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基于網(wǎng)絡藥理學探討葛根芩連湯治療放射性腸炎的作用機制

2022-04-19 00:39:00張思萌夏曉萌吳登斌
中國藥物經(jīng)濟學 2022年3期
關鍵詞:連湯葛根芩腸炎

朱 旭 張 博 張思萌 夏曉萌 吳登斌*

2017年中國惡性腫瘤流行病學分析,每年至少49.9萬例新發(fā)盆腔惡性腫瘤[1],其中20%~60%需要放射治療[2]。由于小腸上皮細胞對放療高度敏感,放射性腸炎是放射治療過程中的主要并發(fā)癥,是小腸和大腸在接受放射治療過程中出現(xiàn)的放射性損傷炎癥反應[3]。其表現(xiàn)為急性或慢性腹瀉、便血和里急后重,嚴重影響腫瘤患者的生命質(zhì)量。放射性腸炎成為直腸癌等腹部腫瘤放射劑量增加的限制性因素。漢代名醫(yī)張仲景在《傷寒雜病論》中對葛根芩連湯進行了詳細描述,方劑由葛根、黃芩、黃連及甘草4味中藥組成,主治太陽表證、協(xié)熱下利,是治療濕熱所致腹瀉和痢疾的經(jīng)典方。近年來發(fā)現(xiàn)其治療放射性腸炎腸道濕熱證療效較好[4-7]。本研究運用網(wǎng)絡藥理學方法就葛根芩連湯治療放射性腸炎的作用機制進行分析?,F(xiàn)報道如下。

1 資料與方法

1.1 收集葛根芩連湯活性成分、作用靶點等信息

以“葛根、黃芩、黃連、甘草”為關鍵詞,在中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫和分析平臺(TCMSP)進行檢索,以每味中草藥的化學成分、類藥性(DL)≥0.18、口服生物利用度(OB)≥30%為篩選依據(jù),對藥物的有效成分進行篩選。然后在數(shù)據(jù)庫內(nèi)以有效成分為依據(jù)進行檢索,對其作用靶點進行確定。然后在Uniprot數(shù)據(jù)庫內(nèi)導入作用靶點,進行基因標準化處理。

1.2 方法

1.2.1 葛根芩連湯共同作用靶點的篩選 將葛根芩連湯通過基因標準化處理得到的基因名稱全部導入Excel表格中,取交集函數(shù),篩出葛根芩連湯共同作用靶點,并對“葛根芩連湯潛在作用靶點”用imageGP工具繪制韋恩圖。

1.2.2 收集放射性腸炎靶點信息 以放射性腸炎相關的靶點、"radiation enteritis" "radiation enteropathy"為關鍵詞在GeneCards數(shù)據(jù)庫內(nèi)進行檢索,然后合并兩個數(shù)據(jù)庫檢索出的靶點,再在Uniprot數(shù)據(jù)庫內(nèi)導入作用靶點,進行基因標準化處理。

1.2.3 收集葛根芩連湯治療放射性腸炎靶點及分析 在Excel表格中導入放射性腸炎背景網(wǎng)絡及葛根芩連湯的作用靶點,取交集,得到葛根芩連湯治療放射性腸炎的共同潛在基因靶點。再將共同作用的靶點、靶點所對應的葛根芩連湯活性成分、葛根芩連湯分別導入Cytoscape3.7.2軟件中,構建“葛根芩連湯-治療成分-靶點-放射性腸炎網(wǎng)絡圖”,對網(wǎng)絡節(jié)點的重要性通過Cytoscape3.7.2中“NetworkAnalyzer”功能對自由度(Degree)等網(wǎng)絡拓撲參數(shù)進行分析。

1.2.4 構建靶蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡及擴充靶蛋白

在String數(shù)據(jù)庫內(nèi)輸入獲得的放射性腸炎治療的作用靶點,物種選擇“Home sapiens”,模式選擇“multiple proteins”,在默認設置下,得到PPI網(wǎng)絡,通過Cytoscape 3.7.2中“NetworkAnalyzer”功能對所獲取數(shù)據(jù)進行Degree等網(wǎng)絡拓撲參數(shù)分析。

1.2.5 GO富集分析和KEGG通路富集分析

在DAVID 6.8數(shù)據(jù)庫內(nèi)輸入擴充靶點及葛根芩連湯治療放射性腸炎的共同作用靶點,分別進行GO富集分析、KEGG通路富集分析,將所獲得的結果導入Excel表格,篩選設定P≤0.05,根據(jù)P值將GO生物過程和KEGG 通路由小到大排序,選取前10位的GO生物過程和KEGG通路,利用imageGP工具繪制葛根芩連湯治療放射性腸炎主要GO生物過程氣泡圖和葛根芩連湯治療放射性腸炎的KEGG通路氣泡圖。

2 結果

2.1 葛根芩連湯作用靶點信息收集

共篩選出128個有效活性成分,其中葛根、黃芩、黃連、甘草分別為3個、31個、9個、88個,葛根芩連湯的主要活性成分見表1。在TCMSP數(shù)據(jù)庫內(nèi)輸入128個有效成分,得到潛在作用靶點2 191個。通過Excel刪除重復值,得到261個基因靶點是葛根芩連湯共同的潛在作用靶點。

表1 葛根芩連湯主要活性成分

2.2 葛根芩連湯治療放射性腸炎靶點的收集及網(wǎng)絡構建和分析

獲得人類放射性腸炎相關靶點共41個。取交集后得到相關靶點基因8個,分別為TGFB1,NOS2,EGF,IL-6,MMP1,THBD,SERPINE1,MPO(圖1)。

圖1 葛根芩連湯與人類放射性腸炎共作用靶點

2.3 靶PPI網(wǎng)絡的構建

PPI網(wǎng)絡包含78個節(jié)點,1 196條邊(節(jié)點間的相互作用關系),平均Degree值為30.7。此網(wǎng)絡中Degree 值大于等于30的從高到低排序依次為IL-6,VEGFA,EGF,TNF,IGF1,CXCL8,SRC,EGFR,MMP9,SERPINE1,TGFB1,TIMP1,STAT3,IL-10,ERBB2,IL-4,PLG,CCL2,HRAS(圖2)。

圖2 葛根芩連湯關鍵靶點PPI網(wǎng)絡

2.4 GO和KEGG通路分析結果

得到20個生物過程(GO)前10位的分別為細胞遷移的正向調(diào)控,MAPK信號通路,細胞黏附,上皮細胞的增殖,白細胞遷移,蛋白轉運的正向調(diào)節(jié),信號受體活動的正向調(diào)節(jié),miRNA基因沉默機制中的產(chǎn)物,調(diào)節(jié)上皮細胞的凋亡,細胞外基質(zhì)組織(圖3)。得到16條KEGG通路,前5位的分別為細胞分化的負向調(diào)控,凋亡信號通路,RNA聚合酶Ⅱ正向調(diào)控pri-miRNA轉錄,多細胞生物的體內(nèi)平衡,上皮細胞遷移的調(diào)節(jié)(圖4)。

圖3 GO生物過程

圖4 KEGG通路氣泡圖

通過GO富集分析顯示黏附斑激酶(FAK)及其信號通路,人巨細胞病毒感染,感染性腸道疾病,Th17細胞分化,胃癌,Rap1信號通路,relaxin信號通路,細胞因子-細胞因子受體相互作用,MAPK信號通路,胰腺癌,PI3K-Akt信號通路,foxo信號通路,乙型肝炎病毒,HIF-1信號通路,膀胱癌,AGE-RAGE信號通路在糖尿病并發(fā)癥中,腫瘤蛋白多糖,EGFR酪氨酸激酶抑制劑等,是葛根芩連湯治療放射性腸炎的作用機制(圖5)。

圖5 GO富集分析

3 討論

近年的研究認為放射性腸炎的發(fā)生與腸上皮細胞的直接損傷,腸道微生物黏膜屏障破壞,輻射誘發(fā)細胞因子介導的腸道炎癥等機制有關[8]。多年的臨床實踐發(fā)現(xiàn)葛根芩連湯對于預防和治療腸道炎癥能夠起到一定的作用[9-10]?,F(xiàn)代藥理研究表明葛根芩連湯能降低血清IL-6、TNF-α的表達,減輕腸道炎癥反應[11],調(diào)控MMP-9/P38MARK途徑減輕腸道黏膜損傷,修復腸道黏膜上皮屏障等[12]。

本研究從網(wǎng)絡藥理學角度對葛根芩連湯治療放射性腸炎的作用機制進行探討,網(wǎng)絡分析顯示葛根芩連湯共有活性成分128種,GO富集分析以及KEGG通路富集分析結果顯示,葛根芩連湯對放射性腸炎損傷修復可能的機制最主要的首先包括FAK及其信號通路,F(xiàn)AK是一種酪氨酸激酶,可以通過刺激胞內(nèi)PI3K-Akt信號通路影響下游foxo信號通路,調(diào)節(jié)HIF-1信號通路以及影響Ras/MAPK等信號通路,調(diào)控細胞的生長。其次是MAPK信號通路,通過促進上皮細胞的增殖,調(diào)節(jié)上皮細胞的凋亡、遷移,結合惡性腫瘤的臨床分析推測,葛根芩連湯治療放射性腸炎的機制首先與FAK及其信號通路、MAPK通路相關的促進上皮細胞的損傷修復有關。再次,葛根芩連湯對炎癥反應的影響,通過調(diào)控Th17細胞分化實現(xiàn),Th17細胞與Th1/Th2細胞同屬免疫調(diào)節(jié)性T細胞,參與腸道炎癥反應,具有促炎癥、致炎作用?;谀壳暗木W(wǎng)絡藥理學分析認為葛根芩連湯可能通過促進上皮細胞的修復,調(diào)節(jié)免疫細胞分化,治療放射性腸炎。近年來研究表明,腸道微環(huán)境中,腸上皮細胞、免疫細胞與腸道菌群是3個相互影響、密切相關的群體[13],腸道微生物群維持上皮屏障的完整性并構建黏膜免疫系統(tǒng),上皮細胞通過構建化學和物理屏障將腸道微生物與腸壁分離,從而構建宿主共生關系,腸道免疫細胞參與維持健康的微生物群和加強上皮屏障功能,因此推斷,葛根芩連湯在影響了上皮細胞的修復和免疫細胞的分化同時,會對腸道菌群產(chǎn)生影響。作為一種治療腹瀉的經(jīng)典方劑,研究表明葛根芩連湯可以通過改變腸道內(nèi)有益菌數(shù)量發(fā)揮治療疾病的作用[14]。但對于治療放射性腸炎是否有影響,還知之甚少,也是未來可以研究的方向。

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