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減源處理下小麥粒重穩(wěn)定性QTL的定位分析

2022-05-23 03:29呂棟云張傳量宋鵬博姚儉昕王笑笑孫道杰
麥類作物學報 2022年4期
關(guān)鍵詞:粒重等位基因表型

周 鋒,楊 虓,呂棟云,張傳量,宋鵬博,姚儉昕,王 鑫,王笑笑,孫道杰

(1.西北農(nóng)林科技大學農(nóng)學院,陜西楊凌 712100; 2.隴東學院農(nóng)林科技學院,甘肅慶陽 745000)

葉片是小麥進行光合作用的主要器官,特別是旗葉對小麥后期的生長發(fā)育及光合產(chǎn)物的積累至關(guān)重要。而環(huán)境改變、自然災害頻發(fā)、銹病、蚜蟲等因素會不可避免地傷害到葉片,從而降低光合產(chǎn)物的合成,導致小麥產(chǎn)量下降,因此,研究小麥在減源條件下影響產(chǎn)量穩(wěn)定性的機制對于確保小麥穩(wěn)產(chǎn)具有重要意義。

多年來,國內(nèi)外學者對小麥的光合作用與產(chǎn)量間的關(guān)系做了大量研究。王義芹等發(fā)現(xiàn),旗葉光合速率和旗葉面積的乘積與生物產(chǎn)量和經(jīng)濟產(chǎn)量之間呈顯著正相關(guān);馮建波等發(fā)現(xiàn),小麥葉面積指數(shù)與產(chǎn)量之間呈顯著正相關(guān),可以通過葉面積指數(shù)的合理調(diào)控來提高小麥的產(chǎn)量;沈新磊通過改變冬小麥源庫大小,分析源庫對產(chǎn)量的影響,發(fā)現(xiàn)去旗葉后千粒重降低不顯著,而其余去葉處理使千粒重顯著降低,推測這與去旗葉傷害后產(chǎn)生的超補償作用有關(guān);劉萬代等研究發(fā)現(xiàn),剪葉可提高剩余葉片的光合速率;張冰晶分析了衰老與非衰老小麥旗葉在基因轉(zhuǎn)錄水平的差異,發(fā)現(xiàn)與衰老轉(zhuǎn)錄因子相關(guān)的microRNA對于調(diào)控葉片衰老有重要作用。因此,協(xié)調(diào)好源庫關(guān)系,提高作物葉片的光合能力,有利于提高作物的產(chǎn)量潛力。

不同時期旗葉缺失或受到傷害均會造成小麥嚴重減產(chǎn),許多災害都會傷害到葉片,特別是旗葉受到傷害后,將大大減少“源”的大小,從而影響產(chǎn)量。小麥產(chǎn)量三要素中,相對于單位面積穗數(shù)和穗粒數(shù),千粒重受遺傳特性的影響最大,遺傳改良效果也最為顯著。而粒長、粒寬與粒重具有較高的相關(guān)性,對小麥的產(chǎn)量具有潛在的影響。前人發(fā)現(xiàn)控制小麥粒重的QTL幾乎覆蓋小麥所有染色體,但減源處理后有關(guān)粒重穩(wěn)定性的QTL研究報道較少。本研究在早播和晚播條件下,通過對減源處理和正常處理的小麥千粒重、粒長和粒寬進行比較分析,挖掘出減源處理下小麥粒重保持穩(wěn)定的QTL,以期為逆境脅迫條件下小麥分子標記輔助育種提供幫助。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

以優(yōu)良品種小偃81和西農(nóng)1376為親本構(gòu)建的包含190個株系的F代RIL群體為材料。其中,西農(nóng)1376是王輝教授課題組選育的結(jié)實性好、單穗粒重高的高產(chǎn)小麥品種;小偃81是李振聲院士選育的高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、多穗型品種。

1.2 田間試驗與性狀測定

于2019年10月1日進行早播,每株系種植2行,隨機區(qū)組設(shè)計,小區(qū)行長1.35 m,行距 0.25 m,2次重復;于2019年11月1日進行晚播,每株系種植2行,隨機區(qū)組設(shè)計,小區(qū)行長 0.65 m,行距0.25 m,2次重復。于開花后,各株系取3株靠近每行中部的植株,剪去旗葉,用紅繩標記,作為減源處理。于小麥成熟后取減源處理的主穗,同時取3個靠近行中部未去葉的主穗作對照處理。分別將早播減源處理、晚播減源處理、早播對照處理、晚播對照處理記為E1、E2、CK1、CK2。穗脫粒曬干后,用萬深SC-G考種儀測量粒長、粒寬和千粒重。以減源處理和對照處理間的性狀值之比作為小麥減源處理后維持產(chǎn)量相關(guān)性狀穩(wěn)定的指標,比值越高,則說明穩(wěn)定性越好,比值越低,則說明減源處理后各性狀降低幅度越大,穩(wěn)定性越差。

1.3 數(shù)據(jù)處理

用SPSS 26.0軟件統(tǒng)計分析數(shù)據(jù),并利用獨立樣本檢驗功能進行差異性分析。利用ICIMapping的ANONA功能,根據(jù)多環(huán)境的表型數(shù)據(jù),計算性狀的最優(yōu)線性無偏估計值(best linear unbiased estimation,BLUE),并計算出遺傳力。

1.4 QTL分析

利用姚儉昕基于50K芯片構(gòu)建得到的QTL圖譜,該圖譜包含10 845個SNP標記,覆蓋21條染色體,全長4 340.81 cM,相鄰標記的平均距離為0.40 cM。使用IciMapping 4.2中的完備復合區(qū)間作圖法(ICIM)對QTL進行定位,經(jīng) 1 000次模擬計算后得到LOD值,以LOD≥2.5為閾值判斷QTL是否存在。

2 結(jié)果與分析

2.1 表型分析結(jié)果

在不同播期不同處理下,小偃81和西農(nóng)1376間的粒長和千粒重差異均達到極顯著水平,粒寬差異達到顯著水平(表1)。同一播期不同處理下,RIL群體減源處理的粒長、粒寬和千粒重平均值均顯著低于對照處理,但同一播期減源處理的粒長、粒寬和千粒重的變異系數(shù)均高于對照處理,說明減源處理導致籽粒的粒長、粒寬和千粒重降低,但表型變異范圍增大。RIL群體表型均值都介于兩親本之間,每個性狀都存在超親分離現(xiàn)象,偏度的絕對值和峰度的絕對值都小于1;在減源處理和對照處理的表型比值中,除粒長比外,兩親本間的粒寬比和千粒重比差異均達極顯著水平(除晚播條件下,粒寬比差異達顯著水平),峰度和偏度的絕對值也基本都小于1。這說明粒長、粒寬、千粒重及其表型比值均符合正態(tài)分布,是由多基因控制的數(shù)量性狀,符合QTL作圖要求。

表1 不同處理下小麥RIL群體表型統(tǒng)計分析Table 1 Statistical analysis of phenotype of wheat RIL population under different treatments

由方差分析結(jié)果(表2)可以看出,基因型和環(huán)境對各性狀的影響均達到了極顯著水平,表明這6個性狀是復雜的數(shù)量性狀,受基因型和環(huán)境共同影響。粒長、粒寬、千粒重、粒長比、粒寬比、千粒重比的遺傳力分別為0.88、0.85、0.86、 0.52、0.61和0.60,相較于粒長、粒寬和千粒重,表型之比受環(huán)境的影響較大。相關(guān)性分析結(jié)果(表3)表明,粒長、粒寬和千粒重在相同處理或減源處理與對照處理間均呈顯著正相關(guān)(除了減源處理后的粒寬和對照處理的粒長不顯著外),三個性狀比值與對照處理的同種性狀(除千粒重外)均呈顯著或極顯著負相關(guān),與減源處理的同種性狀均呈極顯著正相關(guān)。

表2 小麥RIL群體各性狀方差分析(F值)Table 2 Variance analysis of traits in the wheat RIL population(F value)

表3 小麥RIL群體相關(guān)性分析Table 3 Correlation analysis of traits in the wheat RIL population

2.2 QTL定位結(jié)果

共檢測到18個控制小麥粒長、粒寬、千粒重、粒長比、粒寬比和千粒重比的QTL,分布在2A、3A、3B、3D、4B、4D和5D染色體上,單個QTL可解釋1.29%~41.04%的表型變異,LOD值范圍為2.53~57.59(表4和圖1)。

表4 小麥RIL群體各性狀QTL定位Table 4 QTLs for various traits in wheat RIL population

定位分析發(fā)現(xiàn),有3個QTL僅在晚播減源處理下檢測到,其中、的增效等位基因來自母本西農(nóng)1376;的增效等位基因來自父本小偃81。有3個QTL僅在對照處理下檢測到,其中(晚播條件下檢測到)的增效等位基因來自母本西農(nóng)1376;和(早播條件下檢測到)的增效等位基因來自父本小偃81。有8個QTL在對照處理和減源處理下均被檢測到,其中、、、和的增效等位基因來自母本西農(nóng)1376;、和的增效等位基因來自父本小偃81。

檢測到7個控制粒長的QTL,分布在2A、3A、3D、4B和5D染色體上,其中、、和的增效等位基因來自西農(nóng)1376,、和的增效等位基因來自于小偃81。、、和均在多個處理中被檢測到,平均可解釋2.46%、4.87%、4.43%、5.73%和8.73%的表型變異,為微效QTL。、和均僅在一個處理中被檢測到,分別可解釋2.46%、41.04%和12.35%的表型變異,和為主效QTL。

共檢測到3個控制粒寬的QTL,分布在4B、4D和5D染色體上,其中的增效等位基因來自西農(nóng)1376,和的增效等位基因來自小偃81。在5個處理中均被檢測出,平均可解釋13.41%的表型變異,為主效QTL。和均僅在一個處理中被檢測到,分別可解釋6.75%和5.39%的表型變異,為微效QTL。

圖1 控制粒長、粒寬、千粒重和表型比值的QTL在染色體上的分布

共檢測到4個控制千粒重的QTL,分布在3B、4B、4D和5D染色體上,其中、和的增效等位基因來自西農(nóng)1376,的增效等位基因來自小偃81。、和均在多個處理中能被檢測到,平均可解釋3.49%、7.20%和8.19%的表型變異。僅在一個處理中被檢測到,可解釋6.38%的表型變異。這4個QTL均為微效QTL。

分別檢測到2、1和1個控制粒長比、粒寬比和千粒重比的QTL,分布在2A、3D和5D染色體上,增效等位基因均來自于西農(nóng)1376,可解釋 6.31%~16.33%的表型變異。檢測到的QTL均在一個處理中被檢測到,其中可解釋14.43%的表型變異,為主效QTL。

3 討 論

了解次優(yōu)條件下的產(chǎn)量穩(wěn)定性和作物表現(xiàn)是縮小產(chǎn)量差距的關(guān)鍵,旗葉為籽粒灌漿貢獻了45%~58%的光合活性和41%~43%的碳水化合物,但外在環(huán)境因素的不穩(wěn)定性會導致旗葉缺失或受傷,進而造成減產(chǎn)。前人探索不同處理下農(nóng)作物性狀間的關(guān)系多為尋找處理間差值QTL,如馮 躍等通過不同施氮水平間各性狀的差值,挖掘到4個水稻耐低氮相關(guān)遺傳位點;李 超等定位到5個在油脂合成中對環(huán)境敏感的差值QTL,為找到甘藍型油菜中對環(huán)境鈍感的含油量相關(guān)基因奠定基礎(chǔ);穆 平等對水稻產(chǎn)量性狀在低磷脅迫下與對照的差值進行QTL定位,共定位到17個耐低磷QTL。上述文獻中所尋找的差值QTL為環(huán)境頓感基因,差值越大,表明對環(huán)境越敏感,耐性越低。本研究采用減源處理與對照處理獲得的表型比值來衡量環(huán)境頓感基因,如果減源處理與對照處理的表型比值越接近1,說明此性狀越穩(wěn)定。利用表型比值挖掘相關(guān)的QTL,為旗葉缺失后小麥穩(wěn)產(chǎn)育種提供基礎(chǔ)。在小麥灌漿期間,不同分蘗之間是否有明顯的同化物交流,目前還未見相關(guān)報道。本研究中西農(nóng)1376在早播條件下減源處理后粒寬和千粒重大于對照處理的情況,在沈新磊的研究中也有同樣的現(xiàn)象,推測是植株在旗葉受到傷害后由于超補償作用所導致。

本研究在減源處理和對照處理下,共檢測到18個控制粒長、粒寬、千粒重以及表型比的QTL,其中減源處理下檢測到11個,對照處理下檢測到11個,同時在減源處理和對照處理下檢測到8個。有3個QTL僅在對照處理下檢測到,說明這些QTL在去旗葉后不會表達;有3個QTL僅在減源處理下檢測到,說明這些QTL僅在去旗葉后開始表達,推測為控制小麥籽粒補償效應(yīng)的QTL,在旗葉受傷或缺失后可保持籽粒相關(guān)性狀的穩(wěn)定性。共檢測到4個表型比QTL,其中控制粒長比的和控制千粒重比的均與控制粒長(、、)、粒寬()和千粒重()的QTL定位區(qū)間部分重疊,其中可解釋14.43%的表型變異,為主效位點;控制粒長比的與控制粒長的位點定位區(qū)間部分重疊,且與Cabral等發(fā)現(xiàn)的控制粒重的位點定位區(qū)間部分重疊??刂屏挶鹊呐c控制粒長的相距較近,與Mangini等發(fā)現(xiàn)的、和位點也較近。推測這些QTL與產(chǎn)量相關(guān)性狀緊密連鎖或存在“一因多效”現(xiàn)象。

本研究共定位到14個控制粒長、粒寬和千粒重的QTL,分布在2A、3A、3B、3D、4B、4D和5D染色體上。前人研究中沒有發(fā)現(xiàn)與控制粒長的和有重疊的定位區(qū)間,推測可能是本研究發(fā)現(xiàn)的新位點。其中可解釋41.04%的表型變異,為主效QTL。在3B染色體上發(fā)現(xiàn)的控制千粒重的與Cabral等和Liu等發(fā)現(xiàn)的控制粒重的QTL距離相近,且均在Xie等發(fā)現(xiàn)的控制粒重的和控制籽粒體積的定位區(qū)間內(nèi)。在3D染色體上發(fā)現(xiàn)的控制粒長的與Liu等發(fā)現(xiàn)的控制千粒重的定位區(qū)間重疊,與部分重疊;與Cabral等發(fā)現(xiàn)的控制粒寬的定位區(qū)間部分重疊。在4B染色體上發(fā)現(xiàn)的控制粒長的與控制千粒重的定位區(qū)間相距41 Mb,其中可解釋12.35%的表型變異,為主效QTL,包含在Xin等發(fā)現(xiàn)的控制粒寬的定位區(qū)間內(nèi);控制粒寬的與Wu等發(fā)現(xiàn)的控制粒長的和Suzuki等發(fā)現(xiàn)的控制千粒重的QTL定位區(qū)間部分重疊;控制千粒重的包含在Xin等發(fā)現(xiàn)的控制粒寬的定位區(qū)間內(nèi),與Cheng等發(fā)現(xiàn)的控制粒厚的定位區(qū)間部分重疊,在該區(qū)間內(nèi)也包含Mangini等發(fā)現(xiàn)的控制粒寬的。在4D染色體上發(fā)現(xiàn)的控制粒寬的和控制千粒重的均在5個處理中被檢測到,并且區(qū)間完全重疊,與Cabral等發(fā)現(xiàn)的控制粒重的和Cui等發(fā)現(xiàn)的粒重相關(guān)的條件位點定位區(qū)間部分重疊。在5D染色體上發(fā)現(xiàn)的控制粒長的包含在Cui等發(fā)現(xiàn)的粒重相關(guān)的條件位點定位區(qū)間中;控制粒長的包含在Liu等發(fā)現(xiàn)的控制千粒重的定位區(qū)間內(nèi);控制粒長的、控制粒寬的和控制千粒重的三者定位區(qū)間幾乎完全重疊,前人也在5D染色體上定位到控制粒寬和千粒重的QTL,但因為使用標記類型不同,無法查證與本研究結(jié)果的一致性,推測是新發(fā)現(xiàn)的位點。

綜上所述,本研究在減源處理和對照處理下分別檢測到3個獨有QTL,在減源處理和對照處理中同時檢測到8個QTL。分別定位到控制粒長比(、)、粒寬比()和千粒重比()的位點,其中為主效QTL。定位到新發(fā)現(xiàn)的位點有5個,分別為、、、和,其中僅在晚播減源處理中被檢測到,可解釋 41.04%的表型變異,為主效QTL;、和在減源處理和對照處理中均能被檢測到,為穩(wěn)定QTL。挖掘這些QTL對研究小麥在多變的環(huán)境中因旗葉傷害導致的減產(chǎn)具有一定的幫助,為小麥分子標記輔助育種提供依據(jù)。

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