研究?jī)r(jià)值的抗真菌藥物靶點(diǎn)[10-11]。釀酒酵母Cofilin中部分蛋白氨基酸位點(diǎn)突變可影響線粒體功能,進(jìn)而產(chǎn)生逆行信號(hào)造成部分轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因轉(zhuǎn)錄水平升高,最終引起突變株對(duì)藥物的耐受升高[12]。此外,煙曲霉Cofilin基因高轉(zhuǎn)錄水平可引起菌株內(nèi)氧化應(yīng)激相關(guān)基因和細(xì)胞壁多聚糖合成基因轉(zhuǎn)錄水平升高,提示Cofilin 在煙曲霉抗逆性和致病力方面可能具有重要作用[13]。本研究探討了Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)在煙曲霉抗逆性和致病力等方面的作用,以期為Cofilin作為治療煙曲霉感染的潛在藥物靶點(diǎn)提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1菌株 煙曲霉野生株CEA17ku80Δ(WT)由法國(guó)巴斯德研究所Jean Paul Latge'教授惠贈(zèng);煙曲霉Cofilin 點(diǎn)突變菌株S5A、D19A-R21A、E48A、K36A、K36E 和D54A 由中國(guó)人民解放軍疾病預(yù)防控制所韓黎研究員惠贈(zèng)。

1.2實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 大蠟螟幼蟲(chóng)購(gòu)自玉米蟲(chóng)農(nóng)場(chǎng)公司。選取體表光滑,顏色淺亮,體重0.3 ~ 0.35 g 的大蠟螟幼蟲(chóng)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。

1.3主要試劑 熒光白、剛果紅和FITC 偶聯(lián)的伴刀豆蛋白購(gòu)自西格瑪奧德里奇貿(mào)易有限公司;過(guò)氧化氫(H2O2)和山梨醇購(gòu)自北京國(guó)藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司;瓊脂購(gòu)自青島海博生物科技有限公司;PCR 酶體系購(gòu)自寶生物工程大連有限公司。

1.4培養(yǎng)基的配制 基礎(chǔ)營(yíng)養(yǎng)培養(yǎng)基(MM)為深圳大學(xué)高等研究院深圳市海洋微生物組工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室配制,成分包括:1 mL Trace element solution[FeSO4·7 H2O 5 g/L、ZnSO4·7 H2O 22 g/L、MnCl2·4 H2O 5 g/L、Na4EDTA 50 g/L、(NH4)6Mo7O24·4 H2O 1.1 g/L、H3BO311 g/L、CoCl2·5 H2O 1.6 g/L 和CaCl2·2 H2O 14.7 g/L]、50 mL 20 × Salt Solution 溶液(KH2PO430.4 g / L、MgSO4·7H2O10.4g/L、KCl10.4g/L 和NaNO3120g/L)、10 g 葡萄糖和15 g 瓊脂;調(diào)節(jié)MM 的酸堿度,配制成pH 10 的MM 培養(yǎng)基;在MM 中加入100 mg / L 熒光白,配制成熒光白培養(yǎng)基;在MM 中加入200 mg/L 剛果紅,配制成剛果紅培養(yǎng)基;在MM 中加入100 mg/L的H2O2,配制成H2O2培養(yǎng)基;在MM 中加入2.4 mol/L山梨醇,配制成山梨醇培養(yǎng)基。

1.5煙曲霉Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)的構(gòu)建 引物序列見(jiàn)表1,由華大基因科技有限公司合成。通過(guò)引物F1和R1(引入突變位點(diǎn)),以煙曲霉菌株CEA17ku80Δ基因組為模板擴(kuò)增Cofilin 編碼基因片段及上游同源臂(長(zhǎng)度1 000 ~ 1 500 bp),同時(shí)利用引物F2 和R2 擴(kuò)增上述基因組中Cofilin 編碼基因另一部分片段;此外,分別通過(guò)引物F3 和R3、F4 和R4 以含有篩選標(biāo)記的質(zhì)粒和煙曲霉基因組為模板,擴(kuò)增篩選標(biāo)記hph 片段及Cofilin 編碼基因下游同源臂(長(zhǎng)度1 000 ~ 1 500 bp);最終利用引物F1 和R4 將上述片段按濃度比1 ∶3 ∶3 ∶1 進(jìn)行片段融合,并采用原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化方式導(dǎo)入CEA17ku80Δ 中原位替換Cofilin編碼基因,經(jīng)篩選并使用引物seqS 和seqA 測(cè)序驗(yàn)證后獲得煙曲霉Cofilin 點(diǎn)突變株。

表1 煙曲霉Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)引物Tab.1 Primers for Cofilin point mutation library of A.fumigatus

1.6煙曲霉Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)的抗逆性檢測(cè) 通過(guò)應(yīng)激試驗(yàn)分析Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)在不同刺激下對(duì)煙曲霉抗氧化、抗高滲透壓和抗細(xì)胞壁干擾等方面的影響。將WT 和Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)煙曲霉的孢子用滅菌磷酸鹽緩沖液稀釋至5 × 107個(gè)/ mL,分別取2 μL 接種至不同成分培養(yǎng)基,在37℃下培養(yǎng)60 ~72 h 后觀察菌落生長(zhǎng)情況。

1.7煙曲霉Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)細(xì)胞壁甘露糖合成及分布的檢測(cè) 通過(guò)FITC 偶聯(lián)的伴刀豆蛋白熒光標(biāo)記Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)煙曲霉中的甘露糖,分析Cofilin點(diǎn)突變對(duì)煙曲霉細(xì)胞壁中甘露糖合成及分布的影響。用含0.01% Tween 20 的滅菌磷酸鹽緩沖液稀釋煙曲霉孢子至5 × 107個(gè)/ mL,取2 μL 接種至含2 mL MM 液體培養(yǎng)基的6 孔板(底部放置10 mm×10 mm 蓋玻片),在37 ℃下培養(yǎng)14 ~16 h;加入200 μL FITC 偶聯(lián)的伴刀豆蛋白,在30 ℃下孵育1 h;用去離子水清洗2 次,將蓋玻片取出后倒扣至含抗熒光淬滅劑的載玻片上,于熒光顯微鏡下觀察并拍照。

1.8煙曲霉Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)的致病力分析 采用大蠟螟幼蟲(chóng)感染試驗(yàn)分析Cofilin 點(diǎn)突變對(duì)煙曲霉致病力的影響。用含0.01% Tween 20 的無(wú)菌磷酸鹽緩沖液將5 × 107個(gè)/ mL 煙曲霉孢子重懸。用微量注射器將10 μL 孢子懸液注入大蠟螟幼蟲(chóng)左排最下端腹足。設(shè)2 個(gè)對(duì)照組,一組大蠟螟幼蟲(chóng)注射10 μL 含0.01% Tween 20 的無(wú)菌磷酸鹽緩沖液,另一組不做任何處理。每組16 只。注射后置于37 ℃遮光培養(yǎng),每12 h 記錄大蠟螟幼蟲(chóng)存活情況。

1.9統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 應(yīng)用GraphPad Prism 5 軟件進(jìn)行大蠟螟幼蟲(chóng)感染實(shí)驗(yàn)生存曲線及顯著性分析,P值及顯著性分析采用Log-rank(Mantel-Cox)檢驗(yàn)。以P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié) 果

2.1煙曲霉Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)的位點(diǎn)選取及構(gòu)建本實(shí)驗(yàn)構(gòu)建了煙曲霉Cofilin 點(diǎn)突變位點(diǎn)K26A、E56A、D11A-E12A、K41A-K42A 和R59A-R61A。選取的煙曲霉Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)包括:?jiǎn)挝稽c(diǎn)突變S5A(第5 位點(diǎn)絲氨酸突變?yōu)楸彼幔?、K26A(第26 位點(diǎn)賴氨酸突變?yōu)楸彼幔36A(第36 位點(diǎn)賴氨酸突變?yōu)楸彼幔?、K36E(第36 位點(diǎn)賴氨酸突變?yōu)楣劝彼幔?、E48A(第48 位點(diǎn)谷氨酸突變?yōu)楸彼幔54A(第54 位點(diǎn)天冬氨酸突變?yōu)楸彼幔?、E56A(第56 位點(diǎn)谷氨酸突變?yōu)楸彼幔┮约半p突變D11A-E12A(第11 位點(diǎn)天冬氨酸和第12 位谷氨酸均突變?yōu)楸彼幔?、D19A-R21A(第19 位點(diǎn)天冬氨酸和第21 位點(diǎn)精氨酸均突變?yōu)楸彼幔41A-K42A(第41 位點(diǎn)賴氨酸和第42 位點(diǎn)賴氨酸均突變?yōu)楸彼幔┖蚏59A-R61A(第59 位點(diǎn)精氨酸和第61 位點(diǎn)精氨酸均突變?yōu)楸彼幔?,?jiàn)圖1。篩選及測(cè)序結(jié)果表明煙曲霉Cofilin 點(diǎn)突變株構(gòu)建正確。

圖1 煙曲霉Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)中選取的突變位點(diǎn)Fig.1 Mutation sites selected from Cofilin point mutation library of A.fumigatus

2.2煙曲霉Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)的抗逆性 相比于WT,Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)中攜帶D11A-E12A、K26A、E56A 和R59A-R61A 的煙曲霉在MM 培養(yǎng)基上菌絲生長(zhǎng)能力減弱,提示Cofilin 及其部分氨基酸位點(diǎn)對(duì)煙曲霉菌絲生長(zhǎng)具有重要作用。此外,Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)中煙曲霉對(duì)細(xì)胞壁干擾劑熒光白(100 mg / L)和剛果紅(200 mg / L)的敏感性與WT 無(wú)顯著差異,提示這些Cofilin 點(diǎn)突變可能不影響煙曲霉細(xì)胞壁完整性及細(xì)胞壁相關(guān)應(yīng)激信號(hào)通路。在pH 10 的MM 培養(yǎng)基和含有山梨醇的高滲培養(yǎng)基中,Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)中煙曲霉與WT 生長(zhǎng)狀態(tài)無(wú)顯著差異,提示這些Cofilin 點(diǎn)突變未影響煙曲霉對(duì)酸堿度和高滲透壓的應(yīng)激能力。但攜帶D19A-R21A 和K36A 的煙曲霉菌株在H2O2培養(yǎng)基中菌絲的生長(zhǎng)能力強(qiáng)于WT,提示這些突變導(dǎo)致煙曲霉對(duì)外界氧化壓力的耐受水平升高;而攜帶K36E 的煙曲霉菌株在H2O2培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)受到明顯抑制,提示該突變導(dǎo)致煙曲霉對(duì)氧化壓力的耐受能力減弱。上述結(jié)果提示,Cofilin 及其部分氨基酸位點(diǎn)在煙曲霉氧化應(yīng)激信號(hào)通路中具有重要作用。見(jiàn)圖2。

圖2 煙曲霉Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)抗逆性試驗(yàn)Fig.2 Stress resistance test of Cofilin point mutants of A.fumigatus

2.3煙曲霉Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)細(xì)胞壁中甘露糖的合成及分布 熒光顯微鏡下觀察顯示,Cofilin 點(diǎn)突變菌株與WT 的甘露糖含量無(wú)明顯區(qū)別,但攜帶K36A和E56A 的煙曲霉菌株出現(xiàn)菌絲頂端甘露糖聚集現(xiàn)象,提示這些Cofilin 位點(diǎn)突變可能影響了細(xì)胞壁中甘露糖的分布,見(jiàn)圖3。

圖3 熒光標(biāo)記Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)細(xì)胞壁中的甘露糖觀察Fig.3 Microscopy of fluorescent-labeled mannose in cell walls of Cofilin point mutants

2.4煙曲霉Cofilin 點(diǎn)突變庫(kù)的致病力 S5A、D11AE12A、K36E、K41A-K42A、E48A、D54A 對(duì)大蠟螟幼蟲(chóng)的致病力與WT 相比,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2分別為0.182、0.495 9、0.124 4、0.567 5、0.068 89、0.236 6,P分別為0.613 4、0.561 6、0.724 3、0.551 3、0.793、0.626 7),提示這些Cofilin 點(diǎn)突變未顯著性影響煙曲霉對(duì)大蠟螟幼蟲(chóng)的致病力。此外,與WT 相比,D19A-R21A、K26A 和K36A 使煙曲霉對(duì)大蠟螟幼蟲(chóng)的致病力顯著增強(qiáng)(χ2分別為5.364、6.6、13.39,P分別為0.020 6、0.010 2、0.000 2),而E56A 和R59AR61A 使煙曲霉對(duì)大蠟螟幼蟲(chóng)的致病力顯著減弱(χ2分別為4.443、4.18,P分別為0.035 1、0.040 9)。上述結(jié)果顯示,Cofilin 及其部分氨基酸位點(diǎn)對(duì)煙曲霉的致病力具有重要作用。見(jiàn)圖4。

圖4 大蠟螟幼蟲(chóng)感染試驗(yàn)分析Cofilin 點(diǎn)突變對(duì)煙曲霉致病力的影響Fig.4 Analysis of effect of Cofilin point mutation on virulence of A.fumigatus by infection test in Galleria mellonella larval

3 討 論

蛋白間相互作用是蛋白行使生物學(xué)功能的重要方式,而蛋白表面的電荷分布是決定蛋白間相互作用的關(guān)鍵因素[14]。本研究利用丙氨酸掃描構(gòu)建的點(diǎn)突變庫(kù)揭示了Cofilin 在煙曲霉抗逆性和致病力等方面的作用。丙氨酸掃描是將蛋白表面帶電荷的氨基酸突變?yōu)楸彼幔栽u(píng)估蛋白功能及關(guān)鍵活性位點(diǎn)等。由于丙氨酸體積小且不帶電荷,通常認(rèn)為丙氨酸掃描僅改變蛋白表面的電荷分布而不影響蛋白結(jié)構(gòu)[15-17]。本研究選擇了煙曲霉Cofilin 中N-端的帶電荷氨基酸,由于Cofilin 的N-端存在保守的磷酸化位點(diǎn)(已證明在煙曲霉Cofilin 的第五位絲氨酸[13]),而該位點(diǎn)附近的蛋白表面可能與Cofilin 上游調(diào)控蛋白的磷酸激酶和去磷酸酶存在相互作用,因此該處帶電荷表面具有重要的生物學(xué)活性[18]。本研究中選取位點(diǎn)主要基于以下考慮:①Cofilin 是煙曲霉必需基因,過(guò)多的位點(diǎn)突變更易造成蛋白失活使菌株死亡,不利于點(diǎn)突變庫(kù)的構(gòu)建;②進(jìn)行常規(guī)的多位點(diǎn)同時(shí)突變后,往往需要在突變框內(nèi)進(jìn)行下一輪單位點(diǎn)或雙位點(diǎn)突變以確定關(guān)鍵功能位點(diǎn),并不能根本性降低工作量;③本研究?jī)H選取感興趣的Cofilin N-端進(jìn)行突變,整體點(diǎn)突變工作量不大;④位點(diǎn)的選取主要參照了前人對(duì)釀酒酵母Cofilin位點(diǎn)的研究工作,以便進(jìn)行研究工作的橫向比較[12];⑤選取的氨基酸位點(diǎn)主要集中于α 螺旋和β 折疊等蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)區(qū)域,以便分析剛性區(qū)域在Cofilin生物學(xué)功能中的重要作用。其中,單位點(diǎn)突變包括S5A、K26A、K36A、K36E、E48A、D54A 和E56A,其中S5A 用來(lái)模擬Cofilin 去磷酸化過(guò)程,K26 用來(lái)分析曲霉屬保守的Loop 區(qū)域中帶電荷氨基酸位點(diǎn)的生物學(xué)功能,K36、E48、D54 和E56 的選取參考釀酒酵母Cofilin 的研究[12]。此外,本研究引入了K36E 作為K36A 的對(duì)照,以便分析不同突變模式在研究蛋白關(guān)鍵帶電荷氨基酸功能中的作用。對(duì)于雙突變位點(diǎn),本研究選取了D11A-E12A、D19A-R21A、K41AK42A 和R59A-R61A,這些位點(diǎn)的選取參照了前人研究中釀酒酵母的Cofilin 點(diǎn)突變模式,可能參與調(diào)節(jié)線粒體功能[12]。

本研究結(jié)果顯示,Cofilin 點(diǎn)突變D11A-E12A、K26A、E56A 和R59A-R61A 可減弱煙曲霉菌絲的生長(zhǎng)能力,該現(xiàn)象的產(chǎn)生可能與點(diǎn)突變Cofilin 調(diào)控細(xì)胞骨架actin 功能的異常有關(guān)?,F(xiàn)有研究證實(shí),Cofilin表面的帶電荷氨基酸對(duì)actin 有直接的調(diào)節(jié)作用。如釀酒酵母Cofilin 中氨基酸位點(diǎn)D10 和E11(分別對(duì)應(yīng)煙曲霉Cofilin 中的D11 和E12)參與對(duì)細(xì)胞骨架actin 的調(diào)節(jié)功能,因此這些位點(diǎn)的突變可導(dǎo)致細(xì)胞骨架actin 形態(tài)異常[12]。其他研究顯示,actin 與細(xì)胞的極性生長(zhǎng)具有重要功能聯(lián)系[11]。上述研究提示,Cofilin 及其部分帶電荷氨基酸可通過(guò)調(diào)節(jié)actin的生物學(xué)功能影響煙曲霉菌絲的極性生長(zhǎng)能力。

JIA 等[13]研究發(fā)現(xiàn),Cofilin基因轉(zhuǎn)錄水平升高可導(dǎo)致煙曲霉氧化應(yīng)激能力增強(qiáng),提示Cofilin 可能參與煙曲霉的氧化應(yīng)激信號(hào)通路。本研究進(jìn)一步證實(shí),Cofilin 中的帶電荷氨基酸位點(diǎn)可能是該蛋白在煙曲霉氧化應(yīng)激中行使功能的分子基礎(chǔ)。值得注意的是,本研究發(fā)現(xiàn),K36E 與K36A 對(duì)H2O2的耐受能力不同,提示該位點(diǎn)及附近的帶電荷氨基酸(或化學(xué)側(cè)鏈)可能調(diào)控了Cofilin 在煙曲霉氧化應(yīng)激信號(hào)通路中的功能。同時(shí)也提示,除常見(jiàn)的丙氨酸和亮氨酸等點(diǎn)突變模式外,對(duì)蛋白中帶電荷氨基酸進(jìn)行反向電荷突變有助于對(duì)關(guān)鍵氨基酸功能及其分子機(jī)制的研究。

有研究發(fā)現(xiàn),Cofilin基因轉(zhuǎn)錄水平升高可導(dǎo)致煙曲霉細(xì)胞壁中β-1,3-葡聚糖和幾丁質(zhì)等合成的增加,提示Cofilin 在煙曲霉細(xì)胞壁多糖的合成及細(xì)胞壁完整性信號(hào)通路中具有重要作用[13]。雖然本研究中的Cofilin 點(diǎn)突變對(duì)細(xì)胞壁中甘露糖的合成量無(wú)明顯影響,但K36A 和E56A 可引起甘露糖在煙曲霉菌絲頂端的聚集,這種現(xiàn)象可能與細(xì)胞壁完整性信號(hào)通路或菌絲的極性生長(zhǎng)有關(guān)。

本研究發(fā)現(xiàn),Cofilin 點(diǎn)突變可影響煙曲霉對(duì)大蠟螟幼蟲(chóng)的致病能力,其中D19A-R21A、K26A 和K36A 導(dǎo)致煙曲霉對(duì)大蠟螟幼蟲(chóng)的致病力顯著增強(qiáng),產(chǎn)生這種現(xiàn)象的原因是這些點(diǎn)突變可能提高了煙曲霉中線粒體的功能活性。其依據(jù)為釀酒酵母Cofilin 中的雙突變D18A-R20A(對(duì)應(yīng)于煙曲霉Cofilin 的D19A-R21A)可導(dǎo)致線粒體功能異?;钴S,而有研究證實(shí),在格特隱球菌中,線粒體活性升高增強(qiáng)真菌的致病力[19]。此外,本研究同時(shí)發(fā)現(xiàn),E56A 和R59A-R61A 引起煙曲霉對(duì)大蠟螟幼蟲(chóng)的致病力減弱,這一現(xiàn)象可能與這些菌株的菌絲生長(zhǎng)能力減弱有關(guān)。

綜上所述,本研究通過(guò)點(diǎn)突變庫(kù)揭示了Cofilin及其氨基酸位點(diǎn)在煙曲霉抗逆性和致病力等方面具有關(guān)鍵作用,其相關(guān)的分子機(jī)制應(yīng)是進(jìn)一步研究的重點(diǎn)。隨著研究的不斷深入,Cofilin 作為治療煙曲霉及其他致病真菌感染的潛在藥物靶點(diǎn)將具有廣闊的發(fā)展前景。

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