成洪杰,張 曉,崔培林
1.首都醫(yī)科大學(xué)大興教學(xué)醫(yī)院消化內(nèi)科,北京 102600;2.北京市大興區(qū)榆垡鎮(zhèn)中心衛(wèi)生院;3.首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京天壇醫(yī)院國(guó)際醫(yī)療部綜合內(nèi)科
胰腺癌是惡性程度最高的腫瘤之一,發(fā)病率和死亡率高。根據(jù)最新中國(guó)癌癥城市報(bào)告[1],2013年中國(guó)城市居民中,胰腺癌發(fā)病率為6.95/10萬(wàn),死亡率為6.18/10萬(wàn),且發(fā)病率和死亡率呈逐年升高的趨勢(shì)。胰腺癌的早期診斷困難,就診時(shí),只有不足20%的患者適合接受手術(shù)治療;晚期治療困難,進(jìn)展期胰腺癌患者的中位生存時(shí)間不足6個(gè)月[2]。鑒于胰腺癌惡性程度高、早期診斷難、晚期治療難、易發(fā)生局部浸潤(rùn)和全身轉(zhuǎn)移,深入探索胰腺癌發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制,發(fā)現(xiàn)潛在臨床治療靶點(diǎn)尤為重要[3]。
長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一類轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度超過(guò)200 nt的不具有蛋白質(zhì)編碼功能的RNA分子總稱。研究[4-6]顯示,lncRNA在多種腫瘤中存在異常表達(dá),與肝癌、結(jié)直腸癌、肺癌、前列腺癌、乳腺癌等密切相關(guān),lncRNA可通過(guò)調(diào)控基因表達(dá),影響腫瘤的發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移、預(yù)后等。近年來(lái),有關(guān)lncRNA在胰腺癌發(fā)生、發(fā)展中的作用得到了越來(lái)越多的關(guān)注。研究[2-3]表明,多種lncRNA在胰腺癌組織中存在異常表達(dá),lncRNA可能在胰腺癌的發(fā)生發(fā)展中起重要作用。HOTAIR、MALAT1、H19、gas5、HOTTIP、PVT-1等多種lncRNA與胰腺癌的發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移和預(yù)后有明顯相關(guān)性。
HOX的反義基因間RNA(HOX transcript antisense RNA,HOTAIR)是第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)與胰腺癌有關(guān)的lncRNA分子,長(zhǎng)度為2 158 bp,位于染色12q13.13的HoxC位點(diǎn)。近年來(lái)研究表明,HOTAIR在乳腺癌、肝癌、食管癌、結(jié)腸癌等存在異常表達(dá)[7-11],HOTAIR高表達(dá)增加了腫瘤細(xì)胞的增殖、侵襲、轉(zhuǎn)移能力。研究[2-3]表明,HOTAIR可能是一種原癌基因,在胰腺癌發(fā)生發(fā)展中起著重要的作用。研究[12]發(fā)現(xiàn),HOTAIR在胰腺癌組織中表達(dá)水平顯著上調(diào),與胰腺癌周圍淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及遠(yuǎn)處浸潤(rùn)密切相關(guān),并且異常表達(dá)HOTAIR還是影響胰腺癌患者臨床預(yù)后的重要因素之一,高表達(dá)水平的HOTAIR預(yù)示著較短的生存期。
目前,關(guān)于HOTAIR在胰腺癌中作用的報(bào)道仍然較少,研究尚處于初步階段,HOTAIR在胰腺癌中的生物學(xué)功能尚不明確,具體發(fā)揮作用途徑和分子機(jī)制更是知之甚少。因此,本研究體外培養(yǎng)胰腺癌細(xì)胞,旨在研究HOTAIR對(duì)胰腺癌細(xì)胞增殖、遷移等影響,為胰腺癌的臨床靶點(diǎn)治療提供可能的方向和實(shí)驗(yàn)依據(jù),為胰腺癌的診斷和治療開(kāi)辟新的途徑。
1.1 材料與試劑人胰腺癌細(xì)胞系A(chǔ)sPC-1和Panc-1購(gòu)自美國(guó)ATCC細(xì)胞中心;DMEM高糖培養(yǎng)基、質(zhì)量濃度為100 g/L的胎牛血清、青鏈雙抗購(gòu)自美國(guó)Gibco公司;Trizol試劑、質(zhì)粒表達(dá)載體pcDNA3.1、轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine 2000均購(gòu)自美國(guó)Invitrogen公司;小干擾RNA(siRNAs)和陰性對(duì)照siRNA(si-NC)由北京健坤禾潤(rùn)科技有限公司代購(gòu);CCK8試劑盒購(gòu)自日本同仁化學(xué)研究所;Transwell小室購(gòu)自美國(guó)Millipore公司;GoScriptTMReverse Transcription System A5001購(gòu)自美國(guó)Promega公司;GoTaq?qPCR Master Mix A6001購(gòu)自美國(guó)Promega公司;RQ1 Rnase-Free Dnase M610A購(gòu)自美國(guó)Promega公司。
1.2 方法
1.2.1 細(xì)胞培養(yǎng):人胰腺癌細(xì)胞(Panc-1、AsPC-1)用DMEM高糖培養(yǎng)基培養(yǎng),補(bǔ)充含質(zhì)量濃度為100 g/L的胎牛血清、100 U/ml青霉素及100 mg/ml鏈霉素,置于37 ℃、體積分?jǐn)?shù)為5% CO2的飽和濕度恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。每1~2 d更換1次培養(yǎng)基,當(dāng)細(xì)胞融合度為80%~90%時(shí)進(jìn)行傳代培養(yǎng)。
1.2.2 獲取目的基因和構(gòu)建質(zhì)粒:查閱基因文庫(kù),發(fā)現(xiàn)并找到人胰腺癌細(xì)胞目的基因HOTAIR轉(zhuǎn)錄mRNA核苷酸序列,利用qRT-PCR技術(shù)逆轉(zhuǎn)錄形成的cDNA再擴(kuò)增形成一個(gè)全長(zhǎng)的HOTAIR片段,用于擴(kuò)增的HOTAIR的寡核苷酸序列為:上游:5′-CATGGATCCACATTCTGCCCTGATTTCCGGAACC-3′,下游:5′-ACTCT-CGAGCCACCACACACACACAACCTACAC-3′,分別包含外源性Hind Ⅲ和Xho Ⅰ位點(diǎn)。驗(yàn)證PCR的產(chǎn)物并亞克隆至哺乳動(dòng)物表達(dá)載體pcDNA3.1中。
1.2.3 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染細(xì)胞:取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期胰腺癌細(xì)胞接種于細(xì)胞培養(yǎng)板,待細(xì)胞貼壁且融合度為40%~60%時(shí),通過(guò)Lipofectamine 2000進(jìn)行載體及對(duì)照組的轉(zhuǎn)染,具體方法參見(jiàn)產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)。注意轉(zhuǎn)染前更換為無(wú)血清培養(yǎng)液;轉(zhuǎn)染后6 h更換含質(zhì)量濃度為100 g/L的胎牛血清培養(yǎng)液。第一步轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-HOTAIR至人胰腺癌細(xì)胞(Panc-1、AsPC-1)中,以空白pcDNA載體(pcDNA3.1-NC)作陰性對(duì)照(陰性對(duì)照組),空試劑做空白處理(試劑空白組)。第二步轉(zhuǎn)染HOTAIR基因小干擾RNA(siRNA-HOTAIR)至人胰腺癌細(xì)胞(Panc-1、AsPC-1)中。應(yīng)用3條獨(dú)立的小干擾RNA(siRNA-HOTAIR-1187、siRNA-HOTAIR-83、siRNA-HOTAIR-1524)分別轉(zhuǎn)染兩株胰腺癌細(xì)胞,尋找并發(fā)現(xiàn)HOTAIR干擾敲低率最佳的siRNA。以陰性siRNA(si-NC)作對(duì)照,空試劑做空白處理。3個(gè)獨(dú)立的HOTAIR siRNA靶序列分別為:siRNA-HOTAIR-1187:5′-GCACUGUCUCUCAAAUAAUTT-3′;siRNA-HOTAIR-83:5′-GCACAUUCUGCCCUGAUUUTT-3′;siRNA-HOTAIR-1524:5′-GCCUUUGCUUCGUGCUGAUTT-3′。
1.2.4 qRT-PCR檢測(cè)HOTAIR表達(dá)量:收集轉(zhuǎn)染后48 h的胰腺癌細(xì)胞,按Trizol試劑說(shuō)明書(shū)提取HOTAIR總RNA。使用GoScriptTMReverse Transcription System和GoTaq?qPCR Master Mix進(jìn)行qRT-PCR分析,檢測(cè)HOTAIR表達(dá)水平,結(jié)果用磷酸甘油酸脫氫酶(GAPDH)的表達(dá)量進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。HOTAIR的PCR上游引物:5′-CAGTGGGGAACTCTGACTCG-3′,下游引物:5′-GTGCCTGGTGCTCTCTTACC-3′;GAPDH上游引物:5′-GGGAGCCAAAAGGGTCAT-3′,下游引物:5′-GAGTCCTTCCACGATACCAA-3′。分析qRT-PCR的結(jié)果并計(jì)算其相對(duì)于臨界循環(huán)次數(shù)的值,然后轉(zhuǎn)換為相對(duì)GAPDH的倍數(shù)改變,采用2-ΔΔCt法進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。
1.2.5 CCK8法檢測(cè)細(xì)胞增殖活力:取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的胰腺癌細(xì)胞以起始1.0×103個(gè)/孔接種于96孔板,每孔加培養(yǎng)液100 μl,24 h后轉(zhuǎn)染,每株胰腺癌細(xì)胞均設(shè)立實(shí)驗(yàn)組和陰性對(duì)照組(NC),每組設(shè)置5個(gè)復(fù)孔。向每孔加入10 μl CCK溶液,注意不要在孔中生成氣泡,否則會(huì)影響吸光度值(OD)的讀數(shù)。分別于轉(zhuǎn)染后0 d、1 d、2 d、3 d和4 d檢測(cè)細(xì)胞增殖。
1.2.6 Transwell細(xì)胞遷移實(shí)驗(yàn):胰腺癌細(xì)胞轉(zhuǎn)染后48 h進(jìn)行Transwell細(xì)胞遷移實(shí)驗(yàn)。將胰腺癌細(xì)胞消化后鋪在transwell小室上層,起始數(shù)量為2.0×104個(gè)/100 μl。含質(zhì)量濃度為100 g/L的胎牛血清的培養(yǎng)基600 μl位于下層。24 h取出小室,用棉簽擦去小室內(nèi)壁一面細(xì)胞,外側(cè)細(xì)胞結(jié)晶紫染色。顯微鏡下拍照。之后2% SDS裂解細(xì)胞(600 μl)。之后移入96孔板檢測(cè)OD值。
2.1 HOTAIR在人胰腺癌細(xì)胞系A(chǔ)sPC-1和Panc-1的表達(dá)情況
2.1.1 AsPC-1細(xì)胞:HOTAIR轉(zhuǎn)染成功過(guò)表達(dá),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。AsPC-1的敲低取得成功,siRNA-1187檢測(cè)到最高敲低率,約為89.6%。其余兩條分別為 43.8%(siRNA-83),74.3%(siRNA-1524),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)(見(jiàn)表1、圖1)。PCR擴(kuò)增曲線和熔解曲線良好,擴(kuò)增產(chǎn)物特異性良好(以AsPc-1過(guò)表達(dá)為例,見(jiàn)圖2)。
2.1.2 Panc-1細(xì)胞:HOTAIR轉(zhuǎn)染成功過(guò)表達(dá),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。Panc-1的敲低取得成功,siRNA-83敲低率最高,相對(duì)陰性白質(zhì)粒對(duì)照組平均值,敲低效率約為62.2%,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)(見(jiàn)表2、圖3)。PCR擴(kuò)增曲線和熔解曲線良好,擴(kuò)增產(chǎn)物特異性良好。
表1 AsPC-1細(xì)胞中HOTAIR相對(duì)表達(dá)量Tab 1 The relative expression of HOTAIR in AsPC-1
圖1 AsPC-1細(xì)胞HOTAIR過(guò)表達(dá)(A)和敲低(B)Fig 1 The overexpression (A) and knockdown (B) of HOTAIR in AsPC-1
圖2 AsPC-1過(guò)表達(dá)擴(kuò)增曲線(A)和AsPC-1過(guò)表達(dá)熔解曲線(B)Fig 2 Amplification curve: the overexpression of HOTAIR in AsPC-1 (A) and melting curve: the overexpression of HOTAIR in AsPC-1 (B)
表2 Panc-1細(xì)胞中HOTAIR相對(duì)表達(dá)量Tab 2 The relative expression of HOTAIR in Panc-1
2.2 HOTAIR對(duì)人胰腺癌細(xì)胞AsPC-1和Panc-1增殖的影響
2.2.1 AsPC-1細(xì)胞:HOTAIR過(guò)表達(dá)組與空載體對(duì)照組相比,細(xì)胞增殖能力差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)(見(jiàn)圖4A),這可能與HOTAIR本身在AsPC-1細(xì)胞中的高表達(dá)相關(guān)。但HOTAIR敲低實(shí)驗(yàn)中,3組HOTAIR敲低表達(dá)的細(xì)胞增殖能力普遍弱于陰性對(duì)照組,0~2 d此趨勢(shì)較明顯,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)(見(jiàn)圖4B)。
2.2.2 Panc-1細(xì)胞:跟蹤細(xì)胞生長(zhǎng)狀況表明,相比陰性對(duì)照組,0~3 d過(guò)表達(dá)HOTAIR組呈生長(zhǎng)優(yōu)勢(shì);相比陰性對(duì)照組,HOTAIR敲低效率較高的siRNA-83和siRNA-1187組增殖能力減弱(見(jiàn)圖5)。
圖3 Panc-1細(xì)胞HOTAIR過(guò)表達(dá)(A)和敲低(B)Fig 3 The overexpression (A) and knockdown (B) of HOTAIR in Panc-1
圖4 AsPC-1細(xì)胞HOTAIR過(guò)表達(dá)(A)和敲低(B)對(duì)細(xì)胞增殖的影響Fig 4 The effect of overexpression (A) and knockdown (B) of HOTAIR on proliferation in AsPC-1
圖5 Panc-1細(xì)胞HOTAIR過(guò)表達(dá)(A)和敲低(B)對(duì)細(xì)胞增殖的影響Fig 5 The effect of overexpression (A) and knockdown (B) of HOTAIR on proliferation in Panc-1
2.3 HOTAIR對(duì)人胰腺癌細(xì)胞AsPC-1和Panc-1遷移的影響
2.3.1 AsPC-1細(xì)胞:Transwell結(jié)果表明,相比陰性對(duì)照組,過(guò)表達(dá)HOTAIR組細(xì)胞遷移能力增強(qiáng)。siRNA-1187轉(zhuǎn)染的細(xì)胞遷移能力明顯下降,而siRNA-83和siRNA-1524變化相對(duì)陰性對(duì)照組不明顯(見(jiàn)圖6)。
2.3.2 Panc-1細(xì)胞:Transwell結(jié)果表明,相比陰性對(duì)照組,過(guò)表達(dá)HOTAIR組細(xì)胞遷移能力增強(qiáng)。敲低效率較高的siRNA-83和siRNA-1187轉(zhuǎn)染的細(xì)胞遷移能力明顯下降,而siRNA-1524變化相對(duì)陰性對(duì)照組不明顯(見(jiàn)圖7)。
注:A1為HOTAIR過(guò)表達(dá)組,A2為A1的陰性對(duì)照組,B1為siRNA-1187組,B2為B1的陰性對(duì)照組,圖片均放大100倍。
注:A1為HOTAIR過(guò)表達(dá)組,A2為A1的陰性對(duì)照組,B1為siRNA-83組,B2為B1的陰性對(duì)照組,圖片均放大100倍。
胰腺癌是常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,惡性程度高,轉(zhuǎn)移出現(xiàn)早,早期診斷困難,晚期治療困難,預(yù)后較差。目前胰腺癌的治療仍以手術(shù)切除聯(lián)合術(shù)后化療為主,雖然患者術(shù)后中位生存期延長(zhǎng),但生存質(zhì)量并未得到顯著提高。因此,深入研究胰腺癌發(fā)生發(fā)展機(jī)制和靶向治療尤為重要。
lncRNA是一類轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度超過(guò)200 nt的不具有蛋白質(zhì)編碼功能的RNA分子總稱。近年來(lái)研究[7-11]表明,lncRNA與肝癌、食管癌、結(jié)腸癌、乳腺癌等多種惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展相關(guān),HOTAIR高表達(dá)可能增加了腫瘤細(xì)胞的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移能力。此外,HOTAIR高表達(dá)常常提示腫瘤患者不良的預(yù)后。
近年來(lái),有關(guān)lncRNA在胰腺癌發(fā)生、發(fā)展中的作用得到了越來(lái)越多的關(guān)注,為臨床上胰腺癌的早期診斷、治療和預(yù)后提供了新的方向。Kim等[12]研究發(fā)現(xiàn),HOTAIR在胰腺癌組織中表達(dá)水平顯著上調(diào),與胰腺癌周圍淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及遠(yuǎn)處浸潤(rùn)密切相關(guān),并且高表達(dá)水平的HOTAIR常預(yù)示著較短的生存期。但關(guān)于HOTAIR在胰腺癌中作用的報(bào)道仍然較少,研究尚處于起步階段。
HOTAIR由Rinn等[13]于2007年首次發(fā)現(xiàn)并描述,是第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)以反式轉(zhuǎn)錄干預(yù)基因表達(dá)的lncRNA。HOTAIR僅存在于哺乳動(dòng)物中,由2 185個(gè)核苷酸組成,位于染色體12q13.13的HOXC11與HOXC12之間,包括6個(gè)外顯子[14]。
HOTAIR有分子骨架的作用,具有特異性雙向結(jié)合能力,能同時(shí)結(jié)合兩種不同的組蛋白修飾復(fù)合體,并可能起到協(xié)調(diào)兩者功能的作用。其5′端與多梳抑制復(fù)合體2(polycomb repressive complex 2,PRC2)的核心組成部分之一EZH2結(jié)合,可使組蛋白H3第27位的賴氨酸三甲基化(H3K27me3),介導(dǎo)PRC2至特定位點(diǎn)來(lái)沉默HOXD基因座及相關(guān)抑癌基因如HOXD10、JAM2、PCDH的轉(zhuǎn)錄從而促進(jìn)腫瘤的轉(zhuǎn)移復(fù)發(fā);而3′端與賴氨酸特異性組蛋白去甲基化酶復(fù)合體(LSD1/CoREST/REST)結(jié)合,可使組蛋白H3第4位的賴氨酸去甲基化(H3K4deme)[15],調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄活性,在染色體層面調(diào)控目的基因活性[16]。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),HOTAIR可以通過(guò)PRC2依賴性和PRC2非依賴性兩種途徑來(lái)介導(dǎo)下游基因表達(dá)調(diào)控,但HOTAIR發(fā)揮調(diào)控作用的機(jī)制仍不完全清楚。
本研究體外培養(yǎng)胰腺癌細(xì)胞,通過(guò)調(diào)控HOTAIR在胰腺癌細(xì)胞中的表達(dá)水平,對(duì)其增殖、遷移能力進(jìn)行分析。本研究發(fā)現(xiàn),在HOTAIR過(guò)量表達(dá)實(shí)驗(yàn)中,HOTAIR過(guò)量表達(dá)可增強(qiáng)Panc-1細(xì)胞增殖能力,但對(duì)AsPC-1細(xì)胞增殖無(wú)影響,我們分析可能與HOTAIR在AsPC-1細(xì)胞本身呈高表達(dá)狀態(tài)相關(guān),進(jìn)一步上調(diào)HOTAIR在AsPC-1的表達(dá)水平,其促進(jìn)胰腺癌細(xì)胞增殖的作用和效果可能不顯著;同時(shí),過(guò)表達(dá)的HOTAIR可以同時(shí)增強(qiáng)AsPC-1細(xì)胞、Panc-1細(xì)胞的遷移能力。在HOTAIR敲低實(shí)驗(yàn)中,通過(guò)下調(diào)HOTAIR在胰腺癌細(xì)胞的表達(dá)水平,可以顯著抑制AsPC-1細(xì)胞、Panc-1細(xì)胞的增殖和遷移能力,這與前人研究結(jié)果相吻合,提示HOTAIR可能促進(jìn)了胰腺癌的發(fā)展,HOTAIR高表達(dá)可能與預(yù)后不良相關(guān)[12]。
綜上所述,本研究表明,HOTAIR高表達(dá)可以增強(qiáng)胰腺癌細(xì)胞的增殖和遷移能力,下調(diào)HOTAIR表達(dá)會(huì)抑制胰腺癌細(xì)胞的增殖和遷移能力,但由于人胰腺癌細(xì)胞種類較多,本研究只對(duì)AsPC-1和Panc-1兩株胰腺癌細(xì)胞進(jìn)行了研究,將來(lái)的研究可能涉及更多不同種類的胰腺癌細(xì)胞系,研究結(jié)果可能與本研究有所差異。此外,本研究?jī)H是體外實(shí)驗(yàn),研究結(jié)果尚需要進(jìn)一步體內(nèi)實(shí)驗(yàn)和臨床試驗(yàn)的證實(shí)。