趙婷,宋穎,張喜蓮
天津中醫(yī)藥大學第一附屬醫(yī)院,國家中醫(yī)針灸臨床醫(yī)學研究中心 天津 300193
腺樣體(adenoidal)位于鼻咽頂后壁中線處,是Waldeyer淋巴環(huán)中四大扁桃腺群之一,又稱為咽扁桃體或增殖體,屬于人體的外周免疫器官,是呼吸道第一道防線,腺樣體在正常兒童2~6歲時會出現(xiàn)生理性肥大,經(jīng)多種因素刺激導致腺樣體病理性增生稱為腺樣體肥大(adenoid hypertrophy,AH)[1]。AH是一種兒童常見病,發(fā)病率為9.9%~29.9%[2],AH會造成氣道阻塞,并繼發(fā)多種并發(fā)癥。臨床常采用腺樣體切除手術(shù)治療AH,但手術(shù)治療可能會導致上呼吸道功能缺失,損傷人體免疫功能[3],且存在全麻、復發(fā)等風險。因此,臨床上越來越多的家長愿意接受非手術(shù)的保守治療。
西醫(yī)的非手術(shù)治療主要為外用鼻類固醇激素、內(nèi)服抗組胺藥、白三烯受體拮抗劑等,缺乏療效好、不良反應小的藥物[4-5]。中醫(yī)藥在治療 AH 取得了很好的療效,為臨床醫(yī)生提供了重要的參考依據(jù),二陳湯作為基礎方被臨床醫(yī)生廣泛應用于AH治療中,但藥物治療 AH 的作用機制并不明確,通過網(wǎng)絡藥理學尋找藥物多成分和多靶點的相互聯(lián)系,目前已被多方面應用于中藥研究當中,本研究從網(wǎng)絡藥理學的角度探究二陳湯治療AH的作用靶點和信號通路,以期為二陳湯治療AH的臨床應用提供一定的依據(jù),并挖掘潛在治療目標。
在GeneCard疾病靶點數(shù)據(jù)庫(https://www.genecards.org/)及OMIM疾病數(shù)據(jù)庫(https://omim.org/)輸入疾病名稱“adenoidal hypertrophy”,搜索AH的疾病靶點,并運用Uniprot數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org/)獲得靶點的Uniprot ID,進行Uniprot ID轉(zhuǎn)化。
在TCMSP數(shù) 據(jù) 庫(https://tcmsp-e.com/)中 搜索半夏、橘紅、茯苓、烏梅、生姜及甘草的主要化學成分,并根據(jù)生物口服利用度OB≥30%,藥物相似性DL≥0.18篩選候選化合物。運用Excel表格和網(wǎng)絡文本整理化合物-靶點信息,運用R語言得到疾病和藥物交集基因的網(wǎng)絡文本和Venn圖。
將交集基因的Excel文本導入Cytoscape3.8.0構(gòu)建二陳湯-AH疾病靶點網(wǎng)絡圖。網(wǎng)絡圖由節(jié)點(node)表示的化合物和靶點以及邊(edge)表示的相互作用所構(gòu)成。網(wǎng)絡中每個節(jié)點的重要性通過Cytoscape插件Analyz Network的拓撲參數(shù)自由度(Degree)和介數(shù)(Betweenness)和中心性(Closeness)進行評估,節(jié)點的自由度、介數(shù)和中心性越大,表明該節(jié)點越重要。
運 用STRING數(shù) 據(jù) 庫(https://string-db.org/)整理交集靶點信息,生物物種選擇人類,篩選條件設置為較高置信度(0.7),構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用(Proteinprotein Interaction,PPI)網(wǎng)絡。并將TSV文件導入Cytoscape3.8.0,計算度(degree)值,進行網(wǎng)絡拓樸學結(jié)構(gòu)分析,根據(jù)自由度、介數(shù)和中心性篩選關(guān)鍵靶點。
運 用Metascape平 臺(https://metascape.org/gp/index.html#/main/step1)對得到的基因進行GO基因富集分析和KEGG通路富集分析,生物物種選擇人類,設定閾值為P<0.01,將排名前20的通路進行可視化分析。
對TCMSP數(shù)據(jù)庫檢索所得成分進行篩選,得到活性化合物半夏12個,茯苓6個,橘紅7個,烏梅8個,生姜4個,甘草81個,去重后共有105個潛在活性化合物,見表1?;钚曰衔锕灿?42節(jié)點,2076條邊,菱形為靶點,圓形為活性化合物,六邊形為藥物,見圖1。根據(jù)節(jié)點度值和介數(shù)、中心性排序,網(wǎng)絡拓撲分析前10的活性化合物為黃芩素(baicalein)、β-谷甾醇(beta-sitosterol)、豆甾醇(Stigmasterol)、柚皮素(Naringenin)、山奈酚(Kaempferol)、槲皮素(Quercetin)、苜蓿素(Medicarpin)、7-甲氧基-2-甲基異黃酮(7-Methoxy-2-methyl isoflavone)、刺芒柄花素(formononetin)、維斯體素(Vestitol)。
圖1 化合物-靶點藥理網(wǎng)絡圖
表1 二陳湯主要活性化合物的基本信息(僅顯示排名前10的活性化合物)
檢索獲得腺樣體肥大的疾病作用靶點862個,腺樣體肥大與活性化合物交集靶點共104個,導入STRING數(shù)據(jù)庫,經(jīng)篩選共得到23個核心靶點(見圖2),取排名前10的關(guān)鍵靶點分別為血清/三氨酸蛋白激酶1(RAC-alpha serine/threonineprotein kinase,AKT1)、絲 裂 原 活 化 蛋 白 激 酶 激 酶1 (Mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、轉(zhuǎn)錄 因 子AP-1(Transcription factor AP-1,JUN)、白介 素-6(Interleukin-6,IL6)、線 粒 體 激 活 蛋 白 激酶8 (Mitogen-activated protein kinase 8,MAPK8)、轉(zhuǎn)錄信號傳感器和激活器3 (Signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、myc原蛋白(Myc proto-oncogene protein,MYC)、絲裂原活化蛋白激酶3(Mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3)、表皮生長因子受體(Epidermal growth factor receptor,EGFR)、熱休克蛋白90α(Heat shock protein HSP 90-alpha,HSP90AA1)等。
GO功能富集分析結(jié)果顯示,二陳湯對無機物質(zhì)的反應、凋亡信號通路、脂多糖反應、細胞對脂質(zhì)的反應、類固醇激素反應、細胞死亡的積極調(diào)節(jié)、細胞群增殖的負調(diào)節(jié)等生物過程,對膜筏、囊腔、線粒體被膜、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)器復合體、血清/三氨酸蛋白激酶復合物、核膜、等離子膜蛋白等細胞功能,對轉(zhuǎn)錄因子-DNA結(jié)合、蛋白質(zhì)激酶結(jié)合、蛋白質(zhì)域特定結(jié)合、核受體的活動、蛋白激酶活性、泛素樣蛋白連接酶結(jié)合、細胞因子受體結(jié)合等分子功能有積極調(diào)控作用,見圖3。
圖3 二陳湯治療AH的GO基因分析
KEGG通路富集分析結(jié)果顯示,二陳湯治療AH通過多條信號通路完成,主要與免疫調(diào)節(jié)密切相關(guān)的IL-17信號通路、PI3K-Akt信號通路、NF-κB信號通路、凋亡信號通路、同種異體移植排斥,病毒感染途徑相關(guān)的麻疹、朊病毒疾病、病毒致癌物信號通路,神經(jīng)系統(tǒng)調(diào)節(jié)相關(guān)的血清素突觸、多巴胺能神經(jīng)突觸,以及內(nèi)分泌調(diào)節(jié)相關(guān)的內(nèi)分泌耐藥性、卵巢類固醇激素信號通路相關(guān),此外,還有癌癥通路、癌癥轉(zhuǎn)錄失調(diào)等其他重要信號通路,見圖4。
圖4 二陳湯治療AH的KEGG通路富集分析
腺樣體肥大在中醫(yī)典籍中缺少相關(guān)記載,近年來隨著醫(yī)家對腺樣體肥大的認識逐漸增多,根據(jù)發(fā)病部位和主要臨床癥狀,將其歸結(jié)為“鼾眠”“痰核”“鼻窒”“頏顙不開”“窠囊”等范疇[6]。如《靈樞集注》中亦提到:“頏顙者,腭之上竅,口鼻之氣及涕唾,從此相通?!薄夺t(yī)碥》中提出:“痰本為津液,但積久聚多遍及全身……甚則結(jié)成牢固的窠囊,表現(xiàn)各異。”腺樣體總屬本虛標實,肺開竅于鼻,咽喉為肺之門戶,外邪侵襲,首先犯肺,尤以鼻咽部為重。小兒臟腑嬌嫩、形氣未充,肺脾腎三臟不足,易感六淫邪氣,正氣不能鼓邪外出,外邪留戀,小兒陽常有余之體,易化熱化火,熱毒煉液成痰,病邪互結(jié)于咽喉。二陳湯是治療腺樣體肥大常用方[6],本方出自于宋·《太平惠民和劑局方》,由半夏、橘紅、茯苓、生姜、烏梅、甘草6味中藥構(gòu)成,標本兼顧,散收相合,燥濕祛已形之痰,健脾絕生痰之源,又可行氣散滯,體現(xiàn)治痰先治氣,氣順則痰消之意。
對二陳湯6味中草藥的105個活性成分和23個核心作用靶點進行預測,發(fā)現(xiàn)多數(shù)活性成分對應多個靶點,同一靶點對應多個活性成分,體現(xiàn)了活性成分與靶點之間相互協(xié)作的關(guān)系。二陳湯主要的活性化合物大多為黃酮類化合物,具有很好的抗病毒、抗炎、抗氧化及免疫調(diào)節(jié)等作用,如黃芩素可以通過抑制PI3K/AKT信號通路及阻斷MAPK信號傳遞等來抑制細胞增殖,通過抑制NF-κB和JAK2/STAT等途徑,下調(diào)促炎性細胞因子(TNF-ɑ、IL-6等)水平從而緩解炎癥[7]-[12]。山奈酚、槲皮素均可抑制NF-κB途徑抑制炎癥反應,影響環(huán)化酶2、白細胞介素、MAPKs的表達,并改變toll樣受體和JAK2/STAT的信號通路,mTOR、AKT及NF-κB等途徑相關(guān)抑制因子的激活可以下調(diào)脂多糖(LPS)誘導促炎癥因子(TNF-ɑ、IL-6等)的產(chǎn)生,還通過抑制蛋白激酶B和蛋白激酶磷酸化等達到抗病毒特性[13]。柚皮素除抑制NF-κB活化、調(diào)節(jié)免疫細胞的分化外,還可在巨噬細胞中激活Akt-Nrf2引起抗氧化反應[11]。苜蓿素通過下調(diào)促炎細胞因子(如TNF-ɑ、IL-6和IL-17A)水平緩解炎癥[14]。維斯體素通過抑制NF-κB和Erk 1/2通路的激活,并誘導巨噬細胞進入M2樣極化[15]。
豆甾醇是植物主要甾醇之一,可抑制細胞中的AKT/mTOR通路同時誘導凋亡和保護性自噬[16]。刺芒柄花素是一種植物激素,具有雌激素狀結(jié)構(gòu),可以通過激活膜雌激素受體GPER顯著提高表皮和真皮層的A20蛋白及其mRNA的表達,同時抑制親炎因子TSLP蛋白及其mRNA在體內(nèi)的表達,A20不僅抑制了NF-κB的活性,而且進一步阻止了NF-κB調(diào)節(jié)的各種炎癥因素的釋放,A20也被認為是過敏性疾病的潛在治療目標[17]。β-谷甾醇是一種天然多酚羥基化合物,是甾醇的主要成分之一,作用于脂多糖(LPS)誘導的巨噬細胞以及抑制NF-κB通路,提高抗炎因子IL-10活性的同時,增強酪氨酸磷酸酶(SHP-1)活性、減小促炎因子和趨化因子活性,還可通過較強的抗氧化活性,下調(diào)人體產(chǎn)生的ROS,經(jīng)嗜酸粒細胞滲濾等緩和炎癥[18]。
通過PPI網(wǎng)絡拓撲分析得到的二陳湯治療AH的關(guān)鍵靶點,AKT1是3種密切相關(guān)的血清/三氨酸蛋白激酶(AKT1、AKT2和 AKT3)之一,稱為AKT激酶,能調(diào)節(jié)新陳代謝、細胞增殖、細胞存活、生長和血管生成等多種生物過程。MAKP1是NF-κB通路的中央蛋白激酶,MAPK1和MAPK3在 MAPK/ERK 級聯(lián)中起著重要作用,MAPK級聯(lián)下游的轉(zhuǎn)錄因子,包括cMyc和SMAD4,并促進激活 STAT 家庭成員 STAT1、STAT3、STAT5A 和 STAT5B,MAPK8參與T細胞向Th1細胞分化過程,MAPK1、MAPK3和MAPK8均參與細胞繁殖、分化、生存,調(diào)節(jié)細胞免疫等過程[19]。JUN參與多種轉(zhuǎn)錄過程和蛋白質(zhì)結(jié)合。IL-6參與多種生物功能,具有免疫力、組織再生和新陳代謝作用。EGFR積極參與MAP激酶活動,調(diào)節(jié)細胞增殖、免疫調(diào)節(jié)等過程。HSP90AA1參與細胞周期控制和信號轉(zhuǎn)導等過程,如結(jié)合細菌脂質(zhì)糖(LPS)和調(diào)解 LPS 引起的炎癥反應,包括單核細胞的 TNF 分泌,在線粒體外膜中調(diào)和 TOMM70 與 IRF3 或 TBK1 的關(guān)聯(lián),促進宿主抗病毒反應等。
本研究對二陳湯作用的靶基因進行了GO和KEGG富集通路分析,GO分析結(jié)果顯示二陳湯對無機物質(zhì)的反應、凋亡信號通路、脂多糖反應、細胞對脂質(zhì)的反應、類固醇激素反應、細胞死亡的積極調(diào)節(jié)、細胞群增殖的負調(diào)節(jié)等生物過程,對轉(zhuǎn)錄因子-DNA結(jié)合、蛋白質(zhì)激酶結(jié)合、蛋白質(zhì)域特定結(jié)合、核受體的活動、蛋白激酶活性、泛素樣蛋白連接酶結(jié)合、細胞因子受體結(jié)合等分子功能有積極調(diào)控作用,KEGG分析顯示二陳湯主要通過IL-17信號通路、PI3K-Akt信號通路、NF-κB信號通路、凋亡信號通路等免疫調(diào)節(jié)通路下調(diào)炎癥因子表達、減小促炎因子和趨化因子活性、調(diào)節(jié)細胞增殖、干擾病毒復制以及抗氧化來下調(diào)ROS緩解炎癥等多途徑治療腺樣體肥大,此外,還可以抑制蛋白激酶B和蛋白激酶磷酸化等途徑達到抗病毒特性等。
綜上所述,二陳湯治療AH是通過多成分、多靶點、多途徑調(diào)控過程,其機制可能是下調(diào)炎癥因子表達、減少促炎因子和趨化因子活性、調(diào)節(jié)細胞增殖、干擾病毒復制以及抗氧化改善機體免疫狀態(tài)和抗病毒能力等?;诰W(wǎng)絡藥理學結(jié)果可以進一步進行藥理學驗證,挖掘潛在治療目標,為臨床應用二陳湯治療AH提供一定的理論依據(jù)。